名城大学農学部非常勤講師

2003年

名古屋女子大学家政学部　非常勤講師

2003年

名古屋大学大学院生命農学研究科 助手

2001年4月 - 2007年3月

滋賀県立大学環境科学部　助手

1996年4月 - 2001年3月

名古屋大学農学研究科 日本学術振興会特別研究員

1992年4月 - 1994年3月

Arctic Plant Responses to Summer Climates and Flooding Events: A Study of Carbon and Nitrogen-Related Larch Growth and Ecosystem Parameters in Northeastern Siberia 査読有り 国際共著

Liang, Maochang Sugimoto, Atsuko Tei, Shunsuke Takano, Shinya Morozumi, Tomoki Shingubara, Ryo Murase, Jun Maximov, Trofim C.

Journal of Geophysical Research: Biogeosciences   128 巻   頁： e2022JG007135   2023年

Estimating Yield-Related Traits Using UAV-Derived Multispectral Images to Improve Rice Grain Yield Prediction 査読有り

Bascon, MV; Nakata, T; Shibata, S; Takata, I; Kobayashi, N; Kato, Y; Inoue, S; Doi, K; Murase, J; Nishiuchi, S

AGRICULTURE-BASEL   12 巻 ( 8 )   2022年8月

eDNA解析を利用した土壌微生物機能への太陽熱土壌消毒の影響評価法 査読有り

浅川晋、村瀬潤、篠原陽子

日本土壌肥料学雑誌   92 巻 ( 6 ) 頁： 476 - 480   2021年12月

土壌に関する政府間技術パネル(ITPS)作業グループ会合報告 招待有り

村瀬　潤

日本土壌肥料学会誌   92 巻 ( 6 ) 頁： 501 - 502   2021年12月

Soil texture and properties rather than irrigation water type shape the diversity and composition of soil microbial communities 査読有り 国際共著

Obayomi, O; Seyoum, MM; Ghazaryan, L; Tebbe, CC; Murase, J; Bernstein, N; Gillor, O

APPLIED SOIL ECOLOGY   161 巻   2021年5月

Top-down effects of protists are greater than bottom-up effects of fertilisers on the formation of bacterial communities in a paddy field soil 国際共著

Asiloglu, R; Kenya, K; Samuel, SO; Sevilir, B; Murase, J; Suzuki, K; Harada, N

SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY   156 巻   2021年5月

Effect of protists on rhizobacterial community composition and rice plant growth in a biochar amended soil 査読有り 国際共著

Asiloglu, R; Sevilir, B; Samuel, SO; Aycan, M; Akca, MO; Suzuki, K; Murase, J; Turgay, OC; Harada, N

BIOLOGY AND FERTILITY OF SOILS   57 巻 ( 2 ) 頁： 293 - 304   2021年2月

Biochar affects taxonomic and functional community composition of protists 査読有り 国際共著

Asiloglu, R; Samuel, SO; Sevilir, B; Akca, MO; Bozkurt, PA; Suzuki, K; Murase, J; Turgay, OC; Harada, N

BIOLOGY AND FERTILITY OF SOILS   57 巻 ( 1 ) 頁： 15 - 29   2021年1月

Soil: the great connector of our lives now and beyond COVID-19 査読有り 国際共著

Poch, RM; dos Anjos, LHC; Attia, R; Balks, M; Benavides-Mendoza, A; Bolanos-Benavides, MM; Calzolari, C; Chabala, LM; de Ruiter, PC; Francke-Campaña, S; Préchac, FG; Graber, ER; Halavatau, S; Hassan, KM; Hien, E; Jin, K; Khan, M; Konyushkova, M; Lobb, DA; Moshia, ME; Murase, J; Nziguheba, G; Patra, AK; Pierzynski, G; Eugenio, NR; Rojas, RV

SOIL   6 巻 ( 2 ) 頁： 541 - 547   2020年11月

Susceptibility and resilience of the soil ciliate community to high temperatures 査読有り

Oshima, T; Shinohara, Y; Asakawa, S; Murase, J

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION   66 巻 ( 6 ) 頁： 870 - 877   2020年11月

Involvement of microaerophilic iron-oxidizing bacteria in the iron-oxidizing process at the surface layer of flooded paddy field soil 査読有り

Nakagawa, K; Murase, J; Asakawa, S; Watanabe, T

JOURNAL OF SOILS AND SEDIMENTS   20 巻 ( 11 ) 頁： 4034 - 4041   2020年11月

Protist-enhanced survival of a plant growth promoting rhizobacteria, Azospirillum sp. B510, and the growth of rice ( Oryza sativa L.) plants

Asiloglu, R; Shiroishi, K; Suzuki, K; Turgay, OC; Murase, J; Harada, N

APPLIED SOIL ECOLOGY   154 巻   頁： 103599   2020年10月

Methane oxidation potential of the arctic wetland soils of a taiga-tundra ecotone in northeastern Siberia 査読有り 国際共著

Murase, J; Sugimoto, A; Shingubara, R; Liang, MC; Morozumi, T; Takano, S; Maximov, TC

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION   66 巻 ( 4 ) 頁： 645 - 652   2020年7月

田んぼの中の原生生物たちの暮らし 招待有り 査読有り

村瀬　潤

土と微生物   74 巻 ( 1 ) 頁： 26 - 31   2020年4月

Invention of Artificial Rice Field Soil: A Tool to Study the Effect of Soil Components on the Activity and Community of Microorganisms Involved in Anaerobic Organic Matter Decomposition

Maeda, Y; Mise, K; Iwasaki, W; Watanabe, A; Asakawa, S; Asiloglu, R; Murase, J

MICROBES AND ENVIRONMENTS   35 巻 ( 4 )   2020年

Diversity of 2-MIB-Producing Cyanobacteria in Lake Ogawara: Microscopic and Molecular Ecological Approaches. 査読有り

Shizuka, K., Ikenaga, M., Murase, J., Nakayama, N., Kakino, W., Taruya, H., & Maie, N.

