2023/06/29 更新

写真a

ミウラ ノブアキ
三浦 信明
MIURA Nobuaki
所属
糖鎖生命コア研究所 戦略推進室 支援部門 特任講師
職名
特任講師

研究キーワード 6

  1. グライコーム

  2. バイオインフォマティクス

  3. プロテオーム

  4. メタプロテオーム

  5. 糖質科学

  6. 計算化学

研究分野 3

  1. ナノテク・材料 / 基礎物理化学  / 理論化学

  2. ナノテク・材料 / 生体化学  / 分子シミュレーション・計算化学

  3. 情報通信 / 生命、健康、医療情報学  / バイオインフォマティクス・メタプロテオミクス ・グライコミクス

経歴 6

  1. 名古屋大学   糖鎖生命コア研究所   特任講師

    2023年6月 - 現在

  2. お茶の水女子大学   プロジェクト教育研究院   特任准教授

    2013年5月 - 2017年3月

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    国名:日本国

  3. 北海道大学   大学院先端生命科学研究院   特任准教授

    2003年10月 - 2012年3月

  4. 北海道大学   大学院理学研究科   博士研究員

    2001年10月 - 2003年9月

  5. 東京都立大学   大学院理学研究科   科学技術振興事業団研究員

    1999年4月 - 2001年9月

  6. 工業技術院   物質工学工業技術研究所   COE研究員

    1998年2月 - 1999年3月

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学歴 3

  1. 北海道大学   理学研究科   化学第二専攻

    - 1998年

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    国名: 日本国

  2. 北海道大学   理学研究科   化学第二専攻

    - 1992年

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    国名: 日本国

  3. 北海道大学   理学部   化学第二学科

    - 1990年

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    国名: 日本国

 

論文 76

  1. Exposure to brefeldin A induces unusual expression of hybrid- and complex-type free N-glycans in HepG2 cells 査読有り

    Kanako Sugiura, Yuho Kawai, Arisa Yamamoto, Hiroki Yoshioka, Yuika Kiyohara, Ayaka Iida, Yurika Ozawa, Mai Nishikawa, Nobuaki Miura, Hisatoshi Hanamatsu, Jun-ichi Furukawa, Yasuro Shinohara

    Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects     頁: 130331 - 130331   2023年2月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.bbagen.2023.130331

  2. Current progress and critical challenges to overcome in the bioinformatics of mass spectrometry-based metaproteomics 招待有り 査読有り

    Nobuaki Miura, Shujiro Okuda

    Computational and Structural Biotechnology Journal   21 巻   頁: 1140 - 1150   2023年1月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.csbj.2023.01.015

  3. Toolbox Accelerating Glycomics (TAG): Improving Large-Scale Serum Glycomics and Refinement to Identify SALSA-Modified and Rare Glycans 招待有り 査読有り 国際誌

    Nobuaki Miura, Hisatoshi Hanamatsu, Ikuko Yokota, Keiko Akasaka-Manya, Hiroshi Manya, Tamao Endo, Yasuro Shinohara, Jun-ichi Furukawa

    International Journal of Molecular Sciences   23 巻 ( 21 ) 頁: 13097 - 13097   2022年10月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:MDPI AG  

    Glycans are involved in many fundamental cellular processes such as growth, differentiation, and morphogenesis. However, their broad structural diversity makes analysis difficult. Glycomics via mass spectrometry has focused on the composition of glycans, but informatics analysis has not kept pace with the development of instrumentation and measurement techniques. We developed Toolbox Accelerating Glycomics (TAG), in which glycans can be added manually to the glycan list that can be freely designed with labels and sialic acid modifications, and fast processing is possible. In the present work, we improved TAG for large-scale analysis such as cohort analysis of serum samples. The sialic acid linkage-specific alkylamidation (SALSA) method converts differences in linkages such as α2,3- and α2,6-linkages of sialic acids into differences in mass. Glycans modified by SALSA and several structures discovered in recent years were added to the glycan list. A routine to generate calibration curves has been implemented to explore quantitation. These improvements are based on redefinitions of residues and glycans in the TAG List to incorporate information on glycans that could not be attributed because it was not assumed in the previous version of TAG. These functions were verified through analysis of purchased sera and 74 spectra with linearity at the level of R2 > 0.8 with 81 estimated glycan structures obtained including some candidate of rare glycans such as those with the N,N’-diacetyllactosediamine structure, suggesting they can be applied to large-scale analyses.

    DOI: 10.3390/ijms232113097

    PubMed

  4. Evaluation of the context of downstream N- and free N-glycomic alterations induced by swainsonine in HepG2 cells. 国際誌

    Chie Morikawa, Kanako Sugiura, Keina Kondo, Yurie Yamamoto, Yuma Kojima, Yurika Ozawa, Hiroki Yoshioka, Nobuaki Miura, Jinhua Piao, Kazue Okada, Hisatoshi Hanamatsu, Masumi Tsuda, Shinya Tanaka, Jun-Ichi Furukawa, Yasuro Shinohara

    Biochimica et biophysica acta. General subjects     頁: 130168 - 130168   2022年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Swainsonine (SWA), a potent inhibitor of class II α-mannosidases, is present in a number of plant species worldwide and causes severe toxicosis in livestock grazing these plants. The mechanisms underlying SWA-induced animal poisoning are not fully understood. In this study, we analyzed the alterations that occur in N- and free N-glycomic upon addition of SWA to HepG2 cells to understand better SWA-induced glycomic alterations. After SWA addition, we observed the appearance of SWA-specific glycomic alterations, such as unique fucosylated hybrid-type and fucosylated M5 (M5F) N-glycans, and a remarkable increase in all classes of Gn1 FNGs. Further analysis of the context of these glycomic alterations showed that (fucosylated) hybrid type N-glycans were not the precursors of these Gn1 FNGs and vice versa. Time course analysis revealed the dynamic nature of glycomic alterations upon exposure of SWA and suggested that accumulation of free N-glycans occurred earlier than that of hybrid-type N-glycans. Hybrid-type N-glycans, of which most were uniquely core fucosylated, tended to increase slowly over time, as was observed for M5F N-glycans. Inhibition of swainsonine-induced unique fucosylation of hybrid N-glycans and M5 by coaddition of 2-fluorofucose caused significant increases in paucimannose- and fucosylated paucimannose-type N-glycans, as well as paucimannose-type free N-glycans. The results not only revealed the gross glycomic alterations in HepG2 cells induced by swainsonine, but also provide information on the global interrelationships between glycomic alterations.

    DOI: 10.1016/j.bbagen.2022.130168

    PubMed

  5. Functional glyco-metagenomics elucidates the role of glycan-related genes in environments. 国際誌

    Hayato Takihara, Nobuaki Miura, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Shujiro Okuda

    BMC bioinformatics   22 巻 ( 1 ) 頁: 505 - 505   2021年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    BACKGROUND: Glycan-related genes play a fundamental role in various processes for energy acquisition and homeostasis maintenance while adapting to the environment in which the organism exists; however, their role in the microbiome in the environment is unclear. METHODS: Sequence alignment was performed between known glycan-related genes and complete genomes of microorganisms, and optimal parameters for identifying glycan-related genes were determined based on the alignments. Using the constructed scheme (> 90% of identity and > 25 aa of alignment length), glycan-related genes in various environments were identified from 198 different metagenome data. RESULTS: As a result, we identified 86.73 million glycan-related genes from the metagenome data. Among the 12 environments classified in this study, the percentage of glycan-related genes was high in the human-associated environment, suggesting that these environments utilize glycan metabolism better than other environments. On the other hand, the relative abundances of both glycoside hydrolases and glycosyltransferases surprisingly had a coverage of over 80% in all the environments. These glycoside hydrolases and glycosyltransferases were classified into two groups of (1) general enzyme families identified in various environments and (2) specific enzymes found only in certain environments. The general enzyme families were mostly from genes involved in monosaccharide metabolism, and most of the specific enzymes were polysaccharide degrading enzymes. CONCLUSION: These findings suggest that environmental microorganisms could change the composition of their glycan-related genes to adapt the processes involved in acquiring energy from glycans in their environments. Our functional glyco-metagenomics approach has made it possible to clarify the relationship between the environment and genes from the perspective of carbohydrates, and the existence of glycan-related genes that exist specifically in the environment.

