東京大学   大学院農学生命科学研究科　准教授

2007年4月 - 2010年3月

東京大学   大学院農学生命科学研究科　助教授

2003年3月 - 2007年3月

アイオワ州立大学   農学部　客員研究員（日本学術振興会海外特別研究員）

2001年5月 - 2002年5月

東京大学   大学院農学生命科学研究科　助手

1996年4月 - 2003年2月

東京大学   農学部　助手

1995年12月 - 1996年3月

日本育種学会   庶務幹事（科研費・農学会担当）

2006年4月 - 2008年3月

International Society for Plant Anaerobiosis

Age-dependent analysis dissects the stepwise control of auxin-mediated lateral root development in rice. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Tanaka, A., Nakazono, M. and Inukai, Y.

Plant Physiology   194 巻   頁： 819 - 831   2024年2月

Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency. 査読有り 国際共著 国際誌

Chen, X., Ru, Y., Takahashi, H., Nakazono, M., Shabala, S., Smith, S. and Yu, M.

Plant Journal   117 巻   頁： 302 - 322   2024年1月

Transcriptome analysis of rice root tips reveals auxin, gibberellin and ethylene signaling underlying nutritropism. 査読有り 国際誌

Yamazaki, K., Ohmori, Y., Takahashi, H. Toyoda, A., Sato, Y., Nakazono, M. and Fujiwara, T.

Plant and Cell Physiology   65 巻 ( 4 ) 頁： 671 - 679   2024年1月

Outer apoplastic barriers in roots: prospects for abiotic stress tolerance. 査読有り 国際共著 国際誌

Peralta Ogorek, L.L., de la Cruz Jiménez, J., Visser, E.J.W., Takahashi, H., Nakazono, M., Shabala, S. and Pedersen, O.

Functional Plant Biology   51 巻   頁： FP23133   2024年

Random regression for modeling soybean plant response to irrigation changes using time-series multispectral data. 査読有り 国際誌

Sakurai, K., Toda, Y., Hamazaki, K., Ohmori, Y., Yamasaki, Y., Takahashi, H., Takanashi, H., Tsuda, M., Tsujimoto, H., Kaga, A., Nakazono, M., Fujiwara, T. and Iwata, H.

Frontiers in Plant Science   14 巻   頁： 1201806   2023年7月

Triterpenoids in aerenchymatous phellem contribute to internal root aeration and waterlogging adaptability in soybeans. 査読有り 国際誌

Takahashi, H., Abo, C., Suzuki, H., Romsuk, J., Oi, T., Yanagawa, A., Gorai, T., Tomisaki, Y., Jitsui, M., Shimamura, S., Mori, H., Kaga, A., Ishimoto, M., Seki, H., Muranaka, T. and Nakazono, M.

New Phytologist   239 巻   頁： 936 - 948   2023年6月

The barrier to radial oxygen loss protects roots against hydrogen sulphide intrusion and its toxic effect. 査読有り 国際共著 国際誌

Peralta Ogorek, L.L., Takahashi, H., Nakazono, M. and Pedersen, O.

New Phytologist   238 巻   頁： 1825 - 1837   2023年4月

Asymmetric auxin distribution establishes a contrasting pattern of aerenchyma formation in the nodal roots of Zea nicaraguensis during gravistimulation. 査読有り 国際誌

Ning, J., Yamauchi, T., Takahashi, H., Omori, F., Mano, Y. and Nakazono, M.

Frontiers in Plant Science   14 巻   頁： 1133009   2023年4月

Effects of irrigation on root growth and development of soybean: a 3-year sandy field experiment. 査読有り 国際誌

Bui, K.T., Naruse, T., Yoshida, H., Toda, Y., Ohmori, Y., Tsuda, M., Kaga, A., Yamasaki, Y., Tsujimoto, H., Ichihashi, Y., Yokota-Hirai, M., Fujiwara, T., Iwata, H., Matsuoka, M., Takahashi, H. and Nakazono, M.

Frontiers in Plant Science   13 巻   頁： 1047563   2022年12月

Tandemly duplicated genes encoding polygalacturonase inhibitors are associated with bruchid (Callosobruchus chinensis) resistance in moth bean (Vigna aconitifolia). 査読有り 国際共著 国際誌

Rathnayaka, S., Kaewwongwal, A., Laosatit, K., Yimram, T., Lin, Y., Chen, X., Nakazono, M. and Somta, P.

Plant Science   323 巻   頁： 111402   2022年10月

Time-series multi-spectral imaging in soybean for improving biomass and genomic prediction accuracy. 査読有り 国際誌

Sakurai, K., Toda, Y., Kajiya-Kanegae, H., Omori, Y., Yamasaki, Y., Takahashi, H., Takanashi, H., Tsuda, M., Tsujimoto, H., Kaga, A., Nakazono, M., Fujiwara, T. and Iwata, H.

Plant Genome   15 巻   頁： e20244   2022年6月

Modeling-based age-dependent analysis reveals the net patterns of ethylene-dependent and -independent aerenchyma formation in rice and maize roots. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T. and Nakazono, M.

Plant Science   321 巻   頁： 111340   2022年5月

Genomic prediction of green fraction dynamics in soybean using UAV observations. 査読有り 国際共著 国際誌

Toda, Y., Sasaki, G., Ohmori, Y., Yamasaki, Y., Takahashi, H., Takanashi, H., Tsuda, M., Kajiya-Kanegae, H., Lopez-Lozano, R., Tsujimoto, H., Kaga, A., Nakazono, M., Fujiwara, T., Baret, F. and Iwata, H

Frontiers in Plant Science   13 巻   頁： 828864   2022年3月

Mechanisms of lysigenous aerenchyma formation under abiotic stress. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T. and Nakazono, M.

Trends in Plant Science   27 巻   頁： 13 - 15   2022年1月

WUSCHEL-related homeobox family genes in rice control lateral root primordium size. 査読有り 国際共著 国際誌

Kawai, T., Shibata, K., Akahoshi, R., Nishiuchi, S., Takahashi, H., Nakazono, M., Kojima, T., Nosaka-Takahashi, M., Sato, Y., Toyoda, A., Lucob-Agustin, N., Kano-Nakata, M., Suralta, R.R., Niones, J.M., Chen, Y., Siddique, K., Yamauchi, A. and Inukai, Y.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   119 巻   頁： e2101846119   2022年1月

Radial oxygen loss from plant roots – methods 査読有り 国際共著 国際誌

Jiménez, JdlC., Pellegrini, E., Pedersen, O. and Nakazono, M.

Plants   10 巻   頁： 2322   2021年10月

Expression analysis of genes for cytochrome P450 CYP86 and glycerol-3-phosphate acyltransferase related to suberin biosynthesis in rice roots under stagnant deoxygenated conditions. 査読有り 国際誌

Nishiuchi, S., Watanabe, K., Sato, S., Takahashi, H. and Nakazono, M.

Plant Root   15 巻   頁： 19 - 35   2021年6月

Key root traits of Poaceae for adaptation to soil water gradients. 査読有り 国際共著 国際誌

Yamauchi, T., Pedersen, O., Nakazono, M. and Tsutsumi, N.

New Phytologist   229 巻   頁： 3133 - 3140   2021年3月

Genetic regulation of root traits for soil flooding tolerance in genus Zea. 招待有り 査読有り 国際誌

Mano, Y. and Nakazono, M.

Breeding Science   71 巻   頁： 30 - 39   2021年3月

Dissection of root behavior to abiotic stimuli for breeding of climate-resilient crops 国際誌

Uga, Y. and Nakazono, M.

Breeding Science   71 巻 ( 1 ) 頁： 1 - 1   2021年3月

Lateral roots, in addition to the adventitious roots, form a barrier to radial oxygen loss in Zea nicaraguensis and a chromosome segment introgression line in maize. 査読有り 国際共著 国際誌

Pedersen, O., Nakayama, Y., Yasue, H., Kurokawa, Y., Takahashi, H., Floytrup, A.H., Omori, F., Mano, Y., Colmer, T.D. and Nakazono, M.

