Updated on 2024/04/02

写真a

 
UEGUCHI, Chiharu
 
Organization
Graduate School of Bioagricultural Sciences Department of Applied Biosciences Associate professor
Graduate School
Graduate School of Bioagricultural Sciences
Undergraduate School
School of Agricultural Sciences Department of Applied Biosciences
Title
Associate professor
Contact information
メールアドレス

Degree 1

  1. Doctor of Science ( Kyoto University ) 

Research Areas 2

  1. Others / Others  / Science@Biology@Plant Physiology

  2. Others / Others  / Interdisciprinary Area@Basic Biology@Molecular Biology

Current Research Project and SDGs 2

  1. 高等植物の分化・生長に関わる分子メカニズムの解明

  2. Signal transduction in higher plant

Research History 4

  1. Associate Professor

    2007.4

      More details

    Country:Japan

  2. 生物分子応答研究センター 助教授

    2000.7

      More details

    Country:Japan

  3. 名古屋大学農学部 助手

    1991.4 - 2000.6

      More details

    Country:Japan

  4. Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences

Education 2

  1. Kyoto University   Graduate School, Division of Natural Science

    - 1991

      More details

    Country: Japan

  2. Kyoto University   Faculty of Science

    - 1986

      More details

    Country: Japan

Professional Memberships 4

  1. 日本植物生理学会   幹事

    2000.4 - 2002.3

  2. 日本分子生物学会

  3. 日本生化学会

  4. 日本植物生理学会

 

Papers 104

  1. Enhancement of meristem formation by bouquet-1, a mis-sense allele of the vernalization independence 3 gene encoding a WD40 repeat protein in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Takagi N, Ueguchi C

    Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   Vol. 17 ( 12 ) page: 982 - 93   2012.12

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/gtc.12014

    PubMed

  2. The Arabidopsis MERISTEM DISORGANIZATION 1 gene is required for the maintenance of stem cells through the reduction of DNA damage. Reviewed

    Yuma Hashimura and Chiharu Ueguchi

    The Plant Journal   Vol. 68 ( 4 ) page: 657 - 69   2011.11

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    In plants, stem cells reside in apical meristems, and provide the descendants required for post-embryonic growth and development throughout the life of a plant. To identify a novel factor required for the maintenance of stem cells, we isolated an Arabidopsis mutant, named meristem disorganization 1-1 (mdo1-1), that exhibits several developmental defects, such as abnormal phyllotaxy and plastochron, stem fasciation and retarded root growth. We found that the mutant plants fail to maintain stem cells, resulting in the differentiation or death of stem cells. The mutant plants also showed several phenotypes related to DNA damage, suggesting that the mutant cells are exposed constitutively to DNA damage even without external genotoxic stress. The growth defect and the hypersensitivity to DNA-damaging agents of mdo1-1 were enhanced significantly when combined with a lesion of the ATAXIA-TELANGIECTASIA MUTATED (ATM) gene, but not of the ATM/RAD3-RELATED (ATR) gene, suggesting that the function of the MDO1 gene is closely related to that of ATM kinase. The MDO1 gene encodes an unknown protein that is conserved in a wide variety of land plants. The results thus suggested that the MDO1 gene product is required for the maintenance of stem cells through a reduction in DNA damage.

    DOI: 10.1111/j.1365-313X.2011.04718.x

    PubMed

  3. RNA interference of the Arabidopsis putative transcription factor TCP16 gene results in abortion of early pollen development. Reviewed

    Takeda T, Amano K, Ohto MA, Nakamura K, Sato S, Kato T, Tabata S, Ueguchi C

    Plant molecular biology   Vol. 61 ( 1-2 ) page: 165 - 77   2006.5

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s11103-006-6265-9

    PubMed

  4. Histidine kinase homologs that act as cytokinin receptors possess overlapping functions in the regulation of shoot and root growth in Arabidopsis. Reviewed

    Nishimura C, Ohashi Y, Sato S, Kato T, Tabata S, Ueguchi C

    The Plant cell   Vol. 16 ( 6 ) page: 1365 - 77   2004.6

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1105/tpc.021477

    PubMed

  5. The OsTB1 gene negatively regulates lateral branching in rice. Reviewed

    Takeda T, Suwa Y, Suzuki M, Kitano H, Ueguchi-Tanaka M, Ashikari M, Matsuoka M, Ueguchi C

    The Plant journal : for cell and molecular biology   Vol. 33 ( 3 ) page: 513 - 20   2003.2

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01648.x

    PubMed

  6. The AHK4 gene involved in the cytokinin-signaling pathway as a direct receptor molecule in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Ueguchi C, Sato S, Kato T, Tabata S

    Plant & cell physiology   Vol. 42 ( 7 ) page: 751 - 5   2001.7

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/pcp/pce094

    PubMed

  7. Escherichia coli ribosome-associated protein SRA, whose copy number increases during stationary phase. Reviewed

    Izutsu K, Wada C, Komine Y, Sako T, Ueguchi C, Nakura S, Wada A

    Journal of bacteriology   Vol. 183 ( 9 ) page: 2765 - 73   2001.5

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/JB.183.9.2765-2773.2001

    PubMed

  8. Novel family of sensor histidine kinase genes in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Ueguchi C, Koizumi H, Suzuki T, Mizuno T

    Plant & cell physiology   Vol. 42 ( 2 ) page: 231 - 5   2001.2

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/pcp/pce015

    PubMed

  9. Two types of putative nuclear factors that physically interact with histidine-containing phosphotransfer (Hpt) domains, signaling mediators in His-to-Asp phosphorelay, in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Suzuki T, Sakurai K, Ueguchi C, Mizuno T

    Plant & cell physiology   Vol. 42 ( 1 ) page: 37 - 45   2001.1

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/pcp/pce011

    PubMed

  10. Negative control of rpoS expression by phosphoenolpyruvate: carbohydrate phosphotransferase system in Escherichia coli. Reviewed

    Ueguchi C, Misonou N, Mizuno T

    Journal of bacteriology   Vol. 183 ( 2 ) page: 520 - 7   2001.1

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/JB.183.2.520-527.2001

    PubMed

  11. Compilation and characterization of histidine-containing phosphotransmitters implicated in His-to-Asp phosphorelay in plants: AHP signal transducers of Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Suzuki T, Sakurai K, Imamura A, Nakamura A, Ueguchi C, Mizuno T

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   Vol. 64 ( 11 ) page: 2486 - 9   2000.11

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1271/bbb.64.2486

    PubMed

  12. Genes encoding pseudo-response regulators: insight into His-to-Asp phosphorelay and circadian rhythm in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Makino S, Kiba T, Imamura A, Hanaki N, Nakamura A, Suzuki T, Taniguchi M, Ueguchi C, Sugiyama T, Mizuno T

    Plant & cell physiology   Vol. 41 ( 6 ) page: 791 - 803   2000.6

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/pcp/41.6.791

    PubMed

  13. rpoS function is essential for bgl silencing caused by C-terminally truncated H-NS in Escherichia coli. Reviewed

    Ohta T, Ueguchi C, Mizuno T

    Journal of bacteriology   Vol. 181 ( 20 ) page: 6278 - 83   1999.10

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/JB.181.20.6278-6283.1999

    PubMed

  14. Biochemical characterization of a putative cytokinin-responsive His-kinase, CKI1, from Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Nakamura A, Kakimoto T, Imamura A, Suzuki T, Ueguchi C, Mizuno T

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   Vol. 63 ( 9 ) page: 1627 - 30   1999.9

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1271/bbb.63.1627

    PubMed

  15. Differential expression of genes for response regulators in response to cytokinins and nitrate in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Kiba T, Taniguchi M, Imamura A, Ueguchi C, Mizuno T, Sugiyama T

    Plant & cell physiology   Vol. 40 ( 7 ) page: 767 - 71   1999.7

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/oxfordjournals.pcp.a029604

    PubMed

  16. Compilation and characterization of Arabidopsis thaliana response regulators implicated in His-Asp phosphorelay signal transduction. Reviewed

    Imamura A, Hanaki N, Nakamura A, Suzuki T, Taniguchi M, Kiba T, Ueguchi C, Sugiyama T, Mizuno T

    Plant & cell physiology   Vol. 40 ( 7 ) page: 733 - 42   1999.7

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/oxfordjournals.pcp.a029600

    PubMed

  17. Histidine-containing phosphotransfer (HPt) signal transducers implicated in His-to-Asp phosphorelay in Arabidopsis. Reviewed

    Suzuki T, Imamura A, Ueguchi C, Mizuno T

    Plant & cell physiology   Vol. 39 ( 12 ) page: 1258 - 68   1998.12

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/oxfordjournals.pcp.a029329

    PubMed

  18. An Arabidopsis protein that interacts with the cytokinin-inducible response regulator, ARR4, implicated in the His-Asp phosphorylay signal transduction. Reviewed

    Yamada H, Hanaki N, Imamura A, Ueguchi C, Mizuno T

    FEBS letters   Vol. 436 ( 1 ) page: 76 - 80   1998.9

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/s0014-5793(98)01103-x

    PubMed

  19. Expression of Arabidopsis response regulator homologs is induced by cytokinins and nitrate. Reviewed

    Taniguchi M, Kiba T, Sakakibara H, Ueguchi C, Mizuno T, Sugiyama T

    FEBS letters   Vol. 429 ( 3 ) page: 259 - 62   1998.6

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/s0014-5793(98)00611-5

    PubMed

  20. The yhhP gene encoding a small ubiquitous protein is fundamental for normal cell growth of Escherichia coli. Reviewed

    Yamashino T, Isomura M, Ueguchi C, Mizuno T

    Journal of bacteriology   Vol. 180 ( 8 ) page: 2257 - 61   1998.4

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/JB.180.8.2257-2261.1998

    PubMed

  21. Response regulators implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis. Reviewed

    Imamura A, Hanaki N, Umeda H, Nakamura A, Suzuki T, Ueguchi C, Mizuno T

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   Vol. 95 ( 5 ) page: 2691 - 6   1998.3