    DOI: 10.1186/s12859-021-04425-9

    PubMed

  6. Oral Pathobiont-Induced Changes in Gut Microbiota Aggravate the Pathology of Nonalcoholic Fatty Liver Disease in Mice 査読有り

    Kyoko Yamazaki, Tamotsu Kato, Yuuri Tsuboi, Eiji Miyauchi, Wataru Suda, Keisuke Sato, Mayuka Nakajima, Mai Yokoji-Takeuchi, Miki Yamada-Hara, Takahiro Tsuzuno, Aoi Matsugishi, Naoki Takahashi, Koichi Tabeta, Nobuaki Miura, Shujiro Okuda, Jun Kikuchi, Hiroshi Ohno, Kazuhisa Yamazaki

    Frontiers in Immunology   12 巻   2021年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Frontiers Media {SA}  

    <jats:sec><jats:title>Background &amp;amp; Aims</jats:title><jats:p>Periodontitis increases the risk of nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD); however, the underlying mechanisms are unclear. Here, we show that gut dysbiosis induced by oral administration of <jats:italic>Porphyromonas gingivalis</jats:italic>, a representative periodontopathic bacterium, is involved in the aggravation of NAFLD pathology.</jats:p></jats:sec><jats:sec><jats:title>Methods</jats:title><jats:p>C57BL/6N mice were administered either vehicle, <jats:italic>P. gingivalis</jats:italic>, or <jats:italic>Prevotella intermedia</jats:italic>, another periodontopathic bacterium with weaker periodontal pathogenicity, followed by feeding on a choline-deficient, l-amino acid-defined, high-fat diet with 60 kcal% fat and 0.1% methionine (CDAHFD60). The gut microbial communities were analyzed by pyrosequencing the 16S ribosomal RNA genes. Metagenomic analysis was used to determine the relative abundance of the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways encoded in the gut microbiota. Serum metabolites were analyzed using nuclear magnetic resonance-based metabolomics coupled with multivariate statistical analyses. Hepatic gene expression profiles were analyzed <jats:italic>via</jats:italic> DNA microarray and quantitative polymerase chain reaction.</jats:p></jats:sec><jats:sec><jats:title>Results</jats:title><jats:p>CDAHFD60 feeding induced hepatic steatosis, and in combination with bacterial administration, it further aggravated NAFLD pathology, thereby increasing fibrosis. Gene expression analysis of liver samples revealed that genes involved in NAFLD pathology were perturbed, and the two bacteria induced distinct expression profiles. This might be due to quantitative and qualitative differences in the influx of bacterial products in the gut because the serum endotoxin levels, compositions of the gut microbiota, and serum metabolite profiles induced by the ingested <jats:italic>P. intermedia</jats:italic> and <jats:italic>P. gingivalis</jats:italic> were different.</jats:p></jats:sec><jats:sec><jats:title>Conclusions</jats:title><jats:p>Swallowed periodontopathic bacteria aggravate NAFLD pathology, likely due to dysregulation of gene expression by inducing gut dysbiosis and subsequent influx of gut bacteria and/or bacterial products.</jats:p></jats:sec>

    DOI: 10.3389/fimmu.2021.766170

  7. メタプロテオミクスとバイオインフォマティクス解析における課題 招待有り

    三浦信明

    日本プロテオーム学会誌   6 巻 ( 1 ) 頁: 17 - 27   2021年7月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  8. Obesity-Related Gut Microbiota Aggravates Alveolar Bone Destruction in Experimental Periodontitis through Elevation of Uric Acid 査読有り 国際誌

    Keisuke Sato, Kyoko Yamazaki, Tamotsu Kato, Yumiko Nakanishi, Takahiro Tsuzuno, Mai Yokoji-Takeuchi, Miki Yamada-Hara, Nobuaki Miura, Shujiro Okuda, Hiroshi Ohno, Kazuhisa Yamazaki

    mBio   12 巻 ( 3 ) 頁: e0077121   2021年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:American Society for Microbiology  

    Obesity is an epidemic health issue with a rapid increase worldwide. It increases the risk of various diseases, including periodontal disease, an oral chronic infectious disease.

    DOI: 10.1128/mbio.00771-21

    PubMed

  9. Comprehensive Glycomic Approach Reveals Novel Low-Molecular-Weight Blood Group-Specific Glycans in Serum and Cerebrospinal Fluid 査読有り 国際誌

    Jun-ichi Furukawa, Hisatoshi Hanamatsu, Ikuko Yokota, Megumi Hirayama, Tomohiro Ando, Hiroyuki Kobayashi, Shunsuke Ohnishi, Nobuaki Miura, Kazue Okada, Shota Sakai, Kohei Yuyama, Yasuyuki Igarashi, Makoto Ito, Yasuro Shinohara, Naoya Sakamoto

    Journal of Proteome Research   20 巻 ( 5 ) 頁: 2812 - 2822   2021年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:American Chemical Society (ACS)  

    ABO blood antigens on the human red blood cell membrane as well as different cells in various human tissues have been thoroughly studied. Anti-A and -B antibodies of IgM are present in serum/plasma, but blood group-specific glyco-antigens have not been extensively described. In this study, we performed comprehensive and quantitative serum glycomic analyses of various glycoconjugates and free oligosaccharides in all blood groups. Our comprehensive glycomic approach revealed that blood group-specific antigens in serum/plasma are predominantly present on glycosphingolipids on lipoproteins rather than glycoproteins. Expression of the ABO antigens on glycosphingolipids depends not only on blood type but also on secretor status. Blood group-specific glycans in serum/plasma were classified as type I, whereas those on RBCs had different structures including hexose and hexosamine residues. Analysis of free oligosaccharides revealed that low-molecular-weight blood group-specific glycans, commonly containing lacto-N-difucotetraose, were expressed in serum/plasma according to blood group. Furthermore, comprehensive glycomic analysis in human cerebrospinal fluid showed that many kinds of free oligosaccharides were highly expressed, and low-molecular-weight blood group-specific glycans, which existed in plasma from the same individuals, were present. Our findings provide the first evidence for low-molecular-weight blood group-specific glycans in both serum/plasma and cerebrospinal fluid.

    DOI: 10.1021/acs.jproteome.1c00056

    PubMed

  10. Profiling of host genetic alterations and intra-tumor microbiomes in colorectal cancer 査読有り 国際誌

    Shujiro Okuda, Yoshifumi Shimada, Yosuke Tajima, Kizuki Yuza, Yuki Hirose, Hiroshi Ichikawa, Masayuki Nagahashi, Jun Sakata, Yiwei Ling, Nobuaki Miura, Mika Sugai, Yu Watanabe, Shiho Takeuchi, Toshifumi Wakai

    Computational and Structural Biotechnology Journal   19 巻   頁: 3330 - 3338   2021年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    Some bacteria are symbiotic in tumor tissues, and metabolites of several bacterial species have been found to cause DNA damage. However, to date, the association between bacteria and host genetic alterations in colorectal cancer (CRC) has not been fully investigated. We evaluated the association between the intra-tumor microbiome and host genetic alterations in 29 Japanese CRC patients. The tumor and non-tumor tissues were extracted from the patients, and 16S rRNA genes were sequenced for each sample. We identified enriched bacteria in tumor and non-tumor tissues. Some bacteria, such as Fusobacterium, which is already known to be enriched in CRC, were found to be enriched in tumor tissues. Interestingly, Bacteroides, which is also known to be enriched in CRC, was enriched in non-tumor tissues. Furthermore, it was shown that certain bacteria that often coexist within tumor tissue were enriched in the presence of a mutated gene or signal pathway with mutated genes in the host cells. Fusobacterium was associated with many mutated genes, as well as cell cycle-related pathways including mutated genes. In addition, the patients with a high abundance of Campylobacter were suggested to be associated with mutational signature 3 indicating failure of double-strand DNA break repairs. These results suggest that CRC development may be partly caused by DNA damage caused by substances released by bacterial infection. Taken together, the identification of distinct gut microbiome patterns and their host specific genetic alterations might facilitate targeted interventions, such as modulation of the microbiome in addition to anticancer agents or immunotherapy.

    DOI: 10.1016/j.csbj.2021.05.049

    PubMed

  11. Japan Computational Mass Spectrometry Meeting 2020 Activity Report 査読有り

    Yamamoto H, Hayakawa E, Tsugawa H, Moriya Y, Fukusaki E, Goto S, Hasumura T, Miura N, Yoshizawa A C

    J. Proteome Data and Methods   2 巻   頁: 5 - 8   2020年12月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Proteomics Society  

    The Japan Computational Mass Spectrometry (JCompMS) group was launched in 2016 as a special interest group of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi). It aims to facilitate research communications, protocol exchanges, and further developments of computational mass spectrometry (compMS) in Japan. JCompMS aims to organize data science projects in multi-omics utilizing mass spectrometry such as proteomics, glycomics, lipidomics and metabolomics; currently, its main activities include organizing symposia, workshops, lectures, and hackathons related to compMS research. In this report, we introduce the activities held in 2020 and review the current informatics research on omics using mass spectrometry data in Japan.