Aquatic Science   68 巻   頁： 9 - 23   2020年

水田への魚類の遡上を促す遡上板の開発 査読有り

皆川明子、若宮慎二、竹下邦明、佐川志朗、河口洋一、村瀬潤、都築隆禎、深澤洋二、江崎保男

応用生態工学   23 巻 ( 1 ) 頁： 79 - 84   2020年

Usability of water surface reflectance for the determination of riverine dissolved methane during extreme flooding in northeastern Siberia

Morozumi, T; Shingubara, R; Murase, J; Nagai, S; Kobayashi, H; Takano, S; Tei, S; Fan, R; Maximov, TC; Sugimoto, A

POLAR SCIENCE   21 巻   頁： 186 - 194   2019年9月

Multi-year effect of wetting on CH₄ flux at taiga-tundra boundary in northeastern Siberia deduced from stable isotope ratios of CH₄

Shingubara, R; Sugimoto, A; Murase, J; Iwahana, G; Tei, S; Liang, MC; Takano, S; Morozumi, T; Maximov, TC

BIOGEOSCIENCES   16 巻 ( 3 ) 頁： 755 - 768   2019年2月

Microhabitat segregation of heterotrophic protists in the rice (<i>Oryza sativa</i> L.) rhizosphere

Asiloglu, R; Murase, J

RHIZOSPHERE   4 巻   頁： 82 - 88   2017年12月

Quest of Soil Protists in a New Era

Murase, J

MICROBES AND ENVIRONMENTS   32 巻 ( 2 ) 頁： 99 - 102   2017年6月

Response of the protistan community of a rice field soil to different oxygen tensions (vol 92, fiw104, 2016)

Takenouchi, Y; Iwasaki, K; Murase, J

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY   93 巻 ( 5 )   2017年5月

Fluctuations in the abundance of ammonia oxidizers and the contents of inorganic nitrogen in solarized soil

Yamagata, M; Shinohara, Y; Maesaka, M; Murase, J; Asakawa, S

SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION   63 巻 ( 5 ) 頁： 434 - 440   2017年

Response of the protistan community of a rice field soil to different oxygen tensions 査読有り

Takenouchi, Y., Iwasaki, K., Murase, J.

FEMS Microbiology Ecology     2016年

Active community structure of microeukaryotes in a rice (Oryza sativa L.) rhizosphere revealed by RNA-based PCR-DGGE 査読有り

Asiloglu, R., Murase, J.

Soil Science and Plant Nutrition   62 巻   頁： 440-446   2016年

Impact of long-term fertilizer treatment on the microeukaryotic community structure of a rice field soil. 査読有り

Murase, J., Hida, A., Ogawa, K., Nonoyama, T., Yoshikawa, N., Imai, K.

Soil Biology and Biochemistry   80 巻   頁： 237-243   2015年

Impact of soil solarization on the ciliate community structure of a greenhouse soil. 61, 927-933 (2015) 査読有り

Yokoe, K., Maesaka, M., Murase, J., Asakawa, S

Soil Sci. Plant Nutr.   61 巻   頁： 641-652   2015年

Impact of soil solarization on the ciliate community structure of a greenhouse soil. 査読有り

Murase, J., Shinohara, Y., Yokoe, K., Matsuda, R., Asakawa, S., Hashimoto, T.

  60 巻 ( 4 ) 頁： 927-933   2015年

Community structure of microeukaryotes in a rice rhizosphere revealed by DNA-based PCR-DGGE. 査読有り

Asiloglu, R., Honjo, H., Saka, N., Asakawa, S., Murase, J.

Soil Sci Plant Nutr   61 巻   頁： 761-768   2015年

Abundance and composition of ammonia oxidizers in response to degradation of root cap cells of rice in soil microcosms. 査読有り

Li, Y., Watanabe, T., Murase, J., Asakawa, S., Kimura, M.

Journal of soils and sediments   14 巻   頁： 1587-1598   2014年

Branched and isoprenoid glycerol dialkyl glycerol tetraethers in soils and lake/river sediments in Lake Biwa basin and implications for MBT/CBT proxies. 査読有り

Ajioka, T., Yamamoto, M., Murase, J.

Organic Geochemistry   73 巻   頁： 70-82   2014年

Low nitrogen fertilization adapts rice root microbiome to low nutrient environment by changing biogeochemical functions. 査読有り

Ikeda, S., Sasaki, K., Okubo, T., Yamashita, A., Terasawa, K., Bao, Z., Liu, D., Watanabe, T., Murase, J., Asakawa, S., Eda, S., Mitsui, H., Sato, T., Minamisawa, K.

Microbes and Environments   29 巻   頁： 50-59   2014年

Growth of hydrogenotrophic and acetoclastic methanogens on substrate from rice plant callus cells in anaerobic soil: an estimation to the role of slough-off root cap cells to their growth 査読有り

Li Y, Watanabe T, Murase J, Asakawa S, Kimura M

  59 巻   頁： 548-558   2013年

Identification of the major capsid gene (g23) of T4-type bacteriophages that assimilate substrates from root cap cells under aerobic and anaerobic soil conditions using a DNA-SIP approach 査読有り

Li Y, Watanabe T, Murase J, Asakawa S, Kimura M

  63 巻   頁： 97-105   2013年

安定同位体プロービング(SIP)法で探る水田土壌の物質動態と微生物 招待有り 査読有り

村瀬　潤

　土と微生物　67, 39-46 (2013)   67 巻   頁： 39-46   2013年

Growth of hydrogenotrophic and acetoclastic methanogens on substrate from rice plant callus cells in anaerobic soil: an estimation to the role of slough-off root cap cells to their growth. 査読有り

Li, Y., Watanabe, T., Murase, J., Asakawa, S., Kimura, M.

