日本化学会

Repetitive Thiazolidine Deprotection Using a Thioester-Compatible Aldehyde Scavenger for One-Pot Multiple Peptide Ligation. 招待有り 査読有り

Koki Nakatsu, Prof. Dr. Akimitsu Okamoto, Prof. Dr. Gosuke Hayashi, Prof. Dr. Hiroshi Murakami

Angewandte Chemie International Edition   61 巻 ( 39 ) 頁： e202206240   2022年7月

Construction of a Highly Diverse mRNA Library for in vitro Selection of Monobodies.

Kondo T, Eguchi M, Tsuzuki N, Murata N, Fujino T, Hayashi G, Murakami H

Bio-protocol   11 巻 ( 16 ) 頁： e4125   2021年8月

Organoruthenium-Catalyzed Chemical Protein Synthesis to Elucidate the Functions of Epigenetic Modifications on Heterochromatin Factors. 招待有り 査読有り

Kamo, N.; Kujirai, T.; Kurumizaka, H.; Murakami, H.; Hayashi, G.* Okamoto, A.*

Chemical Science   12 巻   頁： 5926 - 5937   2021年3月

cDNA TRAP display for rapid and stable in vitro selection of antibody-like proteins. 国際誌

Kondo T, Eguchi M, Kito S, Fujino T, Hayashi G, Murakami H

Chemical communications (Cambridge, England)   57 巻 ( 19 ) 頁： 2416 - 2419   2021年3月

An Amino Acid-Swapped Genetic Code. 国際誌

Fujino T, Tozaki M, Murakami H

ACS synthetic biology   9 巻 ( 10 ) 頁： 2703 - 2713   2020年10月

An amino acid-swapped genetic code. 査読有り

Fujino, T.; Tozaki, M.; Murakami, H.*

ACS Synthetic Biology   9 巻 ( 10 ) 頁： 2703 - 2713   2020年9月

Exploring the Minimal RNA Substrate of Flexizymes. 査読有り 国際誌

Fujino T, Kondo T, Suga H, Murakami H

Chembiochem : a European journal of chemical biology   20 巻 ( 15 ) 頁： 1959 - 1965   2019年8月

Multiple Site-Directed and Saturation Mutagenesis by the Patch Cloning Method. 国際誌

Taniguchi N, Murakami H

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   1498 巻   頁： 339 - 347   2017年

Transient Tcf3 Gene Repression by TALE-Transcription Factor Targeting.

Masuda J, Kawamoto H, Strober W, Takayama E, Mizutani A, Murakami H, Ikawa T, Kitani A, Maeno N, Shigehiro T, Satoh A, Seno A, Arun V, Kasai T, Fuss IJ, Katsura Y, Seno M

Applied biochemistry and biotechnology   180 巻 ( 8 ) 頁： 1559 - 1573   2016年12月

Expanding the amino acid repertoire of ribosomal polypeptide synthesis via the artificial division of codon boxes.

Iwane Y, Hitomi A, Murakami H, Katoh T, Goto Y, Suga H

Nature chemistry   8 巻 ( 4 ) 頁： 317 - 325   2016年4月

Ribosomal Synthesis of Peptides with Multiple β-Amino Acids.

Fujino T, Goto Y, Suga H, Murakami H

Journal of the American Chemical Society   138 巻 ( 6 ) 頁： 1962 - 1969   2016年2月

In Vitro Selection Combined with Ribosomal Translation Containing Non-proteinogenic Amino Acids.

Fujino T, Murakami H

Chemical record (New York, N.Y.)   16 巻 ( 1 ) 頁： 365 - 377   2016年2月

Incorporation of electrically charged N-alkyl amino acids into ribosomally synthesized peptides via post-translational conversion. 査読有り

Kawakami, T.*; Sasaki, T; Reid, P. C.; Murakami, H.

Chemical Science   5 巻   頁： 887-893   2014年11月

ZFP36L1 and ZFP36L2 control LDLR mRNA stability via the ERK-RSK pathway.

Adachi S, Homoto M, Tanaka R, Hioki Y, Murakami H, Suga H, Matsumoto M, Nakayama KI, Hatta T, Iemura S, Natsume T

Nucleic acids research   42 巻 ( 15 ) 頁： 10037 - 10049   2014年9月

Incorporation of electrically charged N-alkyl amino acids into ribosomally synthesized peptides via post-translational conversion

Takashi Kawakami, Toru Sasaki, Patrick C. Reid, Hiroshi Murakami

Chemical Science   5 巻 ( 3 ) 頁： 887 - 887   2014年

Nonstandard peptide expression under the genetic code consisting of reprogrammed dual sense codons.

Goto Y, Iseki M, Hitomi A, Murakami H, Suga H

ACS chemical biology   8 巻 ( 12 ) 頁： 2630 - 2634   2013年12月

Patch cloning method for multiple site-directed and saturation mutagenesis.

Taniguchi N, Nakayama S, Kawakami T, Murakami H

BMC biotechnology   13 巻 ( 1 ) 頁： 91   2013年12月

Extensive reprogramming of the genetic code for genetically encoded synthesis of highly N-alkylated polycyclic peptidomimetics.

