Updated on 2024/04/02
Doctor of Science （ Kyoto University ）
Others / Others / Science@Biology@Plant Physiology
Others / Others / Interdisciprinary Area@Basic Biology@Molecular Biology
高等植物の分化・生長に関わる分子メカニズムの解明
Signal transduction in higher plant
Associate Professor
2007.4
Country：Japan
生物分子応答研究センター 助教授
2000.7
Country：Japan
名古屋大学農学部 助手
1991.4 - 2000.6
Country：Japan
Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences
Kyoto University Graduate School, Division of Natural Science
- 1991
Country： Japan
Kyoto University Faculty of Science
- 1986
Country： Japan
日本植物生理学会 幹事
2000.4 - 2002.3
日本植物生理学会
日本分子生物学会
日本生化学会
Enhancement of meristem formation by bouquet-1, a mis-sense allele of the vernalization independence 3 gene encoding a WD40 repeat protein in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Takagi N, Ueguchi C
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms Vol. 17 ( 12 ) page： 982 - 93 2012.12
The Arabidopsis MERISTEM DISORGANIZATION 1 gene is required for the maintenance of stem cells through the reduction of DNA damage. Reviewed
Yuma Hashimura and Chiharu Ueguchi
The Plant Journal Vol. 68 ( 4 ) page： 657 - 69 2011.11
RNA interference of the Arabidopsis putative transcription factor TCP16 gene results in abortion of early pollen development. Reviewed
Takeda T, Amano K, Ohto MA, Nakamura K, Sato S, Kato T, Tabata S, Ueguchi C
Plant molecular biology Vol. 61 ( 1-2 ) page： 165 - 77 2006.5
Histidine kinase homologs that act as cytokinin receptors possess overlapping functions in the regulation of shoot and root growth in Arabidopsis. Reviewed
Nishimura C, Ohashi Y, Sato S, Kato T, Tabata S, Ueguchi C
The Plant cell Vol. 16 ( 6 ) page： 1365 - 77 2004.6
The OsTB1 gene negatively regulates lateral branching in rice. Reviewed
Takeda T, Suwa Y, Suzuki M, Kitano H, Ueguchi-Tanaka M, Ashikari M, Matsuoka M, Ueguchi C
The Plant journal : for cell and molecular biology Vol. 33 ( 3 ) page： 513 - 20 2003.2
The AHK4 gene involved in the cytokinin-signaling pathway as a direct receptor molecule in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Ueguchi C, Sato S, Kato T, Tabata S
Plant & cell physiology Vol. 42 ( 7 ) page： 751 - 5 2001.7
Escherichia coli ribosome-associated protein SRA, whose copy number increases during stationary phase. Reviewed
Izutsu K, Wada C, Komine Y, Sako T, Ueguchi C, Nakura S, Wada A
Journal of bacteriology Vol. 183 ( 9 ) page： 2765 - 73 2001.5
Novel family of sensor histidine kinase genes in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Ueguchi C, Koizumi H, Suzuki T, Mizuno T
Plant & cell physiology Vol. 42 ( 2 ) page： 231 - 5 2001.2
Two types of putative nuclear factors that physically interact with histidine-containing phosphotransfer (Hpt) domains, signaling mediators in His-to-Asp phosphorelay, in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Suzuki T, Sakurai K, Ueguchi C, Mizuno T
Plant & cell physiology Vol. 42 ( 1 ) page： 37 - 45 2001.1
Negative control of rpoS expression by phosphoenolpyruvate: carbohydrate phosphotransferase system in Escherichia coli. Reviewed
Ueguchi C, Misonou N, Mizuno T
Journal of bacteriology Vol. 183 ( 2 ) page： 520 - 7 2001.1
Compilation and characterization of histidine-containing phosphotransmitters implicated in His-to-Asp phosphorelay in plants: AHP signal transducers of Arabidopsis thaliana. Reviewed
Suzuki T, Sakurai K, Imamura A, Nakamura A, Ueguchi C, Mizuno T
Bioscience, biotechnology, and biochemistry Vol. 64 ( 11 ) page： 2486 - 9 2000.11
Genes encoding pseudo-response regulators: insight into His-to-Asp phosphorelay and circadian rhythm in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Makino S, Kiba T, Imamura A, Hanaki N, Nakamura A, Suzuki T, Taniguchi M, Ueguchi C, Sugiyama T, Mizuno T
Plant & cell physiology Vol. 41 ( 6 ) page： 791 - 803 2000.6
rpoS function is essential for bgl silencing caused by C-terminally truncated H-NS in Escherichia coli. Reviewed
Ohta T, Ueguchi C, Mizuno T
Journal of bacteriology Vol. 181 ( 20 ) page： 6278 - 83 1999.10
Biochemical characterization of a putative cytokinin-responsive His-kinase, CKI1, from Arabidopsis thaliana. Reviewed
Nakamura A, Kakimoto T, Imamura A, Suzuki T, Ueguchi C, Mizuno T
Bioscience, biotechnology, and biochemistry Vol. 63 ( 9 ) page： 1627 - 30 1999.9
Differential expression of genes for response regulators in response to cytokinins and nitrate in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Kiba T, Taniguchi M, Imamura A, Ueguchi C, Mizuno T, Sugiyama T
Plant & cell physiology Vol. 40 ( 7 ) page： 767 - 71 1999.7
Compilation and characterization of Arabidopsis thaliana response regulators implicated in His-Asp phosphorelay signal transduction. Reviewed
Imamura A, Hanaki N, Nakamura A, Suzuki T, Taniguchi M, Kiba T, Ueguchi C, Sugiyama T, Mizuno T
Plant & cell physiology Vol. 40 ( 7 ) page： 733 - 42 1999.7
Histidine-containing phosphotransfer (HPt) signal transducers implicated in His-to-Asp phosphorelay in Arabidopsis. Reviewed
Suzuki T, Imamura A, Ueguchi C, Mizuno T
Plant & cell physiology Vol. 39 ( 12 ) page： 1258 - 68 1998.12
An Arabidopsis protein that interacts with the cytokinin-inducible response regulator, ARR4, implicated in the His-Asp phosphorylay signal transduction. Reviewed
Yamada H, Hanaki N, Imamura A, Ueguchi C, Mizuno T
FEBS letters Vol. 436 ( 1 ) page： 76 - 80 1998.9
Expression of Arabidopsis response regulator homologs is induced by cytokinins and nitrate. Reviewed
Taniguchi M, Kiba T, Sakakibara H, Ueguchi C, Mizuno T, Sugiyama T
FEBS letters Vol. 429 ( 3 ) page： 259 - 62 1998.6
The yhhP gene encoding a small ubiquitous protein is fundamental for normal cell growth of Escherichia coli. Reviewed
Yamashino T, Isomura M, Ueguchi C, Mizuno T
Journal of bacteriology Vol. 180 ( 8 ) page： 2257 - 61 1998.4
Response regulators implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis. Reviewed
Imamura A, Hanaki N, Umeda H, Nakamura A, Suzuki T, Ueguchi C, Mizuno T
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America Vol. 95 ( 5 ) page： 2691 - 6 1998.3
The leuO gene product has a latent ability to relieve bgl silencing in Escherichia coli. Reviewed
Ueguchi C, Ohta T, Seto C, Suzuki T, Mizuno T
Journal of bacteriology Vol. 180 ( 1 ) page： 190 - 3 1998.1
Cloning of a cDNA encoding a putative metal-transporting P-type ATPase from Arabidopsis thaliana. Reviewed
Tabata K, Kashiwagi S, Mori H, Ueguchi C, Mizuno T
Biochimica et biophysica acta Vol. 1326 ( 1 ) page： 1 - 6 1997.5
Systematic mutational analysis revealing the functional domain organization of Escherichia coli nucleoid protein H-NS. Reviewed
Ueguchi C, Suzuki T, Yoshida T, Tanaka K, Mizuno T
Journal of molecular biology Vol. 263 ( 2 ) page： 149 - 62 1996.10
H-NS regulates OmpF expression through micF antisense RNA in Escherichia coli. Reviewed
Suzuki T, Ueguchi C, Mizuno T
Journal of bacteriology Vol. 178 ( 12 ) page： 3650 - 3 1996.6
The rpoD gene functions as a multicopy suppressor for mutations in the chaperones, CbpA, DnaJ and DnaK, in Escherichia coli. Reviewed
Shiozawa T, Ueguchi C, Mizuno T
FEMS microbiology letters Vol. 138 ( 2-3 ) page： 245 - 50 1996.5