New Phytologist   229 巻   頁： 94-105   2021年1月

Regulation of root adaptive anatomical and morphological traits during low soil oxygen. 招待有り 査読有り 国際共著 国際誌

Pedersen, O., Sauter, M., Colmer, T.D. and Nakazono, M.

New Phytologist   229 巻   頁： 42-49   2021年1月

Formation of a barrier to radial oxygen loss in L-type lateral roots of rice. 査読有り 国際誌

Noorrohmah, S., Takahashi, H. and Nakazono, M.

Plant Root   14 巻   頁： 33-41   2020年12月

Distance-to-time conversion using Gompertz model reveals age-dependent aerenchyma formation in rice roots. 査読有り 国際共著 国際誌

Yamauchi, T., Nakazono, M., Inukai, Y. and Tsutsumi N.

Plant Physiology   183 巻   頁： 1424-1427   2020年8月

Differences in xylem development between Dutch and Japanese tomato (Solanum lycopersicum) correlate with cytokinin levels in hypocotyls. 査読有り 国際共著 国際誌

Qi, X., Takahashi, H., Kawasaki, Y., Ohta, Y., Isozaki, M., Kojima, M., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Imanishi, S., Chen, X. and Nakazono, M.

Annals of Botany   126 巻   頁： 315-322   2020年8月

A role for auxin in ethylene-dependent inducible aerenchyma formation in rice roots. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Tanaka, A., Tsutsumi, N., Inukai, Y. and Nakazono, M.

Plants   9 巻 ( 5 ) 頁： e610   2020年5月

QTLs for constitutive aerenchyma from Zea nicaraguensis improve tolerance of maize to root-zone oxygen deficiency. 査読有り 国際共著 国際誌

Gong, F., Takahashi, H., Omori, F., Wang, W., Mano, Y. and Nakazono, M.

Journal of Experimental Botany   70 巻   頁： 6475-6487   2019年11月

Fine control of aerenchyma and lateral root development through AUX/IAA and ARF-dependent auxin signaling. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Tanaka, A., Inahashi, H., Nishizawa, N.K., Tsutsumi, N., Inukai, Y. and Nakazono, M.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   116 巻 ( 41 ) 頁： 20770-20775   2019年10月

Genetic and tissue-specific RNA-sequencing analysis of self-compatible mutant TSC28 in Brassica rapa L. toward identification of a novel self-incompatibility factor. 査読有り 国際誌

Osaka M, Nabemoto M, Maeda S, Sakazono S, Masuko-Suzuki H, Ito K, Takada Y, Kobayashi I, Lim YP, Nakazono M, Fujii S, Murase K, Takayama S, Suzuki G, Suwabe K and Watanabe M

Genes & Genetic Systems   94 巻   頁： 167-176   2019年8月

Specification of the basal region identity after asymmetric zygotic division requires mitogen-activated protein kinase 6 in rice. 査読有り 国際誌

Ishimoto, K., Sonohara, S., Kaboshi-Kishi, M., Itoh, J., Hibara, K., Sato, Y., Watanabe, T., Abe, K., Miyao, A., Nosaka-Takahashi, M., Suzuki, T., Ta, N.K., Shimizu-Sato, S., Suzuki, T., Toyoda, A., Takahashi, H., Nakazono, M., Nagato, Y., Hirochika, H. and Sato, Y.

Development   146 巻   頁： dev176305   2019年6月

Rice acclimation to soil flooding: low concentrations of organic acids can trigger a barrier to radial oxygen loss in roots. 査読有り 国際共著 国際誌

Colmer, T.D., Kotula, L., Malik, A.I., Takahashi, H., Konnerup, D., Nakazono, M. and Pedersen, O.

Plant, Cell & Environment   42 巻   頁： 2183-2197   2019年4月

Root cortex provides a venue for gas-space formation and is essential for plant adaptation to waterlogging. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Abe, F., Tsutsumi, N. and Nakazono, M.

Frontiers in Plant Science   10 巻   頁： e259   2019年3月

Laser microdissection-based tissue specific transcriptome analyses reveals novel regulatory network of genes involved in heat-induced grain chalk in rice endosperm. 査読有り 国際共著 国際誌

Ishimaru, T., Parween, S., Saito, Y., Shigemitsu, T., Yamakawa, H., Nakazono, M., Masumura, T., Nishizawa, N.K., Kondo, M. and Sreenivasulu, N.

Plant and Cell Physiology   60 巻   頁： 626-642   2019年3月

42 蛍光X線分析による迅速・簡便なダイズ葉のイオノーム解析（関東支部講演会）

大森 良弘, 岩田 洋佳, 藤原 徹, 山崎 清志, 津田 麻衣, 鐘ケ江 弘美, 戸田 悠介, 山崎 裕司, 辻本 壽, 加賀 秋人, 中園 幹生

日本土壌肥料学会講演要旨集   65 巻 ( 0 ) 頁： 258 - 258   2019年

Sucrose supply from leaves is required for aerenchymatous phellem formation in hypocotyl of soybean under waterlogged conditions. 査読有り 国際共著 国際誌

Takahashi, H., Qi, X., Shimamura, S., Yanagawa, A., Hiraga, S. and Nakazono, M.

Annals of Botany   121 巻   頁： 723-731   2018年3月

Regulation of root traits for internal aeration and tolerance to soil waterlogging-flooding stress. 査読有り 国際共著 国際誌

Yamauchi, T., Colmer, T.D., Pedersen, O. and Nakazono, M.

Plant Physiology   176 巻   頁： 1118-1130   2018年2月

A major locus involved in the formation of the radial oxygen loss barrier in adventitious roots of teosinte Zea nicaraguensis is located on the short-arm of chromosome 3. 査読有り 国際共著 国際誌

Watanabe, K., Takahashi, H., Sato, S., Nishiuchi, S., Omori, F., Malik, A.I., Colmer, T.D., Mano, Y. and Nakazono, M.

Plant, Cell & Environment   40 巻   頁： 304-316   2017年

Molecular bases for phyllomorph development in a one-leaf plant, Monophyllaea glabra (Gesneriaceae). 査読有り 国際誌

Ishikawa, N., Takahashi, H., Nakazono, M. and Tsukaya, H.

American Journal of Botany   104 巻   頁： 233-240   2017年

Anatomical and biochemical characterisation of a barrier to radial O2 loss in adventitious roots of two contrasting Hordeum marinum accessions. 査読有り 国際共著 国際誌

Kotula, L., Schreiber, L., Colmer, T.D. and Nakazono, M.

Functional Plant Biology   44 巻   頁： 845-857   2017年

An NADPH oxidase RBOH functions in rice roots during lysigenous aerenchyma formation under oxygen-deficient conditions. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Yoshioka, M., Fukazawa, A., Mori, H., Nishizawa, N.K., Tsutsumi, N., Yoshioka, H. and Nakazono, M.

Plant Cell   29 巻   頁： 775-790   2017年

Community recommendations on terminology and procedures used in flooding and low oxygen stress research 査読有り 国際誌

Sasidharan, R., Bailey-Serres, J., Ashikari, M., Atwell, B., Colmer, T.D., Fagerstedt, K., Fukao, T., Geigenberger, P., Hebelstrup, K., Hill, R.D., Holdsworth, M.J., Ismail, A.M., Licausi, F., Mustroph, A., Nakazono, M., Pedersen, O., Perata, P., Sauter, M., Shih, M.-C., Sorrell, B., Striker, G.G., van Dongen, J.T., Whelan, J., Xiao, S., Visser, E.J.W. and Voesenek, L.A.C.J.

New Phytologist   214 巻   頁： 1403-1407   2017年

METALLOTHIONEIN genes encoding ROS scavenging enzymes are down-regulated in the root cortex during inducible aerenchyma formation in rice. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Fukazawa, A. and Nakazono, M.