Kawakami T, Ishizawa T, Murakami H

Journal of the American Chemical Society   135 巻 ( 33 ) 頁： 12297 - 12304   2013年8月

In vitro selection of multiple libraries created by genetic code reprogramming to discover macrocyclic peptides that antagonize VEGFR2 activity in living cells.

Kawakami T, Ishizawa T, Fujino T, Reid PC, Suga H, Murakami H

ACS chemical biology   8 巻 ( 6 ) 頁： 1205 - 1214   2013年6月

TRAP display: a high-speed selection method for the generation of functional polypeptides.

Ishizawa T, Kawakami T, Reid PC, Murakami H

Journal of the American Chemical Society   135 巻 ( 14 ) 頁： 5433 - 5440   2013年4月

Reevaluation of the D-amino acid compatibility with the elongation event in translation.

Fujino T, Goto Y, Suga H, Murakami H

Journal of the American Chemical Society   135 巻 ( 5 ) 頁： 1830 - 1837   2013年2月

Patch cloning method for multiple site-directed and saturation mutagenesis 査読有り

Taniguchi, N; Nakayama, S; Kawakami, T.; Murakami, H.

BMC Biotechnology     頁： 13:91   2013年

Extensive reprogramming of the genetic code for genetically encoded synthesis of highly N-alkylated polycyclic peptidomimetics. 査読有り

Kawakami, T.; Ishizawa, T.; Murakami, H

Journal of the American Chemical Society   135 巻   頁： 12297-304   2013年

Artificially created nucleic acids and peptides/proteins in chemical biology.

Kuwahara M, Li Y, Rozners E, Murakami H

Journal of nucleic acids   2013 巻   頁： 219263   2013年

Genetically encoded libraries of nonstandard peptides.

Kawakami T, Murakami H

Journal of nucleic acids   2012 巻   頁： 1 - 15   2012年

Diverse backbone-cyclized peptides via codon reprogramming.

Kawakami T, Ohta A, Ohuchi M, Ashigai H, Murakami H, Suga H

Nature chemical biology   5 巻 ( 12 ) 頁： 888 - 890   2009年12月

A flexizyme that selectively charges amino acids activated by a water-friendly leaving group.

Niwa N, Yamagishi Y, Murakami H, Suga H

Bioorganic & medicinal chemistry letters   19 巻 ( 14 ) 頁： 3892 - 3894   2009年7月

Ribosomal synthesis of cyclic peptides with a fluorogenic oxidative coupling reaction.

Yamagishi Y, Ashigai H, Goto Y, Murakami H, Suga H

Chembiochem : a European journal of chemical biology   10 巻 ( 9 ) 頁： 1469 - 1472   2009年6月

Ribosomal synthesis of peptides with C-terminal lactams, thiolactones, and alkylamides.

Nakajima E, Goto Y, Sako Y, Murakami H, Suga H

Chembiochem : a European journal of chemical biology   10 巻 ( 7 ) 頁： 1186 - 1192   2009年5月

Bases in the anticodon loop of tRNA(Ala)(GGC) prevent misreading.

Murakami H, Ohta A, Suga H

Nature structural & molecular biology   16 巻 ( 4 ) 頁： 353 - 358   2009年4月

Ribosomal synthesis of dehydrobutyrine- and methyllanthionine-containing peptides.

Goto Y, Iwasaki K, Torikai K, Murakami H, Suga H

Chemical communications (Cambridge, England)   ( 23 ) 頁： 3419 - 3419   2009年

Ribosomal synthesis of polypeptoids and peptoid-peptide hybrids.

Kawakami T, Murakami H, Suga H

Journal of the American Chemical Society   130 巻 ( 50 ) 頁： 16861 - 16863   2008年12月

Polymerization of alpha-hydroxy acids by ribosomes.

Ohta A, Murakami H, Suga H

Chembiochem : a European journal of chemical biology   9 巻 ( 17 ) 頁： 2773 - 2778   2008年11月

Structural basis of specific tRNA aminoacylation by a small in vitro selected ribozyme.

Xiao H, Murakami H, Suga H, Ferré-D'Amaré AR

Nature   454 巻 ( 7202 ) 頁： 358 - 361   2008年7月

Initiating translation with D-amino acids.

Goto Y, Murakami H, Suga H

RNA (New York, N.Y.)   14 巻 ( 7 ) 頁： 1390 - 1398   2008年7月

Ribosomal synthesis of bicyclic peptides via two orthogonal inter-side-chain reactions.

Sako Y, Morimoto J, Murakami H, Suga H

Journal of the American Chemical Society   130 巻 ( 23 ) 頁： 7232 - 7234   2008年6月

Ribosomal synthesis of peptidase-resistant peptides closed by a nonreducible inter-side-chain bond.

