所属
大学院医学系研究科 附属神経疾患・腫瘍分子医学研究センター 腫瘍病態統御部門 講師
大学院担当
大学院医学系研究科
学部担当
医学部 医学科
職名
講師
シンジョウ ケイコ
新城 恵子
SHINJO Keiko
学位 1
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医学博士 （ 2012年7月 名古屋大学 ）
研究キーワード 2
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エピジェネティクス
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がん
研究分野 1
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ライフサイエンス / 分子生物学 / がん
現在の研究課題とSDGs 3
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膵臓がんのがん間質ダイナミクスを制御する機能性RNAの同定と標的化
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EZH2過剰発現により誘導される新規異常複合体の解明
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シングルセルエピゲノム解析による膵臓がん悪性化に関与する非翻訳RNAの同定
経歴 1
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名古屋大学 大学院医学系研究科 附属神経疾患・腫瘍分子医学研究センター 腫瘍病態統御部門 講師
2017年7月 - 現在
学歴 2
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名古屋大学 医学系研究科
2008年4月 - 2012年3月
国名： 日本国
-
北海道大学 医学部
- 1996年3月
国名： 日本国
所属学協会 3
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日本がん分子標的治療学会 評議員
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日本癌学会 評議員
受賞 3
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2011 AACR-GlaxoSmithKline Outstanding Clinical Scholars
2011年4月 American Association for Cancer Research Integrated analysis of genetic and epigenetic alterations reveals CpG island methylator phenotype associated with clinical outcome of lung adenocarcinoma
Keiko Shinjo
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AstraZeneca International Scholar-in-Training Award
2010年1月 American Association for Cancer Research Significance of CpG island methylator phenotype in human lung cancers
Keiko Shinjo
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第25回日本がん分子標的治療学会学術集会 優秀演題賞
2021年5月 日本がん分子標的治療学会 新規LSD1阻害剤の開発
新城恵子
論文 53
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Mutation of the SWI/SNF complex component Smarce1 decreases nucleosome stability in ES cells and impairs differentiation.
Kashiwagi K, Yoshida J, Kimura H, Shinjo K, Kondo Y, Horie K
Journal of cell science 2024年2月
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Astrocyte-induced mGluR1 activates human lung cancer brain metastasis via glutamate-dependent stabilization of EGFR.
Ishibashi K, Ichinose T, Kadokawa R, Mizutani R, Iwabuchi S, Togi S, Ura H, Tange S, Shinjo K, Nakayama J, Nanjo S, Niida Y, Kondo Y, Hashimoto S, Sahai E, Yano S, Nakada M, Hirata E
Developmental cell 2024年1月
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Shibuki, T; Mizuno, N; Kobayashi, N; Hirano, H; Tsuchikawa, T; Matsumoto, S; Okuyama, H; Sasaki, E; Shinjo, K; Yamaguchi, R; Kawata, T; Hosoda, W
ANNALS OF ONCOLOGY 34 巻 頁： S701 - S701 2023年10月
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Suzuki, MM; Iijima, K; Ogami, K; Shinjo, K; Murofushi, Y; Xie, JQ; Wang, XB; Kitano, Y; Mamiya, A; Kibe, Y; Nishimura, T; Ohka, F; Saito, R; Sato, S; Kobayashi, J; Yao, R; Miyata, K; Kataoka, K; Suzuki, HI; Kondo, Y
NATURE COMMUNICATIONS 14 巻 ( 1 ) 頁： 4521 2023年8月
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Takahashi, H; Yasui, T; Hirano, M; Shinjo, K; Miyazaki, Y; Shinoda, W; Hasegawa, T; Natsume, A; Kitano, Y; Ida, M; Zhang, M; Shimada, T; Paisrisarn, P; Zhu, ZT; Ohka, F; Aoki, K; Rahong, S; Nagashima, K; Yanagida, T; Baba, Y
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS 234 巻 頁： 115318 2023年8月
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Muraoka, A; Suzuki, M; Hamaguchi, T; Watanabe, S; Iijima, K; Murofushi, Y; Shinjo, K; Osuka, S; Hariyama, Y; Ito, M; Ohno, K; Kiyono, T; Kyo, S; Iwase, A; Kikkawa, F; Kajiyama, H; Kondo, Y
SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE 15 巻 ( 700 ) 頁： eadd1531 2023年6月
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Rapid detection of the MYD88 L265P mutation for pre- and intra-operative diagnosis of primary central nervous system lymphoma
Yamaguchi Junya, Ohka Fumiharu, Kitano Yotaro, Maeda Sachi, Motomura Kazuya, Aoki Kosuke, Takeuchi Kazuhito, Nagata Yuichi, Hattori Hikaru, Tsujiuchi Takashi, Motomura Ayako, Nishikawa Tomohide, Kibe Yuji, Shinjo Keiko, Kondo Yutaka, Saito Ryuta
CANCER SCIENCE 2023年3月
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A new layer of epigenetic regulation in cancer cells
Shinjo, K
CANCER SCIENCE 114 巻 頁： 702 - 702 2023年2月
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Maintenance of genome stability in cancer cells by long noncoding RNA
Suzuki, M; Iijima, K; Shinjo, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 114 巻 頁： 190 - 190 2023年2月
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Investigation of novel therapeutic targets for brain metastasis using MGS method
Ishibashi, K; Shinjo, K; Kondo, Y; Hirata, E
CANCER SCIENCE 114 巻 頁： 2131 - 2131 2023年2月
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Identification of long non-coding RNA and protein interactions through CRISPR-Cas13 system
