所属
環境医学研究所 生体適応・防御研究部門 講師
大学院担当
大学院医学系研究科
職名
講師
オカ ヤスヨシ
岡 泰由
OKA Yasuyoshi
学位 1
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博士 (学術) （ 2011年9月 長崎大学 ）
研究キーワード 8
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ゲノムの安定化維持機構
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DNA修復
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アルデヒド代謝
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老化
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遺伝性疾患
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疾患モデル動物
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ゲノム解析
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プロテオーム解析
研究分野 6
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ライフサイエンス / 分子生物学
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ライフサイエンス / ゲノム生物学
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環境・農学 / 化学物質影響
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環境・農学 / 放射線影響
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ライフサイエンス / 遺伝学
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ライフサイエンス / 病態医化学 / 5
所属学協会 3
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日本プロテオーム学会
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日本分子生物学会
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日本環境変異原学会
論文 24
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Mitochondria-associated membrane collapse impairs TBK1-mediated proteostatic stress response in ALS 招待有り 査読有り
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2023年11月
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Lysosomal cholesterol overload in macrophages promotes liver fibrosis in a mouse model of NASH. 査読有り 国際誌
Itoh M, Tamura A, Kanai S, Tanaka M, Kanamori Y, Shirakawa I, Ito A, Oka Y, Hidaka I, Takami T, Honda Y, Maeda M, Saito Y, Murata Y, Matozaki T, Nakajima A, Kataoka Y, Ogi T, Ogawa Y, Suganami T
The Journal of experimental medicine 220 巻 ( 11 ) 2023年11月
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A case of non-immune hydrops fetalis with maternal mirror syndrome diagnosed by trio-based exome sequencing: An autopsy case report and literature review 査読有り
Tano Sho, Kotani Tomomi, Yoshihara Masato, Nakamura Noriyuki, Matsuo Seiko, Ushida Takafumi, Imai Kenji, Ito Miharu, Oka Yasuyoshi, Sato Emi, Hayashi Shin, Ogi Tomoo, Kajiyama Hiroaki
MOLECULAR GENETICS AND METABOLISM REPORTS 33 巻 頁： 100925 2022年12月
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A novel missense variant in CUL3 shows altered binding ability to BTB-adaptor proteins leading to diverse phenotypes of CUL3-related disorders 査読有り 国際誌
Kato Kohji, Miya Fuyuki, Oka Yasuyoshi, Mizuno Seiji, Saitoh Shinji
JOURNAL OF HUMAN GENETICS 66 巻 ( 5 ) 頁： 491 - 498 2021年5月
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Digenic mutations in ALDH2 and ADH5 impair formaldehyde clearance and cause a multisystem disorder, AMeD syndrome 査読有り 国際誌