Sako Y, Goto Y, Murakami H, Suga H

ACS chemical biology   3 巻 ( 4 ) 頁： 241 - 249   2008年4月

Reprogramming the translation initiation for the synthesis of physiologically stable cyclic peptides. 査読有り

Goto Y, Ohta A, Sako Y, Yamagishi Y, Murakami H, Suga H

ACS chemical biology   3 巻 ( 2 ) 頁： 120 - 129   2008年2月

Messenger RNA-programmed incorporation of multiple N-methyl-amino acids into linear and cyclic peptides. 査読有り

Kawakami T, Murakami H, Suga H

Chemistry & biology   15 巻 ( 1 ) 頁： 32 - 42   2008年1月

Synthesis of polyester by means of genetic code reprogramming.

Ohta A, Murakami H, Higashimura E, Suga H

Chemistry & biology   14 巻 ( 12 ) 頁： 1315 - 1322   2007年12月

The flexizyme system: a highly flexible tRNA aminoacylation tool for the translation apparatus.

Ohuchi M, Murakami H, Suga H

Current opinion in chemical biology   11 巻 ( 5 ) 頁： 537 - 542   2007年10月

[Reprogramming the genetic code using flexizyme].

Sako Y, Murakami H, Suga H

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme   52 巻 ( 13 Suppl ) 頁： 1643 - 8   2007年10月

Ribosomal Polyester Synthesis Using Reprogrammed Genetic Code 査読有り

Atsushi Ohta, Hiroshi Murakami, Hiroaki Suga

Kobunshi   56 巻 ( 4 ) 頁： 196 - 199   2007年

In situ generation of aminoacyl-tRNAs assisted by ribozymes in translation apparatus. 査読有り

Ohuchi M, Murakami H, Suga H

Nucleic acids symposium series (2004)   ( 51 ) 頁： 115 - 116   2007年

Exploration of incorporation of Nalpha-methylated amino acids into peptides by sense-suppression method. 査読有り

Kawakami T, Murakami H, Suga H

Nucleic acids symposium series (2004)   ( 51 ) 頁： 361 - 362   2007年

[Expansion and reprogramming of genetic code by Flexizyme].

Murakami H, Suga H

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme   51 巻 ( 16 Suppl ) 頁： 2496 - 501   2006年12月

フレキシザイムを用いた遺伝暗号の拡張とリプログラミング (RNAと生命) -- (RNAテクノロジーと創薬)

村上 裕, 菅 裕明

蛋白質核酸酵素   51 巻 ( 16 ) 頁： 2496-2501   2006年12月

Leucyl/Phenylalanyl-tRNA-protein transferase-mediated chemoenzymatic coupling of N-terminal Arg/Lys units in post-translationally processed proteins with non-natural amino acids.

Taki M, Kuno A, Matoba S, Kobayashi Y, Futami J, Murakami H, Suga H, Taira K, Hasegawa T, Sisido M

Chembiochem : a European journal of chemical biology   7 巻 ( 11 ) 頁： 1676 - 1679   2006年11月

テクノ・トレンド フレキシザイム--遺伝暗号の拡張とリプログラミングへの応用

村上 裕, 菅 裕明

バイオテクノロジージャーナル   6 巻 ( 6 ) 頁： 734-737   2006年11月

A highly flexible tRNA acylation method for non-natural polypeptide synthesis.

Murakami H, Ohta A, Ashigai H, Suga H

Nature methods   3 巻 ( 5 ) 頁： 357 - 359   2006年5月

セントラルドグマをつくりかえる (特集 生命をデザインする合成生物学)

村上 裕, 菅 裕明, 平尾 一郎

バイオニクス   3 巻 ( 3 ) 頁： 34-39   2006年3月

Flexizyme as a versatile tRNA acylation catalyst and the application for translation. 査読有り 国際誌

Murakami H, Ohta A, Goto Y, Sako Y, Suga H

Nucleic acids symposium series (2004)   ( 50 ) 頁： 35-36 - 6   2006年

In vitro evolution of flexizymes that function under the conditions in translation system. 査読有り

Ohuchi M, Murakami H, Suga H

Nucleic acids symposium series (2004)   ( 50 ) 頁： 299-300   2006年

Translation initiation by using various N-acylaminoacyl tRNAs. 査読有り 国際誌

Goto Y, Ashigai H, Sako Y, Murakami H, Suga H

Nucleic acids symposium series (2004)   ( 50 ) 頁： 293-294 - 4   2006年

Programmable ribozymes for mischarging tRNA with nonnatural amino acids and their applications to translation.

Kourouklis D, Murakami H, Suga H

Methods (San Diego, Calif.)   36 巻 ( 3 ) 頁： 239 - 244   2005年7月

Designer ribozymes: programming the tRNA specificity into flexizyme.

Ramaswamy K, Saito H, Murakami H, Shiba K, Suga H

Journal of the American Chemical Society   126 巻 ( 37 ) 頁： 11454 - 11455   2004年9月

Position-specific incorporation of dansylated non-natural amino acids into streptavidin by using a four-base codon.