Xie, J; Suzuki, M; Iijima, K; Shinjo, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 114 巻 頁： 1561 - 1561 2023年2月
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Combination therapy with cisplatin and inhibition stress granule formation in lung cancer cells
Hayai, S; Suzuki, M; Shinjo, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 114 巻 頁： 434 - 434 2023年2月
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A new LSD1 inhibitor targeting glioma and reveal its mechanism of action
Shinjo, K; Murofushi, Y; Suzuki, M; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 114 巻 頁： 558 - 558 2023年2月
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CA19-9 in Combination with Methylated HOXA1 and SST Is Useful to Diagnose Stage I Pancreatic Cancer
Suehiro Yutaka, Suenaga Shigeyuki, Kunimune Yuki, Yada Shoko, Hamamoto Kaori, Tsuyama Takanori, Amano Shogo, Matsui Hiroto, Higaki Shingo, Fujii Ikuei, Suzuki Chieko, Hoshida Tomomi, Matsumoto Toshihiko, Fujimoto Yuko, Kaino Seiji, Shinjo Keiko, Kondo Yutaka, Sakaida Isao, Takami Taro, Nagano Hiroaki, Yamasaki Takahiro
ONCOLOGY 100 巻 ( 12 ) 頁： 674 - 684 2022年10月
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Characteristic DNA methylation profiles of chorionic villi in recurrent miscarriage
Matsumoto Yosuke, Shinjo Keiko, Mase Shoko, Fukuyo Masaki, Aoki Kosuke, Ozawa Fumiko, Yoshihara Hiroyuki, Goto Shinobu, Kitaori Tamao, Ozaki Yasuhiko, Takahashi Satoru, Kaneda Atsushi, Sugiura-Ogasawara Mayumi, Kondo Yutaka
SCIENTIFIC REPORTS 12 巻 ( 1 ) 頁： 11673 2022年7月
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Effectiveness of NLRP3 Inhibitor as a Non-Hormonal Treatment for ovarian endometriosis
Murakami Mayuko, Osuka Satoko, Muraoka Ayako, Hayashi Shotaro, Bayasula, Kasahara Yukiyo, Sonehara Reina, Hariyama Yumi, Shinjo Kanako, Tanaka Hideaki, Miyake Natsuki, Yoshita Sayako, Nakanishi Natsuki, Nakamura Tomoko, Goto Maki, Kajiyama Hiroaki
REPRODUCTIVE BIOLOGY AND ENDOCRINOLOGY 20 巻 ( 1 ) 頁： 58 2022年3月
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A new LSD1 inhibitor targeting glioma and its mechanism
Shinjo, K; Murofushi, Y; Suzuki, M; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 113 巻 頁： 510 - 510 2022年2月
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The concept of cancer associated glial-network in brain metastasis.
Ishibashi, K; Shinjo, K; Kondo, Y; Hirata, E
CANCER SCIENCE 113 巻 頁： 922 - 922 2022年2月
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Long noncoding RNA TUG1 regulates R-loop resolution and maintains cancer cell proliferation
Suzuki, M; Iijima, K; Shinjo, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 113 巻 2022年2月
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Newly established patient-derived organoid model of intracranial meningioma
Yamazaki Shintaro, Ohka Fumiharu, Hirano Masaki, Shiraki Yukihiro, Motomura Kazuya, Tanahashi Kuniaki, Tsujiuchi Takashi, Motomura Ayako, Aoki Kosuke, Shinjo Keiko, Murofushi Yoshiteru, Kitano Yotaro, Maeda Sachi, Kato Akira, Shimizu Hiroyuki, Yamaguchi Junya, Adilijiang Alimu, Wakabayashi Toshihiko, Saito Ryuta, Enomoto Atsushi, Kondo Yutaka, Natsume Atsushi
NEURO-ONCOLOGY 23 巻 ( 11 ) 頁： 1936 - 1948 2021年11月
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Annealed ZnO/Al2O3 Core-Shell Nanowire as a Platform to Capture RNA in Blood Plasma
Takahashi Hiromi, Yasui Takao, Klamchuen Annop, Khemasiri Narathon, Wuthikhun Tuksadon, Paisrisarn Piyawan, Shinjo Keiko, Kitano Yotaro, Aoki Kosuke, Natsume Atsushi, Rahong Sakon, Baba Yoshinobu
NANOMATERIALS 11 巻 ( 7 ) 2021年7月
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Microheater-integrated zinc oxide nanowire microfluidic device for hybridization-based detection of target single-stranded DNA
Takahashi Hiromi, Yasui Takao, Kashida Hiromu, Makino Koki, Shinjo Keiko, Liu Quanli, Shimada Taisuke, Rahong Sakon, Kaji Noritada, Asanuma Hiroyuki, Baba Yoshinobu
NANOTECHNOLOGY 32 巻 ( 25 ) 2021年6月
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Cancer-Specific Targeting of Taurine-Upregulated Gene 1 Enhances the Effects of Chemotherapy in Pancreatic Cancer
Tasaki Yoshihiko, Suzuki Miho, Katsushima Keisuke, Shinjo Keiko, Iijima Kenta, Murofushi Yoshiteru, Naiki-Ito Aya, Hayashi Kazuki, Qiu Chenjie, Takahashi Akiko, Tanaka Yoko, Kawaguchi Tokuichi, Sugawara Minoru, Kataoka Tomoya, Naito Mitsuru, Miyata Kanjiro, Kataoka Kazunori, Noda Tetsuo, Gao Wentao, Kataoka Hiromi, Takahashi Satoru, Kimura Kazunori, Kondo Yutaka
CANCER RESEARCH 81 巻 ( 7 ) 頁： 1654 - 1666 2021年4月
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Hayai, S; Iijima, K; Suzuki, M; Shinjo, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 112 巻 頁： 292 - 292 2021年2月
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The concept of cancer-promotive and cancer-suppressive brain microenvironment.