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1073/pnas.95.5.2691

    PubMed

  22. The leuO gene product has a latent ability to relieve bgl silencing in Escherichia coli. Reviewed

    Ueguchi C, Ohta T, Seto C, Suzuki T, Mizuno T

    Journal of bacteriology   Vol. 180 ( 1 ) page: 190 - 3   1998.1

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/JB.180.1.190-193.1998

    PubMed

  23. Cloning of a cDNA encoding a putative metal-transporting P-type ATPase from Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Tabata K, Kashiwagi S, Mori H, Ueguchi C, Mizuno T

    Biochimica et biophysica acta   Vol. 1326 ( 1 ) page: 1 - 6   1997.5

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/s0005-2736(97)00064-3

    PubMed

  24. Systematic mutational analysis revealing the functional domain organization of Escherichia coli nucleoid protein H-NS. Reviewed

    Ueguchi C, Suzuki T, Yoshida T, Tanaka K, Mizuno T

    Journal of molecular biology   Vol. 263 ( 2 ) page: 149 - 62   1996.10

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1006/jmbi.1996.0566

    PubMed

  25. H-NS regulates OmpF expression through micF antisense RNA in Escherichia coli. Reviewed

    Suzuki T, Ueguchi C, Mizuno T

    Journal of bacteriology   Vol. 178 ( 12 ) page: 3650 - 3   1996.6

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/jb.178.12.3650-3653.1996

    PubMed

  26. The rpoD gene functions as a multicopy suppressor for mutations in the chaperones, CbpA, DnaJ and DnaK, in Escherichia coli. Reviewed

    Shiozawa T, Ueguchi C, Mizuno T

    FEMS microbiology letters   Vol. 138 ( 2-3 ) page: 245 - 50   1996.5

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/j.1574-6968.1996.tb08165.x

    PubMed

  27. Purification of H-NS protein and its regulatory effect on transcription in vitro. Reviewed

    Ueguchi C, Mizuno T

    Methods in enzymology   Vol. 274   page: 271 - 6   1996

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/s0076-6879(96)74023-5

    PubMed

  28. An Escherichia coli curved DNA-binding protein whose expression is affected by the stationary phase-specific sigma factor sigma S. Reviewed

    Kakeda M, Ueguchi C, Yamada H, Mizuno T

    Molecular & general genetics : MGG   Vol. 248 ( 5 ) page: 629 - 34   1995.9

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/BF02423459

    PubMed

  29. A study of the double mutation of dnaJ and cbpA, whose gene products function as molecular chaperones in Escherichia coli. Reviewed

    Ueguchi C, Shiozawa T, Kakeda M, Yamada H, Mizuno T

    Journal of bacteriology   Vol. 177 ( 13 ) page: 3894 - 6   1995.7

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/jb.177.13.3894-3896.1995

    PubMed

  30. Quantitative control of the stationary phase-specific sigma factor, sigma S, in Escherichia coli: involvement of the nucleoid protein H-NS. Reviewed

    Yamashino T, Ueguchi C, Mizuno T

    The EMBO journal   Vol. 14 ( 3 ) page: 594 - 602   1995.2

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07035.x

    PubMed

  31. An analogue of the DnaJ molecular chaperone whose expression is controlled by sigma s during the stationary phase and phosphate starvation in Escherichia coli. Reviewed

    Yamashino T, Kakeda M, Ueguchi C, Mizuno T

    Molecular microbiology   Vol. 13 ( 3 ) page: 475 - 83   1994.8

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/j.1365-2958.1994.tb00442.x

    PubMed

  32. A fission yeast gene encoding a protein that preferentially associates with curved DNA. Reviewed

    Yamada H, Mori H, Momoi H, Nakagawa Y, Ueguchi C, Mizuno T

    Yeast (Chichester, England)   Vol. 10 ( 7 ) page: 883 - 94   1994.7

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/yea.320100704

    PubMed

  33. Importance of stereospecific positioning of the upstream cis-acting DNA element containing a curved DNA structure for the functioning of the Escherichia coli proV promoter. Reviewed

    Tanaka K, Ueguchi C, Mizuno T

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   Vol. 58 ( 6 ) page: 1097 - 1101   1994.6

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1271/bbb.58.1097

    PubMed

  34. An analogue of the DnaJ molecular chaperone in Escherichia coli. Reviewed

    Ueguchi C, Kakeda M, Yamada H, Mizuno T

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   Vol. 91 ( 3 ) page: 1054 - 8   1994.2

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1073/pnas.91.3.1054

    PubMed

  35. Physical map location of a set of Escherichia coli genes (hde) whose expression is affected by the nucleoid protein H-NS. Reviewed

    Yoshida T, Ueguchi C, Mizuno T

    Journal of bacteriology   Vol. 175 ( 23 ) page: 7747 - 8   1993.12

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/jb.175.23.7747-7748.1993

    PubMed

  36. Sequence of a fission yeast gene encoding a protein with extensive homology to eukaryotic elongation factor-1 gamma. Reviewed

    Momoi H, Yamada H, Ueguchi C, Mizuno T

    Gene   Vol. 134 ( 1 ) page: 119 - 22   1993.11

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/0378-1119(93)90184-5

    PubMed

  37. Expression of the Escherichia coli dimorphic glutamic acid decarboxylases is regulated by the nucleoid protein H-NS. Reviewed

    Yoshida T, Yamashino T, Ueguchi C, Mizuno T

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   Vol. 57 ( 9 ) page: 1568 - 9   1993.9

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1271/bbb.57.1568

    PubMed

  38. The Escherichia coli nucleoid protein H-NS functions directly as a transcriptional repressor. Reviewed

    Ueguchi C, Mizuno T

    The EMBO journal   Vol. 12 ( 3 ) page: 1039 - 46   1993.3

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05745.x

    PubMed

  39. Function of the Escherichia coli nucleoid protein, H-NS: molecular analysis of a subset of proteins whose expression is enhanced in a hns deletion mutant. Reviewed

    Yoshida T, Ueguchi C, Yamada H, Mizuno T

    Molecular & general genetics : MGG   Vol. 237 ( 1-2 ) page: 113 - 22   1993.2

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/BF00282791

    PubMed

  40. Autoregulatory expression of the Escherichia coli hns gene encoding a nucleoid protein: H-NS functions as a repressor of its own transcription. Reviewed

    Ueguchi C, Kakeda M, Mizuno T

    Molecular & general genetics : MGG   Vol. 236 ( 2-3 ) page: 171 - 8   1993.1

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/BF00277109

    PubMed

  41. Insertional disruption of the nusB (ssyB) gene leads to cold-sensitive growth of Escherichia coli and suppression of the secY24 mutation. Reviewed

    Taura T, Ueguchi C, Shiba K, Ito K

    Molecular & general genetics : MGG   Vol. 234 ( 3 ) page: 429 - 32   1992.9

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/BF00538702

    PubMed

  42. [Structure and function of sequence directed DNA curvature]. Reviewed

    Ueguchi C, Mizuno T

    Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme   Vol. 37 ( 10 ) page: 1631 - 40   1992.8

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:Japanese   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    PubMed

  43. Multicopy suppression: an approach to understanding intracellular functioning of the protein export system. Reviewed

    Ueguchi C, Ito K

    Journal of bacteriology   Vol. 174 ( 5 ) page: 1454 - 61   1992.3

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/jb.174.5.1454-1461.1992

    PubMed

  44. [The sec genes of Escherichia coli]. Reviewed

    Ueguchi C, Ito K

    Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society   Vol. 63 ( 4 ) page: 293 - 8   1991.4

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:Japanese   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    PubMed

  45. Characterization of cold-sensitive secY mutants of Escherichia coli. Reviewed

    Baba T, Jacq A, Brickman E, Beckwith J, Taura T, Ueguchi C, Akiyama Y, Ito K

    Journal of bacteriology   Vol. 172 ( 12 ) page: 7005 - 10   1990.12

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/jb.172.12.7005-7010.1990

    PubMed

  46. Escherichia coli sec mutants accumulate a processed immature form of maltose-binding protein (MBP), a late-phase intermediate in MBP export. Reviewed

    Ueguchi C, Ito K

    Journal of bacteriology   Vol. 172 ( 10 ) page: 5643 - 9   1990.10

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/jb.172.10.5643-5649.1990

    PubMed

  47. Effects of mutations in heat-shock genes groES and groEL on protein export in Escherichia coli. Reviewed

    Kusukawa N, Yura T, Ueguchi C, Akiyama Y, Ito K

    The EMBO journal   Vol. 8 ( 11 ) page: 3517 - 21   1989.11

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/j.1460-2075.1989.tb08517.x

    PubMed

  48. The secY-rpmJ region of the spc ribosomal protein operon in Escherichia coli: structural alterations affecting secY expression. Reviewed

    Ueguchi C, Wittekind M, Nomura M, Akiyama Y, Ito K

    Molecular & general genetics : MGG   Vol. 217 ( 1 ) page: 1 - 5   1989.5

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/BF00330934

    PubMed

  49. Enhancement of meristem formation by bouquet-1, a mis-sense allele of the VERNALIZATION INDEPENDENCE 3 gene encoding a WD40 repeat protein in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Naoto Takagi and Chiharu Ueguchi

    Genes to Cells     2012.12

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: DOI: 10.1111/gtc.12014

  50. Cytokinin receptors are required for normal development of auxin-transporting vascular tissues in the hypocotyl but not in adventitious roots. Reviewed

    Kuroha, T., Ueguchi, C., Sakakibara, H. and Satoh, S.

      Vol. 47   page: 234-243   2006

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  51. RNA interference of the Arabidopsis putative transcription factor TCP16 gene results in abortion of early pollen development. Reviewed

    Takeda, T., Amano, K., Ohto, M., Nakamura, K., Sato, S., Tabata, S. and Ueguchi, C.