Purification of H-NS protein and its regulatory effect on transcription in vitro. Reviewed
Ueguchi C, Mizuno T
Methods in enzymology Vol. 274 page： 271 - 6 1996
An Escherichia coli curved DNA-binding protein whose expression is affected by the stationary phase-specific sigma factor sigma S. Reviewed
Kakeda M, Ueguchi C, Yamada H, Mizuno T
Molecular & general genetics : MGG Vol. 248 ( 5 ) page： 629 - 34 1995.9
A study of the double mutation of dnaJ and cbpA, whose gene products function as molecular chaperones in Escherichia coli. Reviewed
Ueguchi C, Shiozawa T, Kakeda M, Yamada H, Mizuno T
Journal of bacteriology Vol. 177 ( 13 ) page： 3894 - 6 1995.7
Quantitative control of the stationary phase-specific sigma factor, sigma S, in Escherichia coli: involvement of the nucleoid protein H-NS. Reviewed
Yamashino T, Ueguchi C, Mizuno T
The EMBO journal Vol. 14 ( 3 ) page： 594 - 602 1995.2
An analogue of the DnaJ molecular chaperone whose expression is controlled by sigma s during the stationary phase and phosphate starvation in Escherichia coli. Reviewed
Yamashino T, Kakeda M, Ueguchi C, Mizuno T
Molecular microbiology Vol. 13 ( 3 ) page： 475 - 83 1994.8
A fission yeast gene encoding a protein that preferentially associates with curved DNA. Reviewed
Yamada H, Mori H, Momoi H, Nakagawa Y, Ueguchi C, Mizuno T
Yeast (Chichester, England) Vol. 10 ( 7 ) page： 883 - 94 1994.7
Importance of stereospecific positioning of the upstream cis-acting DNA element containing a curved DNA structure for the functioning of the Escherichia coli proV promoter. Reviewed
Tanaka K, Ueguchi C, Mizuno T
Bioscience, biotechnology, and biochemistry Vol. 58 ( 6 ) page： 1097 - 1101 1994.6
An analogue of the DnaJ molecular chaperone in Escherichia coli. Reviewed
Ueguchi C, Kakeda M, Yamada H, Mizuno T
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America Vol. 91 ( 3 ) page： 1054 - 8 1994.2
Physical map location of a set of Escherichia coli genes (hde) whose expression is affected by the nucleoid protein H-NS. Reviewed
Yoshida T, Ueguchi C, Mizuno T
Journal of bacteriology Vol. 175 ( 23 ) page： 7747 - 8 1993.12
Sequence of a fission yeast gene encoding a protein with extensive homology to eukaryotic elongation factor-1 gamma. Reviewed
Momoi H, Yamada H, Ueguchi C, Mizuno T
Gene Vol. 134 ( 1 ) page： 119 - 22 1993.11
Expression of the Escherichia coli dimorphic glutamic acid decarboxylases is regulated by the nucleoid protein H-NS. Reviewed
Yoshida T, Yamashino T, Ueguchi C, Mizuno T
Bioscience, biotechnology, and biochemistry Vol. 57 ( 9 ) page： 1568 - 9 1993.9
The Escherichia coli nucleoid protein H-NS functions directly as a transcriptional repressor. Reviewed
Ueguchi C, Mizuno T
The EMBO journal Vol. 12 ( 3 ) page： 1039 - 46 1993.3
Function of the Escherichia coli nucleoid protein, H-NS: molecular analysis of a subset of proteins whose expression is enhanced in a hns deletion mutant. Reviewed
Yoshida T, Ueguchi C, Yamada H, Mizuno T
Molecular & general genetics : MGG Vol. 237 ( 1-2 ) page： 113 - 22 1993.2
Autoregulatory expression of the Escherichia coli hns gene encoding a nucleoid protein: H-NS functions as a repressor of its own transcription. Reviewed
Ueguchi C, Kakeda M, Mizuno T
Molecular & general genetics : MGG Vol. 236 ( 2-3 ) page： 171 - 8 1993.1
Insertional disruption of the nusB (ssyB) gene leads to cold-sensitive growth of Escherichia coli and suppression of the secY24 mutation. Reviewed
Taura T, Ueguchi C, Shiba K, Ito K
Molecular & general genetics : MGG Vol. 234 ( 3 ) page： 429 - 32 1992.9
[Structure and function of sequence directed DNA curvature]. Reviewed
Ueguchi C, Mizuno T
Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme Vol. 37 ( 10 ) page： 1631 - 40 1992.8
Multicopy suppression: an approach to understanding intracellular functioning of the protein export system. Reviewed
Ueguchi C, Ito K
Journal of bacteriology Vol. 174 ( 5 ) page： 1454 - 61 1992.3
[The sec genes of Escherichia coli]. Reviewed
Ueguchi C, Ito K
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society Vol. 63 ( 4 ) page： 293 - 8 1991.4
Characterization of cold-sensitive secY mutants of Escherichia coli. Reviewed
Baba T, Jacq A, Brickman E, Beckwith J, Taura T, Ueguchi C, Akiyama Y, Ito K
Journal of bacteriology Vol. 172 ( 12 ) page： 7005 - 10 1990.12
Escherichia coli sec mutants accumulate a processed immature form of maltose-binding protein (MBP), a late-phase intermediate in MBP export. Reviewed
Ueguchi C, Ito K
Journal of bacteriology Vol. 172 ( 10 ) page： 5643 - 9 1990.10
Effects of mutations in heat-shock genes groES and groEL on protein export in Escherichia coli. Reviewed
Kusukawa N, Yura T, Ueguchi C, Akiyama Y, Ito K
The EMBO journal Vol. 8 ( 11 ) page： 3517 - 21 1989.11
The secY-rpmJ region of the spc ribosomal protein operon in Escherichia coli: structural alterations affecting secY expression. Reviewed
Ueguchi C, Wittekind M, Nomura M, Akiyama Y, Ito K
Molecular & general genetics : MGG Vol. 217 ( 1 ) page： 1 - 5 1989.5
Enhancement of meristem formation by bouquet-1, a mis-sense allele of the VERNALIZATION INDEPENDENCE 3 gene encoding a WD40 repeat protein in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Naoto Takagi and Chiharu Ueguchi
Genes to Cells 2012.12
Cytokinin receptors are required for normal development of auxin-transporting vascular tissues in the hypocotyl but not in adventitious roots. Reviewed
Kuroha, T., Ueguchi, C., Sakakibara, H. and Satoh, S.
Vol. 47 page： 234-243 2006
RNA interference of the Arabidopsis putative transcription factor TCP16 gene results in abortion of early pollen development. Reviewed
Takeda, T., Amano, K., Ohto, M., Nakamura, K., Sato, S., Tabata, S. and Ueguchi, C.
Plant Molecular Biology Vol. 61 page： 165-177 2006
*Histidine kinase homologs that act as cytokinin receptors possess overlapping functions in the regulation of shoot and root growth in Arabidopsis. Reviewed
Nishimura C., Ohashi Y., Sato S., Kato T., Tabata S. and Ueguchi C.
The Plant Cell Vol. 16 page： 1365-1377 2004
サイトカイニンシグナル伝達の分子機構と生物学的機能
上口智治
蛋白質 核酸 酵素 Vol. 49 ( 16 ) page： 2549ー2557 2004
*The OsTB1 gene negatively regulates lateral branching in rice Reviewed
Takeda T., Suwa Y., Suzuki M., Kitano H., Ueguchi-Tanaka M., Ashikari M., Matsuoka M. and Ueguchi C.
The Plant Journal Vol. 33 page： 513-520 2003
二成分制御系
上口智治
蛋白質核酸酵素増刊号「植物の形作り」 Vol. 47 page： 1711ー1716 2002.9
Negative control of rpoS expression by phosphoenolpyruvate: carbohydrate phosphotransferase system (PEP: PTS) in Escherichia coli Reviewed
Ueguchi C., Misonou N. and Mizuno T.
Journal of bacteriology Vol. 183 page： 520-527 2001
*The AHK4 gene involved in the cytokinin-signaling pathway as a direct receptor molecule in Arabidopsis thaliana Reviewed
Ueguchi C., Sato S., Kato T. and Tabata S.
Plant and Cell Physiology Vol. 42 page： 751-755 2001
LeuO expression in response to starvation for branched-chain amino acids Reviewed
Majumder, A., Fang, M., Tsai, K-J., Ueguchi, C., Mizuno, T., and Wu, H-Y.
Journal of Biological Chemistry Vol. 276 page： 19046-19051 2001
Escherichia coli ribosome-associated protein SRA, which increases during stationary phase Reviewed
Izutsu, K., Wada, C., Komine, Y., Sako, T., Ueguchi, C., Nakura, S., and Wada, A.