Plant Signaling & Behavior   12 巻   頁： e1388976   2017年

Rice stomatal closure requires guard cell plasma membrane ATP-binding cassette transporter RCN1/OsABCG5. 査読有り 国際誌

Matsuda, S., Takano, S., Nagasawa. H., Yoshikawa, S., Tokuji, Y., Yazaki, K., Nakazono, M., Takamure, I. and Kato, K.

Molecular Plant   9 巻   頁： 417-427   2016年

Ethylene-dependent aerenchyma formation in adventitious roots is regulated differently in rice and maize. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Tanaka, A., Mori, H., Takamure, I., Kato, K. and Nakazono, M.

Plant, Cell & Environment   39 巻   頁： 2145-2157   2016年

Transcriptional regulatory mechanism of alcohol dehydrogenase 1-deficient mutant of rice for the cell survival under complete submergence. 査読有り 国際共著 国際誌

Mohanty, B., Takahashi, H., de los Reyes, B.G., Wijaya, E., Nakazono, M. and Lee, D.Y.

Rice   9 巻   頁： e51   2016年

Transcripts of two ent-copalyl diphosphate synthase genes differentially localize in rice plants according to their distinct biological roles. 査読有り 国際誌

Toyomasu, T., Usui, M., Sugawara, C., Kanno, Y., Sakai, A., Takahashi, H., Nakazono, M., Kuroda, M., Miyamoto, K., Morimoto, Y., Mitsuhashi, W., Okada, K., Yamaguchi, S. and Yamane, H.

Journal of Experimental Botany   66 巻   頁： 369–376   2015年

Transcript profiles in cortical cells of maize primary root during ethylene-induced lysigenous aerenchyma formation under aerobic conditions. 査読有り 国際誌

Takahashi, H., Yamauchi, T., Rajhi, I., Nishizawa, N.K. and Nakazono, M.

Annals of Botany   115 巻   頁： 879-894   2015年

Transcriptional characteristics and differences in Arabidopsis stigmatic papilla cells pre- and post-pollination. 査読有り 国際誌

Matsuda, T., Matsushima, M., Nabemoto, M., Osaka, M., Sakazono, S., Masuko-Suzuki, H., Takahashi, H., Nakazono, M., Iwano, M., Takayama, S., Shimizu, K.K., Okumura, K., Suzuki, G., Watanabe, M. and Suwabe, K.

Plant and Cell Physiology   56 巻   頁： 663-673   2015年

The rice RCN11 gene encodes β1,2-xylosyltransferase and is required for plant responses to abiotic stresses and phytohormones. 査読有り 国際誌

Takano, S., Matsuda, S., Funabiki, A., Furukawa, J., Yamauchi, T., Tokuji, Y., Nakazono, M., Shinohara, Y., Takamure, I. and Kato, K.

Plant Science   236 巻   頁： 75-88   2015年

Ethylene biosynthesis is promoted by very-long-chain fatty acids during lysigenous aerenchyma formation in rice roots. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Shiono, K., Nagano, M., Fukazawa, A., Ando, M., Takamure, I., Mori, H., Nishizawa, N.K., Kawai-Yamada, M., Tsutsumi, N., Kato, K. and Nakazono, M.

Plant Physiology   169 巻   頁： 180-193   2015年

Laser microdissection-based gene expression analysis in the aleurone layer and starchy endosperm of developing rice caryopses in the early storage phase. 査読有り 国際誌

Ishimaru, T. Ida, M., Hirose, S., Shimamura, S., Masumura, T., Nishizawa, N.K., Nakazono, M. and Kondo, M.

Rice   8 巻   頁： e22   2015年

Molecular cloning and expression analysis of the WEE1 and CCS52A genes in European pear (Pyrus communis L.) and their possible roles in a giant fruit mutant. 査読有り 国際誌

Hanada, T., Nashima, K., Kato, M., Takashina, T., Ikeda, K., Sakamoto, Y., Takahashi, H., Nakazono, M., Oikawa, A., Shiratake, K. and Isuzugawa, K.

Journal of Horticultural Science & Biotechnology   90 巻   頁： 511-517   2015年

Rice alcohol dehydrogenase 1 promotes survival and has a major impact on carbohydrate metabolism in the embryo and endosperm when seeds are germinated in partially oxygenated water. 査読有り 国際共著 国際誌

Takahashi, H., Greenway, H., Matsumura, H., Tsutsumi N. and Nakazono, M.

Annals of Botany   113 巻   頁： 851-859   2014年

Strigolactone and cytokinin act antagonistically in regulating rice mesocotyl elongation in darkness. 査読有り 国際誌

Hu, Z., Yamauchi, T., Yang, J., Jikumaru, Y., Tsuchida-Mayama, T., Ichikawa, H., Takamure, I., Nagamura, Y., Tsutsumi, N., Yamaguchi, S., Kyozuka J. and Nakazono M.

Plant and Cell Physiology   55 巻   頁： 30-41   2014年

Ethylene and reactive oxygen species are involved in root aerenchyma formation and adaptation of wheat seedlings to oxygen-deficient conditions. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Watanabe, K., Fukazawa, A., Mori, H., Abe, F., Kawaguchi, K., Oyanagi, A. and Nakazono, M.

Journal of Experimental Botany   65 巻   頁： 261-273   2014年

Effects of organic acids on formation of the barrier to radial oxygen loss in roots of Hordeum marinum. 査読有り 国際共著 国際誌

Kotula, L., Colmer, T.D. and Nakazono, M.

Functional Plant Biology   41 巻   頁： 187-202   2014年

Spatial transcriptomes of iron-deficient and cadmium-stressed rice. 査読有り 国際誌

Ogo, Y., Kakei, Y., Nakanishi-Itai, R., Kobayashi, T., Nakanishi, H., Takahashi, H., Nakazono, M and Nishizawa, N.K.

New Phytologist   201 巻   頁： 781-794   2014年

Biochemical and molecular characterization of rice (Oryza sativa L.) roots forming a barrier to radial oxygen loss. 招待有り 査読有り 国際誌

Kulichikhin, K., Yamauchi, T., Watanabe, K. and Nakazono, M.

Plant, Cell & Environment,   37 巻   頁： 2406-2420   2014年

Transcriptome analysis of flower receptacle of the European pear (Pyrus communis L.) `La France' and its giant fruit sport using next-generation sequencing technology. 査読有り 国際誌

Nashima, K., Terakami, S., Nishitani, C., Yamamoto, T., Habu, T., Takahashi, H., Nakazono, M., Isuzugawa, K., Hanada, T., Takashina, T., Matsumoto, S., Otagaki, S., Mori, H., Oikawa, A. and Shiratake, K.

Journal of Horticultural Science & Biotechnology   89 巻   頁： 293-300   2014年

Microarray analysis of laser-microdissected tissues indicates the biosynthesis of suberin in the outer part of roots during formation of a barrier to radial oxygen loss in rice (Oryza sativa). 査読有り 国際共著 国際誌

Shiono, K., Yamauchi, T, Yamazaki, S., Mohanty, B., Malik, A.I., Nagamura, Y., Nishizawa, N.K., Tsutsumi, N., Colmer, T.D. and Nakazono, M.

Journal of Experimental Botany   65 巻   頁： 4795-4806   2014年

RCN1/OsABCG5, an ATP-binding cassette (ABC) transporter, is required for hypodermal suberization of roots in rice (Oryza sativa). 査読有り 国際誌

Shiono, K., Ando, M., Nishiuchi, S., Takahashi, H., Watanabe, K., Nakamura, M., Matsuo, Y., Yasuno, N., Yamanouchi, U., Fujimoto, M., Takanashi, H., Ranathunge, K., Franke, R., Shitan, N., Nishizawa, N.K., Takamure, I., Yano, M., Tsutsumi, N., Schreiber, L., Yazaki, K., Nakazono, M. and Kato, K.