Soil Sci. Plant Nutr.   59 巻   頁： 548-558   2013年

Growth of methanogens in an oxic soil microcosm: Elucidation by a DNA-SIP experiment using 13C-labeled dried rice callus. 査読有り

Li, Y, Lee CG, Watanabe T, Murase J, Asakawa S, Kimura M

  58 巻   頁： 37-44   2012年

Phylogenetic diversity of microturbellarians in Japanese rice paddy fields, with special attention to the genus Stenostomum. 査読有り

Yamazaki, M, Murase, J, Asakawa, S, Kimura, M

Soil Science and Plant Nutrition   58 巻   頁： 11-23   2012年

Incorporation of plant residue-derived carbon into the microeukaryotic community in a rice field soil revealed by DNA stable-isotope probing. 査読有り

Murase J, Shibata M, Lee CG, Watanabe T, Asakawa S, Kimura M

  79 巻   頁： 371-379   2012年

北方湿地生態系からのメタン放出に及ぼす積雪の影響 招待有り 査読有り

村瀬　潤

低温科学   70 巻   頁： 131-136   2012年

Strain-specific incorporation of methanotrophic biomass into eukaryotic grazers in a rice field soil revealed by PLFA-SIP. 査読有り

FEMS Microbiology Ecology   75 巻   頁： 284-290   2011年

Identification of microbial communities that assimilate substrate from root cap cells in an aerobic soil using a DNA-SIP approach. 査読有り

Li, Y, Lee CG, Watanabe T, Murase J, Asakawa S, Kimura M

Soil Biology & Biochemistry   43 巻   頁： 1928-1935   2011年

Assimilation of glucose-derived carbon into methanogenic archaea in soil under unflooded condition. 査読有り

Watanabe T, Wang G, Taki K, Lee CG, Murase J, Asakawa S, Kimura M

Applied Soil Ecology   48 巻   頁： 201-209   2011年

A new thermophilic heterolobosean amoeba, Fumarolamoeba ceborucoi, gen. nov., sp. nov., isolated near a fumarole at a volcano in Mexico. 査読有り

Johan F. De Jonckheere JF, Murase J, Opperdoes FR

  50 巻   頁： 43-50   2011年

Bacterial populations assimilating carbon from ¹³C-labeled plant residue in soil: analysis by a DNA-SIP approach. 査読有り

Lee CG, Watanabe T, Sato Y, Murase J, Asakawa S, Kimura M

  43 巻   頁： 814-822   2011年

Unique viral capsid assembly protein gene (g20) of cyanophages in the floodwater of a Japanese paddy field. 査読有り

Wang GH, Murase J, Asakawa S, Kimura M

Biol. Fert. Soils   46 巻   頁： 93-102   2010年

Isolation of a new heterolobosean amoeba from a rice field soil: Vrihiamoeba italica gen. nov., sp. nov. 査読有り

Murase J, Kawasaki M, De Jonckheere JF

Eur. J. Protistol.   46 巻   頁： 164-170   2010年

Isolation of a new heterolobosean amoeba from a rice field soil: Vrihiamoeba italica gen. nov., sp. nov. 査読有り

Murase J, Kawasaki M, De Jonckheere JF

European Jouranal of Protistology   46 巻   頁： 164-170   2010年

Low diversity of T4-type bacteriophages in applied rice straw, plant residues and rice roots in Japanese rice soils: Estimation from major capsid gene (g23) composition. 査読有り

Fujihara S, Murase J, Tun CC, Matsuyama T, Ikenaga M, Asakawa S, Kimura M

Soil Science and Plant Nutrition   56 巻   頁： 800-812   2010年

Novel cyanophage photosynthetic gene psbA in the floodwater of a Japanese rice field. 査読有り

Wang GH, Murase J, Asakawa S, Kimura M

FEMS Microbiol. Ecol.   70 巻   頁： 79-86   2009年

Methanogenic archaeal communities developed in paddy fields in the Kojima Bay polder, estimated by denaturing gradient gel electrophoresis, real-time PCR and sequencing analyses. 査読有り

Watanabe, T., Cahyani, V.R., Murase, J., Ishibashi, E., Kimura, M., Asakawa, S.

Soil Sci. Plant Nutr.   55 巻   頁： 73-79   2009年

Phyologenetic positions of Mn-oxidizing bacteria and fungi inhabiting Mn nodules in rice field subsoils. 査読有り

Cahyani, V.R., Murase, J., Ikeda, A., Taki, K., Asakawa, S., Kimura,M

Biol. Fertil. Soils   45 巻   頁： 337-346   2009年

T4-type bacteriophage communities estimated from the major capsid genes (g23) in manganese nodules in Japanese paddy fields. 査読有り

Cahyani VR, Murase J, Ishibashi E, Asakawa S, Kimura M

Soil Sci. Plant Nutr.   55 巻   頁： 468-477   2009年

Changes in major capsid genes (g23) of T4-type bacteriophages with soil depth in two Japanese rice fields. 査読有り

Wang GH, Murase J, Taki K, Ohashi Y, Yoshikawa N, Asakawa S, Kimura M

Biol. Fert. Soils   45 巻   頁： 521-529   2009年

Eukaryotic communities associated with the decomposition of rice straw compost in a Japanese rice paddy field estimated by DGGE analysis 査読有り

HatamotoM., Tanahashi T., Murase J., Matsuya M., Hayashi M., Kimura M., Asakawa S.

Bio. Fert. Soils   44 巻 ( 3 ) 頁： 527-532   2008年

*Selective grazing of methanotrophs by protozoa in a rice field soil. 査読有り

Murase,J. Frenzel,P.