Journal of Bacteriology Vol. 183 page： 2765-2773 2001
Novel family of sensor histidine kinase genes in Arabidopsis thaliana
Ueguchi C., Koizumi H., Suzuki T. and Mizuno T.
Plant and Cell Physiology Vol. 42 page： 231-235 2001
Two types of putative nuclear factors that physically interact with histidine-containing phosphotransfer (HPt) domains, signaling mediators in His-to-Asp phosphorelay, in Arabidopsis thaliana
Suzuki T., Sakurai K., Ueguchi C. and Mizuno T.
Plant and Cell Physiology Vol. 42 page： 37-45 2001
Genes encoding pseudo-response regulators: insight into His-to-Asp phosphorelay and circadian rhythm in Arabidopsis thaliana Reviewed
Makino S., Kiba T., Imamura A., Hanaki N., Nakamura A., Suzuki T., Taniguchi M., Ueguchi C., Sugiyama T. and Mizuno T
Plant and Cell Physiology Vol. 41 page： 791-803 2000
Compliation and characterization of histidine-containing phosphotransmitters implicated in His-to-Asp phosphorelay in plants: AHP signal transducers of Arabidopsis thaliana Reviewed
Suzuki T, Sakurai K, Imamura A, Nakamura A, Ueguchi C, Mizuno T
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry Vol. 64 page： 2486-2489 2000
"Biochemical characterization of a putative cytokinin-responsive His-kinase, CKI1, from Arabidopsis thaliana" Reviewed
Nakamura A. Kakimoto T. Imamura A. Suzuki T. Ueguchi C. Mizuno T.
Biosci. Biotech. Biochem. Vol. 63 page： 1627-1630 1999.9
Differential expression of genes for response regulators in response to cytokinins and nitrate in Arabidopsis thaliana. Reviewed
Kiba T. Taniguchi M. Imamura A. Ueguchi C. Mizuno T. Sugiyama T.
Plant & Cell Physiology Vol. 40 page： 767-771 1999.7
Compilation and charalterization of Arobidopsis thaliana response regulatovs implicated in His-Asp phosphoralay signal transduction. Reviewed
Imamura A., Hanaki N., Nakamura A., Suzuki T., Taniguchi M., Kiba T., Ueguchi C., Sugiyama T. and Mizuno T.
Plant and Cell Physiology Vol. 40 page： 733-742 1999
rpoS function is essential for bgl silencing caused by C-terminally truncated H-NS in Escherichia coli Reviewed
Ohta T., Ueguchi C. and Mizuno T.
Journal of Bacteriology Vol. 181 page： 6278-6283 1999
Identification of the DNA binding surface of H-NS protein from Escherichia coli by heteronuclear NMR spectroscopy Reviewed
Shindo H., Ohnuki A., Ginba H., Katoh E., Ueguchi C., Mizuno T. and Yamazaki T.
FEBS Letters Vol. 455 page： 63-69 1999
Histidine-containing phosphotransfer (HPt) signal transducers implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis.
"Suzuki T., Imamura A., Ueguchi C. and Mizuno T.,"
Plant & Cell Physiology Vol. 39 page： 1258-1268 1998.1
"An Arabidopsis protein that interacts with the cytokinin-iucible response regulator, ARR4, implicated in the His-Asp phosphorylay signal transduction."
"Yamada H., Hanaki N., Imamura A., Ueguchi C. and Mizuno T.,"
FEBS Letters Vol. 436 page： 76-80 1998.1
The leuO gene-product has a latent ability to relieve the bgl silencing in Escherichia coli.
"Ueguchi C., Ohta T., Seto C., Suzuki T. and Mizuno T.,"
Journal of Bacteriology Vol. 180 page： 190-193 1998.1
The yhhP gene encoding a small ubiquitous protein that is essential for the normal cell-growth of Escherichia coli.
"Yamashino T.,ハ Isomura M., Ueguchi C. and Mizuno T.,"
Journal of Bacteriology Vol. 180 page： 2257-2261 1998.1
Response regulators implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in <u>Arabidopsis.</u> Reviewed
Imamura A., Hanaki N., Umeda H., Nakamura A., Suzuki T., Ueguchi C. and Mizuno T.
Proceedings of National Academy of Sciences in USA Vol. 95 page： 2691 1998
Expression of Arabidopsis response regulator homologs is induced by cytokinins and nitrate Reviewed
Taniguchi M., Kiba T., Sakakibara H., Ueguchi C., Mizuno T. and Sugiyama T.
FEBS Letters Vol. 429 page： 259 1998
Cloning of a cDNA encoding a putative metal-transporting P-type ATPase from Arabidopsis thaliana.
"Tabata K., Kashiwagi S., Mori H., Ueguchi C. and Mizuno T.,"
Biochimica et Biophysica Acta Vol. 1326 page： 1-6 1997.1
Clarification of the dimerization domain and its functional significance for the <u>Escherichia coli</u> nucleoid protein H-NS. Reviewed
Ueguchi C., Seto C., Suzuki T. and Mizuno T.
Journal of Molecular Biology Vol. 274 page： 145 1997
Purification of H-NS protein and its regulatory effect on transcription in vitro. Invited Reviewed
Ueguchi C. Mizuno T.
Methods in Enzymology Vol. 274 page： 271-276 1996.1
H-NS regulates OmpF expression through micF antisense RNA in Escherichia coli. Reviewed
"Suzuki T., Ueguchi C. and Mizuno T.,"
Journal of Bacteriology Vol. 178 page： 3650-3653 1996.1
The <u>rpoD</u> gene functions as a multicopy suppressor for mutations in the chaperones, CbpA, DnaJ and DnaK, in Escherichia coli. Reviewed
Shiozawa T., Ueguchi C. and Mizuno T.
FEMS Microbiological Letters Vol. 138 page： 245 1996
Systematic mutational analysis revealing the functional domain organization of <u>Escherichia</u> <u>coli</u> nucleoid protein H-NS Reviewed
Ueguchi C., Suzuki T., Yoshida T., Tanaka K. and Mizuno T.
Journal of Molecular Biology Vol. 263 page： 149 1996
飢餓に耐えるための転写制御
上口智治
化学と生物 Vol. 33 page： 694-695 1995.1
"A study of the double mutation of dnaJ a cbpA, whose gene products function as molecular chaperones in Escherichia coli."
"Ueguchi C., Shiozawa T., Kakeda M., Yamada H. and Mizuno T.,"
Journal of Bacteriology Vol. 177 page： 3894-3896 1995.1
Quantitative control of the stationary phase-specific sigma factor, σS, in <u>Escherichia coli</u> : involvement of the nucleoid protein H-NS Reviewed
Yamashino T., Ueguchi C. and Mizuno T.
The EMBO Journal Vol. 14 ( 3 ) page： 594-602 1995
An <u>Escherichia coli</u> curved DNA-binding protein whose expression is affected by the stationary phase-specific sigma factor δs Reviewed
Kakeda M., Ueguchi C., Yamada H. and Mizuno T.
Molecular and General Genetics Vol. 248 page： 629 1995
Solution structure of the DNA binding domain of a nucleoid-associated protein, H-NS, from <u>Escherichia coli</u> Reviewed
Shindo H., Iwaki T., Ieda R., Kurumizaka H., Ueguchi C., Mizuno T., Morikawa S., Nakamura H. and Kuboniwa H.
FEBS Letters Vol. 360 page： 125-131 1995
An analogue of the DnaJ molecular chaperone in <u>Escherichia coli</u> Reviewed
Ueguchi C., Kakeda M., Yamada H. and Mizuno T.
Proceedings of the National Academy of Sciences in USA Vol. 91 page： 1054-1058 1994
Importance of stereospecific positioning of the upstream <u>cis</u>-acting DNA element containing a curved DNA structure for the functioning of the <u>Escherichia coli proV</u> pranoter Reviewed
Tanaka K., Ueguchi C. and Mizuno T.
Biosciences, Biotechnology and Biochemistry Vol. 58 ( 6 ) page： 1097-1101 1994
A fission yeast gene encoding a protein that preferentially associates with curved DNA Reviewed
Yamada H., Mori., Momoi H., Nakagawa Y., Ueguchi C. and Mizuno T.
Yeast Vol. 10 page： 883-894 1994
An analogue of the Dna J molecular chaperone whose expression is controlled by σS during the stationary phase and phosphate starvation in <u>Escherichia coli</u> Reviewed
Yamashino T., Kakeda M., Ueguchi C. and Mizuno T.