Plant Journal   80 巻   頁： 40-51   2014年

Aerenchyma formation in crop species: a review. 招待有り 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Shimamura, S., Nakazono, M. and Mochizuki, T.

Field Crops Research   152 巻   頁： 8-16   2013年

Molecular evidence for phytosiderophore-induced improvement of iron nutrition of peanut intercropped with maize in calcareous soil. 査読有り 国際共著 国際誌

Xiong, H., Kakei, Y., Kobayashi, T., Guo, X., Nakazono, M., Takahashi, H., Nakanishi, H., Shen, H., Zhang, F., Nishizawa, N.K. and Zuo, Y.

Plant, Cell & Environment   36 巻   頁： 1888-1902   2013年

Transcriptome analysis of developing ovules in rice isolated by laser microdissection. 査読有り 国際誌

Kubo, T., Fujita, M., Takahashi, H., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Kurata, N.

Plant and Cell Physiology   54 巻   頁： 750-765   2013年

Does suberin accumulation in plant roots contribute to waterlogging tolerance? 招待有り 査読有り 国際誌

Watanabe, K., Nishiuchi, S., Kulichikhin, K. and Nakazono M.

Frontiers in Plant Science   4 巻   頁： e178   2013年

Microarray analysis of gene expression patterns during fruit development in European pear (Pyrus communis). 査読有り 国際誌

Nashima, K., Shimizu, T., Nishitani, C., Yamamoto, T., Takahashi, H., Nakazono, M., Itai, A., Isuzugawa, K., Hanada, T., Takashina, T., Matsumoto, S., Otagaki, S., Oikawa, A. and Shiratake, K.

Scientia Horticulturae   164 巻   頁： 466-473   2013年

Transcriptome analysis of giant pear fruit with fruit-specific DNA reduplication on a mutant branch. 査読有り 国際誌

Nashima, K., Takahashi, H., Nakazono, M., Shimizu, T., Nishitani, C., Yamamoto, T., Itai, A., Isuzugawa, K., Hanada, T., Takashina, T., Kato, M., Matsumoto, S., Oikawa, A. and Shiratake, K.

Journal of the Japanese Society for Horticultural Science   82 巻   頁： 301-311   2013年

Cell type-specific transcriptome of Brassicaceae stigmatic papilla cells from a combination of laser microdissection and RNA sequencing. 査読有り 国際誌

Osaka, M., Matsuda, T., Sakazono, S., Masuko-Suzuki, H., Maeda, S., Sewaki, M., Sone, M., Takahashi, H., Nakazono, M., Iwano, M., Takayama, S., Shimizu, K.K.., Yano, K., Lim, Y.P., Suzuki, G., Suwabe, K. and Watanabe, M.

Plant and Cell Physiology   54 巻   頁： 1894-1906   2013年

Mechanisms for coping with submergence and waterlogging in rice. 招待有り 査読有り 国際誌

Nishiuchi, S., Yamauchi, T., Takahashi, H., Kotula, L. and Nakazono, M.

Rice   5 巻   頁： e2   2012年

Acquisition of aluminum tolerance by modification of a single gene in barley. 査読有り 国際誌

Fujii, M., Yokosho, K., Yamaji, N., Saisho, D., Yamane, M., Takahashi, H., Sato, K., Nakazono, M. and Ma, J.F.

Nature Commun.   3 巻   頁： 713   2012年

Genome-wide transcriptome dissection of the rice root system: Implications for developmental and physiological functions. 査読有り 国際誌

Takehisa, H., Sato, Y., Igarashi, M., Abiko, T., Antonio, B., Kamatsuki, K., Minami, H., Namiki, N., Inukai, Y., Nakazono, M. and Nagamura, Y.

Plant J.   69 巻   頁： 126–140   2012年

Enhanced formation of aerenchyma and induction of a barrier to radial oxygen loss in adventitious roots of Zea nicaraguensis contribute to its waterlogging tolerance as compared with maize (Zea mays ssp. mays). 査読有り 国際共著 国際誌

Abiko, T., Kotula, L., Shiono, K., Malik, A.I., Colmer, T.D. and Nakazono, M.

Plant Cell Environ.   35 巻   頁： 1618–1630   2012年

Cell-type specific transcriptome analysis in nodules of Lotus japonicas. 査読有り 国際誌

Takanashi, K., Takahashi, H., Sakurai, N., Sugiyama, A., Shibata , D., Nakazono, M. and Yazaki, K.

Mol. Plant-Microbe Interact.   25 巻   頁： 869-876   2012年

AhNRAMP1 iron transporter is involved in iron acquisition in peanut. 査読有り 国際共著 国際誌

Xiong, H., Kobayashi, T., Kakei, Y., Senoura, T., Nakazono, M., Takahashi, H., Nakanishi, H., Shen, H., Duan, P., Guo, X., Nishizawa, N.K. and Zuo, Y.

J. Exp. Bot.   63 巻   頁： 4437–4446   2012年

Screening of candidate genes associated with constitutive aerenchyma formation in adventitious roots of the teosinte Zea nicaraguensis. 査読有り 国際誌

Abiko, T., Obara, M., Abe, F., Kawaguchi, K., Oyanagi, A., Yamauchi, T. and Nakazono, M.

Plant Root   6 巻   頁： 19-27   2012年

Lysigenous aerenchyma formation in maize root is confined to cortical cells by regulation of genes related to generation and scavenging of reactive oxygen species. 査読有り 国際誌

Yamauchi, T., Rajhi, I., and Nakazono, M.

Plant Signal. Behav.   6 巻   頁： 759-761   2011年

Contrasting dynamics of radial O2-loss barrier induction and aerenchyma formation in rice roots of two lengths. 査読有り 国際共著 国際誌

Shiono, K., Ogawa, S., Yamazaki, S., Isoda, H., Fujimura, T., Nakazono, M. and Colmer, T.D.

Annals of Botany   107 巻   頁： 89–99   2011年

Identification of genes expressed in maize root cortical cells during lysigenous aerenchyma formation using laser microdissection and microarray analyses. 査読有り 国際共著 国際誌

Rajhi, I., Yamauchi, T., Takahashi, H., Nishiuchi, S., Shiono, K., Watanabe, R., Mliki, A., Nagamura, Y., Tsutsumi, N., Nishizawa, N.K. and Nakazono, M.

New Phytol.   190 巻   頁： 351-368   2011年

Cell division and cell elongation in the coleoptile of rice alcohol dehydrogenase 1-deficient mutant are reduced under complete submergence. 査読有り 国際誌

Takahashi, H., Saika, H., Matsumura, H., Nagamura, Y., Tsutsumi, N., Nishizawa, N.K. and Nakazono, M.

Annals of Botany   108 巻   頁： 253-261   2011年

Comprehensive network analysis of anther-expressed genes in rice by the combination of 33 laser microdissection and 143 spatiotemporal microarrays. 査読有り 国際誌

Aya, K., Suzuki, G., Suwabe, K., Hobo, T., Takahashi, H., Shiono, K., Yano, K., Tsutsumi, N., Nakazono, M., Nagamura, Y., Matsuoka, M. and Watanabe, M.

PLoS ONE   6 巻   頁： e26162   2011年

A method for obtaining high quality RNA from paraffin sections of plant tissues by laser microdissection. 査読有り 国際誌

Takahashi, H., Kamakura, H., Sato, Y., Shiono, K., Abiko, T., Tsutsumi, N., Nagamura, Y., Nishizawa, N.K. and Nakazono, M

J. Plant Res.   123 巻   頁： 807–813   2010年

Strigolactones negatively regulate mesocotyl elongation in rice during germination and growth in darkness. 査読有り 国際共著 国際誌

Hu, Z., Yan, H., Yang, J., Yamaguchi, S., Maekawa, M., Takamure, I., Tsutsumi, N., Kyozuka, J. and Nakazono, M.

