2021/09/21 更新

写真a

ヒビノ エミ
日比野 絵美
HIBINO Emi
所属
大学院創薬科学研究科 基盤創薬学専攻 創薬分子構造学 特任助教
職名
特任助教
連絡先
メールアドレス

学位 1

  1. 薬科学 ( 2017年3月   京都大学 ) 

研究キーワード 5

  1. 天然変性タンパク質

  2. タンパク質間相互作用

  3. アルツハイマー病

  4. p53

  5. NMR

研究分野 3

  1. ライフサイエンス / 生物物理学

  2. ライフサイエンス / 薬系分析、物理化学

  3. ライフサイエンス / 生物物理学

経歴 4

  1. 名古屋大学   創薬科学研究科   特任助教

    2020年6月 - 現在

  2. 滋賀医科大学   神経難病研究センター   客員助教

    2020年6月 - 現在

  3. 滋賀医科大学   神経難病研究センター   特任助教

    2017年4月 - 2020年5月

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    国名:日本国

  4. 滋賀医科大学   神経難病研究センター   特任助教

    2017年4月 - 2020年5月

学歴 3

  1. 京都大学大学院   薬学研究科

    2011年4月 - 2017年3月

  2. 京都大学   薬学研究科   薬科学専攻

    2013年4月 - 2017年3月

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    国名: 日本国

  3. 京都大学   薬学部   薬科学科

    2007年4月 - 2011年3月

所属学協会 7

  1. 日本生化学会

  2. 日本蛋白質科学会

  3. 日本生物物理学会

  4. 日本核磁気共鳴学会

  5. 日本蛋白質科学会

  6. 日本生物物理学会

  7. 日本生化学会

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論文 10

  1. Extracellular Release of ILEI/FAM3C and Amyloid-β Is Associated with the Activation of Distinct Synapse Subpopulations.

    Nakano M, Mitsuishi Y, Liu L, Watanabe N, Hibino E, Hata S, Saito T, Saido TC, Murayama S, Kasuga K, Ikeuchi T, Suzuki T, Nishimura M

    Journal of Alzheimer's disease : JAD   80 巻 ( 1 ) 頁: 1 - 16   2021年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Journal of Alzheimer's disease : JAD  

    BACKGROUND: Brain amyloid-β (Aβ) peptide is released into the interstitial fluid (ISF) in a neuronal activity-dependent manner, and Aβ deposition in Alzheimer's disease (AD) is linked to baseline neuronal activity. Although the intrinsic mechanism for Aβ generation remains to be elucidated, interleukin-like epithelial-mesenchymal transition inducer (ILEI) is a candidate for an endogenous Aβ suppressor. OBJECTIVE: This study aimed to access the mechanism underlying ILEI secretion and its effect on Aβ production in the brain. METHODS: ILEI and Aβ levels in the cerebral cortex were monitored using a newly developed ILEI-specific ELISA and in vivo microdialysis in mutant human Aβ precursor protein-knockin mice. ILEI levels in autopsied brains and cerebrospinal fluid (CSF) were measured using ELISA. RESULTS: Extracellular release of ILEI and Aβ was dependent on neuronal activation and specifically on tetanus toxin-sensitive exocytosis of synaptic vesicles. However, simultaneous monitoring of extracellular ILEI and Aβ revealed that a spontaneous fluctuation of ILEI levels appeared to inversely mirror that of Aβ levels. Selective activation and inhibition of synaptic receptors differentially altered these levels. The evoked activation of AMPA-type receptors resulted in opposing changes to ILEI and Aβ levels. Brain ILEI levels were selectively decreased in AD. CSF ILEI concentration correlated with that of Aβ and were reduced in AD and mild cognitive impairment. CONCLUSION: ILEI and Aβ are released from distinct subpopulations of synaptic terminals in an activity-dependent manner, and ILEI negatively regulates Aβ production in specific synapse types. CSF ILEI might represent a surrogate marker for the accumulation of brain Aβ.

