所属
大学院創薬科学研究科 基盤創薬学専攻 創薬分子構造学 教授
細胞生理学研究センター 教授
細胞生理学研究センター 教授
大学院担当
大学院創薬科学研究科
学部担当
理学部
職名
教授
連絡先
外部リンク
ヒロアキ ヒデカズ
廣明 秀一
HIROAKI Hidekazu
学位 3
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博士（薬学） （ 1992年3月 大阪大学 ）
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薬学修士 （ 1989年3月 大阪大学 ）
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薬学士 （ 1987年3月 大阪大学 ）
研究分野 3
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ライフサイエンス / 構造生物化学
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ライフサイエンス / 生物物理学
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ライフサイエンス / 薬系分析、物理化学
現在の研究課題とSDGs 6
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タイトジャンクションを制御剤の開発と医療・化粧品応用
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ヒトPDZドメインタンパク質を標的とした抗コロナウイルス薬の探索
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ヒトRNaseH1の構造生物学的研究
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ヒトPDZドメインタンパク質を標的とした抗がん剤の開発
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天然変性タンパク質の医療応用
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Abetaのオリゴマーの構造生物学的研究
経歴 2
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名古屋大学 細胞生理学研究センター 所長（センター長）
2013年4月 - 現在
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名古屋大学 大学院理学研究科 附属構造生物学研究センター 教授
2012年4月 - 2020年3月
学歴 3
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大阪大学 薬学研究科 薬品科学専攻
1989年4月 - 1992年3月
国名： 日本国
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大阪大学 薬学研究科 薬品科学専攻
1987年4月 - 1989年3月
国名： 日本国
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大阪大学 薬学部 製薬化学科
1984年4月 - 1987年3月
国名： 日本国
所属学協会 7
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日本薬学会
2000年4月 - 現在
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日本蛋白質科学会 役員（選挙管理担当）
2019年5月 - 現在
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日本核磁気共鳴学会 評議員
2016年4月 - 現在
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日本生物物理学会
2017年4月 - 現在
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日本ケミカルバイオロジー学会
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日本分子生物学会
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American Association for the Advancement of Science
論文 102
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Direct inhibition of the first PDZ domain of ZO-1 by glycyrrhizin is a possible mechanism of tight junction opening of Caco-2 cells 査読有り 国際誌
Hibino Emi, Goda Natsuko, Hisada Misaki, Tenno Takeshi, Hiroaki Hidekazu
FOOD & FUNCTION 13 巻 ( 4 ) 頁： 1953 - 1964 2022年2月
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Potential of rescue and reactivation of tumor suppressor p53 for cancer therapy. 招待有り 査読有り 国際誌
Hibino E, Hiroaki H
Biophysical reviews 14 巻 ( 1 ) 頁： 267 - 275 2022年2月
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Naoki Matsuo, Natsuko Goda, Takeshi Tenno, and Hidekazu Hiroaki
PeerJ Physical Chemistry 3 巻 頁： e20 2021年12月
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Structural and Functional Analysis of Glycyrrhizin Bound to the Scaffold Protein ZO1-PDZ1 of Tight Junctions 国際誌
30 巻 頁： 119 - 119 2021年10月
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NMR-Guided Repositioning of Non-Steroidal Anti-Inflammatory Drugs into Tight Junction Modulators 査読有り 国際誌
Tenno Takeshi, Kataoka Kohki, Goda Natsuko, Hiroaki Hidekazu
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 22 巻 ( 5 ) 2021年3月
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High dose of baicalin or baicalein can reduce tight junction integrity by partly targeting the first PDZ domain of zonula occludens-1 (ZO-1) 査読有り
Hisada Misaki, Hiranuma Minami, Nakashima Mio, Goda Natsuko, Tenno Takeshi, Hiroaki Hidekazu
EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACOLOGY 887 巻 頁： 173436 2020年11月
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Opposing Effect of Naringenin and Quercetin on the Junctional Compartment of MDCK II Cells to Modulate the Tight Junction 査読有り
Nakashima Mio, Hisada Misaki, Goda Natsuko, Tenno Takeshi, Kotake Ayaka, Inotsume Yuko, Kameoka Ikuo, Hiroaki Hidekazu
NUTRIENTS 12 巻 ( 11 ) 2020年11月
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Principal component analysis of data from NMR titration experiment of uniformly N-15 labeled amyloid beta (1-42) peptide with osmolytes and phenolic compounds 査読有り
Iwaya Naoko, Goda Natsuko, Matsuzaki Mizuki, Narita Akihiro, Shigemitsu Yoshiki, Tenno Takeshi, Abe Yoshito, Hoshi Minako, Hiroaki Hidekazu
ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS 690 巻 頁： 108446 2020年9月
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Presence of intrinsically disordered proteins can inhibit the nucleation phase of amyloid fibril formation of A beta(1-42) in amino acid sequence independent manner 査読有り
Ikeda Koki, Suzuki Shota, Shigemitsu Yoshiki, Tenno Takeshi, Goda Natsuko, Oshima Atsunori, Hiroaki Hidekazu
SCIENTIFIC REPORTS 10 巻 ( 1 ) 頁： 12334 2020年7月
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Synthesis of selenomethylene-locked nucleic acids (SeLNA) nucleoside unit bearing an adenine base 査読有り
Moai Yoshihiro, Hiroaki Hidekazu, Obika Saoshi, Kodama Tetsuya
NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS 39 巻 ( 1-3 ) 頁： 131 - 140 2020年2月
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Spatial Overlap of Claudin- and Phosphatidylinositol Phosphate-Binding Sites on the First PDZ Domain of Zonula Occludens 1 Studied by NMR 査読有り
Hiroaki Hidekazu, Satomura Kaori, Goda Natsuko, Nakakura Yukako, Hiranuma Minami, Tenno Takeshi, Hamada Daizo, Ikegami Takahisa
MOLECULES 23 巻 ( 10 ) 2018年10月
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Using H-1(N) amide temperature coefficients to define intrinsically disordered regions: An alternative NMR method 査読有り
Okazaki Hiroki, Matsuo Naoki, Tenno Takeshi, Goda Natsuko, Shigemitsu Yoshiki, Ota Motonori, Hiroaki Hidekazu
PROTEIN SCIENCE 27 巻 ( 10 ) 頁： 1821 - 1830 2018年10月
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Discovery of Potent Disheveled/Dvl Inhibitors Using Virtual Screening Optimized With NMR-Based Docking Performance Index 査読有り
Hori Kiminori, Ajioka Kasumi, Goda Natsuko, Shindo Asako, Takagishi Maki, Tenno Takeshi, Hiroaki Hidekazu
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY 9 巻 頁： 983 2018年9月
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Discovery of Cryoprotective Activity in Human Genome-Derived Intrinsically Disordered Proteins
Matsuo Naoki, Goda Natsuko, Shimizu Kana, Fukuchi Satoshi, Ota Motonori, Hiroaki Hidekazu
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 19 巻 ( 2 ) 2018年2月
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Common molecular pathogenesis of disease-related intrinsically disordered proteins revealed by NMR analysis. 査読有り
Shigemitsu Y, Hiroaki H
Journal of biochemistry 163 巻 ( 1 ) 頁： 11-18 2018年1月
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Ecl1 is a zinc-binding protein involved in the zinc-limitation-dependent extension of chronological life span in fission yeast. 査読有り
Shimasaki T, Ohtsuka H, Naito C, Azuma K, Tenno T, Hiroaki H, Murakami H, Aiba H
Molecular genetics and genomics : MGG 292 巻 ( 2 ) 頁： 475-481 2017年4月
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Niwa, N., Shimizu, S., Maeda, Y., Hiroaki, H., Ueno, Y.
7 巻 頁： 25378-25386 2017年1月
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Nuclear magnetic resonance evidence for the dimer formation of beta amyloid peptide 1-42 in 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol. 査読有り
Shigemitsu Y, Iwaya N, Goda N, Matsuzaki M, Tenno T, Narita A, Hoshi M, Hiroaki H
Analytical biochemistry 498 巻 頁： 59-67 2016年4月
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Na, K-ATPase α3 is a death target of Alzheimer patient amyloid-β assembly. 査読有り
112 巻 ( 32 ) 頁： E4465-74 2015年8月
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用語解説 「天然変性蛋白質」 招待有り
廣明秀一
再生医療（日本再生医療学会雑誌） 14 巻 ( 3 ) 頁： 52-53 2015年8月
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A Method for Systematic Assessment of Intrinsically Disordered Protein Regions by NMR. 査読有り
Goda N, Shimizu K, Kuwahara Y, Tenno T, Noguchi T, Ikegami T, Ota M, Hiroaki H
International journal of molecular sciences 16 巻 ( 7 ) 頁： 15743-60 2015年7月
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Crystal structure of afadin PDZ domain-nectin-3 complex shows the structural plasticity of the ligand-binding site. 査読有り
Fujiwara Y, Goda N, Tamashiro T, Narita H, Satomura K, Tenno T, Nakagawa A, Oda M, Suzuki M, Sakisaka T, Takai Y, Hiroaki H
Protein science : a publication of the Protein Society 24 巻 ( 3 ) 頁： 376-85 2015年3月
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Natsuko Goda, Naoki Matsuo, Takeshi Tenno, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino, Satoshi Fukuchi, Motonori Ota & Hidekazu Hiroaki*
ntrinsically Disordered Proteins 3 巻 ( 1 ) 頁： 1-6 2015年2月
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Decreased amyloidogenicity caused by mutational modulation of surface properties of the immunoglobulin light chain BRE variable domain. 査読有り
Kobayashi Y, Tsutsumi H, Abe T, Ikeda K, Tashiro Y, Unzai S, Kamikubo H, Kataoka M, Hiroaki H, Hamada D.
Biochemistry 53 巻 ( 31 ) 頁： 5162-5173 2014年8月
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Multiple interactions of the intrinsically disordered region between the helicase and nuclease domains of the archaeal Hef protein. 査読有り
Ishino S, Yamagami T, Kitamura M, Kodera N, Mori T, Sugiyama S, Ando T, Goda N, Tenno T, Hiroaki H, Ishino Y.
J Biol Chem. 289 巻 ( 31 ) 頁： 21627-21639 2014年8月
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IDEAL in 2014 illustrates interaction networks composed of intrinsically disordered proteins and their binding partners. 査読有り
Fukuchi S, Amemiya T, Sakamoto S, Nobe Y, Hosoda K, Kado Y, Murakami SD, Koike R, Hiroaki H, Ota M.
Nucleic Acids Res. 42 巻 ( Database issue ) 頁： D320-325 2014年1月
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特集「タンパク質構造機能相関再考」~ NMRで見るタンパク質－低分子相互作用 (2013) 招待有り
廣明秀一
生化学 85 巻 ( 8 ) 頁： 679-686 2013年8月
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Tenno T, Goda N, Umetsu Y, Ota M, Kinoshita K, Hiroaki H.
Molecules 18 巻 ( 8 ) 頁： 9567-9581 2013年8月
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Recent applications of isotopic labeling for protein NMR in drug discovery. 招待有り 査読有り
Hiroaki, H*
Expert Opinion on Drug Discovery 8 巻 ( 5 ) 頁： 523-536 2013年3月
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Effect of Ca(2+) on the microtubule-severing enzyme p60-katanin. Insight into the substrate-dependent activation mechanism. 査読有り
Iwaya N, Akiyama K, Goda N, Tenno T, Fujiwara Y, Hamada D, Ikura T, Shirakawa M, Hiroaki H.
FEBS J. 279 巻 ( 7 ) 頁： 1339-1352. 2012年3月
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IDEAL: Intrinsically Disordered proteins with Extensive Annotations and Literature. 査読有り
Fukuchi S, Sakamoto S, Nobe Y, Murakami SD, Amemiya T, Hosoda K, Koike R, Hiroaki H, Ota M.
Nucleic Acids Res. 40 巻 頁： D507-511. 2011年11月
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A simplified recipe for assigning amide NMR signals using combinatorial 14N amino acid inverse-labeling. 査読有り
Hiroaki H, Umetsu Y, Nabeshima Y, Hoshi M, Kohda D.
