所属
細胞生理学研究センター 基礎生物学研究部門 准教授
大学院担当
大学院創薬科学研究科
職名
准教授
連絡先
アベ カズヒロ
阿部 一啓
ABE Kazuhiro
学位 1
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博士（理学） （ 2004年3月 北海道大学 ）
研究キーワード 1
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膜タンパク質 極低温電子顕微鏡 胃 プロトンポンプ P-type ATPase
研究分野 5
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ライフサイエンス / 分子生物学
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ライフサイエンス / 機能生物化学
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ライフサイエンス / 構造生物化学
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ライフサイエンス / 生物物理学
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ライフサイエンス / 薬系化学、創薬科学
経歴 6
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名古屋大学 大学院創薬科学研究科 基盤創薬学専攻 創薬分子構造学 准教授
2012年4月 - 現在
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京都大学 特定研究員
2011年4月 - 2012年3月
国名：日本国
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社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム
2008年4月 - 2011年3月
国名：日本国
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日本学術振興会特別研究員 (PD)
2005年4月 - 2008年3月
国名：日本国
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日本学術振興会特別研究員 (PD)
2004年4月 - 2005年3月
国名：日本国
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日本学術振興会 特別研究員 (DC2)
2003年4月 - 2004年3月
国名：日本国
学歴 3
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北海道大学 理学研究科 化学専攻
2001年4月 - 2004年4月
国名： 日本国
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北海道大学 理学研究科 化学専攻
1999年4月 - 2001年3月
国名： 日本国
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北海道大学 理学部 化学科
1995年4月 - 1999年3月
国名： 日本国
所属学協会 2
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日本生化学会
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日本生物物理学会
受賞 5
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日本生化学会奨励賞
2013年9月 日本生化学会
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若手奨励賞
2011年12月 生体エネルギー研究会
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JBC Herbert Tabor Award
2011年10月 ASBMB
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Margrethe Moller Award
2008年8月 P-ATPase conference
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FASEB SRC Young Scientist Award
2004年8月 FASEB
論文 37
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Crystal structures of the gastric proton pump 査読有り 国際共著
Abe Kazuhiro, Irie Katsumasa, Nakanishi Hanayo, Suzuki Hiroshi, Fujiyoshi Yoshinori
NATURE 556 巻 ( 7700 ) 頁： 214-+ 2018年4月
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Structure and function of H+/K+ pump mutants reveal Na+/K+ pump mechanisms 査読有り 国際共著
Young Victoria C., Nakanishi Hanayo, Meyer Dylan J., Nishizawa Tomohiro, Oshima Atsunori, Artigas Pablo, Abe Kazuhiro
NATURE COMMUNICATIONS 13 巻 ( 1 ) 2022年9月
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Structural Basis for Binding of Potassium-Competitive Acid Blockers to the Gastric Proton Pump 査読有り 国際共著
Tanaka Saki, Morita Mikio, Yamagishi Tatsuya, Madapally Hridya Valia, Hayashida Kenichi, Khandelia Himanshu, Gerle Christoph, Shigematsu Hideki, Oshima Atsunori, Abe Kazuhiro
JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY 65 巻 ( 11 ) 頁： 7843 - 7853 2022年6月
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Cryo-EM of the ATP11C flippase reconstituted in Nanodiscs shows a distended phospholipid bilayer inner membrane around transmembrane helix 2 査読有り
Nakanishi H, Hayashida K, Nishizawa T, Oshima A and Abe K
Journal of Biological Chemistry 298 巻 頁： 101498 2022年1月
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Gastric proton pump with two occluded K+ engineered with sodium pump-mimetic mutations 査読有り
Abe Kazuhiro, Yamamoto Kenta, Irie Katsumasa, Nishizawa Tomohiro, Oshima Atsunori
NATURE COMMUNICATIONS 12 巻 ( 1 ) 2021年9月
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細胞膜リン脂質フリッパーゼATP11Cの立体構造と輸送機構 招待有り
中西華代 阿部一啓
生化学 93 巻 ( 6 ) 頁： 824 - 829 2021年
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Transport Cycle of Plasma Membrane Flippase ATP11C by Cryo-EM 査読有り