Oka Yasuyoshi, Hamada Motoharu, Nakazawa Yuka, Muramatsu Hideki, Okuno Yusuke, Higasa Koichiro, Shimada Mayuko, Takeshima Honoka, Hanada Katsuhiro, Hirano Taichi, Kawakita Toshiro, Sakaguchi Hirotoshi, Ichimura Takuya, Ozono Shuichi, Yuge Kotaro, Watanabe Yoriko, Kotani Yuko, Yamane Mutsumi, Kasugai Yumiko, Tanaka Miyako, Suganami Takayoshi, Nakada Shinichiro, Mitsutake Norisato, Hara Yuichiro, Kato Kohji, Mizuno Seiji, Miyake Noriko, Kawai Yosuke, Tokunaga Katsushi, Nagasaki Masao, Kito Seiji, Isoyama Keiichi, Onodera Masafumi, Kaneko Hideo, Matsumoto Naomichi, Matsuda Fumihiko, Matsuo Keitaro, Takahashi Yoshiyuki, Mashimo Tomoji, Kojima Seiji, Ogi Tomoo
SCIENCE ADVANCES 6 巻 ( 51 ) 2020年12月
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Biallelic VPS35L pathogenic variants cause 3C/Ritscher-Schinzel-like syndrome through dysfunction of retriever complex 査読有り 国際誌
Kato Kohji, Oka Yasuyoshi, Muramatsu Hideki, Vasilev Filipp F., Otomo Takanobu, Oishi Hisashi, Kawano Yoshihiko, Kidokoro Hiroyuki, Nakazawa Yuka, Ogi Tomoo, Takahashi Yoshiyuki, Saitoh Shinji
JOURNAL OF MEDICAL GENETICS 57 巻 ( 4 ) 頁： 245 - 253 2020年4月
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Ubiquitination of DNA Damage-Stalled RNAPII Promotes Transcription-Coupled Repair 査読有り 国際誌
Nakazawa Yuka, Hara Yuichiro, Oka Yasuyoshi, Komine Okiru, van den Heuvel Diana, Guo Chaowan, Daigaku Yasukazu, Isono Mayu, He Yuxi, Shimada Mayuko, Kato Kana, Jia Nan, Hashimoto Satoru, Kotani Yuko, Miyoshi Yuka, Tanaka Miyako, Sobue Akira, Mitsutake Norisato, Suganami Takayoshi, Masuda Akio, Ohno Kinji, Nakada Shinichiro, Mashimo Tomoji, Yamanaka Koji, Luijsterburg Martijn S., Ogi Tomoo
CELL 180 巻 ( 6 ) 頁： 1228 - + 2020年3月
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TRAIP is a PCNA-binding ubiquitin ligase that protects genome stability after replication stress 査読有り 国際誌
Hoffmann Saskia, Smedegaard Stine, Nakamura Kyosuke, Mortuza Gulnahar B., Raschle Markus, Ibanez de Opakua Alain, Oka Yasuyoshi, Feng Yunpeng, Blanco Francisco J., Mann Matthias, Montoya Guillermo, Groth Anja, Bekker-Jensen Simon, Mailand Niels
JOURNAL OF CELL BIOLOGY 212 巻 ( 1 ) 頁： 63 - 75 2016年1月
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Ubiquitin-like protein UBL5 promotes the functional integrity of the Fanconi anemia pathway 査読有り 国際誌
Oka Yasuyoshi, Bekker-Jensen Simon, Mailand Niels
EMBO JOURNAL 34 巻 ( 10 ) 頁： 1385 - 1398 2015年5月
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Proteomics reveals dynamic assembly of repair complexes during bypass of DNA cross-links 査読有り 国際誌
Raeschle Markus, Smeenk Godelieve, Hansen Rebecca K., Temu Tikira, Oka Yasuyoshi, Hein Marco Y., Nagaraj Nagarjuna, Long David T., Walter Johannes C., Hofmann Kay, Storchova Zuzana, Cox Juergen, Bekker-Jensen Simon, Mailand Niels, Mann Matthias
SCIENCE 348 巻 ( 6234 ) 頁： 1253671 - 1253671 2015年5月