FEMS Microbiol. Ecol.   65 巻   頁： 408-414   2008年

Phyologenetic positions of Mn-oxidizing bacteria and fungi inhabiting Mn nodules in rice field subsoils. 査読有り

Vita Ratri Cahyani, Jun Murase, Akihiro Ikeda, Katsutoshi Taki, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura

Bio. Fert. Soils     頁： 10.1007/s00374-008-0337-8.   2008年

Bacterial communities in Fe mottles in the plow pan layer of a Japanese rice field: estimation using PCR-DGGE and sequencing analyses 査読有り

Vita Ratri Cahyani, Jun Murase, Eiji Ishibasi, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura

Soil Sci. Plant Nutr.   54 巻 ( 4 ) 頁： doi: 10.1111/j.1747-0765.2008.00291.x   2008年

*A methane-driven microbial food web in a wetland rice soil. 査読有り

Murase, J., Frenzel,P.

Environ. Microbiol.   9 巻 ( 12 ) 頁： 3025-3034   2007年12月

*水田土壌の細菌群集の構造と機能に及ぼす原生動物の影響 招待有り

村瀬　潤

土と微生物   61 巻   頁： 65-68   2007年

Bacterial communities in manganese nodules in rice field subsoils: estimation by PCR-DGGE and sequencing analyses. 査読有り

Cahyani, V.R., Murase,J., Ishibashi,E., Asakawa,S., Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   53 巻   頁： 578-584   2007年

Impact of protists on the activity and structure of the bacterialcommunity in a rice field soil 査読有り

Murase, J., Noll, M., Frenzel,P.

Applied and Environmental Microbiology   72 巻 ( 8 ) 頁： 5436-5444   2006年8月

土壌中の遺伝子・遺伝情報　何ができるのか、何が分かるのか９．土壌DNAの利用、新しい研究手法（その２）Stable Isotope Probing 招待有り 査読有り

村瀬　潤

日本土壌肥料学雑誌   77 巻 ( 2 ) 頁： 231-234   2006年

*Incorporation of 13C-labeled rice straw carbon into microbial communities in submerged rice field soil and the percolating water. 査読有り

  38 巻   頁： 3483-3491   2006年

Vertical Changes in Bacterial communities in percolating water of a Japanese paddy field as revealed by PCR-DGGE. 査読有り

Murase,J., Shimizu,M., Hayashi,M., Matsuya,K., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   51 巻   頁： 821-829   2005年

Inhibitory effect of light on methane oxidation in the pelagic water column of a mesotrophic lake (Lake Biwa, Japan). 査読有り

Murase,J. and Sugimoto,A.

Limnol. Oceanogr.   50 巻   頁： 1339-1343   2005年

Carbon cycling in rice field ecosystems in the context of input, decomposition and translocation of organic materials and the fates of their end products (CO2 and CH4). 査読有り

Kimura,M., Murase,J., and Lu,Y.

Soil Biol. Biochem.   36 巻   頁： 1399-1416   2005年

Effect of rice straw amendment on dissolved organic and inorganic carbon, and cationic nutrients in percolating water from a flooded paddy soil: A microcosm experiment using 13C-enriched rice straw. 招待有り 査読有り

Katoh,M., Murase,J., Sugimoto,A., and Kimura,M.

Org. Geochem.   36 巻   頁： 803-811   2005年

Bacterial community responsible for the decomposition of rice straw compost in a Japanese rice paddy field estimated by DGGE analysis of amplified 16S rDNA and 16S rRNA fragments. 査読有り

Tanahashi,T., Murase,J., Matsuya,K., Asakawa, S., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr., 51, 351-360 (2005)   51 巻   頁： 351-360   2005年

Dynamics of methane in a mesotrophic Lake Biwa, Japan. 招待有り 査読有り

Murase.J., Sakai,Y., Kametani,A., and Sugimoto,A.

Ecol. Res.   20 巻   頁： 377-385   2005年

Analysis of communities of ammonia oxidizers, methanotrophs, and methanogens associated with microcrustaceans in the floodwater of a rice field microcosm. 査読有り

Niswati,A., Murase,J., Asakawa,S., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   50 巻   頁： 447-455   2004年

Microbial communities responsible for the decomposition of rice straw compost in a Japanese rice paddy field determined by phospholipid fatty acid (PLFA) analysis. 査読有り

Tanahashi,T., Murase,J., Matsuya,K., Asakawa,S., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr., 50, 1229-1236 (2004)   50 巻   頁： 1229-1236   2004年

Sites and process of nutrient accumulation in the subsoil through water percolation from the plow layer in a submerged paddy soil microcosm. 査読有り

Katoh,M., Murase,J., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   50 巻   頁： 731-738   2004年

Nutrient leaching from the plow layer by water percolation and accumulation in the subsoil in an irrigated paddy field. 査読有り

Katoh,M., Murase,J., Hayashi,M., Matsuya,K., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   50 巻   頁： 721-729   2004年

Biotic and abiotic methane releases from Lake Biwa sediment slurry. 査読有り

Dan,J., Kumai,T., Sugimoto,A., and Murase,J.

Limnology   5 巻   頁： 149-154   2004年

Linking microbial community dynamics to rhizosphere carbon flow in a wetland rice soil. 査読有り

Lu,Y., Murase,J., Watanabe,A., Sugimoto,A., and Kimura,M.

FEMS Microbiol. Ecol.   48 巻   頁： 179-186   2004年

Effect of application of rice straw and compost on the community structure of bacteria associated with microcrustaceans in the floodwater of a paddy field microcosm. 査読有り

Niswati,A., Murase,J., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   49 巻   頁： 191-200   2003年

Sources of dissolved methane in Lake Biwa. 査読有り

Murase,J., Sakai,Y., Sugimoto,A., Okubo,K., and Sakamoto,M.

Limnology   4 巻   頁： 91-99   2003年

Molecular analysis of β-proteobacterial ammonia oxidizer populations in surface layers of a submerged paddy soil microcosm. 査読有り

Murase,J., Itoh,K., Kano,M., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   49 巻   頁： 909-913   2003年

Adsorption as a methane storage process in natural lake sediment. 査読有り

Sugimoto,A., Dan,J., Kumai,T., and Murase,J.