    DOI: 10.3233/jad-201174

    Scopus

    PubMed

  2. FAM3C in Alzheimer's disease. A risk-related molecule and potential therapeutic target. 査読有り

    Nishimura M, Watanabe N, Mitsuishi Y, Hibino E, Nakano M, Liu L, Sugi T

    Neuroscience of Dementia     頁: in press   2020年

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    記述言語:英語  

  3. A novel mode of interaction between intrinsically disordered proteins 査読有り

    Hibino Emi, Hoshino Masaru

    BIOPHYSICS AND PHYSICOBIOLOGY   in press 巻 ( 0 ) 頁: 86 - 93   2020年

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    <p>An increasing number of proteins, which have neither regular secondary nor well-defined tertiary structures, have been found to be present in cells. The structure of these proteins is highly flexible and disordered under physiological (native) conditions, and they are called "intrinsically disordered" proteins (IDPs). Many of the IDPs are involved in interactions with other biomolecules such as DNA, RNA, carbohydrates, and proteins. While these IDPs are largely unstructured by themselves, marked conformational changes often occur upon binding to an interacting partner, which is known as the "coupled folding and binding mechanism", which enable them to change the conformation to become compatible with the shape of the multiple target biomolecules. We have studied the structure and interaction of eukaryotic transcription factors Sp1 and TAF4, and found that both of them have long intrinsically disordered regions (IDRs). One of the IDRs in Sp1 exhibited homo-oligomer formation. In addition, the same region was used for the interaction with another IDR found in the TAF4 molecule. In both cases, we have not detected any significant conformational change in that region, suggesting a prominent and novel binding mode for IDPs/IDRs, which are not categorized by the well-accepted concept of the coupled folding and binding mechanism.</p>

    DOI: 10.2142/biophysico.bsj-2020012

    Web of Science

    PubMed

    CiNii Article

  4. Lipid class composition of membrane and raft fractions from brains of individuals with Alzheimer's disease. 査読有り 国際誌

    Kawatsuki A, Morita SY, Watanabe N, Hibino E, Mitsuishi Y, Sugi T, Murayama S, Nishimura M

    Biochemistry and biophysics reports   20 巻 ( 100704 ) 頁: 100704 - 100704   2019年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Biochemistry and Biophysics Reports  

    Perturbation of the homeostasis of brain membrane lipids has been implicated in the pathomechanism of Alzheimer's disease (AD). The ε4 allele of the apolipoprotein E gene (APOE) confers an increased risk, in a dosage-dependent manner, for brain amyloid-β accumulation and the development of sporadic AD. An effect of the APOE genotype on brain lipid homeostasis may underlie the AD risk associated with the ε4 allele. In this research, we examined an effect of APOE ε4 on the lipid class composition of crude membranes and raft-enriched fractions of brains. We applied enzymatic reaction-based methods for the quantification of phosphatidylcholine, phosphatidylethanolamine, phosphatidylserine, phosphatidic acid, and sphingomyelin. Our results indicate that brain lipid class composition was neither significantly altered in AD subjects nor affected by the presence of the APOE ε4 allele.

    DOI: 10.1016/j.bbrep.2019.100704

    Scopus

    PubMed

  5. 大脳皮質におけるILEI/FAM3CおよびAβの間質液への分泌様式に関する比較検討 査読有り

    中野 将希, 三ツ石 弥千代, 渡邊 直希, 日比野 絵美, 斉藤 貴志, 西道 隆臣, 鈴木 利治, 西村 正樹

    Dementia Japan   33 巻 ( 4 ) 頁: 514 - 514   2019年10月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

  6. 天然変性タンパク質の新しい相互作用機構 招待有り 査読有り

    日比野 絵美, 星野 大

    「生物物理」誌   59 巻 ( 4 ) 頁: 202 - 204   2019年7月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.59.202