    DOI: 10.14889/jpdm.2020.0005

  12. Lactone-Driven Ester-to-Amide Derivatization for Sialic Acid Linkage-Specific Alkylamidation 査読有り 国際誌

    Jun-ichi Furukawa, Hisatoshi Hanamatsu, Takashi Nishikaze, Hiroshi Manya, Nobuaki Miura, Hirokazu Yagi, Ikuko Yokota, Keiko Akasaka-Manya, Tamao Endo, Motoi Kanagawa, Norimasa Iwasaki, Koichi Tanaka

    Analytical Chemistry   92 巻 ( 21 ) 頁: 14383 - 14392   2020年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:American Chemical Society (ACS)  

    Sialic acid attached to nonreducing ends of glycan chains via different linkages is associated with specific interactions and physiological events. Linkage-specific derivatization of sialic acid is of great interest for distinguishing sialic acids by mass spectrometry, specifically for events governed by sialyl linkage types. In the present study, we demonstrate that α-2,3/8-sialyl linkage-specific amidation of esterified sialyloligosaccharides can be achieved via an intramolecular lactone. The method of lactone-driven ester-to-amide derivatization for sialic acid linkage-specific alkylamidation, termed LEAD-SALSA, employs in-solution ester-to-amide conversion to directly generate stable and sialyl linkage-specific glycan amides from their ester form by mixing with a preferred amine, resulting in the easy assignments of sialyl linkages by comparing the signals of esterified and amidated glycan. Using this approach, we demonstrate the accumulation of altered N-glycans in cardiac muscle tissue during mouse aging. Furthermore, we find that the stability of lactone is important for ester-to-amide conversion based on experiments and density functional theory calculations of reaction energies for lactone formation. By using energy differences of lactone formation, the LEAD-SALSA method can be used not only for the sialyl linkage-specific derivatization but also for distinguishing the branching structure of galactose linked to sialic acid. This simplified and direct sialylglycan discrimination will facilitate important studies on sialylated glycoconjugates.

    DOI: 10.1021/acs.analchem.0c02209

    PubMed

  13. p62/SQSTM1-droplet serves as a platform for autophagosome formation and antioxidative stress response 査読有り

    Kageyama S, Gudmundsson S, Sou Y-S, Ichimura Y, Tamura N, Kazuno S, Ueno, T, Miura Y, Noshiro D, Abe M, Mizushima T, Miura N, Okuda S, Motohashi H, Lee J-A, Sakimura K, Ohe T, Noda N, Waguri S, Eskelinen E-L, Komatsu M

    Nature Comm. (inpress)     2020年10月

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    記述言語:英語  

  14. Toolbox Accelerating Glycomics (TAG): Glycan Annotation from MALDI-TOF MS Spectra and Mapping Expression Variation to Biosynthetic Pathways 招待有り 査読有り 国際誌

    Nobuaki Miura, Hisatoshi Hanamatsu, Ikuko Yokota, Kazue Okada, Jun-Ichi Furukawa, Yasuro Shinohara

    Biomolecules   10 巻 ( 10 ) 頁: 1383 - 1383   2020年9月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:MDPI AG  

    Glycans present extraordinary structural diversity commensurate with their involvement in numerous fundamental cellular processes including growth, differentiation, and morphogenesis. Unlike linear DNA and protein sequences, glycans have heterogeneous structures that differ in composition, branching, linkage, and anomericity. These differences pose a challenge to developing useful software for glycomic analysis. To overcome this problem, we developed the novel Toolbox Accelerating Glycomics (TAG) program. TAG consists of three units: ‘TAG List’ creates a glycan list that is used for database searching in TAG Expression; ‘TAG Expression’ automatically annotates and quantifies glycan signals and draws graphs; and ‘TAG Pathway’ maps the obtained expression information to biosynthetic pathways. Herein, we discuss the concepts, outline the TAG process, and demonstrate its potential using glycomic expression profile data from Chinese hamster ovary (CHO) cells and mutants lacking a functional Npc1 gene (Npc1 knockout (KO) CHO cells). TAG not only drastically reduced the amount of time and labor needed for glycomic analysis but also detected and quantified more glycans than manual analysis. Although this study was limited to the analysis of N-glycans and free oligosaccharides, the glycomic platform will be expanded to facilitate the analysis of O-glycans and glycans of glycosphingolipids.

    DOI: 10.3390/biom10101383

    PubMed

  15. Analysis of the susceptibility of reducing disaccharides composed of d-glucose to glycation using the Maillard reaction and a novel sensitive method that measures the percentage of the open-ring form 査読有り

    Yasuro Shinohara, Yurika Ozawa, Akimi Okita, Koichi Kato, Taku Chiba, Nobuaki Miura, Jun-ichi Furukawa

    Carbohydrate Research   493 巻   頁: 108019 - 108019   2020年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.carres.2020.108019

  16. A prospective compound screening contest identified broader inhibitors for Sirtuin 1 査読有り 国際誌

    Chiba S, Ohue M, Gryniukova A, Borysko P, Zozulya S, Yasuo N, Yoshino R, Ikeda K, Shin W-H, Kihara D, Iwadate M, Umeyama H, Ichikawa T, Teramoto R, Hsin K-Y, Gupta V, Kitano H, Sakamoto M, Higuchi A, Miura N, Yura K, Mochizuki M, Ramakrishnan C, Thangakani A M, Velmurugan D, Michael Gromiha M, Nakane I, Uchida N, Hakariya H, Tan M, Nakamura H, Suzuki S D, Ito T, Kawatani M, Kudoh K, Takashina S, Yamamoto K, Moriwaki M, Oda K, Kobayashi D, Okuno T, Minami S, Chikenji G, Prathipati P, Nagao N, Mohsen A, Ito M, Mizuguchi K, Honma T, Ishida T, Hirokawa T, Akiyama Y, Sekijima M

    Scientific Reports   9 巻 ( 1 ) 頁: 19585 - 19585   2019年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Potential inhibitors of a target biomolecule, NAD-dependent deacetylase Sirtuin 1, were identified by a contest-based approach, in which participants were asked to propose a prioritized list of 400 compounds from a designated compound library containing 2.5 million compounds using in silico methods and scoring. Our aim was to identify target enzyme inhibitors and to benchmark computer-aided drug discovery methods under the same experimental conditions. Collecting compound lists derived from various methods is advantageous for aggregating compounds with structurally diversified properties compared with the use of a single method. The inhibitory action on Sirtuin 1 of approximately half of the proposed compounds was experimentally accessed. Ultimately, seven structurally diverse compounds were identified.

    DOI: 10.1038/s41598-019-55069-y

    PubMed

  17. Comparative Glycomic Analysis of Sialyl Linkage Isomers by Sialic Acid Linkage-Specific Alkylamidation in Combination with Stable Isotope Labeling of α2,3-Linked Sialic Acid Residues. 査読有り 国際誌

    Hanamatsu H, Nishikaze T, Tsumoto H, Ogawa K, Kobayashi T, Yokota I, Morikawa K, Suda G, Sho T, Nakai M, Miura N, Higashino K, Sekiya S, Iwamoto S, Miura Y, Furukawa J-I, Tanaka K, Sakamoto N

    Analytical Chemistry   91 巻 ( 21 ) 頁: 13343 - 13348   2019年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Sialic acids form the terminal sugars in glycan chains on glycoproteins via α2,3, α2,6, or α2,8 linkages, and structural isomers of sialyl linkages play various functional roles in cell recognition and other physiological processes. We recently developed a novel procedure based on sialic acid linkage-specific alkylamidation via lactone ring opening (aminolysis-SALSA). Herein, we have investigated an isotope labeling of α2,3-linked sialic acid residues (iSALSA) using amine hydrochloride salts. One limitation of SALSA using amine hydrochloride salts may be solved by adding only tert-butylamine (t-BA) as an acid scavenger, and comparative and quantitative glycomic analyses can be performed using iSALSA. We also developed quantitative glycomic analysis using dual isotope-labeled glycans by derivatizing with aminooxy-functionalized tryptophanylarginine methyl ester (aoWR) and iSALSA at the reducing and nonreducing end, respectively. Furthermore, we demonstrate that the amount of α2,3-linked sialoglycans in serum are altered during liver fibrosis using matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and liquid chromatography MS (LC/MS) analyses. We revealed that the ratio of A33,6,6 to A3F3,6,6 was gradually decreased along with liver fibrosis progression. Therefore, these glycan alterations are potential diagnostic markers of nonalcoholic steatohepatitis (NASH) fibrosis progression.