Geophys. Res. Lett.   30 巻   頁： doi:10.1029/2003GL018162   2003年

第2編第2章2.2自然特性

村瀬潤

    2002年3月

Resuspension of bottom sediment by an internal wave in Lake Biwa 査読有り

Sakai,Y., Murase,J., Sugimoto,A., Okubo,K., and Nakayama,E.

Lakes Reserv.   7 巻   頁： 339-344   2002年

Seasonal and spatial variations of methane production in mesotrophic lake sediments (Lake Biwa, Japan).

Murase,J. and Sugimoto,A.:

Verh.Int. Ver. Limnol.   28 巻   頁： 971-974   2002年

Comparison of microbial communities in percolating water from plow layer and subsoil layer estimated by phospholipid fatty acid (PLFA) analysis. 査読有り

Shimizu,M., Hayashi,M., Matsuya,K., Murase,J., and Kimura,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   48 巻   頁： 877-881   2002年

Uptake of carbon and nitrogen through roots of rice and corn plants, grown in soils treated with 13C and 15N dual-labeled cattle manure compost. 査読有り

Yamamuro,S., Ueno,H., Yamada,H., Takahashi,Y., Shiga,Y., Miyahara,S., Shimonihara,T., Murase,J., Yanai,J., and Nishida,M.

Soil Sci. Plant Nutr.   48 巻   頁： 787-795   2002年

沿岸帯を観るキーワード　－その多面的多様性－ 招待有り 査読有り

村瀬　潤・野崎健太郎・山田佳裕

陸水学雑誌   63 巻   頁： 269-270   2002年

Spatial distribution of methane in the Lake Biwa sediments and its carbon isotopic compositions

Jun MURASE & Atsuko SUGIMOTO

Geochemical Journal   35 巻   頁： 257-263   2001年8月

Horizontal distribution of carbon and nitrogen and their isotopic compositions in the surface sediment of Lake Biwa

"Murase,J. and Sakamoto,M"

Limnology   1 巻   頁： 177-184   2000年1月

琵琶湖堆積物の生元素の空間的分布

村瀬潤

    1998年1月

"Anaerobic reoxidation of Mn2+, Fe2+, S0 and S2- in submerged paddy soils."

"Murase,J. and Kimura,M.:"

Biol.Fert.Soil.   25 巻   頁： 302-306   1997年1月

Anaerobic reoxidation of Mn²⁺, Fe²⁺, S⁰ and S^2- in submerged poddy soils.

Biology Fertility Soil   25 巻   頁： 302-306   1997年

Methane production and its fate in paddy fields. IX. Methane flux distribution and decomposition of methane in the subsoil during the growth period of rice plants.

"Murase,J. and Kimura,M."

Soil Sci. Plant Nutr.   42(1) 巻   頁： 187-190   1996年1月

Utilization of the feces sludge from the swine farm for rice production in the problem soils in Thailand.

"Murase,J., Korpraditskul,R., Osotsapar,Y., and Korpraditskul,V"

J. ISSAAS   2 巻   頁： 54-71   1996年1月

Methane production and its fate in paddy fields. (]G0009[) Methane flux distribution and decompostition of methane in the subsoil during the growth period of rice plants

Soil Science and Plant Nutrition   42 巻 ( 1 ) 頁： 187-190   1996年

Utilization of the faces sludge from the swine Farm for rice production in the problem soils in Thailand

Journal of International Society for Southeast Asian Agricultural Sciences(J. ISSAAS)   2 巻   頁： 54-71   1996年

Methane production and its fate in paddy fields. IV. Sources of microorganisms and substrates responsible for anaerobic methane oxidation in subsoil. 査読有り

Soil Science and Plant Nutrition   40 巻 ( 1 ) 頁： 57-61   1994年

Methane production and its fate in paddy fields. (]G0006[) Anaerobic oxidation of methane in plow layer soil

Soil Science and Plant Nutrition   40 巻 ( 3 ) 頁： 505-514   1994年

Methane production and Its fate in paddy fields. (]G0007[) Electron Acceptors responsible for anaerobic methane oxidation

Soil Science and Plant Nutrition   40 巻 ( 4 ) 頁： 647-654   1994年

Methane production and its fate in paddy fields. (]G0003[). Effects of percolation on methane flux distribution to the atmosphere and the subsoil

Soil Science and Plant Nutrition   39 巻 ( 1 ) 頁： 63-70   1993年

身近な水の環境科学第2版

村瀬　潤（ 担当： 分担執筆 ,  範囲: 水田の物質循環）

朝倉書店  2022年4月  （ ISBN:978-4-254-18062-6 ）

水田微生物の特徴と生産性とのかかわり

村瀬　潤（ 担当： 単著）

朝倉書店  2018年8月  （ ISBN:978-4-254-43571-9 ）

最新農業技術「土壌施肥 vol.9」

村瀬　潤（ 担当： 単著 ,  範囲: 太陽熱処理が土壌繊毛虫群集に及ぼす影響）

農文協  2017年3月 

土のひみつ-食料・環境・生命-

日本土壌肥料学会「土のひみつ」編集グループ（編）（ 担当： 共著）

朝倉書店  2015年9月 

4.1 微生物．身近な水の環境科学-実習・測定編-

日本陸水学会東海支部会（ 担当： 共著）

朝倉書店  2014年6月 

第16章 Stable Isotope Probing、土壌微生物実験法第３版

日本土壌微生物学会　（編）（ 担当： 単著）

養賢堂  2013年6月 

第10章 原生動物 (10-2～10-6節)、土壌微生物実験法第３版

日本土壌微生物学会　（編）（ 担当： 単著）

養賢堂  2013年6月 

12. 窒素サイクル，メタンサイクルに果たす微生物の役割、 シリーズ　現代の生態学11巻

村瀬　潤（ 担当： 単著）

共立出版  2011年3月 

７．水田の土壌環境と微生物相　　身近な自然の保全生態学

浅川　晋、村瀬　潤　（ 担当： 共著）

培風館  2010年9月  （ ISBN:978-4-563-07810-2 ）

世紀を超えて座談会を傍聴する、日本微生物生態学会編、土壌微生物通信(1962-1986)探訪(2)　「通信」の時代と現在の間

村瀬　潤（ 担当： 単著）

博友社  2010年5月 

7.集水域の中の水田、日本陸水学会東海支部会編、身近な水の環境科学－源流から干潟まで－

村瀬　潤（ 担当： 単著）

朝倉書店  2010年1月  （ ISBN:978-4-254-18023-7 ）

*土壌の原生生物・線虫群集－その土壌生態系での役割－

橋本知義、村瀬　潤、島野智之、岡田浩明、豊田剛己、佐藤恵利華（ 担当： 共著）

博友社  2009年8月 

Terrestrial ecosystems in a changing world.

