名古屋大学生物分子応答研究センター研究員

1997年4月 - 1998年9月

Robo2 contains a cryptic binding site for neural EGFL-like (NELL) protein 1/2 査読有り

Yamamoto Naoka, Kashiwagi Manabu, Ishihara Manami, Kojima Takaaki, Maturana Andres D., Kuroda Shun'ichi, Niimi Tomoaki

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   294 巻 ( 12 ) 頁： 4693 - 4703   2019年3月

Scaffold protein Enigma Homolog activates CREB whereas a short splice variant prevents CREB activation in cardiomyocytes.

Ito, J., Iijima, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., Kuroda, S., Maturana, A. D.

Cell. Signal.   27 巻   頁： 2425-2433   2015年12月

Mapping the heparin-binding site of the osteoinductive protein NELL1 by site-directed mutagenesis. 査読有り

Takahashi, K., Imai, A., Iijima, M., Yoshimoto, N., Maturana, A. D., Kuroda, S., and Niimi, T.

FEBS Letters   589 巻   頁： 4026-4032   2015年12月

Intracellular trafficking of bio-nanocapsule-liposome complex: Identification of fusogenic activity in the pre-S1 region of hepatitis B virus surface antigen L protein. 査読有り

Somiya, M., Sasaki, Y., Matsuzaki, T., Iijima, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., Maturana, A. D., and Kuroda, S.

J. Controll. Release   212 巻   頁： 10-18   2015年8月

One-step scalable preparation method for non-cationic liposomes with high siRNA content. 査読有り

Somiya, M., Yamaguchi, K., Liu, Q., Niimi, T., Maturana, A. D., Iijima, M., Yoshimoto, N., and Kuroda, S.

Int. J. Pharm.   490 巻   頁： 316-323   2015年7月

Virosomes of hepatitis B virus envelope L proteins containing doxorubicin: synergistic enhancement of human liver-specific anti-tumor growth activity by radiotherapy. 査読有り

Liu, Q., Jung, J., Somiya, M., Iijima, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., Maturana, A. D., Shin, S. H., Jeong, S.-Y., Choi, E. K., and Kuroda, S.

Int. J. Nanomedicine   10 巻   頁： 4159-4172   2015年6月

Oligomerization-induced conformational change in the C-terminal region of Nel-like molecule 1 (NELL1) protein is necessary for the efficient mediation of murine MC3T3-E1 cell adhesion and spreading. 査読有り

Nakamura, Y., Hasebe, A., Takahashi, K., Iijima, M., Yoshimoto, N., Maturana, A. D., Ting, K., Kuroda, S., and Niimi, T.

J. Biol. Chem.   289 巻   頁： 9781-9794   2014年4月

High-throughput de novo screening of receptor agonists with an automated single-cell analysis and isolation system.

Yoshimoto, N., Tatematsu, K., Iijima, M., Niimi, T., Maturana, A. D., Fujii, I., Kondo, A., Tanizawa, K., and Kuroda, S.

  4 巻   頁： 4242   2014年

Cell surface-fluorescence immunosorbent assay for real-time detection of hybridomas with efficient antibody secretion at the single-cell level. Anal. Chem. 査読有り

Kida, A., Iijima, M., Niimi, T., Maturana, A. D., Yoshimoto, N., and Kuroda, S.

Anal. Chem.   85 巻   頁： 1753-1759   2013年

Exploring dynamics of molybdate in living animal cells by a genetically encoded FRET nanosensor. 査読有り

Nakanishi, Y., Iida, S., Ueoka-Nakanishi, H., Niimi, T., Tomioka, R., and Maeshima, M.

PLoS One.   8 巻   頁： e58175   2013年

An automated system for high-throughput single cell-based breeding. 査読有り

Yoshimoto, N., Kida, A., Jie, X., Kurokawa, M., Iijima, M., Niimi, T., Maturana, A. D., Nikaido, I., Ueda, H. R., Tatematsu, K., Tanizawa, K., Kondo, A., Fujii, I., and Kuroda, S.

Sci. Rep.   3 巻   頁： 1191   2013年

Nanocapsule-based probe for evaluating the orientation of antibodies immobilized on a solid phase. 査読有り

Iijima, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., Maturana, A. D., and Kuroda, S.

