研究者詳細 - 加藤　竜司

論文 - 加藤　竜司

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Effects of theproperties of short peptides conjugated with cell-penetrating peptides on theirinternalization into cells. 査読有り

Matsumoto Ryo, Okochi Mina, Shimizu Kazunori, Kanie Kei, Kato Ryuji, Honda Hiroyuki

SCIENTIFIC REPORTS 5 巻頁： 12884 2015年8月

配向性解析によるコンフレント細胞の非侵襲品質評価 (医用画像)

佐々木啓, 佐々木寛人, 高橋厚妃, 蟹江慧, 姜時友, 加藤竜司, 湯浅哲也

電子情報通信学会技術研究報告 114 巻 ( 482 ) 頁： 167 - 172 2015年3月

出版者・発行元：一般社団法人電子情報通信学会

近年,再生医療は実用化に向けて急速に発展しつつあるが,その実現に対する技術的障壁の一つに非侵襲的な細胞品質評価の難しさがある.この問題に対して,非侵襲的に取得される位相差顕微鏡画像から細胞品質を定量評価する画像処理・情報解析技術が注目されている.しかしながら,コンフレントな状態の細胞画像は,形態的特徴量が乏しいために細胞の正確な認識が技術的に難しいという課題があった.本研究では,コンフレントな細胞画像に現れる細胞の集団的な情報をスコア化する画像処理技術として,細胞画像の配向性・ヘテロ性に着目し,それらから特徴量を抽出する手法を考案する.実験データに関してコンフレント細胞の状態を判別することで,提案手法の有効性を定量的に評価する.

Identification of an interactionbetween VWF rs7965413 and platelet count as a novel risk marker for metabolicsyndrome an extensive search of candidate polymorphisms in a case-controlstudy. 査読有り

Nakatochi Masahiro, Ushida Yasunori, Yasuda Yoshinari, Yoshida Yasuko, Kawai Shun, Kato Ryuji, Nakashima Toru, Iwata Masamitsu, Kuwatsuka Yachiyo, Ando Masahiko, Hamajima Nobuyuki, Kondo Takaaki, Oda Hiroaki, Hayashi Mutsuharu, Kato Sawako, Yamaguchi Makoto, Maruyama Shoichi, Matsuo Seiichi, Honda Hiroyuki

PLOS ONE 10 巻 ( 2 ) 頁： e0117591 2015年2月

In vivo heat-stimulus-triggered osteogenesis. 査読有り

Ikuta Kunihiro, Urakawa Hiroshi, Kozawa Eiji, Hamada Shunsuke, Ota Takehiro, Kato Ryuji, Honda Hiroyuki, Kobayashi Takeshi, Ishiguro Naoki, Nishida Yoshihiro

INTERNATIONAL JOURNAL OF HYPERTHERMIA 31 巻 ( 1 ) 頁： 58 - 66 2015年2月

Characterization of time-course morphological features for efficientprediction of osteogenic potential in human mesenchymal stem cells. 査読有り

Matsuoka Fumiko, Takeuchi Ichiro, Agata Hideki, Kagami Hideaki, Shiono Hirofumi, Kiyota Yasujiro, Honda Hiroyuki, Kato Ryuji

BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING 111 巻 ( 7 ) 頁： 1430 - 1439 2014年7月

Label-free morphology-based prediction of multiple differentiation potentials ofhuman mesenchymal stem cells for early evaluation of intact cells. 査読有り

Sasaki Hiroto, Takeuchi Ichiro, Okada Mai, Sawada Rumi, Kanie Kei, Kiyota Yasujiro, Honda Hiroyuki, Kato Ryuji

PLOS ONE 9 巻 ( 4 ) 頁： e93952 2014年4月

ペプチドアレイを用いたECMタンパク質由来機能性ペプチドの探索ストラテジーとその可能性

蟹江慧, 加藤竜司

化学と生物 52 巻 ( 6 ) 頁： 361 - 370 2014年

担当区分：最終著者,　責任著者出版者・発行元：公益社団法人日本農芸化学会

生物，特にヒトのような高等動物は体の仕組みが巧妙に整理されている．体は，構成する単位の小さいものから細胞，組織，臓器，器官と構成され，臓器一つをとってみても複雑ではあるが，組織という構成単位で美しく整列している．最近話題となっている再生医療は最小単位である細胞を用い，組織や臓器を作製することが最終目的であり，構成単位が乱れると患者に重篤な副作用を及ぼす．再生医療の考えの一つに組織工学があり，失った組織を細胞を用いることで構成させ，欠損組織を代替・再生させる．この考えのもと人工血管・人工心臓・人工骨・人工歯などの体内留置型医療機器が幅広く開発されてきている．しかし，これらの医療機器は再生というよりは代替の意味合いが強く，完全再生に至っていないため副作用を及ぼす．筆者らは，再生の答えが生体内に隠されており，生体を学ぶことにより解決策を生み出すのではないかと考えた．生体内には細胞の挙動を制御する分子として細胞外マトリックス (ECM:Extracellular matrix) が存在している．その中でもECMタンパク質をターゲットとし，ECMタンパク質を構成する小成分としてペプチドに着目した．本稿では，ペプチドアレイという機能性ペプチド探索ツールを用い，ある細胞には接着するが，ある細胞には接着しない細胞選択的に接着するペプチドを探索するいくつかの手法を紹介する．そして，ペプチドアレイを使用した探索手法を通し，ECM中に存在するペプチドと細胞選択性に関して考察し，ペプチドアレイ探索による生命現象の解釈と再生促進型医療機器開発の可能性に関して述べる．

DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.52.361

培養中の幹細胞品質評価 : 画像を用いた評価技術とその貢献 (特集再生医療実現に向けた幹細胞培養工学の最前線)