Plant Cell Physiol.   51 巻   頁： 1136-1142   2010年

Apple phloem cells contain some mRNAs transported over long distances. 査読有り 国際誌

Kanehira, A., Yamada, K., Iwaya, T., Tsuwamoto, R., Kasai, A., Nakazono, M. and Harada, T.

Tree Genet. Genomes   6 巻   頁： 635-642   2010年

Fusion of mitochondria in tobacco suspension cultured cells is dependent on the cellular ATP level but not on actin polymerization. 査読有り 国際誌

Wakamatsu, K., Fujimoto, M., Nakazono, M., Arimura, S. and Tsutsumi, N.

Plant Cell Rep.   29 巻   頁： 1139-1145   2010年

A receptor-like kinase, KLAVIER, mediates systemic regulation of nodulation and non-symbiotic shoot development in Lotus japonicus. 国際誌

Miyazawa, H., Oka-Kira, E., Sato, N., Takahashi, H., Wu, G. J., Sato, S., Hayashi, M., Betsuyaku, S., Nakazono, M., Tabata, S., Harada, K., Sawa, S., Fukuda, H. and Kawaguchi, M.

Development   137 巻   頁： 4317-4325   2010年

Arabidopsis dynamin-related proteins DRP3A and DRP3B are functionally redundant in mitochondrial fission but have distinct roles in peroxisomal fission. 査読有り 国際誌

Fujimoto, M., Arimura, S., Mano, S., Kondo, M., Saito, C., Ueda, T., Nakazono, M., Nakano, A., Nishimura, M. and Tsutsumi, T.

Plant J.   58 巻   頁： 388-400   2009年

Rice OsYSL15 is an iron-regulated iron(III)-deoxymugineic acid transporter expressed in the roots and is essential for iron uptake in early growth of the seedlings. 査読有り 国際誌

Inoue, H., Kobayashi, T., Nozoye, T., Takahashi, M., Kakei, Y., Suzuki, K., Nakazono, M., Nakanishi, H., Mori, S. and Nishizawa, N.K.

J. Biol. Chem.   284 巻   頁： 3470-3479   2009年

Formation of grain chalkiness and changes in water distribution in developing rice caryopses grown under high-temperature stress. 査読有り 国際誌

Ishimaru, T., Horigane, A.K., Ida, M., Iwasawa, N., San-oh, Y.A., Nakazono, M., Nishizawa, N.K., Masumura, T., Kondo, M. and Yoshida, M.

J. Cereal Sci.   50 巻   頁： 166-174   2009年

Nod factor/nitrate-induced CLE genes that drive HAR1-mediated systemic regulation of nodulation. 査読有り 国際誌

Okamoto, S., Ohnishi, E., Sato, S., Takahashi, H., Nakazono, M., Tabata, S. and Kawaguchi, M.

Plant Cell Physiol.   50 巻   頁： 67-77   2009年

Role of ethylene in acclimations to promote oxygen transport in roots of plants in waterlogged soils. 査読有り 国際共著 国際誌

Shiono, K., Takahashi, H., Colmer, T.D. and Nakazono, M.

Plant Sci.   175 巻   頁： 52-58   2008年

Separated transcriptomes of male gametophyte and tapetum in rice: validity of a laser microdissection (LM) microarray. 査読有り 国際誌

Suwabe, K., Suzuki, G., Takahashi, H., Shiono, K., Endo, M., Yano, K., Fujita, M., Masuko, H., Saito, H., Fujioka, T., Kaneko, F., Kazama, T., Mizuta, Y., Kawagishi-Kobayashi, M., Tsutsumi, N., Kurata, N., Nakazono, M. and Watanabe, M.

Plant Cell Physiol.   49 巻   頁： 1407-1416   2008年

Arabidopsis dynamin-related protein DRP2B is co-localized with DRP1A on the leading edge of the forming cell plate. 査読有り 国際誌

Fujimoto, M., Arimura, S., Nakazono, M. and Tsutsumi, N.

Plant Cell Rep.   27 巻   頁： 1581-1586   2008年

Drought induction of Arabidopsis 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase occurs in vascular parenchyma cells. 査読有り 国際誌

Endo, A., Sawada, Y., Takahashi, H., Okamoto, M., Ikegami, K., Koiwai, H., Seo, M., Toyomasu, T., Mitsuhashi, W., Shinozaki, K., Nakazono, M., Kamiya, Y., Koshiba, T. and Nambara, E.

Plant Physiol.   147 巻   頁： 1984-1993   2008年

Arabidopsis ELM1 is required for the localization of dynamin-related protein DRP3A to mitochondrial fission sites. 査読有り 国際誌

Arimura, S., Fujimoto, M., Doniwa, Y., Kadoya, N., Nakazono, M., Sakamoto, W. and Tsutsumi, N.:

Plant Cell   20 巻   頁： 1555-1566   2008年

Various spatiotemporal expression profiles of anther-expressed genes in rice. 査読有り 国際誌

Hobo, T., Suwabe, K., Aya, K., Suzuki, G., Yano, K., Ishimizu, T., Fujita, M., Kikuchi, S., Hamada, K., Miyano, M., Fujioka, T., Kaneko, F., Kazama, T., Mizuta, Y., Takahashi, H., Shiono, K., Nakazono, M., Tsutsumi, N., Nagamura, Y., Kurata, N., Watanabe, M. and Matsuoka, M.

Plant Cell Physiol.   49 巻   頁： 1417-1428   2008年

Cell type-specific gene expression profiling in plants by using a combination of laser microdissection and high-throughput technologies. 査読有り 国際共著 国際誌

Ohtsu, K., Takahashi, H., Schnable, P.S. and Nakazono, M.

Plant Cell Physiol.   48 巻   頁： 3-7   2007年

Rice tillering dwarf mutant dwarf3 has increased leaf longevity during darkness-induced senescence or hydrogen peroxide-induced cell death. 査読有り 国際誌

Yan, H., Saika, H., Maekawa, M., Takamure, I., Tsutsumi, N., Kyozuka, J. and Nakazono, M.

Genes Genet. Syst.   82 巻   頁： 361-366   2007年

A method for obtaining high integrity RNA from developing aleurone cells and starchy endosperm in rice (Oryza sativa L.) by laser microdissection. 査読有り 国際誌

Ishimaru, T., Nakazono, M., Masumura, T., Abiko, M., San-oh, Y., Nishizawa, N. K. and Kondo, M.

Plant Sci.   173 巻   頁： 321-326   2007年

Ethylene promotes submergence-induced expression of OsABA8ox1, a gene that encodes ABA 8´-hydroxylase in rice. 国際誌

Saika, H., Okamoto, M., Miyoshi, K., Kushiro, T., Shinoda, S., Jikumaru, Y., Fujimoto, M., Arikawa, T., Takahashi, H., Ando, M., Arimura, S., Miyao, A., Hirochika, H., Kamiya, Y., Tsutsumi, N., Nambara, E. and Nakazono, M.

Plant Cell Physiol.   48 巻   頁： 287-298   2007年

Isolation of MaDEF from Muscari armeniacum and analysis of its expression using laser microdissection. 査読有り 国際誌

Nakada, M., Komatsu, M., Ochiai, T., Ohtsu, K., Nakazono, M., Nishizawa, N.K., Nitta, K., Nishiyama, R., Kameya, T. and Kanno, A.

Plant Sci.   170 巻   頁： 143-150   2006年

Analysis of expression of genes for mitochondrial aldehyde dehydrogenase in maize during submergence and following re-aeration. 査読有り 国際誌

Meguro, N., Tsuji, H., Suzuki, Y., Tsutsumi, N., Hirai, A. and Nakazono, M.

Breed. Sci.   56 巻   頁： 365-370   2006年

Dynamic and reversible changes in histone H3-Lys4 methylation and H3 acetylation occurring at submergence-inducible genes in rice. 査読有り 国際誌

Tsuji, H., Saika, H., Tsutsumi, N., Hirai, A. and Nakazono, M.

