日本ケミカルバイオロジー学会

日本生理学会

Photoresponsive Adenosine Derivatives for the Optical Control of Adenosine A_2A Receptors in Living Cells

Suzuki, H; Doura, T; Matsuba, Y; Matsuoka, Y; Araya, T; Asada, H; Iwata, S; Kiyonaka, S

ACS CHEMICAL BIOLOGY   19 巻 ( 12 ) 頁： 2494 - 2501   2024年11月

Nanoscale organization is changed in native, surface AMPARs by mouse brain region and tauopathy.

Vaidya RM, Zhang J, Nall D, Lee Y, Chang Kim E, Ma D, Huang F, Nonaka H, Kiyonaka S, Hamachi I, Jung Chung H, Selvin PR

bioRxiv : the preprint server for biology     2024年7月

Hijacking endogenous mRNA for genetic code expansion 査読有り 国際誌

Doura, T; Matsuoka, Y; Kiyonaka, S

NATURE CHEMICAL BIOLOGY   20 巻 ( 6 ) 頁： 660 - 661   2024年6月

Multi-color super-resolution imaging of surface AMPAR and phosphotau inside dendritic spines in thick brain slice

Lee, Y; Vaidya, RM; Nall, DL; Zhang, J; Ma, D; Huang, F; Kiyonaka, S; Hamachi, I; Chung, HJ; Selvin, PR

BIOPHYSICAL JOURNAL   123 巻 ( 3 ) 頁： 417A - 417A   2024年2月

Observing nanoscale organization of native, cell-surface AMPARs in mouse brain slices as a function of brain region and taupathy

Vaidya, RM; Nall, DL; Zhang, J; Lee, Y; Ma, D; Huang, F; Kiyonaka, S; Hamachi, I; Chung, HJ; Selvin, PR

BIOPHYSICAL JOURNAL   123 巻 ( 3 ) 頁： 417A - 417A   2024年2月

Bioorthogonal chemical labeling of endogenous neurotransmitter receptors in living mouse brains 査読有り 国際誌

Nonaka, H; Sakamoto, S; Shiraiwa, K; Ishikawa, M; Tamura, T; Okuno, K; Kondo, T; Kiyonaka, S; Susaki, EA; Shimizu, C; Ueda, HR; Kakegawa, W; Arai, I; Yuzaki, M; Hamachi, I

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   121 巻 ( 6 ) 頁： e2313887121   2024年2月

Crystal structure reveals the binding mode and selectivity of a photoswitchable ligand for the adenosine A2A receptor 国際誌

Araya, T; Matsuba, Y; Suzuki, H; Doura, T; Nuemket, N; Nango, E; Yamamoto, M; Asada, H; Kiyonaka, S; Iwata, S

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   695 巻   頁： 149393   2024年2月

[Next-Generation Chemogenetics for Elucidating Higher Brain Functions].

Matsuoka Y, Kashiwa S, Doura T, Kiyonaka S

Brain and nerve = Shinkei kenkyu no shinpo   75 巻 ( 4 ) 頁： 367 - 374   2023年4月

Coordination chemogenetics for activation of GPCR-type glutamate receptors in brain tissue Open Access

Ojima, K; Kakegawa, W; Yamasaki, T; Miura, Y; Itoh, M; Michibata, Y; Kubota, R; Doura, T; Miura, E; Nonaka, H; Mizuno, S; Takahashi, S; Yuzaki, M; Hamachi, I; Kiyonaka, S

NATURE COMMUNICATIONS   13 巻 ( 1 ) 頁： 3167   2022年6月

Chemogenetics of cell surface receptors: beyond genetic and pharmacological approaches 国際誌 Open Access

Miura, Y; Senoo, A; Doura, T; Kiyonaka, S

RSC CHEMICAL BIOLOGY   3 巻 ( 3 ) 頁： 269 - 287   2022年3月

Superresolution imaging of native surface AMPA receptors in brain tissue

Vaidya, R; Kiyonaka, S; Hamachi, I; Chung, HJ; Selvin, PR

BIOPHYSICAL JOURNAL   121 巻 ( 3 ) 頁： 271A - 272A   2022年2月

Orthogonal Activation of Metabotropic Glutamate Receptor Using Coordination Chemogenetics 国際誌 Open Access