    Plant Molecular Biology   Vol. 61   page: 165-177   2006

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  52. *Histidine kinase homologs that act as cytokinin receptors possess overlapping functions in the regulation of shoot and root growth in Arabidopsis. Reviewed

    Nishimura C., Ohashi Y., Sato S., Kato T., Tabata S. and Ueguchi C.

    The Plant Cell   Vol. 16   page: 1365-1377   2004

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    Cytokinins are plant hormones that may play essential and crucial roles in various aspects of plant growth and development. To gain an insight into the molecular functions of the three AHK genes, AHK2, AHK3, and AHK4, we constructed a set of multiple ahk mutants. The ahk2 ahk4 and ahk3 ahk4 double mutants, as well as the ahk single mutants, grew normally, whereas the ahk2 ahk3 double mutants exhibited a semi-dwarf phenotype as to shoots, such as a reduced leaf size and a reduced influorescence stem length. The growth and development of the ahk2 ahk3 ahk4 triple mutant were markedly inhibited in various tissues and organs, including the roots and leaves in the vegetative growth phase, and the influorescence meristem in the reproductive phase. We showed that the inhibition of growth is associated with reduced meristematic activity of cells. Our results thus strongly suggest that the primary functions of AHK genes, and thus those of endogenous cytokinins, are triggering of the cell division and maintenance of the meristematic competence of cells to prevent subsequent differentiation until a sufficient number of cells has accumulated during organogenesis.

  53. サイトカイニンシグナル伝達の分子機構と生物学的機能

    上口智治

    蛋白質 核酸 酵素   Vol. 49 ( 16 ) page: 2549ー2557   2004

     More details

    Authorship:Lead author   Language:Japanese  

  54. *The OsTB1 gene negatively regulates lateral branching in rice Reviewed

    Takeda T., Suwa Y., Suzuki M., Kitano H., Ueguchi-Tanaka M., Ashikari M., Matsuoka M. and Ueguchi C.

    The Plant Journal   Vol. 33   page: 513-520   2003

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  55. 二成分制御系

    上口智治

    蛋白質核酸酵素増刊号「植物の形作り」   Vol. 47   page: 1711ー1716   2002.9

     More details

    Language:Japanese  

  56. Negative control of rpoS expression by phosphoenolpyruvate: carbohydrate phosphotransferase system (PEP: PTS) in Escherichia coli Reviewed

    Ueguchi C., Misonou N. and Mizuno T.

    Journal of bacteriology   Vol. 183   page: 520-527   2001

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  57. *The AHK4 gene involved in the cytokinin-signaling pathway as a direct receptor molecule in Arabidopsis thaliana Reviewed

    Ueguchi C., Sato S., Kato T. and Tabata S.

    Plant and Cell Physiology   Vol. 42   page: 751-755   2001

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  58. LeuO expression in response to starvation for branched-chain amino acids Reviewed

    Majumder, A., Fang, M., Tsai, K-J., Ueguchi, C., Mizuno, T., and Wu, H-Y.

    Journal of Biological Chemistry   Vol. 276   page: 19046-19051   2001

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  59. Escherichia coli ribosome-associated protein SRA, which increases during stationary phase Reviewed

    Izutsu, K., Wada, C., Komine, Y., Sako, T., Ueguchi, C., Nakura, S., and Wada, A.

    Journal of Bacteriology   Vol. 183   page: 2765-2773   2001

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  60. Novel family of sensor histidine kinase genes in Arabidopsis thaliana

    Ueguchi C., Koizumi H., Suzuki T. and Mizuno T.

    Plant and Cell Physiology   Vol. 42   page: 231-235   2001

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  61. Two types of putative nuclear factors that physically interact with histidine-containing phosphotransfer (HPt) domains, signaling mediators in His-to-Asp phosphorelay, in Arabidopsis thaliana

    Suzuki T., Sakurai K., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Plant and Cell Physiology   Vol. 42   page: 37-45   2001

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  62. Genes encoding pseudo-response regulators: insight into His-to-Asp phosphorelay and circadian rhythm in Arabidopsis thaliana Reviewed

    Makino S., Kiba T., Imamura A., Hanaki N., Nakamura A., Suzuki T., Taniguchi M., Ueguchi C., Sugiyama T. and Mizuno T

    Plant and Cell Physiology   Vol. 41   page: 791-803   2000

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  63. Compliation and characterization of histidine-containing phosphotransmitters implicated in His-to-Asp phosphorelay in plants: AHP signal transducers of Arabidopsis thaliana Reviewed

    Suzuki T, Sakurai K, Imamura A, Nakamura A, Ueguchi C, Mizuno T

    Bioscience, Biotechnology and Biochemistry   Vol. 64   page: 2486-2489   2000

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  64. "Biochemical characterization of a putative cytokinin-responsive His-kinase, CKI1, from Arabidopsis thaliana" Reviewed

    Nakamura A. Kakimoto T. Imamura A. Suzuki T. Ueguchi C. Mizuno T.

    Biosci. Biotech. Biochem.   Vol. 63   page: 1627-1630   1999.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  65. Differential expression of genes for response regulators in response to cytokinins and nitrate in Arabidopsis thaliana. Reviewed

    Kiba T. Taniguchi M. Imamura A. Ueguchi C. Mizuno T. Sugiyama T.

    Plant & Cell Physiology   Vol. 40   page: 767-771   1999.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  66. Compilation and charalterization of Arobidopsis thaliana response regulatovs implicated in His-Asp phosphoralay signal transduction. Reviewed

    Imamura A., Hanaki N., Nakamura A., Suzuki T., Taniguchi M., Kiba T., Ueguchi C., Sugiyama T. and Mizuno T.

    Plant and Cell Physiology   Vol. 40   page: 733-742   1999

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  67. rpoS function is essential for bgl silencing caused by C-terminally truncated H-NS in Escherichia coli Reviewed

    Ohta T., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Journal of Bacteriology   Vol. 181   page: 6278-6283   1999

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  68. Identification of the DNA binding surface of H-NS protein from Escherichia coli by heteronuclear NMR spectroscopy Reviewed

    Shindo H., Ohnuki A., Ginba H., Katoh E., Ueguchi C., Mizuno T. and Yamazaki T.

    FEBS Letters   Vol. 455   page: 63-69   1999

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  69. Histidine-containing phosphotransfer (HPt) signal transducers implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis.

    "Suzuki T., Imamura A., Ueguchi C. and Mizuno T.,"

    Plant & Cell Physiology   Vol. 39   page: 1258-1268   1998.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  70. "An Arabidopsis protein that interacts with the cytokinin-iucible response regulator, ARR4, implicated in the His-Asp phosphorylay signal transduction."

    "Yamada H., Hanaki N., Imamura A., Ueguchi C. and Mizuno T.,"

    FEBS Letters   Vol. 436   page: 76-80   1998.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  71. The leuO gene-product has a latent ability to relieve the bgl silencing in Escherichia coli.

    "Ueguchi C., Ohta T., Seto C., Suzuki T. and Mizuno T.,"

    Journal of Bacteriology   Vol. 180   page: 190-193   1998.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  72. The yhhP gene encoding a small ubiquitous protein that is essential for the normal cell-growth of Escherichia coli.

    "Yamashino T.,ハ Isomura M., Ueguchi C. and Mizuno T.,"

    Journal of Bacteriology   Vol. 180   page: 2257-2261   1998.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  73. Response regulators implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in <u>Arabidopsis.</u> Reviewed

    Imamura A., Hanaki N., Umeda H., Nakamura A., Suzuki T., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Proceedings of National Academy of Sciences in USA   Vol. 95   page: 2691   1998

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  74. Expression of Arabidopsis response regulator homologs is induced by cytokinins and nitrate Reviewed

    Taniguchi M., Kiba T., Sakakibara H., Ueguchi C., Mizuno T. and Sugiyama T.

    FEBS Letters   Vol. 429   page: 259   1998

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  75. Cloning of a cDNA encoding a putative metal-transporting P-type ATPase from Arabidopsis thaliana.

    "Tabata K., Kashiwagi S., Mori H., Ueguchi C. and Mizuno T.,"

    Biochimica et Biophysica Acta   Vol. 1326   page: 1-6   1997.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  76. Clarification of the dimerization domain and its functional significance for the <u>Escherichia coli</u> nucleoid protein H-NS. Reviewed

    Ueguchi C., Seto C., Suzuki T. and Mizuno T.

    Journal of Molecular Biology   Vol. 274   page: 145   1997

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  77. Purification of H-NS protein and its regulatory effect on transcription in vitro. Invited Reviewed

    Ueguchi C. Mizuno T.

    Methods in Enzymology   Vol. 274   page: 271-276   1996.1

     More details

    Language:English  

  78. H-NS regulates OmpF expression through micF antisense RNA in Escherichia coli. Reviewed

    "Suzuki T., Ueguchi C. and Mizuno T.,"

    Journal of Bacteriology   Vol. 178   page: 3650-3653   1996.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  79. The <u>rpoD</u> gene functions as a multicopy suppressor for mutations in the chaperones, CbpA, DnaJ and DnaK, in Escherichia coli. Reviewed

    Shiozawa T., Ueguchi C. and Mizuno T.

    FEMS Microbiological Letters   Vol. 138   page: 245   1996

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  80. Systematic mutational analysis revealing the functional domain organization of <u>Escherichia</u> <u>coli</u> nucleoid protein H-NS Reviewed

    Ueguchi C., Suzuki T., Yoshida T., Tanaka K. and Mizuno T.

    Journal of Molecular Biology   Vol. 263   page: 149   1996

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  81. 飢餓に耐えるための転写制御

    上口智治

    化学と生物   Vol. 33   page: 694-695   1995.1

     More details

    Language:Japanese  

  82. "A study of the double mutation of dnaJ a cbpA, whose gene products function as molecular chaperones in Escherichia coli."