Kohyama,T., Urabe,J., Hikosaka,K., Shibata,H., Yoshioka,T., Konohira,E., Murase,J., Wada,E.（ 担当： 共著）

Springer  2007年 

地球環境と生態系 5.4 水系のガス代謝

村瀬　潤・杉本敦子（ 担当： 共著）

共立出版  2006年5月 

東アジアモンスーン域の湖沼と流域　3-4湖の富栄養化の現状、変動経過、原因

坂本　充・村瀬　潤・丸尾雅啓（ 担当： 共著）

名古屋大学出版会  2006年 

新・土の微生物 (5)系統分類からみた土の細菌

村瀬潤（ 編：日本土壌微生物学会編）（ 担当： 共著）

博友社  2000年 

水稲根圏微生物叢の形成に及ぼす水稲品種、土壌タイプ、施肥の影響

天野 真宏, 長谷川 昂平, 森 拓也, 西内 俊策, 土井 一行, 勝見尚也, Rasit ASILOGLU, 高橋 宏和, 中園 幹生, 村瀬 潤

日本微生物生態学会第35回大会  2022年11月  日本微生物生態学会

トウモロコシへの耐湿性遺伝子の導入が根圏微生物叢に及ぼす影響

村瀬 潤、間野吉郎、大森史恵、高橋秀和、高橋宏和、中園幹生

日本土壌肥料学会2022年度東京大会  2022年9月  日本土壌肥料学会

異なる水稲栽培品種の根圏微生物群集の施肥に対する応答

天野 真宏、長谷川 昂平、森 拓也、西内 俊策、土井 一行、吉田 英樹、松岡 信、高橋 宏和、中園 幹生、村瀬 潤

日本土壌肥料学会2022年度東京大会  2022年9月  日本土壌肥料学会

水田土壌表層の微生物群集に及ぼす光の影響

出水明日香、村瀬潤

日本土壌微生物学会2022 年度鹿児島大会  2022年6月  日本土壌微生物学会

異なる水稲栽培品種の根圏微生物群集の施肥に対する応答

天野真宏, 長谷川昂平, 森拓也, 西内俊策, 土井一行, 松岡信, 高橋宏和, 中園幹生, 村瀬潤

日本土壌肥料学会2021年度北海道大会  2021年9月  日本土壌肥料学会

Microeukaryotic community in the upland soil under the long-term fertilizer treatments.

Sok, S., and Murase, J.

日本土壌肥料学会2020年度倉敷大会  2020年9月  日本土壌肥料学会

温度は細菌を捕食する土壌原生生物の群集構成を支配する 国際共著

大島崇彰, Gillar, O., 村瀬潤

日本土壌肥料学会中部支部2019年名古屋大会  2019年11月27日  日本土壌肥料学会中部支部

土壌に導入された微生物を利用する微生物群集のStable Isotope Probing法による解析 国際共著

南川浩樹, 大島崇彰, Gillar, O., 村瀬潤

日本土壌肥料学会2019年度静岡大会  2019年9月3日  日本土壌肥料学会

水稲根圏の細菌群集に及ぼす原生生物の影響

永井裕也、村瀬　潤

日本土壌微生物学会2019年度大会  2019年6月15日  日本土壌微生物学会

田んぼの中の原生生物たちの暮らし 招待有り

村瀬　潤

日本土壌微生物学会2019年度大会  2019年6月16日  日本土壌微生物学会

湛水水田土壌表層における溶存酸素鉛直プロファイルの昼夜変動

村瀬潤, 後藤佳介, 杉浦大輔

日本土壌肥料学会中部支部2018年度大会  2018年11月29日  日本土壌肥料学会中部支部

土壌繊毛虫群集に及ぼす温度環境の影響－高温に対する脆弱性と復元力

大島崇彰、篠原陽子、村瀬　潤

日本土壌肥料学会2018年度神奈川大会  2018年8月29日  日本土壌肥料学会

The effect of humic substances on the methanogenic microbial community in the artificial rice field soil 国際会議

Maeda, Y., and Murase, J.

17th International Symposium on Microbial Ecology  2018年8月  International Society of Microbial Ecology

Microflora in Arctic Wetland Soils of a Taiga-Tundra Ecotone in Northeastern Siberia 国際共著 国際会議

Murase, J., Sugimoto, A., Shingubara, R., and Maximov, T. C.

The 10th Asian Symposium in Microbial Ecology  2018年7月 

長期施肥試験圃場で生育する作物の根圏微生物群集－発病抑止性との関連－

村瀬　潤、田原保樹、日置真優、西内俊策、北野英己、柘植尚志

日本土壌微生物学会2018年度大会  2018年6月16日  日本土壌微生物学会

Ecology of protists in a rice rhizosphere 招待有り 国際会議

International Workshop of Mollisols Ecology  2018年6月8日  Chinese Academy of Science

Methane-driven microbial food web in the rice rhizosphere 国際会議

Hibino, Y., Tokida, T., Okubo, T., Arai, M., Hayashi, K., Sakai, H., Hasegawa, T., and Murase, J.