    DOI: 10.1021/acs.analchem.9b03617

    PubMed

  18. The GlyCosmos Web Portal: glycan structures, glycogenes, glycoproteins, pathways, diseases and more! 査読有り

    Shiota Masaaki, Tsuchiya Shinichiro, Ono Tamiko, Kuoka Thukaa, Miura Nobuaki, Hiraki Aiko, Yamada Issaku, Shinmachi Daisuke, Aoki Nobuyuki P, Kim Jin-Dong, Watanabe Yu, Okuda Shujiro, Suzuki Yoshinori, Fujita Noriaki, Angata Kiyohiko, Narimatsu Hisashi, Aoki-Kinoshita Kiyoko F

    GLYCOBIOLOGY   28 巻 ( 12 ) 頁: 1070 - 1071   2018年12月

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  19. Sialic Acid Linkage-Specific Derivatization of GlycoSphingolipid Glycans by Ring-Opening Aminolysis of Lactones 査読有り

    Hanamatsu H, Nishikaze T, Miura N, Piao J, Okada K, Sekiya S, Iwamoto S, Sakamoto N, Tanaka K, Furukawa J-I

    Analytical Chemistry   90 巻   頁: 13193 - 13199   2018年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  20. Functional network in posttranslational modifications: Glyco-Net in Glycoconjugate Data Bank 査読有り

    Nobuaki Miura, Takuya Okada, Daisuke Murayama, Kazuko Hirose, Taku Sato, Ryo Hashimoto, Nobuhiro Fukushima

    Methods in Molecular Biology   1273 巻   頁: 149 - 157   2015年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/978-1-4939-2343-4_11

    PubMed

  21. Fluorescence polarization-based assay using N-glycan-conjugated quantum dots for screening in hemagglutinin blockers for influenza A viruses 査読有り

    Okamatsu M, Feng F, Ohyanagi T, Nagahori N, Someya K, Sakoda Y, Miura N, Nishimura S-I, Kida H

    Journal of Virological Methods   187 巻 ( 2 ) 頁: 390 - 394   2013年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier B.V.  

    Attachment of influenza virus to susceptible cells is mediated by viral protein hemagglutinin (HA), which recognizes cell surface glycoconjugates that terminate in α-sialosides. To develop anti-influenza drugs based on inhibition of HA-mediated infection, novel fluorescent nanoparticles displaying multiple biantennary N-glycan chains with α-sialosides (A2-PC-QDs) that have high affinity for the HA were designed and constructed. The A2-PC-QDs enabled an easy and efficient fluorescence polarization (FP) assay for detection of interaction with the HA and competitive inhibition even by small molecule compounds against A2-PC-QDs-HA binding. The quantum dot (QD)-based FP assay established in the present study is a useful tool for high-throughput screening and to accelerate the development of novel and more effective blockers of the viral attachment of influenza virus.

    DOI: 10.1016/j.jviromet.2012.11.004

  22. Novel thiosialosides tethered to metal nanoparticles as potent influenza A virus hemagglutinin blockers 査読有り

    Feng F, Sakoda Y, Ohyanagi T, Nagahori N, Shibuya H, Okamastu M, Miura N, Kida H, Nishimura S-I

    Antiviral Chemistry & Chemotherapy   23 巻   頁: 59 - 65   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  23. Identification of novel serum biomarkers of hepatocellular carcinoma using glycomic analysis 査読有り 国際誌

    Kamiyama T, Yokoo H, Furukawa J-I, Kurogochi M, Togashi T, Miura N, Nakanishi K, Kamachi H, Kakisaka T, Tsuruga Y, Taketomi A, Nishimura S-I, Todo S

    Hepatology   57 巻 ( 6 ) 頁: 2314 - 2325   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/hep.26262

    PubMed

  24. Enantioselective synthesis of tripodal cyclophanes and pyridinophanes by intramolecular [2+2+2] cycloaddition 査読有り

    Shibata T, Miyoshi M, Uchiyama T, Endo K, Miura N, Monde K

    Tetrahedron   68 巻   頁: 2679 - 2686   2012年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  25. Relationship between ATM and ribosomal protein S6 revealed by the chemical inhibition of Ser/Thr protein phosphatase Type 1 査読有り

    Li Y, Mitsuhashia S, Ikejo M, Miura N, Kawamura T, Hamakubo T, Ubukata M

    Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry   76 巻 ( 3 ) 頁: 486 - 494   2012年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry  

    The optimal cellular responses to DNA damage are modulated by kinase and phosphatase. The ataxia telangiectasia mutated (ATM) is a Ser/Thr kinase which is the core of the DNA damage signaling apparatus. The Ser/Thr protein phosphatase type 1 (PP1) inhibitor, tautomycetin (TC) and an antibody to the phospho-(S/T)Q sites of the ATM substrate were used to identify the common substrates for PP1 and ATM in regulating the pathway for DNA damage response. Ribosomal protein S6 (RPS6) was first identified as a substrate for PP1 and ATM. The phosphorylation at Ser247 of RPS6 was then significantly decreased by PP1-mediated dephosphorylation immediately after UV irradiation. These results suggest that PP1 specifically dephosphorylated RPS6 at phospho-Ser247 <I>in vivo</I>. In response to DNA damage, ATM activity was finally required for the phosphorylation of RPS6 at Ser247. We propose from these results a novel mechanism for modulating the RPS6 function by PP1 and ATM which regulates cell growth and survival in response to DNA-damage stimuli.

    DOI: 10.1271/bbb.110774

    CiNii Books

    その他リンク: https://jlc.jst.go.jp/DN/JALC/10000221015?from=CiNii

  26. A Strategy for neuraminidase inhibitors using mechanism-based labeling information 査読有り

    Hinou H, Miyoshi R, Takasu Y, Kai H, Kurogochi M, Arioka S, Gao X-D, Miura N, Fujitani N, Otomo S, Yoshinaga T, Fujiwara T, Noshi T, Togame H, Takemoto H, Nishimura S-I

    Chemistry an Asian Journal   2011 巻 ( 4 ) 頁: 1048 - 1056   2011年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/asia.201000594

    Scopus

    PubMed

  27. Salvileucalin C, a novel rearranged neoclerodane diterpene from Salvia leucantha 査読有り

    Aoyagi Y, Yamazaki A, Kato R, Tobe F, Fukaya H, Nishikawa T, Nakahashi A, Miura N, Monde K, Takeya K

    Tetrahedron Letters   52 巻   頁: 1851 - 1853   2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  28. Alg14 organizes the formation of a multi-glycosyltransferase complex involved in initiation of lipid-linked oligosaccharide biosynthesis 査読有り

    Lu J, Takahashi T, Ohoka A, Nakajima K-I, Hashimoto R, Miura N, Tachikawa H, Gao X-D

    Glycobiology   22 巻   頁: 504 - 516   2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  29. A vibrational circular dichroism approach to the determination of the absolute configurations of flavorous 5-substituted- 2(5H)-furanones 査読有り

    Nakahashi A, Yaguchi Y, Miura N, Emura M, Monde K

    Journal of Natural Products   74 巻   頁: 707 - 711   2011年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  30. (R)-(+)- [VCD(–)984]-4-Ethyl-4-methyloctane, a cryptochiral hydrocarbon with a quaternary chirality center. (2) vibrational CD spectra of both enantiomers and absolute configurational assignment 査読有り

    Kuwahara S, Obata K, Fujita T, Miura N, Nakahashi A, Monde K, Harada N

    European Journal of Organic Chemistry   2010 巻   頁: 6385 - 6392   2010年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  31. Novel trivalent anti-influenza reagent 査読有り 国際誌

    Feng F†, Miura N†, Isoda N, Sakoda Y, Okamastu M, Kida H, Nishimura S-I

    Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters   20 巻 ( 12 ) 頁: 3772 - 3776   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2010.04.060

    PubMed

  32. Functional network of glycan-related molecules: Glyco-Net in Glycoconjugate Data Bank 査読有り

    Hashimoto R, Hirose K, Sato T, Fukushima N, Miura N, Nishimura S-I

    BMC Systems Biology   4 巻   頁: 91-1 - 91-8   2010年

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BioMed Central  

    Background: Glycans are involved in a wide range of biological process, and they play an essential role in functions such as cell differentiation, cell adhesion, pathogen-host recognition, toxin-receptor interactions, signal transduction, cancer metastasis, and immune responses. Elucidating pathways related to post-translational modifications (PTMs) such as glycosylation are of growing importance in post-genome science and technology. Graphical networks describing the relationships among glycan-related molecules, including genes, proteins, lipids and various biological events are considered extremely valuable and convenient tools for the systematic investigation of PTMs. However, there is no database which dynamically draws functional networks related to glycans. Description: We have created a database called Glyco-Net http://www.glycoconjugate.jp/functions/, with many binary relationships among glycan-related molecules. Using search results, we can dynamically draw figures of the functional relationships among these components with nodes and arrows. A certain molecule or event corresponds to a node in the network figures, and the relationship between the molecule and the event are indicated by arrows. Since all components are treated equally, an arrow is also a node. Conclusions: In this paper, we describe our new database, Glyco-Net, which is the first database to dynamically show networks of the functional profiles of glycan related molecules. The graphical networks will assist in the understanding of the role of the PTMs. In addition, since various kinds of bio-objects such as genes, proteins, and inhibitors are equally treated in Glyco-Net, we can obtain a large amount of information on the PTMs.

