2021/10/27 更新

写真a

ハシヤ フミタカ
橋谷 文貴
HASHIYA Fumitaka
所属
物質科学国際研究センター 助教
大学院担当
大学院理学研究科
職名
助教

学位 1

  1. 理学博士 ( 2019年3月   京都大学 ) 

研究キーワード 1

  1. ヌクレオソーム

受賞 1

  1. 奨励賞

    2021年1月   日本光医学・光生物学会   5-ブロモウラシルと光反応を利用した新規ヌクレオソーム形成部位の特定手法

    橋谷文貴、杉山弘、阿部洋

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

 

論文 16

  1. Antisense oligonucleotide modified with disulfide units induces efficient exon skipping in mdx myotubes through enhanced membrane permeability and nucleus internalization.

    Hiraoka H, Shu Z, Le BT, Masuda K, Nakamoto K, Lyu F, Abe N, Hashiya F, Kimura Y, Shimizu Y, Veedu RN, Abe H

    Chembiochem : a European journal of chemical biology     2021年10月

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    記述言語:英語  

    DOI: 10.1002/cbic.202100413

    PubMed

  2. Completely Chemically Synthesized Long DNA Can be Transcribed in Human Cells

    Yamaoka Kazuki, Oikawa Ryota, Abe Naoko, Nakamoto Kosuke, Tomoike Fumiaki, Hashiya Fumitaka, Kimura Yasuaki, Abe Hiroshi

    CHEMBIOCHEM     2021年10月

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    記述言語:日本語  

    DOI: 10.1002/cbic.202100312

    Web of Science

    PubMed

  3. Variety of Nucleotide Polymerase Mutants Aiming to Synthesize Modified RNA

    Ohashi Sana, Hashiya Fumitaka, Abe Hiroshi

    CHEMBIOCHEM   22 巻 ( 14 ) 頁: 2398 - 2406   2021年7月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:ChemBioChem  

    Significant efforts have been made to develop therapeutic RNA aptamers that exploit synthetic RNA to capture target molecules. However, ensuring RNA aptamers are resistant against intrinsic nucleases remains an issue and restricts their use as therapeutics. Introduction of chemical modifications to the 2′ sugar moiety of RNA improves their stability effectively and can be achieved by chemical synthesis using modified phosphoramidites; however, this approach is not suitable for preparing long RNA molecules. Although recombinant nucleotide polymerases can transcribe RNA, these polymerases cannot synthesize modified RNA because they do not recognize 2′ modified nucleoside triphosphates. In this review, we focus on several polymerase mutants that tolerate substrates containing modifications of the 2′ sugar moiety to synthesize RNA, and the problems that must be overcome to prepare chemically modified RNA with high efficacy by in vitro transcription.

    DOI: 10.1002/cbic.202100004

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  4. A novel method for locating nucleosomes by exploiting 5-bromouracil, pyrene-modified histone, and photoirradiation 査読有り

    Fumitaka Hashiya, Hiroshi Sugiyama

    Photomedicine and Photobiology   42 巻   頁: 13 - 16   2021年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  5. Direct Observation of Dynamic Interactions between Orientation-Controlled Nucleosomes in a DNA Origami Frame 国際誌

    Feng Yihong, Hashiya Fumitaka, Hidaka Kumi, Sugiyama Hiroshi, Endo Masayuki

    CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL   26 巻 ( 66 ) 頁: 15282 - 15289   2020年11月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Chemistry - A European Journal  

    The nucleosome is one of the most fundamental units involved in gene expression and consequent cell development, differentiation, and expression of cell functions. We report here a method to place reconstituted nucleosomes into a DNA origami frame for direct observation using high-speed atomic-force microscopy (HS-AFM). By using this method, multiple nucleosomes can be incorporated into a DNA origami frame and real-time movement of nucleosomes can be visualized. The arrangement and conformation of nucleosomes and the distance between two nucleosomes can be designed and controlled. In addition, four nucleosomes can be placed in a DNA frame. Multiple nucleosomes were well accessible in each conformation. Dynamic movement of the individual nucleosomes were precisely monitored in the DNA frame, and their assembly and interaction were directly observed. Neither mica surface modification nor chemical fixation of nucleosomes is used in this method, meaning that the DNA frame not only holds nucleosomes, but also retains their natural state. This method offers a promising platform for investigating nucleosome interactions and for studying chromatin structure.

