Updated on 2024/04/02
博士（工学） （ 2006.9 東京大学 ）
Others / Others / Chemistry Related to Living Body
PRESTO, JST
2022.10 - 2026.3
Country：Japan
Visiting Scholar, The Scripps Research Institute
2019.7 - 2020.1
Country：Japan
PRESTO, JST
2014.10 - 2018.3
Country：Japan
名古屋大学大学院工学研究科准教授
2013.2
Country：Japan
名古屋大学大学院工学研究科講師
2011.5 - 2013.1
Country：Japan
名古屋大学大学院工学研究科助教
2007.4 - 2011.4
Country：Japan
日本学術振興会特別研究員(PD)
2006.10 - 2007.3
Country：Japan
The University of Tokyo Graduate School, Division of Engineering Department of Chemistry and Biotechnology
2004.4 - 2006.9
Country： Japan
The University of Tokyo Graduate School, Division of Engineering Department of Chemistry and Biotechnology
2002.4 - 2004.3
Country： Japan
The University of Tokyo Faculty of Engineering Department of Chemistry and Biotechnology
1998.4 - 2002.3
Country： Japan
The Chemical Society of Japan
The Society of Polymer Science, Japan
光化学協会
核酸化学会
高分子学会東海支部 東海高分子研究会 代表幹事
2020.4 - 2021.3
高分子学会東海支部 東海高分子研究会 庶務幹事
2016.4 - 2017.3
高分子学会 高分子編集委員会 委員
2015.6 - 2017.5
化学グランプリ 二次選考運営委員
2015 - 2016
日本化学会生体機能関連化学部会 若手代表幹事
2013.4 - 2014.3
SPSJ Science Award 2022
2023.5 The Society of Polymer Science, Japan Development of Supramolecular Materials Based on Artificial Nucleic Acids
Hiromu Kashida
The Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology: The Young Scientists' Prize
2017.4 Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Award for Encouragement of Research in Polymer Science
2015.5 The Society of Polymer Science, Japan
The Chemical Society of Japan Award for Young Chemists
2014.3 The Chemical Society of Japan
Outstanding Oral Presentation Award
2013.11 The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
赤崎賞
2012.3 名古屋大学
講演賞
2011.9 第５回バイオ関連化学シンポジウム
若手研究者奨励講演賞
2011.7 第２１回バイオ高分子研究会シンポジウム
Best Oral Presentation by a Young Scientist
2011.6 XVth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components
PCCP Prize
2011.3 Royal Society of Chemistry, PCCP (Physical Chemistry Chemical Physics) and Faraday Discussion
Photosensitization of TiO2 electrodes immobilized with chiral plasmonic Au nanocolloids by circularly polarized light irradiation Invited Reviewed
Tatsuya Kameyama, Shuji Isogawa, Kazutaka Akiyoshi, Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma, Tsukasa Torimoto
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS Vol. 160 ( 9 ) page： 094709 2024.3
Kashida, H; Azuma, H; Sotome, H; Miyasaka, H; Asanuma, H
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION Vol. 63 ( 14 ) page： e202319516 2024.2
Kashida Hiromu, Ito Yuka, Kakuta Takahiro, Ogoshi Tomoki, Asanuma Hiroyuki
CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL Vol. 29 ( 22 ) page： e202300182 2023.4
Murayama Keiji, Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki
ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY Vol. 20 ( 20 ) page： 4115 - 4122 2022.5
Xeno nucleic acids (XNAs) having non-ribose scaffolds with unique supramolecular properties Reviewed
Asanuma Hiroyuki, Kamiya Yukiko, Kashida Hiromu, Murayama Keiji
CHEMICAL COMMUNICATIONS Vol. 58 ( 25 ) page： 3993 - 4004 2022.3
Makino Koki, Susaki Etsuo A., Endo Motomu, Asanuma Hiroyuki, Kashida Hiromu
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY Vol. 144 ( 4 ) page： 1572 - 1579 2022.2
Pseudo Base Pairs that Exhibit High Duplex Stability and Orthogonality through Covalent and Non-covalent Interactions Invited Reviewed
Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki
JOURNAL OF SYNTHETIC ORGANIC CHEMISTRY JAPAN Vol. 79 ( 11 ) page： 1013 - 1019 2021.11
Kashida Hiromu, Nishikawa Keiji, Ito Yuka, Murayama Keiji, Hayashi Ichiyo, Kakuta Takahiro, Ogoshi Tomoki, Asanuma Hiroyuki
CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL Vol. 27 ( 59 ) page： 14582 - 14585 2021.10
Perylene-Cy3 FRET System to Analyze Photoactive DNA Structures Reviewed
Kawai Hayato, Doi Tetsuya, Ito Yuka, Kameyama Tatsuya, Torimoto Tsukasa, Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki
CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL Vol. 27 ( 50 ) page： 12845 - 12850 2021.9
Takahashi Hiromi, Yasui Takao, Kashida Hiromu, Makino Koki, Shinjo Keiko, Liu Quanli, Shimada Taisuke, Rahong Sakon, Kaji Noritada, Asanuma Hiroyuki, Baba Yoshinobu
NANOTECHNOLOGY Vol. 32 ( 25 ) 2021.6
A helical amplification system composed of artificial nucleic acids Reviewed
Kashida Hiromu, Nishikawa Keiji, Shi Wenjing, Miyagawa Toshiki, Yamashita Hayato, Abe Masayuki, Asanuma Hiroyuki
CHEMICAL SCIENCE Vol. 12 ( 5 ) 2021.2
Kashida Hiromu, Kawai Hayato, Azuma Hidenori, Araki Yasuyuki, Wada Takehiko, Asanuma Hiroyuki
CHEMPHOTOCHEM Vol. 5 ( 2 ) page： 167 - 172 2021.2
Preparation of artificial hexaplex composed of non-natural nucleic acid Reviewed
Koki Makino, Yuhei Hattori, Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma
CURRENT PROTOCOLS 2021
Kamiya, Y; Satoh, T; Kodama, A; Suzuki, T; Murayama, K; Kashida, H; Uchiyama, S; Kato, K; Asanuma, H
COMMUNICATIONS CHEMISTRY Vol. 3 ( 1 ) 2020.11
Kashida Hiromu, Azuma Hidenori, Maruyama Ryoko, Araki Yasuyuki, Wada Takehiko, Asanuma Hiroyuki
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION Vol. 59 ( 28 ) page： 11360 - 11363 2020.7
Chen Yanglingzhi, Murayama Keiji, Kashida Hiromu, Kamiya Yukiko, Asanuma Hiroyuki
CHEMICAL COMMUNICATIONS Vol. 56 ( 40 ) page： 5358 - 5361 2020.5