    DOI: 10.1186/1752-0509-4-91

  33. Absolute stereochemistries and structure-odor relationships of 2-substituted-3(2H)-furanones

    Emura M, Sugimoto D, Yaguchi Y, Nakahashi A, Miura N, Monde K

    9th Wartburg Symposium on Flavor Chemistry & Biology     2010年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

  34. Stereochemical studies of hexylitaconic acid, an inhibitor of p53-HDM2 interaction 査読有り

    Nakahashi A, Miura N, Monde K, Tsukamoto S

    Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters   19 巻   頁: 3027 - 3030   2009年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  35. Vibrational CD Spectroscopy as a Powerful Tool for Stereochemical Study of Cyclophynes in Solution 査読有り

    An D L, Chen Q, Fang J, Yan H, Orita A, Miura N, Nakahashi A, Monde K, Otera J

    Tetrahedron Letters   50 巻   頁: 1689 - 1692   2009年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  36. Stereochemical study of a novel tautomeric furanone, homofuraneol 査読有り

    Monde K, Nakahashi A, Miura N, Yaguchi Y, Sugimoto D, Emura

    Chirality   21 巻   頁: E110 - E115   2009年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  37. Stereochemical studies of odorous 2-substituted-3(2H)-furanones by vibrational circular dichroism 査読有り

    Emura M, Yaguchi Y, Nakahashi A, Sugimoto D, Miura N, Monde K

    Journal of Agricultural and Food Chemistry   57 巻   頁: 9909 - 9915   2009年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  38. Absolute stereochemistry of flavor related 2-substituted-3(2H)-furanones, 2,5-dimethyl- 4-hydroxy-3(2H)-furanone and analogues

    Emura M, Yaguchi Y, Sugimoto D, Nakahashi A, Miura N, Monde K

    Proceedings of the 12th Weurman Symposium   12 巻   頁: 541 - 544   2008年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

  39. Interaction between the C Termini of Alg13 and Alg14 mediate formation of the active UDP-N-Acetylglucosamie transferase complex 査読有り

    Gao X-D, Moriyama S, Miura N, Dean N, Nishimura S-I

    Journal of Biological Chemistry   283 巻   頁: 32534 - 32541   2008年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  40. Glycoconjugate Data Bank: structures — and annotated glycan structure database and N-glycan primary structure verification service 査読有り

    Nakahara T, Hashimoto R, Nakagawa H, Monde K, Miura N, Nishimura S-I

    Nucleic Acids Research   36 巻   頁: D368 - D371   2008年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  41. Stereochemical study of chiral tautomeric flavorous furanones by vibrational circular dichroism 査読有り

    Yaguchi Y, Nakahashi A, Miura N, Sugimoto D, Monde K, Emura M

    Organic Letters   10 巻   頁: 4883 - 4885   2008年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  42. (R)-(+)-[VCD(+)945]-4-Ethyl-4-methyloctane, the simplest chiral saturated hydrocarbon with a quaternary stereogenic center 査読有り

    Fujita T, Obata K, Kuwahara S, Miura N, Nakahashi A, Monde K, Decatur J, Harada N

    Tetrahedron Letters   48 巻   頁: 4219 - 4222   2007年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  43. A structure and an absolute configuration of (+)-alternamin, a new coumarin from Murraya alternans having antidote activity against snake venom 査読有り

    Min H M, Aye M, Taniguchi T, Miura N, Monde K, Ohzawa K, Nikai T, Niwa M, Takaya Y

    Tetrahedron Letters   48 巻   頁: 6155 - 6158   2007年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  44. Stereochemical studies of sialic acid derivatives by vibrational circular dichroism 査読有り

    Nakahashi A, Taniguchi T, Miura N, Monde K

    Organic Letters   9 巻   頁: 4741 - 4744   2007年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  45. Structural transition of a 15 amino acid residue peptide induced by GM1 査読有り

    Fujitani N, Shimizu H, Matsubara T, Ohta T, Komata Y, Miura N, Sato T, Nishimura S-I

    Carbohydrate Research   342 巻   頁: 1895 - 1903   2007年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  46. A theoretical study of α- and β- D-glucopyranose conformations by the density functional theory 査読有り

    Miura N, Taniguchi T, Monde K, Nishimura S-I

    Chemical Physics Letters   419 巻 ( 4-6 ) 頁: 326 - 332   2006年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.cplett.2005.11.113

  47. Conformational analysis of chiral helical perfluoroalkyl chains by VCD 査読有り

    Monde K, Miura N, Hashimoto M, Taniguchi T, Inabe T

    Journal American Chemical Society   128 巻   頁: 6000 - 6001   2006年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  48. Absolute configurations of brominated sesquiterpenes determined from vibrational circular dichroism 査読有り

    Monde K, Taniguchi T, Miura N, Nishimura S-I

    Chirality   18 巻   頁: 335 - 339   2006年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  49. Structural assignment of isomeric 2-aminopyridine-derivatized monosialylated biantennary N-linked oligosaccharides using negative-ion multistage tandem mass spectral matching 査読有り

    Deguchi K, Takegawa Y, Ito H, Miura N, Yoshioka S, Nagai S, Nakagawa H, Nishimura S-I

    Rapid Communications in Mass Spectrometry   20 巻 ( 3 ) 頁: 412 - 418   2006年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:John Wiley & Sons  

    To investigate the possibility of structural assignment based on negative-ion MSn spectral matching, four isomers of 2-aminopyridine-derivatized (PA) monosialylated oligosaccharides (i.e., complex type N-glycans with an α2-3 or α2-6 linked sialic acid on α1-6 or α1-3 antennae) were analyzed by using high-performance liquid chromatography/electrospray ion trap time-of-flight mass spectrometry(HPLC/ESI-IT-TOF MS). The negative ion [M-2H]2- is observed dominantly in the MS1 spectra without the loss of a sialic acid. The MS2 spectra derived from it are sufficiently reproducible that MS2 spectral matching based on correlation coefficients can be applied to the assignment of these isomers. Theisomers containing a sialic acid on α1-6 or α1-3 antennae can be distinguished by MS2 spectralmatching, but the α2-3 and α2-6 linkage types of sialic acid cannot be distinguished by their MS2spectra. However, MS3 spectra derived from fragment ions containing a sialic acid (i.e., C4- and D-type ions) clearly differentiate the α2-3 and α2-6 linkage types of sialic acid in their MS3 spectral patterns.This difference might be rationalized in terms of a proton transfer from the reducing-end mannose to the negatively-charged sialic acid. These two moieties are very close in the structural conformations of the precursor C4-type fragment ions, as predicted by molecular mechanics calculations. Thus, negative-ion MSn (n=2, 3) spectral matching was proven to be useful for the structural assignment of these four monosialylated PA N-glycan isomers.

    DOI: 10.1002/rcm.2320

  50. Absolute configurations of endoperoxides determined by vibrational circular dichroism (VCD) 査読有り

    Monde K, Taniguchi T, Miura N, Vairappan C, Suzuki M

    Tetrahedron Letters   47 巻   頁: 4389 - 4392   2006年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  51. Chiral cruciferous phytoalexins: preparation, absolute configuration, and biological activity 査読有り

    Monde K, Taniguchi T, Miura N, Kutschy P, Čurillová Z, Pilátová M, Mojžiš J

    Bioorganic & Medicinal Chemistry   13 巻   頁: 5206 - 5212   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  52. Rational dsign, synthesis, and characterization of novel inhibitors for human β1,4-galactosyltransferase 査読有り

    Takaya K, Nagahori N, Kurogochi M, Furuike T, Miura N, Monde K, Lee Y C, Nishimura S-I

    Journal of Medicinal Chemistry   48 巻   頁: 6054 - 6065   2005年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  53. High-throughput protein glycomics: combined use of chemoselective glycoblotting and MALDI-TOF/TOF mass spectrometry 査読有り

    Nishimura S-I, Niikura K, Kurogochi M, Fumoto M, Hinou H, Kamitani R, Nakagawa H, Deguchi K, Miura N, Monde K, Kondo H

