Graduate School of Science Designated assistant professor

Updated on 2023/09/11
博士(農学)
Evolution
kleptoprotein
Bioluminescence
Octocorallia
Luciferin
Ctenophora
Parapriacanthus ransonneti
Life Science / Evolutionary biology / Bioluminescence
Diversity and ecology on the bioluminescence in the deep sea and sea floor
Understanding the role of bioluminescence in soil ecosystem
Investigation on the marine animal diversity
Nagoya University Institute for Advanced Research Designated assistant professor
2020.4
Country:Japan
Monterey Bay Aquarium Research Institute Research and Development Postdoctoral fellow
2018.4 - 2020.3
Country:United States
Chubu University College of Bioscience and Biotechnology Researcher
2017.9 - 2018.3
Country:Japan
Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences
2014.4 - 2017.3
The Rising Generation of Evo-Devo Biologists Organizing committee member of
2014 - 2017
Committee type:Academic society
他者のタンパク質を利用する盗タンパク質現象 Invited Reviewed International coauthorship International journal
加藤 巧己, 別所-上原 学
生物工学会誌 Vol. 101 ( 4 ) page: 200 - 200 2023.4
Investigating the diversity of bioluminescent marine worm Polycirrus (Annelida), with description of three new species from the Western Pacific Reviewed International coauthorship
Naoto Jimi , Manabu Bessho-Uehara , Koji Nakamura , Masahiko Sakata , Taro Hayashi , Shusei Kanie , Yasuo Mitani , Yoshihiro Ohmiya , Aoi Tsuyuki , Yuzo Ota , Sau Pinn Woo and Katsunori Ogoh
Royal Society Open Science 2023.3
Evidence for de novo Biosynthesis of the Luminous Substrate Coelenterazine in Ctenophores Reviewed International coauthorship International journal
Manabu Bessho-Uehara, Wentao Huang, Wyatt L. Patry, William E. Browne, Jing-Ke Weng, Steven H.D. Haddock
iScience Vol. 23 ( 12 ) page: 101859 - 101859 2020.12
Biochemical characterization of diverse deep-sea anthozoan bioluminescence systems Reviewed International coauthorship International journal
Manabu Bessho-Uehara, Warren R. Francis, Steven H. D. Haddock
Marine Biology Vol. 167 ( 8 ) 2020.8
Kleptoprotein bioluminescence: Parapriacanthus fish obtain luciferase from ostracod prey Invited Reviewed International coauthorship International journal
Manabu Bessho-Uehara, Naoyuki Yamamoto, Shuji Shigenobu, Hitoshi Mori, Keiko Kuwata, Yuichi Oba
Science Advances Vol. 6 ( 2 ) page: eaax4942 - eaax4942 2020.1
Firefly genomes illuminate parallel origins of bioluminescence in beetles Reviewed International coauthorship International journal
Timothy R. Fallon, Sarah E. Lower, Ching-Ho Chang, Manabu Bessho-Uehara, Gavin J. Martin, Adam J. Bewick, Megan Behringer, Humberto J. Debat, Isaac Wong, John C. Day, Anton Suvorov, Christian J. Silva, Kathrin F. Stanger-Hall, David W. Hall, Robert J. Schmitz, David R. Nelson, Sara M. Lewis, Shuji Shigenobu, Seth M. Bybee, Amanda M. Larracuente, Yuichi Oba, Jing-Ke Weng
ELIFE Vol. 7 page: 71 2018.10
19. Structure and Biological Activity of Blarina Paralytic Peptides (BPPs) from the Short-tailed Shrew <i>Blarina brevicauda</i> Invited Reviewed International coauthorship International journal
Kita Masaki, Takenaka Toshiko, Bessho–Uehara Manabu, Maturana Andres D., Kigoshi Hideo, Ohdachi Satoshi D., Uemura Daisuke
Symposium on the Chemistry of Natural Products, symposium papers Vol. 60 ( 0 ) page: 109-114 - 114 2018
Investigating the diversity of bioluminescent marine worm Polycirrus (Annelida), with description of three new species from the Western Pacific Reviewed International coauthorship International journal