加藤竜司, 清田泰次郎, 備瀬竜馬

生物工学会誌 92 巻 ( 9 ) 頁： 495 - 499 2014年

Orientation based segmentation for phase-contrast microscopic image of confluent cell 査読有り

Sasaki Kei, Yuasa Tetsuya, Sasaki Hiroto, Kato Ryuji

PROCEEDINGS OF THE ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IEEE ENGINEERING IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY 頁： 3323 - 3326 2013年10月

Screening of peptide ligands that bind to the Fc region of IgG using peptide array and its application to affinity purification of antibody 査読有り

Sugita Tomoya, Katayama Makoto, Okochi Mina, Kato Ryuji, Ichihara Takamitsu, Honda Hiroyuki

BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL 79 巻頁： 33 - 40 2013年10月

Analysing the substrate multispecificity of a proton-coupled oligopeptide transporter using a dipeptide library. 査読有り

Ito Keisuke, Hikida Aya, Kawai Shun, Vu Thi Tuyet Lan, Motoyama Takayasu, Kitagawa Sayuri, Yoshikawa Yuko, Kato Ryuji, Kawarasaki Yasuaki

NATURE COMMUNICATIONS 4 巻頁： 2502 2013年9月

Morphology-based prediction of osteogenic differentiation potential of humanmesenchymal stem cells. 査読有り

Matsuoka Fumiko, Takeuchi Ichiro, Agata Hideki, Kagami Hideaki, Shiono Hirofumi, Kiyota Yasujiro, Honda Hiroyuki, Kato Ryuji

PLOS ONE 8 巻 ( 2 ) 頁： e55082 2013年2月

Systematic analysis of a dipeptide library for inhibitor development using human dipeptidyl peptidase IV produced by a Saccharomyces cerevisiae expression system 査読有り

Hikida Aya, Ito Keisuke, Motoyama Takayasu, Kato Ryuji, Kawarasaki Yasuaki

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 430 巻 ( 4 ) 頁： 1217 - 1222 2013年1月

Comprehensive Combination Analysis for Screening of Significant Peptide Epitopes Using a Slide Glass Type-Exclusive Peptide Array from Milk Protein 査読有り

Nakatochi Masahiro, Katayama Makoto, Kato Ryuji, Okochi Mina, Takase Tomokazu, Yoshida Yasuko, Kawase Mitsuo, Honda Hiroyuki

KAGAKU KOGAKU RONBUNSHU 39 巻 ( 1 ) 頁： 40 - 45 2013年

出版者・発行元：The Society of Chemical Engineers, Japan

Based on the hypothesis that development of cow's milk allergy (CMA) in children can diagnosed from species of IgE epitope in patients, significant peptide epitope for IgE was analyzed by comprehensive combination analysis using the graphic assessment method. The Adaboost algorithm was used for classification of decision stump as weak classifier, and 6044060 models were constructed. Classification accuracies by 10-fol CV (10-fold cross-validation) were determined. Total distribution of accuracies was depicted and it was analyzed by Gaussian mixture distribution using the EM algorithm. It was found that the distribution could be divided into 5 sub-distributions by the Bayesian information criterion. The Gaussian sub-distributions were grouped into “significant sub-distributions” and “non-significant sub-distributions” and classifiers that belong to “significant distribution” were identified. Analysis of the assignment frequency of individual inputs assigned to the “significant distribution” identified 16 peptide epitopes with high assignment frequency, including aS1C30 and aS1C47 peptides. Since SERYLGYL from aS1C30 has already been reported as significant peptide epitope for CMA diagnose, our proposed method, CC-GAM, was suggested to be a useful tool for selection of significant epitopes.

DOI： 10.1252/kakoronbunshu.39.40

Web of Science

Scopus

実用化に資する医薬品生産培養技術の課題と展開～抗体医薬品から細胞医薬品まで～)

長森英二, 加藤竜司, 清水一憲, 柳原佳奈

生物工学会誌 91 巻 ( 9 ) 2013年

再生促進型医療材料開発のための細胞選択的接着ペプチドの探索と応用

蟹江慧, 加藤竜司, 桑原史明, 成田裕司, 本多裕之

生体医工学 51 巻 ( 3 ) 頁： 202 - 206 2013年

Orientation based segmentation for phase-contrast microscopic image of confluent cell 査読有り

Sasaki Kei, Yuasa Tetsuya, Sasaki Hiroto, Kato Ryuji

2013 35TH ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IEEE ENGINEERING IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY (EMBC) 頁： 3323 - 3326 2013年

Combinational risk factors ofmetabolic syndrome identified by fuzzy neural network analysis of health-checkdata. 査読有り

Ushida Yasunori, Kato Ryuji, Niwa Kosuke, Tanimura Daisuke, Izawa Hideo, Yasui Kenji, Takase Tomokazu, Yoshida Yasuko, Kawase Mitsuo, Yoshida Tsutomu, Murohara Toyoaki, Honda Hiroyuki

BMC MEDICAL INFORMATICS AND DECISION MAKING 12 巻 ( 1 ) 頁： 80 2012年8月

Screening for silver nanoparticle-binding peptides by using a peptide array 査読有り

Kuboyama Masashi, Kato Ryuji, Okochi Mina, Honda Hiroyuki

BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL 66 巻頁： 73 - 77 2012年7月

Collagen type IV-specific tripeptides forselective adhesion of endothelial and smooth muscle cells. 査読有り

Kanie Kei, Narita Yuji, Zhao Yingzi, Kuwabara Fumiaki, Satake Makoto, Honda Susumu, Kaneko Hiroaki, Yoshioka Tomohiko, Okochi Mina, Honda Hiroyuki, Kato Ryuji

BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING 109 巻 ( 7 ) 頁： 1808 - 1816 2012年7月

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