    "Ueguchi C., Shiozawa T., Kakeda M., Yamada H. and Mizuno T.,"

    Journal of Bacteriology   Vol. 177   page: 3894-3896   1995.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  83. Quantitative control of the stationary phase-specific sigma factor, σS, in <u>Escherichia coli</u> : involvement of the nucleoid protein H-NS Reviewed

    Yamashino T., Ueguchi C. and Mizuno T.

    The EMBO Journal   Vol. 14 ( 3 ) page: 594-602   1995

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  84. An <u>Escherichia coli</u> curved DNA-binding protein whose expression is affected by the stationary phase-specific sigma factor δs Reviewed

    Kakeda M., Ueguchi C., Yamada H. and Mizuno T.

    Molecular and General Genetics   Vol. 248   page: 629   1995

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  85. Solution structure of the DNA binding domain of a nucleoid-associated protein, H-NS, from <u>Escherichia coli</u> Reviewed

    Shindo H., Iwaki T., Ieda R., Kurumizaka H., Ueguchi C., Mizuno T., Morikawa S., Nakamura H. and Kuboniwa H.

    FEBS Letters   Vol. 360   page: 125-131   1995

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  86. An analogue of the DnaJ molecular chaperone in <u>Escherichia coli</u> Reviewed

    Ueguchi C., Kakeda M., Yamada H. and Mizuno T.

    Proceedings of the National Academy of Sciences in USA   Vol. 91   page: 1054-1058   1994

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  87. Importance of stereospecific positioning of the upstream <u>cis</u>-acting DNA element containing a curved DNA structure for the functioning of the <u>Escherichia coli proV</u> pranoter Reviewed

    Tanaka K., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Biosciences, Biotechnology and Biochemistry   Vol. 58 ( 6 ) page: 1097-1101   1994

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  88. A fission yeast gene encoding a protein that preferentially associates with curved DNA Reviewed

    Yamada H., Mori., Momoi H., Nakagawa Y., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Yeast   Vol. 10   page: 883-894   1994

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  89. An analogue of the Dna J molecular chaperone whose expression is controlled by σS during the stationary phase and phosphate starvation in <u>Escherichia coli</u> Reviewed

    Yamashino T., Kakeda M., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Molecular Microbiology   Vol. 13 ( 3 ) page: 475-483   1994

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  90. Function of the Escherichia coli nucleoid protein, H-NS : molecular analysis of a subset of proteins whose expression is enhanced in a hns deletion mutant. Reviewed

    Yoshida T., Ueguchi C., Yamada H. and Mizuno T.

    Molecular and General Genetics   Vol. 237   page: 113-122   1993

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  91. Expression of the Escherichia coli dimorphic glutamic acid decarboxylase is regulated by the nucleoid protein H-NS. Reviewed

    Yoshida T., Yamashino T., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Biosciences, Biotechnology and Biochemistry   Vol. 57 ( 9 ) page: 1568-1569   1993

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  92. Autoregulatory expression of the Escherichia coli hns gene encoding a nucleoid protein : H-NS functions as a repressor of its own transcription Reviewed

    Ueguchi C., Kakeda M. and Mizuno T.

    Molecular and General Genetics   Vol. 236   page: 171-178   1993

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  93. Sequence of a fission yeast gene encoding a protein with extensive homology to eukaryotic elongation factor-1γ Reviewed

    Momoi H., Yamada H., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Gene   Vol. 134   page: 119-122   1993

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  94. Physical map location of a set of Escherichia coli genes(hde)whose expression is affected by the nucleoid protein, H-NS. Reviewed

    Yoshida T., Ueguchi C. and Mizuno T.

    Journal of Bacteriology   Vol. 175 ( 23 ) page: 7747-7748   1993

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  95. The Escherichia coli nucleoid protein H-NS functions directly as a transcriptional repressor. Reviewed

    Ueguchi C. and Mizuno T.

    The EMBO Journal   Vol. 12 ( 3 ) page: 1039-1046   1993

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  96. Structure and function of sequence directed DNA curvature

      Vol. 37   page: 10   1992

     More details

    Language:Japanese  

  97. Multicopy suppression : an approach to understanding intracellular functioning of the protein export system Reviewed

    Ueguchi C. and Ito K.

    Journal of Bacteriology   Vol. 174   page: 5   1992

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  98. Insertional disruption of the nusB(ssyB) gene leads to cold-sensitive growth of Escherichia coli and suppression of the secY24 mutation. Reviewed

    Taura T., Ueguchi C., Shiba K. and Ito K.

    Molecular and General Genetics   Vol. 234   page: 429-432   1992

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  99. Yeast gene which suppresses the defect in protein export of a secY mutant of E. coli Reviewed

    Sakaguchi M., Ueguchi C., Ito K. and Omura T.

    Journal Biochemistry (TOKYO)   Vol. 109   page: 799-802   1991

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  100. The sec genes of <u>Escherichia</u> <u>coli</u>

      Vol. 63   page: 4   1991

     More details

    Language:Japanese  

  101. Escherichia coli sec mutants accumulate a processed immature form of maltose-binding protein (MBP), a late-phase intermediate in MBP export Reviewed

    Ueguchi C. and Ito K.

    Journal of Bacteriology   Vol. 172   page: 5643-5649   1990

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  102. Characterization of cold-sensitive secY mutants of Escherichia coli Reviewed

    Baba T., Jacq A., Brickman E., Beckwith J., Taura T., Ueguchi C., Akiyama Y. and Ito K.

    Journal of Bacteriology   Vol. 172   page: 7005-7010   1990

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  103. The secy-rpmJ region of the spc ribosomal protein operon in Escherichia coli : Structural alterations affecting secY expression Reviewed

    Ueguchi C., Wittekind M., Nomura M., Akiyama Y. and Ito K.

    Molecular and General Genetics   Vol. 217   page: 1-5   1989

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  104. Effects of mutations in heat-shock genes groES and groEL on protein export in Escherichia coli Reviewed

    Kusukawa N., Yura T., Ueguchi C., Akiyama Y. and Ito K.

    The EMBO Journal   Vol. 8   page: 3517-3521   1989

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

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Books 5

  1. 基礎生化学実験法

    上口智治( 編:)( Role: Joint author)

    東京化学同人  2000 

     More details

    Language:Japanese

  2. *Molecular Chaperone and Protein-Folding Sequences.

    "Mizuno T. and Ueguchi C.( EDITOR:Gething, M. J.)"( Role: Joint author)

    University Press  1997 

     More details

    Language:English

    CbpA

  3. *Purification of H-NS protein and its regulatory effect on transcription in vitro

    ( Role: Joint author)

    Methods in Enzymology  1996 

     More details

    Language:English

  4. 新遺伝子操作の基礎技術

    上口智治( 編:太田美智男)( Role: Joint author)

    菜根出版  1995 

     More details

    Language:Japanese

    遺伝子の解析

  5. 用語ライブラリー: 転写因子

    "上口智治, 水野猛( 編:田村隆明,梅園和彦)"( Role: Joint author)

    羊土社  1995 

     More details

    Language:Japanese

    H-NS

Presentations 56

  1. 受容体様キナーゼをコードするシロイヌナズナCRK14遺伝子はglobal proliferative arrestに関与する

    石崎千里、樋口真由、松下侑真、鈴木孝征、望月伸悦、長谷あきら、上口智治

    第62回日本植物生理学会年会  2022.3.22  日本植物生理学会

     More details

    Event date: 2022.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:茨城県つくば市   Country:Japan  

  2. Global proliferative arrestに関わるシロイヌナズナFIREWORKS遺伝子の同定

    今井翔、廣澤ひかる、鈴木孝征、小鍛治敬生、望月伸悦、長谷あきら、上口智治

    第60回日本植物生理学会年会  2019.3  日本植物生理学会

     More details

    Event date: 2019.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:名古屋  

  3. A missense allele of Arabidopsis CNGC20 gene encoding a cyclic nucleotide-gated channel affects leaf growth and maintenance of stem cell activity in shoot apical meristem

     More details

    Event date: 2016.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  4. MERISTEM DISORGANIZATION 1 (MDO1)遺伝子は胚発生能力を持つ配偶子の形成に必要である

    中上朋美,上口智治

    第53回日本植物生理学会年会 

     More details

    Event date: 2012.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都   Country:Japan  

  5. シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION 1遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である

    橋村侑磨,上口智治

    第53回日本植物生理学会年会 

     More details

    Event date: 2012.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都   Country:Japan  

  6. シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION 1遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である

    橋村侑磨,上口智治

    第52回日本植物生理学会年会 

     More details

    Event date: 2011.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:仙台   Country:Japan  

  7. MERISTEM DISORGANIZATION 1 (MDO1)遺伝子は胚発生能力を持つ配偶子の形成に必要である

    中上朋美,上口智治

    第52回日本植物生理学会年会 

     More details

    Event date: 2011.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:仙台   Country:Japan  

  8. シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION1 (MDO1)遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である

    橋村侑磨、上口智治

    第33回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2010.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

  9. シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION1 (MDO1)遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である

    橋村侑磨、西史江、上口智治

    第51回日本植物生理学会年会 

     More details

    Event date: 2010.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  10. シロイヌナズナBOUQUIT遺伝子のミスセンス変異によるメリステムの過剰形成

    高木直人、上口智治

    第50回日本植物生理学会年会 

     More details

    Event date: 2009.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  11. Biological functions of the cytokinin receptors in Arabidopsis International conference

    6th annual symposium of Agricultural Plant Stress Research Center 

     More details

    Event date: 2006.9

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

  12. Cytokinin receptors are required for normal development of auxin-transporting vascular tissues in the hypocotyl but not in adventitious roots. International conference

    17th International Conference on Arabidopsis Research 

     More details

    Event date: 2006.6

    Language:English  

  13. シロイヌナズナのサイトカイニン受容体は、側根形成を誘導するオーキシン輸送に関わる胚軸維管束の発達に必要である

    黒羽剛、上口智治、榊原均、佐藤忍

    第24回根研究集会 

     More details

    Event date: 2006.5

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  14. シロイヌナズナのサイトカイニン受容体AHK2~4の機能低下は、背軸での維管束発達の抑制およびオーキシンの蓄積による、側根形成の抑制と不定根形成を引き起こす