    DOI: 10.1002/chem.202003071

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  6. Phosphorothioate Modification of mRNA Accelerates the Rate of Translation Initiation to Provide More Efficient Protein Synthesis 国際誌

    Kawaguchi Daisuke, Kodama Ayumi, Abe Naoko, Takebuchi Kei, Hashiya Fumitaka, Tomoike Fumiaki, Nakamoto Kosuke, Kimura Yasuaki, Shimizu Yoshihiro, Abe Hiroshi

    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION   59 巻 ( 40 ) 頁: 17403 - 17407   2020年9月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Angewandte Chemie - International Edition  

    Messenger RNAs (mRNAs) with phosphorothioate modification (PS-mRNA) to the phosphate site of A, G, C, and U with all 16 possible combinations were prepared, and the translation reaction was evaluated using an E. coli cell-free translation system. Protein synthesis from PS-mRNA increased in 12 of 15 patterns when compared with that of unmodified mRNA. The protein yield increased 22-fold when the phosphorothioate modification at A/C sites was introduced into the region from the 5′-end to the initiation codon. Single-turnover analysis of PS-mRNA translation showed that phosphorothioate modification increases the number of translating ribosomes, thus suggesting that the rate of translation initiation (rate of ribosome complex formation) is positively affected by the modification. The method provides a new strategy for improving translation by using non-natural mRNA.

    DOI: 10.1002/anie.202007111

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  7. A synthetic transcription factor pair mimic for precise recruitment of an epigenetic modifier to the targeted DNA locus. 国際誌

    Yu Z, Ai M, Samanta SK, Hashiya F, Taniguchi J, Asamitsu S, Ikeda S, Hashiya K, Bando T, Pandian GN, Isaacs L, Sugiyama H

    Chemical communications (Cambridge, England)   56 巻 ( 15 ) 頁: 2296 - 2299   2020年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c9cc09608f

    PubMed

  8. Translational control by secondary-structure formation in mRNA in a eukaryotic system 国際誌

    Kawaguchi Daisuke, Shimizu Saaya, Abe Naoko, Hashiya Fumitaka, Tomoike Fumiaki, Kimura Yasuaki, Abe Hiroshi

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS   39 巻 ( 1-3 ) 頁: 195 - 203   2020年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids  

    Eukaryotic mRNA has a cap structure at the 5′ end and a poly(A) tail at the 3′ end. The cap and poly(A) tail form a complex with multiple translation factors, and mRNA forms a circularized structure called a closed-loop model. This circularized structure reportedly not only stabilizes mRNA but also promotes ribosome recycling during translation, which improves translation efficiency. We designed an artificial mRNA that forms a circularized structure without a cap structure and poly(A) tail and found that its translational efficiency was improved compared with that of a sequence without the circularized structure in a eukaryotic translation system.

    DOI: 10.1080/15257770.2019.1671593

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  9. Electron injection from mitochondrial transcription factor A to DNA associated with thymine dimer photo repair. 国際誌

    Hashiya F, Ito S, Sugiyama H

    Bioorganic & medicinal chemistry   27 巻 ( 2 ) 頁: 278 - 284   2019年1月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2018.11.044

    PubMed

  10. Approach to the Investigation of Nucleosome Structure by Using the Highly Emissive Nucleobase <sup>th</sup> dG-tC FRET Pair. 国際誌

    Han JH, Park S, Hashiya F, Sugiyama H

    Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)   24 巻 ( 64 ) 頁: 17091 - 17095   2018年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/chem.201803382