Molecular Microbiology Vol. 13 ( 3 ) page： 475-483 1994
Function of the Escherichia coli nucleoid protein, H-NS : molecular analysis of a subset of proteins whose expression is enhanced in a hns deletion mutant. Reviewed
Yoshida T., Ueguchi C., Yamada H. and Mizuno T.
Molecular and General Genetics Vol. 237 page： 113-122 1993
Expression of the Escherichia coli dimorphic glutamic acid decarboxylase is regulated by the nucleoid protein H-NS. Reviewed
Yoshida T., Yamashino T., Ueguchi C. and Mizuno T.
Biosciences, Biotechnology and Biochemistry Vol. 57 ( 9 ) page： 1568-1569 1993
Autoregulatory expression of the Escherichia coli hns gene encoding a nucleoid protein : H-NS functions as a repressor of its own transcription Reviewed
Ueguchi C., Kakeda M. and Mizuno T.
Molecular and General Genetics Vol. 236 page： 171-178 1993
Sequence of a fission yeast gene encoding a protein with extensive homology to eukaryotic elongation factor-1γ Reviewed
Momoi H., Yamada H., Ueguchi C. and Mizuno T.
Gene Vol. 134 page： 119-122 1993
Physical map location of a set of Escherichia coli genes(hde)whose expression is affected by the nucleoid protein, H-NS. Reviewed
Yoshida T., Ueguchi C. and Mizuno T.
Journal of Bacteriology Vol. 175 ( 23 ) page： 7747-7748 1993
The Escherichia coli nucleoid protein H-NS functions directly as a transcriptional repressor. Reviewed
Ueguchi C. and Mizuno T.
The EMBO Journal Vol. 12 ( 3 ) page： 1039-1046 1993
Structure and function of sequence directed DNA curvature
Vol. 37 page： 10 1992
Multicopy suppression : an approach to understanding intracellular functioning of the protein export system Reviewed
Ueguchi C. and Ito K.
Journal of Bacteriology Vol. 174 page： 5 1992
Insertional disruption of the nusB(ssyB) gene leads to cold-sensitive growth of Escherichia coli and suppression of the secY24 mutation. Reviewed
Taura T., Ueguchi C., Shiba K. and Ito K.
Molecular and General Genetics Vol. 234 page： 429-432 1992
Yeast gene which suppresses the defect in protein export of a secY mutant of E. coli Reviewed
Sakaguchi M., Ueguchi C., Ito K. and Omura T.
Journal Biochemistry (TOKYO) Vol. 109 page： 799-802 1991
The sec genes of <u>Escherichia</u> <u>coli</u>
Vol. 63 page： 4 1991
Escherichia coli sec mutants accumulate a processed immature form of maltose-binding protein (MBP), a late-phase intermediate in MBP export Reviewed
Ueguchi C. and Ito K.
Journal of Bacteriology Vol. 172 page： 5643-5649 1990
Characterization of cold-sensitive secY mutants of Escherichia coli Reviewed
Baba T., Jacq A., Brickman E., Beckwith J., Taura T., Ueguchi C., Akiyama Y. and Ito K.
Journal of Bacteriology Vol. 172 page： 7005-7010 1990
The secy-rpmJ region of the spc ribosomal protein operon in Escherichia coli : Structural alterations affecting secY expression Reviewed
Ueguchi C., Wittekind M., Nomura M., Akiyama Y. and Ito K.
Molecular and General Genetics Vol. 217 page： 1-5 1989
Effects of mutations in heat-shock genes groES and groEL on protein export in Escherichia coli Reviewed
Kusukawa N., Yura T., Ueguchi C., Akiyama Y. and Ito K.
The EMBO Journal Vol. 8 page： 3517-3521 1989
基礎生化学実験法
上口智治（ 編：）（ Role： Joint author）
東京化学同人 2000
*Molecular Chaperone and Protein-Folding Sequences.
"Mizuno T. and Ueguchi C.( EDITOR:Gething, M. J.)"（ Role： Joint author）
University Press 1997
*Purification of H-NS protein and its regulatory effect on transcription in vitro
（ Role： Joint author）
Methods in Enzymology 1996
新遺伝子操作の基礎技術
上口智治（ 編：太田美智男）（ Role： Joint author）
菜根出版 1995
用語ライブラリー: 転写因子
"上口智治, 水野猛（ 編：田村隆明,梅園和彦）"（ Role： Joint author）
羊土社 1995
受容体様キナーゼをコードするシロイヌナズナCRK14遺伝子はglobal proliferative arrestに関与する
石崎千里、樋口真由、松下侑真、鈴木孝征、望月伸悦、長谷あきら、上口智治
第62回日本植物生理学会年会 2022.3.22 日本植物生理学会
Global proliferative arrestに関わるシロイヌナズナFIREWORKS遺伝子の同定
今井翔、廣澤ひかる、鈴木孝征、小鍛治敬生、望月伸悦、長谷あきら、上口智治
第60回日本植物生理学会年会 2019.3 日本植物生理学会
A missense allele of Arabidopsis CNGC20 gene encoding a cyclic nucleotide-gated channel affects leaf growth and maintenance of stem cell activity in shoot apical meristem
MERISTEM DISORGANIZATION 1 (MDO1)遺伝子は胚発生能力を持つ配偶子の形成に必要である
中上朋美,上口智治
第53回日本植物生理学会年会
シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION 1遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である
橋村侑磨,上口智治
第53回日本植物生理学会年会
シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION 1遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である
橋村侑磨,上口智治
第52回日本植物生理学会年会
MERISTEM DISORGANIZATION 1 (MDO1)遺伝子は胚発生能力を持つ配偶子の形成に必要である
中上朋美,上口智治
第52回日本植物生理学会年会
シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION1 (MDO1)遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である
橋村侑磨、上口智治
第３３回日本分子生物学会年会
シロイヌナズナMERISTEM DISORGANIZATION1 (MDO1)遺伝子は頂端分裂組織における未分化細胞の維持に必要である
橋村侑磨、西史江、上口智治
第５１回日本植物生理学会年会
シロイヌナズナBOUQUIT遺伝子のミスセンス変異によるメリステムの過剰形成
高木直人、上口智治
第５０回日本植物生理学会年会
Biological functions of the cytokinin receptors in Arabidopsis International conference
6th annual symposium of Agricultural Plant Stress Research Center
Cytokinin receptors are required for normal development of auxin-transporting vascular tissues in the hypocotyl but not in adventitious roots. International conference
17th International Conference on Arabidopsis Research
シロイヌナズナのサイトカイニン受容体は、側根形成を誘導するオーキシン輸送に関わる胚軸維管束の発達に必要である
黒羽剛、上口智治、榊原均、佐藤忍
第２４回根研究集会
シロイヌナズナのサイトカイニン受容体AHK2～4の機能低下は、背軸での維管束発達の抑制およびオーキシンの蓄積による、側根形成の抑制と不定根形成を引き起こす
日本植物生理学会2005年度年会
Biological functions of the cytokinin receptors in Arabidopsis
International Symposium "Plant Axis Formation and Signal Transduction"