    CiNii Article

  7. Identification of heteromolecular binding sites in transcription factors Sp1 and TAF4 using high-resolution nuclear magnetic resonance spectroscopy 査読有り

    Hibino Emi, Inoue Rintaro, Sugiyama Masaaki, Kuwahara Jun, Matsuzaki Katsumi, Hoshino Masaru

    PROTEIN SCIENCE   26 巻 ( 11 ) 頁: 2280 - 2290   2017年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Protein Science  

    The expression of eukaryotic genes is precisely controlled by interactions between general transcriptional factors and promoter-specific transcriptional activators. The fourth element of TATA-box binding protein-associated factor (TAF4), an essential subunit of the general transcription factor TFIID, serves as a coactivator for various promoter-specific transcriptional regulators. Interactions between TAF4 and site-specific transcriptional activators, such as Sp1, are important for regulating the expression levels of genes of interest. However, only limited information is available on the molecular mechanisms underlying the interactions between these transcriptional regulatory proteins. We herein analyzed the interaction between the transcriptional factors Sp1 and TAF4 using high-resolution solution nuclear magnetic resonance spectroscopy. We found that four glutamine-rich (Q-rich) regions in TAF4 were largely disordered under nearly physiological conditions. Among them, the first Q-rich region in TAF4 was essential for the interaction with another Q-rich region in the Sp1 molecule, most of which was largely disordered. The residues responsible for this interaction were specific and highly localized in a defined region within a range of 20–30 residues. Nevertheless, a detailed analysis of 13C-chemical shift values suggested that no significant conformational change occurred upon binding. These results indicate a prominent and exceptional binding mode for intrinsically disordered proteins other than the well-accepted concept of “coupled folding and binding.”.

    DOI: 10.1002/pro.3287

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  8. Interaction between intrinsically disordered regions in transcription factors Sp1 and TAF4 査読有り

    Hibino Emi, Inoue Rintaro, Sugiyama Masaaki, Kuwahara Jun, Matsuzaki Katsumi, Hoshino Masaru

    PROTEIN SCIENCE   25 巻 ( 11 ) 頁: 2006 - 2017   2016年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Protein Science  

    The expression of eukaryotic genes is precisely controlled by specific interactions between general transcription initiation factors and gene-specific transcriptional activators. The general transcription factor TFIID, which plays an essential role in mediating transcriptional activation, is a multisubunit complex comprising the TATA box-binding protein (TBP) and multiple TBP-associated factors (TAFs). On the other hand, biochemical and genetic approaches have shown that the promoter-specific transcriptional activator Sp1 has the ability to interact with one of the components of TFIID, the TBP-associated factor TAF4. We herein report the structural details of the glutamine-rich domains (Q-domains) of Sp1 and TAF4 using circular dichroism (CD) and heteronuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. We found that the two Q-domains of Sp1 and four Q-domains of TAF4 were disordered under physiological conditions. We also quantitatively analyzed the interaction between the Q-domains of Sp1 and TAF4 by NMR and surface plasmon resonance, and detected a weak but specific association between them. Nevertheless, a detailed analysis of CD spectra suggested that any significant conformational change did not occur concomitantly with this association, at least at the level of the overall secondary structure. These results may represent a prominent and exceptional binding mode for the IDPs, which are not categorized in a well-accepted concept of “coupled folding and binding.”.

    DOI: 10.1002/pro.3013

    Web of Science

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    PubMed

  9. Glutamine-rich activation domain of transcription factor Sp1-biochemical activity and structure

    Kuwahara Jun, Uwatoko Chisana, Hibino Emi, Matsuzaki Katsumi, Hoshino Masaru

    PROTEIN SCIENCE   24 巻   頁: 312 - 312   2015年10月

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  10. Interaction between isolated transcriptional activation domains of Sp1 revealed by heteronuclear magnetic resonance 査読有り

