Organization
Graduate School of Science Associate professor
Graduate School
Graduate School of Science
Undergraduate School
School of Science
Title
Associate professor
MAKI, Kosuke
Degree 1
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博士（理学） （ 1999.3 東京大学 ）
Research Interests 4
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function
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structure
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folding
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protein
Research Areas 1
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Others / Others / Biophysics
Research History 8
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Nagoya University Graduate School of Science Associate professor
2007.6
Country：Japan
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Okazaki Institute of Integrative Bioscience Assistant Professor
2007.4 - 2007.5
Country：Japan
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Institute for Molecular Science, National Institutes of Natural Sciences Assistant Professor
2007.4 - 2007.5
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The Graduate University for Advanced Studies School of Physical Sciences Assistant Professor
2007.4 - 2007.5
Country：Japan
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The University of Tokyo Department of Physics, Graduate School of Science Assistant
2003.2 - 2007.3
Country：Japan
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Fox Chase Cancer Center Postdoctoral associate
2001.9 - 2003.1
Country：United States
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New Energy and Industrial Technology Development Organization (worked at National Institute of Advanced Industrial Science and Technology) NEDO fellow
2000.4 - 2001.8
Country：Japan
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Marine Biotechnology Institute Co., Ltd (worked at National Institute of Bioscience and Human Technology) Postdoctoral fellow
1999.4 - 2000.3
Country：Japan
Education 3
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The University of Tokyo Graduate School, Division of Science Department of Physics
1996.4 - 1999.3
Country： Japan
-
The University of Tokyo Graduate School, Division of Science Department of Physics
1994.4 - 1996.3
Country： Japan
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The University of Tokyo Faculty of Science Department of Physics
1990.4 - 1994.3
Country： Japan
Professional Memberships 3
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The Physical Society of Japan
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Protein Science Society of Japan
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Biophysical Society of Japan
Committee Memberships 2
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日本物理学会 領域12運営委員(生物物理)
2010.10 - 2011.9
Committee type：Academic society
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日本蛋白質科学会 アーカイブ編集委員会委員
2007.4 - 2015.3
Committee type：Academic society
Papers 5
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Folding of Staphylococcal Nuclease Induced by Binding of Chemically Modified Substrate Analogues Sheds Light on Mechanisms of Coupled Folding/Binding Reactions Reviewed International coauthorship
Mori Yujiro, Mizukami Takuya, Segawa Saho, Roder Heinrich, Maki Kosuke
Biochemistry Vol. 62 ( 11 ) page： 1670 - 1678 2023.5
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Energetics and kinetics of substrate analog-coupled staphylococcal nuclease folding revealed by a statistical mechanical approach Reviewed International coauthorship
Mizukami Takuya, Furuzawa Shunta, Itoh Satoru G., Segawa Saho, Ikura Teikichi, Ihara Kunio, Okumura Hisashi, Roder Heinrich, Maki Kosuke
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America Vol. 117 ( 33 ) page： 19953 - 19962 2020.8
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Three-Step Isomerization of the Retinal Chromophore during the Anion Pumping Cycle of Halorhodopsin Reviewed
Kouyama Tsutomu, Ihara Kunio, Maki Kosuke, Chan Siu Kit
Biochemistry Vol. 57 ( 41 ) page： 6013 - 6026 2018.10
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統計力学モデルを用いて捉えなおす蛋白質の酸変性・フォールディング Reviewed
水上 琢也, 槇 亙介
日本物理学会誌 Vol. 73 ( 2 ) page： 85 - 90 2018.2
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Characterization of kinetic folding intermediates of recombinant canine milk lysozyme by stopped-flow circular dichroism. Reviewed
Nakao, M., Maki, K., Arai, M., Koshiba, T., Nitta, K. and Kuwajima, K.
Biochemistry Vol. 44 ( 17 ) page： 6685 - 6692 2005.5
Books 2
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"Equilibrium and kinetically observed molten globule states." in Protein Folding Handbook Reviewed
Maki, K., Kamagata, K., Kuwajima, K.（ Role： Joint author）
WILEY-VCH 2005.1 （ ISBN:9783527307845 ）
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"Early events in protein folding explored by rapid mixing methods." in Protein Folding Handbook Reviewed International journal
Roder, H., Maki, K., Latypov, R. F., Cheng, H. and Shastry, M. C. R.（ Role： Joint author）
WILEY-VCH 2005.1 （ ISBN:9783527307845 ）
Presentations 1
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Structural Insights into Switching Mechanisms between Spontaneous Folding and Ligand-Induced Folding of Staphylococcal Nuclease International coauthorship International conference
Yujiro Mori, Issei Suzuki, Shingo Furuzawa, Kosuke Miki, Heinrich Roder, Kosuke Maki
21st IUPAB Congress 2024 / The 62nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2024.6.26 International Union of Pure and Applied Biophysics / Biophysical Society of Japan
KAKENHI (Grants-in-Aid for Scientific Research) 4
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Elucidation of driving forces underlying protein folding coupled with ligand binding.