Hohsaka T, Muranaka N, Komiyama C, Matsui K, Takaura S, Abe R, Murakami H, Sisido M

FEBS letters   560 巻 ( 1-3 ) 頁： 173 - 177   2004年2月

Using a solid-phase ribozyme aminoacylation system to reprogram the genetic code.

Murakami H, Kourouklis D, Suga H

Chemistry & biology   10 巻 ( 11 ) 頁： 1077 - 1084   2003年11月

[Artificial ribozymes: selection and application for nonnatural amino acid mutagenesis]. 査読有り

Murakami H, Suga H

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme   48 巻 ( 11 Suppl ) 頁： 1511-1518   2003年8月

人工リボザイム--試験管内分子進化と非天然アミノ酸変異法への応用 (化学と生物学の接点がつくるNewバイオテクノロジー) -- (新規遺伝子と蛋白質を創製する)

村上 裕, 菅 裕明

蛋白質核酸酵素   48 巻 ( 11 ) 頁： 1511-1518   2003年8月

A versatile tRNA aminoacylation catalyst based on RNA.

Murakami H, Saito H, Suga H

Chemistry & biology   10 巻 ( 7 ) 頁： 655 - 662   2003年7月

Random insertion and deletion mutagenesis. 査読有り

Murakami H, Hohsaka T, Sisido M

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   231 巻   頁： 53 - 64   2003年

Position-specific incorporation of a fluorophore-quencher pair into a single streptavidin through orthogonal four-base codon/anticodon pairs.

Taki M, Hohsaka T, Murakami H, Taira K, Sisido M

Journal of the American Chemical Society   124 巻 ( 49 ) 頁： 14586 - 14590   2002年12月

Aminoacyl-tRNA synthesis by a resin-immobilized ribozyme.

Murakami H, Bonzagni NJ, Suga H

Journal of the American Chemical Society   124 巻 ( 24 ) 頁： 6834 - 6835   2002年6月

Random insertion and deletion of arbitrary number of bases for codon-based random mutation of DNAs.

Murakami H, Hohsaka T, Sisido M

Nature biotechnology   20 巻 ( 1 ) 頁： 76 - 81   2002年1月

A novel fluorescent nonnatural amino acid that can be incorporated into a specific position of streptavidin. 査読有り

Taki M, Hohsaka T, Murakami H, Kuno A, Hasegawa T, Taira K, Sisido M

Nucleic acids research. Supplement (2001)   ( 2 ) 頁： 203 - 204   2002年

Incorporation of Nonnatural Amino Acids into Proteins by Using Various Four-Base Codons in an <i>Escherichia coli</i> in Vitro Translation System

Takahiro Hohsaka, Yuki Ashizuka, Hikaru Taira, Hiroshi Murakami, Masahiko Sisido

Biochemistry   40 巻 ( 37 ) 頁： 11060 - 11064   2001年9月

A non-natural amino acid for efficient incorporation into proteins as a sensitive fluorescent probe

Taki, M. and Hohsaka, T. and Murakami, H. and Taira, K. and Sisido, M.

FEBS Letters   507 巻 ( 1 ) 頁： 35-38   2001年

Five-base codons for incorporation of nonnatural amino acids into proteins

Hohsaka, T. and Ashizuka, Y. and Murakami, H. and Sisido, M.

Nucleic Acids Res.   29 巻 ( 17 ) 頁： 3646-3651   2001年

Incorporation of nonnatural amino acids into proteins by using various four-base codons in an Escherichia coli in vitro translation system

Hohsaka, T. and Ashizuka, Y. and Taira, H. and Murakami, H. and Sisido, M.

Biochemistry   40 巻 ( 37 ) 頁： 11060-11064   2001年

Five-base codons for incorporation of nonnatural amino acids into proteins

Hohsaka, T, Ashizuka, Y, Murakami, H, Sisido, M

Nucleic Acids Res.   29 巻 ( 17 ) 頁： 3646-3651   2001年

Site-Directed Incorporation of Fluorescent Nonnatural Amino Acids into Streptavidin for Highly Sensitive Detection of Biotin

Hiroshi Murakami, Takahiro Hohsaka, Yuki Ashizuka, Kimiko Hashimoto, Masahiko Sisido

Biomacromolecules   1 巻 ( 1 ) 頁： 118 - 125   2000年3月

A chiral Eu3+-thienoyltrifluoroacetone complex on an avidin tetramer: luminescence and CD studies on the supramolecular protein-metal chelate complex

Taki, M. and Murakami, H. and Sisido, M.

Chem. Commun.   ( 13 ) 頁： 1199-1200   2000年

A chiral Eu3+–thienoyltrifluoroacetone complex on an avidin tetramer: luminescence and CD studies on the supramolecular protein–metal chelate complex

Masumi Taki, Hiroshi Murakami, Masahiko Sisido

Chemical Communications   ( 13 ) 頁： 1199 - 1200   2000年

Efficient incorporation of nonnatural amino acids with large aromatic groups into streptavidin in in vitro protein synthesizing systems

Hohsaka, T. and Kajihara, D. and Ashizuka, Y. and Murakami, H. and Sisido, M.