    Hiramatsu Naoko, Hibino Emi, Matsuzaki Katsumi, Kuwahara Jun, Hoshino Masaru

    PROTEIN SCIENCE   21 巻 ( 10 ) 頁: 1481 - 1488   2012年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Protein Science  

    The promoter-specific transcription factor Sp1 is expressed ubiquitously, and plays a primary role in the regulation of the expression of many genes. Domains A and B located in the N-terminal half of the protein are characterized by glutamine-rich (Q-rich) sequences. These Q-rich domains have been shown to be involved in the interaction between Sp1 and different classes of nuclear proteins, such as TATA-binding protein associated factors. Furthermore, the selfassociation of Sp1 via Q-rich domains is also important for the regulation of transcriptional activity. It has been considered that an Sp1 molecule bound to a "distal" GC-box synergistically interacts with another Sp1 molecule at a "proximal" binding site. Although the formation of multimers via Q-rich domains seems functionally important for Sp1, little is known about the structural and physicochemical nature of the interaction between Q-rich domains. We analyzed the structural details of isolated glutamine-rich B (QB) domains of Sp1 by circular dichroism (CD), analytical ultracentrifugation, and heteronuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR). We found the isolated QB domains to be disordered under all conditions examined. Nevertheless, a detailed analysis of NMR spectra clearly indicated interaction between the domains. In particular, the C-terminal half was responsible for the self-association. Furthermore, analytical ultracentrifugation demonstrated weak but significant interaction between isolated QB domains. The self-association between QB domains would be responsible, at least in part, for the formation of multimers by full-length Sp1 molecules that has been proposed to occur during transcriptional activation. © 2012 The Protein Society.

    DOI: 10.1002/pro.2137

    Web of Science

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MISC 2

  1. Announcing the call for the Special Issue on "The Australian Society for Biophysics (ASB) - 2021 Meeting".

    Cranfield C, Whelan D, Cox C, Shearwin K, Ho J, Allen T, Shibuya R, Hibino E, Hayashi K, Dos Remedios C, Li A  

    Biophysical reviews13 巻 ( 4 ) 頁: 1 - 2   2021年6月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Biophysical Reviews  

    This Commentary describes a call for submissions for the upcoming Special Issue focused on the research topics presented at the Australian Society of Biophysics (ASB) in 2020 and 2021. Submissions from past and present ASB members who could not attend these meetings are also welcome as contributions to this special issue.

    DOI: 10.1007/s12551-021-00813-w

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    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s12551-021-00813-w/fulltext.html

  2. Glutamine-rich activation domain of transcription factor Sp1-biochemical activity and structure

    Jun Kuwahara, Chisana Uwatoko, Emi Hibino, Katsumi Matsuzaki, Masaru Hoshino  

    PROTEIN SCIENCE24 巻   頁: 312 - 312   2015年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:WILEY-BLACKWELL  

    Web of Science

講演・口頭発表等 15

  1. Aβ産生抑制タンパク質ILEIの活性中心の同定

    日比野 絵美, 西村正樹

    第58回日本生物物理学会年会  2020年9月16日 

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    開催年月日: 2020年9月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

  2. The interaction between transcription factors Sp1 and TAF4 via the intrinsically disordered regions. 国際会議

    The 9th SKO Symposium Program 

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    開催年月日: 2015年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:大韓民国  

  3. 転写因子Sp1とTAF4の天然変性領域を介した相互作用 招待有り

    日比野 絵美, 井上 倫太郎, 杉山 正明, 桑原 淳, 松崎 勝巳, 星野 大

    第52回日本生物物理学会年会 

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    開催年月日: 2014年9月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:札幌   国名:日本国  

  4. 転写因子Sp1とTAF4の天然変性領域を介した相互作用の解析

    日比野 絵美, 桑原 淳, 松崎 勝巳, 星野 大

    第13回日本蛋白質科学会年会  

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    開催年月日: 2013年6月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:鳥取   国名:日本国  