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Ubiquitin-SUMO Circuitry Controls Activated Fanconi Anemia ID Complex Dosage in Response to DNA Damage 査読有り 国際誌
Gibbs-Seymour Ian, Oka Yasuyoshi, Rajendra Eeson, Weinert Brian T., Passmore Lori A., Patel Ketan J., Olsen Jesper V., Choudhary Chunaram, Bekker-Jensen Simon, Mailand Niels
MOLECULAR CELL 57 巻 ( 1 ) 頁： 150 - 164 2015年1月
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TRIP12 and UBR5 Suppress Spreading of Chromatin Ubiquitylation at Damaged Chromosomes 査読有り
Gudjonsson Thorkell, Altmeyer Matthias, Savic Velibor, Toledo Luis, Dinant Christoffel, Grofte Merete, Bartkova Jirina, Poulsen Maria, Oka Yasuyoshi, Bekker-Jensen Simon, Mailand Niels, Neumann Beate, Heriche Jean-Karim, Shearer Robert, Saunders Darren, Bartek Jiri, Lukas Jiri, Lukas Claudia
CELL 159 巻 ( 6 ) 頁： 1476 - 1477 2014年12月
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UBL5 is essential for pre-mRNA splicing and sister chromatid cohesion in human cells 査読有り 国際誌
Oka Yasuyoshi, Varmark Hanne, Vitting-Seerup Kristoffer, Beli Petra, Waage Johannes, Hakobyan Anna, Mistrik Martin, Choudhary Chunaram, Rohde Mikkel, Bekker-Jensen Simon, Mailand Niels
EMBO REPORTS 15 巻 ( 9 ) 頁： 956 - 964 2014年9月
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Live-Cell Imaging Visualizes Frequent Mitotic Skipping During Senescence-Like Growth Arrest in Mammary Carcinoma Cells Exposed to Ionizing Radiation 査読有り 国際誌
Suzuki Masatoshi, Yamauchi Motohiro, Oka Yasuyoshi, Suzuki Keiji, Yamashita Shunichi
INTERNATIONAL JOURNAL OF RADIATION ONCOLOGY BIOLOGY PHYSICS 83 巻 ( 2 ) 頁： E241 - E250 2012年6月
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Mode of ATM-dependent suppression of chromosome translocation 査読有り 国際誌
Yamauchi Motohiro, Suzuki Keiji, Oka Yasuyoshi, Suzuki Masatoshi, Kondo Hisayoshi, Yamashita Shunichi
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 416 巻 ( 1-2 ) 頁： 111 - 118 2011年12月
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Persistence and Dynamics of DNA Damage Signal Amplification Determined by Microcolony Formation and Live-cell Imaging 査読有り 国際誌
Oka Yasuyoshi, Yamauchi Motohiro, Suzuki Masatoshi, Yamashita Shunichi, Suzuki Keiji
JOURNAL OF RADIATION RESEARCH 52 巻 ( 6 ) 頁： 766 - 774 2011年11月
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Recruitment of the cohesin loading factor NIPBL to DNA double-strand breaks depends on MDC1, RNF168 and HP1 gamma in human cells 査読有り 国際誌
Oka Yasuyoshi, Suzuki Keiji, Yamauchi Motohiro, Mitsutake Norisato, Yamashita Shunichi
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 411 巻 ( 4 ) 頁： 762 - 767 2011年8月
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Creating localized DNA double-strand breaks with microirradiation 査読有り 国際誌
Suzuki Keiji, Yamauchi Motohiro, Oka Yasuyoshi, Suzuki Masatoshi, Yamashita Shunichi
NATURE PROTOCOLS 6 巻 ( 2 ) 頁： 134 - 139 2011年2月