J Struct Funct Genomics. 12 巻 ( 3 ) 頁： 167-174 2011年8月
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Structure and Function of the N-terminal Nucleolin Binding Domain of Nuclear Valosin-containing Protein-like 2 (NVL2) Harboring a Nucleolar Localization Signal. 査読有り
Fujiwara, Y., Fujiwara, K., Goda, N., Iwaya, N., Tenno, T., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
J Biol Chem. 286 巻 ( 24 ) 頁： 21732-21741. 2011年6月
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(1)H, (13)C, and (15)N resonance assignment of the SPFH domain of human stomatin. 査読有り
Tsuruta, T., Goda, N., Umetsu, Y., Iwaya, N., Kuwahara, Y., and Hiroaki, H.
Biomol NMR Assign. 6 巻 ( 1 ) 頁： 23-25. 2011年6月
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SH3YL1 regulates dorsal ruffle formation by a novel phosphoinositide-binding domain. 査読有り
Hasegawa, J., Tokuda, E., Tenno, T., Tsujita, K., Sawai, H., Hiroaki, H., Takenawa, T., and Itoh, T.
J Cell Biol. 193 巻 ( 5 ) 頁： 901-916. 2011年5月
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Structural difference of vasoactive intestinal peptide in two distinct membrane-mimicking environments. 査読有り
Umetsu, Y., Tenno, T., Goda, N., Shirakawa, M., Ikegami, T., and Hiroaki, H.
Biochim Biophys Acta. 1814 巻 ( 5 ) 頁： 724-730. 2011年5月
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(1)H, (13)C, and (15)N resonance assignment of the first PDZ domain of mouse ZO-1. 査読有り
Umetsu, Y., Goda, N., Taniguchi, R., Satomura, K., Ikegami, T., Furuse, M., and Hiroaki, H.
Biomol NMR Assign. 5 巻 ( 2 ) 頁： 207-210. 2011年3月
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SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins. 査読有り
Motono, C., Nakata, J., Koike, R., Shimizu, K., Shirota, M., Amemiya, T., Tomii, K., Nagano, N., Sakaya, N., Misoo, K., Sato, M., Kidera, A., Hiroaki, H., Shirai, T., Kinoshita, K., Noguchi, T., and Ota, M.
Nucleic Acids Res. 39 巻 頁： D487-493. 2011年1月
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Crystal structure of a PFU-PUL domain pair of Saccharomyces cerevisiae Doa1/Ufd3. 査読有り
Nishimasu, R., Komori, H., Higuchi, Y., Nishimasu, H., and Hiroaki, H.
Kobe J Med Sci. 56 巻 ( 3 ) 頁： E125-139. 2010年10月
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1H, 13C, and 15N resonance assignment of the TIR domain of human MyD88. 査読有り
Ohnishi, H., Tochio, H., Kato, Z., Kimura, T., Hiroaki, H., Kondo, N., and Shirakawa, M.
Biomol NMR Assign. 4 巻 ( 2 ) 頁： 123-125. 2010年10月
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A common substrate recognition mode conserved between katanin p60 and VPS4 governs microtubule severing and membrane skeleton reorganization. 査読有り
Iwaya, N., Kuwahara, Y., Fujiwara, Y., Goda, N., Tenno, T., Akiyama, K., Mase, S., Tochio, H., Ikegami, T., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
J Biol Chem. 285 巻 ( 22 ) 頁： 16822-16829. 2010年5月
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Structure and mutagenesis studies of the C-terminal region of licensing factor Cdt1 enable the identification of key residues for binding to replicative helicase Mcm proteins. 査読有り
Jee, J., Mizuno, T., Kamada, K., Tochio, H., Chiba, Y., Yanagi, K., Yasuda, G., Hiroaki, H., Hanaoka, F., and Shirakawa, M.
J Biol Chem. 285 巻 ( 21 ) 頁： 15931-15940. 2010年5月
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Unusual thermal disassembly of the SPFH domain oligomer from Pyrococcus horikoshii. 査読有り
Kuwahara, Y., Unzai, S., Nagata, T., Hiroaki, Y., Yokoyama, H., Matsui, I., Ikegami, T., Fujiyoshi, Y., and Hiroaki, H.
Biophys J. 97 巻 ( 7 ) 頁： 2034-2043. 2009年10月
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Structural basis for the multiple interactions of the MyD88 TIR domain in TLR4 signaling. 査読有り
Ohnishi, H., Tochio, H., Kato, Z., Orii, K. E., Li, A., Kimura, T., Hiroaki, H., Kondo, N., and Shirakawa, M.
Proc Natl Acad Sci U S A. 106 巻 ( 25 ) 頁： 10260-10265. 2009年6月
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High-resolution multi-dimensional NMR spectroscopy of proteins in human cells. 査読有り
Inomata, K., Ohno, A., Tochio, H., Isogai, S., Tenno, T., Nakase, I., Takeuchi, T., Futaki, S., Ito, Y., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
Nature. 458 巻 ( 7234 ) 頁： 106-109. 2009年3月
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The solution structure of the C-terminal domain of NfeD reveals a novel membrane-anchored OB-fold. 査読有り
Kuwahara, Y., Ohno, A., Morii, T., Yokoyama, H., Matsui, I., Tochio, H., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
Protein Sci. 17 巻 ( 11 ) 頁： 1915-1924. 2008年11月
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Intracellular protein delivery activity of peptides derived from insulin-like growth factor binding proteins 3 and 5. 査読有り
Goda, N., Tenno, T., Inomata, K., Shirakawa, M., Tanaka, T., and Hiroaki, H.
Exp Cell Res. 314 巻 ( 13 ) 頁： 2352-2361. 2008年8月
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DNA damage-induced ubiquitylation of RFC2 subunit of replication factor C complex. 査読有り
Tomida, J., Masuda, Y., Hiroaki, H., Ishikawa, T., Song, I., Tsurimoto, T., Tateishi, S., Shiomi, T., Kamei, Y., Kim, J., Kamiya, K., Vaziri, C., Ohmori, H., and Todo, T.
J Biol Chem. 283 巻 ( 14 ) 頁： 9071-9079. 2008年4月
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Kinetic and Thermodynamic Evidence for Flipping of a Methyl-CpG Binding Domain on Methylated DNA. 査読有り
Inomata, K., Ohki, I., Tochio, H., Fujiwara, K., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
Biochemistry. 47 巻 ( 10 ) 頁： 3266-3271. 2008年3月
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Fluoroscopic assessment of protein leakage during Xenopus oocytes in-cell NMR experiment by co-injected EGFP. 査読有り
Sakai, T., Tochio, H., Inomata, K., Sasaki, Y., Tenno, T., Tanaka, T., Kokubo, T., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
Anal Biochem. 371 巻 ( 2 ) 頁： 247-249. 2007年12月
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LBT/PTD dual tagged vector for purification, cellular protein delivery and visualization in living cells. 査読有り
Goda, N., Tenno, T., Inomata, K., Iwaya, N., Sasaki, Y., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
Biochim Biophys Acta. 1773 巻 ( 2 ) 頁： 141-146. 2007年2月
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Fine-tuning of protein domain boundary by minimizing potential coiled coil regions. 査読有り
Iwaya, N., Goda, N., Unzai, S., Fujiwara, K., Tanaka, T., Tomii, K., Tochio, H., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
J Biomol NMR. 37 巻 ( 1 ) 頁： 53-63. 2007年1月
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The common phospholipid-binding activity of the N-terminal domains of PEX1 and VCP/p97. 査読有り
Shiozawa, K., Goda, N., Shimizu, T., Mizuguchi, K., Kondo, N., Shimozawa, N., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
FEBS J. 273 巻 ( 21 ) 頁： 4959-4571. 2006年11月
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In-cell NMR spectroscopy of proteins inside Xenopus laevis oocytes. 査読有り
Sakai, T., Tochio, H., Tenno, T., Ito, Y., Kokubo, T., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
J Biomol NMR. 36 巻 ( 3 ) 頁： 179-188. 2006年11月
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Crystal structure of SUMO-3-modified thymine-DNA glycosylase. 査読有り
Baba, D., Maita, N., Jee, J. G., Uchimura, Y., Saitoh, H., Sugasawa, K., Hanaoka, F., Tochio, H., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
J Mol Biol. 359 巻 ( 1 ) 頁： 137-147. 2006年5月
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Optimization of size complementary of the aromatic side chain in the hydrophobic core of the designed coiled-coil. 査読有り
Sakurai, Y., Mizuno, T., Hiroaki, H., Oku, J., and Tanaka, T.
J Pept Res. 66 巻 ( 6 ) 頁： 387-394. 2005年12月
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Crystal structure of thymine DNA glycosylase conjugated to SUMO-1. 査読有り
Baba, D., Maita, N., Jee, J. G., Uchimura, Y., Saitoh, H., Sugasawa, K., Hanaoka, F., Tochio, H., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
Nature. 435 巻 ( 7044 ) 頁： 979-982. 2005年10月
-
High thermal stability imparted by a designed tandem Arg-Trp stretch in an alpha-helical coiled coil. 査読有り
Sakurai, Y., Mizuno, T., Hiroaki, H., Gohda, K., Oku, J., and Tanaka, T.
Angew Chem Int Ed Engl. 44 巻 ( 38 ) 頁： 6180-6183. 2005年9月
-
Structural characterization of the MIT domain from human Vps4b. 査読有り
Takasu, H., Jee, J. G., Ohno, A., Goda, N., Fujiwara, K., Tochio, H., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
Biochem Biophys Res Commun. 334 巻 ( 2 ) 頁： 460-465. 2005年8月
-
Structure of the UBA domain of Dsk2p in complex with ubiquitin molecular determinants for ubiquitin recognition. 査読有り
Ohno, A., Jee, J., Fujiwara, K., Tenno, T., Goda, N., Tochio, H., Kobayashi, H., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
Structure (Camb). 13 巻 ( 4 ) 頁： 521-532. 2005年4月
-
[High-throughput construction of expression vector for protein domain analysis].
Tenno, T., Goda, N., and Hiroaki, H.
Tanpakushitsu Kakusan Koso. 49 巻 ( 16 ) 頁： 2587-2594. 2004年12月
-
Structure of the N-terminal domain of PEX1 AAA-ATPase. Characterization of a putative adaptor-binding domain. 査読有り
Shiozawa, K., Maita, N., Tomii, K., Seto, A., Goda, N., Akiyama, Y., Shimizu, T., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
J Biol Chem. 279 巻 ( 48 ) 頁： 50060-50068. 2004年11月
-
Crystallographic characterization of the N-terminal domain of PEX1. 査読有り
Shiozawa, K., Maita, N., Tomii, K., Seto, A., Goda, N., Akiyama, Y., Shimizu, T., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 60 巻 ( 11 ) 頁： 2098-2099. 2004年11月
-
Two-Metal Ion, Ni(II) and Cu(II), Binding alpha-Helical Coiled Coil Peptide. 査読有り
Tanaka, T., Mizuno, T., Fukui, S., Hiroaki, H., Oku, J. I., Kanaori, K., Tajima, K., and Shirakawa, M.
J Am Chem Soc. 126 巻 ( 43 ) 頁： 14023-14028. 2004年10月
-
Structural basis for distinct roles of Lys63- and Lys48-linked polyubiquitin chains. 査読有り
Tenno, T., Fujiwara, K., Tochio, H., Iwai, K., Morita, E. H., Hayashi, H., Murata, S., Hiroaki, H., Sato, M., Tanaka, K., and Shirakawa, M.
Genes Cells. 9 巻 ( 10 ) 頁： 865-875. 2004年10月
-
High-throughput construction method for expression vector of peptides for NMR study suited for isotopic labeling. 査読有り
Tenno, T., Goda, N., Tateishi, Y., Tochio, H., Mishima, M., Hayashi, H., Shirakawa, M., and Hiroaki, H.
Protein Eng Des Sel. 17 巻 ( 4 ) 頁： 305-314. 2004年4月
-
The PRESAT-vector: asymmetric T-vector for high-throughput screening of soluble protein domains for structural proteomics. 査読有り
Goda, N., Tenno, T., Takasu, H., Hiroaki, H., and Shirakawa, M.