Ishibashi, K; Shinjo, K; Kondo, Y; Hirata, E
CANCER SCIENCE 112 巻 頁： 691 - 691 2021年2月
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Suzuki, M; Shinjo, K; Iijima, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 112 巻 頁： 339 - 339 2021年2月
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Long Non-coding RNA TUG1 governs replication stress in cancer cells
Iijima, K; Suzuki, M; Shinjo, K; Kobayashi, J; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 112 巻 頁： 1045 - 1045 2021年2月
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LncRNA TUG1 is a potent therapeutic target via enhancing 5-FU sensitivity in pancreatic cancer.
Tasaki, Y; Katsushima, K; Shinjo, K; Suzuki, M; Iijima, K; Miyata, K; Kataoka, K; Kimura, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 112 巻 頁： 440 - 440 2021年2月
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Identification of a Novel EZH2 Complex in Cancer
Shinjo, K; Iijima, K; Suzuki, M; Kaneko, H; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 112 巻 頁： 336 - 336 2021年2月
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Rare genetic variants in the gene encoding histone lysine demethylase 4C (KDM4C) and their contributions to susceptibility to schizophrenia and autism spectrum disorder
Kato Hidekazu, Kushima Itaru, Mori Daisuke, Yoshimi Akira, Aleksic Branko, Nawa Yoshihiro, Toyama Miho, Furuta Sho, Yu Yanjie, Ishizuka Kanako, Kimura Hiroki, Arioka Yuko, Tsujimura Keita, Morikawa Mako, Okada Takashi, Inada Toshiya, Nakatochi Masahiro, Shinjo Keiko, Kondo Yutaka, Kaibuchi Kozo, Funabiki Yasuko, Kimura Ryo, Suzuki Toshimitsu, Yamakawa Kazuhiro, Ikeda Masashi, Iwata Nakao, Takahashi Tsutomu, Suzuki Michio, Okahisa Yuko, Takaki Manabu, Egawa Jun, Someya Toshiyuki, Ozaki Norio
TRANSLATIONAL PSYCHIATRY 10 巻 ( 1 ) 2020年12月
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The Brain Microenvironment Induces DNMT1 Suppression and Indolence of Metastatic Cancer Cells
Hirata Eishu, Ishibashi Kojiro, Kohsaka Shinji, Shinjo Keiko, Kojima Shinya, Kondo Yutaka, Mano Hiroyuki, Yano Seiji, Kiyokawa Etsuko, Sahai Erik
ISCIENCE 23 巻 ( 9 ) 頁： 101480 2020年9月
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Peritoneal Lavage Tumor DNA as a Novel Biomarker for Predicting Peritoneal Recurrence in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
Suenaga Masaya, Fujii Tsutomu, Yamada Suguru, Hayashi Masamichi, Shinjo Keiko, Takami Hideki, Niwa Yukiko, Sonohara Fuminori, Shimizu Dai, Kanda Mitsuro, Kobayashi Daisuke, Tanaka Chie, Nakayama Goro, Koike Masahiko, Fujiwara Michitaka, Kondo Yutaka, Kodera Yasuhiro
ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY 2020年9月
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Autocrine HGF/c-Met signaling pathway confers aggressiveness in lymph node adult T-cell leukemia/lymphoma
Totani Haruhito, Shinjo Keiko, Suzuki Miho, Katsushima Keisuke, Mase Shoko, Masaki Ayako, Ito Asahi, Ri Masaki, Kusumoto Shigeru, Komatsu Hirokazu, Ishida Takashi, Inagaki Hiroshi, Iida Shinsuke, Kondo Yutaka
ONCOGENE 39 巻 ( 35 ) 頁： 5782 - 5794 2020年8月
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A novel sensitive detection method for DNA methylation in circulating free DNA of pancreatic cancer