    日本植物生理学会2005年度年会 

     More details

    Event date: 2005.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  15. Biological functions of the cytokinin receptors in Arabidopsis

    International Symposium "Plant Axis Formation and Signal Transduction" 

     More details

    Event date: 2005.3

    Language:English   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  16. 根端優勢が喪失したシロイヌナズナ突然変異ar-22はサイトカイニン受容体機能欠損突然変異wolの新規アリルである

    黒羽剛、上口智治、佐藤忍

    シロイヌナズナワークショップ2004 

     More details

    Event date: 2004.11

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  17. Biological functions of the cytokinin receptors in Arabidopsis International conference

    18th International Conference on Plant Growth Substances 

     More details

    Event date: 2004.9

    Language:English  

  18. Cytokinin receptor gene mutants in Arabidopsis International conference

    Cytokinin 2004 

     More details

    Event date: 2004.7

    Language:English  

  19. シロイヌナズナTCP16遺伝子は花粉形成に必須な転写因子である

    武田泰斗、天野和夫、西村千佳、大籐雅章、中村研三、佐藤修正、加藤友彦、田畑哲之、上口智治

    日本植物生理学会2004年度年会 

     More details

    Event date: 2004.3

    Language:Japanese  

  20. サイトカイニン受容体をコードするAHK遺伝子群の変異解析

    西村千佳、大橋芳、佐藤修正、加藤友彦、田畑哲之、上口智治

    日本植物生理学会2004年度年会 

     More details

    Event date: 2004.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  21. シロイヌナズナTCP10遺伝子は細胞分裂を正に制御する

    武田泰斗、佐藤修正、加藤友彦、田畑哲之、上口智治

    日本植物生理学会2003年度年会 

     More details

    Event date: 2003.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  22. イネOsTB1遺伝子は側枝の生長を負に制御する

    武田泰斗、諏訪裕子、北野英巳、上口美弥子、芦刈基行、松岡信、上口智治

    日本植物生理学会2003年度年会 

     More details

    Event date: 2003.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  23. シロイヌナズナTCP遺伝子群の機能解析

    "武田泰斗,佐藤修正,加藤友彦,田畑哲之,上口智治"

    日本植物生理学会2002年度年会 

     More details

    Event date: 2002.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  24. サイトカイニンシグナルと形態形成

    上口智治

    植物の体づくりを探る 

     More details

    Event date: 2002.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    "東京大学, 東京都"

  25. サイトカイニン受容体

    上口智治

    第12回シロイヌナズナ・ワークショップ 

     More details

    Event date: 2001.9

    Language:Japanese  

    "名古屋大学, 名古屋市"

  26. シロイヌナズナAHK4遺伝子産物はサイトカイニンレセプターとして機能する

    "上口智治,佐藤修正,加藤友彦,田畑哲之"

    日本植物生理学会2001年度年会 

     More details

    Event date: 2001.3

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  27. The AHK4 gene is involved in the cytokinin-signaling pathway as a direct receptor molecule in Arabidopsis thaliana. International conference

    第8回国際イネゲノムワークショップ 

     More details

    Event date: 2001.2

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    つくば市 Japan

  28. シロイヌナズナのセンサーキナーゼAHK4遺伝子の変異解析

    "上口智治,佐藤修正,加藤友彦,田畑哲之"

    第23回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2000.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  29. シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸リレー情報伝達:疑似レギュレーター因子群の機能解析

    "牧野聖也,今村綾,木羽隆敏,谷口光隆,上口智治,杉山達夫,水野猛"

    日本植物生理学会2000年度年会 

     More details

    Event date: 2000.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  30. シロイヌナズナのHPt因子AHPと相互作用する因子の検索

    "鈴木友美,櫻井健介,上口智治,水野猛"

    日本植物生理学会2000年度年会 

     More details

    Event date: 2000.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  31. シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸転移情報伝達機構因子群ARRsの比較総合解析

    "今村綾,鈴木友美,上口智治,水野猛"

    日本植物生理学会2000年度年会 

     More details

    Event date: 2000.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  32. シロイヌナズナのレスポンスレギュレーター遺伝子の発現解析

    "木羽隆敏,藤田明恵,谷口光隆,榊原均,上口智治,水野猛,杉山達夫"

    日本植物生理学会1999年度年会 

     More details

    Event date: 1999.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  33. シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸リレー情報伝達系因子(HPt)の検索と機能解析

    "鈴木友美,今村綾,上口智治,水野猛"

    日本植物生理学会1999年度年会 

     More details

    Event date: 1999.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  34. "シロイヌナズナのサイトカイニン誘導性レギュレーター,ARR4,結合因子の解析"

    "花木直人,山田寿美,今村綾,鈴木友美,中村あや子,上口智治,水野猛"

    第21回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1998.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  35. 大腸菌細胞分裂に関わる新規タンパク質YhhPの機能

    "石井祐子,山田寿美,山篠貴史,上口智治,水野猛"

    第21回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1998.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  36. シロイヌナズナのレスポンスレギュレーター遺伝子群の解析

    "上口智治,今村綾,花木直人,谷口光隆,杉山達夫,水野猛"

    第21回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1998.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  37. シロイヌナズナにおける新規二成分制御系シグナル伝達因子(HPt)の検索と機能解析

    "鈴木友美,上口智治,水野猛"

    第21回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1998.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  38. 大腸菌のbglサイレンシングに関与する新規因子の解析

    "太田朋子,上口智治,水野猛"

    第21回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1998.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  39. シロイヌナズナのレスポンスレギュレーター遺伝子は無機窒素源及びサイトカイニンにより発現制御を受ける

    "谷口光隆,木羽隆敏,榊原均,上口智治,水野猛,杉山達夫"

    日本植物生理学会1998年度年会 

     More details

    Event date: 1998.5

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  40. シロイヌナズナにおける二成分制御系シグナル伝達因子の検索

    "上口智治,今村綾,花木直人,水野猛"

    日本植物生理学会1998年度年会 

     More details

    Event date: 1998.5

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  41. シロイヌナズナにおける新規二成分制御系シグナル伝達因子(HPt)の検索

    "鈴木友美,上口智治,水野猛"

    日本植物生理学会1998年度年会 

     More details

    Event date: 1998.5

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  42. シロイヌナズナにおけるバクテリア型情報伝達因子の解析

    "花木直人,山田寿美,今村綾,中村あや子,鈴木友美,上口智治,水野猛"

    日本農芸化学会1998年度大会 

     More details

    Event date: 1998.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  43. シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸転移信号伝達系遺伝子群の解析

    上口智治

    核酸情報ワークショップ 

     More details

    Event date: 1998.1

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Country:Japan  

  44. 大腸菌DNA結合タンパク質LeuOによるbglサイレンシングの解除

    "太田朋子,背戸千春,鈴木友美,上口智治,水野猛"

    第20回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1997.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  45. シロイヌナズナにおけるバクテリア型情報伝達因子の機能解析

    "今村綾,中村あや子,花木直人,上口智治,水野猛"

    第20回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1997.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  46. 大腸菌各様体タンパク質H-NSの機能ドメイン:二量体形成ドメインの同定とその機能的重要性

    "背戸千春,鈴木友美,上口智治,水野猛"

    第20回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1997.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  47. シロイヌナズナにおけるHPtドメインを持つ新規二成分制御系シグナル伝達因子の検索

    "鈴木友美,上口智治,水野猛"

    第20回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1997.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  48. Structure and function of the E. coli nucleoid protein H-NS. International conference

    EMBO workshop: Nucleoid-Associated proteins. 

     More details

    Event date: 1997.5

    Language:English  

    Camerino Italy

  49. シロイヌナズナにおけるバクテリア型情報伝達因子の取得と解析

    "梅田裕之,花木直人,今村綾,上口智治,水野猛"

    日本農芸化学会1997年度大会 

     More details

    Event date: 1997.4

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  50. シロイヌナズナにおける二成分制御系シグナル伝達因子の探索

    "上口智治,鈴木友美,梅田裕之,花木直人,水野猛"

    日本植物生理学会1997年度年会 

     More details

    Event date: 1997.3

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  51. 大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能ドメイン構造

    上口智治

    第13回染色体ワークショップ 

     More details

    Event date: 1996.1

    Language:Japanese  

  52. 大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能ドメイン解析

    "上口智治,鈴木友美,吉田孝行,水野猛"

    第18回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1995.12

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  53. ompF/ompC遺伝子発現における核様体タンパク質H-NSの役割

    "鈴木友美,上口智治,水野猛"

    第18回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 1995.12

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    Country:Japan  

  54. 大腸菌核様体タンパク質H-NSによる転写制御とストレス応答

    上口智治

    第10回朝霧シンポジウム 

     More details

    Event date: 1995.9

    Language:Japanese  

  55. 湾曲DNA結合タンパク質の構造と機能

    "上口智治, 水野猛"

    基礎生物学研究所研究会オルガネラDNA結合性タンパク質の構造と機能 

     More details

    Event date: 1995.1

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

  56. 大腸菌における栄養飢餓ストレス応答の制御機構

    上口智治

    ストレス応答の分子機構 

     More details

    Event date: 1995.1

    Language:Japanese  

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KAKENHI (Grants-in-Aid for Scientific Research) 24

  1. Quality control for plant gametogenesis

    Grant number:25440130  2013.4 - 2017.3

    Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    UEGUCHI CHIHARU

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\5200000 ( Direct Cost: \4000000 、 Indirect Cost:\1200000 )

    In monocarpic plants, it is observed that developing reproductive structures control whole-plant senescence, so-called global proliferative arrest (GPA). To identify genes involved in this process, we isolated and analyzed a mutant showing premature cessation of inflorescence growth in Arabidopsis. The mutant, named premature aging 1 (pma1), plants exhibited earlier cessation of floral bud formation and stem growth. In addition, pma1 showed premature cessation of leaf growth and earlier senescence. Map-based cloning revealed that pma1 is a missense allele of the CNGC20 gene encoding a cyclic nucleotide-gated cation channel. These results suggest that the maintenance of intracellular ionic homeostasis is important for the process of whole-plant senescence.