    PubMed

  11. Direct Observation of H3-H4 Octasome by High-Speed AFM. 国際誌

    Zou T, Hashiya F, Wei Y, Yu Z, Pandian GN, Sugiyama H

    Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)   24 巻 ( 60 ) 頁: 15998 - 16002   2018年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/chem.201804010

    PubMed

  12. Biomimetic Artificial Epigenetic Code for Targeted Acetylation of Histones. 国際誌

    Taniguchi J, Feng Y, Pandian GN, Hashiya F, Hidaka T, Hashiya K, Park S, Bando T, Ito S, Sugiyama H

    Journal of the American Chemical Society   140 巻 ( 23 ) 頁: 7108 - 7115   2018年6月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/jacs.8b01518

    PubMed

  13. A novel detection technique of polyamide binding sites by photo-induced electron transfer in (Br)U substituted DNA. 招待有り 査読有り

    Chemical Communications   51 巻 ( 77 ) 頁: 14485 - 14488   2015年10月

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    記述言語:英語  

  14. Locating the uracil-5-yl radical formed upon photoirradiation of 5-bromouracil-substituted DNA. 招待有り 査読有り

    Nucleic acids research   42 巻 ( 22 ) 頁: 13469 - 13473   2014年12月

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    記述言語:英語  

  15. Sequence-specific DNA alkylation and transcriptional inhibition by long-chain hairpin pyrrole-imidazole polyamide-chlorambucil conjugates targeting CAG/CTG trinucleotide repeats. 招待有り 査読有り

    Bioorganic & medicinal chemistry.   22 巻 ( 17 ) 頁: 4646 - 4657   2014年9月

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    記述言語:英語  

  16. Sequence-specific electron injection into DNA from an intermolecular electron donor. 査読有り

    Hironobu Morinaga, Tomohiro Takenaka, Fumitaka Hashiya, Seiichiro Kizaki, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama.

    Nucleic acids research   41 巻 ( 8 ) 頁: 4724 - 4728   2013年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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講演・口頭発表等 12

  1. Chemically modified PCR primer aiming accurate and efficient DNA assembly

    Fumitaka Hashiya, Kaoru Onda, Kohei Nomura, Gao Yiuno, Hirotaka Murase, Kosuke Nakamoto, Masahito Inagaki, Haruka Hiraoka, Naoko Abe, Yasuaki Kimura, Natsuhisa Oka, Goro Terai, Kiyoshi Asai, Hiroshi Abe

    2021年11月11日 

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    開催年月日: 2021年11月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:日本国  

  2. Chemically modified PCR primer aiming accurate and efficient DNA assembly

    Fumitaka Hashiya, Kaoru Onda, Kohei Nomura, Gao Yiuno, Hirotaka Murase, Kosuke Nakamoto, Masahito Inagaki, Haruka Hiraoka, Naoko Abe, Yasuaki Kimura, Natsuhisa Oka, Goro Terai, Kiyoshi Asai, Hiroshi Abe

    2021年11月4日 

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    開催年月日: 2021年11月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:日本国  

  3. ホスホロチオエート修飾mRNAの合成とその翻訳活性

    竹渕慧、川口大輔、児玉亜有美、阿部奈保子、橋谷文貴、友池史明、中本航介、木村康明、清水義宏、阿部洋

    第52回 中部化学関係学協会支部連合秋季大会(静岡) 

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    開催年月日: 2021年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  4. メッセンジャーRNAのチオ修飾による翻訳開始反応の促進

    阿部奈保子・川口大輔・児玉亜有実・橋谷文貴・友池史明・木村康明・清水義宏・阿部洋

    第15回バイオ関連化学シンポジウム 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  5. 化学的手法を用いた新規ゲノムスケールDNA合成技術の開発

    野村浩平・恩田馨・Gao Yiuno・村瀬裕貴・中本航介・稲垣雅仁・平岡陽花・阿部奈保子・橋谷文貴・木村康明・阿部洋

    第15回バイオ関連化学シンポジウム 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  6. フルオロリン酸アミデート基の開発と核酸アナログのプロドラッグへの応用