Protein Sci. 13 巻 ( 3 ) 頁： 652-658. 2004年3月
-
Structure of the ubiquitin-interacting motif of S5a bound to the ubiquitin-like domain of HR23B. 査読有り
Fujiwara, K., Tenno, T., Sugasawa, K., Jee, J. G., Ohki, I., Kojima, C., Tochio, H., Hiroaki, H., Hanaoka, F., and Shirakawa, M.
J Biol Chem. 279 巻 ( 6 ) 頁： 4760-4767. 2004年2月
-
Thermodynamic study of hybridization properties of heterochiral nucleic acids. 査読有り
Urata, H., Shimizu, H., Hiroaki, H., Kohda, D., and Akagi, M.
Biochem Biophys Res Commun. 309 巻 ( 1 ) 頁： 79-83. 2003年9月
-
1H, 13C and 15N backbone resonance assignments of the N-terminal domain of Drosophila GCM protein. 査読有り
Shimizu, M., Hiroaki, H., Kohda, D., Morita, E. H., Hotta, S., and Morikawa, K.
J Biomol NMR. 26 巻 ( 3 ) 頁： 277-278. 2003年7月
-
Phosphorylation of p47phox directs phox homology domain from SH3 domain toward phosphoinositides, leading to phagocyte NADPH oxidase activation. 査読有り
Ago, T., Kuribayashi, F., Hiroaki, H., Takeya, R., Ito, T., Kohda, D., and Sumimoto, H.
Proc Natl Acad Sci U S A. 100 巻 ( 8 ) 頁： 4474-4479. 2003年4月
-
NMR and ICP spectroscopic analysis of the DNA-binding domain of the Drosophila GCM protein reveals a novel Zn2+ -binding motif. 査読有り
Shimizu, M., Hiroaki, H., Kohda, D., Hosoya, T., Akiyama-Oda, Y., Hotta, Y., Morita, E. H., and Morikawa, K.
Protein Eng. 16 巻 ( 4 ) 頁： 247-254. 2003年4月
-
[Membrane associating protein domains: a new paradigm of phosphoinositide binding domains].
Hiroaki, H.
Tanpakushitsu Kakusan Koso. 46 巻 ( 13 ) 頁： 1936-1942. 2001年10月
-
The PX domain as a novel phosphoinositide- binding module. 査読有り
Ago, T., Takeya, R., Hiroaki, H., Kuribayashi, F., Ito, T., Kohda, D., and Sumimoto, H.
Biochem Biophys Res Commun. 287 巻 ( 3 ) 頁： 733-738. 2001年9月
-
Solution structure of the PX domain, a target of the SH3 domain. 査読有り
Hiroaki, H., Ago, T., Ito, T., Sumimoto, H., and Kohda, D.
Nat Struct Biol. 8 巻 ( 6 ) 頁： 526-530. 2001年6月
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Characterization of DNA, RNA and DNA/RNA duplexes containing an L-nucleotide.
Urata, H., Shimizu, H., Hiroaki, H., Kohda, D., and Akagi, M.
Nucleic Acids Res Suppl. 1 巻 頁： 243-244. 2001年
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Design of a Heterotrimeric alpha -Helical Bundle by Hydrophobic Core Engineering. 査読有り
Kashiwada, A., Hiroaki, H., Kohda, D., Nango, M., and Tanaka, T.
J Am Chem Soc. 122 巻 ( 2 ) 頁： 212 -215. 2000年12月
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Soft metal ions, Cd(II) and Hg(II), induce triple-stranded alpha-helical assembly and folding of a de novo designed peptide in their trigonal geometries. 査読有り
Li, X., Suzuki, K., Kanaori, K., Tajima, K., Kashiwada, A., Hiroaki, H., Kohda, D., and Tanaka, T.
Protein Sci. 9 巻 ( 7 ) 頁： 1327-1333. 2000年7月
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A'-form RNA double helix in the single crystal structure of r(UGAGCUUCGGCUC). 査読有り
Tanaka, Y., Fujii, S., Hiroaki, H., Sakata, T., Tanaka, T., Uesugi, S., Tomita, K., and Kyogoku, Y.
Nucleic Acids Res. 27 巻 ( 4 ) 頁： 949-955. 1999年2月
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Influence of various nucleotides on the in situ crystallization of Ca2+-ATPase. 査読有り
Hiroaki, Y., Mitsuoka, K., Cheng, Y., Hiroaki, H., and Fujiyoshi, Y.
Biochim Biophys Acta. 1415 巻 ( 2 ) 頁： 361-368. 1999年1月
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Metal Ion Induced Self-Assembly of a Designed Peptide into a Triple-Stranded a Helical Bundle: A Novel Metal Binding Site in the Hydrophobic Core. 査読有り
Suzuki, K., Hiroaki, H., Kohda, D., Nakamura, H., and Tanaka, T.
J Am Chem Soc. 120 巻 ( 50 ) 頁： 13008 -13015. 1998年12月
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An isoleucine zipper peptide forms a native-like triple stranded coiled coil in solution. 査読有り
Suzuki, K., Hiroaki, H., Kohda, D., and Tanaka, T.
Protein Eng. 11 巻 ( 11 ) 頁： 1051-1055. 1998年11月
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Determination of the solution structure of the SH3 domain of human p56 Lck tyrosine kinase. 査読有り
Hiroaki, H., Klaus, W., and Senn, H.
J Biomol NMR. 8 巻 ( 2 ) 頁： 105-122. 1996年9月
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Cloning of boar SPMI gene which is expressed specifically in seminal vesicle and codes for a sperm motility inhibitor protein. 査読有り
Iwamoto, T., Hiroaki, H., Furuichi, Y., Wada, K., Satoh, M., Satoh, M., Osada, T., and Gagnon, C.
FEBS Lett. 368 巻 ( 3 ) 頁： 420-424. 1995年7月
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Spectroscopic Characterization of the Decadeoxynucleotide Duplex Modified with Dichloroethylene-diaminoplatinum(II). 査読有り
Urata, H., Urata, M., Akagi, M., Hiroaki, H., and Uesugi, S.
Nucleosides & Nucleotides. 13 巻 頁： 1259-1269. 1994年7月
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Properties Of A Hammerhead-Type Rna Enzyme-System That Consists Of 3 Rna Oligomer Strands. 査読有り
Odai, O., Hiroaki, H., Tanaka, T., and Uesugi, S.
Nucleosides & Nucleotides. 13 巻 頁： 1569-1579. 1994年7月
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Properties of hammerhead-type RNA enzyme derivatives which contain a G-to-I replacement in the loop region.
Uesugi, S., Kodama, H., Hiroaki, H., and Odai, O.
Nucleic Acids Symp Ser. 27 巻 頁： 13-14. 1992年
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Conformational features of the four successive non-Watson-Crick base pairs in RNA duplex.
Fujii, S., Tanaka, Y., Uesugi, S., Tanaka, T., Sakata, T., and Hiroaki, H.
Nucleic Acids Symp Ser. 27 巻 頁： 63-64. 1992年
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Interaction of bleomycin with deoxyribonucleic acid oligomer: proton nuclear magnetic resonance titration study using novel bleomycin complexes with Ni2+ and VO3+. 査読有り
Hiroaki, H., Nakayama, T., Ikehara, M., and Uesugi, S.
Chem Pharm Bull (Tokyo). 39 巻 ( 11 ) 頁： 2780-2786. 1991年11月
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Conformation of 2'GMP bound to a mutant ribonuclease T1 (Y45W) determined by X-ray diffraction and NMR methods. 査読有り
Itoh, T., Tomita, K., Hakoshima, T., Hiroaki, H., Uesugi, S., Nishikawa, S., Amisaki, T., Morioka, H., Ohtsuka, E., and Ikehara, M.
J Biochem (Tokyo). 110 巻 ( 5 ) 頁： 677-680. 1991年11月
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The molecular recognition mechanism of DNA by bleomycin.
Hiroaki, H., Uesugi, S., and Fujii, S.
Nucleic Acids Symp Ser. 25 巻 頁： 147-148. 1991年
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Molecular structure of extraordinarily stable RNA: model building and X-ray analysis.
Fujii, S., Tanaka, Y., Tomita, K., Sakata, T., Hiroaki, H., Tanaka, T., and Uesugi, S.
Nucleic Acids Symp Ser. 25 巻 頁： 181-182. 1991年
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Synthesis and NMR study of ribo-oligonucleotides forming a hammerhead-type RNA enzyme system. 査読有り
Odai, O., Kodama, H., Hiroaki, H., Sakata, T., Tanaka, T., and Uesugi, S.
Nucleic Acids Res. 18 巻 ( 20 ) 頁： 5955-5960. 1990年10月
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Studies on the structure and stabilizing factor of the CUUCGG hairpin RNA using chemically synthesized oligonucleotides. 査読有り
Sakata, T., Hiroaki, H., Oda, Y., Tanaka, T., Ikehara, M., and Uesugi, S.
Nucleic Acids Res. 18 巻 ( 13 ) 頁： 3831-3839. 1990年7月
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The role of a conserved guanosine residue in the hammerhead-type RNA enzyme. 査読有り
Odai, O., Hiroaki, H., Sakata, T., Tanaka, T., and Uesugi, S.
FEBS Lett. 267 巻 ( 1 ) 頁： 150-152. 1990年7月
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Conformation and properties of hammerhead-type RNA enzymes.
Uesugi, S., Odai, O., Hiroaki, H., Kodama, H., Sakata, T., and Tanaka, T.
Nucleic Acids Symp Ser. 22 巻 頁： 41-42. 1990年
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Base recognition mechanism of bleomycin: solution structure of d(GGGGAGCTCCCC)2 based on 1H-NMR and restrained molecular dynamics.
Hiroaki, H., Ebata, T., Uesugi, S., and Fujii, S.
Nucleic Acids Symp Ser. 22 巻 頁： 53-54. 1990年
-
Identification of DNA degradation products by antitumor antibiotic, esperamicin.
Ebata, T., Hiroaki, H., Uesugi, S., and Sugiura, Y.
Nucleic Acids Symp Ser. 22 巻 頁： 19-20. 1990年
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A 2-deoxyribonolactone-containing nucleotide: isolation and characterization of the alkali-sensitive photoproduct of the trideoxyribonucleotide d(ApCpA). 査読有り
Urata, H., Yamamoto, K., Akagi, M., Hiroaki, H., and Uesugi, S.
Biochemistry. 28 巻 ( 25 ) 頁： 9566-9569. 1989年12月
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Novel 1H-31P heteronuclear coherence transfer spectroscopy based on spin locking MLEV-17 and its application to signal assignment for a short DNA fragment. 査読有り
Hiroaki, H., and Uesugi, S.
FEBS Lett. 244 巻 ( 1 ) 頁： 43-46. 1989年2月
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Synthesis and properties of RNA with catalytic activity.
Odai, O., Sakata, T., Orita, M., Hiroaki, H., Uesugi, S., and Tanaka, T.
Nucleic Acids Symp Ser. 21 巻 頁： 105-106. 1989年
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NMR studies on DNA hairpin structures with a five nucleotide loop.
Uesugi, S., Oda, Y., Hiroaki, H., and Ikehara, M.