  2. 植物における新規な配偶子品質管理機構の解析

    2013.4 - 2016.3

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

    上口智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    顕花植物の生殖過程では、親世代の胞子体の役割は、単に受精可能な配偶子の形成に限定されるものではなく、受精後の接合子の胚発生過程にも積極的に関与する。本申請では後者に関わる全く新しい生命現象の分子機構の解析を提案する。申請者はシロイヌナズナ新規変異体の遺伝学的解析の途上で、雌雄いずれの配偶子も受精後に胚発生可能な性質(胚発生能)を親世代の胞子体が決定しており、これがDNA障害応答の一環であることを発見した。この新規生命現象は種の継続性を担保する重要な機構であると共に、種内のゲノムの多様性をもたらす可能性がある点で、進化的観点からも興味深い。本提案は、この新規生命現象の分子機構解明ならびにゲノム多様化の観点からの生物学的意義の解明を目的とする。

  3. Molecular analysis of plant genes involved in the maintenance of cell fate

    Grant number:22570038  2010 - 2012

    Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    UEGUCHI Chiharu

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\4550000 ( Direct Cost: \3500000 、 Indirect Cost:\1050000 )

    It is essential for plant growth and development to maintain the undifferentiated state of stem cells and the cell fate of differentiating cells. We identified a novel gene required for maintenance of undifferentiated state of stem cells through the reduction of DNA damage. We also found that the known gene has a novel function for proper progression of cell differentiation process. These results, thus, suggested novel mechanisms for the maintenance of plant cell fate.

  4. サイトカイニンによる高等植物の生長・分化の制御

    2002.4 - 2007.3

    科学研究費補助金  特定領域研究(A)(2)(計画),課題番号:14036215

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    科研費

  5. サイトカイニンによる高等植物の生長・分化の制御

    Grant number:14036215  2002 - 2006

    科学研究費助成事業  特定領域研究

    上口 智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\66700000 ( Direct Cost: \66700000 )

    シロイヌナズナサイトカイニン受容体遺伝子群(AHK2,AHK3,AHK4)の多重変異株は構成細胞数の低下に起因する顕著な綾性表現型を示す。この表現型の原因をさらに詳しく調べるために、CUC1過剰発現による異所的SAM形成のAHK遺伝子依存性の検討、ならびにahk多重変異株のトランスクリプトーム解析を行った。CUC1の過剰発現は子葉の向軸側に異所的なSAMを形成する。この過剰発現は外植片からの不定芽誘導もサイトカイニン依存的に活性化させる。ahk三重変異株におけるCUC1過剰発現の影響を調べたところ、頻度は低下するものの、異所的なSAM形成は阻害されなかった。このことからin vivoとin vitroにおける異所的なSAM形成の機構が完全に同じではない可能性が考えられる。ahk2 ahk3二重変異株およびahk三重変異株を対象にしたトランスクリプトーム解析では、これら変異株で特異的に発現が減少・増加する遺伝子としてそれぞれ約100種・60種の遺伝子を同定した。発現減少を示す遺伝子にはAタイプARRなどのサイトカイニン初期誘導遺伝子が含まれる。サイトカイニン生合成遺伝子の発現上昇と分解・不活化酵素遺伝子の発現低下は、シグナル伝達による内性ホルモン量の調節機構を示唆する。また主要熱ショックタンパク質遺伝子の発現が顕著に上昇しており、多重変異株がタンパク質の変性を伴う何らかのストレス状態に置かれていることを示している。多数のレドックス関連遺伝子の発現も影響されることから、サイトカイニンシグナルと細胞内酸化還元バランスの調節の関連性が示唆された。実際、ahk多重変異体は強光ストレスに対して顕著な耐性を示し、レドックスストレス応答が恒常的に引き起こされていると考えればよく理解できる。

  6. 植物の可塑的な生長・分化を支える分子機構

    2001.4 - 2006.3

    科学研究費補助金  特別推進研究

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

    科研費

  7. 高等植物のサイトカイニン応答におけるセンサーキナーゼファミリーの機能解析

    2001.4 - 2003.3

    科学研究費補助金  基盤研究(C)(2)(一般)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    科研費

  8. Molecular mechanism of flexible development and differentiation in plants

    Grant number:13CE2005  2001 - 2005

    Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for COE Research

    MATSUOKA Makoto, HATTORI Tsukaho, SAKAGAMI Youji, MAESHIMA Masayoshi, UOZUMI Nobuyuki, MIZUNO Takeshi

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

    ○Study on molecular mechanism of plant growth
    We identified a receptor of gibberellin (GA). which is an important growth phytohormone. The GAreceptor interacts with bioactive GAs at a reasonable concentration. The binding GA to the receptor induces the interaction between GID1 and a DELLA protein, which functions as a negative factor of GA signaling. Cytokinin is another growth phytohomone. We identified the three genes encoding cytokinin receptors and investigated their relevant in planta functions. We also revealed that a grain number in rice is controlled by the level of cytokinin in the floral meristems. Using the graining number gene, we increased the grain number of Koshihikari, the top rice leading variety of Japan. We identified a set of components (or genes), named PRRs, which play coordinately essential roles within (or dose to) the Arabidopsis circadian clock that is important for the control of the flowering time in plants. We also identified a receptor of plant peptide hormone, pktosulfokine, discovered by us.
    ○Study on molecular mechanism of plant response to physical environments.
    We found characteristic properties of five cation/H+ exchangers of rice. Ktr/HKTtype transporters were also found to be essential for the adaptation of plants and bacteria to salinity stress and high osmolality We also revealed that nitrate transporter genes are activated by multiple mechanisms involving nitrate and/or nitrite, and also that glutamine was shown to regulate nitrate transport activity at both the transcriptional and post-translational levels. For understanding of signal transduction of responses to hyperosmotic stress, we have identified an SnRK2 interacting protein that would function as a scaffold for signaling components.

  9. Functional analysis of a sensor kinase gene family implicated in cytokinin signaling in higher plants

    Grant number:13640644  2001 - 2002

    Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    UEGUCHI Chiharu

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\3500000 ( Direct Cost: \3500000 )

    We identified a set of structurally related genes, AHK2 3 and 4, each encoding a sensor histidine kinase in Arabidopsis thaliana. We identified a loss-of-function mutation of the AHK4 gene. The mutant exhibited the cytokinin-resistant phenotype not only in inhibition of root growth by cytokinin but also in greening and shoot induction of calli. Moreover, AHK4 expressed in budding yeast showed histidine kinase activity in a manner dependent on the presence of cytokinin. These results strongly suggested that AHK4 is involved in the cytokinin-signaling pathway, as a direct receptor. We then screened and isolated loss-of function mutations of the AHK2 and 3 genes. Two independent alleles of ahk3 mutations exhibited the cytokinin-insensitive phenotype in greening and shoot induction of calli, indicating that AHK3 is also a cytokinin receptor. Although two independent alleles of ahk2 showed normal growth and cytokinin sensitivity, the ahk2/ 3 double mutant exhibited semi-dwarf phenotype in the above-ground tissues. These results suggest that AHK2 and 3 also function as cytokinin receptors and that cytokinins act as positive regulators in cell division activity in vivo.

  10. 高等植物の分化成長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析

    Grant number:13017208  2001

    科学研究費助成事業  特定領域研究(A)

    上口 智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\3000000 ( Direct Cost: \3000000 )

    1.サイトカイニン受容体遺伝子群の機能解析 シュート部位で発現しているサイトカイニンレセプターの候補であるAHK2,3がいかなる部位で発現しているのかを組織及び細胞レベルで解析するために、AHK2,3とGUSならびにGFPの融合タンパク質を構築したしAHK3-GFP融合体の観察では、GFP活性は根・胚軸・子葉や本葉で認められる。根や胚軸においてはコルメラ細胞群や維管束で、若い本葉では特に葉縁部で、成熟葉では葉脈で発現しているものと考えられる。またGFPの蛍光は細胞の外縁を取り巻くように認められ、AHK3が細胞質膜に局在するという予測と一致する。
    AHK2,3両遺伝子のT-DNA挿入変異体の検索を行い、AHK2遺伝子については1ラインの、AHK3遺伝子については2ラインの挿入変異体を同定できた。AHK3変異体の二つのラインについてはホモ接合体を確立でき、胚軸から調整したカルスはサイトカイニンに対する感受性が低下していることを見出した。
    2.TCP遺伝子群の機能解析 サイトカイニンシグナル伝達に関与することが想定されているAHP遺伝子群(二成分制御系の信号仲介因子であるHPt因子をコードする)と物理的相互作用が可能な因子として、TCPドメインを持つ新規転写関連因子を見出し、TCP10と名付けた。この遺伝子のT-DNA挿入変異体は植物体のシュート部位において顕著な矮性を示すことを見出した。TCP10遺伝子の過剰生産体はそれとは逆に葉柄や胚軸が伸長する。さらにTCP10プロモーターとGUSの融合体を用いて発現部位の詳細な解析を行い、TCP10の発現は胚軸・本葉・花の花柱で認められ、花茎を除くと表現型が現れる部位との間には相関があることが判明した。

  11. 高等植物の分化成長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析

    Grant number:12037207  2000

    科学研究費助成事業  特定領域研究(A)

    上口 智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2800000 ( Direct Cost: \2800000 )