J. Am. Chem. Soc.   121 巻 ( 1 ) 頁： 34-40   1999年

Incorporation of two different nonnatural amino acids independently into a single protein through extension of the genetic code

Hohsaka, T. and Ashizuka, Y. and Sasaki, H. and Murakami, H. and Sisido, M.

J. Am. Chem. Soc.   121 巻 ( 51 ) 頁： 12194-12195   1999年

Site-directed incorporation of p-nitrophenylalanine into streptavidin and site-to-site photoinduced electron transfer from a pyrenyl group to a nitrophenyl group on the protein framework

Murakami, H. and Hohsaka, T. and Ashizuka, Y. and Sisido, M.

J. Am. Chem. Soc.   120 巻 ( 30 ) 頁： 7520-7529   1998年

Incorporation of nonnatural amino acids into streptavidin through in vitro frame-shift suppression

Hohsaka, T. and Ashizuka, Y. and Murakami, H. and Sisido, M.

J. Am. Chem. Soc.   118 巻 ( 40 ) 頁： 9778-9779   1996年

フレキシザイムを用いた遺伝暗号の拡張とリプログラミング (RNAと生命) -- (RNAテクノロジーと創薬)

村上 裕, 菅 裕明  

蛋白質核酸酵素51 巻 ( 16 ) 頁： 2496-2501 - 2501   2006年12月

[Expansion and reprogramming of genetic code by Flexizyme]. 査読有り

Murakami H, Suga H  

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme51 巻 ( 16 Suppl ) 頁： 2496-2501   2006年12月

テクノ・トレンド フレキシザイム--遺伝暗号の拡張とリプログラミングへの応用

村上 裕, 菅 裕明  

バイオテクノロジージャーナル6 巻 ( 6 ) 頁： 734-737 - 737   2006年11月

酵素(L/F‐tRNA‐protein transferase)を用いた蛋白質の新規N末端特異的修飾法

瀧真清, 久野敦, 的場進介, 小林由紀, 村上裕, 菅裕明, 多比良和誠, 長谷川典巳, 宍戸昌彦  

日本化学会講演予稿集86th 巻 ( 2 ) 頁： 877   2006年3月

セントラルドグマをつくりかえる (特集 生命をデザインする合成生物学)

村上 裕, 菅 裕明, 平尾 一郎  

バイオニクス3 巻 ( 3 ) 頁： 34-39 - 39   2006年3月

人工リボザイム--試験管内分子進化と非天然アミノ酸変異法への応用 (化学と生物学の接点がつくるNewバイオテクノロジー) -- (新規遺伝子と蛋白質を創製する)

村上 裕, 菅 裕明  

蛋白質核酸酵素48 巻 ( 11 ) 頁： 1511-1518 - 1518   2003年8月

[Artificial ribozymes: selection and application for nonnatural amino acid mutagenesis]. 査読有り

Murakami H, Suga H  

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme48 巻 ( 11 Suppl ) 頁： 1511-1518   2003年8月

足場ペプチド連結

鈴木沙依,水嶋真吾,竹内優紀乃,林剛介,村上裕

日本化学会 第104春季年会  2024年3月21日  日本化学会

ペプチド固相合成法に適用可能な新規セレノシステイン保護基の開発

吉富文香,中津幸輝,林剛介,村上裕

日本化学会 第104春季年会  2024年3月21日  日本化学会

除去可能なペプチドステープリングによるペプチド構造・機能の制御

土岐優介,小澤英知,林剛介,村上裕

日本化学会 第104春季年会  2024年3月21日  日本化学会

足場ペプチド連結

鈴木沙依,水嶋真吾,竹内優紀乃,林剛介,村上裕

日本化学会 第104春季年会  2024年3月21日  日本化学会

α-二置換アミノ酸を用いたペプチドチオエステル合成の効率化

中村元紀,中津幸輝,林剛介,村上裕

日本化学会 第104春季年会  2024年3月21日  日本化学会

進化工学で人工タンパク質を創製し新技術を開発する 招待有り

村上裕

第23回フロンティア生命化学研究会  2024年1月5日  フロンティア生命化学研究会

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村上裕

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mRNA提示法における人工抗体モノボディ・大環状ペプチドライブラリの多様性最大化

梅本駿,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

第46回日本分子生物学会年会  2023年12月8日  日本分子生物学会

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梅本駿,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

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天然・転写ハイブリッドtRNAによるSer/Leu交換翻訳系の高収率化

藤野 公茂,園田 凌吾,村上 裕

第54回中部化学関係学協会支部連合秋季大会  2023年11月12日  中部化学関係学協会支部

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Solid-phase Synthesis of C-terminal Diketopiperazine Thioester Peptide