    Angewandte Chemie International Edition   44 巻   頁: 91 - 96   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  54. Direct observation of sugar-protein, sugar-sugar, and sugar-water complexes by using cold-spray ionization time-of-flight mass spectrometry 査読有り

    Nishimura S-I, Nagahori N, Takaya K, Tachibana Y, Miura N, Monde K

    Angewandte Chemie International Edition   44 巻   頁: 571 - 575   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  55. A characteristic CH band in VCD of methyl glycosidic carbohydrates 査読有り

    Taniguchi T, Monde K, Miura N, Nishimura S-I

    Tetrahedron Letters   45 巻 ( 46 ) 頁: 8451 - 8453   2004年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.tetlet.2004.09.108

  56. Potential energy surface and intermolecular vibrations of O2-H2O 査読有り

    Sabu A, Kondo S, Miura N, Hashimoto K

    Chemical Physics Letters   391 巻   頁: 101 - 105   2004年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  57. Direct N-glycan profiling in the presence of tryptic peptides on MALDI-TOF by controlled ion enhancement and suppression upon glycan-selective derivatization 査読有り

    Shinohara Y, Furukawa J-I, Niikura K, Miura N, Nishimura S-I

    Analytical Chemistry   76 巻   頁: 6989 - 6997   2004年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ac0492766

  58. Azasugar-based MMP/ADAM inhibitors as antipsoriatic agent 査読有り

    Moriyama H, Tsukida T, Inoue Y, Yokota K, Yoshino K, Kondo H, Miura N, Nishimura S-I

    Journal of Medicinal Chemistry   47 巻   頁: 1930 - 1938   2004年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  59. Specific band observed in VCD predicts the anomeric configuration of carbohydrates 査読有り

    Monde K, Taniguchi T, Miura N, Nishimura S-I

    Journal American Chemical Society   126 巻 ( 31 ) 頁: 9496 - 9497   2004年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja048446t

  60. Vibrational circular dichroism: Chiroptical analysis of biomolecules 査読有り

    Taniguchi T, Miura N, Nishimura S-I, Monde K

    Molecular Nutrition & Food Research   48 巻   頁: 246 - 254   2004年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  61. Electronically excited states of sodium–water clusters 査読有り

    Schulz C P, Bobbert C, Shimosato T, Daigoku K, Miura N, Hashimoto K

    The Journal of Chemical Physics   119 巻   頁: 11620 - 11629   2003年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  62. Preparation of cruciferous phytoalexin related metabolites, (-)-dioxibrassinin and (-)-3-cyanomethyl-3-hydroxyindole, and determination of their absolute configurations by vibrational circular dichroism (VCD) 査読有り

    Monde K, Taniguchi T, Miura N, Nishimura S-I, Harada N, Dukor R K, Nafie L A

    Tetrahedron Letters   44 巻 ( 32 ) 頁: 6017 - 6020   2003年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/s0040-4039(03)01513-2

  63. Multi-reference configuration interaction calculation of positronium fluoride 2,1S and 2,1P states 査読有り

    Miura N, Saito S L

    Molecular Physics   101 巻   頁: 143 - 149   2003年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  64. Glycotentacles: Synthesis of cyclic glycopeptides toward a tailored blocker of influenza virus hemagglutinin 査読有り

    Ohta T, Miura N, Fujitani N, Nakajima F, Niikura K, Guo C-T, Suzuki T, Suzuki Y, Monde K, Nishimura S-I

    Angewandte Chemie International Edition   42 巻 ( 42 ) 頁: 5186 - 5189   2003年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/anie.200351640

  65. Electronic quenching of O(1D) by collisions with O2: A theoretical study 査読有り

    Miura N, Hashimoto K, Takahashi K, Taniguchi N, Matsumi Y

    The Journal of Chemical Physics   116 巻 ( 13 ) 頁: 5551 - 5556   2002年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1063/1.1457433

    Web of Science

  66. Electronic states of NH4(NH3)n (n=0-4) cluster radicals 査読有り

    Daigoku K, Miura N, Hashimoto K

    Chemical Physics Letters   346 巻   頁: 81 - 88   2001年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  67. Photodissociation spectroscopy of Li-H2O and Li-D2O Complexes 査読有り

    Takasu R, Nishikawa K, Miura N, Sabu A, Hashimoto K, Shulz C P, Hertel I V, Fuke K

    Journal of Physical Chemistry A   105 巻   頁: 6602 - 6608   2001年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  68. Excitation energies, electron affinities and ionization potential of the transition metals (II) V, Cr and Mn 査読有り

    Osanai Y, Ishikawa H, Miura N, Noro T

    Theoretical Chemistry Accounts   105 巻   頁: 437 - 445   2001年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  69. Theoretical study of [Na(NH3)n]-(n=1-4) 査読有り

    Hashimoto K, Kamimoto T, Miura N, Okuda R, Daigoku K

    The Journal of Chemical Physics   113 巻   頁: 9540 - 9548   2000年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  70. Molecular mechanics with QEq-CS (charge equilibration method generalized for charge separation system) 査読有り

    Kitao O, Miura N, Ushiyama H

    Journal of Molecular Structure: THEOCHEM   461-462 巻   頁: 239 - 247   1999年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  71. Theoretical study of the mechanism of electron transfer at photosynthetic reaction centers I. Singlet excited states of free base porphin 査読有り

    Kitao O, Ushiyama H, Miura N

    The Journal of Chemical Physics   110 巻   頁: 2936 - 2946   1999年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  72. 分散並列処理による巨大分子系の電荷計算

    三浦信明, 建部修見, 北尾修, 長嶋雲兵, 関口智嗣

    情報処理学会研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング   76-4 巻   頁: 19 - 24   1999年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(研究会,シンポジウム資料等)  

  73. 原子の光イオン化過程へのR行列法の応用

    三浦信明

        1998年3月

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    記述言語:日本語   掲載種別:学位論文(博士)  

  74. Electron affinities, excitation energies and ionization potentials of the transition metals (I) Sc and Ti 査読有り

    Miura N, Noro T, Sasaki F, Osanai Y

    Theoretical Chemistry Accounts   99 巻   頁: 248 - 254   1998年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  75. Theoretical study of the 2s2p4 4P resonance state in the photodetachment of C- 査読有り

    Miura N, Noro T, Sasaki F

    Journal of Physics B   30 巻   頁: 5419 - 5427   1997年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  76. Theoretical determination of energies and widths of autoionizing states of the Be atom 査読有り

    Miura N, Osanai Y, Noro T, Sasaki F

    Journal of Physics B   29 巻   頁: 2689 - 2699   1996年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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書籍等出版物 6

  1. 医薬品開発におけるオミクス解析技術 : ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム

    情報機構( 担当: 共著 ,  範囲: 第3章 第3節 プロテオーム解析におけるバイオインフォマティクスの役割)

    情報機構  2020年3月  ( ISBN:9784865021844

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    総ページ数:vii, 181p   記述言語:日本語

    CiNii Books

  2. Importance of Chirality to Flavor Compounds

    Engel K-H, Gary Takeoka G( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Vibrational CD (VCD) Spectroscopy as a Powerful Tool for Chiral Analysis of Flavor Compounds, Yaguchi Y, Nakahashi A, Miura N, Taniguchi T, Sugimoto D, Emura M, Zaizen K, Kusano Y and Monde K)

    ACS Symposium Series 1212  2015年 

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    記述言語:英語 著書種別:学術書

  3. Methods in Molecular Biology Glycoinformatics

    Lütteke T, Frank M( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Functional Network in Posttranslational Modifications: Glyco-Net in Glycoconjugate Data Bank, Miura N, Okada N, Murayama D, Hirose K, Sato T, Hashimoto R and Fukushima N)

    Springer  2015年 

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    記述言語:英語 著書種別:学術書

  4. Molecular Imaging for Integrated Medical Therapy and Drug Development

    Tamaki N, Kuge Y( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Functional and Structural Analysis Reveals Dual Function on C-Terminal α Helix of Alg13 Protein, Gao X-D, Moriyama S, Miura N and Nishimura S-I)

    Springer  2010年 

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    記述言語:英語 著書種別:学術書

  5. Experimental Glycoscience: Glycobiology

    Taniguchi N, Suzuki A, Ito Y, Narimatsu H, Kawasaki T, Hase S( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Glycoconjugate Data Bank, Miura N and Nishimura S-I)

    Springer  2008年 

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    記述言語:英語 著書種別:学術書

  6. 未来を拓く糖鎖科学

    永井克彦監( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Glycoconjugate Data Bank の開発について, 西村紳一郎, 三浦信明)