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A novel and simple micro-irradiation technique for creating localized DNA double-strand breaks 査読有り 国際誌
Suzuki Keiji, Yamauchi Motohiro, Oka Yasuyoshi, Suzuki Masatoshi, Yamashita Shunichi
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 38 巻 ( 12 ) 頁： e129 2010年7月
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Requirement of ATM-dependent pathway for the repair of a subset of DNA double strand breaks created by restriction endonucleases. 査読有り 国際誌
Suzuki K, Takahashi M, Oka Y, Yamauchi M, Suzuki M, Yamashita S
Genome integrity 1 巻 ( 1 ) 頁： 4 - 4 2010年5月
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Higher-Order Chromatin Structure and Nontargeted Effects 査読有り
Suzuki Keiji, Yamauchi Motohiro, Oka Yasuyoshi, Yamashita Shunichi
RADIATION HEALTH RISK SCIENCES 頁： 123 - 126 2009年
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Paracrine Interactions Between Normal, but Not Cancer, Epithelial and Normal Mesenchymal Cells Attenuate Radiation-Induced DNA Damage 査読有り
Saenko Vladimir A., Nakazawa Yuka, Rogounovitch Tatiana I., Suzuki Keiji, Mitsutake Norisato, Matsuse Michiko, Oka Yasuyoshi, Yamashita Shunichi
RADIATION HEALTH RISK SCIENCES 頁： 294 - + 2009年
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Growth of persistent foci of DNA damage checkpoint factors is essential for amplification of G1 checkpoint signaling 査読有り 国際誌
Yamauchi Motohiro, Oka Yasuyoshi, Yamamoto Masashi, Niimura Koichi, Uchida Motoyuki, Kodama Seiji, Watanabe Masami, Sekine Ichiro, Yamashita Shunichi, Suzuki Keiji
DNA REPAIR 7 巻 ( 3 ) 頁： 405 - 417 2008年3月
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Qualitative and quantitative analysis of phosphorylated ATM foci induced by low-dose ionizing radiation. 査読有り 国際誌
Suzuki K, Okada H, Yamauchi M, Oka Y, Kodama S, Watanabe M
Radiation research 165 巻 ( 5 ) 頁： 499 - 504 2006年5月
科研費 5
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DNA損傷部位特異的に集積する転写共役修復因子群を同定・評価する新規技術の開発
研究課題/研究課題番号：19H04266 2019年4月 - 2022年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
橋本 悟, 寺林 健, 岡 泰由, 荻 朋男
担当区分：研究分担者
RNA合成酵素が転写伸長中にDNA損傷と衝突した際に生じていると考えられている、バックトラッキング（DNA損傷部位から転写と逆方向にRNA合成酵素がスライドする現象）の観察が可能となる新しい実験系を開発する。この実験系を用いて、転写と共役したDNA修復異常を来す各種疾患群の病態メカニズム解明を目指す。
様々な環境要因によってDNAは損傷を受けており、複数の機構によってDNA損傷は修復されている。転写領域において、RNAポリメラーゼがDNA損傷と遭遇することが修復開始のシグナルになることがあるが、その詳細なメカニズムについては不明な点が多い。ここで、細胞内におけるDNA損傷とRNAポリメラーゼが遭遇しているゲノム上における部位特異的な現象を評価する実験系が無いことが研究上の大きな課題となっている。本研究計画では、RNAポリメラーゼによる損傷認識機構を解明すべくDNA損傷に衝突したRNAポリメラーゼを評価する新しい実験系の開発を目指す。
RNAポリメラーゼによる損傷認識に伴うDNA修復機構（TCR）の破綻は、コケイン症候群（CS）と紫外線高感受性症候群（UVSS）を来す。CSおよびUVSSともに光線過敏を示すが、CSでは光線過敏以外に認知機能の異常や運動機能障害等、様々な神経症状を有する。ここで、同じTCR機能の異常を原因とする疾患群で異なる臨床像を示すメカニズムについては未解明である。本研究によりTCR機能異常の詳細を明らかにすることが可能となり、CS並びにUVSSの治療法開発に貢献することが可能となる。 -
研究課題/研究課題番号：18K11639 2018年4月 - 2021年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