    1)シロイヌナズナから3種類の新規センサーキナーゼ遺伝子を分離して一次構造を確定し、これら遺伝子をAHK2,3,4(AHK=Arabidopsis histidine kinase)と名付けた。AHK遺伝子群は相互に高い相同性を示す遺伝子ファミリーを形成している。またAHK遺伝子群の発現を調べたところ、AHK4が根組織で特異的に発現していることがわかった。
    2)AHK4遺伝子にT-DNAが挿入された変異株を同定した。AHK4の発現が根組織特異的であることに注目した解析から、この変異株が植物ホルモンの一つであるサイトカイニンに対して非感受性を示すことを明らかにした。AHK4遺伝子を出芽酵母のセンサーキナーゼ変異株に導入したところ、各種サイトカイニン(BA,Kinetin,t-Zeatin)に依存的な生育を示し、AHK4がサイトカイニンの直接の受容体であり、リガンドとの結合がヒスチジンキナーゼ活性を正に制御することを明らかにした。。
    3)TCP10はTCP1などと同様に、側生器官の分化成長に直接関与すると考えられているトウモロコシのT〓1やキンギョソウのCYCと同じ構造を持つサブファミリーに属しており、機能的に重要であると考えられる。このサブファミリーに属するTCP遺伝子をシロイヌナズナのゲノムからさらに3種見出し、TCP11〜13と名付け、当サブファミリーに属する遺伝子群(TCP1,2,3,5,10,11,12,13)すべてのクローン化を終了でた。

  12. 高等植物の分化生長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析

    1999.1 - 2001.12

    科学研究費補助金  特定領域研究(A)(2)(公募)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    科研費

  13. 高等植物の分化成長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析

    Grant number:11163210  1999

    科学研究費助成事業  特定領域研究(A)

    上口 智治, 水野 猛

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\3000000 ( Direct Cost: \3000000 )

    1.二成分制御系遺伝子の検索と構造決定
    シロイヌナズナESTクローンバンクとゲノム情報の検索から、現在14種類のレスポンスレギュレーター遺伝子(ARR)、5種類のHPtメディエーター遺伝子(AHP)と3種類の新規センサーキナーゼ遺伝子(AHK)を確認し、cDNAレベルでの一次構造を確定した。ARRならびにAHP遺伝子群の発現解析を行い、いずれも根器官での発現が顕著であること、AタイプのARR遺伝子の発現は植物ホルモンのうち、サイトカイニンでのみ一過的に誘導されるがBタイプはそうではないことを見出した。
    2.ARR・AHPの分子機能
    1)Aタイプに属するARRタンパク質を精製し、大腸菌のHPt因子からリン酸基を受容できることを確認した。AHPタンパク質についても同様に、大腸菌のハイブリッドセンサーキナーゼからリン酸基を受容できること、ならびにそのリン酸基をARRタンパク質に転移できることを確認した。
    2)出芽酵母のHPt因子をコードするYPD1遺伝子の変異をAHP1が相補できることを証明した。この相補活性にはリン酸化部位であるヒスチジン残基が必須である。また出芽酵母のセンサーキナーゼをコードするSLN1遺伝子の変異はAHK3遺伝子によって相補されることも示した。この相補活性にも自己リン酸化部位のヒスチジン残基が必須である。以上の結果はARR,AHP,AHK各分子が二成分制御系の因子として機能しうることを示している。
    3.植物における機能解析
    1)酵母Two-hybrid法を用いてAHPと相互作用する植物の因子を検索した。その結果、AHP1〜3はBタイプのARR(ARR1,2,10)と、AHP2,3はそれらに加えてTCPドメインを持つ新規タンパク質と相互作用しうることを明らかにした。前者については酵母の系のみならず精製タンパク質のレベルで相互作用を確認し、相互作用がHPtドメインとARR1のレシーバードメイン間でなされることを明らかにした。さらにHPtからARR1へのリン酸基転移を証明した。後者のTCPドメインは最近注目されはじめた機能ドメインで、側芽の成長や花器官の対象性に関与する遺伝子の例が知られている。
    2)かずさDNA研究所との共同研究により、AHP、AHKおよびTCP遺伝子のノックアウト変異株の検索に着手した。

  14. 大腸菌核様体タンパク質H-NSによる新規な遺伝子発現調節機構の解析

    1997.1 - 1998.12

    科学研究費補助金  基盤研究(C)(2)(一般)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    科研費

  15. Regulatory mechanism of gene expression by Escherichio coli nucleoid protein H-NS

    Grant number:09680671  1997 - 1998

    Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    UEGUCHI Chiharu

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\3200000 ( Direct Cost: \3200000 )

    The Escherichia coil H-NS protein is one of the major constituents of the nucleoid structure. This protein has been implicated not only in the compact organization of the nucleoid structure, but also in the global regulation of gene expression. In this study, on systematic mutational analysis of hns, three distinct functional domains were found in H-NS, which appear to be responsible for DNA-binding, transcriptional repression and dimerization, respectively. Mutations in the C-terminal domain resulted in a loss of its DNA-binding ability, suggesting that this domain is directly involved in its binding to DNA.The N-terminal domain was suggested to be involved in the ability to repress transcription. The relatively central portion of H-NS was found to be involved in protein-protein interaction, especially dimerization. The functional significance for each domain was also clarified. In addition, expression of the bgl operon was found to be affected by only a subset of hns mutations in a highly allele-specific manner. This finding is also addressed with regard to a unique regulatory mechanism (i.e. silencing) for the bgl operon, which is partly mediated by H-NS.
    The Escherichia coli bgl operon is of interest since its expression is silent (phenotypically Bgl^-), at least under standard laboratory conditions. To identify a trans-acting factor(s) that is presumably relevant to the regulation of bgl, I screened mutants exhibiting Bgl+ phenotype. By a random insertion mutagenesis with mini-Tn10, a novel type of mutation was obtained. In this case, the insertion mutation was found to be just in front of the leuO gene encoding a putative LysR-like DNA-binding protein. Genetic analyses revealed that an overproduction of LeuO in the wild-type cells causes the phenotype of Bgl^+.

  16. 大腸菌定常期特異的シグマ因子の発現/活性制御機構の解析

    1996.1 - 1996.12

    科学研究費補助金  基盤研究(C)(2)(一般)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    科研費

  17. 大腸菌定常期特異的シグマ因子の発現/活性制御機構の解析

    Grant number:08680738  1996

    科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    上口 智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2600000 ( Direct Cost: \2600000 )

    I.定常期特異的シグマ因子の発現制御機構の解析
    1)δSの発現に関わる正の制御因子を検索する目的で、δSが脱抑制されるhns変異株中でもその発現が低下するような変異株を分離した。sirA(sigma S regulation)と名付けたこの変異株中では、δSの転写や翻訳効率には変化がないものの、産物が不安定化することでその発現量に異常が生じたものであることを明らかにした。変異のマッピングとクローン化により、sirA遺伝子をクローン化した。しかしhns変異を含まない野生型大腸菌にsirA変異を導入したところ、δSの発現には顕著な異常は観察されず、δS発現におけるsirA変異の影響はhns変異株という特殊な遺伝子型に限って現れる現象であると結論できる。ところでsirAの欠失変異を新たに構築したところ、その変異株はrich medium sensitivityと細胞の異常な伸長という表現型を示した。このことはSirAは本来細胞分裂に関係する機能を持つ蛋白質であることを示唆する。
    2)エネルギー代謝における中間産物であるアセチルリン酸がδSの発現調節において負の制御因子であることを示唆するデータを得た。δS発現の負の制御因子として、最近二成分制御系のレギュレーターであるRssBが同定されている。アセチルリン酸は他のレギュレーター蛋白質をリン酸化しうる低分子であることを考慮すると、アセチルリン酸がRssBの制御因子として機能する可能性が考えられ、現在解析中である。
    II.グローバルリプレッサーH-NSの機能ドメインの解析
    グローバルな転写抑制因子であるH-NSの作用メカニズム解明のため、変異解析による機能ドメインの解析を行った。H-NS制御下にあるプロモーターの転写を指標として多数のhns変異株を取得し、遺伝学的・生化学的解析を行い、H-NSのN末端・中央部・C末端領域に転写抑制・オリゴマー化・DNA結合ドメインがそれぞれ局在することを立証した。

  18. 栄養飢餓ストレス応答における大腸菌DnaJシャペロンのアナログCbpAの分子機能

    1995.1 - 1995.12

    科学研究費補助金  特定領域研究(A)(2)(公募)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    科研費

  19. 翻訳段階での遺伝子発現制御機構における大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能解析

    1995.1 - 1995.12

    科学研究費補助金  基盤研究(C)(2)(一般)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    科研費

  20. 栄養飢餓ストレスにおける大腸菌DnaJシャペロンのアナログCbpAの分子機能

    Grant number:07253209  1995

    科学研究費助成事業  重点領域研究

    上口 智治, 水野 猛

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2000000 ( Direct Cost: \2000000 )

    I.DnaJアナログであるCbpAの機能解析
    1)cbpAの欠失変異を構築し、その表現型を解析した。cbpAの単独変異は野生株同様の良好な生育を見せるが、cbpA/dnaJ二重変異株は生育可能温度領域が著しく狭く、高温感受性に加えて低温感受性を示す。さらにこの二重変異株は、セプタム形成異常に伴う細胞の伸張や、栄養源枯渇(炭素源)における生存率の低下などの表現型を示した。こうした表現型はdnaK欠失変異に特徴的に観察されるものと一致しており、CbpAとDnaJはDnaKと協調的に働くことで機能することを示唆している。
    2)cbpA/dnaJ二重変異株の低温感受性を抑制する多コピーサプレッサーを分離したところ、rpoD遺伝子を得た。これは二重変異の示す低温感受性が熱ショックタンパク質の過剰生産によるものであり、主要シグマ因子の増産によってそれが競争的に阻害されるためであると解釈できる。
    II.栄養飢餓ストレス応答機構の解明
    1)栄養飢餓ストレス応答の正の制御因子であるシグマ因子(シグマS)の発現制御にH-NSが負の調節因子として機能していることを見いだした。H-NSは栄養豊富な環境ではシグマSの翻訳を抑え、またシグマSタンパク質の不安定化を引き起こす。hns変異株中ではシグマSの脱抑制が起こり、細胞は対数増殖期においてもあたかも栄養飢餓状態にあるような生理状態にあることを見いだした。従ってH-NSは、利用可能な栄養環境に応答して細胞の生理的状態をスイッチする機能のキ-分子であると考えられる。
    2)シグマSの発現に関わる他の因子を検索し、一つの候補遺伝子を得た。