Plant Cell Physiol.   47 巻   頁： 995-1003   2006年

GAMYB controls different sets of genes and is differentially regulated by microRNA in aleurone cells and anthers. 査読有り 国際誌

Tsuji, H., Aya, K., Ueguchi-Tanaka, M., Shimada, Y., Nakazono, M., Watanabe, R., Nishizawa, N.K., Gomi, K., Shimada, A., Kitano, H., Ashikari, M. and Matsuoka, M.

Plant J.   47 巻   頁： 427-444   2006年

A point mutation of Adh1 gene is involved in repression of coleoptile elongation under submergence in rice. 査読有り 国際誌

Saika, H., Matsumura, H., Takano, T., Tsutsumi, N. and Nakazono, M.

Breed Sci.   56 巻   頁： 69-74   2006年

Rice plants take up iron as an Fe3+-phytosiderophore and as Fe2+. 査読有り 国際誌

Ishimaru, Y., Suzuki, M., Tsukamoto, T., Suzuki, K., Nakazono, M., Kobayashi, T., Wada, Y., Watanabe, S., Matsuhashi, S., Takahashi, M., Nakanishi, H., Mori, S. and Nishizawa, N.K.

Plant J.   45 巻   頁： 335-346   2006年

cDNA microarray analysis of gene expression changes during pollination, pollen-tube elongation, fertilization, and early embryogenesis in rice pistils. 査読有り 国際誌

Yoshida, K.T., Endo, M., Nakazono, M., Fukuda, H., Demura, T., Tsuchiya, T. and Watanabe, M.

Sex. Plant Reprod.   17 巻   頁： 269-275   2005年

Anaconda, a new class of transposon belonging to the Mu superfamily, has diversified by acquiring host genes during rice evolution. 査読有り 国際誌

Ohtsu, K., Hirano, H., Tsutsumi, N., Hirai, A. and Nakazono, M.

Mol. Genet. Genomics   274 巻   頁： 606-615   2005年

A transposon-induced spontaneous mutation results in low β-amylase content in rice. 査読有り 国際誌

Saika, H., Nakazono, M., Ikeda, A., Yamaguchi, J., Masaki, S., Kanekatsu, M. and Nemoto, K.

Plant Sci.   169 巻   頁： 239-244   2005年

Global expression profiling applied to plant development. 査読有り 国際共著 国際誌

Schnable, P.S., Hochholdinger, F. and Nakazono, M.

Curr. Opin. Plant Biol.   7 巻   頁： 50-56   2004年

A rice dynamin-like protein, OsDRP3A, is involved in mitochondrial fission. 査読有り 国際誌

Fujimoto, M., Arimura, S., Nakazono, M. and Tsutsumi, N.

Breed. Sci.   54 巻   頁： 367-372   2004年

Frequent fusion and fission of plant mitochondria with unequal nucleoid distribution. 査読有り 国際誌

Arimura, S., Yamamoto, J., Aida, G.P., Nakazono, M. and Tsutsumi, N.

Proc. Natl. Acad. Sci. USA   101 巻   頁： 7805-7808   2004年

Arabidopsis dynamin-like protein 2a (ADL2a), like ADL2b, is involved in plant mitochondrial division. 査読有り 国際誌

Arimura, S., Aida, G.P., Fujimoto, M., Nakazono, M. and Tsutsumi, N.

Plant Cell Physiol.   45 巻   頁： 236-242   2004年

The rice pyruvate decarboxylase 3 gene, which lacks introns, is transcribed in mature pollen. 査読有り 国際誌

Li, Y., Ohtsu, K., Nemoto, K., Tsutsumi, N., Hirai, A. and Nakazono, M.

J. Exp. Bot.   55 巻   頁： 145-146   2004年

Organ-specific expressions and chromosomal locations of two mitochondrial aldehyde dehydrogenase genes from rice (Oryza sativa L.), ALDH2a and ALDH2b. 査読有り 国際誌

Tsuji, H., Tsutsumi, N., Sasaki, T., Hirai, A. and Nakazono, M.

Gene   305 巻   頁： 195-204   2003年

Induction of mitochondrial aldehyde dehydrogenase by submergence facilitates oxidation of acetaldehyde during re-aeration in rice. 査読有り 国際誌

Tsuji, H., Meguro, N., Suzuki, Y., Tsutsumi, N., Hirai, A. and Nakazono, M.

FEBS Lett.   546 巻   頁： 369-373   2003年

Laser capture microdissection, a tool for the global analysis of gene expression in specific plant cell types: Identification of genes differentially expressed in epidermal cells or vascular tissues of maize. 査読有り 国際共著 国際誌

Nakazono, M., Qiu, F., Borsuk, L.A. and Schnable, P.S.

Plant Cell   15 巻   頁： 583-596   2003年

The complete sequence of rice (Oryza sativa L.) mitochondrial genome: frequent DNA sequence acquisition and loss during evolution of flowering plants. 査読有り 国際誌

Notsu, Y., Masood, S., Nishikawa, T., Kubo, N., Akiduki, G., Nakazono, M., Hirai, A. and Kadowaki, K.

Mol. Gen. Genomics   268 巻   頁： 434-445   2002年

AOX1c, a novel rice gene for alternative oxidase; comparison with rice AOX1a and AOX1b. 査読有り 国際誌

Saika, H., Ohtsu, K., Hamanaka, S., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Genes Genet. Syst.   77 巻   頁： 31-38   2002年

ABA-independent expression of rice alternative oxidase genes under environmental stresses. 査読有り 国際誌

Ohtsu, K., Ito, Y., Saika, H., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Plant Biotechnol.   19 巻   頁： 187-190   2002年

Decreased transcription of a gene encoding putative mitochondrial aldehyde dehydrogenase in barley (Hordeum vulgare L.) under submerged conditions. 査読有り 国際誌

Meguro, N., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Plant Biotechnol.   18 巻   頁： 223-228   2001年

ATP synthesis inhibitors as well as respiratory inhibitors increase steady-state level of alternative oxidase mRNA in Arabidopsis thaliana. 査読有り 国際誌

Saisho, D., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

J. Plant Physiol.   158 巻   頁： 241-245   2001年

Characterization and expression of the genes for cytochrome c oxidase subunit VIb (COX6b) from rice and Arabidopsis thaliana. 査読有り 国際誌

Ohtsu, K., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Gene   264 巻   頁： 233-239   2001年

The gene for alternative oxidase-2 (AOX2) from Arabidopsis thaliana consists of five exons unlike other AOX genes and is transcribed at an early stage during germination. 査読有り 国際誌

Saisho, D., Nakazono, M., Lee, K.H., Tsutsumi, N., Akita, S. and Hirai, A.

Genes Genet. Syst.   76 巻   頁： 89-97   2001年

Expression of a gene encoding mitochondrial aldehyde dehydrogenase in rice increases under submerged conditions. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Tsuji, H., Li, Y., Saisho, D., Arimura, S., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Plant Physiol.   124 巻   頁： 587-598   2000年

Characterization of two cDNA clones encoding isozymes of the F1F0-ATPase inhibitor protein of rice mitochondria. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Imamura, T., Tsutsumi, N., Sasaki, T. and Hirai, A.

Planta   210 巻   頁： 188-194   2000年

Molecular and cellular characterizations of a cDNA clone encoding a novel isozyme of aldehyde dehydrogenase from rice. 査読有り 国際誌

Li, Y., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Gene   249 巻   頁： 67-74   2000年

Transcript levels of the nuclear-encoded respiratory genes in rice decrease by oxygen deprivation: evidence for involvement of calcium in expression of the alternative oxidase 1a gene. 査読有り 国際誌

Tsuji, H., Nakazono, M., Saisho, D., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

FEBS Lett.   471 巻   頁： 201-204   2000年

AtUCP2: a Novel isoform of the mitochondrial uncoupling protein of Arabidopsis thaliana. 査読有り 国際誌

Watanabe, A., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Plant Cell Physiol.   40 巻   頁： 1160-1166   1999年

A novel plant nuclear gene coding for chloroplast ribosomal protein S9 has a transit peptide related to that of rice chloroplast ribosomal protein L12. 査読有り 国際誌

Arimura, S., Takusagawa, S., Hatano, S., Nakazono, M., Hirai, A. and Tsutsumi, N.