Shinjo Keiko, Hara Kazuo, Nagae Genta, Umeda Takayoshi, Katsushima Keisuke, Suzuki Miho, Murofushi Yoshiteru, Umezu Yuta, Takeuchi Ichiro, Takahashi Satoru, Okuno Yusuke, Matsuo Keitaro, Ito Hidemi, Tajima Shoji, Aburatani Hiroyuki, Yamao Kenji, Kondo Yutaka
PLOS ONE 15 巻 ( 6 ) 2020年6月
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H3F3A mutant allele specific imbalance in an aggressive subtype of diffuse midline glioma, H3 K27M-mutant
Maeda Sachi, Ohka Fumiharu, Okuno Yusuke, Aoki Kosuke, Motomura Kazuya, Takeuchi Kazuhito, Kusakari Hironao, Yanagisawa Nobuyuki, Sato Shinya, Yamaguchi Junya, Tanahashi Kuniaki, Hirano Masaki, Kato Akira, Shimizu Hiroyuki, Kitano Yotaro, Yamazaki Shintaro, Yamashita Shinji, Takeshima Hideo, Shinjo Keiko, Kondo Yutaka, Wakabayashi Toshihiko, Natsume Atsushi
ACTA NEUROPATHOLOGICA COMMUNICATIONS 8 巻 ( 1 ) 2020年2月
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Pathogenic Epigenetic Consequences of Genetic Alterations in IDH-Wild-Type Diffuse Astrocytic Gliomas
Ohka Fumiharu, Shinjo Keiko, Deguchi Shoichi, Matsui Yusuke, Okuno Yusuke, Katsushima Keisuke, Suzuki Miho, Kato Akira, Ogiso Noboru, Yamamichi Akane, Aoki Kosuke, Suzuki Hiromichi, Sato Shinya, Rayan Nirmala Arul, Prabhakar Shyam, Goke Jonathan, Shimamura Teppei, Maruyama Reo, Takahashi Satoru, Suzumura Akio, Kimura Hiroshi, Wakabayashi Toshihiko, Zong Hui, Natsume Atsushi, Kondo Yutaka
CANCER RESEARCH 79 巻 ( 19 ) 頁： 4814 - 4827 2019年10月
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Identification of a chemical modulator of EZH2-mediated silencing by cell-based high-throughput screening assay
Murashima Akihiro, Shinjo Keiko, Katsushima Keisuke, Onuki Tetsuo, Kondoh Yasumitsu, Osada Hiroyuki, Kagaya Noritaka, Shin-ya Kazuo, Kimura Hiroshi, Yoshida Minoru, Murakami Shingo, Kondo Yutaka
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 166 巻 ( 1 ) 頁： 41 - 50 2019年7月
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DNA methylation inhibitor attenuates polyglutamine-induced neurodegeneration by regulating Hes5
Kondo Naohide, Tohnai Genki, Sahashi Kentaro, Iida Madoka, Kataoka Mayumi, Nakatsuji Hideaki, Tsutsumi Yutaka, Hashizume Atsushi, Adachi Hiroaki, Koike Haruki, Shinjo Keiko, Kondo Yutaka, Sobue Gen, Katsuno Masahisa
EMBO MOLECULAR MEDICINE 11 巻 ( 5 ) 2019年5月
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ZNF671 DNA methylation as a molecular predictor for the early recurrence of serous ovarian cancer
Mase Shoko, Shinjo Keiko, Totani Haruhito, Katsushima Keisuke, Arakawa Atsushi, Takahashi Satoru, Lai Hung-Cheng, Lin Ru-Inn, Chan Michael W. Y., Sugiura-Ogasawara Mayumi, Kondo Yutaka
CANCER SCIENCE 110 巻 ( 3 ) 頁： 1105 - 1116 2019年3月
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A Novel Diagnostic Method to Detect Aberrant DNA Methylation in cfDNA of Pancreas Cancer Patients
Shinjo, K; Katsushima, K; Nagae, G; Aburatani, H; Yamao, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 205 - 205 2018年12月
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Tumorigenic role of non-coding RNA, TUG1 in pancreatic cancer
Tasaki, Y; Katsushima, K; Shinjo, K; Suzuki, M; Totani, H; Mase, S; Murashima, A; Miyata, K; Kataoka, K; Kimura, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 1250 - 1250 2018年12月