Nucleic Acids Symp Ser. 21 巻 頁： 65-66. 1989年
書籍等出版物 11
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相分離生物学の全貌（現代化学・増刊46)
廣明秀一（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 25. 天然変性タンパク質）
東京化学同人 2020年11月 （ ISBN:978-4-8079-1346-6 ）
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In silico創薬におけるスクリーニングの高速化・効率化技術
廣明秀一（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 第一章 第７節NMRによるin-silicoスクリーニング計算結果の検証）
技術情報協会 2018年3月 （ ISBN:978-4-86104-842-5 ）
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Experimental Approaches of NMR Spectroscopy
Hidekazu Hiroaki, Daisuke Kohda（ 担当： 共著 , 範囲: Chapter 21: Protein-ligand interactions studied by NMR）
Springer 2018年1月 （ ISBN:978-981-10-5965-0 ）
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領域融合レビュー 査読有り
天野剛志, 廣明秀一（ 担当： 共著 , 範囲: 立体構造が明らかにしたGタンパク質共役受容体の刺激受容のしくみ 2-e003）
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構, データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 2013年3月
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実験医学別冊 実験ハンドブックシリーズ 改訂タンパク質実験ハンドブック 竹縄忠臣・伊藤俊樹編
廣明秀一（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 第２章 タンパク質取扱いの基礎技術（１．タンパク質の定量法、２．タンパク質の濃縮法（各種濃縮法）、３．タンパク質の透析法、４．タンパク質の保存法）、第３章 タンパク質精製法（１．タンパク質の抽出と分画、2-4. 疎水性クロマトグラフィー、４．構造研究のためのタンパク質精製前処理 NMR、X線解析に必要なタンパク質） p21-37, p49-52, p65-68, p98-102）
羊土社 2011年11月
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タンパク質の立体構造入門 : 基礎から構造バイオインフォマティクスへ
藤 博幸, 太田 元規, 川端 猛, 木下 賢吾, 白井 剛, 諏訪 牧子, 高田 彰二, 高橋 聡, 廣明 秀一, 真柳 浩太, 倭 剛久, 由良 敬（ 担当： 共著）
講談社 2010年 （ ISBN:9784061538818 ）
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分光測定入門シリーズ８ 核磁気共鳴分光法
廣明秀一（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 第一章 NMRの原理）
講談社サイエンティフィク 2009年6月
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バイオインフォマティクス事典 日本バイオインフォマティクス学会編
廣明秀一（ 担当： 分担執筆 , 範囲: １．核磁気共鳴法 ２．X線解析 ３．生体分子の構造決定法）
共立出版 2006年5月
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生物薬科学実験講座 核酸I
廣明秀一, 上杉晴一（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 第一章 核酸の合成 ： ３ ＤＮＡの化学合成）
広川書店 2004年10月
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ゲノミクス・プロテオミクスの新展開「生物情報の解析と応用」
廣明秀一（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 第二編プロテオミクス・第三節２ NMRによる構造解析のハイスループット化）
エヌティーエス 2004年5月
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分子生物学イラストレイテッド・改訂第２版
渡邊 太一, 廣明 秀一, 白川 昌宏（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 第8章 分子生物学の新領域 １．構造生物学）
羊土社 2002年6月
講演・口頭発表等 125
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グリチルリチンとタイト結合裏打ちタンパク質ZO1-PDZ1ドメインとの結合解析
日比野絵美、久田美咲、合田名都子、天野剛志、廣明秀一
令和2年度 生物物理中部支部講演会 2021年3月31日
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フラボノイドによる細胞間タイト結合の可逆的・双方向制御の試み
中島美緒、久田美咲、合田名都子、天野剛志、小竹彩香、猪爪優子、亀岡郁夫、廣明秀一
日本薬学会第141年会 2021年3月29日
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グリチルリチンのタイト結合裏打ちタンパク質ZO1 PDZ1ドメインへの結合構造の解析
日比野絵美、久田美咲、合田名都子、天野剛志、廣明秀一
日本薬学会第141年会 2021年3月28日
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医薬品吸収促進とバリア強化に応用可能なタイトジャンクション制御技術
廣明秀一
第２回ファーマラボEXPO東京 アカデミックフォーラム 2020年11月25日
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植物フラボノイド成分による上皮バリア機能制御の分子機構
廣明秀一
第１回化粧品開発展（大阪）内アカデミックフォーラム 2020年9月9日
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低分子化合物によるタイトジャンクションの制御
天野剛志, 野田 翔太, 中倉 由香子, 合田 名都子,廣明 秀一
第136回日本薬学会年会
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化学シフト温度依存性に着目した天然変性タンパク質領域の同定法
岡崎寛貴、松尾直紀、天野剛志、廣明秀一
201５年度⽣物物物理学会中部⽀部講演会
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HFIP中におけるβアミロイド(1-42)ペプチドの二量体形成
重光佳基、岩谷奈央子、天野剛志、合田名都子、松崎瑞季、成田哲博、星美奈子、廣明秀一
201５年度⽣物物物理学会中部⽀部講演会
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医療応用を志向したタンパク質・細胞の凍結保護剤
廣明秀一
第２回メディカルメッセ（【同時開催】中部地区 医療・バイオ系シーズ発表会）
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タイトジャンクションを制御する低分子化合物の探索と応用
廣明秀一・天野剛志
第２回メディカルメッセ（【同時開催】中部地区 医療・バイオ系シーズ発表会）
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Structure and molecular mechanism of the microtubule severing enzyme using NMR. 国際会議
N. Iwaya*, S. Noda, N. Goda, T. Tenno, H. Hiroaki
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Use of principal component analysis of 1H-15N NMR spectra of amyloid-β(1–42) peptide for characterization of fibril formation inhibitors. 国際会議
H. Hiroaki*, N. Iwaya, M. Matsuzaki, Y. Shigemitsu, N. Goda, Y. Abe, M. Hoshi, A. Narita
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タイトジャンクションの形成制御に関わるZO-1、LNX-1 PDZドメインのクローディンとの相互作用解析
天野-合田名都子、中倉由香子、秋吉由佳里、天野剛志、廣明秀一
BMB2015・第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同大会
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LNX-PDZ domain結合化合物NPL3007はタイト結合機能や細胞移動に影響を与える
三上 翔平、矢藤 まり、野田 翔太、廣明 秀一、伊藤 素行
BMB2015・第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同大会
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低分子化合物を使ったタイトジャンクションの調節
天野 剛志、野田 翔太、中倉 由香子、合田 名都子、廣明 秀一
BMB2015・第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同大会
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遺伝子修復因子FANCMの天然変性領域とRNase H1の相互作用の意義
清水 沙紀、合田 名都子、山上 健、石野 園子、石野 良純、兒玉 哲也、廣明 秀一
BMB2015・第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同大会
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ARHGEF11を介したZO-1 ZU5ドメインによるRhoAシグナル調節機構の解析
石原 将、天野 剛志、谷口 諒、廣明 秀一
BMB2015・第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同大会
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セレノメチレン架橋型ピリミジンヌクレオシドで修飾したアンチセンス分子
兒玉哲也， 百相義大， 森廣邦彦， 廣明秀一， 小比賀 聡
日本核酸医薬学会第1回年会
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赤血球によるオリゴ核酸送達を期待したヘモグロビン親和性化合物結合型オリゴ核酸の合成と評価
近田達哉、廣明秀一、兒玉哲也
日本核酸医薬学会第1回年会
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NMRデータベースBioMagResBankの統合的拡張と公開
小林直宏, 横地政史, 岩田武史, 本野千恵, 廣明秀一, 児嶋長次郎, 藤原敏道
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn
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重光佳基, 岩谷奈央子, 岩谷奈央子, 天野剛志, 天野剛志, 合田名都子, 松崎瑞季, 成田哲博, 星美奈子, 廣明秀一, 廣明秀一
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn
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Cryoprotective Activity in Human Genome-derived Intrinsically Disordered Proteins and Their Pharmaceutical Applications 招待有り 国際会議
廣明秀一
2015 The 5th NU-TECH ROUND TABLE
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βアミロイド(1‐42)ペプチドはHFIP中で二量体を形成する
重光佳基, 岩谷奈央子, 合田名都子, 松崎瑞希, 天野剛志, 成田哲博, 星美奈子, 廣明秀一
第15回日本蛋白質科学会年会
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清水沙紀, 合田名都子, 山上健, 石野園子, 石野良純, 廣明秀一
第15回日本蛋白質科学会年会
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松尾直紀, 合田(天野)名都子, 清水佳奈, 福地佐斗志, 太田元規, 廣明秀一
第15回日本蛋白質科学会年会
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PDZドメインをターゲットとしたタイトジャンクション制御化合物の探索
野田翔太, 天野剛志, 中倉由香子, 合田名都子, 廣明秀一
第15回日本蛋白質科学会年会
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3’,5’位間に架橋構造を導入した2’‐5’結合人工核酸の合成研究
牧野亜衣, 廣明秀一, 兒玉哲也
日本薬学会年会要旨集(CD-ROM)
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百相義大, 武田修一, 松本友治, 廣明秀一, 小比賀聡, 兒玉哲也
日本薬学会年会要旨集(CD-ROM)
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遺伝子修復因子FANCMの天然変性領域とRNase H1の相互作用の意義
清水沙紀, 合田名都子, 山上健, 石野園子, 石野良純, 兒玉哲也, 廣明秀一
日本生化学会大会(Web)
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LNX‐PDZ domain結合化合物NPL3007はタイト結合機能や細胞移動に影響を与える
三上翔平, 矢藤まり, 野田翔太, 廣明秀一, 廣明秀一, 伊藤素行
日本生化学会大会(Web)
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天野剛志, 野田翔太, 中倉由香子, 合田名都子, 廣明秀一, 廣明秀一
日本生化学会大会(Web)
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タイトジャンクションの形成制御に関わるZO‐1,LNX‐1PDZドメインのクローディンとの相互作用解析
天野(合田)名都子, 中倉由香子, 秋吉由佳里, 天野剛志, 廣明秀一, 廣明秀一, 廣明秀一
日本生化学会大会(Web)
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ARHGEF11を介したZO‐1ZU5ドメインによるRhoAシグナル調節機構の解析
石原将, 天野剛志, 谷口諒, 廣明秀一
日本生化学会大会(Web)
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守屋彩子, 廣明秀一, 兒玉哲也
日本薬学会年会要旨集(CD-ROM)
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重光佳基, 岩谷奈央子, 天野剛志, 合田名都子, 松崎瑞季, 成田哲博, 星美奈子, 廣明秀一
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn
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天然変性タンパク質と低分子のNMR滴定実験における主成分分析の利用
岩谷奈央子, 重光佳基, 天野剛志, 合田名都子, 松崎瑞希, 成田哲博, 阿部義人, 星美奈子, 廣明秀一
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn
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細胞間接着装置の制御に関わるPDZドメインの構造・機能解析
秋吉 由佳里、合田名都子、里村香織、梅津喜崇、成田宏隆、鈴木守、天野剛志、濱田大三、藤原芳江、中川敦史、古瀬幹夫、廣明秀一
第132回日本薬学会年会
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創薬標的としてのAAA-ATPaseとNMR構造生物学
廣明秀一
第一回岐阜構造生物学・医学・論理的創薬研究会シンポジウム:構造生物学・医学・論理的創薬の拠点構築を目指して
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Structural and functional analyses of human stomatin SPFH domain
Shunsuke Goto, Tomoyuki Tsuruta, Natsuko Goda, Yoshitaka Umetsu, Naoko Iwaya, Yohta Kuwahara, Takeshi Tenno, Hidekazu Hiroaki
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High-throughput construction of protein expression vector using PRESAT-vector
Natsuko Goda, Takeshi Tenno, Hidekazu Hiroaki
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Effect of Ca2+ on the microtubule-severing enzyme p60-katanin
Naoko Iwaya, Natsuko Goda, Takeshi Tenno, Daizo Hamada, Teikichi Ikura, Masahiro Shirakawa, Hidekazu Hiroaki
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細胞間接着装置タイトジャンクションの抑制(分解)因子LNX1のPDZドメインの構造解析
秋吉 由佳里、天野 剛志、中川 敦史、鈴木 守、古瀬 幹夫、廣明 秀一
平成23年度ターゲットタンパク研究プログラム公開シンポジウム 『ターゲットタンパク研究プログラムから見える未来５』
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遺伝⼦修復因⼦Hef と核⼩体タンパク質 ヌクレオリンに含まれる天然変性領域の解析
廣明秀一
新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第二回公開シンポジウム
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自己切断プロテアーゼを用いた天然変性タンパク質の調製
合田 名都子、天野 剛志、廣明 秀一
新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第二回公開シンポジウム
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細胞間接着装置タイトジャンクションの抑制(分解)因子LNX1のPDZドメインの構造解析
秋吉 由佳里、天野 剛志、中川 敦史、鈴木 守、古瀬 幹夫、廣明 秀一
平成２３年度ターゲットタンパク研究プログラム成果報告会
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A hypothesis of membrane skeleton : Are SPFH-domain proteins membrane scaffolding proteins ? 国際会議
Hidekazu Hiroaki
Kobe University-University of Washington Joint Symposium on Integrative Membrane Biology and Signal Transduction Medicine
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The interaction between optineurin and polyubiquitin chains makes foci around Golgi apparatus.