Naoto Jimi, Manabu Bessho-Uehara, Koji Nakamura, Masahiko Sakata, Taro Hayashi, Shusei Kanie, Yasuo Mitani, Yoshihiro Ohmiya, Aoi Tsuyuki, Yuzo Ota, Sau Pinn Woo, Katsunori Ogoh
Royal Society Open Science Vol. 10 ( 3 ) page: 230039 2023.3
14-3-3 proteins are luciferases candidate proteins from lanternfish Diaphus watasei. Reviewed International coauthorship International journal
Daichi Yano, Manabu Bessho-Uehara, José Paitio, Masakazu Iwasaka, Yuichi Oba
Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology Vol. 22 ( 2 ) page: 263 - 277 2023.2
Acquisition of bioluminescent trait by non-luminous organisms from luminous organisms through various origins Reviewed International coauthorship International journal
Chatragadda Ramesh, Manabu Bessho-Uehara
PHOTOCHEMICAL & PHOTOBIOLOGICAL SCIENCES Vol. 20 ( 11 ) page: 1547 - 1562 2021.11
Identification and characterization of the Luc2-type luciferase in the Japanese firefly, Luciola parvula, involved in a dim luminescence in immobile stages Reviewed International coauthorship International journal
Manabu Bessho-Uehara, Yuichi Oba
LUMINESCENCE Vol. 32 ( 6 ) page: 924 - 931 2017.9
Biochemical characteristics and gene expression profiles of two paralogous luciferases from the Japanese firefly Pyrocoelia atripennis (Coleoptera, Lampyridae, Lampyrinae): insight into the evolution of firefly luciferase genes Reviewed International coauthorship International journal
Manabu Bessho-Uehara, Kaori Konishi, Yuichi Oba
PHOTOCHEMICAL & PHOTOBIOLOGICAL SCIENCES Vol. 16 ( 8 ) page: 1301 - 1310 2017.8
Manabu Bessho-Uehara
Photochemical and Photobiological Sciences Vol. 16 page: 1301 - 1310 2017.6
研究者の結婚生活: 恋愛はぜんぜん科学的じゃない⁉ International journal
高山善光( Role: Contributor , 結婚式はウェディング姿で研究発表)
日本の研究者出版 2020.10
研究者,生活を語る(3)おさるのジョージと黄色い帽子のおじさんのような生活
別所-上原 学
科学 Vol. 93 ( 3 ) page: 200 - 202 2023.3
太古より受け継がれる深海サンゴの発光 Invited
別所-上原 学
新妻免疫塾 (YouTubeチャンネル) 2020.6.22
Kleptoprotein Bioluminescence Invited International conference
Manabu Bessho-Uehara
Yosakoi Ecology Seminar 2020.6.16 Noriyuki Suzuki
前田太郎 Invited
前田太郎
前田太郎 2022.3.10
餌生物の能力をコピー!?キンメモドキの「盗タンパク質」 Invited
別所-上原 学
静岡ライフサイエンスシンポジウム 2022.3.6 静岡大学
Evolution of bioluminescence in the sea Invited International coauthorship International conference
Manabu Bessho-Uehra
Moss Landing Marine Laboratories Seminar 2020.2.20
生物発光の収斂進化 Invited International conference
別所-上原 学
永井研公開セミナー 2020.6.21
Kleptoprotein Bioluminescence: A fish obtains luciferase from a luminous ostracod prey International conference
Manabu Bessho-Uehara, Naoyuki Yamamoto, Shuji Shigenobu, Keiko Kuwata, Yuichi Oba
Living Light 2021.9.23
Kleptoprotein Bioluminescence: Protein uptake in a fish from luminous crustacean International conference
Manabu Bessho-Uehara, Shuji Shigenobu, Keiko Kuwata, Naoyuki Yamamoto, Yuichi Oba
2nd AsiaEvo Conference 2021.8.17
ウミホタルを食べて光る魚 〜盗タンパク質による生物発光〜 Invited
別所-上原 学
ScienceOme 2021.8.4
深海サンゴ(花虫綱)の生物発光メカニズムの比較と進化
別所-上原 学
第23回進化学会 2021.8.19
Biochemical characterization of diverse deep‐sea anthozoan bioluminescence systems Invited International coauthorship International conference
Manabu Bessho-Uehara, Warren R. Francis, Steven H.D. Haddock
16th Deep-sea Biology Symposium 2021.9.15
名古屋大学出前授業2 太古の海の光る森 Invited
別所-上原 学
豊橋市自然史博物館 ワークショップ・講演会・解説会 2021.11.20
盗タンパク質による生物発光:ウミホタルを食べて光るキンメモドキ Invited
別所上原学
基礎生物学研究所 部門公開セミナー 2021.11.17
Glow-in-the-dark corals light up the deep sea
“Fragile!” Provision mechanisms of bioluminescent compounds via food chain in the marine ecosystem
2021.4 - 2023.3
Authorship:Coinvestigator(s) Grant type:Competitive