Nanometer Accuracy in Cryogenic Far-Field Localization Microscopy of Individual Molecules Reviewed
Furubayashi Taku, Ishida Keita, Kashida Hiromu, Nakata Eiji, Morii Takashi, Matsushita Michio, Fujiyoshi Satoru
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS Vol. 10 ( 19 ) page： 5841 - 5846 2019.10
Kashida Hiromu, Kokubo Yuta, Makino Koki, Asanuma Hiroyuki
ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY Vol. 17 ( 28 ) page： 6786 - 6789 2019.7
Inagaki Masahito, Uematsu Ryohei, Mizutani Tatsuya, Unabara Daisuke, Araki Yasuyuki, Sakamoto Seiji, Kashida Hiromu, Nishijima Masaki, Asanuma Hiroyuki, Inoue Yoshihisa, Wada Takehiko
CHEMISTRY LETTERS Vol. 48 ( 4 ) page： 341 - 344 2019.4
Miyoshi Yuichi, Ohtsuki Takashi, Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki, Watanabe Kazunori
PLOS ONE Vol. 14 ( 1 ) 2019.1
Photo-regulatable DNA isothermal amplification by template-mediated ligation Reviewed
Cheng Bohao, Kashida Hiromu, Shimada Naohiko, Maruyama Atsushi, Asanuma Hiroyuki
CHEMICAL COMMUNICATIONS Vol. 55 ( 8 ) page： 1080 - 1083 2019.1
The Use of Serinol Nucleic Acids as Ultrasensitive Molecular Beacons
Murayama Keiji, Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki
NON-NATURAL NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS Vol. 1973 page： 261 - 279 2019
Kashida Hiromu, Kawai Hayato, Maruyama Ryoko, Kokubo Yuta, Araki Yasuyuki, Wada Takehiko, Asanuma Hiroyuki
COMMUNICATIONS CHEMISTRY Vol. 1 2018.12
The DNA Duplex as an Aqueous One-Dimensional Soft Crystal Scaffold for Photochemistry Invited Reviewed
Asanuma Hiroyuki, Murayama Keiji, Kamiya Yukiko, Kashida Hiromu
BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN Vol. 91 ( 12 ) page： 1739 - 1748 2018.12
Bifacial nucleobases for hexaplex formation in aqueous solution Reviewed
H. Kashida, Y. Hattori, K. Tazoe, T. Inoue, K. Nishikawa, K. Ishii, S. Uchiyama, H. Yamashita, M. Abe, Y. Kamiya, H. Asanuma
J. Am. Chem. Soc. Vol. 140 ( 27 ) page： 8456 - 8462 2018.7
Chaperone polymer-assisted, photo-driven DNA strand displacement Reviewed
B. Cheng, H. Kashida, N. Shimada, A. Maruyama, H. Asanuma
ChemBioChem Vol. 18 ( 16 ) page： 1568 - 1572 2017.8
H. Kashida, A. Kurihara, H. Kawai, H. Asanuma
Nucleic Acids Res. Vol. 45 ( 11 ) page： e105 2017.6
Development of Pseudo Base-Pairs on d-Threoninol which Exhibit Various Functions Invited Reviewed
H. Kashida, H. Asanuma
Bull. Chem. Soc. Jpn. Vol. 90 ( 5 ) page： 475 - 484 2017.5
Design of photofunctional oligonucleotides by copolymerization of natural nucleobases with base surrogates prepared from acyclic scaffolds Invited Reviewed
H. Asanuma, K. Murayama, Y. Kamiya, H. Kashida
Polymer J. Vol. 49 ( 3 ) page： 279 - 289 2017.3
DNA二重鎖による色素会合体の精密位置配向制御と光化学への展開 Invited
浅沼浩之、樫田啓
固体物理 Vol. 52 ( 3 ) page： 149-158 2017
Development of Pseudo Base Pairs Which Show High DNA Duplex Stabilities and Orthogonality Invited Reviewed
Kashida, H; Asanuma, H
KOBUNSHI RONBUNSHU Vol. 74 ( 4 ) page： 257 - 264 2017
Strand-invading linear probe combined with unmodified PNA Reviewed
H. Asanuma, R. Niwa, M. Akahane, K. Murayama, H. Kashida, Y. Kamiya
Bioorg. Med. Chem. Vol. 24 page： 4129-4137 2016.9
Faint electric treatment-induced rapid endosomal escape for efficient delivery of functional macromolecules into the cytoplasm Reviewed
M. Hasan, A. Nishimoto, T. Ohgita, S. Hama, H. Kashida, H. Asanuma, K. Kogure
J. Control Release Vol. 228 page： 20-25 2016
Acyclic artificial nucleic acids with phosphodiester bonds exhibit unique functions" Reviewed
H. Kashida, K. Murayama, H. Asanuma
Polymer J. Vol. 48 page： 781-786 2016
Visible Light-Triggered Crosslinking of DNA Duplex by Reversible [2+2] Photocycloaddition of Styrylpyrene Reviewed
T. Doi, H. Kawai, K. Murayama, H. Kashida, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 22 page： 10533-10538 2016
A stem-less probe using spontaneous pairing between Cy3 and quencher for RNA detection Reviewed
H. Kashida, K. Morimoto, H. Asanuma
Sci. Technol. Adv. Mater. Vol. 17 page： 267-273 2016
新規人工核酸SNAを用いたRNAイメージング Invited
樫田啓、村山恵司、浅沼浩之
生体の科学 Vol. 66 ( 2 ) page： 145-150 2015
Ultrasensitive Molecular Beacon Designed with Totally Serinol Nucleic Acid (SNA) for Monitoring mRNA in Cells Reviewed
K. Murayama, Y. Kamiya, H. Kashida, H. Asanuma
ChemBioChem Vol. 16 ( 9 ) page： 1298-1301 2015
Efficiency of [2+2] photodimerization of various stilbene derivatives within the DNA duplex scaffold Reviewed
T. Doi, H. Kashida, H. Asanuma
Org. Biomol. Chem. Vol. 13 ( 15 ) page： 4430-4437 2015
Acyclic L-threoninol nucleic acid (L-aTNA) with suitable structural rigidity cross-pairs with DNA and RNA Reviewed
K. Murayama, H. Kashida, H. Asanuma
Chem. Commun. Vol. 51 ( 30 ) page： 6500-6503 2015
Molecular design of Cy3 derivative for highly sensitive in-stem molecular beacon and its application to the wash-free FISH Reviewed
H. Kashida, T. Osawa, K. Morimoto, Y. Kamiya, H. Asanuma
Bioorg. Med. Chem. Vol. 23 ( 8 ) page： 1758-1762 2015
Highly Sensitive and Robust Linear Probe for Detection of mRNA in Cells Reviewed
H. Asanuma, M. Akahane, R. Niwa, H. Kashida, Y. Kamiya
Angew. Chem. Int. Ed. Vol. 54 ( 14 ) page： 4315-4319 2015
Hetero-Selective DNA-like Duplex Stabilized by Donor-Acceptor Interaction Reviewed
T. Doi, T. Sakibara, H. Kashida, Y. Araki, T. Wada, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 21 page： 15974-15980 2015
Terminus-free siRNA prepared by photo-crosslinking activated via slicing by Ago2 Reviewed