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The roles of HGF/c-Met pathway in adult T-cell leukemia/lymphoma
Totani, H; Shinjo, K; Tasaki, Y; Murashima, A; Mase, S; Yamamichi, A; Suzuki, M; Katsushima, K; Ishida, T; Iida, S; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 508 - 508 2018年12月
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Study of Novel Inhibitor of EZH2/PRC2 in Cancer Cells
Murashima, A; Shinjo, K; Katsushima, K; Onuki, T; Ito, A; Yoshida, M; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 1175 - 1175 2018年12月
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Development of anticancer agents targeting long non-coding RNA
Katsushima, K; Natsume, A; Ohka, F; Shinjo, K; Shibata, T; Miyata, K; Kataoka, K; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 352 - 352 2018年12月
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Shinjo, K; Katsushima, K; Suzuki, M; Nagae, G; Aburatani, H; Yamao, K; Kondo, Y
CANCER RESEARCH 78 巻 ( 13 ) 2018年7月
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A novel high-sensitivity assay to detect a small fraction of mutant IDH1 using droplet digital PCR
Hirano Masaki, Ohka Fumiharu, Maeda Sachi, Chalise Lushun, Yamamichi Akane, Aoki Kosuke, Kato Akira, Tanahashi Kuniaki, Motomura Kazuya, Nishimura Yusuke, Hara Masahito, Shinjo Keiko, Kondo Yutaka, Wakabayashi Toshihiko, Natsume Atsushi
BRAIN TUMOR PATHOLOGY 35 巻 ( 2 ) 頁： 97-105 2018年4月
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Development of anticancer agents targeting long non-coding RNA TUG1
Katsushima Keisuke, Natsume Atsushi, Ohka Fumiharu, Deguchi Shoichi, Shinjo Keiko, Shibata Tatsuhiro, Miyata Kanjiro, Kataoka Kazunori, Kondo Yutaka
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 398 - 398 2018年1月
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Identification of a novel biomarker, ZNF671, for detection of early recurrence of serous ovarian cancer
Mase Shoko, Shinjo Keiko, Totani Haruhito, Katsushima Keisuke, Chan Michael W. Y., Kondo Yutaka
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 240 - 240 2018年1月
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Identification of potential inhibitors for EZH2/PRC2 in cancer cells
Murashima, A; Shinjo, K; Dohi, N; Katsushima, K; Ito, A; Onuki, T; Yoshida, M; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 621 - 621 2018年1月
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Ohka, F; Natsume, A; Suzuki, H; Aoki, K; Deguchi, S; Katsushima, K; Shinjo, K; Wakabayashi, T; Kondo, Y
CANCER SCIENCE 109 巻 頁： 463 - 463 2018年1月
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POLYION COMPLEX-MEDIATED INTRAVENOUS DELIVERY OF ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES AGAINST THE NOTCH-REGULATED NON-CODING RNA TUG1 IN GLIOMA
Natsume Atsushi, Katsushima Keisuke, Ohka Fumiharu, Shinjo Keiko, Miyata Kanjiro, Kataoka Kazunori, Kondo Yutaka
NEURO-ONCOLOGY 19 巻 頁： 265 - 265 2017年11月
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Long non-coding RNAs as an epigenetic regulator in human cancers
Kondo Yutaka, Shinjo Keiko, Katsushima Keisuke
CANCER SCIENCE 108 巻 ( 10 ) 頁： 1927-1933 2017年10月