Nakanishi Hanayo, Nishizawa Tomohiro, Segawa Katsumori, Nureki Osamu, Fujiyoshi Yoshinori, Nagata Shigekazu, Abe Kazuhiro
CELL REPORTS 32 巻 ( 13 ) 2020年9月
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Crystal structure of a human plasma membrane phospholipid flippase 査読有り
Nakanishi Hanayo, Irie Katsumasa, Segawa Katsumori, Hasegawa Kazuya, Fujiyoshi Yoshinori, Nagata Shigekazu, Abe Kazuhiro
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 295 巻 ( 30 ) 頁： 10180 - 10194 2020年7月
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Isoform-selective regulation of mammalian cryptochromes 査読有り
Miller Simon, Son You Lee, Aikawa Yoshiki, Makino Eri, Nagai Yoshiko, Srivastava Ashutosh, Oshima Tsuyoshi, Sugiyama Akiko, Hara Aya, Abe Kazuhiro, Hirata Kunio, Oishi Shinya, Hagihara Shinya, Sato Ayato, Tama Florence, Itami Kenichiro, Kay Steve A., Hatori Megumi, Hirota Tsuyoshi
NATURE CHEMICAL BIOLOGY 16 巻 ( 6 ) 頁： 676 - + 2020年6月
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Purified F-ATP synthase forms a Ca2+-dependent high-conductance channel matching the mitochondrial permeability transition pore 査読有り
Urbani Andrea, Giorgio Valentina, Carrer Andrea, Franchin Cinzia, Arrigoni Giorgio, Jiko Chimari, Abe Kazuhiro, Maeda Shintaro, Shinzawa-Itoh Kyoko, Bogers Janna F. M., McMillan Duncan G. G., Gerle Christoph, Szabo Ildiko, Bernardi Paolo
NATURE COMMUNICATIONS 10 巻 2019年9月
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A single K+-binding site in the crystal structure of the gastric proton pump 査読有り 国際共著
Yamamoto Kenta, Dubey Vikas, Irie Katsumasa, Nakanishi Hanayo, Khandelia Himanshu, Fujiyoshi Yoshinori, Abe Kazuhiro
ELIFE 8 巻 2019年8月
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K+ binding and proton redistribution in the E2P state of the H+, K+-ATPase 査読有り 国際共著
Dubey Vikas, Han Minwoo, Kopec Wojciech, Solov'yov Ilia A., Abe Kazuhiro, Khandelia Himanshu
SCIENTIFIC REPORTS 8 巻 2018年8月
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The Elusive Proton in the Gastric Proton Potassium ATPase
Dubey Vikas, Abe Kazuhiro, Solov'yov Ilia, Khandelia Himanshu
BIOPHYSICAL JOURNAL 114 巻 ( 3 ) 頁： 146A - 146A 2018年2月
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The cryo-EM structure of gastric H+, K+-ATPase with bound BYK99, a high-affinity member of K+-competitive, imidazo[1,2-a]pyridine inhibitors
Abe Kazuhiro, Shimokawa Jun, Naito Mao, Munson Keith, Vagin Olga, Sachs George, Suzuki Hiroshi, Tani Kazutoshi, Fujiyoshi Yoshinori
SCIENTIFIC REPORTS 7 巻 2017年7月
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The cryo-EM structure of gastric H+,K+-ATPase with bound BYK99, a high-affinity member of K+-competitive, imidazo[1,2-a] pyridine inhibitors 査読有り
Kazuhiro Abe, Jun Shimokawa, Mao Naito, Keith Munson, Olga Vagin, George Sachs, Hiroshi Suzuki, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi
Scientific Reports 7 巻 頁： 6632 2017年6月
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Cryo-electron microscopy for structure analyses of membrane proteins in the lipid bilayer 招待有り 査読有り
Abe K. & Fujiyoshi Y
Current Opinion in Structural Biology 39 巻 頁： 71-78 2016年8月
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Systematic comparison of molecular conformations of H+,K+-ATPase reveals an important contribution of the A-M2 linker for the luminal gating. 査読有り
Abe, K., Tani, K., Fujiyoshi, Y.
J. Biol. Chem. 289 巻 ( 44 ) 頁： 30590-30601 2014年9月
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Biochemical and electron crystallographic studies of gastric proton pump 招待有り
Abe, K.
86 巻 ( 4 ) 頁： 429-440 2014年8月
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1. The four-transmembrane protein IP39 of Euglena forms strands by a trimeric unit repeat 査読有り
Suzuki, H., Ito, Y., Yamazaki, Y., Mineta, K., Uji, M., Abe, K., Tani, K., Fujiyoshi, Y. & Tsukita, S.