Y. Kamiya, K. Iishiba, T. Doi, K. Tsuda, H. Kashida, H. Asanuma
Biomater. Sci. Vol. 3 page： 1534-1538 2015
DNA二重鎖を足場とした配向依存的FRET Invited
浅沼浩之、栗原綾子、樫田啓
光化学 Vol. 45 page： 146-147 2014
De Novo Design of Functional Oligonucleotides with Acyclic Scaffolds Reviewed
H. Asanuma, H. Kashida, Y. Kamiya
Chem. Rec. Vol. 14 ( 6 ) page： 1055-1069 2014
Enhancement of Stability and Activity of siRNA by Terminal Substitution with Serinol Nucleic Acid (SNA) Reviewed
Y. Kamiya, J. Takai, H. Ito, K. Murayama, H. Kashida, H. Asanuma
ChemBioChem Vol. 15 ( 17 ) page： 2549-2555 2014
Selective labeling of mature RISC using siRNA carrying fluorophore-quencher pair Invited Reviewed
Y. Kamiya, A. Ito, H. Ito, M. Urushihara, J. Takai, T. Fujii, X.G. Liang, H. Kashida, H. Asanuma
Chem. Sci. Vol. 4 page： 4016-4021 2013
The "sugar-deficient" G-quadruplex: incorporation of aTNA in quadruplex structures Invited Reviewed
J. Zhou, K. Murayama, S. Amrane, H. Kashida, A. Bourdoncle, H. Asanuma, J. L. Mergny
Chem. Sci. Vol. 4 page： 3693-3698 2013
Highly stable duplex formation by artificial nucleic acids aTNA and SNA with acyclic scaffolds Invited Reviewed
K. Murayama, Y. Tanaka, T. Toda, H. Kashida, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 19 page： 14151-14158 2013
p-Stilbazole moieties as artificial base pairs for photocrosslinking of DNA duplex Reviewed
H. Kashida, T. Doi, T. Sakakibara, T. Hayashi, H. Asanuma
J. Am. Chem. Soc. Vol. 135 page： 7960-7966 2013
Evaluation of intrinsic spectroscopic properties of chromophore assemblies by shielding with cyclohexyl base pairs within a DNA duplex Invited Reviewed
H. Kashida, N. Higashiyama, T. Kato, H. Asanuma
Bioorg. Med. Chem. Vol. 21 ( 20 ) page： 6191-6197 2013
Development of a robust model system of FRET using base-surrogates tethering fluorophores for strict control of their position and orientation within DNA duplex Reviewed
T. Kato, H. Kashida, H. Kishida, H. Yada, H. Okamoto, H. Asanuma
J. Am. Chem. Soc. Vol. 135 page： 741-750 2013
Highly Stable Duplex Formation by Artificial Nucleic Acids Acyclic Threoninol Nucleic Acid (aTNA) and Serinol Nucleic Acid (SNA) with Acyclic Scaffolds Reviewed
K. Murayama, Y. Tanaka, T. Toda, H. Kashida, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 19 ( 42 ) page： 14151-14158 2013
SNA：配列設計でらせん構造が制御可能な核酸アナログ
浅沼浩之、村山恵司、樫田啓
高分子 Vol. 62 page： 513-514 2013
Design of an Artificial Functional Nanomaterial with High Recognition Ability Reviewed
X.G. Liang, T. Mochizuki, T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
Natural Computing Vol. 11 page： 231-238 2012
Reversed assembling of dyes in RNA duplex compared with those in DNA Reviewed
T. Fujii, M. Urushihara, H. Kashida, H. Ito, X.G. Liang, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 18 page： 13304-13313 2012
Bulge-like asymmetric hetero dye-clustering in DNA duplex results in efficient quenching of background emission based on the maximized excitonic interaction Reviewed
T. Fujii, Y. Hara, T. Osawa, H. Kashida, X.G. Liang, Y. Yoshida, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 18 page： 10865-10872 2012
Quencher-free molecular beacon tethering 7-hydroxycoumarin detects targets through protonation/deprotonation Reviewed
H. Kashida, K. Yamaguchi, Y. Hara, H. Asanuma
Bioorg. Med. Chem. Vol. 20 page： 4310-4315 2012
Preparation of supramolecular chromophoric assemblies using a DNA duplex Reviewed
H. Kashida, H. Asanuma
Phys. Chem. Chem. Phys. Vol. 14 page： 7196-7204 2012
Quencher-free linear probe with multiple fluorophores on acyclic scaffold Reviewed
H. Asanuma, M. Akahane, N. Kondo, T. Osawa, T. Kato, H. Kashida
Chem. Sci. page： accepted. 2012
Coherent Interactions of Dyes Assembled on DNA Invited Reviewed
H. Asanuma, T. Fujii, T. Kato, H. Kashida
J. Photochem. Photobiol. C Vol. 13 page： 1065-1084 2012
Polycation-chaperoned in-stem molecular beacon system Reviewed
H. Asanuma, T. Osawa, H. Kashida, T. Fujii, X.G. Liang, K. Niwa, Y. Yoshida, N. Shimada, A. Maruyama
Chem. Commun. Vol. 48 page： 1760-1762 2012
Detection of three-base deletion by exciplex formation with perylene derivatives Reviewed
H. Kashida, N. Kondo, K. Sekiguchi, H. Asanuma
Chem. Commun. Vol. 47 page： 6404-6406 2011
Cationic dye-triplet as unique glue that can connect full-matched termini of the duplexes Reviewed
H. Kashida, T. Hayashi, T. Fujii, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 17 page： 2614-2622 2011
Control of the Chirality and Helicity of Oligomers of Serinol Nucleic Acid (SNA) by Sequence Design." Reviewed
H. Kashida, K. Murayama, T. Toda, H. Asanuma
Angew. Chem. Int. Ed. Vol. 50 page： 1285-1288 2011
Design of a Functional Nanomaterial with Recognition Ability for Constructing Light-Driven Nanodevices Reviewed
X. G. Liang, T. Mochizuki, T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
LCNS Vol. 6518 page： 112-122 2011
Cyclohexyl base pairs stabilize duplexes and intensify pyrene fluorescence by shielding it from natural base pairs Reviewed
H. Kashida, K. Sekiguchi, N. Higashiyama, T. Kato, H. Asanuma
Org. Biomol. Chem. Vol. 9 page： 8313-8320 2011
Insulator base pairs for lighting-up perylenediimide in a DNA duplex. Reviewed
H. Kashida, K. Sekiguchi, H. Asanuma.
Chem. Eur. J. Vol. 16 page： 11554-11557 2010
Coherent Quenching of a Fluorophore for the Design of a Highly Sensitive In-Stem Molecular Beacon Reviewed