根端優勢が喪失したシロイヌナズナ突然変異ar-22はサイトカイニン受容体機能欠損突然変異wolの新規アリルである
黒羽剛、上口智治、佐藤忍
シロイヌナズナワークショップ２００４
Biological functions of the cytokinin receptors in Arabidopsis International conference
18th International Conference on Plant Growth Substances
Cytokinin receptor gene mutants in Arabidopsis International conference
Cytokinin 2004
シロイヌナズナTCP16遺伝子は花粉形成に必須な転写因子である
武田泰斗、天野和夫、西村千佳、大籐雅章、中村研三、佐藤修正、加藤友彦、田畑哲之、上口智治
日本植物生理学会2004年度年会
サイトカイニン受容体をコードするAHK遺伝子群の変異解析
西村千佳、大橋芳、佐藤修正、加藤友彦、田畑哲之、上口智治
日本植物生理学会2004年度年会
シロイヌナズナTCP10遺伝子は細胞分裂を正に制御する
武田泰斗、佐藤修正、加藤友彦、田畑哲之、上口智治
日本植物生理学会2003年度年会
イネOsTB1遺伝子は側枝の生長を負に制御する
武田泰斗、諏訪裕子、北野英巳、上口美弥子、芦刈基行、松岡信、上口智治
日本植物生理学会2003年度年会
シロイヌナズナTCP遺伝子群の機能解析
"武田泰斗,佐藤修正,加藤友彦,田畑哲之,上口智治"
日本植物生理学会2002年度年会
サイトカイニンシグナルと形態形成
上口智治
植物の体づくりを探る
サイトカイニン受容体
上口智治
第12回シロイヌナズナ・ワークショップ
シロイヌナズナAHK4遺伝子産物はサイトカイニンレセプターとして機能する
"上口智治,佐藤修正,加藤友彦,田畑哲之"
日本植物生理学会2001年度年会
The AHK4 gene is involved in the cytokinin-signaling pathway as a direct receptor molecule in Arabidopsis thaliana. International conference
第8回国際イネゲノムワークショップ
シロイヌナズナのセンサーキナーゼAHK4遺伝子の変異解析
"上口智治,佐藤修正,加藤友彦,田畑哲之"
第23回日本分子生物学会年会
シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸リレー情報伝達:疑似レギュレーター因子群の機能解析
"牧野聖也,今村綾,木羽隆敏,谷口光隆,上口智治,杉山達夫,水野猛"
日本植物生理学会2000年度年会
シロイヌナズナのHPt因子AHPと相互作用する因子の検索
"鈴木友美,櫻井健介,上口智治,水野猛"
日本植物生理学会2000年度年会
シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸転移情報伝達機構因子群ARRsの比較総合解析
"今村綾,鈴木友美,上口智治,水野猛"
日本植物生理学会2000年度年会
シロイヌナズナのレスポンスレギュレーター遺伝子の発現解析
"木羽隆敏,藤田明恵,谷口光隆,榊原均,上口智治,水野猛,杉山達夫"
日本植物生理学会1999年度年会
シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸リレー情報伝達系因子(HPt)の検索と機能解析
"鈴木友美,今村綾,上口智治,水野猛"
日本植物生理学会1999年度年会
"シロイヌナズナのサイトカイニン誘導性レギュレーター,ARR4,結合因子の解析"
"花木直人,山田寿美,今村綾,鈴木友美,中村あや子,上口智治,水野猛"
第21回日本分子生物学会年会
大腸菌細胞分裂に関わる新規タンパク質YhhPの機能
"石井祐子,山田寿美,山篠貴史,上口智治,水野猛"
第21回日本分子生物学会年会
シロイヌナズナのレスポンスレギュレーター遺伝子群の解析
"上口智治,今村綾,花木直人,谷口光隆,杉山達夫,水野猛"
第21回日本分子生物学会年会
シロイヌナズナにおける新規二成分制御系シグナル伝達因子(HPt)の検索と機能解析
"鈴木友美,上口智治,水野猛"
第21回日本分子生物学会年会
大腸菌のbglサイレンシングに関与する新規因子の解析
"太田朋子,上口智治,水野猛"
第21回日本分子生物学会年会
シロイヌナズナのレスポンスレギュレーター遺伝子は無機窒素源及びサイトカイニンにより発現制御を受ける
"谷口光隆,木羽隆敏,榊原均,上口智治,水野猛,杉山達夫"
日本植物生理学会1998年度年会
シロイヌナズナにおける二成分制御系シグナル伝達因子の検索
"上口智治,今村綾,花木直人,水野猛"
日本植物生理学会1998年度年会
シロイヌナズナにおける新規二成分制御系シグナル伝達因子(HPt)の検索
"鈴木友美,上口智治,水野猛"
日本植物生理学会1998年度年会
シロイヌナズナにおけるバクテリア型情報伝達因子の解析
"花木直人,山田寿美,今村綾,中村あや子,鈴木友美,上口智治,水野猛"
日本農芸化学会1998年度大会
シロイヌナズナにおけるHis-Aspリン酸転移信号伝達系遺伝子群の解析
上口智治
核酸情報ワークショップ
大腸菌DNA結合タンパク質LeuOによるbglサイレンシングの解除
"太田朋子,背戸千春,鈴木友美,上口智治,水野猛"
第20回日本分子生物学会年会
シロイヌナズナにおけるバクテリア型情報伝達因子の機能解析
"今村綾,中村あや子,花木直人,上口智治,水野猛"
第20回日本分子生物学会年会
大腸菌各様体タンパク質H-NSの機能ドメイン:二量体形成ドメインの同定とその機能的重要性
"背戸千春,鈴木友美,上口智治,水野猛"
第20回日本分子生物学会年会
シロイヌナズナにおけるHPtドメインを持つ新規二成分制御系シグナル伝達因子の検索
"鈴木友美,上口智治,水野猛"
第20回日本分子生物学会年会
Structure and function of the E. coli nucleoid protein H-NS. International conference
EMBO workshop: Nucleoid-Associated proteins.
シロイヌナズナにおけるバクテリア型情報伝達因子の取得と解析
"梅田裕之,花木直人,今村綾,上口智治,水野猛"
日本農芸化学会1997年度大会
シロイヌナズナにおける二成分制御系シグナル伝達因子の探索
"上口智治,鈴木友美,梅田裕之,花木直人,水野猛"
日本植物生理学会1997年度年会
大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能ドメイン構造
上口智治
第13回染色体ワークショップ
大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能ドメイン解析
"上口智治,鈴木友美,吉田孝行,水野猛"
第18回日本分子生物学会年会
ompF/ompC遺伝子発現における核様体タンパク質H-NSの役割
"鈴木友美,上口智治,水野猛"
第18回日本分子生物学会年会
大腸菌核様体タンパク質H-NSによる転写制御とストレス応答
上口智治
第10回朝霧シンポジウム
湾曲DNA結合タンパク質の構造と機能
"上口智治, 水野猛"
基礎生物学研究所研究会オルガネラDNA結合性タンパク質の構造と機能
大腸菌における栄養飢餓ストレス応答の制御機構
上口智治
ストレス応答の分子機構
Quality control for plant gametogenesis
Grant number：25440130 2013.4 - 2017.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
UEGUCHI CHIHARU
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\5200000 （ Direct Cost: \4000000 、 Indirect Cost：\1200000 ）
In monocarpic plants, it is observed that developing reproductive structures control whole-plant senescence, so-called global proliferative arrest (GPA). To identify genes involved in this process, we isolated and analyzed a mutant showing premature cessation of inflorescence growth in Arabidopsis. The mutant, named premature aging 1 (pma1), plants exhibited earlier cessation of floral bud formation and stem growth. In addition, pma1 showed premature cessation of leaf growth and earlier senescence. Map-based cloning revealed that pma1 is a missense allele of the CNGC20 gene encoding a cyclic nucleotide-gated cation channel. These results suggest that the maintenance of intracellular ionic homeostasis is important for the process of whole-plant senescence.
植物における新規な配偶子品質管理機構の解析
2013.4 - 2016.3
科学研究費補助金 基盤研究(C)
上口智治
Authorship：Principal investigator
顕花植物の生殖過程では、親世代の胞子体の役割は、単に受精可能な配偶子の形成に限定されるものではなく、受精後の接合子の胚発生過程にも積極的に関与する。本申請では後者に関わる全く新しい生命現象の分子機構の解析を提案する。申請者はシロイヌナズナ新規変異体の遺伝学的解析の途上で、雌雄いずれの配偶子も受精後に胚発生可能な性質（胚発生能）を親世代の胞子体が決定しており、これがDNA障害応答の一環であることを発見した。この新規生命現象は種の継続性を担保する重要な機構であると共に、種内のゲノムの多様性をもたらす可能性がある点で、進化的観点からも興味深い。本提案は、この新規生命現象の分子機構解明ならびにゲノム多様化の観点からの生物学的意義の解明を目的とする。
Molecular analysis of plant genes involved in the maintenance of cell fate
Grant number：22570038 2010 - 2012
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
UEGUCHI Chiharu
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\4550000 （ Direct Cost: \3500000 、 Indirect Cost：\1050000 ）
It is essential for plant growth and development to maintain the undifferentiated state of stem cells and the cell fate of differentiating cells. We identified a novel gene required for maintenance of undifferentiated state of stem cells through the reduction of DNA damage. We also found that the known gene has a novel function for proper progression of cell differentiation process. These results, thus, suggested novel mechanisms for the maintenance of plant cell fate.