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Oncogenic effects of evolutionarily conserved noncoding RNA ECONEXIN on gliomagenesis
Deguchi S., Katsushima K., Hatanaka A., Shinjo K., Ohka F., Wakabayashi T., Zong H., Natsume A., Kondo Y.
ONCOGENE 36 巻 ( 32 ) 頁： 4629-4640 2017年8月
書籍等出版物 9
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がんゲノムペディア
新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: エピゲノム創薬）
羊土社 2024年2月 （ ISBN:978-4-7581-2130-9 ）
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胆と膵 新時代のKRAS変異～診断の主役から治療の標的へ～
新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: 膵癌における血中KRAS変異を含めた新たな遺伝子診断法の開発）
医学図書出版 2023年7月
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遺伝を考える
63. 新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: “エピジェネティクス”）
日本医師会雑誌 2023年6月
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論文図表を読む作法
新城恵子（ 担当： 共著 , 範囲: デジタルPCR）
羊土社 2022年 （ ISBN:978-4-7581-2260-3 ）
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リアルタイム・デジタルPCR実験スタンダード
新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: デジタルPCRを用いたcfDNAのDNAメチル化解析）
羊土社 2022年 （ ISBN:978-4-7581-2257-3 ）
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疾患の原因遺伝子・タンパク質の解析と診断/治療技術の開発
新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: がんの発症に関与するエピゲノム異常の探索 ―非翻訳RNAによるエピゲノム制御―）
技術情報協会 2022年
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進化するがん創薬
新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: エピゲノム標的薬）
化学同人 2019年 （ ISBN:978-4-7598-1733-1 ）
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リキッドバイオプシー
新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: 血中DNAメチル化解析とがん診断）
シーエムシー出版 2017年 （ ISBN:978-4-7813-1259-0 ）
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エピジェネティクス実験スタンダード
新城恵子、近藤豊（ 担当： 共著 , 範囲: パイロシークエンス法）
羊土社 2017年 （ ISBN:978-4-7581-0199-8 ）
講演・口頭発表等 7
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脳腫瘍を標的とした新規LSD1阻害剤の開発
新城恵子、梅原崇史、室伏 善照、鈴木美穂、近藤 豊
第82回日本癌学会学術総会 2023年9月23日 日本癌学会
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LSD1を標的とした脳腫瘍の新規治療薬の開発
新城恵子、梅原崇史、近藤 豊
第27回分子標的治療学会学術集会 2023年6月22日 分子標的治療学会
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新規LSD1阻害剤の開発と脳腫瘍に対する治療効果
新城恵子、梅原崇史、鈴木美穂、近藤 豊
第16回エピジェネティクス研究会年会 2023年6月20日 日本エピジェネティクス研究会
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がんエピジェネティクスの新展開
新城恵子
第81回日本癌学会学術総会 2022年9月30日 日本癌学会学
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脳腫瘍を標的とした新規LSD1阻害剤の開発とその機序の解明
新城恵子
第81回日本癌学会学術総会 2022年9月29日 日本癌学会学
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脳腫瘍に対する新規LSD1阻害剤の治療効果
新城恵子
第26回分子標的治療学会学術集会 2022年6月30日 分子標的治療学会
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新規LSD1阻害剤の開発と脳腫瘍に対する治療効果
新城恵子
第15回エピジェネティクス研究会年会 2022年6月9日 日本エピジェネティクス研究会
科研費 5
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シングルセルエピゲノム解析による膵臓がん悪性化に関与する非翻訳長鎖RNAの同定
研究課題/研究課題番号：23K06633 2023年4月 - 2026年3月
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
新城 恵子
担当区分：研究代表者
配分額：4810000円 （ 直接経費：3700000円 、 間接経費：1110000円 ）
KPCマウスを用いて膵臓がん悪性化に関わるlncRNAの同定を目指す。KPCマウスでは膵臓特異的にKRAS変異とTP53変異が誘導され、生後3週では正常膵臓組織であるが、8週では前がん病変である膵上皮内腫瘍性病変（PanIN）、12週以降では膵臓がん病変を有する。それぞれの段階で膵臓組織を回収してscATAC-seqとscRNA-seqを行い、膵臓がん悪性化に関わるlncRNAを同定する。
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神経線維腫症1型の特性から解明するScarless Wound Healing
研究課題/研究課題番号：21K09763 2021年4月 - 2024年3月
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