Y. Hara, T. Fujii, H. Kashida, K. Sekiguchi, X. G. Liang, K. Niwa, T. Takase, Y. Yoshida, H. Asanuma.
Angew. Chem. Int. Ed. Vol. 49 page： 5502-5506 2010
Accumulation of fluorophores into DNA duplexes to mimic the properties of quantum dots Reviewed
J. Am. Chem. Soc. Vol. 132 page： 6223-6230 2010
An efficient FRET between pyrene and perylene assembled in a DNA duplex and its potential for discriminating single base changes. Reviewed
H. Kashida, T. Takatsu, K. Sekiguchi, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 16 page： 2479-2486 2010
Unexpectedly stable artificial duplex from flexible acyclic threoninol Reviewed
H. Asanuma, T. Toda, K. Murayama, X. G. Liang, H. Kashida
J. Am. Chem. Soc. Vol. 132 page： 14702-14703 2010
Rational design of functional DNA with a non-ribose acyclic scaffold Reviewed
H. Kashida, X. G. Liang, H. Asanuma
Curr. Org. Chem. Vol. 13 page： 1065-1084 2009.7
Modulation of pKa of Brooker's Merocyanine by DNA Hybridization Reviewed
H. Kashida, K. Sano, Y. Hara, H. Asanuma.
Bioconjugate Chem. Vol. 20 page： 258-265 2009.2
*Positively charged base surrogate for highly stable “base-pairing" through electrostatic and stacking interactions Reviewed
H. Kashida, H. Ito, T. Fujii, T. Hayashi, H. Asanuma
J. Am. Chem. Soc. Vol. 131 page： 9928-9930 2009
Analysis of Coherent Heteroclustering of Different Dyes by Use of Threoninol-Nucleotides for Comparison with the Molecular Exciton Theory Reviewed
T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
Chem. Eur. J. Vol. 15 page： 10092-10102 2009
第３の塩基対をつくる
樫田啓
化学 Vol. 11 page： 70-71 2009
Efficient energy transfer from pyrene to perylene assembled inside DNA duplex
H. Kashida, T. Takatsu, H. Asanuma
Nucleic Acids Symp. Ser. Vol. 53 page： 29-30 2009
*In-Stem Molecular Beacon containing a Pseudo Base Pair of Threoninol Nucleotides for Removal of Background Emission. Reviewed
H. Kashida, T. Takatsu, T. Fujii, K. Sekiguchi, X. G. Liang, K. Niwa, T. Takase, Y. Yoshida, H. Asanuma.
Angew. Chem. Int. Ed. Vol. 48 page： 7044-7047 2009
Postsynthetic modification of DNA via threoninol on a solid support by means of allylic protection. Reviewed
H. Asanuma, Y. Hara, A. Noguchi, K. Sano, H. Kashida
Tetrahedron Lett. Vol. 49 page： 5144-5146 2008.7
Threoninol as a Scaffold of Dyes (Threoninol-nucleotide) and Their Stable Interstrand Clustering in Duplexes. Reviewed
H. Kashida, T. Fujii, H. Asanuma
Org. Biomol. Chem. Vol. 6 page： 2892-2899 2008.6
Preparation of coherent hetero clusters with threoninol scaffold
T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
Nucleic Acids Symp. Ser. Vol. 52 page： 699-700 2008
Incorporation of cationic dyes into DNA for distinct stabilization of duplex
H. Kashida, H. Itoh, T. Fujii, H. Asanuma.
Nucleic Acids Symp. Ser. Vol. 52 page： 701-702 2008
Detection of genetic polymorphisms with high sensitivityby DNA–perylene conjugate Reviewed
H. Kashida, T. Takatsu, H. Asanuma
Tetrahedron Lett. Vol. 48 page： 6759-6762 2007.7
Development of high-sensitive DNA probe by using perylene.
H. Kashida, T. Takatsu, H. Asanuma
Nucleic Acids Symp. Ser. Vol. 51 page： 279-280 2007
Preparation of "comb-type" hetero aggregates by DNA-dye conjugation.
T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
Nucleic Acids Symp. Ser. Vol. 51 page： 277-278 2007
Construction of novel dye aggregates based on "comb-type" sequence.
H. Kashida, T. Fujii, H. Asanuma
Nucleic Acids Symp. Ser. Vol. 51 page： 11-12 2007
2',6'-Dimethylazobenzene as an efficient and thermo-stable photo-regulator for the photoregulation of DNA hybridization. Reviewed
H. Nishioka, X. G. Liang, H. Kashida, H. Asanuma
Chem. Commun. page： 4354-4356 2007
Exciplex formation between pyrene and N,N-dimethylaniline in DNA for the detection of one-base deletion Reviewed
H. Kashida, M. Komiyama, H. Asanuma
Chem. Lett. Vol. 35 ( 8 ) page： 934-035 2006.8
Covalent incorporation of methyl red dyes into double-stranded DNA for their ordered clustering Reviewed
H. Kashida, M. Tanaka, S. Baba, T. Sakamoto, G. Kawai, H. Asanuma, M. Komiyama
Chem. --Eur. J. Vol. 12 ( 3 ) page： 777-784 2006.1
Insertion of two pyrene moieties into oligodeoxyribonucleotides for the efficient detection of deletion polymorphisms Reviewed
H. Kashida, H. Asanuma, M. Komiyama
Chem. Commun. ( 26 ) page： 2768-2770 2006.1
Enhancement of RNA cleavage activity of 10-23 DNAzyme by covalently introduced intercalator Reviewed
H. Asanuma, H. Hayashi, J. Zhao, X. G. Liang, A. Yamazawa, T. Kuramochi, D. Matsunaga, Y. Aiba, H. Kashida, M. Komiyama
Chem. Commun. ( 48 ) page： 5062-5064 2006
Incorporation of methyl group on azobenzene for the effective photo-regulation of hybridization and suppression of thermal isomerization
H. Nishioka, H. Kashida, M. Komiyama, X. G. Liang, H. Asanuma
Nucleic Acids Symp. Ser. Vol. 50 page： 85-86 2006
Interstrand H-aggregation of cationic dyes for narrowing the absorption spectra and stabilizing the duplex Reviewed
H. Kashida, H. Asanuma, M. Komiyama
Supramol. Chem. Vol. 16 ( 6 ) page： 459-464 2004.9
Alternating hetero H aggregation of different dyes by interstrand stacking from two DNA-dye conjugates
H. Kashida, H. Asanuma, M. Komiyama
Angew. Chem. Int. Ed. Vol. 43 ( 47 ) page： 6522-6525 2004
光機能性DNAの設計と応用