サイトカイニンによる高等植物の生長・分化の制御
2002.4 - 2007.3
科学研究費補助金 特定領域研究(A)(2)(計画)，課題番号：14036215
Authorship：Principal investigator
科研費
Grant number：14036215 2002 - 2006
科学研究費助成事業 特定領域研究
上口 智治
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\66700000 （ Direct Cost: \66700000 ）
シロイヌナズナサイトカイニン受容体遺伝子群(AHK2,AHK3,AHK4)の多重変異株は構成細胞数の低下に起因する顕著な綾性表現型を示す。この表現型の原因をさらに詳しく調べるために、CUC1過剰発現による異所的SAM形成のAHK遺伝子依存性の検討、ならびにahk多重変異株のトランスクリプトーム解析を行った。CUC1の過剰発現は子葉の向軸側に異所的なSAMを形成する。この過剰発現は外植片からの不定芽誘導もサイトカイニン依存的に活性化させる。ahk三重変異株におけるCUC1過剰発現の影響を調べたところ、頻度は低下するものの、異所的なSAM形成は阻害されなかった。このことからin vivoとin vitroにおける異所的なSAM形成の機構が完全に同じではない可能性が考えられる。ahk2 ahk3二重変異株およびahk三重変異株を対象にしたトランスクリプトーム解析では、これら変異株で特異的に発現が減少・増加する遺伝子としてそれぞれ約100種・60種の遺伝子を同定した。発現減少を示す遺伝子にはAタイプARRなどのサイトカイニン初期誘導遺伝子が含まれる。サイトカイニン生合成遺伝子の発現上昇と分解・不活化酵素遺伝子の発現低下は、シグナル伝達による内性ホルモン量の調節機構を示唆する。また主要熱ショックタンパク質遺伝子の発現が顕著に上昇しており、多重変異株がタンパク質の変性を伴う何らかのストレス状態に置かれていることを示している。多数のレドックス関連遺伝子の発現も影響されることから、サイトカイニンシグナルと細胞内酸化還元バランスの調節の関連性が示唆された。実際、ahk多重変異体は強光ストレスに対して顕著な耐性を示し、レドックスストレス応答が恒常的に引き起こされていると考えればよく理解できる。
植物の可塑的な生長・分化を支える分子機構
2001.4 - 2006.3
科学研究費補助金 特別推進研究
Authorship：Coinvestigator(s)
科研費
高等植物のサイトカイニン応答におけるセンサーキナーゼファミリーの機能解析
2001.4 - 2003.3
科学研究費補助金 基盤研究(C)(2)(一般)
Authorship：Principal investigator
科研費
Molecular mechanism of flexible development and differentiation in plants
Grant number：13CE2005 2001 - 2005
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for COE Research
MATSUOKA Makoto, HATTORI Tsukaho, SAKAGAMI Youji, MAESHIMA Masayoshi, UOZUMI Nobuyuki, MIZUNO Takeshi
Authorship：Coinvestigator(s)
○Study on molecular mechanism of plant growth
We identified a receptor of gibberellin (GA). which is an important growth phytohormone. The GAreceptor interacts with bioactive GAs at a reasonable concentration. The binding GA to the receptor induces the interaction between GID1 and a DELLA protein, which functions as a negative factor of GA signaling. Cytokinin is another growth phytohomone. We identified the three genes encoding cytokinin receptors and investigated their relevant in planta functions. We also revealed that a grain number in rice is controlled by the level of cytokinin in the floral meristems. Using the graining number gene, we increased the grain number of Koshihikari, the top rice leading variety of Japan. We identified a set of components (or genes), named PRRs, which play coordinately essential roles within (or dose to) the Arabidopsis circadian clock that is important for the control of the flowering time in plants. We also identified a receptor of plant peptide hormone, pktosulfokine, discovered by us.
○Study on molecular mechanism of plant response to physical environments.
We found characteristic properties of five cation/H+ exchangers of rice. Ktr/HKTtype transporters were also found to be essential for the adaptation of plants and bacteria to salinity stress and high osmolality We also revealed that nitrate transporter genes are activated by multiple mechanisms involving nitrate and/or nitrite, and also that glutamine was shown to regulate nitrate transport activity at both the transcriptional and post-translational levels. For understanding of signal transduction of responses to hyperosmotic stress, we have identified an SnRK2 interacting protein that would function as a scaffold for signaling components.
Grant number：13640644 2001 - 2002
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
UEGUCHI Chiharu
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\3500000 （ Direct Cost: \3500000 ）
We identified a set of structurally related genes, AHK2 3 and 4, each encoding a sensor histidine kinase in Arabidopsis thaliana. We identified a loss-of-function mutation of the AHK4 gene. The mutant exhibited the cytokinin-resistant phenotype not only in inhibition of root growth by cytokinin but also in greening and shoot induction of calli. Moreover, AHK4 expressed in budding yeast showed histidine kinase activity in a manner dependent on the presence of cytokinin. These results strongly suggested that AHK4 is involved in the cytokinin-signaling pathway, as a direct receptor. We then screened and isolated loss-of function mutations of the AHK2 and 3 genes. Two independent alleles of ahk3 mutations exhibited the cytokinin-insensitive phenotype in greening and shoot induction of calli, indicating that AHK3 is also a cytokinin receptor. Although two independent alleles of ahk2 showed normal growth and cytokinin sensitivity, the ahk2/ 3 double mutant exhibited semi-dwarf phenotype in the above-ground tissues. These results suggest that AHK2 and 3 also function as cytokinin receptors and that cytokinins act as positive regulators in cell division activity in vivo.
高等植物の分化成長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析
Grant number：13017208 2001
科学研究費助成事業 特定領域研究(A)
上口 智治
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\3000000 （ Direct Cost: \3000000 ）
1.サイトカイニン受容体遺伝子群の機能解析 シュート部位で発現しているサイトカイニンレセプターの候補であるAHK2,3がいかなる部位で発現しているのかを組織及び細胞レベルで解析するために、AHK2,3とGUSならびにGFPの融合タンパク質を構築したしAHK3-GFP融合体の観察では、GFP活性は根・胚軸・子葉や本葉で認められる。根や胚軸においてはコルメラ細胞群や維管束で、若い本葉では特に葉縁部で、成熟葉では葉脈で発現しているものと考えられる。またGFPの蛍光は細胞の外縁を取り巻くように認められ、AHK3が細胞質膜に局在するという予測と一致する。
AHK2,3両遺伝子のT-DNA挿入変異体の検索を行い、AHK2遺伝子については1ラインの、AHK3遺伝子については2ラインの挿入変異体を同定できた。AHK3変異体の二つのラインについてはホモ接合体を確立でき、胚軸から調整したカルスはサイトカイニンに対する感受性が低下していることを見出した。
2.TCP遺伝子群の機能解析 サイトカイニンシグナル伝達に関与することが想定されているAHP遺伝子群(二成分制御系の信号仲介因子であるHPt因子をコードする)と物理的相互作用が可能な因子として、TCPドメインを持つ新規転写関連因子を見出し、TCP10と名付けた。この遺伝子のT-DNA挿入変異体は植物体のシュート部位において顕著な矮性を示すことを見出した。TCP10遺伝子の過剰生産体はそれとは逆に葉柄や胚軸が伸長する。さらにTCP10プロモーターとGUSの融合体を用いて発現部位の詳細な解析を行い、TCP10の発現は胚軸・本葉・花の花柱で認められ、花茎を除くと表現型が現れる部位との間には相関があることが判明した。