Nature Communications 4 巻 頁： 1766 2013年4月
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Carbon sandwich preparation preserves quality of two-dimensional crystals for cryo-electron microscopy 査読有り
Yang F., Abe, K., Tani K., Fujiyoshi Y.
Microscopy 62 巻 頁： 597-606 2013年
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Cryo-EM structure of gastric H+,K+-ATPase with a single occupied cation-binding site 査読有り
Abe, K., Tani, K., Friedrich, T.& Fujiyoshi, Y.
Proceedings of the National Academy of Sciences USA 109 巻 ( 45 ) 頁： 18401-18406 2012年11月
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Unique properties of gastric H+,K+-ATPase and conserved conformational changes among P-type ATPases
Abe, K.
84 巻 頁： 115-119 2012年2月
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Conformational rearrangement of gastric H+,K+-ATPase with an acid suppressant.
Abe, K., Tani, K. & Fujiyoshi, Y.
Nature Communications 2 巻 ( 155 ) 頁： 1-9 2011年1月
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A novel ratchet mechanism of gastric H+,K+-ATPase revealed by electron crystallography of two-dimensional crystals.
Abe, K., Tani, K., Nishizawa, T. & Fujiyoshi, Y.
130 巻 頁： 205-210 2010年
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Structural analysis of gastric proton pump by cryo-electron microscopy.
Abe, K.
45 巻 頁： 264-267 2010年
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Structural and functional characterization of H+,K+-ATPase with bound fluorinated phosphate analogs.
Abe, K., Tani, K. & Fujiyoshi, Y.
Journal of Structural Biology 170 巻 頁： 60-68 2010年
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Inter-subunit interaction of gastric H+,K+-ATPase prevents reverse reaction of the transport cycle.
Abe, K., Tani, K., Nishizawa, T. & Fujiyoshi, Y.
EMBO Journal 28 巻 頁： 1637-1643 2009年
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E2P state stabilization by the N-terminal tail of the H,K-ATPase beta-subunit is critical for efficient proton pumping under in vivo conditions.
Dürr, K., Abe, K., Tavraz, N.N. & Friedrich, T.
Journal of Biological Chemistry 284 巻 頁： 20147-20154 2009年
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Epigallocatechin-3-gallate is an inhibitor of Na+,K+-ATPase by favoring the E1 conformation.
Ochiai, H., Takeda, K., Soeda, S., Tahara, Y., Takenaka, H., Abe, K., Hayashi, Y., Noguchi, S., Inoue, M., Schwarz, S., Schwarz, W. & Kawamura, M.
Biochemical Phamacology 78 巻 頁： 1069-1074 2009年
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Structural analysis of 2D crystals of gastric H+,K+-ATPase in different states of the transport cycle.
Nishizawa, T., Abe, K., Tani, K. & Fujiyoshi, Y.
Journal of Structural Biology 162 巻 頁： 219-228 2008年
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Relationship between activity and tetraprotomeric structure of ion-transporting ATPases.
Abe, K., & Kaya, S.
79 巻 頁： 527-534 2007年
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New evidence for ATP binding induced catalytic subunit interactions in pig kidney Na/K-ATPase.
Tanoue, K., Kaya, S., Hayashi, Y., Abe, K., Imagawa, T., Taniguchi, K. & Sakaguchi, K.
Journal of Biochemistry 140 巻 頁： 599-607 2006年
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Evidence for a relationship between activity and the tetraprotomeric assembly of solubilized pig gastric H/K-ATPase.
Abe, K., Kaya, S., Taniguchi, K., Hayashi, Y., Imagawa, T., Kikumoto, M., Oiwa, K. & Sakaguchi, K.
Journal of Biochemistry 138 巻 頁： 293-301 2005年
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Correlation between the activities and the oligomeric forms of pig gastric H/K-ATPase.
Abe, K., Kaya, S., Hayashi, Y., Imagawa, T., Kikumoto, M., Oiwa, K., Katoh, T., Yazawa, M. & Taniguchi, K.
Biochemistry 42 巻 頁： 15132-15138 2003年
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Gastric H/K-ATPase liberates two moles of Pi from one mole of phosphoenzyme formed from a high-affinity ATP binding site and one mole of enzyme-bound ATP at the low-affinity site during cross-talk between catalytic subunits.