Analyst.   138 巻   頁： 3470-3477   2013年

Bio-nanocapsules for signal enhancement of alkaline phosphatase-linked immunosorbent assays. 査読有り

Iijima, M., Yamamoto, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., and Kuroda, S.

Biosci. Biotechnol. Biochem.   77 巻   頁： 843-846   2013年

Nano-visualization of oriented-immobilized IgGs on immunosensors by high-speed atomic force microscopy

Iijima, M., Somiya, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., and Kuroda, S. (2012). Nano-visualization of oriented-immobilized IgGs on immunosensors by high-speed atomic force microscopy.

Sci. Rep.   2 巻   頁： 790   2012年

NELL-1 promotes cell adhesion and differentiation via Integrin β1 査読有り

Shen, J., James, A. W., Chung, J., Lee, K., Zhang, J. B., Ho, S., Lee, K. S., Kim, T. M., Niimi, T., Kuroda, S., Ting, K., and Soo

J. Cell. Biochem.   113 巻   頁： 3620-3628   2012年

The C-terminal region of NELL1 mediates osteoblastic cell adhesion through integrin α3β1 査読有り

Hasebe, A., Nakamura, Y., Tashima, H., Takahashi, K., Iijima, M., Yoshimoto, N., Ting, K., Kuroda, S., and Niimi, T.

FEBS Lett.   586 巻   頁： 2500-2506   2012年

Engineered bio-nanocapsules, hepatitis B virus surface antigen L protein particles, for in vivo active targeting to splenic dendritic cells. 査読有り

Matsuo, H., Yoshimoto, N., Iijima, M., Niimi, T., Jung, J., Jeon, S.-Y., Choi, E. K., Sewaki, T., Arakawa, T., and Kuroda, S.

Int. J. Nanomedicine.   7 巻   頁： 3341-3350   2012年

Targeting of polyplex to human hepatic cells by bio-nanocapsules, hepatitis B virus surface antigen L protein particles 査読有り

Somiya, M., Yoshimoto, N., Iijima, M., Niimi, T., Dewa, T., Jung, J., and Kuroda, S.

Bioorg. Med. Chem.   20 巻   頁： 3873-3879   2012年

Hepatitis B virus envelope L protein-derived bio-nanocapsules: Mechanisms of cellular attachment and entry into human hepatic cells 査読有り

Yamada, M., Oeda, A., Jung, J. Iijima, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., Jeong, S.-Y., Choi, E. K., Tanizawa, K., and Kuroda, S.

J. Control. Release   160 巻   頁： 322-329   2012年

Efficient production and characterization of recombinant human NELL1 protein in human embryonic kidney 293-F cells. 査読有り

Hasebe, A., Tashima, H., Ide, T., Iijima, M., Yoshimoto, N., Ting, K., Kuroda, S., and Niimi, T.

Mol. Biotechnol.   51 巻   頁： 58-66   2012年

Nanocapsules incorporating IgG Fc-binding domain derived from Staphylococcus aureus protein A for displaying IgGs on immunosensor chips 査読有り

Iijima, M., Kadoya, H., Hatahira, S., Hiramatsu, S., Jung, G., Martin, A., Quinn, J., Jung, J., Jeong, S. Y., Choi, E. K., Arakawa, T., Hinako, F., Kusunoki, M., Yoshimoto, N., Niimi, T., Tanizawa, K., and Kuroda, S.

Biomaterials   32 巻   頁： 1455-1464   2011年

Fluorophore-labeled nanocapsules displaying IgG Fc-binding domains for the simultaneous detection of multiple antigens. 査読有り

Iijima, M., Matsuzaki, T., Yoshimoto, N., Niimi, T., Tanizawa, K., and Kuroda, S.

Biomaterials   32 巻   頁： 9011-9020   2011年

Efficient and rapid purification of drug- and gene-carrying bio-nanocapsules, hepatitis B virus surface antigen L particles, from Saccharomyces cerevisiae 査読有り

Jung, J., Iijima, M., Yoshimoto, N., Sasaki, M., Niimi, T., Tatematsu, K., Jeong, S.-Y., Choi, E. K., Tanizawa, K., and Kuroda, S.

Protein Expr. Purif.   78 巻   頁： 149-155   2011年

Hepatic stellate cells stimulate HCC cell migration via laminin-5 production 査読有り

Santamato, A., Fransvea, E., Dituri, F., Caligiuri, A., Quaranta, M., Niimi, T., Pinzani, M., Antonaci, S., and Giannelli, G.