13 th International Conference of The East and Southeast Asia Federation Of Soil Sciences (13 th ESAFS)  2017年12月  East and Southeast Asia Federation Of Soil Sciences

水稲根圏における原生生物の生態と機能 招待有り

村瀬　潤

第362回生存権シンポジウム  2017年11月21日  京都大学

北東シベリア湿地土壌のメタン酸化のポテンシャルと微生物叢の特性 国際共著

村瀬潤, 杉本敦子, 新宮原諒, マキシモフ・トロフィーム・C

日本土壌肥料学会中部支部2017年度大会  2017年10月26日  日本土壌肥料学会中部支部

水稲根圏におけるメタン酸化食物連鎖の安定同位体プロービング法による解析

日比野優子, 常田岳志, 大久保卓, 荒井美和, 林健太郎, 酒井英光, 長谷川利拡, 村瀬潤

日本土壌肥料学会2017年度仙台大会  2017年9月  日本土壌肥料学会

⽔⽥⼟壌のメタン酸化微⽣物⾷物連鎖の構造と機能 国際会議

村瀬潤, 日比野優子, 常田岳志, 大久保卓, 荒井美和, 林健太郎, 酒井英光, 長谷川利拡

日本地球惑星科学連合2017年大会  2017年5月24日  日本地球惑星科学連合

人工水田土壌のメタン生成活性と微生物群集に及ぼす土壌構成要素の影響

村瀬潤, 前田悠

日本微生物生態学会第31回大会  2016年10月  日本微生物生態学会

Diversity and ecology of microeukaryotes in rice field soil 招待有り 国際会議

The 8th Asian Symposium on Microbial Ecology  2016年10月1日  Taiwan Society of Microbial Ecology

北東シベリア湿地土壌のメタン酸化ポテンシャル 国際共著

村瀬潤, 杉本敦子, 新宮原諒, マキシモフ・トロフィーム・C

日本土壌肥料学会2016年度佐賀大会  2016年9月20日  日本土壌肥料学会

Response of the protistan community of a rice field soil to different oxygen tensions. 国際会議

16th International Symposium on Microbial Ecology  2016年8月  International Society of Microbial Ecology

太陽熱土壌消毒が土壌微生物群集に及ぼす影響のeDNA解析による評価

大島崇彰, 篠原陽子, 山野明日夏, 前坂昌宏, 横江和典, 山縣美奈, 橋本知義, 村瀬潤, 浅川晋

日本土壌微生物学会2016年度大会  2016年6月11日  日本土壌微生物学会

有機物資材の長期施用が畑土壌の病害抑止性と微生物群集に及ぼす影響

村瀬潤, 田原保樹, 日置真優, 西内俊策, 北野英己, 柘植尚志

日本土壌微生物学会2016年度大会  2016年6月11日  日本土壌微生物学会

Methane Oxidation Potential of Arctic Wetland Soil of a Taiga-Tundra Ecotone in Northeastern Siberia 国際共著 国際会議

2016年5月26日 

水田土壌微生物の態解析を目指した人工開発 —腐植物質が微生群集およびその活性に及ぼす影響 —

前田悠, 村瀬潤

日本土壌肥料学会中部支部第95回例会  2016年3月3日  日本土壌肥料学会中部支部

水田土壌微生物の生態解析を目指した人工土壌の開発

前田悠, 村瀬潤

第31回日本腐植物質学会  2015年11月20日  日本腐植物質学会

Methane oxidation potential of arctic wetland soil of a Taiga-Tundra ecotone in Northeastern Siberia. 国際共著 国際会議

Murase, J., Sugimoto, A., Shingubara, R., and Maximov, T. C

The 7th Japan-Taiwan-Korea International Symposium on Microbial Ecology  2015年10月18日 

Methane-driven microbial food web in a rice field soil 招待有り 国際会議

International Synposiumm "From classic to Frontiers: Methanotrophy and Meta-omics”  2015年9月21日  Chinese Academy of Science

Diversity and Ecology of Microeukaryotic Community in a Paddy Soil 国際会議

12th International Conference of the East and Southeast Asia Federation of Soil Science Societies (ESAFS2015)  2015年9月18日  East and Southeast Asia Federation of Soil Science Societies

異なる有機物資材の長期施用が畑土壌の細菌群集に及ぼす影響

村瀬潤, 田原保樹, 日置真優, 西内俊策, 北野英己, 柘植尚志

日本土壌肥料学会2015年京都大会  2015年9月  日本土壌肥料学会

Methane Oxidation Potential of Arctic Wetland Soil of a Taiga-Tundra Ecotone in Northeastern Siberia 国際共著 国際会議

2015年5月26日 

Assimilation of Plant-derived Carbon by Microeukaryotes in a Rice Field Soil 国際会議

Murase, J., Lee, C. G., Li, Y., Shibata, M., Nakatani, H., Minami, H., Watanabe, T., Asakawa, S., and Kimura, M.

15th International Symposium on Microbial Ecology  2018年8月  International Society of Microbial Ecology

Assimilation of Plant-derived Carbon by Microeukayotes in Rice Field Soil Revealed Using Stable-Isotope Probing. 国際会議

Murase, J., Lee, C. G., Li, Y., Shibata, M., Nakatani, H., Minami, H., Watanabe, T., Asakawa, S., and Kimura, M.