Abe, K., Kaya, S., Imagawa, T. & Taniguchi, K.
Biochemistry 41 巻 頁： 2438-2445 2002年
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The oligomeric nature of Na/K-transport ATPase
Taniguchi, K, Kaya, S., Abe, K. & Mårdh, S.
Journal of Biochemistry 129 巻 頁： 335-342 2001年
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Acid-labile ATP and/or ADP/Pi binding to the tetraprotoemeric form of Na/K-ATPase accompanying catalytic phosphorylation-dephosphorylation cycle.
Yokoyama, T., Kaya, S., Abe, K., Taniguchi, K., Katoh, T., Yazawa, M., Hayashi, Y. & Mårdh, S.
Journal of Biological Chemistry 274 巻 頁： 31792-31796 1999年
書籍等出版物 2
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Methods in Molecular Biology, P-type ATPases, 4 Isoration of H+,K+-ATPase-enriched membrane fraction from pig stomach
（ 担当： 共著）
Springer 2016年1月 （ ISBN:978-1-4939-3178-1 ）
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Methods in Molecular Biology, P-type ATPases, 39 Two-dimensional crystallization of gastric H+,K+-ATPase for structural analysis by electron crystallography
Abe K（ 担当： 単著）
Springer 2016年1月 （ ISBN:978-1-4939-3178-1 ）
講演・口頭発表等 79
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ナトリウムポンプのつくりかた 招待有り
阿部一啓
日本薬学会第143年会 2023年3月28日
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ナトリウムポンプのつくりかた 招待有り
阿部一啓
日本生体エネルギー研究会 第48回討論会 2022年12月14日
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プロトンポンプ胃酸抑制剤結合構造のクライオ電顕構造解析 招待有り
阿部一啓
第45回分子生物学会 2022年12月1日
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ナトリウムポンプのつくりかた
阿部一啓
第95回日本生化学会大会 2022年11月9日
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Crystal and cryo-EM structures of cation-transporting P-type ATPase 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
Frontier of Dynamic Structural Biology 2022年10月17日
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How to make a Na+ pump 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
The 60th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2022年9月28日
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Structural Physiology of the Gastric Proton pump and the Lipid Flippase 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
2022年9月15日
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Structural Physiology of the Gastric Proton pump and the Lipid Flippase 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
P-Type ATPases in Health and Disease 2022年9月8日
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胃酸抑制剤のターゲット・胃プロトンポンプの構造生物化学 招待有り
阿部一啓
創薬談話会2022 2022年6月30日
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胃プロトンポンプの分子構造が解き明かす胃強酸性化の分子メカニズムと胃酸抑制剤結合構造基盤 招待有り
阿部一啓
PPIの基礎と臨床（講演会） 2022年2月21日 武田薬品工業
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２つのK+を結合した胃プロトンポンプ変異体 招待有り
阿部一啓
日本生体エネルギー研究会第47回討論会 理研シンポジウム「輸送とエネルギー」 2021年12月17日
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Primary transporters that generate asymmetric distribution of cation and phospholipid 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
3rd Research Meeting on Cell Dynamics, iCeMS 2021年11月24日 ICeSM, Kyoto University
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膜輸送体の構造生理学 招待有り
阿部一啓
北海道大学生物化学特別講演 2021年11月12日
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Gastric proton pump with two occluded K+ engineered with sodium pump-mimetic mutations 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
The 94th Annual Meeting of the Japan Biochemical Society "Membrane transport proteins- listin to their quiet whisper while standing on the shoulders of the giants-" 2021年11月3日
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胃の酸性化の分子機構 招待有り
阿部一啓
第42回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム 2021年10月29日
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胃の酸性化のメカニズム 招待有り
阿部一啓
第69回SPring8先端利用ワークショップ 2021年9月21日
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細胞膜フリッパーゼATP11Cによる脂質輸送メカニズム
阿部一啓
生理研研究会 構造情報を基盤とした膜機能分子の整理機能理解へ向けて 2021年9月7日
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『細胞死を司るポンプ』脂質フリッパーゼATP11Cの結晶構造とCryo-EM構造
阿部一啓
日本生体エネルギー研究会第46回討論会
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細胞膜フリッパーゼATP11Cの構造機能解析
阿部一啓
第93回日生化学会
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胃プロトンポンプの結晶構造 –胃酸抑制剤の結合、H+排出およびK+対向 輸送に関する分子基盤
阿部一啓
日本薬学会
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胃プロトンポンプのプロトン排出機構に関する構造基盤 招待有り
阿部一啓
第97回日本生理学会大会
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Molecular mechanisms for the drug binding, H+-extrusion and the K+ counter-transport 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