Clin. Sci.   121 巻   頁： 159-168   2011年

*The production of recombinant human laminin-332 in a Leishmania tarentolae expression system 査読有り

Phan, H.P., Sugino, M. and Niimi, T.

Protein Expr. Purif.   68 巻   頁： 79-84   2009年

Novel Culture System of Mesenchymal Stromal Cells from Human Subcutaneous Adipose Tissue 査読有り

Iwashima, S., Ozaki, T., Maruyama, S., Saka, Y., Kobori, M., Omae, K., Yamaguchi, H., Niimi, T., Toriyama, K., Kamei, Y., Torii, S., Murohara, T., Yuzawa, Y., Kitagawa, Y. and Matsuo, S.

Stem Cells Dev.   18 巻   頁： 533-543   2009年

Expression of secretoglobin3A2 (SCGB3A2) in primary pulmonary carcinomas 査読有り

Tachihara-Yoshikawa, M., Ishida, T., Watanabe, K., Sugawara, A., Kanazawa, K., Kanno, R., Suzuki, T., Niimi, T., Kimura, S. and Munakata, M.

Fukushima J. Med. Sci.   54 巻   頁： 61-72   2008年

*Expression and chain assembly of human laminin-332 in an insect cell-free translation system 査読有り

Phan, H.-P., Ezure, T., Ito, M., Kadowaki, T., Kitagawa, Y., and Niimi, T.

Biosci. Biotechnol. Biochem.   72 巻   頁： 1847-1852   2008年

Cryptic fragment alpha4 LG4-5 derived from laminin alpha4 chain inhibits de novo adipogenesis by modulating the effect of fibroblast growth factor-2 査読有り

Yamashita, H., Goto, C., Tajima, R., Koparal, A. T., Kobori, M., Ohki, K., Shitara, K., Narita, R., Toriyama, K., Torii, S., Niimi, T., and Kitagawa, Y.

Develop. Growth Differ.   50 巻   頁： 97-107   2008年

*Transcriptional activation of the human claudin-18 gene promoter through two AP-1 motifs in PMA-stimulated MKN45 gastric cancer cells 査読有り

Yano, K., Imaeda, T., and Niimi, T.

Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol.   294 巻   頁： G336-G343   2008年

The Sp family of transcription factors regulates the human laminin alpha 1 gene in JAR choriocarcinoma cells 査読有り

Niimi, T., Hayashi, Y., Sekiguchi, K., and Kitagawa, Y.

Biochim. Biophys. Acta.   1759 巻   頁： 573-579   2006年

Identification and expression of alternative splice variants of the mouse Ppp1r3b gene in lung epithelial cells 査読有り

Niimi, T., Kurotani, R., Kimura, S., and Kitagawa, Y.

Biochem. Biophys. Res. Commun.   349 巻   頁： 588-596   2006年

Induction of uteroglobin-related protein 2 (Ugrp2) gene expression by the Th2 cytokines IL-4 and IL-13 査読有り

Yamada, A., Sheikh, F., Niimi, T., DeMayo, F. J., Keegan, A. D., Donnelly, R. P., Kimura, S.

J. Immunol.   175 巻   頁： 5708-5715   2005年

SOX7 and SOX17 regulate the parieetal endoderm-specific enhancer activity of mouse laminin a1 gene 査読有り

Niimi, T., Hayashi, Y., Futaki, S., and Sekiguchi, K.

J. Biol. Chem   279 巻 ( 36 ) 頁： 38055-38061   2004年

Identification of an upstream enhancer in the mouse laminin alpha1 gene defining its high level of expression in parietal endoderm cells 査読有り

Niimi, T. Hayashi, Y., and Sekiguchi, K.

J. Biol. Chem.   14 巻   頁： 9332-9338   2003年

A polymorphism in the human UGRP1 gene promoter that regulates transcription is associated with an increased risk of asthma 査読有り

Niimi, T., Munakata, M., Keck-Waggoner, C. L., Popescu, N. C., Levitt, R. C., Hisada, M., and Kimura, S.

Am. J. Hum. Genet.   70 巻   頁： 718-725   2002年

Cloning, expression, and chromosomal localization of the mouse gene (Scgb3a1, alias Ugrp2) that encodes a member of the novel uteroglobin-related protein gene family 査読有り

Niimi, T., Copeland, N. G., Gilbert, D. J., Jenkins, N. A., Srisodsai, A., Zimonjic, D. B., Keck-Waggoner, C. L., Popescu, N. C., and Kimura, S.