Yuya Nakajima,Koki Nakatsu,Gosuke Hayashi,Hiroshi Murakami

2023年11月10日 

固相チオエステル化反応によるペプチドチオエステルの直接合成法開発

中嶋 雄哉,中津 幸輝,林 剛介,村上 裕

第54回中部化学関係学協会支部連合秋季大会  2023年11月3日  中部化学関係学協会支部

mRNA提示法のライブラリ多様性に対してmRNA配列が与える影響の大規模解析

梅本駿,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月11日  日本化学会

mRNA提示法のライブラリ多様性に対してmRNA配列が与える影響の大規模解析

梅本駿,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月11日  日本化学会

MCP-1結合鏡像モノボディの合成と機能解

内藤俊紀,三浦清楓,岩本直也,大石真也,林剛介,村上裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月9日  日本化学会

微小炎症関連タンパク質に対する人工抗体の創製

松尾瑠星,Jing-Jing Jiang,藤野公茂,林剛介,村上正晃,村上裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月9日  日本化学会

第17回バイオ関連化学シンポジウム

田中千尋1・田川寛2・山本智勇2・片山佳樹3・藤野公茂1・林剛介1・森健3・村上裕1,4

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月9日  日本化学会

1分子ペプチドアミノ酸配列決定法の開発を目指したN末端Gly・Phe結合人工抗体の創製

菅野晃矢,近藤太志,梅本駿,藤野公茂,林剛介,村上裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月9日  日本化学会

大腸菌を用いた大環状ペプチド簡便大量合成法の開発

東長田泰斗,藤野 公茂,村上 裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月9日  日本化学会

WYP-richとNNKライブラリ由来の大環状ペプチドの親和性評価

鷲見大河,藤野公茂,村上裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月9日  日本化学会

天然・転写ハイブリッドtRNAによるSer/Leu交換翻訳の高効率化

藤野 公茂,園田 凌吾,村上 裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月8日  日本化学会

天然・転写ハイブリッドtRNAによるSer/Leu交換翻訳の高効率化

藤野 公茂,園田 凌吾,村上 裕

第17回バイオ関連化学シンポジウム  2023年9月8日  日本化学会

進化工学で人工タンパク質を創製し新技術を開発する 招待有り

村上裕

第75回日本生物工学会大会  2023年9月5日  日本生物工学会大会

進化工学で人工タンパク質を創製し新技術を開発する 招待有り

村上裕

第75回日本生物工学会大会  2023年9月5日  日本生物工学会大会

Large-scale Analysis of the Effect of mRNA Sequences on the diversity of mRNA display libraries

梅本駿,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

第24回日本RNA学会年会  2023年7月5日  日本RNA学会

In vitro selection of antibody-like proteins against small molecules 国際会議

村上裕

The 19th Akabori Conference(German-Japanese Symposium on Peptide Science)  2023年5月19日  日本ペプチド学会

In vitro selection of antibody-like proteins against small molecules 国際会議

村上裕

The 19th Akabori Conference(German-Japanese Symposium on Peptide Science)  2023年5月19日  日本ペプチド学会

高速人工抗体創製法の開発と応用 招待有り

村上裕

2022年度　鳥取大学工学研究科化学バイオコースセミナー  2022年12月19日 

高速人工抗体創製法の開発と応用 招待有り

村上裕

第93回講演会 有機化学研究会（白鷺セミナー）  2022年12月7日 

WYP-rich 大環状ペプチドライブラリによる効率的なペプチド選択

藤野 公茂,鷲見 大河,村上 裕

第53回中部化学関係学協会支部連合秋季大会  2022年12月6日 

連結方向切り替え可能なOne-potペプチド連結法

中津 幸輝,岡本 晃充,林 剛介,村上 裕

第53回中部化学関係学協会支部連合秋季大会  2022年12月6日 

WYP-rich Macrocyclic Peptide Library

2022年10月26日 

Improved chemical synthesis of dual-mono ubiquitinated PAF15 protein

uya Takahashi, Satomi Kori, Kyohei Arita, Gosuke Hayashi and Hiroshi Murakami

第59回ペプチド討論会  2022年10月26日 

Direction-Switchable One-Pot Peptide Ligation Using Two Orthogonal Protecting Group Strategies