5th TKJ International Symposium in Microbial Ecology  2013年11月1日  Taiwan Society of Microbial Ecology

長期の施肥管理が水田土壌の繊毛虫群集に及ぼす影響

村瀬潤, 松田梨里, 飛田あづさ, 小川佳織, 今井克彦, 吉川那々子, 野々山利博, 木村眞人

日本土壌肥料学会2013年度名古屋大会  2013年9月  日本土壌肥料学会

PLFA-SIP法を用いた水田土壌の原生動物によるメタン酸化細菌の捕食解析

村瀬　潤、Paul Bodelier

日本土壌微生物学会 

微生物食物連鎖の分子生物学的解析：メタン酸化を例として

日本生態学会 

水田土壌から分離された新奇Heteroloboseaアメーバの形態学的・分子系統学的解析

村瀬　潤、Johan F. De Jonckheere

日本陸水学会東海支部会 

原生動物の捕食作用が水田土壌のメタン酸化細菌群集に及ぼす影響

村瀬　潤、Peter Frenzel

日本微生物生態学会 

有機物施用および酸素の有無が水田土壌の真核微生物群集に及ぼす影響

岩崎和史・村瀬　潤・木村眞人

日本土壌肥料学会 

Impact of protozoan grazing on the community of methanotrophic bacteria in a wetland rice field soil 国際会議

the10th InternationalSymposium on Bacterial Genetics and Ecology 

水田土壌のメタン酸化細菌群集におよぼす原生動物の影響

村瀬　潤・Peter Frenzel

日本土壌微生物学会 

水田土壌の原生動物によるメタン酸化細菌の選択的捕食

村瀬　潤、Paul L.E. Bodelier

日本陸水学会東海支部会 

水田土壌生態系の機能における細菌-原生生物系の役割

日本土壌肥料学会2008年度大会 

Selective grazing of free-living naked amoeba on methane-oxidizing bacteria. (Wako, Japan) 9 2007.8-27-30 国際会議

XIIth International Meeting on the Biology and Pathogenicity of Free-Living Amoebae 

水田土壌から単離したアメーバの系統解析

村瀬　潤・Peter Frenzel

日本土壌肥料学会2007年度大会 

メタン酸化細菌に対する原生動物の捕食選択性

村瀬　潤・Peter Frenzel

日本土壌微生物学会2007年度大会 

The Methanotrophic Microbial Food Chain in a Rice Field Soil 国際会議

The 10th International Symposium on Wetland Biogeochemistry 

水田土壌の物質循環と原生動物の機能

村瀬　潤

2006年度・日本微生物生態学会　学際シンポジュウム　－土壌における原生生物の多様性と微生物との相互作用－ 

原生動物が水田土壌の物質循環に及ぼす影響

村瀬　潤・Peter Frenzel・Matthias Noll

日本土壌肥料学会2006年度秋田大会 

水田土壌の原生生物群集に及ぼすメタンの影響

村瀬　潤・Peter Frenzel

土壌微生物学会 

A microbial food web in a rice field soil driven by methane oxidation. 国際会議

11th International Symposium on Microbial Ecology 

The impact of protists on activity and structure of bacterial community in a flooded rice field soil. 国際会議

ASLO Summer Meeting 

Methane dynamics in Lake Biwa. 国際会議

The Goldschmidt Conference 2003 

Carbon dynamics in bottom sediment of Lake Biwa, Japan: origins, metabolism, and impact on the lake ecosystem. 国際会議

The International Symposium on Response of Terrestrial Watershed Ecosystems in Monsoon Asia to Global Change (Kyoto, Japan) 

Chemical determination of microbially reducible manganese and iron in paddy soils and lake sediments. 国際会議

17th World Congress of Soil Science 

トウモロコシ属植物の耐湿性獲得機構の全容解明と分子育種への応用

研究課題/研究課題番号：21H04724  2021年4月 - 2025年3月

科学研究費助成事業  基盤研究(A)

中園 幹生, 間野 吉郎, 村瀬 潤, 高橋 秀和

遺伝型・表現型が支配する水稲根圏の微生物食物連鎖構造と機能

研究課題/研究課題番号：20H02887  2020年4月 - 2023年3月

科学研究費助成事業  基盤研究(B)

村瀬 潤, 中園 幹生, 土井 一行, 西内 俊策

田畑輪換圃場の微生物群集動態を長期継続調査し水田土壌微生物群集の安定性を解明する

研究課題/研究課題番号：18H02114  2018年4月 - 2023年3月

科学研究費助成事業  基盤研究(B)

浅川 晋, 村瀬 潤, 渡邉 健史

熱帯畑作地における有機物の「質・量」統合的生態系管理による劣化土壌修復技術の創出

研究課題/研究課題番号：18H02315  2018年4月 - 2022年3月

科学研究費助成事業  基盤研究(B)

小崎 隆, 村瀬 潤, 杉原 創, 沢田 こずえ

Cryo-TOF-SIMS/SEMによる根圏効果のサブミリスケールの可視化

研究課題/研究課題番号：16K15075  2016年4月 - 2020年3月

村瀬 潤

酸化還元境界層のゆらぎが微生物の動態とガス代謝に及ぼす影響

研究課題/研究課題番号：16H05056  2016年4月 - 2019年3月

村瀬 潤

北東シベリア永久凍土地帯のガス代謝と微生物群集の環境変動に対する応答

研究課題/研究課題番号：16H05618  2016年4月 - 2019年3月

村瀬 潤

小川原湖における異臭味原因物質の発生要因の解明

研究課題/研究課題番号：15K07532  2015年4月 - 2018年3月

眞家 永光

土壌生態系の解剖学的解析ツールとしての人工土壌の開発

2013年4月 - 2016年3月

科学研究費補助金 

水稲根圏におけるメタンの動態に関わる微生物食物連鎖の構造と機能の解析

2013年4月 - 2016年3月

科学研究費補助金  基盤研究(B)

メタン酸化をめぐる微生物食物連鎖の機能解析　　　　　　　　　　　　　　　　　　　

2008年

科学研究費補助金  基盤研究(C)，課題番号：20580061

村瀬　潤

湿地土壌における原生生物の多様性と機能

2003年10月 - 2008年3月

科学研究費補助金 

微生物還元性鉄・マンガンの化学的定量法の確立と環境動態解析への応用

2001年7月 - 2003年1月

科学研究費補助金  奨励研究(A)

湖沼におけるガス交換

1999年7月 - 2002年1月

科学研究費補助金  特定領域研究(B)(2)(計画)

21世紀の環境構造変化に対応できる「琵琶湖標準モデル」の開発

1998年7月 - 2000年1月

科学研究費補助金  基盤研究(A)(2)(一般)