Organization
Administrative Support Organizations Academic Research & Industry-Academia-Government Collaboration Designated Lecturer
Title
Designated Lecturer
HAMAGUCHI Tomonari
Degree 1
-
医学博士 （ 2014.12 名古屋大学 ）
Research Areas 3
-
Life Science / Medical biochemistry
-
Life Science / Molecular biology
-
Life Science / Neuropathology
Papers 19
-
Bacterial constipation: Mucin-degrading intestinal commensal bacteria cause constipation Open Access
Hamaguchi, T; Gibo, N; Ohara, M; Ito, M; Ogura, T; Takeda, JI; Nishiwaki, H; Zhao, F; Kinoshita-Daitoku, R; Hattori, M; Nonogaki, K; Maeda, T; Kashihara, K; Tsuboi, Y; Hirayama, M; Fujishiro, M; Kawashima, H; Ohno, K
GUT MICROBES Vol. 18 ( 1 ) page： 2596809 2026.12
-
Zhao, F; Hamaguchi, T; Egawa, R; Enomoto, A; Ohno, K
CELL REPORTS METHODS Vol. 5 ( 11 ) page： 101208 2025.11
-
Butyrate-producing bacteria in pregnancy maintenance: mitigating dysbiosis-induced preterm birth Open Access
Uchida, A; Imai, K; Miki, R; Hamaguchi, T; Nishiwaki, H; Ito, M; Ueyama, J; Hattori, S; Tano, S; Fuma, K; Matsuo, S; Ushida, T; Ohno, K; Kajiyama, H; Kotani, T
JOURNAL OF TRANSLATIONAL MEDICINE Vol. 23 ( 1 ) page： 533 2025.5
-
Hamaguchi, T; Ohara, M; Hisatomi, A; Sekiguchi, K; Takeda, JI; Ueyama, J; Ito, M; Nishiwaki, H; Ogi, T; Hirayama, M; Ohkuma, M; Sakamoto, M; Ohno, K
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY Vol. 75 ( 1 ) 2025
-
Masuda, A; Okamoto, T; Kawachi, T; Takeda, J; Hamaguchi, T; Ohno, K
MOLECULAR CELL Vol. 84 ( 15 ) page： 2949 - 2965.e10 2024.8
-
Meta-analysis of shotgun sequencing of gut microbiota in Parkinson's disease
Nishiwaki, H; Ueyama, J; Ito, M; Hamaguchi, T; Takimoto, K; Maeda, T; Kashihara, K; Tsuboi, Y; Mori, H; Kurokawa, K; Katsuno, M; Hirayama, M; Ohno, K
NPJ PARKINSONS DISEASE Vol. 10 ( 1 ) page： 106 2024.5
-
Muraoka, A; Suzuki, M; Hamaguchi, T; Watanabe, S; Iijima, K; Murofushi, Y; Shinjo, K; Osuka, S; Hariyama, Y; Ito, M; Ohno, K; Kiyono, T; Kyo, S; Iwase, A; Kikkawa, F; Kajiyama, H; Kondo, Y
SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE Vol. 15 ( 700 ) page： eadd1531 2023.6
-
Gastrointestinal disorders in Parkinson's disease and other Lewy body diseases
Hirayama, M; Nishiwaki, H; Hamaguchi, T; Ohno, K
NPJ PARKINSONS DISEASE Vol. 9 ( 1 ) page： 71 2023.5
-
Asano-Inami, E; Yokoi, A; Sugiyama, M; Hyodo, T; Hamaguchi, T; Kajiyama, H
COMMUNICATIONS BIOLOGY Vol. 6 ( 1 ) page： 415 2023.4
-
Gut microbiota in dementia with Lewy bodies
Nishiwaki, H; Ueyama, J; Kashihara, K; Ito, M; Hamaguchi, T; Maeda, T; Tsuboi, Y; Katsuno, M; Hirayama, M; Ohno, K
NPJ PARKINSONS DISEASE Vol. 8 ( 1 ) page： 169 2022.12
-
Gibo, N; Hamaguchi, T; Miki, Y; Yamamura, T; Nakaguro, M; Ito, M; Nakamura, M; Kawashima, H; Hirayama, M; Hirooka, Y; Wakabayashi, K; Ohno, K
JOURNAL OF GASTROINTESTINAL AND LIVER DISEASES Vol. 31 ( 3 ) page： 290 - 300 2022.9
-