Academia Sinica IBC seminar
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Crystal structure of the gastric proton pump 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
World Laureates Forum 2nd conference
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X線結晶学とクライオ電顕で得られた構造情報の上手な活用法 ～胃プロトンポンプの構造解析を例として～ 招待有り 国際会議
阿部一啓
2019年度生理研研究会
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胃プロトンポンプの輸送機構に対する構造基盤 招待有り 国際会議
阿部一啓
生物物理第57回年会 台湾‐日本 二国間シンポジウム：X線結晶構造解析とクライオ電顕2019
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Structural basis for the H+-extrusion and the K+-occlusion of the gastric proton pump 招待有り 国際会議
Abe K
Society of General Physiology /SOBLA 2019
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Crystal structure of the gastric proton pump 国際会議
Kazuhiro Abe, Kenta Yamamoto, Katsumasa Irie, Hanayo Nakanishi, Yoshinori Fujiyoshi
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胃の強酸性化の分子メカニズム ‐胃プロトンポンプの結晶構造解析 招待有り
阿部一啓
日本生体エネルギー研究会 第４４回討論会
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Crystal structures of the gastric proton pump 招待有り 国際会議
Kazuhiro Abe
AsCA2018
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1. 胃プロトンポンプの結晶構造によって明らかになったH+排出機構 招待有り
阿部一啓
大阪大学蛋白質研究所セミナー 構造生物学と計算科学の融合による動的構造生物学の新しい展開
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胃プロトンポンプの結晶構造 国際会議
阿部一啓
第９１回日本生化学会大会 シンポジウム 生化学から広がる膜輸送体研究の深化,
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3. 胃の強酸性化の秘密 招待有り
阿部一啓
創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 平成30年度BINDS公開 シンポジウム「知って、使って、進む あなたの研究」
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4. 胃プロトンポンプの構造生理学～胃酸に対してプロトンを押し出すメカニズム～ 招待有り
阿部一啓
大阪大学蛋白質研究所セミナー 構造情報に基づいた膜イオン輸送タ ンパク質の生理機能の解明に向けて
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Structural basis for the H+ extrusion and the transport stoichiometry of the gastric proton pump 招待有り
Kazuhiro Abe
Frontiers in P-type ATPase Research 2018, Institute for Quantitative Bioscience
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Crystal structure of the gastric proton pump at 2.8A resolution
Kazuhiro Abe
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Structural and functional analysis of gastric proton pump and acid suppressants
Kazuhiro Abe
ConBio2017
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Structural and functional analysis of gastric H+,K+-ATPase 招待有り 国際会議
The 15th international conference on Na,K-ATPase and related transport ATPases
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胃プロトンポンプの構造生理学 招待有り
阿部一啓
日本物理学会 第72回年次大会
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Binding model of the acid suppressant to the gastric proton pump 招待有り
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日本生化学会 招待有り
阿部一啓
第89回日本生化学会大会
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電子線結晶学と機能解析に基づいた胃プロトンポンプの構造生理学 招待有り
阿部一啓
大阪大学蛋白質研究所セミナー 『膜タンパク質の構造ダイナミクス』 Structural dynamics of membrane proteins
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胃プロトンポンプの構造生理学 招待有り
阿部一啓
千里ライフサイエンスセミナーＫ２ トランスポーターと創薬～構造と病態からのアプローチ～
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Electron crystallographic analysis of gastric proton pump
Kazuhiro Abe
IPR Seminar "Introduction and overview of cryo-electron microscopy"
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胃H+,K+-ATPaseの 胃酸抑制剤結合状態についての考察
阿部一啓
日本生体エネルギー研究会 第４１回 討論会
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Mutational analysis of acid surppressant binding site of gastric proton pump based on its structural model
Kazuhiro ABE, Kazutoshi Tani, Mao Naito, Jun Shimokawa, Yoshinori Fujiyoshi
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Antagonist-bound structure of gastric proton pump
Abe K
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Structural physiology of gastric proton pump 国際会議
Denmark-Japan Joint Workshop on Ion Transport Proteins
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Electron crystallographic and mutational analysis of acid suppressant-bound gastric proton pump
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Systematic comparison of the molecular conformation of gastric H+,K+-ATPase in E2P state analogs
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胃プロトンポンプH+,K+-ATPaseの構造生理学
阿部一啓
第3回 九州地区 生理薬理系研究会
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Electron crystallographic analysis of gastric proton pump
Abe, K.