高等植物の分化成長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析
Grant number：12037207 2000
科学研究費助成事業 特定領域研究(A)
上口 智治
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2800000 （ Direct Cost: \2800000 ）
1)シロイヌナズナから3種類の新規センサーキナーゼ遺伝子を分離して一次構造を確定し、これら遺伝子をAHK2,3,4(AHK=Arabidopsis histidine kinase)と名付けた。AHK遺伝子群は相互に高い相同性を示す遺伝子ファミリーを形成している。またAHK遺伝子群の発現を調べたところ、AHK4が根組織で特異的に発現していることがわかった。
2)AHK4遺伝子にT-DNAが挿入された変異株を同定した。AHK4の発現が根組織特異的であることに注目した解析から、この変異株が植物ホルモンの一つであるサイトカイニンに対して非感受性を示すことを明らかにした。AHK4遺伝子を出芽酵母のセンサーキナーゼ変異株に導入したところ、各種サイトカイニン(BA,Kinetin,t-Zeatin)に依存的な生育を示し、AHK4がサイトカイニンの直接の受容体であり、リガンドとの結合がヒスチジンキナーゼ活性を正に制御することを明らかにした。。
3)TCP10はTCP1などと同様に、側生器官の分化成長に直接関与すると考えられているトウモロコシのT〓1やキンギョソウのCYCと同じ構造を持つサブファミリーに属しており、機能的に重要であると考えられる。このサブファミリーに属するTCP遺伝子をシロイヌナズナのゲノムからさらに3種見出し、TCP11〜13と名付け、当サブファミリーに属する遺伝子群(TCP1,2,3,5,10,11,12,13)すべてのクローン化を終了でた。
高等植物の分化生長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析
1999.1 - 2001.12
科学研究費補助金 特定領域研究(A)(2)(公募)
Authorship：Principal investigator
科研費
高等植物の分化成長における二成分制御系シグナル伝達因子の機能解析
Grant number：11163210 1999
科学研究費助成事業 特定領域研究(A)
上口 智治, 水野 猛
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\3000000 （ Direct Cost: \3000000 ）
1.二成分制御系遺伝子の検索と構造決定
シロイヌナズナESTクローンバンクとゲノム情報の検索から、現在14種類のレスポンスレギュレーター遺伝子(ARR)、5種類のHPtメディエーター遺伝子(AHP)と3種類の新規センサーキナーゼ遺伝子(AHK)を確認し、cDNAレベルでの一次構造を確定した。ARRならびにAHP遺伝子群の発現解析を行い、いずれも根器官での発現が顕著であること、AタイプのARR遺伝子の発現は植物ホルモンのうち、サイトカイニンでのみ一過的に誘導されるがBタイプはそうではないことを見出した。
2.ARR・AHPの分子機能
1)Aタイプに属するARRタンパク質を精製し、大腸菌のHPt因子からリン酸基を受容できることを確認した。AHPタンパク質についても同様に、大腸菌のハイブリッドセンサーキナーゼからリン酸基を受容できること、ならびにそのリン酸基をARRタンパク質に転移できることを確認した。
2)出芽酵母のHPt因子をコードするYPD1遺伝子の変異をAHP1が相補できることを証明した。この相補活性にはリン酸化部位であるヒスチジン残基が必須である。また出芽酵母のセンサーキナーゼをコードするSLN1遺伝子の変異はAHK3遺伝子によって相補されることも示した。この相補活性にも自己リン酸化部位のヒスチジン残基が必須である。以上の結果はARR,AHP,AHK各分子が二成分制御系の因子として機能しうることを示している。
3.植物における機能解析
1)酵母Two-hybrid法を用いてAHPと相互作用する植物の因子を検索した。その結果、AHP1〜3はBタイプのARR(ARR1,2,10)と、AHP2,3はそれらに加えてTCPドメインを持つ新規タンパク質と相互作用しうることを明らかにした。前者については酵母の系のみならず精製タンパク質のレベルで相互作用を確認し、相互作用がHPtドメインとARR1のレシーバードメイン間でなされることを明らかにした。さらにHPtからARR1へのリン酸基転移を証明した。後者のTCPドメインは最近注目されはじめた機能ドメインで、側芽の成長や花器官の対象性に関与する遺伝子の例が知られている。
2)かずさDNA研究所との共同研究により、AHP、AHKおよびTCP遺伝子のノックアウト変異株の検索に着手した。
大腸菌核様体タンパク質H-NSによる新規な遺伝子発現調節機構の解析
1997.1 - 1998.12
科学研究費補助金 基盤研究(C)(2)(一般)
Authorship：Principal investigator
科研費
Regulatory mechanism of gene expression by Escherichio coli nucleoid protein H-NS
Grant number：09680671 1997 - 1998
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
UEGUCHI Chiharu
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\3200000 （ Direct Cost: \3200000 ）
The Escherichia coil H-NS protein is one of the major constituents of the nucleoid structure. This protein has been implicated not only in the compact organization of the nucleoid structure, but also in the global regulation of gene expression. In this study, on systematic mutational analysis of hns, three distinct functional domains were found in H-NS, which appear to be responsible for DNA-binding, transcriptional repression and dimerization, respectively. Mutations in the C-terminal domain resulted in a loss of its DNA-binding ability, suggesting that this domain is directly involved in its binding to DNA.The N-terminal domain was suggested to be involved in the ability to repress transcription. The relatively central portion of H-NS was found to be involved in protein-protein interaction, especially dimerization. The functional significance for each domain was also clarified. In addition, expression of the bgl operon was found to be affected by only a subset of hns mutations in a highly allele-specific manner. This finding is also addressed with regard to a unique regulatory mechanism (i.e. silencing) for the bgl operon, which is partly mediated by H-NS.
The Escherichia coli bgl operon is of interest since its expression is silent (phenotypically Bgl^-), at least under standard laboratory conditions. To identify a trans-acting factor(s) that is presumably relevant to the regulation of bgl, I screened mutants exhibiting Bgl+ phenotype. By a random insertion mutagenesis with mini-Tn10, a novel type of mutation was obtained. In this case, the insertion mutation was found to be just in front of the leuO gene encoding a putative LysR-like DNA-binding protein. Genetic analyses revealed that an overproduction of LeuO in the wild-type cells causes the phenotype of Bgl^+.
大腸菌定常期特異的シグマ因子の発現/活性制御機構の解析
1996.1 - 1996.12
科学研究費補助金 基盤研究(C)(2)(一般)
Authorship：Principal investigator
科研費
Grant number：08680738 1996
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
上口 智治
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2600000 （ Direct Cost: \2600000 ）
I.定常期特異的シグマ因子の発現制御機構の解析
1)δSの発現に関わる正の制御因子を検索する目的で、δSが脱抑制されるhns変異株中でもその発現が低下するような変異株を分離した。sirA(sigma S regulation)と名付けたこの変異株中では、δSの転写や翻訳効率には変化がないものの、産物が不安定化することでその発現量に異常が生じたものであることを明らかにした。変異のマッピングとクローン化により、sirA遺伝子をクローン化した。しかしhns変異を含まない野生型大腸菌にsirA変異を導入したところ、δSの発現には顕著な異常は観察されず、δS発現におけるsirA変異の影響はhns変異株という特殊な遺伝子型に限って現れる現象であると結論できる。ところでsirAの欠失変異を新たに構築したところ、その変異株はrich medium sensitivityと細胞の異常な伸長という表現型を示した。このことはSirAは本来細胞分裂に関係する機能を持つ蛋白質であることを示唆する。
2)エネルギー代謝における中間産物であるアセチルリン酸がδSの発現調節において負の制御因子であることを示唆するデータを得た。δS発現の負の制御因子として、最近二成分制御系のレギュレーターであるRssBが同定されている。アセチルリン酸は他のレギュレーター蛋白質をリン酸化しうる低分子であることを考慮すると、アセチルリン酸がRssBの制御因子として機能する可能性が考えられ、現在解析中である。
II.グローバルリプレッサーH-NSの機能ドメインの解析