大石 真由美, 新城 恵子, 高成 啓介, 橋川 和信, 蛯沢 克己, 神戸 未来, 樋口 慎一, 山本 周平, 亀井 譲
担当区分：研究分担者
本研究の目的は神経線維腫症1型(NF-1)の創傷治癒から瘢痕抑制のメカニズムを解明し、scarless wound healingを可能とする新規治療薬を開発することである。NF-1では手術後の瘢痕が目立ちにくく、肥厚性瘢痕やケロイドを生じにくいことが経験的に知られているが、NF-1の創傷治癒過程における過剰な瘢痕形成を抑制するメカニズムは明らかではない。現在行われている瘢痕治療の効果は限定的であり、手術や外傷後に傷あとが残ることは不可避であったが、NF-1に特有な創傷治癒メカニズムを再現することで、scarless wound healingの実現を試みる。
現在行われている瘢痕治療の効果は限定的であり、手術や外傷後に傷あとが残ることは不可避である。一方、神経線維腫症１型（NF-1）では手術後の瘢痕が目立ちにくく、肥厚性瘢痕やケロイドを生じにくいことが経験的に知られているが、NF-1の創傷治癒過程における過剰な瘢痕形成を抑制するメカニズムは明らかではない。本研究の目的は、NF-1の創傷治癒から瘢痕抑制のメカニズムを解明し、scarless wound healingを可能とする新規治療薬を開発することである。
本年度はヒト皮膚線維芽細胞を用いた実験系の確立に焦点を当てて研究を行った。まずNF-1患者・非患者をリクルートし、これらのドナーから皮膚組織を採取した。皮膚組織から線維芽細胞の単離培養を行ったところ、これらの培養線維芽細胞は安定的に継代することができ、核酸抽出が可能であった。次にin vitroで創傷環境を再現するための刺激実験を行った。NF-1非患者から単離培養した正常皮膚線維芽細胞の培養液中へTGFβ-1を24時間添加し、主要な創傷治癒関連遺伝子の発現量を定量した。その結果、筋線維芽細胞マーカーであるαSMAの発現量はTGFβ-1刺激後に上昇することが確認できたものの、一方で組織修復に必要な細胞外基質であるⅠ型コラーゲンを構成するCOL1A2の発現量はTGFβ-1刺激後も不変であった。次年度以降は、より生体内に近い創傷環境を培養線維芽細胞で再現するための刺激条件を引き続き検討することに加えて、網羅的遺伝子発現解析を行う予定である。
ドナーから採取した検体からの線維芽細胞単離およびRNA抽出に関しては予定通り進めることができたが、培養条件下で創傷環境を再現するための刺激条件の最適化が予想以上に困難であった。成長因子およびサイトカインを用いた刺激条件の検討が引き続き必要であるものの、本年度は研究代表者が産前産後休暇を取得したため進捗が遅れている。
今後の解析を進めるにあたって、より生体内に近い創傷環境を培養線維芽細胞で再現する必要がある。成長因子およびサイトカインを用いた刺激条件を引き続き検討する予定である。 -
膵臓がんのがん間質ダイナミクスを制御する機能性RNAの同定と標的化
研究課題/研究課題番号：19KK0209 2019年10月 - 2022年3月
国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))
新城 恵子
担当区分：研究代表者
配分額：18460000円 （ 直接経費：14200000円 、 間接経費：4260000円 ）
がん細胞に対する分子標的薬の開発が目覚ましく進む中、膵臓がんにはいまだに有効な治療法がない。その原因の一つとしてがん細胞の周囲に存在するがん関連線維芽細胞（CAF)の存在が指摘されている。CAFはがん細胞の増殖および進展に促進的に働くことや、がん組織内の細胞へ薬物送達を妨げているなど、様々な機能を果たしていることが考えられる。CAFの性格を決める分子として長鎖非翻訳RNA (long non-coding RNA, lncRNA) に注目し、国際共同研究を推進する。膵臓がんマウスモデルを用いて、実際の生体内で膵臓がんの進展に関わるCAFを同定し、その機能を解析する。
がん細胞に対する分子標的薬の開発が目覚ましく進む中、膵臓がんにはいまだに有効な治療法がない。その原因の一つとしてがん細胞の周囲に存在するがん関連線維芽細胞（CAF）とがん細胞の相互作用が挙げられる。CAFにはがんの悪性化に促進的に働くCAFのみならず、抑制的に働くCAFが存在することが明らかになりつつあり、腫瘍の進展に伴いCAFの性質が動的に変化する可能性が推測されている。
本研究ではCAFの可塑性にかかわり、一方でCAFの個性を規定する分子として長鎖非翻訳RNA (long non-coding RNA, lncRNA) に注目し、トロント大学のDaniel Schramek 博士と国際共同研究を推進する。膵臓がん細胞皮下移植モデルを用いてCRISPRiによるlncRNAのin vivo網羅的解析システムを構築し、膵臓がんの進展にかかわるCAF関連lncRNAの同定を試みる。さらに同定した膵臓がんの悪性化にかかわるlncRNAを標的とした核酸医薬の開発を試みる。
CRISPRスクリーニングのため、ヒトとマウスで保存されている長鎖非翻訳RNAを約１９０選択した。それぞれの標的に対するgRNAの設計はSchramek 博士が行い、合成を開始した。
1次スクリーニングはin vitroで行うこととし、膵臓がん同所移植マウスモデルからCAFの樹立する系を構築した。複数ラインのCAFを樹立し、CAFのマーカー遺伝子の発現状態を確認している。実際に用いる予定のマウス（Meflin-dTomato, Cas9-GFP) の準備を開始した。これらのマウスを交配して作成したMeflin-dTomato：Cas9-GFPマウスにおいて膵臓に腫瘍を移植してCAFを樹立してスクリーニングに用いる。
膵臓がん同所移植マウスモデルを構築し、CAFを培養する系の構築が完成した。
また、2020年2月にはトロント大学で共同研究者のSchramek、榎本、近藤、新城でミーティングを行い、実験系の細かな打ち合わせをすることができ、今後の方向性が明確となった。
CRISPRスクリーニングのため、ヒトとマウスで保存されている長鎖非翻訳RNAを選び、gRNAライブラリーの設計まで完了し、合成を開始した。 スクリーニングで用いるマウスの準備（Meflin-dTomato, Cas9-GFP)の準備を開始した。
Meflin-dTomato； Cas9-GFPマウスで膵臓がん同所移植を行い、CAFを樹立する。このCAFを用い、in vitroでCRISPRスクリーニングを行い、CAFのダイナミクスに関わるlncRNAを同定する。CAFはがん細胞のみならず免疫細胞等の様々な細胞と相互作用しているため、2次スクリーニングはin vivoで screeningする必要がある。これらのスクリーニングから、最終的に膵臓がんの進展にかかわるCAFのlncRNAを同定する予定である。同定したlncRNAの機能を詳細に解析し、どのように膵臓がんの悪性化に寄与するかを検討する。
CAFを標的とした治療は、CAFの多様性からこれまで困難であったが、lncRNAを標的とした新規核酸医薬治療法は新たなCAFを標的とした治療になりうる。スクリーニングから同定したlncRNAを標的とし、治療としての有用性を評価する。 -
EZH2過剰発現により誘導される新規異常複合体の解明
研究課題/研究課題番号：19K07661 2019年4月 - 2022年3月
新城 恵子
担当区分：研究代表者