浅沼浩之、樫田啓
高分子加工 Vol. 53 ( 1 ) page： 37-43 2004
NMR study on the photoresponsive DNA tethering an azobenzene. Assignment of the absolute configuration of two diastereomers and structure determination of their duplexes in the trans-form Reviewed
X. G. Liang, H. Asanuma, H. Kashida, A. Takasu, T. Sakamoto, G. Kawai, M. Komiyama
J. Am. Chem. Soc. Vol. 125 ( 52 ) page： 16408-16415 2003.12
DNA-dye conjugates for controllable H* aggregation Reviewed
H. Asanuma, K. Shirasuka, T. Takarada, H. Kashida, M. Komiyama
J. Am. Chem. Soc. Vol. 125 ( 8 ) page： 2217-2223 2003.12
DNA-Naphthyl Red conjugate as a visualizing probe of DNA hybridization Reviewed
H. Asanuma, H. Kashida, X. G. Liang, M. Komiyama
Chem. Commun. ( 13 ) page： 1536-1537 2003
Development of a probe DNA which accompanies color change on hybridization
H. Kashida, H. Asanuma, M. Komiyama
Nucleic Acids Res. Suppl. Vol. 3 page： 143-144 2003
シングルセル解析でなにがわかるか
樫田啓、浅沼浩之（ Role： Joint author）
化学同人 2020.7
生体材料化学
浅沼浩之、樫田啓、神谷由紀子（ Role： Joint author）
コロナ社 2015.12
化学便覧応用化学編第７版「DNA工学」
樫田啓（ Role： Sole author）
丸善出版 2014
DNA Conjugates and Sensors
H. Kashida, H. Asanuma（ Role： Joint author）
RSC Publishing 2012
バイオチップ実用化ハンドブック・人工核酸を利用したプローブDNAの調製と遺伝子多型検出
樫田啓、浅沼浩之（ Role： Joint author）
エヌ・ティー・エス 2010
人工核酸を基盤とする超分子材料の開発 Invited
樫田啓
第72回高分子年次大会 2023.5.26
人工核酸を利用した機能性材料の開発 Invited
樫田啓
第４回発動分子科学サロン
核酸の多様化を⽬指した⼈⼯核酸の開発 Invited
樫田啓
第９回バイオ関連化学シンポジウム若手フォーラム
Development of fluorescent probes detecting RNA Invited International conference
H. Kashida
Pacifichem2021 2021.12.21
Precise control of dye interaction by using D-threoninol scaffold Invited International conference
H. Kashida
11th International Conference on Porphyrins & Phthalocyanines (ICPP-11) 2021.7.3
細胞イメージングに向けた人工核酸の開発 Invited
樫田啓
第8回卓越・先端・次世代研究シンポジウム 2021.6.23 名古屋大学高等研究院
核酸の化学修飾とその応用 Invited
樫田啓
第69回高分子討論会
単純な構造を持つ核酸の開発及びその応⽤ Invited
樫田啓
第5回生体分子科学シンポジウム
単純な核酸をつくる・つかう Invited
樫田啓
第18回FIT-MEセミナー
人工核酸を利用した新規機能性材料・超分子の開発 Invited
樫田啓
生体機能関連化学部会若手の会 第30回サマースクール
新規人工核酸SNAを用いた生細胞内RNAイメージング Invited
樫田啓
日本化学会第98春季年会
Orientation Dependent FRET as a Tool to Analyze DNA Structures Invited International conference
H. Kashida
INTERNATIONAL CONGRESS ON PURE & APPLIED CHEMISTRY 2018 (ICPAC2018)
DNAはどこまで化学的に入れ換え可能か? Invited
樫田啓
東京大学化学生命工学科2017年度談話会
Analysis of energy transfer between dyes by using DNA scaffold Invited
Hiromu Kashida
Chemical synthesis of artificial DNA for functional materials Invited
Hiromu Kashida
Molecular design of pseudo base pairs for functionalization of DNA Invited International conference
H. Kashida
Annual Spring Meeting of Polymer Society of Korea
Development of functional DNA materials by using acyclic scaffolds Invited International conference
H. Kashida
CBC SEMINAR
Synthesis of Serinol Nucleic Acid (SNA) Exhibiting Unique Functions Invited
H. Kashida
10th Anniversary International Symposium on Nanomedicine (ISNM2016)
非環状骨格を持つ機能性疑似塩基対の開発 Invited
樫田啓
第47回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
新規人工核酸SNAを用いた生細胞内RNAイメージング
樫田 啓
日本化学会第96春季年会
Development of a robust FRET system for structural analyses of DNA duplexes International conference
H. Kashida, A. Kurihara, H. Asanuma
BIT's 6th World Gene Convention-2015
Design of functional DNA by using pseudo base-pair
Hiromu Kashida
Orientation-dependent FRET system for structural analyses of nucleic acids
Highly-sensitive RNA detection by using In Stem Molecular Beacon International conference
H. Kashida
China/Japan Young Chemists Forum
機能性核酸材料の創製を目指した人工塩基対の開発
樫田啓
第63回高分子学会年次大会
非天然分子による疑似塩基対を利用した機能性核酸の創製
樫田啓
日本化学会第94春季年会
人工塩基対の開発による機能性核酸の創製
樫田啓
九州地区高分子若手研究会・夏の講演会
Preparation of novel artificial base pairs for functionalization of DNA
H. Kashida
The First International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2012)
Ru錯体を利用した部位特異的DNA光架橋法の開発
樫田啓, 東秀憲, 五月女光, 宮坂博, 浅沼浩之
日本化学会第104春季年会 2024.3.18 日本化学会
セリノール核酸によるナノ構造体形成を利用したキラ ル増幅
樫田啓, 西川慧史, 浅沼浩之
第72回高分子討論会 高分子学会
二重鎖形成を利用した人工核酸の配列解析
樫田啓, 香川恵未莉, 清水優香, 愛場雄一郎,荘司長三, 浅沼浩之
第17回バイオ関連化学シンポジウム 日本化学会
ペリレンーCy3間FRETを利用したDNA構造解析
樫田啓, 河合隼人, 浅沼浩之
2023年光化学討論会 光化学協会
人工核酸ナノ構造体を利用したキロプティカルシグナル発現
樫田啓, 西川慧史, 浅沼浩之
第33回バイオ・高分子シンポジウム 高分子学会バイオ・高分子研究会
二重鎖形成を利用した人工核酸配列解析法の開発
樫田啓, 香川恵未莉, 清水優香, 戸谷恵介,愛場雄一郎,荘司長三, 浅沼浩之
日本化学会第103春季年会 日本化学会
人工核酸SNAナノ構造体を利用したキラル増幅
樫田 啓, 西川慧史, 角田貴洋, 生越友樹, 浅沼浩之
第14回バイオ関連化学シンポジウム
人工核酸を利用した六重鎖の開発
樫田 啓, 服部悠平, 浅沼浩之
第30回バイオ・高分子シンポジウム
人工核酸を利用したキラル増幅系の開発
樫田 啓, 西川慧史, 林 一陽, 角田貴洋, 生越友樹, 浅沼浩之
第69回高分子学会年次大会
Hexaplex formation in aqueous solution
Hiromu Kashida, Yuhei Hattori, Hiroyuki Asanuma
The 12th SPSJ International Polymer Conference (IPC2018)
Hexaplex formation by artificial nucleic acid tethering bifacial nucleobases
Hiromu Kashida, Yuhei Hattori, Kentaro Ishii, Susumu Uchiyama, Hiroyuki Asanuma
ISNAC2018
RNA detection by a stem-less probe using pairing between fluorophores and quenchers International conference
Hiromu Kashida, Kazuhiro Morimoto Hiroyuki Asanuma
23rd International Roundtable on Nucleosides, Nucleotide and Nucleic Acids (IRT2018)
Observation of orientation dependence of FRET by using DNA scaffold International conference
Hiromu Kashida, Ayako Kurihara, Tomohiro Kato, Hiroyuki Asanuma
International Symposium on Photochemistry (27th PhotoIUPAC)
人工核酸を利用した六重鎖の調製
樫田 啓, 服部悠平, 中村健人, 浅沼 浩之
日本化学会第99春季年会