Takeshi Tenno, Hiroya Ichikawa, Takahisa Ikegami, Hidekazu Hiroaki
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自己切断プロテアーゼを用いた天然変性タンパク質の調製
合田名都子、天野剛志、石野園子、石野良純、廣明秀一
第３４回日本分子生物学学会年会
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核小体に局在するAAA ATPase, NVL2のN末端ドメインの解析
藤原芳江、合田名都子、岩谷奈央子、天野剛志、白川昌宏、廣明秀一
第３４回日本分子生物学学会年会
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大腸菌pCold-GSTシステムを用いたG蛋白質共役型受容体N末端細胞外ドメインの可溶性画分への発現
片岡沙織、林こころ、天野剛志、廣明秀一、藤原敏道、児島長次郎
第３４回日本分子生物学学会年会
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LBT/CPP-Dual tagタンパク質発現ベクターの開発とCPP配列の細胞内取込み機構の解析
天野剛志、合田名都子、坂越廣之、廣明秀一
JST/CREST生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術シンポジウム「新しい計測で生命に迫る」
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ネクチン３のC末端配列と結合したアファディンPDZドメインの構造解析
藤原芳江、合田名都子、里村香織、成田宏隆、中川敦史、高井義美、匂坂敏朗、鈴木守、廣明秀一
平成23年度日本結晶学会年会
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Contribution of NMR studies to constructing SAHG, a database of predicted protein structures from human genome.
Hidekazu Hiroaki, Natsuko Goda, Takeshi Tenno, Chieko Motono, Kentaro Tomii, Kana Shimizu, Kengo Kinoshita, Motonori Ota
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SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins, and structure prediction pipeline for eukaryotic proteins.
Chie Motono, Junichi Nakata, Ryotaro Koike, Kana Shimizu, Matsuyuki Shirota, Takayuki Amemiya, Kentaro Tomii, Nozomi Nagano, Naofumi Sakaya, Kiyotaka Misoo, Miwa Sato, Akinori Kidera, Hidekazu Hiroaki, Tsuyoshi Shirai, Kengo Kinoshita, Tamotsu Noguchi, Motonori Ota
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Structure and Function of the Two N-Terminal Domains of AAA-ATPases, p60 Katanin and Nuclear Valosin Containing Protein Like 2 (NVL2) 国際会議
Hidekazu Hiroaki
9th International Conference on AAA proteins
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NMR Analysis of the Toxic Abeta High Molecular Weight Oligomer
Hidekazu Hiroaki
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NMRを利用した創薬支援研究の現状と未来--“偶発的”なタンパク質・薬剤相互作用の構造生物学
廣明 秀一
2011 名大サマーセミナー（メディシナルサイエンスの未来）
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計測科学研究室のあゆみ
杤尾 豪人、廣明 秀一、白川昌宏
横浜市立大学鶴見キャンパス 開設10周年記念講演会 生命科学の未来-横浜市立大学鶴見キャンパス10周年を記念して-
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NMRの原理 1D/2D-NMR
廣明 秀一
2011年 日本分光学会NMR講習会
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Mechanism of mature neuron-specific toxicity induced by high-mass amyloid β-protein assembly with a unique toxic structure 国際会議
Minako Hoshi, Takayuki Ohnishi, Masafumi Inoue, Hidekazu Hiroaki, Yo-ichi Nabeshima, Akiyoshi Kakita
Alzheimer's Association International Conference 2011
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タンパク質1H-15N 二次元NMRの徹底理解 （理想的でない試料のスペクトルを中心に）
廣明 秀一
第12回若手NMR研究会
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可溶性Aβ集合体アミロスフェロイドのNMR による構造解析に向けた試料調
梅津 喜崇、天野 剛志、合田 名都子、鍋島 陽一、星 美奈子、廣明 秀一
第１１回日本蛋白質科学会
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ヒトタンパク質構造データベースSAHGによるドラッガブルなPDZドメインの探索
天野剛志、合田名都子、岩谷奈央子、廣明秀一、木下賢吾、太田元規
第１１回日本蛋白質科学会
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細胞間接着装置の制御に関わるLNX1の構造・機能解析
秋吉由佳里1、合田名都子1、成田宏隆2、鈴木守2、天野剛志1、濱田大三13、藤原芳江13、中川敦史2、古瀬幹夫134、廣明秀一
第１１回日本蛋白質科学会
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血管作動性腸管ペプチドVIPの二種類の溶液条件下での構造の比較
梅津喜崇、天野剛志、合田名都子、白川昌宏、池上貴久、廣明秀一
日本ケミカルバイオロジー学会第6回年会
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揺らいだ試料/IDP測定に特化したNMR講座１ ～スペクトルの見方、考え方～
廣明 秀一
新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識と機能発現」第二回若手育成講習会
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タンパク質の溶液NMR、基礎の基礎（HSQCの見方）
廣明 秀一
新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識と機能発現」第二回若手育成講習会
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細胞間接着装置タイトジャンクションの分解因子LNX1のX線結晶構造解析
秋吉由佳里、 成田宏隆、 中川敦史、 鈴木守、 古瀬幹夫、 ○廣明秀一
平成22年度ターゲットタンパク研究プログラム公開シンポジウム
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天然変性タンパク質データベースの構築
福地 佐斗志、野辺 由紀子、村上 聖子、佐藤 智子、坂本 盛宇、廣明 秀一、太田 元規
第33回日本分子生物学会年会 (BMB2010)
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ネクチン3のC末端配列と結合したアファディンPDZドメインの構造解析
藤原芳江、 合田(天野）名都子、 里村香織、 成田宏隆、 中川敦史、 匂坂敏朗、 鈴木守、 廣明秀一
第33回日本分子生物学会年会 (BMB2010)
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超好熱菌Pyrococcus horikosiiのSPFHスーパーファミリーに属する膜タンパク質群の機能構造と膜小胞体形成
松井郁夫、桑原陽太、松井えり子、廣明秀一、横山英志
第33回日本分子生物学会年会 (BMB2010)
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NF-kB シグナリングに関わるユビキチン結合型Zn2+フィンガードメインの構造・機能解析
天野 剛志、 市川 大哉、 池上 貴久、 廣明 秀一
第49回NMR討論会
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Structure and function of the N-terminal nucleolin binding domain of nuclear valocine containing protein like 2 (NVL2)
Yoshie Fujiwara, Ken-ichiro Fujiwara, Natsuko Goda, Naoko Iwaya, Takeshi Tenno, Masahiro Shirakawa, Hidekazu Hiroaki
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細胞接着装置ネクチン・アファジン複合体の構造解析
藤原芳江、里村香織、廣明秀一、成田宏隆、中川敦史、鈴木守
平成22年度ターゲットタンパク研究プログラム成果報告会
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X-ray crystallography of PDZ domains from LNX1, an E3 ubiquitin ligase regulating intercellular adhesion machinery.
秋吉 由佳里、成田 宏隆、合田(天野） 名都子、里村 香織、藤原 芳江、中川 敦史、鈴木 守、古瀬 幹夫、廣明 秀一
日本生物物理学会第48回年会
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SOFAST-HMQC/BEST-HNCAの理解と蛋白質NMRのケミカルバイオロジーへの応用
廣明 秀一
平成22年度分光学会NMR分光部会シンポジウム
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NMR study of a highly toxic Ab peptide oligomer (amylospheroid) and other Ab oligomers. 国際会議
Hidekazu Hiroaki, Yoshitaka Umetsu, Natsuko Goda, Takeshi Tenno, Daizo Hamada, Yoichi Nabeshima, Minako Hoshi.
International Conference of Magnetic Resonance in Biological Systems XXIV
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A common mechanism of katanin p60 and Vps4 governs cytoskeleton and membrane skeleton disassembly.
廣明 秀一
グローバルCOE「統合的膜生物学の国際研究教育拠点」第4回ワークショップ
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Extensive search for crystallization condition of afadin PDZ domain
藤原 芳江、合田(天野） 名都子、里村 香織、匂坂 敏朗、鈴木 守、廣明 秀一
グローバルCOE「統合的膜生物学の国際研究教育拠点」第4回ワークショップ
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天然変性タンパク質データベースの構築
福地 佐斗志、梅嵜 雅人、野辺 由紀子、村上 聖子、佐藤 智子、坂本 盛宇、廣明 秀一、太田 元規
第10回日本蛋白質科学会年会
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ドメイン構造に基づいたＡＡＡ - ＡＴＰａｓｅの分類と機能メカニズムの予測
廣明 秀一、藤原 芳江、岩谷 奈央子、合田(天野） 名都子、池上 貴久、白川 昌宏
第10回日本蛋白質科学会年会
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ヒトゲノム構造・機能アノテーションデータベースSAHG(Structurral Atlas of Human Genome)の構築
本野 千恵、中田 淳一、清水 佳奈、富井 健太郎、長野 希美、野口 保、廣明 秀一、雨宮 崇之、城田 松之、小池 亮太郎、白井 剛、木下 賢吾、太田 元規
第10回日本蛋白質科学会年会
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In-Cell NMRを用いた蛋白質の相互作用解析に向けて
猪俣 晃介、真板 綾子、村山 秀平、磯貝 信、天野 剛志、二木 史朗、伊藤 隆、廣明 秀一、杤尾 豪人、白川 昌宏
第10回日本蛋白質科学会年会
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細胞間接着装置の制御に関わるE3酵素LNX1由来PDZドメインのX線構造解析
秋吉 由佳里、成田 宏隆、合田(天野） 名都子、里村 香織、藤原 芳江、中川 敦史、鈴木 守、古瀬 幹夫、廣明 秀一
第10回日本蛋白質科学会年会
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微小管動態を制御する蛋白質katanin p60の構造生物学的研究
岩谷奈央子、藤原芳江、合田(天野）名都子、天野剛志、白川昌宏、廣明秀一
第57回日本生化学会近畿支部例会
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細胞接着装置タイトジャンクションを制御する化合物探索の試み
廣明 秀一、里村 香織、合田（天野） 名都子、間瀬 省吾、池上 貴久、古瀬 幹夫
日本ケミカルバイオロジー学会第5回年会
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細胞接着装置構成タンパク質の構造生物学的研究-ZO1-PDZ1を標的としたケミカルバイオロジー
廣明 秀一
平成21年度ターゲットタンパク研究プログラム公開シンポジウム
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細胞接着装置構成タンパク質の構造生物学的研究-ZO1-PDZ1を標的としたケミカルバイオロジー
廣明 秀一
ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
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PRESAT-vector を用いた天然変性タンパク質配列の網羅的検証系の確立
合田（天野） 名都子、清水 佳奈、桑原 陽太、天野 剛志、池上 貴久、太田 元規、廣明 秀一
第32回日本分子生物学会年会
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構造生物学と計算機科学に基づいたタイトジャンクションを制御する化合物の探索
間瀬 省吾、里村 香織、合田（天野） 名都子、秋吉 由佳里、天野 剛志、古瀬 幹夫、廣明 秀一
日本生物物理学会第47回年会
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ドメイン構造から理解するＡＡＡ - ＡＴＰａｓｅの機能分担
廣明 秀一
京都大学低温物質科学研究センター 第8回講演会・研究交流会「構造生物学の現状と未来」
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ユビキチン結合型ジンクフィンガードメインの構造・機能解析
天野 剛志、市川 大哉、廣明 秀一
第２回神戸大学バイオサイエンス・若手研究者交流会
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NMRの原理
廣明 秀一
分光学会第45回夏期セミナー
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Stuructural and functional analysis of the N-terminal domain of Nuclear VCP-like Protein, NVL2
Yoshie Fujiwara, Natsuko Goda, Naoko Iwaya. Masahiro Shirakawa, Hidekazu Hiroaki
Innovative Nanoscience of Supermolecular Motor Proteins Working in Biomembranes
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Structural ans functional analysis for ZU5 domain of tight junction protein ZO-1
Takeshi Tenno, Kaori Satomura, Natsuko Goda, Mikio Furuse, Hirdekazu Hiroaki
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基礎から理解する溶液NMRの最新技術
廣明 秀一
第48回NMR討論会
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NMRによる天然変性タンパク質配列の網羅的検証法
合田（天野） 名都子、清水 佳奈、桑原 陽太、野口 保、池上 貴久、太田 元規、廣明 秀一
日本生物物理学会第47回年会
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核に存在するVCP様タンパク質、NVL2のN末端ドメインの解析
藤原 芳江、岩谷 奈央子、藤原 健一朗、白川 昌宏、廣明 秀一
第56回日本生化学会近畿支部例会
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熱により不可逆的に解離するPH0470由来のSPFHドメイン多量体
桑原 陽太、雲財 悟、永田 崇、池上 貴久、廣明 洋子、藤吉 好則、廣明 秀一
第９回日本蛋白質科学会年会
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核に存在するVCP様蛋白質NVL2のN末端ドメインの解析
藤原 芳江、岩谷 奈央子、藤原 健一朗、白川 昌宏、廣明 秀一
第９回日本蛋白質科学会年会
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核に存在するVCP様蛋白質、NVL2のN末端ドメインの構造・機能解析
藤原 芳江、藤原 健一朗、合田（天野） 名都子、岩谷 奈央子、天野 剛志、白川 昌宏、廣明 秀一
第２回神戸大学バイオサイエンス・若手研究者交流会
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LBT/PTD-Dual-Tag蛋白質発現ベクターの開発とPTD配列の細胞内取り込み機構の解析
天野剛志、合田（天野） 名都子、廣明 秀一
ＣＲＥＳＴ 「生命現象」 平成2１年度中間報告会・終了報告会
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P. horikoshiiのStomatin PH0470のSPFHドメインオリゴマーの特異な熱解離
廣明 秀一
JST-CNRS合同「マリーンゲノム・バイオ分野」セミナー 新規ウイルス様膜小胞体の発見と超好熱性古細菌での機能解明に向けて
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新規細胞膜透過ペプチドIGFBP3, IGFBP5のNMR構造解析
坂越 廣之、合田(天野） 名都子、天野 剛志、池上 貴久、廣明 秀一
第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
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In-Cell NMR法による真核細胞内におけるタンパク質－タンパク質およびタンパク質－低分子薬剤間相互作用の観察への試み
猪股 晃介、大野 綾子、杤尾 豪人、磯貝 信、天野 剛志、中瀬 生彦、竹内 敏秀、二木 史朗、伊藤 隆、廣明 秀一、白川昌宏
第47回NMR討論会
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カタニンp60による微小管切断メカニズムの構造生物学的基盤
藤原 芳江、桑原 陽太、岩谷奈央子、秋山浩平、合田(天野） 名都子、廣明 秀一
日本生物物理学会第46回年会
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In-Cell NMR法による真核細胞内におけるタンパク質－タンパク質およびタンパク質－低分子薬剤間相互作用の観察への試み
猪股 晃介、大野 綾子、杤尾 豪人、磯貝 信、天野 剛志、中瀬 生彦、竹内 敏秀、二木 史朗、伊藤 隆、廣明 秀一、白川昌宏
第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
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NMRによるVPAC2細胞外ドメインのリガンド認識機構の解析
天野 剛志、岩田 麻知子、合田（天野） 名都子、池上 貴久、廣明 秀一
第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
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A method for high-throughput construction of bacterial protein expression vector and its application for cell biology. 国際会議
廣明 秀一、合田(天野） 名都子、天野 剛志、田中 俊樹、白川 昌宏
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細胞接着装置の細胞質因子の相互作用ネットワーク の構造生物学的解析
廣明 秀一、里村 香織、藤原 芳江、天野 名都子、天野 剛志
平成20年度ターゲットタンパク研究プログラム公開シンポジウム
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蛋白質立体構造決定の現場においてなぜバイオインフォマティクスが必要か？
廣明 秀一
第73神戸バイオサイエンス研究会
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IGFBP3, IGFBP5由来ペプチドを用いた細胞への蛋白質導入と、LBTを用いた検出法
合田（天野） 名都子、猪股 晃介、天野 剛志、白川 昌宏、田中 俊樹、廣明 秀一
第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
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NMRによる速いH/D交換速度の新しい測定法と、蛋白質機能解析への応用
廣明 秀一
第７回日本蛋白質科学会年会
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Structure and function of the MIT-domain variant isolated from katanin p60, a microtubule severing enzyme. 国際会議
岩谷奈央子、秋山浩平、雲財悟、 富井健太郎、合田名都子、杤尾豪人、白川昌宏、廣明秀一
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NMRによる速いH/D交換測定を用いたタンパク質立体構造転移の検出
廣明 秀一
日本生物物理学会第４５回年会
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NMRによる超好熱菌Pyrococcus horikoshii由来膜タンパク質PH0470 SPFHドメインの構造機能解析
桑原 陽太、雲財悟、永田崇、横山英志、松井郁夫、廣明秀一
第３０回分子生物学会年会・第８０回生化学会大会
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新規ペプチドタグを用いた細胞へのタンパク質導入と検出法
合田（天野）名都子、天野剛志、猪股晃介、白川昌宏、田中俊樹、廣明秀一
第３０回分子生物学会年会・第８０回生化学会大会
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NMRによるVIP受容体細胞外ドメインのリガンド認識機構の解析
天野剛志、岩田麻知子、合田（天野）名都子、廣明秀一
第３０回分子生物学会年会・第８０回生化学会大会
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エンドソーム膜出芽と微小管切断に関わる分子に共通するドメイン構成
廣明 秀一
第３０回分子生物学会年会・第８０回生化学会大会
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疾病に関連する細胞膜結合タンパク質の構造生物学
廣明 秀一
第３回血液免疫ネットワーク in 金沢
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Computational and experimental approaches to protein interactions and complexes
廣明 秀一
JST-BIRD国際ワークショップ、蛋白研セミナー、"Experimental Aspects of protein-lipid interaction by NMR.”
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The Solution structure of the C-terminal domain of NfeD reveals a novel membrane-anchored OB-fold. 国際会議
桑原 陽太、大野綾子、森井太一、合田名都子、横山英志、松井郁夫、白川昌宏、廣明秀一
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新規蛍光標識タグLBTの利用と細胞膜透過ペプチドの探索
廣明 秀一
第３回神戸大学医学シーズフォーラム
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エンドサイトーシスと膜構造変換に関連したタンパク質ドメインの構造生物学
廣明 秀一
神戸大学グローバルCOE第一回研究討論会
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構造生物学の現場になぜバイオインフォマティクスが必要か
廣明 秀一
バイオインフォマティクス推進事業シンポジウム・長浜バイオインフォ祭
共同研究・競争的資金等の研究課題 11
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認知症・タウオパチーの根本治療を志向した微小管切断酵素阻害の探索
2013年4月 - 2014年3月
研究成果展開事業 研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP)
資金種別：競争的資金
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解析拠点相関構造解析業務相関構造解析 蛋白質動態変化に特化した分子間相互作用のNMR検出技術
2012年11月 - 2015年3月
創薬等支援技術基盤プラットフォーム補助金
資金種別：競争的資金
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ESCRT-III経路の活性化に着目したPD・AD根本治療法開発の基盤
2012年10月 - 2014年9月
平成２４年度調査研究助成
資金種別：競争的資金
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細胞接着装置タイトジャンクションを制御する低分子シード化合物探索
2012年10月 - 2013年9月
研究成果展開事業 研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP)
資金種別：競争的資金
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ヌクレオリンによる核酸医薬のガン細胞特異的シャトル機構の解明
2011年 - 2013年
科学研究費助成事業
資金種別：競争的資金
ヌクレオリンは核小体に局在する蛋白質として知られるが、近年の研究で核質・細胞質・細胞表面にも存在していることが明らかになっている。細胞表面のヌクレオリンはウイルスの分子標的など、リガンド受容体として機能し、またがん細胞のマーカーの一つである。本研究では抗がん剤として開発中の核酸医薬AS1411の、ヌクレオリンによる細胞内取り込みにおける分子認識機構を検討した。ヌクレオリンによるAS1411の認識にはRNA結合性ドメイン(RRM1～4およびGARドメイン)が関与することは既知であるが、AS1411は4本鎖構造を特徴としており、その認識機構は未知である。ドミナントに結合するドメイン解明のため、ヌクレオリン本来のドメインの連続性を維持したままドメイン分割し、一群の部分蛋白質を用意した。一方AS1411の4本鎖構造はこれまで、主に2本のDNA鎖によって形成されていると考えられてきたが、アニール条件により単独鎖由来の4本鎖構造も含む、分取可能な複数のピーク
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立体構造情報を高度に利用した合成生物学によるAAA-ATPaseのメカニズム解明
2010年 - 2012年
科学研究費助成事業
資金種別：競争的資金
立体構造情報を高度に駆使し、I型/II型AAA-ATPaseをN末端ドメイン部分とAAA部分に機能分解することで、Katanin p60の基質(tubulin)結合部位を同定し、Ca^2+による新規の活性制御メカニズムを発見した。またNVL2についてはN末端ドメインの立体構造決定に成功し、結合標的(nucleolin)を同定した。得られた情報に基づき、Katanin p60の微小管切断機構ならびにNVL2の細胞内機能について仮説を提案した。