  21. 翻訳段階での遺伝子発現制御機構における大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能解析

    Grant number:07680735  1995

    科学研究費助成事業  一般研究(C)

    上口 智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2500000 ( Direct Cost: \2500000 )

    I.核様体タンパク質H-NSの機能ドメイン解析
    H-NSによってその転写が抑制されているpeoUオペロンの発現を指標にして、25種類のhns変異を分離した。このうち20種類のミスセンス変異はH-NS上で大きく3つの領域(N末端領域、C末端側2つの領域)に集中した。精製した変異タンパク質について生化学的解析を行ったところ、C末端側ドメインはDNAとの結合に、N末端側ドメインは転写抑制機能に必要な領域であることが示唆された。H-NSはホモダイマーを形成して機能することが知られているが、ダイマー形成にはN末端側2/3が必要十分であり、おそらくH-NSの中央部ドメインがそれに関与するのではないかと推測された。
    II.栄養飢餓ストレス応答機構の解明
    1)栄養飢餓ストレス応答の正の制御因子であるシグマ因子(シグマS)の発現制御にH-NSが負の調節因子として機能していることを見いだした。H-NSは栄養豊富な環境ではシグマSの翻訳を抑え、またシグマSタンパク質の不安定化を引き起こす。hns変異株中ではシグマSの脱抑制が起こり、細胞は対数増殖期においてもあたかも栄養飢餓状態にあるような生理状態にあることを見いだした。従ってH-NSは、利用可能な栄養環境に応答して細胞の生理的状態をスイッチする機構のキ-分子であると考えられる。
    2)シグマSの発現に関わる他の因子を検索し、一つの候補遺伝子を得た。

  22. 大腸菌分子シャペロンDnaJの構造的/機能的アナログ:cbpA蛋白質の分子機能

    Grant number:06261217  1994

    科学研究費助成事業  重点領域研究

    上口 智治, 水野 猛

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\1800000 ( Direct Cost: \1800000 )

    I.DnaJアナログであるCbpAの機能解析
    1)cbpA欠失変異株を構築し、その表現型を調べた。cbpAの単独欠失変異は野生株とほとんど変わらない生育を見せるが、cbpA/dnaJ二重変異株は生育温度領域が著しく狭い、セプタム形成の異常に伴う細胞の伸長、炭素源枯渇に伴う生存率の低下等の表現型が観察された。従ってCbpAはDnaJと同様の生理的機能を保持していると考えられる。
    2)cbpAの転写が増殖定常期やリン酸源の枯渇に誘導されることを見いだした。このことは抗CbpA抗体を用いた免疫ブロティング法でも確認された。この誘導は栄養飢餓ストレス特異的なシグマ因子であるσ^Sに依存する。このことから大腸菌は2種類のDnaJ様シャペロンをストレスの種類に応じて使い分けているのではないかと推測した。
    II.栄養飢餓ストレス応答の分子機構
    cbpAの発現調節を解析する中で、σ^Sの発現調節に大腸菌核様体タンパク質H-NSが深く関与していることを明らかにした。詳細な解析の結果、H-NSはσ^Sの翻訳と産物の安定性の両段階を負に調節することで、栄養飢餓に応答した発現を保証していることが分かった。栄養飢餓ストレス応答は、近年多くの研究者が関心を寄せている研究分野であり、σ^Sの発現制御機構の解明はその中でも中心的課題となっている。我々の研究結果は当該分野の進展に重要な寄与をなしたといえる。

  23. 環境応答機構における大腸菌湾曲DNA結合タンパク質の機能解析

    Grant number:06680665  1994

    科学研究費助成事業  一般研究(C)

    上口 智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2100000 ( Direct Cost: \2100000 )

    I. 湾曲DNA結合タンパク質H-NSの機能解析
    1)H-NSによって負の転写制御を受けるproUオペロンの脱抑制を指標にして、hns遺伝子に起きた20種類のミスセンス変異と5種類のナンセンス変異を分離した。hns変異の示す多面的な表現型をもとにして、これらの変異が4つのクラスに分類できることを明らかにした。ミスセンス変異はhns遺伝子上で大きく3つの領域(N末端領域、C末端側2つの領域)にかたまって分離され、それぞれ表現系の示すクラスと相関が認められる。生化学的解析から、H-NSのDNAとの結合にはC末端側が関与していることが示唆された。共同研究(東京薬科大学;神藤助教授、)によって明らかにされたH-NSのC末端側の高次構造と照らしあわせることで、H-NSのDNAとの結合にはC末端側のループ構造が重要な役割を果すことが示唆された。
    2)栄養飢餓ストレス応答の正の調節因子であるo^Sの発現をH-NSが負に制御するという新しい現象を明らかにした。これは転写段階ではなく、翻訳と翻訳産物の安定性制御の各段階をH-NSが負に制御することで行われている。
    II DnaJアナログであるCbpAの機能解析
    1)cbpA欠失変異株を構築し、その表現型を調べた。cbpAの単独欠失変異は野生株とほとんど変らない生育を見せるが、cbpA/dnaJ二重変異株は生育温度領域が著しく狭い、セプタム形成の異常に伴う細胞の伸長、炭素源枯渇に伴う生存率の低下等の表現型が観察された。従ってCbpAはDnaJと同様の生理的機能を保持していると考えられる。
    2)CbpAの発現がo^S依存的に栄養飢餓ストレスに応答することを見いだした。このことから大腸菌は2種類のDnaJ様シャペロンをストレスの種類に応じて使い分けているのではないかと推測した。

  24. 湾曲DNA構造とその結合タンパク質の分子機能解析

    Grant number:05680590  1993

    科学研究費助成事業  一般研究(C)

    上口 智治

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2100000 ( Direct Cost: \2100000 )

    1.大腸菌湾曲DNA結合タンパク質H-NSの機能解析
    (1)H-NSによって負の転写制御を受けるproUオペロンの脱抑制を指標にして、hns遺伝子に起きた20種類のミスセンス変異と5種類のナンセンス変異を分離した。hns変異の示す多面的な表現型をもとにして、これらの変異が5つのクラスに分類できることが分かった。代表的な変異については変異H-NSの精製を行い、生化学的解析を行いつつある。既に予備的な解析から、DNAへの結合にはN末端約2/3があればよいが、C末端側の変異によってDNA結合能の低下をきたすことが分かっている。また殆の変異はC末端側に集中していたが、β-グリコシドの資化性に変化をきたす変異のみはN末端側に起きるという興味深い結果を得ている。
    (2)培地pHによって制御を受けるグルタミン酸デカルボキシラーゼの発現が、中性pH領域ではH-NSによって強く抑制されることを見いだした。
    2.新たに見いだした大腸菌湾曲DNA結合タンパク質CbpAとCbpBの解析
    (1)CbpAをコードする遺伝子cbpAをクローン化し、遺伝子構造を明かにした。CbpAの一次構造は大腸菌の分子シャペロンであるDnaJと高い相同性をもち、分子遺伝学的解析からDnaJと同じ機能をもつ、構造的/機能的アナログであると結論した。大腸菌において、同一機能をもつ複数の分子シャペロンが見いだされたのはこれがはじめてであり、当該分野の研究において重要な発見であるといえる。
    (2)CbpBはKornbergらによって、大腸菌oriC領域に結合するタンパク質として見いだされたRobタンパク質と同一であることを証明した。更にcbpB遺伝子の発現を解析したところ、cbpBは定常期特異的なシグマ因子であるRpoSによって、生育定常期並びに炭素源やリン酸源の枯渇に伴ってその発現が誘導されることを見いだした。
    3.分裂酵母における湾曲DNA結合タンパク質の解析
    分裂酵母から湾曲DNAに対して優先的に結合する分子量43kDのタンパク質を精製し、遺伝子構造を明かにした。四分子解析を行ったところ、この遺伝子は生育には必須ではないことが分かった。現在欠失変異株の表現型解析を行っている。

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Teaching Experience (On-campus) 29

  1. Plant Developmental Biology

    2021

  2. The World of Genes

    2021

  3. Plant Physiology 1

    2021

  4. Applied Plant Molecular Biology

    2021

  5. Applied Plant Molecular Biology

    2021

  6. Plant Physiology 1

    2021

  7. The World of Genes

    2020

  8. Applied Plant Molecular Biology

    2020

  9. Plant Physiology 1

    2020

  10. Applied Plant Molecular Biology

    2020

  11. Plant Physiology 1

    2020

  12. 植物発生学特論

    2020

  13. 応用生命科学実験実習2

    2020

  14. 遺伝子の世界

    2014

  15. 植物機能学I

    2014

  16. 植物機能学I

    2013

  17. 遺伝子の世界

    2013

  18. 植物機能学1

    2012

  19. 遺伝子の世界

    2012

  20. The World of Genes

    2011

  21. 植物機能学1

    2011

  22. 遺伝子の世界

    2010

  23. 植物機能学1

    2010

  24. 遺伝子の世界

    2008

  25. 植物機能学1

    2008

  26. 遺伝子の世界

    2006

  27. 植物機能学1

    2006

  28. 遺伝子の世界

    2005

  29. 植物機能学1

    2005

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Social Contribution 2

  1. 科学技術と生活

    Role(s):Lecturer

    特定非営利活動法人「学習障害児・者の教育と自立の保障をすすめる会」  2022.10 - 2023.1

  2. 科学技術と生活

    Role(s):Lecturer

    特定非営利活動法人「学習障害児・者の教育と自立の保障をすすめる会」  2021.10 - 2022.1