DNAを光反応場として利用した同種色素間エネ ルギー移動の解析
樫田啓, 河合隼人, 荒木保幸, 和田健彦, 浅沼浩之
第11回バイオ関連化学シンポジウム
DNA骨格を利用した同種色素間エネルギー移動の詳細な解析
樫田 啓, 河合隼人, 荒木保幸, 和田健彦, 浅沼 浩之
2017年光化学討論会
安定な色素ペアを利用した高感度RNA検出
樫田 啓, 森本一弘, 浅沼 浩之
日本化学会第97春季年会
Accumulation of dyes into DNA for efficient light-harvesting
Hiromu Kashida, Ryoko Maruyama, Hayato Kawai, Yasuyuki Araki, Takehiko Wada, Hiroyuki Asanuma
The 11th SPSJ International Polymer Conference (IPC 2016)
Development of Artificial Nucleic Acids for Sensitive Detection of RNA in Cell International conference
H. Kashida
NUS-JST(PRESTO) Workshop on BioImaging and Single Cell Analysis
Structural analyses of nicked and gapped DNA duplexes by using orientation dependence of FRET
Hiromu Kashida, Ayako Kurihara, Hiroyuki Asanuma
The 43rd International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2016)
Development of a linear probe tethering Cy3 for RNA detection in cell
ステム構造不要なCy3導入リニアプローブによるRNA検出
樫田 啓, 森本一弘, 浅沼 浩之
第10回バイオ関連化学シンポジウム
DNA骨格を利用したエネルギーマイグレーションの検討
樫田 啓, 丸山 諒子, 河合隼人, 荒木保幸, 和田健彦, 浅沼 浩之
2016年光化学討論会
FRETの距離・配向依存性を利用した核酸構造解析法の開発
樫田 啓, 栗原 綾子, 浅沼 浩之
第26回バイオ・高分子シンポジウム
高効率光捕集系の構築に向けた蛍光色素集積化DNAの調製
樫田 啓, 丸山 諒子, 栗原 綾子, 浅沼 浩之
第65回高分子学会年次大会
DEVELOPMENT OF A ROBUST FRET SYSTEM BY USING D-THREONINOL SCAFOLD International conference
H. Kashida
26th IUPAC International Symposium on Photochemistry
FRETの配向依存性を利用したDNA二重鎖中のGap構造解析
樫田 啓, 栗原綾子, 浅沼浩之
日本化学会第96春季年会
Development of orientation-dependent FRET system for structural analyses of nucleic acids International conference
H. Kashida, A. Kurihara, H. Asanuma
Pacifichem2015
Structural analysis of gapped DNA duplex by using orientation dependent FRET system
Hiromu Kashida, Ayako Kurihara, Hiroyuki Asanuma
The 42nd International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
電荷移動相互作用を利用したヘテロ選択的人工二重鎖形成
樫田 啓、榊原拓海、土居哲也、荒木保幸、和田健彦、浅沼浩之
第64回高分子討論会
配向依存型FRETを利用したDNAのGap構造解析
樫田 啓、栗原綾子、浅沼浩之
第９回バイオ関連化学シンポジウム
DNA structural analysis by using orientation-dependent FRET system
H. Kashida, A. Kurihara, H. Asanuma
Structural analysis of dye-modified DNA duplex by using FRET
H. Kashida, A. Kurihara, H. Asanuma
The 41st International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2014)
DNA二重鎖を利用した配向依存型FRETシステムの開発
樫田啓,加藤智博,栗原綾子,浅沼浩之
第8回バイオ関連化学シンポジウム
Synthesis of Serinol Nucleic Acid (SNA) with unique properties International conference
H. Kashida, K. Murayama, H. Asanuma
The 40th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2013)
Cy3 複数導入インステムモレキュラービーコンによる高感度核酸検出
樫田啓,大澤卓矢,神谷由紀子,浅沼浩之
第23回バイオ・高分子シンポジウム
Development of a robust model system of FRET within DNA duplex International conference
H. Kashida, T. Kato, H. Asanuma
26th International Conference on Photochemistry (ICP 2013)
A Study on FRET System Between Dyes Introduced within DNA Duplex
H. Kashida, T. Kato, H. Kishida, H. Yada, H. Okamoto, H. Asanuma
DNA二重鎖内部へ付加的に導入された色素間のFRET に関する研究
加藤智博,樫田啓,岸田英夫,矢田祐之,岡本博,浅沼浩之
日本化学会第93春季年会
DNA二重鎖を利用した色素会合体のらせん制御
樫田啓、土居哲也、藤井大雅、浅沼浩之
第61回高分子討論会
励起子相互作用を利用した高感度モレキュラービーコンの開発
樫田啓、藤井大雅、原雄一、吉田安子、浅沼浩之
2012年光化学討論会
リン酸アニオンを認識する蛍光性核酸プローブの開発
樫田啓、土居哲也、藤井大雅、浅沼浩之
第6回バイオ関連化学シンポジウム
Design of novel artificial base pairs for the suppression of electron transfer in DNA duplex International conference
H. Kashida, K. Sekiguchi, T. Kato, H. Asanuma
XXIVth IUPAC Symposium on Photochemistry
エキシプレックス発光を利用した三塩基欠失検出モレキュラービーコンの開発
樫田啓,関口康司,浅沼浩之
第22回バイオ・高分子シンポジウム
Effect of chirality of threoninol linker on the stability of DNA duplex International conference
H. Kashida, T. Doi, T. Fujii, H. Asanuma
The 24th International Symposium on Chirality
Design of novel artificial base pairs for the enhancement of fluorescence
H. Kashida, K. Sekiguchi, T. Kato, H. Asanuma
The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
カチオン性色素会合を利用した光機能性DNA グルーの開発
樫田啓,林威光,土居哲也,浅沼浩之
第５回バイオ関連化学シンポジウム
スチルバゾールの光二量化反応を利用したＤＮＡの光架橋
樫田啓、林威光、土居哲也、浅沼浩之
2011年光化学討論会
蛍光色素の高輝度化を目指した新規人工塩基対の開発
樫田啓,関口康司,浅沼浩之
第21回バイオ・高分子シンポジウム
Development of Insulator Base Pairs for the Drastic Enhancement of Quantum International conference
H. Kashida, K. Sekiguchi, H. Asanuma
XVth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components
Strong adhesion between full-matched DNA
H. Kashida, T. Hayashi, T. Fujii, H. Asanuma
DNA 二重鎖の強固な連結を目指したカチオン性人工塩基対の開発
樫田啓・林威光・藤井大雅・浅沼浩之
日本化学会第９１春季年会
DNA dot: Accumulation of fluorophores in DNA duplex for the enhancement of emission International conference
H. Kashida; K. Sekiguchi; H. Asanuma
PACIFICHEM 2010
"Base pairing" of cationic dyes for the stabilization of DNA duplex International conference
H. Kashida; T. Hayashi; T. Fujii; H. Asanuma
PACIFICHEM 2010
Synthesis of novel artificial nucleic acid by using chiral serinol as a linker
H. Kashida, K. Murayama, T. Toda, H. Asanuma
The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
蛍光色素の高輝度化を目指したインスレーター塩基対の開発
樫田 啓、関口 康司、浅沼 浩之
第４回バイオ関連化学シンポジウム
In Stem Molecular Beacon (IS-MB): A Novel Molecular Beacon with Low Background Emission International conference
H. Kashida, T. Takatsu, T. Fujii, K. Sekiguchi, X. G. Liang, Y. Yoshida, H. Asanuma
XVIII International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids
カチオン性色素クラスター形成によるDNA二重鎖の連結
樫田啓・林威光・藤井大雅・浅沼浩之
第２０回バイオ・高分子シンポジウム
カチオン性色素のクラスター形成を利用したDNAグルーの開発
樫田啓・林威光・藤井大雅・浅沼浩之
第５９回高分子年次大会
蛍光色素の量子収率向上を目指した“インスレーター塩基対”の開発（1）高感度蛍光ラベル化剤開発に向けた”インスレーター塩基対”の設計