    金芳堂  2005年 

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    記述言語:日本語 著書種別:学術書

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MISC 3

  1. メタプロテオミクスを強力に支援するタンパク質配列データベース構築法の研究-近縁種のゲノム情報活用による未知生物のアミノ酸配列予測-

    三浦信明, 石濱泰, 奥田修二郎, 奥田修二郎  

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)44th 巻   2021年

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  2. 血清中のスフィンゴ糖脂質および遊離オリゴ糖鎖に特異的なABO式血液型抗原の解析

    岡田 和恵, 横田 育子, 花松 久寿, 三浦 信明, 大西 俊介, 湯山 耕平, 酒井 祥太, 伊東 信, 五十嵐 靖之, 坂本 直哉, 篠原 康郎, 古川 潤一  

    生命科学系学会合同年次大会2017年度 巻   頁: [2P - 0021]   2017年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:生命科学系学会合同年次大会運営事務局  

  3. 赤外円二色性を用いた絶対配置決定 誘導化を必要としない溶液状態での絶対配置決定法

    門出健次, 三浦信明, 谷口透  

    化学と生物47 巻 ( 7 ) 頁: 455 - 458   2007年

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   出版者・発行元:日本農芸化学会  

    CiNii Books

講演・口頭発表等 19

  1. 大規模データベースサーチの憂鬱 -メタプロテオミクス- 招待有り

    三浦信明

    質量分析インフォマティクス研究会2022年(第7回)ワークショップ データ解析セッション「プロテオミクスデータ解析」  2022年4月22日 

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    開催年月日: 2022年4月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(指名)  

  2. 質量分析から見るグライコームの夢―グライコミクスのインフォマティクスとマルチオミックスへの取り組み― 招待有り

    三浦信明

    質量分析インフォマティクス研究会2020年(第5回)ワークショップ 

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    開催年月日: 2020年8月

    記述言語:日本語  

  3. 大規模グライコミクスに基づく発現解析とマイニングを支援するインフォマティクス研究

    三浦信明, 古川潤一, 朴錦花, 岡田和恵, 横山育子, 篠原康郎

    第34回糖質学会  2015年7月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  4. 大規模グライコミクスに基づく発現解析とデータマイニングを支援するインフォマティクス研究

    三浦信明, 古川潤一, 朴錦花, 岡田和恵, 横田育子

    第88回日本生化学会大会 第38回日本分子生物学会年会 合同大会  2015年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  5. 大規模グライコミクスにおける発現解析へのインフォマティクスからアプローチ:スフィンゴ糖脂質

    三浦信明, 古川潤一, 横田育子, 岡田和恵, 篠原康郎

    第35回日本糖質学会  2016年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  6. 大規模グライコミクスにおける発現解析へのインフォマティクスからのアプローチ:スフィンゴ糖脂質

    三浦信明, 花松久寿, 古川潤一, 横田育子, 岡田和恵, 篠原康郎

    第36回日本糖質学会  2017年7月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  7. 大規模グライコミクスにおける発現とマイニングへのインフォマティクスからのアプローチ -スフィンゴ糖脂質-

    三浦信明, 古川潤一, 横田育子, 岡田和恵, 篠原康郎

    第89回日本生化学会大会  2016年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

  8. 分散並列処理による巨大分子系の電荷計算

    三浦信明, 建部修見, 北尾修, 長島雲兵, 関口智嗣

    第76回ハイパフォーマンスコンピューティング研究会  1999年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  9. ポストゲノム研究における糖質の計算化学とその周辺 招待有り

    三浦信明

    日本化学会第2回関東支部大会  2008年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

  10. フッ化アルキル鎖のらせん構造の理論計算とVCDスペクトルによる解析

    三浦信明, 橋本真維, 門出健次, 吉田昌史, 谷口透

    第37回構造有機討論会  2007年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  11. Theoretical study of the 2s2p4 4P resonance state in the photodetachment of C- by the R-matrix method 国際会議

    Miura N, Sasaki F, Noro T

    The XXI International conference on the physics of electronic and atomic collisions (XXI ICPEAC)  1999年 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

  12. R行列法を用いた原子の光電離断面積の計算プログラムの作成

    三浦信明, 野呂武司

    日本物理学会1992年秋の分科会  1992年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  13. R行列法による多電子原子の光イオン化断面積の計算

    三浦信明

    日本物理学会1993年秋の分科会  1993年10月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  14. R行列法による原子の光イオン化断面積の計算

    三浦信明, 長内有, 野呂武司, 佐々木不可止

    日本物理学会第49回年会  1994年3月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  15. R行列法によるC-の光脱離断面積の計算

    三浦信明, 野呂武司, 佐々木不可止

    日本物理学会1997年秋の分科会  1997年1月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  16. Computational Chemicstry in Glyco-science 国際会議

    Miura N

    The 1st CRIS International Symposium on Computational Science and Neuroscience and The 3rd Hokudai Simulation Salon Workshop  2005年 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

  17. A DFT study on helical perfluoroalkyl chains 国際会議

    Miura N, Hashimoto M, Nakahashi A, Yoshida M, Monde K

    Chirality 2008  2008年 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

  18. 糖鎖のDFT法によるコンフォメーション解析と振動円二色性(VCD)スペクトルによる検証

    三浦信明, 谷口透, 門出健次, 西村紳一郎

    第17回基礎有機化学連合討論会  2004年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  19. 糖鎖の計算化学的手法による配座解析と赤外領域円二色性(VCD)分光法によるその検証

    三浦 信明, 谷口 透, 門出 健次, 西村 紳一郎

    第53回高分子討論会  2004年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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共同研究・競争的資金等の研究課題 3

  1. 質量分析と統計解析の融合によるメタプロテオミクス

    2019年

    JST戦略的創造研究推進制度(研究チーム型) (戦略的基礎研究推進事業:CREST) 

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    担当区分:その他  資金種別:競争的資金

  2. 大規模グライコミクスにおける発現解析への質量分析と統計解析などを用いたバイオインフォマティクスアプローチ

    2013年

    共同研究 

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    担当区分:その他 

  3. in silicoスクリーニングと質量分析法を用いた酵素阻害剤等探索法の開発

    2005年

    秋山記念生命科学振興財団 平成17年研究助成(奨励) 

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    資金種別:競争的資金

科研費 17

  1. 包括的組織グライコームによる糖鎖分子ネットワークの構築と老化の客観的評価

    研究課題/研究課題番号:22H03502  2022年4月 - 2026年3月

    科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    古川 潤一, 萬谷 博, 三浦 信明

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    担当区分:研究分担者 

    申請者はこれまでに特定のサブグライコームだけではなく、種々のサブグライコームを解析する技術の開発によって、細胞や血清の包括的なグライコームを利用した網羅的なバイオマーカ探索等を行ってきた。本申請課題では、申請者が有する独自技術を基盤として組織や体液の包括的なグライコーム(全糖鎖)解析法を確立し、組織横断的な総合グライコームを明らかにする。さらに老化に伴うグライコーム変化と糖鎖合成・代謝に関わる遺伝子発現変動を統合した糖鎖分子ネットワーク変化を指標とした老化の客観的評価法について精査する。

  2. 大規模グライコミクスの自動データ解析への基盤構築

    研究課題/研究課題番号:21K12124  2021年4月 - 2024年3月

    科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    三浦 信明

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    担当区分:研究代表者 

    配分額:4160000円 ( 直接経費:3200000円 、 間接経費:960000円 )