配分額：4420000円 （ 直接経費：3400000円 、 間接経費：1020000円 ）
EZH2はヒストンメチル化酵素であり、EZH2の発現亢進は多くのがんで観察される。近年EZH2の酵素活性を阻害する薬の開発が進んでいるが、EZH2酵素活性阻害薬は、EZH2が過剰発現した腫瘍のすべてで有効ではなく、EZH2の本来の酵素活性に非依存的な発がんへの関与が注目されている。本研究では我々が見出したEZH2の新規複合体の解明を試みる。この新規複合体はEZH2高発現による悪性化の原因解明につながると考える。さらに新規複合体形成を阻害することは新たな治療標的となりうる。本研究により、EZH2高発現の腫瘍における新たな分子メカニズムの解明が可能であると考える。
EZH2過剰発現により、がんは悪性度の高い性質を持つことが多いが、その機序は明確ではない。一方で、EZH2はがんにおいて異常な複合体を形成することが報告されている。我々はEZH2過剰発現している腫瘍細胞において、EZH2はこれまでに複合体を作ることが報告されていないタンパク質（ヒストンメチル化酵素X）と複合体を形成していることを見出し、この機能を明らかにすることを目的として研究を行っている。
この新規EZH2複合体は通常の複合体とは別の新たな機能を獲得している可能性があるため、この複合体に含まれるタンパクを同定するために免疫沈降を複数のがん細胞株で行なった。ヒストンメチル化酵素Xで免疫沈降を行うと、EZH2のみではなく、SUZ12も結合していることが明らかになった。また、この新規複合体は複数のがん細胞株で存在することも明らかとなった。さらに細胞株を追加して検討を行い、どのような細胞でこの新規複合体が存在するかを、各種がん細胞、正常細胞において検討する。EZH2の発現量と細胞の遺伝子変異などの情報を合わせて検討し、新規複合体ができる条件を明らかとする。
新規複合体にのみ含まれるタンパクを質量分析で同定するため、それぞれのタンパク質にタグタンパク質をつけたベクターを作成している。このベクターを使用してクロマチン免疫沈降も予定しており、それぞれのタグタンパクによるChIPを行うことで、新規複合体が修飾するゲノム領域を同定する。FRETシステムを用いたスクリーニング系の構築のため、それぞれのタンパク質に蛍光タンパク質をつけたベクターも現在作成中である。
複数のがん細胞株を用いてヒストンメチル化タンパクXで免疫沈降し、ウエスタンブロットで通常のPRC2に含まれているSuz12、EEDなどのタンパク質が存在するかを確認し、この新規複合体の存在を確認した。また、SUZ12は存在することが確認できが、EEDは含まれていないようであった。
ゲノム上の修飾領域を検索するため、同じベクター上にヒストンメチル化タンパクX－タグタンパクーEZH2－タグタンパクをのせ、同時に強制発現できる系を作成している。また、それぞれのタンパク質に蛍光タンパク質をつけたベクターも現在作成中で、完成したらFRETを用いて複合体の存在や、形成する条件などを確認することが可能である。
ヒストンメチル化タンパクX－タグタンパクーEZH2－タグタンパクを同一ベクターで発現可能となったら、このシステムを用いて免疫沈降を行い、新規複合体内に含まれるタンパク質を同定する。PRC2複合体を形成しているのか、全く異なるタンパクが含まれるのかを確認する。また、この系を用いChIP-seqを行う。ゲノム上のどのような領域を修飾しているのか、その部位は活性化修飾されるのか、抑制化修飾されるのかを詳細に検討し、この新規複合体の果たす役割を検討する。
FRETシステムを構築し、複合体の形成される条件を同定する。さらに複合体形成を阻害する小分子化合物のスクリーニング系が可能となるように準備を進める。 -
エピジェネティクス機構制御によるケロイド・肥厚性瘢痕に対する新規治療法の開発
研究課題/研究課題番号：19K10006 2019年4月 - 2022年3月
高成 啓介
担当区分：研究分担者
ケロイドは外的刺激などにより組織の繊維が増殖性に反応し、異常瘢痕を形成するもので、疼痛・掻痒・瘢痕拘縮といった症状に悩まされる。罹患者は国内で年間10万人といわれている。ケロイドは周囲の組織へ進展し、切除しても再発を繰り返すため難治であり、現在の治療はステロイドの外用や局所注射、切除と放射線治療などが行われているが、これらは基本的には対症療法であり、その原因の解明および病因に沿った治療が望まれている。本研究では、ケロイドにおけるエピジェネティクス機構の一端を解明し、エピジェネティクス治療薬によるケロイドの治療が可能であるかを検証することを目的とする。
目的：ケロイドは皮膚線維芽細胞が産生した細胞外基質が過剰蓄積する皮膚良性腫瘍である。前胸部・肩・恥骨上など特定部位にケロイドが発生することから、機械的刺激によるシグナル伝達の活性化やこれに伴うエピジェネティックな遺伝子発現調節が関与すると考えられているが、正常な創傷治癒過程との違いを決定づける直接的因子は明らかでない。我々はエピジェネティクスの観点からケロイドの発生機序に迫るために研究を行っている。
方法：今年度は既存のゲノムデータベースを用いてケロイド特異的な遺伝子の探索研究を行った。パブリックデータベース(NCBI GEO)を利用し、ケロイド特異的に発現する遺伝子群の探索を行った。解析にはGSE113619、GSE92566、GSE7890のデータを用いた。
結果：ケロイド・正常皮膚組織の遺伝子発現アレイ(GSE92566)、ケロイド・正常瘢痕由来線維芽細胞の遺伝子発現アレイ(GSE7890)、ケロイド・正常瘢痕組織を用いたRNAシークエンスデータ(GSE113619)において、２遺伝子が共通してケロイド群で発現上昇を示した(発現変動1.5倍以上, p<0.05)。また、ケロイド群で共通して発現低下を示すのは５遺伝子であった(発現変動1.5倍以上, p<0.05)。
考察・次年度の予定：今年度の研究において、ケロイドに特異的な遺伝子の候補をあげることができた。次年度はこれに基づいて実際の皮膚サンプルおよびケロイドサンプルよりさらに解析を進めていく予定である。すでに臨床組織を採取することについての院内の倫理委員会を通しており、サンプルも順調に集まっている。
当初の目的であった、ケロイドに特異的な遺伝子の候補をあげることができた。また、次年度に向けてサンプルの採取も順調に進んでいる。
次年度以降は臨床のサンプルより、正常皮膚およびケロイドの組織を用い実際に候補となった遺伝子の変動がみられるかについてin vitro, in vivoで検証を行っていく予定である。また、正常皮膚とケロイドの間でどのような違いがあるかについても同時に検証を行っていく。
担当経験のある科目 (本学) 5
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自然環境と人間
2021
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修士課程 医科学専攻 病理病態学
2021
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腫瘍医学
2021
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基盤医学実習
2021
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修士課程 医科学専攻 病理病態学
2020