Nishiwaki, H; Ito, M; Hamaguchi, T; Maeda, T; Kashihara, K; Tsuboi, Y; Ueyama, J; Yoshida, T; Hanada, H; Takeuchi, I; Katsuno, M; Hirayama, M; Ohno, K
NPJ PARKINSONS DISEASE Vol. 8 ( 1 ) page： 65 2022.6
-
Hirayama, M; Nishiwaki, H; Hamaguchi, T; Ito, M; Ueyama, J; Maeda, T; Kashihara, K; Tsuboi, Y; Ohno, K
PLOS ONE Vol. 16 ( 11 ) page： e0260451 2021.11
-
Nishiwaki, H; Hamaguchi, T; Ito, M; Ishida, T; Maeda, T; Kashihara, K; Tsuboi, Y; Ueyama, J; Shimamura, T; Mori, H; Kurokawa, K; Katsuno, M; Hirayama, M; Ohnoa, K
MSYSTEMS Vol. 5 ( 6 ) 2020.11
-
Meta-Analysisof Gut Dysbiosis in Parkinson's Disease
Nishiwaki, H; Ito, M; Ishida, T; Hamaguchi, T; Maeda, T; Kashihara, K; Tsuboi, Y; Ueyama, J; Shimamura, T; Mori, H; Kurokawa, K; Katsuno, M; Hirayama, M; Ohno, K
MOVEMENT DISORDERS Vol. 35 ( 9 ) page： 1626 - 1635 2020.9
-
SRSF3 and hnRNP K Antagonistically Regulate Splicing of Large Exons
Kawachi, T; Masuda, A; Takeda, J; Ito, M; Hamaguchi, T; Ohno, K
FASEB JOURNAL Vol. 34 2020.4
-
Sakaguchi, T; Takefuji, M; Wettschureck, N; Hamaguchi, T; Amano, M; Kato, K; Tsuda, T; Eguchi, S; Ishihama, S; Mori, Y; Yura, Y; Yoshida, T; Unno, K; Okumura, T; Ishii, H; Shimizu, Y; Bando, YK; Ohashi, K; Ouchi, N; Enomoto, A; Offermanns, S; Kaibuchi, K; Murohara, T
CIRCULATION Vol. 140 ( 21 ) page： 1737 - 1752 2019.11
-
Suzuki, A; Ito, M; Hamaguchi, T; Mori, H; Takeda, Y; Baba, R; Watanabe, T; Kurokawa, K; Asakawa, S; Hirayama, M; Ohno, K
PLOS ONE Vol. 13 ( 12 ) page： e0208313 2018.12
-
Discovery of long-range inhibitory signaling to ensure single axon formation Open Access
Takano, T; Wu, MY; Nakamuta, S; Naoki, H; Ishizawa, N; Namba, T; Watanabe, T; Xu, CD; Hamaguchi, T; Yura, Y; Amano, M; Hahn, KM; Kaibuchi, K
NATURE COMMUNICATIONS Vol. 8 ( 1 ) page： 33 2017.6
Research Project for Joint Research, Competitive Funding, etc. 1
-
パーキンソン病の起因となる腸管α-synuclein異常蓄積に対する腸内細菌叢の関与の解明
2017.10
GSKジャパン研究助成
Grant type：Competitive
KAKENHI (Grants-in-Aid for Scientific Research) 4
-
Grant number：25K22916 2025.6 - 2027.3
科学研究費助成事業 挑戦的研究(萌芽)
佐藤 和秀, 丸山 裕, 浜口 知成
Authorship：Coinvestigator(s)
研究代表者はNIR-PITの機序は、これまでの細胞死と異なる光化学反応による“Photochemosis”であることを解明しており、この細胞死の新しさにより“第５のがん治療”と認識され早期承認に繋がった 。このような背景・経緯で、NIR-PIT治療が、がんのみならず細菌菌体にも殺菌効果を及ぼすことを着想しdysbiosisを是正する細菌叢操作技術；細菌叢時空間光制御に応用可能であると着想した。
-
Lewy小体病に関連する腸内細菌の機能遺伝子および代謝産物の解明
Grant number：24K10657 2024.4 - 2027.3
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
平山 正昭, 浜口 知成
Authorship：Coinvestigator(s)
腸内細菌の80%が機能が十分明らかになっていないことから細菌叢解析のみでは、細菌叢の機能的役割を明らかにはできない。そこで、ショットガンシークエンス解析による機能解析およびその結果推定される代謝産物を測定することによりに発祥様式の異なるLewy小体病における脳障害と脳保護作用の機序解明を行うことで、病態進展因子と抑制因子を明らかにする。