2022年10月25日 

転写・抽出tRNAを用いた高効率Ser/Leu交換翻訳系の開発

園田 凌吾,藤野 公茂,村上 裕

第12回CSJ化学フェスタ  2022年10月20日 

抗MCP-1人工抗体のミラーイメージ選択

三浦 清楓,近藤 太志,薄井 友輔,大石 真也,藤野 公茂,林 剛介,村上 裕

第12回CSJ化学フェスタ  2022年10月18日 

連結方向切り替え可能なone-potペプチド連結法を用いたタンパク質化学合成

中津 幸輝,岡本 晃充,林 剛介,村上 裕

第12回CSJ化学フェスタ  2022年10月18日 

WYP-rich大環状ペプチドライブラリの構築と有用性の検証

鷲見大河,藤野 公茂,村上 裕

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022年9月12日 

連結方向切り替え可能なOne-Potペプチド連結法によるタンパク質化学合成

中津幸輝,岡本晃充,林剛介,村上裕

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022年9月12日 

mRNA配列の翻訳効率と精度への影響の網羅的解析と人工抗体・環状ペプチドの高多様性ライブラリ創製への応用

梅本駿,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022年9月12日 

抗体担持ナチュラルキラー細胞療法を可能にする人工抗体の創製

田中千尋,藤野公茂,原田結,米滿吉和,林剛介,村上裕

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022年9月12日 

維持メチル化機構解明を目指したジユビキチン化PAF15タンパク質の効率的化学合成ルートの開拓

高橋 侑也,郡 聡実,有田 恭平,林 剛介,村上 裕

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022年9月12日 

WYP-rich大環状ペプチドライブラリの構築

藤野公茂,鷲見大河,村上 裕

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022年9月11日 

SARS-CoV-2 Omicron株に対する人工抗体の創製

近藤太志,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,林剛介,岩谷靖雅,村上裕

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022年9月10日 

幅広い結合親和性を網羅する低分子リガンド−Monobody結合ペアの開発

梅本 駿,都築 成晃,吉井 達之,近藤 太志,藤野 公茂,林 剛介,築地 真也,村上 裕

日本化学会 第102春季年会  2022年3月23日  日本化学会

ワンポットペプチド連結反応による人工抗体モノボディの化学合成と機能評価

小澤英知,林剛介,村上 裕

日本化学会 第102春季年会  2022年3月23日  日本化学会

ジケトピペラジン形成を伴うペプチドセレノエステルの合成とタンパク質化学合成への応用

橋本 雅也, 林 剛介,村上 裕

日本化学会 第102春季年会  2022年3月23日  日本化学会

Tyr, Trp, Pro-rich環状ペプチドライブラリの構築とSARS-CoV2に対する環状ペプチドの選択

藤野 公茂,園田 凌吾,鷲見 大河,村上 裕

日本化学会 第102春季年会  2022年3月23日  日本化学会

ワンポットペプチド連結反応を駆使したジユビキチン化PAF15タンパク質の化学合成

高橋侑也,郡聡実,有田恭平,林剛介,村上 裕

日本化学会 第102春季年会  2022年3月23日  日本化学会

新型コロナウイルスに対する人工抗体Monobodyの親和性成熟による中和活性の向上

近藤太志、松岡和弘、藤野公茂、梅本駿、林剛介、岩谷靖雅 、村上裕

日本化学会 第102春季年会  2022年3月23日  日本化学会

転写・抽出tRNAを用いたSer/Leu交換翻訳系の構築

園田凌吾,藤野公茂,村上裕

第44回日本分子生物学会年会  2021年12月1日  日本分子生物学会年会

アミノ酸交換遺伝暗号の構築

藤野公茂,戸崎将弘,村上裕

第44回日本分子生物学会年会  2021年12月1日  日本分子生物学会

SARS-CoV-2を捕捉する人工抗体の迅速創製 招待有り

近藤太志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,横幕能行,林剛介,村上裕

第31回基礎及び最新の分析化学講習会  2021年11月9日 

新型コロナウイルスを捕まえる人工抗体をつくる 招待有り

近藤太志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,横幕能行,林剛介,村上裕

第11回 CSJ化学フェスタ  2021年10月20日 

新型コロナウイルスに対する人工抗体の迅速創製 招待有り

近藤太志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,横幕能行,林剛介,村上裕

化学工学会第52回秋季大会  2021年9月24日 

SARS-CoV-2 に対する Monobody の親和性成熟による従来株及び 変異株に対する中和活性の向上

近藤太志,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,林剛介,岩谷靖雅,村上裕

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021年9月10日 

維持メチル化機構解明を指向したジユビキチン化PAF15タンパク質の化学合成

高橋侑也,郡聡美,有田恭平,林剛介,村上裕

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021年9月9日 

高効率ペプチドライゲーションのための新規セレノエステル合成法の開発

橋本雅也,林剛介,村上裕

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021年9月9日 

パラジウム錯体を利用したコロナウイルス結合人工抗体の効率的全合成

小澤英知,林剛介,村上裕

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021年9月9日 

C末端配列改変による人工抗体Monobodyの可溶性向上 –SARS-CoV-2中和抗体医薬への応用を指向して–

梅本駿,齊木輝,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021年9月8日 

天然・転写tRNAによるSer/Leu交換遺伝暗号の翻訳高効率化

藤野公茂,園田凌吾,村上裕

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021年9月8日 