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ランタニド結合配列を用いたエンドソーム・マクロピノソームの可視化
2007年 - 2008年
科学研究費助成事業
資金種別：競争的資金
本研究の目的は(1)わずか17アミノ酸残基の蛍光標識タグであるランタニド結合タグ(LBT)を用いた細胞生物学研究に適したバイオイメージング技術を確立すること、(2)とくにマクロピノサイトーシスやエンドソームのリサイクル現象を可視化すること、(3)新規のタンパク質細胞内導入ドメイン(PTD)を単離すること、の3点である。これらについて以下の成果を得た。●哺乳動物細胞での遺伝子発現ベクターpCDNA3.1にクローニングされた遺伝子に、LBTタグを付加して培養細胞でのタンパク質の発現を確認した。マクロピノサイトーシス時の細胞骨格の再構成の可視化に向けて、別途GFP-tubulinの安定発現細胞株の樹立を行った。LBTで可視化した別の細胞骨格・エンドソーム関連因子との二重染色の実験は現在進行中である。●ヒトの蛋白質由来の新規PTD配列2種(IGFBP-3/IGFBP-5)を単離同定し、その細胞内導入の経路がHIV-TATと同様のヘパリン依存的マクロピノサイトーシス経路であることを明らかにした(Exp.C
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AAA型ATPaseに隠されたオルガネラアダプターの分子基盤
2004年 - 2005年
科学研究費助成事業
資金種別：競争的資金
AAA-ATPaseは、細菌からヒトまで広く保存されているタンパク質ファミリーであり、ATP加水分解エネルギーを利用して、タンパク質のunfoldや複合体の解離を行う。その分子中央部分に、AAAドメインを一つ有するI型と2つ有するII型に大別される。また、19SプロテアソームのようにN末端部分にドメインを持たないもの、PEX1のように更に長い(〜500残基)配列を有するものなどがあり,ドメイン解剖学的研究が必須であった.そこで,まずタンパク質ドメイン発現系を効率よく作成する方法論(PRESAT-vector法)を確立した。それを用いてII型酵素ペルオキシソーム因子PEX1のN末端から新規のドメインを発見し,結晶構造解析に成功した。驚くべきことに、14%という低い配列相同性ながらその構造は他の膜融合装置のそれに酷似していた。また,エンドソームに局在するI型酵素Vps4と,類縁の微小管切断因子katanin p60のN末端から,ドメインを単離し立体構造決定を行った.前者のドメイン(MIT)の分子表面には,標的となるESCR
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たんぱく質間相互作用を介した膜受容体による情報伝達機構の構造学的研究
2003年 - 2008年
科学研究費助成事業
資金種別：競争的資金
本研究期間中に、チミンDNAグリコシラーゼ(TDG)についてSUMO-3化されたTDGの中央領域の立体構造を論文発表し、非共役型のSUMO-1/TDGの中央領域の立体構造、を解析した。またMCAF1のSUMO結合領域(SIM)とSUMO-3の複合体の立体構造をNMRにより決定した。岐阜大学医学研究科の加藤善一郎博士らとの共同研究により、Myd88のTIRドメインの立体構造をNMRによって決定し、さらにシグナル伝達に関与する分子表面残基を解析した。
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ヒトホスホリパーゼDのドメイン解剖学による細胞シグナル伝達機構の研究
2002年 - 2003年
科学研究費補助金(若手研究(B))
資金種別：競争的資金
本研究は、ヒトホスホリパーゼD(PLD)と代謝産物ホスファチジン酸(PA)のシグナル伝達機構を、構造生物学的に解明することが最終的な目的である。本課題では、(1)PLDの細胞内局在や活性を制御しているN末端領域から、単独でfoldingするドメインを単離し構造解析を行うドメイン解剖学的研究、(2)PLDシグナル経路下流に存在するエフェクターを同定する目的で新規PA結合ドメインの探索、(3)両者に共通するドメイン解剖学の基盤技術の開発を行った。その結果(1)PLDのN末端に存在するPLD1-PXの発現系・巻き戻し条件を確立しNMR測定に成功した。PLD1-PXは溶解度が低く、部分的に非特異的に会合し、6割強のNMRシグナルしか観測できなかった。生化学的実験には十分な試料を得る方法が確立できた。今後、脂質結合特異性を決定する。(2)2003年にJangらによりPLD2-PXとPLCγ1-SH3の相互作用のシグナル伝達における重要性が示された。類似のドメイン間相互作用系として、PLD2-PXよりも溶解度の高いp47PXとp47SH3Cを用いて、脂質結合の変化を調べた。PI(45)P_2との結合はSH3により阻害される一方、PAとの結合は阻害されなかった(論文1)(3)新規膜結合ドメインを探索するために、それに適した発現系構築法(PRESAT-vector法)を開発し、MITドメインとPXAドメイン計9種類の発現実験を行った(論文2)。いずれもエンドソーム因子SNX中でPXに隣接して現れるドメインであり、PLD下流因子である可能性がある。現在、MITの一つにPIP結合活性があることを見出し、立体構造解析中である。(4)ドメイン解剖学的手法の基盤として、溶解度の低い蛋白質ドメインのNMR解析法を開発した。GCMをモデル試料として実証実験を行い、その完全帰属に成功した(論文3)。
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ヒトホスホリパーゼDのドメイン解剖学による細胞シグナル伝達機構の研究
2002年 - 2003年
科学研究費助成事業
資金種別：競争的資金
本研究は、ヒトホスホリパーゼD(PLD)と代謝産物ホスファチジン酸(PA)のシグナル伝達機構を、構造生物学的に解明することが最終的な目的である。本課題では、(1)PLDの細胞内局在や活性を制御しているN末端領域から、単独でfoldingするドメインを単離し構造解析を行うドメイン解剖学的研究、(2)PLDシグナル経路下流に存在するエフェクターを同定する目的で新規PA結合ドメインの探索、(3)両者に共通するドメイン解剖学の基盤技術の開発を行った。その結果(1)PLDのN末端に存在するPLD1-PXの発現系・巻き戻し条件を確立しNMR測定に成功した。PLD1-PXは溶解度が低く、部分的に非特異的に会合し、6割強のNMRシグナルしか観測できなかった。生化学的実験には十分な試料を得る方法が確立できた。今後、脂質結合特異性を決定する。(2)2003年にJangらによりPLD2-PXとPLCγ1-SH3の相互作用のシグナル伝達における重要性が示された。類似のドメイン間相互作用系として、PLD2-PXよりも溶解度の高いp47PXとp47SH3Cを
科研費 15
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立体構造情報を活用した上皮細胞の接着と細胞形態の動的制御機構の解明
2015年 - 2017年
科学研究費補助金 基盤研究(B)
廣明 秀一
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天然変性タンパク質の分子シールド効果を応用したタンパク質凝集抑制剤
2016年4月 - 2017年3月
科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究
廣明 秀一
担当区分：研究代表者
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機能未知天然変性タンパク質の細胞医療への応用
2014年 - 2015年
科学研究費補助金
廣明 秀一
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ヌクレオリンによる核酸医薬のガン細胞特異的シャトル機構の解明
2011年 - 2013年
科学研究費補助金 基盤研究(C)
藤原 芳江
ヌクレオリンは核小体に局在する蛋白質として知られるが、近年の研究で核質・細胞質・細胞表面にも存在していることが明らかになっている。細胞表面のヌクレオリンはウイルスの分子標的など、リガンド受容体として機能し、またがん細胞のマーカーの一つである。本研究では抗がん剤として開発中の核酸医薬AS1411の、ヌクレオリンによる細胞内取り込みにおける分子認識機構を検討した。ヌクレオリンによるAS1411の認識にはRNA結合性ドメイン(RRM1～4およびGARドメイン)が関与することは既知であるが、AS1411は4本鎖構造を特徴としており、その認識機構は未知である。ドミナントに結合するドメイン解明のため、ヌクレオリン本来のドメインの連続性を維持したままドメイン分割し、一群の部分蛋白質を用意した。一方AS1411の4本鎖構造はこれまで、主に2本のDNA鎖によって形成されていると考えられてきたが、アニール条件により単独鎖由来の4本鎖構造も含む、分取可能な複数のピークに分離できることが報告された。そこで分取の再現性を確認し、代表的なピークも分取した。以上を用いてバンドシフトアッセイを試みたが、結合の確定的な判定は難しかった。AS1411の4本鎖構造形成は1塩基付与でも容易に影響をうけてしまうことから、BIAcore等の別手法によりヌクレオリンとの結合を今後判定する必要がある。
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立体構造情報を高度に利用した合成生物学によるAAA-ATPaseのメカニズム解明
2010年 - 2012年
科学研究費補助金 基盤研究(C)
廣明 秀一
立体構造情報を高度に駆使し、I型/II型AAA-ATPaseをN末端ドメイン部分とAAA部分に機能分解することで、Katanin p60の基質(tubulin)結合部位を同定し、Ca^2+による新規の活性制御メカニズムを発見した。またNVL2についてはN末端ドメインの立体構造決定に成功し、結合標的(nucleolin)を同定した。得られた情報に基づき、Katanin p60の微小管切断機構ならびにNVL2の細胞内機能について仮説を提案した。
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タンパク質天然変性状態の情報基盤の確立と展開
2009年 - 2013年
科学研究費補助金 文部科学省新学術領域研究
太田 元規
本年度は、データベース(IDEAL)のデータ表示や検索機能ができる仕組みを開発し、データベースの一般公開を行った。データ表示法として天然変性/球状構造領域を直感的に理解できるインターフェースの工夫を行い、修飾残基、相互作用情報、ドメイン情報とあわせて表示するようにした。注釈付け方法、データベースの仕様、表示系の各々が確立し、データベース開発が軌道に乗った。この一般公開に合わせ、Nucleic Acids Research誌のデータベース特集号に論文を発表し、周知をはかった。現在、公開中のデータは、157タンパク質、161の機能性変性領域、の情報を有しており、さらに89タンパク質のデータの公開を近日中に予定している。公開中のデータで、特に機能性変性領域のコレクションはIDEALが提供する世界で唯一のデータである。このほか,天然変性タンパク質CARMILの機能発現機構を調べるために,CARMILやその相互作用の相手であるCPの分子動力学計算を開始した.実験では,天然変性領域(IDR)を解析するために,安定同位体標識試料を調製するための新規の発現系の構築を行った.これは,IDRが^<13>C/^<15>N含有最少培地で培養した大腸菌体内で分解されることを抑えるために,積極的に封入体への産物蓄積を行ったのちに,精製タグが自動的に切断されるという豚コレラウイルス由来プロテアーゼN(pro)をN末端に融合する発現系である.これを活用して,領域内の他班との共同研究を進め,古細菌Hef,ヒトFANC-MのIDP領域の試料の^<15>N標識試料の調製に成功し,NMR実験を開始した.また,核小体タンパク質ヌクレオリンのC末端天然変性領域(GARドメイン)に,ヌクレオリンと相互作用する新規因子NVL2との相互作用を強める機能があることを発見した.
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ランタニド結合配列を用いたエンドソーム・マクロピノソームの可視化
2007年 - 2008年
科学研究費補助金
廣明 秀一
本研究の目的は(1)わずか17アミノ酸残基の蛍光標識タグであるランタニド結合タグ(LBT)を用いた細胞生物学研究に適したバイオイメージング技術を確立すること、(2)とくにマクロピノサイトーシスやエンドソームのリサイクル現象を可視化すること、(3)新規のタンパク質細胞内導入ドメイン(PTD)を単離すること、の3点である。これらについて以下の成果を得た。●哺乳動物細胞での遺伝子発現ベクターpCDNA3.1にクローニングされた遺伝子に、LBTタグを付加して培養細胞でのタンパク質の発現を確認した。マクロピノサイトーシス時の細胞骨格の再構成の可視化に向けて、別途GFP-tubulinの安定発現細胞株の樹立を行った。LBTで可視化した別の細胞骨格・エンドソーム関連因子との二重染色の実験は現在進行中である。●ヒトの蛋白質由来の新規PTD配列2種(IGFBP-3/IGFBP-5)を単離同定し、その細胞内導入の経路がHIV-TATと同様のヘパリン依存的マクロピノサイトーシス経路であることを明らかにした(Exp.Cell Res.,314 2352-2361.(2008))。●IGFBP-5由来の新規PTD配列のヘパリン結合時の立体構造を調べた結果、HIV-TATと異なりa-helix構造が誘導されないことが明らかになった。この差がIGFBP由来PTDとHIV-TATの導入速度の差に関連して,いる可能性がある。●京都大学との共同研究を行い、LBT-PTD-二重タグ付きUbが活用して導入効率の向上を検定した。HIV-TAT由来PTDを用いて蛋白質導入を行い、最終的に生きたヒト細胞に15N標識した蛋白質を導入しその多次元NMRを測定するIn-cell NMRP技術の確立に貢献した(Nature458106-109(2009)).これらの研究は、おおむね研究実施計画どおりに進行しており、マクロピノサイトーシスの観察手法としてのLBT蛍光イメージング法はほぼ実用化できた。
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AAA型ATPaseに隠されたオルガネラアダプターの分子基盤
2004年 - 2005年
科学研究費補助金 基盤研究(C)
廣明 秀一
AAA-ATPaseは、細菌からヒトまで広く保存されているタンパク質ファミリーであり、ATP加水分解エネルギーを利用して、タンパク質のunfoldや複合体の解離を行う。その分子中央部分に、AAAドメインを一つ有するI型と2つ有するII型に大別される。また、19SプロテアソームのようにN末端部分にドメインを持たないもの、PEX1のように更に長い(〜500残基)配列を有するものなどがあり,ドメイン解剖学的研究が必須であった.そこで,まずタンパク質ドメイン発現系を効率よく作成する方法論(PRESAT-vector法)を確立した。それを用いてII型酵素ペルオキシソーム因子PEX1のN末端から新規のドメインを発見し,結晶構造解析に成功した。驚くべきことに、14%という低い配列相同性ながらその構造は他の膜融合装置のそれに酷似していた。また,エンドソームに局在するI型酵素Vps4と,類縁の微小管切断因子katanin p60のN末端から,ドメインを単離し立体構造決定を行った.前者のドメイン(MIT)の分子表面には,標的となるESCRT-III複合体の結合部位と考えられる特徴的な溝が存在していた.後者はドメイン直後にコイルドコイル領域が存在するため,解析可能な試料を得るにはコイルドコイル配列の改変技術が不可欠であった.さらにN末端ドメインをもたないプロテアソームについては,基質認識を行うシャトル因子と呼ばれる別のタンパク質が介在しているが,そのうちの一つDsk2についてUBAドメインとユビキチン複合体の構造決定を行った.また19Sプロテアソームによる基質認識機構について、K48linkポリUb鎖のみを基質とし、K63linkは基質としないという特異性を解明するため、両者の動的性質の違いをNMRにより比較した。解析を行った5例のうち2例に,脂質結合活性があることを見出した.