樫田啓・関口康司・浅沼浩之
日本化学会第90春季年会
Efficient energy transfer from pyrene to perylene assembled inside DNA duplex
The 6th International symposium on Nucleic Acid Chemistry
ステム内部での色素会合を利用した高感度モレキュラービーコンの開発
樫田啓・高津智彦・梁興国・丹羽孝介・高瀬智和・吉田安子・浅沼浩之
第58回高分子討論会
ペリレン－アントラキノン塩基対を利用した高感度In-Stem Molecular Beaconの開発
樫田啓・高津智彦・関口康司・梁興国・丹羽孝介・高瀬智和・吉田安子・浅沼浩之
第24回生体機能関連化学シンポジウム
DNA内部での蛍光色素会合を利用した高感度ラベル化法の開発
樫田啓・関口康司・高津智彦・浅沼浩之
第19回バイオ・高分子シンポジウム
Distinct Stabilization of DNA Duplex by IntroducingCationic Dye Cluster International conference
International Conference on Materials for Advanced Technologies 2009
カチオン性色素による"塩基対"導入によるDNA二重鎖の安定化
樫田 啓・伊藤 栄紘・藤井 大雅・浅沼 浩之
日本化学会第89春季年会
ペリレン導入Threoninol nucleotideを活用した高感度モレキュラービーコンの設計
高津 智彦・丹羽 孝介・高瀬 智和・吉田 安子・梁 興国・樫田 啓・浅沼 浩之
カチオン性色素会合を利用したDNA二重鎖の安定化
樫田啓・伊藤栄紘・藤井大雅・浅沼浩之
第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
Incorporation of cationic dyes into DNA for distinct stabilization of duplex International conference
Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids and 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
Preparation of dye aggregates by means of DNA scaffolds International conference
XXII IUPAC SYMPOSIUM ON PHOTOCHEMISTRY
蛍光色素導入DNAを用いた塩基欠失多型の高感度検出
第18回バイオ・高分子シンポジウム
色素会合を利用したDNA二重鎖の安定化
第57回高分子学会年次大会
メロシアニン系色素導入DNAを用いた新規蛍光プローブの開発
樫田啓・佐野香苗・浅沼浩之
日本化学会第88春季年会
Construction of novel dye aggregates based on"comb-type" sequence International conference
SNAC2007 5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
DNA 二重鎖形成に伴う“くし型”会合を利用したホモ色素クラスターの調製
第22回生体機能関連化学シンポジウム
DNAの二重鎖形成を利用したくし型色素クラスターの調製
樫田啓・藤井大雅・浅沼浩之
第１７回バイオ・高分子シンポジウム
新規配列解析法を利用した機能性PNAアプタマーの開発
2022.10 - 2026.3
科学技術振興機構 さきがけ
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
人工核酸を利用した細胞内タンパク質検出
2020.4 - 2022.3
中谷医工計測技術振興財団 奨励研究
Grant type：Competitive
Grant amount：\2000000 （ Direct Cost: \2000000 ）
核酸の二重鎖形成を利用した生体分子の網羅的解析
2019.4 - 2021.3
旭硝子財団 研究奨励
Grant type：Competitive
Grant amount：\2000000 （ Direct Cost: \2000000 ）
新規人工核酸ＳＮＡを用いた生細胞内ＲＮＡイメージング
2014.10 - 2018.3
さきがけ
Grant type：Competitive
塩基欠失多型を高感度に検出する蛍光性核酸プローブの開発
2012.4 - 2014.3
内藤記念科学奨励金（研究助成）
Grant type：Competitive
人工塩基対形成を利用した高感度モレキュラービーコンの開発
2011.9 - 2012.3
A-STEP FSステージ 探索タイプ
Grant type：Competitive
リン酸アニオンの認識による二重鎖形成検出プローブの開発
2009.10 - 2010.3
立松財団研究助成
Grant type：Competitive
エネルギー移動を利用した遺伝子多型検出の高感度化
2009.4 - 2010.3
H21年度シーズ発掘試験
Grant type：Competitive
Grant number：23H04873 2023.4 - 2028.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Authorship：Coinvestigator(s)
Novel sequencing method for serinol nucleic acid by using hybridization
Grant number：23H02081 2023.4 - 2026.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\18850000 （ Direct Cost: \14500000 、 Indirect Cost：\4350000 ）
蛍光バーコードを利用したインタラクトームイメージング法の開発
Grant number：22K19107 2022.6 - 2024.3
科学研究費助成事業 挑戦的研究(萌芽)
樫田 啓
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\6500000 （ Direct Cost: \5000000 、 Indirect Cost：\1500000 ）
我々は核酸の鎖交換反応を利用することで多数の分子を同時にラベル化する蛍光バーコードの開発に成功した。この蛍光バーコードは蛍光色素の種類や蛍光変化回数を増加させることで、ラベルの種類を指数関数的に増大できるという特長がある。そこで、本研究では蛍光バーコードを利用することで生体分子間相互作用を可視化する手法の開発を目指す。
これまでに人工核酸の鎖交換反応を利用することで、蛍光色が”配列”に従って変化する蛍光バーコードの開発に成功している。本研究では、これを更に発展させることで生体分子間相互作用を可視化することを目指す。具体的には１）蛍光バーコードの拡張、及び２）それを利用した生体分子間相互作用解析について検討を行う予定である。
本年度は１）の蛍光バーコードの拡張において重要となる人工核酸の鎖交換反応の速度論について重点的に解析を行った。具体的には我々が開発した人工核酸であるトレオニノール核酸（aTNA）及びセリノール核酸（SNA）のtoehold長を変化させ、系統的に鎖交換反応の速度を解析した。また、同様の配列をもつDNAとの比較を行った。その結果、人工核酸の鎖交換反応速度もDNA同様のtoehold長依存性を示すものの、低温においてはDNAと比較して反応が若干遅いことがわかった。これは人工核酸が高い二重鎖安定性を示すことに起因すると考えられる。一方、より高温条件下で同様の測定を行ったところ、人工核酸特にaTNAの鎖交換反応が大幅に高速化することが明らかとなった。このことは、aTNAを利用することで温度駆動型の論理回路を開発できることを示唆している。また、蛍光バーコードの蛍光色変化を高速化するためには室温より高温の温度が望ましいことがわかった。更に、aTNAのキラリティに応じて鎖交換反応の直交性を示すことが明らかとなった。
これらの成果は現在論文投稿準備中である。
本研究では２年間の研究期間において、１）蛍光バーコードの拡張、及び２）それを利用した生体分子間相互作用解析について検討を行う予定である。
本年度は１）蛍光バーコードの拡張において重要となる人工核酸の鎖交換反応の速度論的解析について主に検討した。その結果、人工核酸の鎖交換反応速度が温度に大きく依存することを明らかにした。これは蛍光バーコードを拡張する際の最適温度を探索する上で重要な知見である。
以上のことから、本研究はおおむね順調に進展していると判断した。
研究期間最終年度となる次年度は人工核酸の鎖交換回数を増大させることで、蛍光バーコードの更なる拡張を目指す。その際、今年度明らかにした人工核酸の鎖交換反応速度を利用することで、蛍光バーコードの駆動速度を最適化したい。また、蛍光バーコードを抗体に固定化することによる、生体分子間相互作用解析について検討を行う予定である。
Development of Curved Nanowires and Their Application to Nanotechnology
Grant number：22H00331 2022.4 - 2026.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Authorship：Coinvestigator(s)
Detection of biomolecules by using chiral amplification system composed of artificial nucleic acids
Grant number：20H02858 2020.4 - 2023.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Kashida Hiromu
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\17940000 （ Direct Cost: \13800000 、 Indirect Cost：\4140000 ）
In this study, we aimed to develop a chiral amplification system utilizing serinol nucleic acid (SNA). First, we prepared a one-dimensional nano structure by hybridizing achiral SNA strands. When chiral nucleic acid was added, CD intensity drastically increased. Thus, chiral amplification system triggered by duplex formation was successfully developed for the first time. Then we modified SNA nano structures with pyrene. The structure expressed circularly polarized luminescence (CPL) upon the addition of chiral nucleic acids. We also succeeded to develop a chiral amplification system triggered by DNA.