2-aminobenzamide誘導体を用いたN末端チアゾリジン脱保護による高効率one-potペプチド連結法

中津幸輝,村上裕,林剛介,岡本晃充

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021年9月8日 

人工抗体迅速創製法によるSARS-CoV-2変異株中和抗体の創製 招待有り

近藤太志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,林剛介,村上裕

第8回バイオ関連化学シンポジウム若手フォーラム  2021年9月3日 

SARS-CoV-2 由来スパイクタンパク質に対する迅速な人工抗体創製 招待有り

近藤太志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,横幕能行,林剛介,村上裕

第34回 日本動物細胞工学会2021年度大会  2021年7月28日 

新型コロナウイルスに対する迅速な人工抗体創製 招待有り

近藤太志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,横幕能行,林剛介,村上裕

第68回構造生物応用研究会  2021年7月15日 

SARS-CoV-2に対する人工抗体の高速創製 招待有り

近藤太志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,横幕能行,林剛介,村上裕

第21回日本蛋白質科学会年会  2021年6月18日 

新型コロナウイルスに対する迅速な人工抗体創製 招待有り

近藤大志,岩谷靖雅,松岡和弘,藤野公茂,梅本駿,横幕能行,林剛介,村上裕

構造生物学・化学・計算科学を融合させたウイルス・パンデミックに対する取り組み  2021年4月2日 

Ru触媒を用いたリンカーヒストンH1.2とHP1αの化学合成とその翻訳後修飾の機能解析

加茂 直己、鯨井 智也、胡桃坂 仁志、村上 裕、林 剛介、岡本 晃充

日本化学会　第101回春期年会  2021年3月22日 

セレノシステインを用いたセレノエステル合成とペプチド連結反応への応用

橋本 雅也、林 剛介、村上 裕

日本化学会　第101回春期年会  2021年3月21日 

High-speed selection of antibody-like proteins that capture and neutralize SARS-CoV-2 国際会議

2021年3月8日 

高速人工抗体創製法の開発とSARS-CoV-2中和抗体作製への応用 招待有り

村上裕

生物化学的測定研究会 第25回学術シンポジウム  2020年11月6日 

SARS-CoV-2を結合・中和する人工抗体の開発

村上裕

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月8日 

SARS-CoV-2由来スパイクタンパク質に対する高親和性人工抗体の高速創製

近藤　太志・岩谷　靖雅・松岡　和弘・藤野　公茂・梅本　駿・横幕 能行・林　剛介・村上　裕

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月7日 

低分子リガンドに特異的に結合する人工抗体の創製

都築 成晃・吉井 達之・近藤 大志・藤野 公茂・林 剛介・築地 真也・村上 裕

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月7日 

アミノ酸入れ替え遺伝暗号の開発

藤野　公茂・戸崎　将弘・村上　裕

第14回バイオ関連化学シンポジウム  2020年9月7日 

TRAP提示法を用いた機能性ペプチド•人工抗体選択 招待有り

村上裕

化学工学会第49回秋季大会 

翻訳合成系を用いた進化分子工学・合成生物学 招待有り

村上裕

ChemBio講演会2017-1  2017年1月17日 

mRNA配列が翻訳効率・精度へ及ぼす影響の網羅的解析と大規模人工抗体・大環状ペプチドライブラリの創製への応用

梅本駿,近藤太志,藤野公茂,林剛介,村上裕

第12回CSJ化学フェスタ  2022年10月18日 

新遺伝暗号の創成

2015年4月 - 2016年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  萌芽研究

広汎用リボソームの開発

研究課題/研究課題番号：23350076  2011年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

村上 裕

JSPS 特殊ペプチド増幅法の開発と創薬への応

2010年4月 - 2014年3月

科学研究費助成事業  最先端・次世代研究開発支援プログラ

ポリペプチド翻訳合成:D体アミノ酸とベータアミノ酸への新展開

2008年4月 - 2011年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究(A)

ポリペプチド翻訳合成:D体アミノ酸とベータアミノ酸への新展開

研究課題/研究課題番号：20681022  2008年 - 2010年

科学研究費助成事業  若手研究(A)

村上 裕

新規アミノアシルtRNA合成リボザイムの創製

2005年4月 - 2007年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究(B)

新規アミノアシルtRNA合成リボザイムの創製

研究課題/研究課題番号：17750151  2005年 - 2006年

科学研究費助成事業  若手研究(B)

村上 裕

脂肪酸生合成リボザイムとRNA生命体の創成

研究課題/研究課題番号：16101007  2004年 - 2008年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(S)

菅 裕明, 村上 裕, 二井 一樹, 神 紘 一郎, 大内 政樹, 太田 淳, 川上 隆史, 丹羽 慶吉, 村上 裕, 二井 一樹, 神 紘 一郎, 大内 政樹, 太田 淳, 川上 隆史, 丹羽 慶吉

SARS-CoV-2のSタンパク質に結合する人工抗体

ポリペプチドを製造するための新遺伝暗号と翻訳系、及びポリペプチドの製造方法

村上　裕、石沢尭大

荷電性非タンパク質性アミノ酸含有ペプチドの製造方法

村上　裕、川上 隆史、パトリック・リード、佐々木 亨

ペプチドライブラリの製造方法、ペプチドライブラリ、及びスクリーニング方法

村上　裕、川上隆史、石沢尭大、パトリック・リード、佐々木亨

血管内皮細胞増殖因子受容体阻害ペプチド

村上　裕、川上隆史、石沢尭大、菅裕明、パトリック・リード

新規人工翻訳合成系

菅　裕明、村上　裕、後藤　佑樹

多目的アシル化触媒とその用途

菅裕明、村上裕

RIBOZYMES WITH BROAD tRNA AMINOACYLATION ACTIVITY

SUGA, Hiroaki, MURAKAMI, Hiroshi, SAITO, Hirohide