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異常凝集体の細胞内形成と分泌によるアルツハイマー病神経細胞死の伝播
研究課題/研究課題番号：17H04055 2017年4月 - 2020年3月
星 美奈子
担当区分：研究分担者
アルツハイマー病の神経細胞死は、生理的に産生されているアミロイドβ（Aβ）が凝集し毒性を獲得することで起こる。しかし、Aβ凝集体がいかに形成され、いかに細胞死を起こし、病変が脳内でいかに伝播するかは不明である。
本研究では、申請者らが患者脳から発見したAβ凝集体ASPDに焦点を合わせ上記の解明を目指した。その結果、Aβは全ての神経細胞で産生されるが、ASPDは特定の神経細胞内で産生され分泌され、ナトリウムポンプNAKα3に結合しNAKα3発現神経細胞を死に至らしめることなどを明らかにした。そして、ASPDとNAKα３との結合を阻止するシードペプチドを探索し得ることが出来、創薬への基盤も開いた。
今回の研究により、Aβの凝集体形成が、単純にAβの濃度だけで決まっている訳ではないことが初めて明確に示された。アルツハイマー病の治療法開発としては、神経細胞の保護機能がある生理的Aβを全て除去することは好ましくない。これにかわる新たな治療法が求められているが、それに対する新たな可能性を提示出来た。また、実際に形成された凝集体と、その標的となるナトリウムポンプの結合を阻止するシードペプチドを発見したことは、創薬への現実的な一歩となる成果である。さらに、ナトリウムポンプは、パーキンソン病など他の神経変性疾患の病態とも関連することから、本研究の成果は他の神経変性疾患にも敷衍可能である。 -
天然変性タンパク質の分子シールド効果を応用したタンパク質凝集抑制剤
研究課題/研究課題番号：16K14707 2016年4月 - 2018年3月
廣明 秀一
担当区分：研究代表者
配分額：3770000円 （ 直接経費：2900000円 、 間接経費：870000円 ）
分子クラウディング効果とは，細胞内のような高濃度の高分子溶液中で，分子の性質が変化する現象である．筆者は，天然変性タンパク質(IDP)の高分子クラウダーとしての性質に着目し，ヒトゲノムにコードされているIDPにタンパク質に対する凍結保護活性を見出した．この効果は，従来理論（排除体積効果）では説明できず，新たに分子シールド効果について解析する必要がある．二つのモデルタンパク質(VLドメイン・Aβペプチド)で検証し，IDPには新たにAβペプチドのアミロイド線維形成阻害活性があることを見だした．
併せて，既存のタンパク質試料中からIDP領域を判別する簡便なNMR分析手法の開発にも成功した． -
天然変性タンパク質の分子シールド効果を応用したタンパク質凝集抑制剤
2016年4月 - 2017年3月
科学研究費補助金
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データベースを利用したNMR創薬支援パイプラインの開発
研究課題/研究課題番号：15K06970 2015年4月 - 2018年3月
小林 直宏
担当区分：連携研究者
ゲノム配列にコードされ実験的に解明されている立体構造は全体の約10％程度であり、近年では構造予測モデルを使った創薬研究事例が増加する傾向がある。本研究課題では核磁気共鳴(NMR)研究のターゲットとなりうるモデル構造データベースをNMR実験データのデータベースであるBMRBなどの複数の外部生命科学系データベースとリンクをさせる創薬支援データベースを構築した。平成28～29年度においてはデータベースを活用し、深層学習を基盤とした自動解析パイプラインを設計し、創薬研究に必要となるNMRシグナル帰属と溶液立体構造決定を従来の4分の1程度のNMRデータを用いた自動解析により半日程度まで短縮可能にした。
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立体構造情報を活用した上皮細胞の接着と細胞形態の動的制御機構の解明
研究課題/研究課題番号：15H04337 2015年4月 - 2018年3月
廣明 秀一
担当区分：研究代表者
配分額：16380000円 （ 直接経費：12600000円 、 間接経費：3780000円 ）
上皮細胞の細胞間接着ならびに細胞形態を制御する可能性があるタンパク質群のPDZドメインに着目して、それらPDZタンパク質群による細胞形態と細胞接着の動的制御機構の解明を試みた。特に、PDZドメインの立体構造を利用して、それを阻害する新規の化合物を単離し、ケミカルバイオロジー的手法ないし薬理学的手法を適用するための学術的基盤を構築した。ZO-1-PDZ1を阻害する化合物を発見したが、これは、既存医薬品の性能向上に役立つ「医薬品吸収促進剤」に応用可能である。LNX1阻害物質はバリア機能強化に活用可能である。新規に発見したDVL阻害薬は、トリプルネガティブ乳がん治療薬の開発候補物質である。
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たんぱく質間相互作用を介した膜受容体による情報伝達機構の構造学的研究
2003年 - 2008年
科学研究費補助金 特定領域研究
白川 昌宏
本研究期間中に、チミンDNAグリコシラーゼ(TDG)についてSUMO-3化されたTDGの中央領域の立体構造を論文発表し、非共役型のSUMO-1/TDGの中央領域の立体構造、を解析した。またMCAF1のSUMO結合領域(SIM)とSUMO-3の複合体の立体構造をNMRにより決定した。岐阜大学医学研究科の加藤善一郎博士らとの共同研究により、Myd88のTIRドメインの立体構造をNMRによって決定し、さらにシグナル伝達に関与する分子表面残基を解析した。
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ヒトホスホリパーゼDのドメイン解剖学による細胞シグナル伝達機構の研究
2002年 - 2003年
科学研究費補助金 若手研究(B)
廣明 秀一
本研究は、ヒトホスホリパーゼD(PLD)と代謝産物ホスファチジン酸(PA)のシグナル伝達機構を、構造生物学的に解明することが最終的な目的である。本課題では、(1)PLDの細胞内局在や活性を制御しているN末端領域から、単独でfoldingするドメインを単離し構造解析を行うドメイン解剖学的研究、(2)PLDシグナル経路下流に存在するエフェクターを同定する目的で新規PA結合ドメインの探索、(3)両者に共通するドメイン解剖学の基盤技術の開発を行った。その結果(1)PLDのN末端に存在するPLD1-PXの発現系・巻き戻し条件を確立しNMR測定に成功した。PLD1-PXは溶解度が低く、部分的に非特異的に会合し、6割強のNMRシグナルしか観測できなかった。生化学的実験には十分な試料を得る方法が確立できた。今後、脂質結合特異性を決定する。(2)2003年にJangらによりPLD2-PXとPLCγ1-SH3の相互作用のシグナル伝達における重要性が示された。類似のドメイン間相互作用系として、PLD2-PXよりも溶解度の高いp47PXとp47SH3Cを用いて、脂質結合の変化を調べた。PI(45)P_2との結合はSH3により阻害される一方、PAとの結合は阻害されなかった(論文1)(3)新規膜結合ドメインを探索するために、それに適した発現系構築法(PRESAT-vector法)を開発し、MITドメインとPXAドメイン計9種類の発現実験を行った(論文2)。いずれもエンドソーム因子SNX中でPXに隣接して現れるドメインであり、PLD下流因子である可能性がある。現在、MITの一つにPIP結合活性があることを見出し、立体構造解析中である。(4)ドメイン解剖学的手法の基盤として、溶解度の低い蛋白質ドメインのNMR解析法を開発した。GCMをモデル試料として実証実験を行い、その完全帰属に成功した(論文3)。
産業財産権 11
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タイトジャンクションの緩和剤、該緩和剤を含む化合物の吸収促進剤、並びに、該緩和剤を有効成分として含む医薬組成物、医薬部外品組成物、化粧品組成物および食品組成物
廣明秀一、天野剛志、久田美咲
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Ｗｎｔシグナル伝達系阻害剤、該阻害剤を有効成分として含む医薬組成物
廣明秀一,天野剛志,進藤麻子,高岸麻紀,堀公則
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タイトジャンクション形成制御剤及び該制御剤を含む医薬組成物
廣明秀一, 天野剛志, 野田翔太、中倉由香子
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タイトジャンクションの緩和剤、該緩和剤を含む薬剤吸収補助剤、及び該緩和剤を含む医薬組成物
廣明秀一, 天野剛志, 野田翔太
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タンパク質凍結保存用保護剤
廣明秀一,天野名都子,松尾直紀,太田元規,岩村佳奈,福地佐斗志
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Vector and utilization of the same
廣明秀一,合田名都子,天野剛志
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ヒトVps4bのMITドメインと二価または三価の金属イオンの複合体の構造的特徴およびヒトVps4bのMITドメインによるホスファチジルイノシトールリン酸認識機構
高須 博敏, 廣明 秀一, 白川 昌宏
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新規ベクター及びその利用
廣明 秀一, 天野 剛志, 合田 名都子
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新規ベクター及びその利用
廣明 秀一, 天野 剛志, 合田 名都子
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酵母DSK2のユビキチン結合ドメインとモノユビキチンとの複合体の構造的特徴および酵母DSK2のユビキチン結合ドメインによるモノユビキチン認識機構
大野 綾子, 廣明 秀一, 白川 昌宏
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蛋白質の構造座標及びNMR化学シフト並びにそれらの使用
神田 大輔, 廣明 秀一, 住本 英樹
担当経験のある科目 (本学) 46
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基礎生物物理学Ia
2021
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生物物理学Ia
2021
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先端構造科学
2021
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生体構築論I
2021
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創薬精密科学
2021
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創薬分子構造学セミナーⅠA
2021
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生態構築論I
2020
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先端構造科学
2020
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生物物理学Ia
2020
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基礎生物物理学I a
2020
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創薬精密科学
2019
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基礎セミナー
2019
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基礎生物物理学I (a,b)
2019
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生物物理学I (a)
2019
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先端構造科学
2019
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生物物理学I (a)
2018
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基礎生物物理学I (a,b)
2018
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先端構造科学
2018
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先端構造科学
2017
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創薬精密科学
2017
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基礎生物物理学I
2017
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生物物理学I
2017
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生物物理学I
2016
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基礎生物物理学I
2016
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創薬精密科学
2016
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先端構造科学
2016
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基盤創薬学概論
2016
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基礎生物物理学I
2015
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生物物理学I
2015
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基盤創薬学概論
2015
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先端構造科学
2015
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創薬精密科学
2015
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基礎生物物理学I
2014
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分子生物学演習I
2014
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生物物理学I
2014
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先端構造科学
2014
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創薬精密科学
2014
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基盤創薬学概論
2014
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基盤創薬学概論
2013
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基礎セミナー
2013
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創薬精密科学
2013
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先端構造科学
2013
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分子生物学演習I
2012
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生物物理学I
2012
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基礎生物物理学I
2012
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基盤創薬概論
2012
担当経験のある科目 (本学以外) 13
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分子構造学特論
2021年3月 - 2022年3月 （東京医科歯科大学）
科目区分：大学院専門科目
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分子構造学特論
2020年4月 - 2021年3月 （東京医科歯科大学）
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分子構造学特論
2019年4月 - 2020年3月 （東京医科歯科大学）
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分子構造学特論
2018年4月 - 2019年3月 （東京医科歯科大学）
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分子構造学特論
2015年4月 - 2016年3月 （東京医科歯科大学）
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分子構造学特論
2012年4月 - 2013年3月 （東京医科歯科大学）
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細胞分子医学特論
2011年4月 - 2012年3月 （神戸大学）
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分子構造学特論
2014年4月 - 2015年3月 （東京医科歯科大学）
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分子構造学特論
2013年4月 - 2014年3月 （東京医科歯科大学）
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細胞分子医学特論
2015年4月 - 2016年3月 （神戸大学）
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細胞分子医学特論
2013年4月 - 2014年3月 （神戸大学）
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集中講義
2015年4月 - 2016年3月 （東京大学）
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細胞分子医学特論
2012年4月 - 2013年3月 （神戸大学）