黒谷 賢一, 岡 泰由, 荻 朋男, 嶋田 繭子, 唐田 清伸
担当区分：研究分担者
DNA損傷応答 (DDR)はゲノムの安定化に極めて重要な反応である。DDR蛋白質の細胞内での機能を理解するためには、蛋白質-蛋白質間の相互作用ネットワークを詳細に知る必要がある。本研究では、精密質量分析装置を利用した、ヒト細胞におけるDDR蛋白質のインタラクトーム解析を実施する。本研究成果の一つとして、DNA損傷後に、RNAポリメラーゼIIの最大サブユニットであるPOLR2A/RPB1と相互作用する因子を複数個同定した。
DNA損傷応答 (DDR)はゲノムの安定化維持機構に極めて重要な役割を持っている。事実、DDR機構の破綻は、成長発達障害、高発がん性、神経変性、早期老化などの様々な疾患の発症に関係していることが知られている。本研究で実施した、DNA損傷誘導後の精密質量分析装置を利用したインタラクトーム解析は、未解明のDDR分子機序の一端を解明したという点において、学術的に優れた成果であったと言える。 -
プロテオーム解析によるDNA損傷応答システムの破綻により生じる疾患発症因子の同定
研究課題/研究課題番号：18H03372 2018年4月 - 2021年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
岡 泰由, 荻 朋男
担当区分：研究代表者
配分額：17550000円 （ 直接経費：13500000円 、 間接経費：4050000円 ）
DNA損傷応答システムの破綻によって、様々な病態を示す遺伝性疾患を発症することが知られている。昨今の大規模ゲノム解析研究から、健常人のゲノムにも数多くの機能変化を生じうる遺伝子変異が多数存在することが明らかになってきた。全エキソーム解析を行ったとしても、疾患原因遺伝子変異の絞り込みが困難なため、確定診断に至るのは30%程度といわれており、疾患原因因子の同定のための新たな探索技術の開発が喫緊の課題である。本研究では、ゲノム解析結果とプロテオーム解析データを統合することで、全エキソーム解析のみでは同定に至らなかった症例から、イントロン深部の新規RNASEH2B変異を同定した。
本研究では、全エキソーム解析のみでは疾患発症因子の同定に至らなかった症例について、プロテオーム解析を実施することで、原因因子を特定することが可能となった。全エキソーム解析に加えて、全ゲノム解析、RNAシーケンス解析、本研究で実施したプロテオーム解析を組み合わせた、マルチオミクス解析を実施することにより、診断率の向上ならびに未診断遺伝性疾患の病態解明へと繋がることが期待される。 -
DNA二本鎖切断修復機構に関与する機能未知の小頭症新規責任因子の分子機能解析
研究課題/研究課題番号：17H01877 2017年4月 - 2020年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
中沢 由華, 岡 泰由, 荻 朋男
担当区分：研究分担者
我々は、DNA修復機構の障害により発症する遺伝性疾患のうち、共通する病態の1つである小頭症に着目して既存症例の解析を行った結果、いくつかの疾患原因遺伝子変異の同定に至った。疾患モデルマウスを作製して解析を行っても、期待された表現型を示さないことが多いため、DNA損傷負荷をかけるために2重変異マウスを作製して解析を進めた。この結果、小頭症や神経変性を発症するメカニズムとして、DNA損傷により転写が阻害される事が原因であるとの新たな知見を得た。RNAポリメラーゼはDNA損傷箇所で停止するとユビキチン化修飾を受けるが、これが障害されることで、コケイン症候群やその関連疾患を発症すると考えられた。
DNA 損傷応答・DNA 修復機構の先天的な異常により、ゲノムが不安定化することで発症する様々な遺伝性疾患が知られている。これらの疾患では小頭症を示す症例が多く、鑑別診断が重要である。今回、収集した症例のゲノム解析などから、いくつかのDNA修復機構に新規の疾患原因変異を同定した。モデルマウスの解析から、コケイン症候群などで観察される小頭症と神経変性を説明可能な転写と共役したDNA修復機構の分子メカニズムの詳細が明らかにされた。 -
DNA二本鎖間の架橋修復を指標とした新規の小頭症原因遺伝子変異の探索
研究課題/研究課題番号：16K21084 2016年4月 - 2019年3月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究(B)
岡 泰由
担当区分：研究代表者
配分額：3900000円 （ 直接経費：3000000円 、 間接経費：900000円 ）
本研究の目的は、ゲノムの安定化維持機構の破綻により発症する遺伝性疾患患者から、新規の疾患発症関連遺伝子を同定することである。ゲノム安定化維持機構の破綻によって発症した遺伝性疾患患者の主徴の一つとして小頭症が知られている。そこで、先天性小頭症患者の次世代ゲノム解析を実施した結果、DNA二本鎖間架橋の原因となり得るアルデヒドの代謝関連酵素に変異を見出した。
ゲノム安定化維持機構に異常を持った劣性遺伝性疾患の臨床像として小頭症を呈する患者群に着目し、ICL修復との関連性から新規の原因遺伝子変異を探すというアプローチは前例がなく、斬新である。本研究では、ゲノムの不安定化により発症した新規の劣性遺伝性疾患の発症原因となる候補遺伝子変異を同定しており、小頭症発症の詳細な分子メカニズムの解明に繋がることが期待される。
産業財産権 1
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造血不全、発育遅滞、高発がん性、精神機能障害のモデル動物
荻朋男/岡泰由
担当経験のある科目 (本学) 6
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基盤医科学実習ベーシックトレーニング
2023
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環境学入門
2023
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自然環境と人間
2021
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基盤医科学実習ベーシックトレーニング
2021
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自然環境と人間
2020
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基盤医科学実習ベーシックトレーニング
2020