Lewy小体病の機能遺伝子解析を行い、連続して機能遺伝子が減少している代謝経路はSCFAの代謝系路やRiboflavin Biotin Folate Porphyrin Arginine biosynthesis・Arginine and proline metabolismであることがわかった。SCFAの酢酸やプロピオン酸は生体に対してエネルギーとして使用され、酪酸は腸粘膜の増殖や免疫の調節に関与していることが知られている。ポリアミンはDNAの安定化やオートファジーの調節などあるはシヌクレインの異常リン酸化に関与する可能性がある。Arginine and proline代謝経路では、Lewy小体病で有意な減少が見られた機能遺伝子についてPolyamine と相関したことからLewy小体病とPolyamineの関連性が考えられた。昨年度はLewy小体病関連疾患（パーキンソン病;PD、Lewy小体型認知症;DLB）の腸内細菌代謝経路における機能遺伝子の同定により水溶性ビタミンの変化が明らかとした。方法としてLewy小体病の腸内細菌ショットガンメタゲノムシークエンスを行い糞便から細菌の遺伝子を抽出し、既知の機能遺伝子を同定した。得られた有意差のある細菌代謝物質として、便中のSCFAとポリアミン、水溶性ビタミンとの関連を検討した。その結果コントロールと比較してPDにおいてビオチン、葉酸、リボフラビンなどビタミンやポリアミンの代謝において連続的に機能遺伝子の減少が見られた。しかし、便中の水溶性ビタミンは遺伝子の減少にもかかわらず低下せずむしろ増加する物質が見られた。そのため健常者での細菌内での水溶性ビタミン量を測定したところ細菌内と細菌外部でのビタミンの乖離が見られた。今回の測定により機能遺伝子の異常がそのまま細菌代謝物の異常を反映しないことが明らかになった。
昨年と当初目的としていたショットガンメタゲノム解析の論文は報告ができ、また水溶性ビタミンの測定系も確立することができている。
昨年度の測定で機能遺伝子の低下にもかかわらず、便中の代謝物が増加する現象が見られた。そのため代謝物に関しては、細菌細胞内の代謝物も測定することを第一の目標にする。ビタミンに関する機能遺伝子の異常は見られたが実際のビタミンとの関連を十分明らかにできなかった。ビタミンは大腸でも吸収され、大腸からの吸収が生体に影響を及ぼすかどうかは十分知られていない。長期抗生物質投与がビオチンやビタミンKなどのビタミン欠乏を起こすことから腸内細菌が生体のビタミン維持に重要な役割を果たすことが知られている。また、腸内細菌は自身で一部のビタミンを産生する能力がなく、特にLewy小体病で低下する酪酸産生菌にはビオチン、葉酸、ビタミンB6を産生する能力はなく、他の細菌で産生されたビタミンによりその細菌自身の維持を行っていると考えられている。したがって、Lewy小体病で低下している酪酸産生菌の改善にビタミン投与が関与するかもしれない。そこで、便中のビタミンを網羅的に測定する方法を確立し、Lewy小体病における腸内細菌が産生する代謝物の役割と腸内細菌改善の創薬開発の方法を明らかにする。 -
Elucidating the Role of Gut Microbiota in the Pathogenesis of Parkinson's Disease
Grant number：22K15394 2022.4 - 2024.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Hamaguchi Tomonari
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2730000 （ Direct Cost: \2100000 、 Indirect Cost：\630000 ）
We hypothesize that specific gut bacteria are involved in the onset and pathogenesis of Parkinson's Disease (PD). One objective of this project is to identify the gut bacteria involved in the onset and progression of PD. The second is to elucidate the role of short-chain fatty acids (SCFAs) in PD. For Objective 1, we created a co-transplantation model of A. muciniphila and Bacteroides spp. and experimentally reproduced chronic constipation, an early symptom of PD. For Objective 2, we observed an exacerbation of PD symptoms by cross-breeding a short-chain fatty acid receptor knockout model with a PD mouse model. Thus, through mouse model studies, it has been demonstrated that gut bacteria are involved in the symptoms of PD.
-
m7GTP cap-mediated translation control
Grant number：19K16516 2019.4 - 2023.3
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Hamaguchi Tomonari
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\4160000 （ Direct Cost: \3200000 、 Indirect Cost：\960000 ）
We identified GEMIN4-binding proteins under arsenic state by LC/MS/MS. Binding of endogenous GEMIN4 to m7GTP was promoted by arsenite and methyl methanesulfonate and inhibited by methylation inhibitors. Using reporter assays and the pulsed SILAC method, we obtained data showing that GEMIN4 suppressed translation or protein degradation in an arsenic concentration-dependent manner. However, Ribosomal profiling, performed in collaboration with a collaborator, did not provide data supporting translational repression. In general, GEMIN4 bound to m7GTP cap of mRNA via methylation reaction. However, the biological significance remains unresolved.