Cytogenet. Genome Res.   97 巻   頁： 120-127   2002年

claudin-18, a novel downstream target gene for the T/EBP/NKX2.1 homeodomain transcription factor, encodes lung-and stomach-specific isoforms through alternative splicing 査読有り

Niimi, T., Nagashima, K., Ward, J. M., Minoo, P., Zimonjic, D. B., Popescu, N. C., and Kimura, S.

Mol. Cell. Biol.   21 巻   頁： 7380-7390   2001年

UGRP1, a uteroglobin/clara cell secretory protein-related protein, is a novel lung-enriched downstream target gene for the T/EBP?NKX2.1 homeodomain transcription factor 査読有り

Niimi, T., Keck-Waggoner, C. L., Popescu, N. C., Zhou, Y., Levitt, R. C., and Kimura, S.

Molecular Endocrinology   15 巻   頁： 2021-2036   2001年

Differential expression of mRNAs encoding laminin chain variants during in vitro development of mouse blastocysts 査読有り

Azimi, M., Niimi, T., Yoshida, N., and Kitagawa, Y.

Cytotechnology   31 巻   頁： 183-191   1999年

A drosophila gene encoding multiple splice variants of Kazal-type serine protease inhibitor-like proteins with potential destinations of mitochondria, cytosol and the secretory pathway 査読有り

Niimi, T., Yookoyama, H., Goto, A., Beck, K., and Kitagawa, Y.

Eur. J. Biochem.   266 巻   頁： 282-292   1999年

Brachyury (T) expression in embryonal carcinoma P19 cells resembles its expression in primitive streak and tail-bud but not that in notochord 査読有り

Yamaguchi, H., Niimi, T., Kitagawa, Y., and Miki, K.

Develop. Growth Differ.   41 巻   頁： 253-264   1999年

Distinct roles of mouse laminin beta1 long arm domains for alpha1beta1gamma1 trimer formation 査読有り

Niimi, T. and Kitagawa, Y.

FEBS Letters   400 巻   頁： 71-74   1997年

多様なラミニン分子の形成機構

新美友章、熊谷知乃、北川泰雄

生体の科学   48 巻   頁： 260-267   1997年

Differentiation-dependent expression of laminin-8 (alpha4beta1gamma1) mRNAs in mouse 3T3-L1 adipocytes 査読有り

Niimi, T., Kumagai, C., Okano, M., and Kitagawa, Y.

Matrix Biology   16 巻   頁： 223-230   1997年

Expression of the long arm sequence of mouse laminin alpha1, beta1, or gamma1 chain in COS1 cells and assembly of monkey-mouse hybrid laminin 査読有り

Niimi, T., Miki, K., and Kitagawa, Y.

J. Biochem   121 巻   頁： 854-861   1997年

alpha-へリックス鎖間会合の特異性と互換性-ラミニン異型体の形成機構を中心に-

北川泰雄、新美友章、熊谷知乃、岡野正樹

生物物理   35 巻   頁： 63-69   1995年

Regulated expression of an osteonectin variant in bovine aortic endothelial cells 査読有り

Jeon, H., Niimi, T., Taniguchi, Y., Miki, K., and Kitagawa, Y.

Biosci. Biotech. Biochem.   58 巻 ( 10 ) 頁： 1889-1891   1994年

The protective role of polyphenols in cytotoxicity of hydrogen peroxide 査読有り

Nakayama, T., Niimi, T., Osawa, T., and Kawakishi, S.

Mutation Research   281 巻   頁： 77-80   1992年

Animal Cell Technology; Basic & Applied Aspects"Laminin chains expressed in human keratinocytes, mouse 3T3-L1 adipocytes and mouse embryonal carcinoma F9."

Niimi, T., Kumagai, C., Azimi, M., and Kitagawa, Y.（ 担当： 共著）

Kluwe Academic Publisher, Dordrecht  1997年 

肺および甲状腺特異的転写因子Nkx2.1とその下流遺伝子による器官形成と機能調節

2005年4月 - 2007年3月

科学研究費補助金  若手研究（Ｂ），課題番号：17780250

新美　友章

分子細胞生物学特論II

2018

生物情報処理演習

2018