Grant amount:\2000000
Grant number:21K15144 2021.4 - 2025.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Authorship:Principal investigator Grant type:Competitive
Grant amount:\4810000 ( Direct Cost: \3700000 、 Indirect Cost:\1110000 )
2022 - 2028
科学技術振興機構 戦略的な研究開発の推進 創発的研究支援事業
別所-上原 学
Authorship:Principal investigator Grant type:Competitive
キンメモドキは発光に必要なルシフェラーゼ遺伝子をもたずウミホタルからタンパク質を盗むことで、餌生物がもつ機能を獲得します。「盗タンパク質」として知られるこの現象はキンメモドキでのみ見つかっています。消化・分解されるはずのタンパク質が捕食者の体内で機能する現象は生物学にとって革新的な概念です。本研究では、盗タンパク質をもつ発光生物を新たに発見し、餌由来のタンパク質を取込む共通原理の解明を目指します。
Discovery of the second kleptoprotein
2021.10 - 2024.3
Japan Science and Technology Agency
Authorship:Principal investigator Grant type:Competitive
Taxonomical review of Pempheridae and the origin and evolution of bioluminescence
Grant number:21K06313 2021.4 - 2025.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Authorship:Coinvestigator(s) Grant type:Competitive
Molecular mechanism involved in the uptake of ostracod luciferase into luminous fish Parapriacanthus
Grant number:20K22627 2020.9 - 2022.3
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
Bessho-Uehara Manabu
Authorship:Principal investigator Grant type:Competitive
Grant amount:\2860000 ( Direct Cost: \2200000 、 Indirect Cost:\660000 )
In order to reveal the mechanism of luciferase protein uptake in the golden sweeper, we aim to elucidate the molecular entities that interact with luciferase and contribute to its uptake. During the period, we examined the preparation of recombinant luciferase and administration experiments, and found that uptake requires a longer period of time than a few days.
Due to the outbreak of the new coronavirus infection, the research was intermittently interrupted and it was impossible to conduct the breeding experiments vigorously.Furthermore, the research grant was reduced from the direct cost of 3 million yen to 2.2 million yen without explanation, which made it difficult to purchase the luminescence measurement equipment necessary for the research.
ウミホタルを食べて光る魚-キンメモドキの発光メカニズムの解明-
Grant number:15J00296 2015.4 - 2017.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 特別研究員奨励費
別所 学
Authorship:Principal investigator Grant type:Competitive
Grant amount:\1900000 ( Direct Cost: \1900000 )
キンメモドキから発光活性を指標にルシフェラーゼを精製し、単離した。RNAseqとMS/MSにより、タンパク質の全長配列を決定し、同定した。その後、リコンビナントルシフェラーゼを抗原とし、抗体を作成し、天然型のルシフェラーゼを結合したカラムを用いて、アフィニティー精製を行なった。その結果、質の高い抗ルシフェラーゼ抗体が得られた。また、キンメモドキの新たな供給経路を確立した。本年度は、これらの材料を元に、ウェスタンブロットと免疫組織化学により、キンメモドキにおける同定したルシフェラーゼの局在が発光器官にのみあることを確認できた。現在、組織の微細構造を確認中であり、並行して論文化を進めている。
また、発光の進化を議論するために、同じくウミホタルルシフェリンを基質とする発光魚についてもサンプルを集めている。本年度は、スズキ目であるが異なる科のツマグロイシモチ、ガマアンコウ目のイサリビガマアンコウを入手できた。ツマグロイシモチは高知で採取され、また、イサリビガマアンコウはアメリカ合衆国のカリフォルニアで採取された。ツマグロイシモチの系統分類的位置付けは、まだはっきりしていないので、発光の進化を議論する上で、今後、分類学者との共同研究が必要になる。
これらの材料に対して、現在、キンメモドキのルシフェラーゼと相同性があるかを調べるため、同様に、ウェスタンブロットと免疫組織化学による検出を進めている。今後、反応が出た場合、プルダウンからのMS/MS解析により、タンパク質の同定を進め、配列から、進化的な考察を深めたい。
Physiology and Anatomy II
2022
How a fish steals its ability to glow Internet
The New York Times 2020.1
跳躍的進化のカギ!?生物の“盗み”戦略 TV or radio program
NHK サイエンスZERO 2023.7
【くもM LAB】発光生物に恋してる!?生き物の光に魅了された研究者(名古屋大学高等研究院特任助教 別所上原学先生 インタビュー Internet
SienceTalks 【くもM LAB】 2021.9
海の光るいのち、進化をひも解く/別所-上原学特任助教 Internet
名古屋大学産学官連隊推進本部 「名大研究フロントライン」 2021.7
深海発光サンゴ 新たに4種 Newspaper, magazine
中日新聞社 中日新聞 2020.10
Fish Steals Bioluminescence from Prey Internet
The Scientist 2020.1
Science Advisor Report International contribution
Role(s):Review, evaluation
Alfred P. Sloan Foundation 2022.2 - 2022.3