Senoo, A; Yamada, Y; Ojima, K; Doura, T; Hamachi, I; Kiyonaka, S

FRONTIERS IN CHEMISTRY   9 巻   頁： 825669   2022年1月

Frontier of Photopharmacology for High-speed Molecular Movies of Proteins Foreword Open Access

Nagasawa, H; Kiyonaka, S

YAKUGAKU ZASSHI-JOURNAL OF THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN   142 巻 ( 5 ) 頁： 477 - 478   2022年

Tethering-based chemogenetic approaches for the modulation of protein function in live cells 国際共著 国際誌

Tsai, YH; Doura, T; Kiyonaka, S

CHEMICAL SOCIETY REVIEWS   50 巻 ( 14 ) 頁： 7909 - 7923   2021年7月

Ligand-directed two-step labeling to quantify neuronal glutamate receptor trafficking 国際誌 Open Access

Ojima, K; Shiraiwa, K; Soga, K; Doura, T; Takato, M; Komatsu, K; Yuzaki, M; Hamachi, I; Kiyonaka, S

NATURE COMMUNICATIONS   12 巻 ( 1 ) 頁： 831   2021年2月

Construction of a Fluorescent Screening System of Allosteric Modulators for the GABA_A Receptor Using a Turn-On Probe 国際誌 Open Access

Sakamoto, S; Yamaura, K; Numata, T; Harada, F; Amaike, K; Inoue, R; Kiyonaka, S; Hamachi, I

ACS CENTRAL SCIENCE   5 巻 ( 9 ) 頁： 1541 - 1553   2019年9月

Construction of ligand assay systems by protein-based semisynthetic biosensors 国際誌

Sakamoto, S; Kiyonaka, S; Hamachi, I

CURRENT OPINION IN CHEMICAL BIOLOGY   50 巻   頁： 10 - 18   2019年6月

On-cell coordination chemistry: Chemogenetic activation of membrane-bound glutamate receptors in living cells

Kubota, R; Kiyonaka, S; Hamachi, I

CHEMICAL AND SYNTHETIC BIOLOGY APPROACHES TO UNDERSTAND CELLULAR FUNCTIONS - PT B   622 巻   頁： 411 - 430   2019年

Shank and Zinc Mediate an AMPA Receptor Subunit Switch in Developing Neurons 国際共著 国際誌 Open Access

Ha, HTT; Leal-Ortiz, S; Lalwani, K; Kiyonaka, S; Hamachi, I; Mysore, SP; Montgomery, JM; Garner, CC; Huguenard, JR; Kim, SA

FRONTIERS IN MOLECULAR NEUROSCIENCE   11 巻   頁： 405   2018年11月

Chemogenetic Approach Using Ni(II) Complex-Agonist Conjugates Allows Selective Activation of Class A G-Protein-Coupled Receptors 国際誌 Open Access

Kubota, R; Nomura, W; Iwasaka, T; Ojima, K; Kiyonaka, S; Hamachi, I

ACS CENTRAL SCIENCE   4 巻 ( 9 ) 頁： 1211 - 1221   2018年9月

Ligand-Directed Chemistry of AMPA Receptors Confers Live-Cell Fluorescent Biosensors 国際誌

Kiyonaka, S; Sakamoto, S; Wakayama, S; Morikawa, Y; Tsujikawa, M; Hamachi, I

ACS CHEMICAL BIOLOGY   13 巻 ( 7 ) 頁： 1880 - 1889   2018年7月

Intracellular thermometry with fluorescent sensors for thermal biology 国際誌 Open Access

Okabe, K; Sakaguchi, R; Shi, B; Kiyonaka, S

PFLUGERS ARCHIV-EUROPEAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY   470 巻 ( 5 ) 頁： 717 - 731   2018年5月

DNA Origami Scaffolds as Templates for Functional Tetrameric Kir3 K<SUP>+</SUP> Channels 国際誌

Kurokawa, T; Kiyonaka, S; Nakata, E; Endo, M; Koyama, S; Mori, E; Tran, NH; Dinh, H; Suzuki, Y; Hidaka, K; Kawata, M; Sato, C; Sugiyama, H; Morii, T; Mori, Y

ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION   57 巻 ( 10 ) 頁： 2586 - 2591   2018年3月

Molecular Technologies in Life Innovation: Novel Molecular Technologies for Labeling and Functional Control of Proteins Under Live Cell Conditions

Hamachi, I; Kiyonaka, S; Tamura, T; Kubota, R

MOLECULAR TECHNOLOGY, VOL 2: LIFE INNOVATION     頁： 297 - 328   2018年

Affinity-Guided Oxime Chemistry for Selective Protein Acylation in Live Tissue Systems 国際誌

Tamura, T; Song, ZN; Amaike, K; Lee, S; Yin, SF; Kiyonaka, S; Hamachi, I

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   139 巻 ( 40 ) 頁： 14181 - 14191   2017年10月

TRP channels in oxygen physiology: distinctive functional properties and roles of TRPA1 in O₂ sensing Open Access

Mori, Y; Takahashi, N; Kurokawa, T; Kiyonaka, S

PROCEEDINGS OF THE JAPAN ACADEMY SERIES B-PHYSICAL AND BIOLOGICAL SCIENCES   93 巻 ( 7 ) 頁： 464 - 482   2017年7月

Chemical labelling for visualizing native AMPA receptors in live neurons 国際誌 Open Access

Wakayama, S; Kiyonaka, S; Arai, I; Kakegawa, W; Matsuda, S; Ibata, K; Nemoto, YL; Kusumi, A; Yuzaki, M; Hamachi, I

NATURE COMMUNICATIONS   8 巻   頁： 14850   2017年4月

Construction of Protein-Based Biosensors Using Ligand-Directed Chemistry for Detecting Analyte Binding

Yamaura, K; Kiyonaka, S; Hamachi, I

ENZYMES AS SENSORS   589 巻   頁： 253 - 280   2017年

A conditional proteomics approach to identify proteins involved in zinc homeostasis

Miki, T; Awa, M; Nishikawa, Y; Kiyonaka, S; Wakabayashi, M; Ishihama, Y; Hamachi, I

NATURE METHODS   13 巻 ( 11 ) 頁： 931 - +   2016年11月

Discovery of allosteric modulators for GABA_A receptors by ligand-directed chemistry 国際誌

Yamaura, K; Kiyonaka, S; Numata, T; Inoue, R; Hamachi, I

NATURE CHEMICAL BIOLOGY   12 巻 ( 10 ) 頁： 822 - +   2016年10月

Allosteric activation of membrane-bound glutamate receptors using coordination chemistry within living cells 国際誌

Kiyonaka, S; Kubota, R; Michibata, Y; Sakakura, M; Takahashi, H; Numata, T; Inoue, R; Yuzaki, M; Hamachi, I

NATURE CHEMISTRY   8 巻 ( 10 ) 頁： 958 - 967   2016年10月

A Set of Organelle-Localizable Reactive Molecules for Mitochondrial Chemical Proteomics in Living Cells and Brain Tissues 国際誌

Yasueda, Y; Tamura, T; Fujisawa, A; Kuwata, K; Tsukiji, S; Kiyonaka, S; Hamachi, I

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   138 巻 ( 24 ) 頁： 7592 - 7602   2016年6月

Structure-activity relations of leucine derivatives reveal critical moieties for cellular uptake and activation of mTORC1-mediated signaling

Nagamori, S; Wiriyasermkul, P; Okuda, S; Kojima, N; Hari, Y; Kiyonaka, S; Mori, Y; Tominaga, H; Ohgaki, R; Kanai, Y

AMINO ACIDS   48 巻 ( 4 ) 頁： 1045 - 1058   2016年4月

Screening of Transient Receptor Potential Canonical Channel Activators Identifies Novel Neurotrophic Piperazine Compounds Open Access

Sawamura, S; Hatano, M; Takada, Y; Hino, K; Kawamura, T; Tanikawa, J; Nakagawa, H; Hase, H; Nakao, A; Hirano, M; Rotrattanadumrong, R; Kiyonaka, S; Mori, MX; Nishida, M; Hu, YP; Inoue, R; Nagata, R; Mori, Y