グローバルな転写抑制因子であるH-NSの作用メカニズム解明のため、変異解析による機能ドメインの解析を行った。H-NS制御下にあるプロモーターの転写を指標として多数のhns変異株を取得し、遺伝学的・生化学的解析を行い、H-NSのN末端・中央部・C末端領域に転写抑制・オリゴマー化・DNA結合ドメインがそれぞれ局在することを立証した。
栄養飢餓ストレス応答における大腸菌DnaJシャペロンのアナログCbpAの分子機能
1995.1 - 1995.12
科学研究費補助金 特定領域研究(A)(2)(公募)
Authorship：Principal investigator
科研費
翻訳段階での遺伝子発現制御機構における大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能解析
1995.1 - 1995.12
科学研究費補助金 基盤研究(C)(2)(一般)
Authorship：Principal investigator
科研費
栄養飢餓ストレスにおける大腸菌DnaJシャペロンのアナログCbpAの分子機能
Grant number：07253209 1995
科学研究費助成事業 重点領域研究
上口 智治, 水野 猛
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2000000 （ Direct Cost: \2000000 ）
I.DnaJアナログであるCbpAの機能解析
1)cbpAの欠失変異を構築し、その表現型を解析した。cbpAの単独変異は野生株同様の良好な生育を見せるが、cbpA/dnaJ二重変異株は生育可能温度領域が著しく狭く、高温感受性に加えて低温感受性を示す。さらにこの二重変異株は、セプタム形成異常に伴う細胞の伸張や、栄養源枯渇(炭素源)における生存率の低下などの表現型を示した。こうした表現型はdnaK欠失変異に特徴的に観察されるものと一致しており、CbpAとDnaJはDnaKと協調的に働くことで機能することを示唆している。
2)cbpA/dnaJ二重変異株の低温感受性を抑制する多コピーサプレッサーを分離したところ、rpoD遺伝子を得た。これは二重変異の示す低温感受性が熱ショックタンパク質の過剰生産によるものであり、主要シグマ因子の増産によってそれが競争的に阻害されるためであると解釈できる。
II.栄養飢餓ストレス応答機構の解明
1)栄養飢餓ストレス応答の正の制御因子であるシグマ因子(シグマS)の発現制御にH-NSが負の調節因子として機能していることを見いだした。H-NSは栄養豊富な環境ではシグマSの翻訳を抑え、またシグマSタンパク質の不安定化を引き起こす。hns変異株中ではシグマSの脱抑制が起こり、細胞は対数増殖期においてもあたかも栄養飢餓状態にあるような生理状態にあることを見いだした。従ってH-NSは、利用可能な栄養環境に応答して細胞の生理的状態をスイッチする機能のキ-分子であると考えられる。
2)シグマSの発現に関わる他の因子を検索し、一つの候補遺伝子を得た。
翻訳段階での遺伝子発現制御機構における大腸菌核様体タンパク質H-NSの機能解析
Grant number：07680735 1995
科学研究費助成事業 一般研究(C)
上口 智治
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2500000 （ Direct Cost: \2500000 ）
I.核様体タンパク質H-NSの機能ドメイン解析
H-NSによってその転写が抑制されているpeoUオペロンの発現を指標にして、25種類のhns変異を分離した。このうち20種類のミスセンス変異はH-NS上で大きく3つの領域(N末端領域、C末端側2つの領域)に集中した。精製した変異タンパク質について生化学的解析を行ったところ、C末端側ドメインはDNAとの結合に、N末端側ドメインは転写抑制機能に必要な領域であることが示唆された。H-NSはホモダイマーを形成して機能することが知られているが、ダイマー形成にはN末端側2/3が必要十分であり、おそらくH-NSの中央部ドメインがそれに関与するのではないかと推測された。
II.栄養飢餓ストレス応答機構の解明
1)栄養飢餓ストレス応答の正の制御因子であるシグマ因子(シグマS)の発現制御にH-NSが負の調節因子として機能していることを見いだした。H-NSは栄養豊富な環境ではシグマSの翻訳を抑え、またシグマSタンパク質の不安定化を引き起こす。hns変異株中ではシグマSの脱抑制が起こり、細胞は対数増殖期においてもあたかも栄養飢餓状態にあるような生理状態にあることを見いだした。従ってH-NSは、利用可能な栄養環境に応答して細胞の生理的状態をスイッチする機構のキ-分子であると考えられる。
2)シグマSの発現に関わる他の因子を検索し、一つの候補遺伝子を得た。
大腸菌分子シャペロンDnaJの構造的/機能的アナログ:cbpA蛋白質の分子機能
Grant number：06261217 1994
科学研究費助成事業 重点領域研究
上口 智治, 水野 猛
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\1800000 （ Direct Cost: \1800000 ）
I.DnaJアナログであるCbpAの機能解析
1)cbpA欠失変異株を構築し、その表現型を調べた。cbpAの単独欠失変異は野生株とほとんど変わらない生育を見せるが、cbpA/dnaJ二重変異株は生育温度領域が著しく狭い、セプタム形成の異常に伴う細胞の伸長、炭素源枯渇に伴う生存率の低下等の表現型が観察された。従ってCbpAはDnaJと同様の生理的機能を保持していると考えられる。
2)cbpAの転写が増殖定常期やリン酸源の枯渇に誘導されることを見いだした。このことは抗CbpA抗体を用いた免疫ブロティング法でも確認された。この誘導は栄養飢餓ストレス特異的なシグマ因子であるσ^Sに依存する。このことから大腸菌は2種類のDnaJ様シャペロンをストレスの種類に応じて使い分けているのではないかと推測した。
II.栄養飢餓ストレス応答の分子機構
cbpAの発現調節を解析する中で、σ^Sの発現調節に大腸菌核様体タンパク質H-NSが深く関与していることを明らかにした。詳細な解析の結果、H-NSはσ^Sの翻訳と産物の安定性の両段階を負に調節することで、栄養飢餓に応答した発現を保証していることが分かった。栄養飢餓ストレス応答は、近年多くの研究者が関心を寄せている研究分野であり、σ^Sの発現制御機構の解明はその中でも中心的課題となっている。我々の研究結果は当該分野の進展に重要な寄与をなしたといえる。
環境応答機構における大腸菌湾曲DNA結合タンパク質の機能解析
Grant number：06680665 1994
科学研究費助成事業 一般研究(C)
上口 智治
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2100000 （ Direct Cost: \2100000 ）
I. 湾曲DNA結合タンパク質H-NSの機能解析
1)H-NSによって負の転写制御を受けるproUオペロンの脱抑制を指標にして、hns遺伝子に起きた20種類のミスセンス変異と5種類のナンセンス変異を分離した。hns変異の示す多面的な表現型をもとにして、これらの変異が4つのクラスに分類できることを明らかにした。ミスセンス変異はhns遺伝子上で大きく3つの領域(N末端領域、C末端側2つの領域)にかたまって分離され、それぞれ表現系の示すクラスと相関が認められる。生化学的解析から、H-NSのDNAとの結合にはC末端側が関与していることが示唆された。共同研究(東京薬科大学;神藤助教授、)によって明らかにされたH-NSのC末端側の高次構造と照らしあわせることで、H-NSのDNAとの結合にはC末端側のループ構造が重要な役割を果すことが示唆された。
2)栄養飢餓ストレス応答の正の調節因子であるo^Sの発現をH-NSが負に制御するという新しい現象を明らかにした。これは転写段階ではなく、翻訳と翻訳産物の安定性制御の各段階をH-NSが負に制御することで行われている。
II DnaJアナログであるCbpAの機能解析
1)cbpA欠失変異株を構築し、その表現型を調べた。cbpAの単独欠失変異は野生株とほとんど変らない生育を見せるが、cbpA/dnaJ二重変異株は生育温度領域が著しく狭い、セプタム形成の異常に伴う細胞の伸長、炭素源枯渇に伴う生存率の低下等の表現型が観察された。従ってCbpAはDnaJと同様の生理的機能を保持していると考えられる。
2)CbpAの発現がo^S依存的に栄養飢餓ストレスに応答することを見いだした。このことから大腸菌は2種類のDnaJ様シャペロンをストレスの種類に応じて使い分けているのではないかと推測した。
Grant number：05680590 1993
科学研究費助成事業 一般研究(C)
上口 智治
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2100000 （ Direct Cost: \2100000 ）
1.大腸菌湾曲DNA結合タンパク質H-NSの機能解析
(1)H-NSによって負の転写制御を受けるproUオペロンの脱抑制を指標にして、hns遺伝子に起きた20種類のミスセンス変異と5種類のナンセンス変異を分離した。hns変異の示す多面的な表現型をもとにして、これらの変異が5つのクラスに分類できることが分かった。代表的な変異については変異H-NSの精製を行い、生化学的解析を行いつつある。既に予備的な解析から、DNAへの結合にはN末端約2/3があればよいが、C末端側の変異によってDNA結合能の低下をきたすことが分かっている。また殆の変異はC末端側に集中していたが、β-グリコシドの資化性に変化をきたす変異のみはN末端側に起きるという興味深い結果を得ている。
(2)培地pHによって制御を受けるグルタミン酸デカルボキシラーゼの発現が、中性pH領域ではH-NSによって強く抑制されることを見いだした。
2.新たに見いだした大腸菌湾曲DNA結合タンパク質CbpAとCbpBの解析
(1)CbpAをコードする遺伝子cbpAをクローン化し、遺伝子構造を明かにした。CbpAの一次構造は大腸菌の分子シャペロンであるDnaJと高い相同性をもち、分子遺伝学的解析からDnaJと同じ機能をもつ、構造的/機能的アナログであると結論した。大腸菌において、同一機能をもつ複数の分子シャペロンが見いだされたのはこれがはじめてであり、当該分野の研究において重要な発見であるといえる。
(2)CbpBはKornbergらによって、大腸菌oriC領域に結合するタンパク質として見いだされたRobタンパク質と同一であることを証明した。更にcbpB遺伝子の発現を解析したところ、cbpBは定常期特異的なシグマ因子であるRpoSによって、生育定常期並びに炭素源やリン酸源の枯渇に伴ってその発現が誘導されることを見いだした。
3.分裂酵母における湾曲DNA結合タンパク質の解析
分裂酵母から湾曲DNAに対して優先的に結合する分子量43kDのタンパク質を精製し、遺伝子構造を明かにした。四分子解析を行ったところ、この遺伝子は生育には必須ではないことが分かった。現在欠失変異株の表現型解析を行っている。
Plant Developmental Biology
2021
The World of Genes
2021
Plant Physiology 1
2021
Applied Plant Molecular Biology
2021
Applied Plant Molecular Biology
2021
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遺伝子の世界
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植物機能学I
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植物機能学１
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科学技術と生活
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特定非営利活動法人「学習障害児・者の教育と自立の保障をすすめる会」 2022.10 - 2023.1
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Role(s)：Lecturer
特定非営利活動法人「学習障害児・者の教育と自立の保障をすすめる会」 2021.10 - 2022.1