FEBS Lett.   450 巻   頁： 231-234   1999年

Characterization of a cDNA encoding a novel subunit for cytochrome c oxidase (COX6b) from rice. 査読有り 国際誌

Ohtsu, K., Hamanaka, S., Yamazaki, K., Nakazono, M. and Hirai, A.

Breed. Sci.   49 巻   頁： 211-215   1999年

Identification of cDNA encoding cytochrome c oxidase subunit 5c (COX5c) from rice: comparison of its expression with nuclear-encoded and mitochondrial-encoded COX genes. 査読有り 国際誌

Hamanaka, S., Ohtsu, K., Kadowaki, K., Nakazono, M. and Hirai, A.

Genes Genet. Syst.   74 巻   頁： 71-75   1999年

Transcription of plastid-derived tRNA genes in rice mitochondria. 査読有り 国際誌

Miyata, S., Nakazono, M. and Hirai, A.

Curr. Genet.   34 巻   頁： 216-220   1998年

A rapid and efficient method for the isolation of differentially expressed genes: Simplified differential display. 査読有り 国際誌

Nakazono, M. and Yoshida, K.T.

Plant Biotechnol.   14 巻   頁： 187-190   1997年

A chloroplast derived trnH gene is expressed in the mitochondrial genome of gramineous plants. 査読有り 国際誌

Kanno, A., Nakazono, M., Hirai, A. and Kameya, T.

Plant Mol. Biol.   34 巻   頁： 353-356   1997年

Characterization of the gene family for alternative oxidase from Arabidopsis thaliana. 査読有り 国際誌

Saisho, D., Nambara, E., Naito, S., Tsutsumi, N., Hirai, A. and Nakazono, M.

Plant Mol. Biol.   35 巻   頁： 585-596   1997年

Maintenance of chloroplast-derived sequences in the mitochondrial DNA of Gramineae. 査読有り 国際誌

Kanno, A., Nakazono, M., Hirai, A. and Kameya, T.

Curr. Genet.   32 巻   頁： 413-419   1997年

Transcript levels of tandem-arranged alternative oxidase genes in rice are increased by low temperature. 査読有り 国際誌

Ito, Y., Saisho, D., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Gene   203 巻   頁： 121-129   1997年

A chloroplast-derived sequence is utilized as a source of promoter sequences for the gene for subunit 9 of NADH dehydrogenase (nad9) in rice mitochondria. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Nishiwaki, S., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Mol. Gen. Genet.   252 巻   頁： 371-378   1996年

Multiple initiation sites for transcription of a gene for subunit 1 of F1-ATPase (atp1) in rice mitochondria. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Ishikawa, M., Yoshida, K.T., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Curr. Genet.   29 巻   頁： 417-422   1996年

The gene for a subunit of an ABC-type heme transporter is transcribed together with the gene for subunit 6 of NADH dehydrogenase in rice mitochondria. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Ito, Y., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Curr. Genet.   29 巻   頁： 412-416   1996年

RNA editing of transcripts of the gene for apocytochrome b (cob) in rice mitochondria. 査読有り 国際誌

Ito, Y., Nakazono, M., Kadowaki, K., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Genes Genet. Syst.   71 巻   頁： 85-89   1996年

Homologous recombination mediated by two palindromic repeated sequences in the mitochondrial genome of Oryza. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Kanno, A., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

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Structure of a gene for subunit 9 of NADH dehydrogenase (nad9) in rice mitochondria and RNA editing of its transcript. 査読有り 国際誌

Nishiwaki, S., Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Plant Cell Physiol.   36 巻   頁： 1135-1138   1995年

A small repeated sequence contains the transcription initiation sites for both trnfM and rrn26 in rice mitochondria. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Tsutsumi, N., Sugiura, M. and Hirai, A.

Plant Mol. Biol.   28 巻   頁： 343-346   1995年

The CRTA motif is present in the promoters of mitochondrial genes of rice. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Plant Sci.   105 巻   頁： 227-234   1995年

The rps3-rpl16-nad3-rps12 gene cluster in rice mitochondrial DNA is transcribed from alternative promoters. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Itadani, H., Wakasugi, T., Tsutsumi, N., Sugiura, M. and Hirai, A.

Curr. Genet.   27 巻   頁： 184-189   1995年

Palindromic repeated sequences (PRSs) in the mitochondrial genome of rice: evidence for their insertion after divergence of the genus Oryza from the other Gramineae. 査読有り 国際誌

Nakazono, M., Kanno, A., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Plant Mol. Biol.   24 巻   頁： 273-281   1994年

Nucleotide sequence of a 28 kbp portion of rice mitochondrial DNA: the existence of many sequences that correspond to parts of mitochondrial genes in intergenic regions. 査読有り 国際誌

Itadani, H., Wakasugi, T., Sugita, M., Sugiura, M., Nakazono, M. and Hirai, A.

Plant Cell Physiol.   35 巻   頁： 1239-1244   1994年

Evolutionary variation in DNA sequences transferred from chloroplast genomes to mitochondrial genomes in the Gramineae. 査読有り 国際誌

Watanabe, N., Nakazono, M., Kanno, A., Tsutsumi, N. and Hirai, A.

Curr. Genet.   26 巻   頁： 512-518   1994年

Six percent of the mitochondrial genome in rice came from chloroplast DNA. 査読有り 国際誌

Hirai, A. and Nakazono, M.

Plant Mol. Biol. Reporter   11 巻   頁： 98-100   1993年

Identification of the entire set of transferred chloroplast DNA sequences in the mitochondrial genome of rice. 査読有り 国際誌

Nakazono, M. and Hirai, A.

Mol. Gen. Genet.   236 巻   頁： 341-346   1993年

Genetic and physical maps and a clone bank of mitochondrial DNA from rice. 査読有り 国際誌

Iwahashi, M., Nakazono, M., Kanno, A., Sugino, K., Ishibashi, T. and Hirai, A.

Theor. Appl. Genet.   84 巻   頁： 275-279   1992年

イネ実生の嫌気応答：冠水下で伸びる謎に迫る. 「発芽生物学―種子発芽の生理・生態・分子機構― （種生物学会（吉岡俊人、清和研二）編）」

高橋宏和、中園幹生（ 担当： 共著）

文一総合出版  2009年 

Abiotic stress. [Rice Biology in the Genomics Era (Hirai, H., Sasaki, T., Sano, Y. and Hirano, H. (eds))]

Ohnishi, T., Nakazono, M. and Tsutsumi, N.（ 担当： 共著）

Springer  2008年 

Frequent DNA transfer among mitochondrial, plastid and nuclear genomes of rice during evolution. [Rice Biology in the Genomics Era (Hirai, H., Sasaki, T., Sano, Y. and Hirano, H. (eds)) ]

Nakazono, M. and Hirai, A.（ 担当： 共著）

Springer  2008年 

植物は過湿土壌にどのように適応しているのか 「化学と生物」

塩野克宏、高橋宏和、中園幹生（ 担当： 共著）

学会出版センター  2008年 

環境ストレスに応答したヒストン修飾の制御. 「植物のエピジェネティクス（細胞工学別冊 植物細胞工学24）」

辻 寛之、中園幹生（ 担当： 共著）

秀潤社  2008年 

ヒストン修飾による植物の環境応答. 「化学と生物」

中園幹生、三好健太郎、松永幸大（ 担当： 共著）

学会出版センター  2007年 

植物のヒストン翻訳後修飾研究の幕開け. 「化学と生物」

松永幸大、栗原大輔、中園幹生（ 担当： 共著）

学会出版センター  2006年 

Involvement of aldehyde dehydrogenase in alleviation of post-anoxic injury in rice. [Abiotic stress tolerance in plants --Toward the improvement of global environment and food-- (Rai, A.K. and Takabe, T. (eds))]