  5. グリチルリチンとタイト結合裏打ちタンパク質ZO1-PDZ1ドメインとの結合解析

    日比野絵美, 久田美咲, 合田名都子, 天野剛志, 廣明秀一

    令和2年度 生物物理中部支部講演会  2021年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

  6. グリチルリチンのタイト結合裏打ちタンパク質ZO1 PDZ1ドメインへの結合構造の解析

    日比野絵美, 久田美咲, 合田名都子, 天野剛志, 廣明秀一

    日本薬学会第141年会  2021年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

  7. ILEI/FAM3C Suppresses Amyloid-β Generation by a Unique Mechanism 国際会議

    日比野 絵美

    第24回MNRC国際シンポジウム  2018年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(指名)  

  8. 特異な機序でアミロイドβ産生を抑制するILEI / FAM3Cとアルツハイマー病リスク

    日比野 絵美, 渡辺 直希, 西村 正樹

    第91回日本生化学会大会  2018年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

  9. Structure-based analysis of ILEI/FAM3C activity to inhibit Aβ generation

    ◯Emi Hibino, Masatake Sugita, Yachiyo Mitsuishi, Naoki Watanabe, Masaki Nakano, Takuma Sugi, Masaki Nishimura

    第56回日本生物物理学会年会  2018年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

  10. Aβ産生抑制タンパク質ILEIの構造と機能の解析

    日比野 絵美

    2017年度生命科学系学会合同年次大会  2017年12月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

  11. 天然変性領域間の相互作用の物理化学的解析

    日比野 絵美

    蛋白質異常凝集研究会  2017年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  12. Aβ産生抑制タンパク質ILEIの構造解析に基づく機能メカニズムの検討

    日比野 絵美

    第36回日本認知症学会学術集会  2017年11月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

  13. The interaction between transcription factors Sp1 and TAF4 via the intrinsically disordered regions. 国際会議

    日比野 絵美, 井上 倫太郎, 杉山 正明, 桑原 淳, 松崎 勝巳, 星野 大

    The 9th SKO Symposium Program  2015年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

  14. 転写因子Sp1とTAF4の天然変性領域を介した相互作用 招待有り

    日比野 絵美, 井上 倫太郎, 杉山 正明, 桑原 淳, 松崎 勝巳, 星野 大

    第52回日本生物物理学会年会  2014年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

  15. 転写因子Sp1とTAF4の天然変性領域を介した相互作用の解析

    日比野 絵美, 桑原 淳, 松崎 勝巳, 星野 大

    第13回日本蛋白質科学会年会  2013年6月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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科研費 4

  1. がん抑制タンパク質p53の機能喪失につながる新規機構解明

    2021年 - 2022年3月

    公益財団法人 愛知県がん研究振興会  がんその他の悪性新生物研究助成金 

  2. アミロイドβタンパク質産生を特異的に抑制する新たな機序の解析

    研究課題/研究課題番号:18K14883  2018年4月 - 2021年3月

    科学研究費補助金 

    日比野絵美

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    担当区分:研究代表者 

  3. ILEIとPresenilin-1との結合構造解析に基づくアルツハイマー病分子治療薬の設計

    2018年4月 - 2019年3月

    滋賀医科大学  学長裁量経費(若手萌芽研究) 

    日比野 絵美

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

  4. ILEIとγセクレターゼ複合体との結合構造解析に基づくアルツハイマー病分子治療薬の設計

    2017年4月 - 2018年3月

    滋賀医科大学  学長裁量経費(若手萌芽研究) 

    日比野 絵美

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

 

担当経験のある科目 (本学以外) 1

  1. 生理学

    京都文化医療専門学校)

 

学術貢献活動 2

  1. 第3回滋賀ジュニアリサーチグラント成果発表会

    役割:審査・評価

    株式会社リバネス  2020年2月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  2. サイエンスキャッスル2019関西大会

    役割:審査・評価

    株式会社リバネス  2019年12月

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    種別:大会・シンポジウム等