Grant number：20K06578 2020.4 - 2024.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
Grant amount：\4420000 （ Direct Cost: \3400000 、 Indirect Cost：\1020000 ）
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Grant number：24570181 2012.4 - 2016.3
科学研究費補助金 基盤研究(C)
槇亙介
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
Grant amount：\5330000 （ Direct Cost: \4100000 、 Indirect Cost：\1230000 ）
本研究の目標は、蛋白質のフォールディングエネルギー地形を、実験の立場から定量的に記述し、蛋白質が天然状態へたどり着く機構を理解することである。スタフィロコッカル・ヌクレアーゼについて、蛍光共鳴エネルギー移動と超高速混合法とを組み合わせ、反応初期に非一様な構造形成が起こることを見いだした。これは初期中間体形成が特異的な相互作用に起因することを示唆する。アポミオグロビンについて、フォールディング反応初期に蓄積する中間体が平衡条件下において蓄積する中間体と同じ速度過程で形成することを見いだした。この結果は、これらの中間体が同一の分子種であることを示唆する。
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球状蛋白質のフォールディング自由エネルギー地形と中間体構造アンサンブルの探索
Grant number：20570153 2008.4 - 2010.3
科学研究費補助金 基盤研究(C)
槙 亙介
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
Grant amount：\4940000 （ Direct Cost: \3800000 、 Indirect Cost：\1140000 ）
球状蛋白質スタフィロコッカル・ヌクレアーゼ及びウマアポミオグロビンのフォールディングを速度論的手法と変異体解析を駆使して特徴付けた。スタフィロコッカル・ヌクレアーゼはフォールディング反応初期に特にβ-バレルドメイン内で顕著な凝縮が認められた。ウマアポミオグロビンは、反応開始後100マイクロ秒以内に中間体を蓄積し、更に逐次的に少なくとも二種類の中間体を経て天然状態に至ることが明らかになった。
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球状蛋白質の自由エネルギー地形とフォールディング中間体構造アンサンブルの探索
Grant number：18770125 2006.4 - 2008.3
科学研究費補助金 若手研究(B)
槙亙介
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
Grant amount：\3700000 （ Direct Cost: \3700000 ）
本研究計画の目的は、蛋白質のフォールディングの物理化学的機構を解明し、特にフォールディング中間体の役割を明らかにすることである。このために、蛋白質フォールディングの速度論的研究で現在広く用いられているストップト・フロー装置よりも不感時間が二桁以上短い超高速混合連続フロー装置を作成する。連続フロー法とストップト・フロー法とを組み合わせて用いることにより、フォールディング開始後数十マイクロ秒の反応初期から天然状態に至る構造形成過程を観測する。昨年度に引き続き、装置のさらなる不感時間の短縮を目指し、装置の不感時間は約100μsに向上した。また、1-アニリノナフタレン-8-スルホン酸の蛍光をプローブに用いることにより、トリプトファンの蛍光をプローブとする場合と比べて、遙かに低い蛋白質濃度(約5μM)で観測を行えることを確認した。
いくつかのモデル蛋白質について、マイクロ秒領域でのフォールディングを観測することができたものの、不感時間内に於けるシグナル変化(バースト相)が観測された。また、連続フロー法とストップト・フロー法とで観測可能な時間領域に2-3msのギャップがある。今後は、より曖昧さを排除した観測を行うために、1.より短い不感時間の連続フロー装置用溶液混合装置を作成すること、2.連続フロー法で観測できる時間領域を長くするための技術の開発、3.ストップト・フロー装置の不感時間を短縮する、の三点を解決することが必要である。
Teaching Experience (On-campus) 40
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Physics Tutorial I
2022
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Laboratory in Physics
2022
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Chemical Physics
2022
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Physics Tutorial I
2021
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Laboratory in Physics
2021
-
Chemical Physics
2021
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Laboratory in Physics
2020
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Physics Tutorial I
2020
-
Chemical Physics
2020
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物理学演習I-1
2018
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物理学実験
2018
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化学物理学
2018
-
化学物理学
2017
-
物理学実験
2017
-
物理学演習I-1
2017
-
物理学実験
2016
-
化学物理学
2016
-
物理学演習I-1
2016
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Chemical physics
2015
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物理学実験
2015
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物理学演習I-1
2015
-
Chemical physics
2014
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物理学実験
2014
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物理学演習I-1
2014
-
Chemical physics
2013
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物理学演習I-1
2013
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物理学実験
2013
-
物理学実験
2012
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物理学演習I-1
2012
-
化学物理学
2012
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物理学演習III
2011
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物理学演習I-1
2011
-
化学物理学
2011
-
化学物理学
2010
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物理学演習III
2009
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生体分子の物性と機能セミナー
2009
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化学物理学
2009
-
化学物理学
2008
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生体分子の物性と機能セミナー
2008
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基礎セミナーA
2008