Meguro, N., Tsuji, H., Tsutsumi, N., Nakazono, M. and Hirai, A.（ 担当： 共著）

Springer  2006年 

酸化ストレスとミトコンドリア機能. 「二重膜オルガネラの遺伝学　（蛋白質核酸酵素（2005年11月号増刊））」

目黒直樹、最相大輔、中園幹生（ 担当： 共著）

共立出版  2005年 

Gene structure and expression of alternative oxidases from Arabidopsis thaliana and Oryza sativa. [Plant mitochondria: from gene to function]

Nakazono, M., Saisho, D., Ito, Y., Hamanaka, S., Tsujii, T. and Hirai, A.（ 担当： 共著）

Backhuys Publishers  1998年 

高等植物のミトコンドリアゲノム：ゲノム構造とその再編成 「蛋白質核酸酵素」

中園幹生、平井篤志（ 担当： 共著）

共立出版  1992年 

イネのスベリン生合成経路に関与するNAM型転写因子の機能解析

西内俊策, 渡邊宏太郎, 山内卓樹, 高橋宏和, 塩野克宏, 槌田(間山)智子, 光田展隆, 高木優, 市川裕章, 中園幹生  

育種学研究13 巻   2011年

イネの根における誘導的通気組織形成に関与する遺伝子の網羅的発現解析

山内卓樹, 塩野克宏, 塩野克宏, 安彦友美, RAJHI Imene, 高牟禮逸朗, 長村吉晃, 堤伸浩, 中園幹生, 加藤清明  

育種学研究12 巻   2010年

マイクロアレイによるイネの根の通気組織形成に関わる分子機構の解析

山内卓樹, 塩野克宏, 塩野克宏, 安彦友美, RAJHI Imene, 高牟禮逸朗, 長村吉晃, 堤伸浩, 加藤清明, 中園幹生, 中園幹生  

育種学研究12 巻   2010年

テオシント(Zea nicaraguensis)の耐湿性に関わる特性

安彦友美, 間野吉郎, 塩野克宏, 塩野克宏, 堤伸浩, 中園幹生  

育種学研究12 巻   2010年

イネの耐湿性獲得に重要なRadial O₂ lossバリアの形成組織における網羅的遺伝子発現解析

塩野克宏, 塩野克宏, AL IMRAN Malik, 山崎聡, 西澤直子, 西澤直子, 長村吉晃, 堤伸浩, COLMER TIMOTHY D., 中園幹生  

育種学研究12 巻   2010年

Genetic and physiological analyses of root traits for internal aeration of plants under flooded soil conditions 招待有り

Mikio Nakazono

Anmeldung zu einem Vortrag im Rahmen des Botanischen Kolloquiums  2019年5月17日 

Root traits that determine waterlogging resilience in rice and maize 招待有り 国際会議

Mikio Nakazono

Keystone Symposia Conference - Climate Change-Linked Stress Tolerance in Plants   2019年5月15日 

Characterization of the root traits for internal aeration of rice under flooded soil conditions 招待有り 国際会議

Mikio Nakazono

16th International Symposium on Rice Functional Genomics   2018年9月5日 

Genetic and physiological analyses of the root traits for internal aeration of crops under flooded soil conditions 招待有り

Mikio Nakazono

International Symposium on Crop Roots and Rhizosphere Interactions  2017年10月10日 

The roles of ethylene and auxin in constitutive lysigenous aerenchyma formation in rice root 国際会議

Mikio Nakazono

12th International Society for Plant Anaerobiosis Conference  2016年9月7日 

遺伝型・表現型が支配する水稲根圏の微生物食物連鎖構造と機能

研究課題/研究課題番号：20H02887  2020年4月 - 2023年3月

日本学術振興会  科学研究費補助金  基盤研究（B）

村瀬 潤（研究代表者）、中園幹生、土井 一行、 西内 俊策

酸素漏出バリア形成機構の解明及びトウモロコシの耐湿性向上への寄与の検証

研究課題/研究課題番号：18H02175  2018年4月 - 2021年3月

日本学術振興会  科学研究費補助金  基盤研究（B）

中園幹生（研究代表者）、間野吉郎、高溝 正

イネ葉鞘における塩排除能の分子機構の解明と耐塩性強化法の提案

研究課題/研究課題番号：16K14836  2016年4月 - 2019年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究

三屋 史朗, 中園 幹生, 髙橋 宏和, Cartagena Joyce

トウモロコシの耐湿性強化に寄与する酸素漏出バリアの形成機構の解明

研究課題/研究課題番号：15H04434  2015年4月 - 2018年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

中園 幹生, 間野 吉郎

ダイズの二次通気組織形成を誘導する葉由来の長距離シグナルの探索

研究課題/研究課題番号：25660003  2013年4月 - 2015年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究

中園 幹生

ダイズの耐湿性強化に寄与する二次通気組織の形成機構の解明

研究課題/研究課題番号：12F02394  2012年4月 - 2016年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

中園 幹生, QI XIAOHUA, QI Xiaohua, QI X., 中園 幹生, QI XIAOHUA, QI Xiaohua, QI X.

アジアの洪水常襲地に適した持続的作物栽培体系の開発

研究課題/研究課題番号：24405021  2012年4月 - 2016年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

坂上 潤一, 江原 宏, 許 東河, 中園 幹生, 八田 珠郎, 犬飼 義明, 鴨下 顕彦, 川口 健太郎, 國分 牧衛

イネのジテルペン環化酵素遺伝子群の進化・分化に関する研究

研究課題/研究課題番号：24580155  2012年4月 - 2015年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

豊増 知伸, 岡田 憲典, 黒田 昌治, 中園 幹生

イネのカスパリー線へのスベリン供給を調節する膜輸送体・転写因子の機能解明

研究課題/研究課題番号：23380004  2011年4月 - 2014年3月

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

中園 幹生

作物の耐湿性強化に寄与する根への効率的な酸素供給機構の解明

研究課題/研究課題番号：11F01082  2011年 - 2013年

日本学術振興会  科学研究費助成事業 特別研究員奨励費  特別研究員奨励費

中園 幹生, KULICHIKHIN Konstantin

トウモロコシの通気組織形成過程で合成される組織特異的タンパク質の網羅的解析

研究課題/研究課題番号：23658008  2011年 - 2012年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究

中園 幹生

巨大葉緑体イネ変異体の利用による葉緑体ゲノム改変技術の確立

研究課題/研究課題番号：22380007  2010年 - 2012年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

坂本 亘, 中園 幹生

作物の耐湿性向上に関わる根の酸素漏洩バリア形成の機構解明

研究課題/研究課題番号：10F00095  2010年 - 2011年

日本学術振興会  科学研究費助成事業 特別研究員奨励費  特別研究員奨励費

中園 幹生, KOTULA Lukasz

エンドサイトーシスによる糖蓄積機構解明とその育種利用

研究課題/研究課題番号：21248002  2009年 - 2011年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

堤 伸浩, 中園 幹生, 有村 慎一

アブラナ科およびナス科植物の自家不和合性の分子機構解明

研究課題/研究課題番号：21248014  2009年 - 2011年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

高山 誠司, 平野 良憲, 前島 正義, 永井 健治, 中園 幹生, 倉田 のり

細胞質雄性不稔系統を用いたミトコンドリアから核へのシグナル伝達機構の解明

研究課題/研究課題番号：08F08423  2008年 - 2010年

日本学術振興会  科学研究費助成事業 特別研究員奨励費  特別研究員奨励費

中園 幹生, YANG Jing-Hua

高等植物のミトコンドリアダイナミクスと生殖戦略

研究課題/研究課題番号：18075005  2006年 - 2010年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

堤 伸浩, 中園 幹生, 有村 慎一