    木村康明, 吉田祐希, 友池史明,, 橋谷文貴, 鈴木哲朗, 廣田嵩人, 齋木由利子, 堀井明, 平山明由, 曽我朋義, 阿部洋

    第15回バイオ関連化学シンポジウム 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  7. Simple chemical synthesis of adenylated RNA, a substrate for template independent RNA ligation

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    開催年月日: 2021年7月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    国名:日本国  

  8. 化学修飾プライマーを活用した高効率で精密な長鎖DNAアセンブリ―法の開発

    橋谷文貴・恩田馨・野村浩平・GaoYiuno・村瀬裕貴・中本航介・稲垣雅仁・平岡陽花・阿部奈保子・木村康明・阿部洋

    日本核酸医薬学会第6年会  2021年6月27日 

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    開催年月日: 2021年6月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  9. 化学修飾プライマーを活用した高効率で精密な長鎖DNAアセンブリ―法の開発

    橋谷文貴・恩田馨・野村浩平・GaoYiuno・村瀬裕貴・中本航介・稲垣雅仁・平岡陽花・阿部奈保子・木村康明・阿部洋

    第15回ケミカルバイオロジー学会  2021年6月21日 

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    開催年月日: 2021年6月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  10. フルオロリン酸アミデート基を用いた新規リン酸プロドラッグの開発

    吉田祐希・Zheng Ti・田辺航・友池史明・橋谷文貴・鈴木哲朗・廣田嵩人・齋木由利子・堀井明・平山明由・曽我朋義・木村康明・阿部洋

    第15回ケミカルバイオロジー学会 

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    開催年月日: 2021年6月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  11. ホスホロチオエート修飾mRNAの合成とその翻訳活性

    竹渕慧、川口大輔、児玉亜有美、阿部奈保子、橋谷文貴、友池史明、中本航介、木村康明、清水義宏、阿部洋

    第15回ケミカルバイオロジー学会 

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    開催年月日: 2021年6月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  12. 5-ブロモウラシルと光反応を利用した新規ヌクレオソーム形成部位の特定手法 招待有り

    橋谷文貴、杉山弘、阿部洋

    第42回日本光医学・光生物学会  2021年1月22日 

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    開催年月日: 2021年1月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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科研費 1

  1. 化学修飾を利用した二本鎖切断によるクロマチンの動的変化解析

    研究課題/研究課題番号:21K14751  2021年4月 - 2024年3月

    科学研究費助成事業  若手研究

    橋谷 文貴

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    担当区分:研究代表者 

    配分額:4680000円 ( 直接経費:3600000円 、 間接経費:1080000円 )

    真核生物の染色体において二本鎖切断のマーカーとして挿入されるH2AXの詳細な挙動をin vitro実験にて解析する。H2AXの挙動は細胞実験から得られたものであり損傷部位への挿入メカニズムについては不明な点が多い。本研究では化学修飾を利用することで、光照射によって切断されるDNA、および挿入の検出が可能なヒストンを開発する。核抽出液存在下これらを用いてヌクレオソームを形成し、DNA光切断後のH2AXの挿入および除去を観察することでDNA損傷部位に対するH2AXの挙動とその責任タンパク質について詳しい知見を得る。

産業財産権 1

  1. 認知機能及び手指運動機能の評価訓練用の電子ペグシステム

    岡橋さやか、橋谷文貴、井出慎吾、菅野明弘、内海潤、草場哲、山口太郎

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    出願人:一般社団法人芝蘭会

    出願番号:特願2019-83343(P2019-83343)  出願日:2019年4月

    公開番号:特開2020-178851(P2020-178851A)  公開日:2020年11月

 

担当経験のある科目 (本学) 2

  1. 基礎セミナーA

    2021

  2. 基礎セミナーA

    2020