    グライコミクスは, 生体中の糖鎖について種類と量を分析しその役割を解明する新しい分野である. 未知の部分が多く, 大量データの迅速な解析が困難である. 煩雑な手動解析が参入障壁となり「重要だけど取り残された」分野となりかねない状況である.
    申請者が開発するToolbox Accelerating Glycomics (TAG)を用いると未熟練であっても糖鎖解析を円滑に行う事ができる. TAGの拡張による自動解析基盤によって, グライコミクスを簡便に活用することが可能となり, 学術としての生命現象の解明に加えバイオマーカー探索や薬剤の活性測定などへの糖鎖の応用の拡大が期待できる.
    本課題では, グライコミクス支援ソフトウェアToolbox Accelerating Glycomics (TAG)の開発を推し進め, 多くのグライコームに対応した自動データ解析の基盤を構築する事にある. 本課題では(1)糖鎖リストの充実, (2)機種依存のできる限りの解消など本体の機能拡張, (3)糖鎖生合成マップの拡張を進める事としている.
    本年度は, (1)についてはSALSA法への対応および酸性糖鎖残基としてシアル酸に加えグルクロン酸への対応を行った. またAOWRに加えBOAを非還元末端のラベルとして追加した. これらに伴って残基のIDの構造を変更しこれまでN型糖鎖については5種類, GSLについては10種類であった残基の基底を15種類に残基に統一した. (2)について, 大量の血清を扱う際の入力データを質量分析に用いるプレートへの点着情報から自動で作成する機能, 定量性を検証するための検量線を作成する機能を追加した. さらに同定した糖鎖組成から可能な糖鎖構造を調べるためにGlyconnect(https://glyconnect.expasy.org/)への検索リンクを追加した. 最新のM1チップを搭載したMacにも対応し使用できるプラットフォームを拡張した. (3)については(1)とも関連するが, 糖鎖残基のデータ構造を変更した事に対応して内部データの取り扱いを変更した. またN型糖鎖の2本差についてはSALSAやNeuGcに対応したパスウェイマップを試作として構築した.
    AIを用いた糖鎖パターンからの疾患や細胞の状態を分類する新機能TAG classifierを考案した. TAGの配布や変更点の周知のためにGithubにリポジトリhttps://github.com/nmiura3/tagを設置し情報発信を行っている.
    大量の血清の糖鎖解析に利用可能とする基礎を構築するためにSALSAへの対応AOWRに加えてBOAラベル化への対応したリストの自動生成, 質量分析プレートの情報から自動で入力ファイルを作成する機能, 帰属した糖鎖組成に対する候補構造をデータベース検索する機能などを追加した. リストの拡張については当初予定していたSALSAのみならず様々な修飾や非還元末端ラベルに対応する事が可能となった. 糖鎖発現パスウェイについてもN型糖鎖の2鎖の部分に限定されるが新しい表示方法のプロトタイプを作成した. また利用者のPC環境的な要望からM1チップを搭載したMacへの対応も行った. これによって対応プラットフォームが増え使い勝手も向上している.
    研究は順調に進捗しているので今後もおおむね当初の計画どおりに進めていきたい. 血清糖鎖の大量解析に耐えるソフトウェアにするために, これによって生じる課題もふくめ当初計画とのバランスを取りながら多少大規模解析の需要を優先して進める. 糖鎖リストを拡充したことと, 検量線の機能が加えられたことで血清の大規模解析には, 最低限耐えられるまでTAGが成長した. 千・万の血清を処理していくための準備を進めているが, いくつかの課題がある. 1つは現在のTAGでは容易にプラットフォームを拡張できるように, データ構造を固定して静的にデータを持つようにしている. 最初に候補構造を絞り込む際に相当大規模のリストを処理する必要があり, これに静的データ量の問題と処理時間の問題が課題となる事が, 今年度の研究からわかった. 対策としては, 前者に対しては他の言語などに移行して動的にメモリを確保するアルゴリズムでTAGを書き換える事, または有料のコンパイラを購入してより大きな静的メモリを確保できるようにする事が考えられている. 後者については一部アルゴリズムの見直しとより高速なコンピュータを導入する事を検討している.

  3. インフルエンザヘマグルチニンタンパク質のpH依存性構造変化に関する理論的研究

    2015年 - 2016年

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    資金種別:その他

  4. インフルエンザウイルスHA蛋白質のpH依存性構造変化に関する分子シミュレーション研究

    2014年 - 2015年

    北海道大学人獣共通感染症リサーチセンター 一般共同研究  共同研究(国内共同研究) 

    三浦信明, 五十嵐学

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    資金種別:その他

  5. 赤外円二色法によるスタンダード・キロプティカル構造解析法の構築

    2008年 - 2010年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

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    資金種別:競争的資金

  6. ホモロジモデリングによるタンパク質構造予測

    2006年 - 2012年

  7. 疾患早期診断のための糖鎖自動分析装置開発・糖鎖による診断システム統合ソフトウェアの開発

    2004年 - 2012年

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    資金種別:競争的資金

  8. 疾患早期診断のための糖鎖自動分析装置開発

    2004年 - 2008年

    科学技術振興機構  科学技術振興機構 平成16年度先端計測分析技術・機器開発事業(機器開発プログラム) 

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    資金種別:競争的資金

  9. 赤外領域円二色性スペクトルによるキラル分析法の応用研究

    2004年 - 2007年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

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    資金種別:競争的資金

  10. 複合糖質の新規キラル分析法の開発

    2002年 - 2004年

    科学研究費助成事業  萌芽研究

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    資金種別:競争的資金

  11. ヘマグルチニンブロッカーの分子設計と合成・評価による抗インフルエンザ剤の研究

    2001年 - 2012年

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    資金種別:産学連携による資金

  12. 生物活性物質などの絶対配置を含めた赤外円二色性分光と量子化学計算によるスペクトル予測による分子構造解明

    2001年 - 2012年

  13. オゾン分解サイクルにおける素過程におけるメカニズムに関する量子化学的研究

    1999年 - 2001年

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    資金種別:競争的資金

  14. タンパク質部分電化の並列処理による高速計算法の研究

    1998年 - 1999年

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    資金種別:競争的資金

  15. ポルフィリン分子の可視スペクトルに関する量子化学的研究

    1998年 - 1999年

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    資金種別:競争的資金

  16. R行列法を用いた多電子原子の光イオン化スペクトルの理論計算

    1992年 - 1998年

  17. 遷移金属原子の電子親和力・イオン化ポテンシャル・レイキエネルギーの精密計算

    1992年 - 1998年

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産業財産権 5

  1. 活性発現メカニズムを考慮した新しい糖転移酵素阻害剤及びその製造法

    西村紳一郎, 高谷健二, 三浦信明

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    出願番号:2005-504842  出願日:2004年

    公開番号:WO2004/69855  公開日:2004年

  2. α-アミラーゼ阻害剤

    西村紳一郎, 門出健次, 内田直人, 三浦信明, 森山英樹, 前川宜彦

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    出願番号:2004-211376  出願日:2004年

  3. VCDを利用した糖の分析方法

    門出健次, 谷口透, 三浦信明, 西村紳一郎

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    出願番号:2003-303740  出願日:2003年

  4. 糖鎖標識試薬

    篠原康郎, 三浦信明, 古川潤一, 西村紳一郎

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    特許番号/登録番号:4566604  発行日:2010年

  5. 酸触媒として機能するゼオライト類似体の簡易な製造法

    西村紳一郎, 塩野正道, 三浦信明

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    特許番号/登録番号:4589869  発行日:2010年

 

担当経験のある科目 (本学以外) 5

  1. 物理学II(熱力学)

    北海道大学)

  2. マネジメント特論

    お茶の水女子大学)

  3. ライフサイエンス論(分担)

    お茶の水女子大学)

  4. 予測生物学

    お茶の水女子大学)

  5. 構造化学

    東京大学)

 

社会貢献活動 7

  1. Sun HPC Consortium Singapore 2006

    役割:講師

    Singapore  2006年5月

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    対象: 研究者, 社会人・一般, 企業

    種別:セミナー・ワークショップ

    「Computational Chemistry and Bioinformatics for Glycoscience and Glycotechnology」という題目で講演

  2. 平成17年度市民キャンパス「バイオとナノが創る新しい健康・生活科学」

    役割:講師

    北海道・札幌市  2005年10月

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    対象: 大学生, 大学院生, 教育関係者, 保護者, 研究者, 社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

    「コンピュータでつくる治療薬」という題目で講演

  3. CONFLEX による構造解析セミナー

    役割:講師

    大阪  2005年5月

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    対象: 研究者, 社会人・一般, 企業

    種別:セミナー・ワークショップ

    「CONFLEXとGaussian03(DFT)を用いた糖類のコンフォメーション解析」という題目で講演

  4. Sun HPC Consortium USA 2004

    役割:講師

    Pittsburgh  2004年11月

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    対象: 研究者, 社会人・一般, 企業

    種別:セミナー・ワークショップ

    「Computer Assisted Glycoscience and Glycotechnology: Computational Chemicalbiology and Glycoconjugate Data Bank」という題目で講演

  5. CONFLEX & Gaussian による構造解析セミナー

    役割:講師

    東京  2004年11月

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    対象: 研究者, 社会人・一般, 企業

    種別:セミナー・ワークショップ

    「CONFLEXとGaussian03(DFT)を用いた糖類のコンフォメーション解析」という題目で講演

  6. 次世代ポス トゲノム・ネットワーク交流会

    役割:講師

    北海道・札幌市  2003年2月

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    対象: 研究者, 社会人・一般, 企業

    種別:セミナー・ワークショップ

    「北海道におけるバイオインフォマティクス分野」という題目で講演

  7. バイオ &ITクラスター創造のための強化セミナー

    役割:講師

    北海道・ニセコ町  2002年9月

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    対象: 研究者, 社会人・一般, 企業

    種別:セミナー・ワークショップ

    「ポストゲノム・シークエンスとITの融合」という題目で講演

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