MOLECULAR PHARMACOLOGY   89 巻 ( 3 ) 頁： 348 - 363   2016年3月

Probing synaptic distribution and arrangement of native surface AMPAR in mouse brain slices with 3D super-resolution microscopy 国際共著 国際誌

Vaidya, RM; Nall, DL; Ma, DH; Huang, F; Kiyonaka, S; Hamachi, I; Chung, HJ; Selvin, PR

BIOPHYSICAL JOURNAL   122 巻 ( 3 ) 頁： 417A - 417A   2023年2月

Revisiting PFA-mediated tissue fixation chemistry:<i> FixEL</i> enables trapping of small molecules in the brain to visualize their distribution changes 査読有り 国際誌 Open Access

Nonaka, H; Mino, T; Sakamoto, S; Oh, JH; Watanabe, Y; Ishikawa, M; Tsushima, A; Amaike, K; Kiyonaka, S; Tamura, T; Aricescu, AR; Kakegawa, W; Miura, E; Yuzaki, M; Hamachi, I

CHEM   9 巻 ( 2 ) 頁： 523 - 540   2023年2月

A conditional proteomics approach to identify proteins involved in zinc homeostasis. 査読有り

Miki T, Awa M, Nishikawa Y, Kiyonaka S, Wakabayashi M, Ishihama Y, Hamachi I

Nature Methods   13 巻 ( 11 ) 頁： 931-937   2016年10月

DNA修復部位の可視化・制御機構解明を目指した蛍光タンパク質プローブの開発

深田 梨沙子、神谷 凌、小川 大輝、金岡 英徳、清中 茂樹

日本化学会第101春季年会  2021年3月 

新たな配位ケモジェネティクス(1): タンパク質構造変化の干渉に基づくグルタミン酸受容体の活性制御法開発

三浦 裕太、小島 憲人、浜地 格、清中 茂樹

日本化学会第101春季年会  2021年3月 

Ligand-directed two-step labeling to quantify AMPA-type glutamate receptor trafficking

Kento Ojima,Kyohei Soga, Itaru Hamachi, Shigeki Kiyonaka

2021年3月 

細胞外ループ工学によるGPCR化学遺伝学(1)：ECL2に着目したヒスタミン受容体の活性制御

柏 俊太朗、堂浦 智裕、清中 茂樹

日本化学会第101春季年会  2021年3月 

DNA修復機構解明を目指した分割蛍光タンパク質プローブによる細胞内イメージング

深田 梨沙子、小川 大輝、神谷 凌、金岡 英徳、清中 茂樹

iACEシンポジウム2021  2021年3月 

リガンド指向性化学を用いた2段階ラベル化戦略によるAMPA受容体の動態解析

小島　憲人、浜地　格、清中　茂樹

生理研研究会「シナプス研究会」  2020年12月 

DNA二重鎖切断修復でのfoci形成におけるSUMOタンパク質の機能解明

深田 梨沙子、小川 大輝、神谷 凌、金岡 英徳、清中 茂樹

第43回日本分子生物学会年会  2020年12月 

代謝型グルタミン酸受容体のin vivo活性制御を指向した新たな化学遺伝学的手法の開発

堂浦 智裕、長谷川 寛太、清中 茂樹

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月 

配位ケモジェネティクスによる GABAB 受容体のアロステリック活性化

曽我 恭平、小島 憲人、道旗 友紀子、浜地 格、清中 茂樹

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月 

配位ケモジェネティクスによる細胞種・サブタイプ選択的なグルタミン酸受容体の活性阻害法開発

三浦 裕太、小島 憲人、美野 丈晴、浜地 格、清中 茂樹

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月 

細胞種直交的活性化に向けた受容体エンジニアリング法の開発

山田 裕太郎、小島 憲人、浜地 格、清中 茂樹

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月 

代謝型グルタミン酸受容体の細胞外ループに注目した新たな化学遺伝学手法の開発

長谷川 寛太、堂浦 智裕、清中 茂樹

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月 

神経伝達物質受容体の機能を解き明かすためのニューロケミカルバイオロジー 招待有り

清中 茂樹

第４４回白金シンポジウム  2020年2月