Development of fluorobarcode that can detect multiple biomolecules simultaneously
Grant number：19K22250 2019.6 - 2021.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Kashida Hiromu
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\6500000 （ Direct Cost: \5000000 、 Indirect Cost：\1500000 ）
Fluorescent imaging is one of the most essential tools in biology. However, the number of detectable molecules was severely restricted due to spectral overlaps of fluorophores. In this study, we aimed to prepare fluorescent barcode, in which emission color changes depending on the color sequence. We found that emission color of fluorescent barcode can change in pre-determined order. We also succeeded in multiplexed imaging of polystyrene beads and proteins in cell.
Investigation of dye interaction and preparation of functional pi-assembly figuration by DNA scaffold
Grant number：17H05150 2017.4 - 2019.3
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\6240000 （ Direct Cost: \4800000 、 Indirect Cost：\1440000 ）
Novel method for structural analyses of nucleic acids by using orientation dependent FRET system
Grant number：16H05925 2016.4 - 2020.3
Kashida Hiromu
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\25350000 （ Direct Cost: \19500000 、 Indirect Cost：\5850000 ）
In this study, we aimed to develop a versatile method to analyze double helical structures of nucleic acids by using orientation dependence of Forster resonance energy transfer (FRET). First, we developed another FRET pair for analyses of larger complexes of nucleic acids. We also found that energy transfer between identical chromophores can also be used for structural analyses. Damaged DNA like gapped DNA, A-tract and RNA structures were successfully analyzed by using the developed method. Furthermore, we succeeded in analyses of the interaction between DNA and small molecules by using orientation dependence of FRET.
Development of artificial nucleic acids forming multi-stranded structures
Grant number：16K14031 2016.4 - 2018.3
Kashida Hiromu
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\3770000 （ Direct Cost: \2900000 、 Indirect Cost：\870000 ）
Natural nucleic acids can form a triplex and a quadruplex by forming hydrogen bonds at both sides of purine bases. In this study, we synthesized novel artificial nucleic acids bearing novel nucleobases, which have hydrogen bonding sites at both sides. And we found that a hexaplex was successfully formed by these nucleic acids. The hexaplex was stabilized in the presence of divalent cations and low pH, indicating the potential of the hexaplex as pH and metal ion sensors. Molecular modelling calculation indicated that the hexaplex has a very unique structure with a pore at its center. It could be applied as novel supramolecular motifs and ion channels.
細胞内イメージングに向けた超高感度核酸プローブの開発
2014.4 - 2016.3
科学研究費補助金 新学術領域研究（研究領域提案型・公募研究）
Authorship：Principal investigator
細胞内イメージングに向けた超高感度核酸プローブの開発
2012.4 - 2014.3
科学研究費補助金 新学術領域研究（研究領域提案型・公募研究）
Authorship：Principal investigator
“ＤＮＡドット”を活用した高感度ラベル化法の開発
2010.4 - 2012.3
科学研究費補助金 若手研究(B)
樫田啓
Authorship：Principal investigator
核酸とのコンジュゲーションによる色素会合体調製法の確立
2007.4 - 2009.3
科学研究費補助金 若手（スタートアップ）
Authorship：Principal investigator
インスレーター及びその利用
樫田啓、浅沼浩之、関口康司
Chemistry and Biotechnology Laboratory 2
2023
Supramolecular Biochemistry
2023
Safety in Laboratory
2023
Biomolecular Chemistry 1 with Exercises
2023
Fundamentals of Biomolecular Chemistry
2022
化学実験
2022
Supramolecular Biochemistry
2021
Technical Visits in Industrial Plants
2021
Understanding the Material World
2021
分子生命化学基礎論
2020
化学生命工学実験２
2020
生化学２及び演習
2020
生命超分子化学
2019
Core Biochemistry
2019
分子生命化学基礎論
2018
生物機能工学演習１
2018
Understanding the Material World
2018
Understanding the Material World
2017
ナノバイオ計測化学
2017
Core Biochemistry
2017
生命超分子化学
2017
生物機能工学演習１
2017
生物機能工学演習１
2016
Understanding the Material World
2016
生体材料工学特論
2015
生物機能工学演習１
2015
分析化学実験第１
2015
Understanding the Material World
2015
分析化学実験第１
2014
生物機能工学演習１
2014
生物機能工学実験
2014
生物機能工学実験
2013
Understanding the Material World
2013
生物機能工学演習１
2013
分析化学実験第１
2013
生体材料工学特論
2013
生物機能工学実験
2012
生物機能工学演習１
2012
Understanding the Material World
2012
分析化学実験第１
2012
分析化学実験第１
2011
生物機能工学演習１
2011
生体材料工学特論
2011
Understanding the Material World
2011
生物機能工学実験
2011
生体物質合成化学
2015.4 - 2016.3 （Aichi Institute of Technology）
生体物質合成化学
2014.4 - 2015.3 （Aichi Institute of Technology）
生体物質合成化学
2013.4 - 2014.3 （Aichi Institute of Technology）
生体物質合成化学
2012.4 - 2013.3 （Aichi Institute of Technology）
生体物質合成化学
2011.4 - 2012.3 （Aichi Institute of Technology）
豊田西高校模擬授業
Role(s)：Lecturer
豊田西高校 2017.11