JEM Next-Generation Microscopic Science
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Systematic comparison of the molecular conformation of gastric H+,K+-ATPase in E2P state analogs
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Structural and biochemical analysis of gastric H+,K+-ATPase in E2P-analogue conformations 国際会議
Abe, K.
ASBMB Special symposia, Na,K-ATPase and related transport ATPases: Structure, Mechanism, Cell Biology, Health and Disease
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胃プロトンポンプの構造生理学 国際会議
阿部一啓
第9回トランスポーター研究会
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胃プロトンポンプの阻害剤結合構造から見えてきたE2P遷移状態における構造変化
阿部一啓
日本生体エネルギー研究会第39回討論会
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胃プロトンポンプの極低温電子顕微鏡による構造解析
阿部一啓
第４回神経科学と構造生物学の融合研究会
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電子顕微鏡のイメージから膜タンパク質の立体構造を再構成する～胃プロトンポンプの例を中心として～
阿部一啓
分析化学会中部支部愛知地区講演会
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Biochemical and electron crystallographic studies of gastric proton pump
Kazuhiro Abe
The 86th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society
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胃プロトンポンプの生化学と電子線結晶構造解析
阿部一啓
第86回日本生化学会 奨励賞受賞講演
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Cryo-EM structures of gastric proton pump 国際会議
Abe K
FAOBMB mini-symposium
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Unique properties and conserved conformational changes found in gastric H+,K+-ATPase 国際会議
Abe K, Tani K and Fujiyoshi Y
Nagoya Symposium
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電子線結晶学による胃プロトンポンプの立体構造解析 国際会議
阿部一啓
生体エネルギー研究会第38回討論会
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胃H+,K+-ATPaseの逆反応防止機構とその解除-- (K+)E2~P構造を中心として
阿部一啓
生体エネルギー研究会 第37回討論会
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Unique structures and conserved conformational changes found in gastric H+,K+-ATPase 国際会議
Kazuhiro Abe
2011 ASBMB sepcial symposia, Na/K-ATPase and related P-ATPases
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電子線結晶学によって明らかになった胃H+,K+-ATPaseのユニークな構造とP型ATPaseファミリー間で保存された構造変化
阿部一啓
第84回日本生化学会大会
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Conformational rearrangement of gastric H+,K+-ATPase induced by an acid suppressant 国際会議
Kazuhiro Abe
Direct imaging in Bio/Medical science
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Three-dimensional structure of gastric H+,K+-ATPase with unti-ulcer drug 国際会議
Kazuhiro Abe
FASEB SRC, transport ATPase
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電子線結晶学により明らかになった胃プロトンポンプの逆反応防止機構
阿部一啓
生体エネルギー研究会 第35回討論会
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胃プロトンポンプのサブユニット間相互作用による逆反応防止機構
阿部一啓
第82回日本生化学会大会
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極低温電子顕微鏡によって明かされた胃H+,K+-ATPaseの逆反応防止機構
阿部一啓、谷一寿、西澤知宏、藤吉好則
日本薬学会年会 第129年会
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A Novel Ratchet Mechanism of Gastric H+,K+-ATPase Revealed by Electron Crystallography of Two-Dimensional Crystals
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Three-dimensional structure of gastric H/K-ATPase at 6.5 Å resolution determined by electron crystallography of two-dimensional crystals 国際会議
Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Tomohiro Nishizawa, Yoshinori Fujiyoshi
17th Meeting of Methods in Protein Structure Analysis (MPSA2008)
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Structure of gastric H+,K+-ATPase at 8-Å resolution 国際会議
Kazuhiro Abe
12th International PATPase conference, Na,K-ATPase and Related Transport ATPases
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Structural Analysis of 2D crystals of Gastric H+, K+-ATPase in different states of the transport cycle
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Two-dimensional crystallization of pig gastric H/K-ATPase 国際会議
Kazuhiro Abe, Tomohiro Nishizawa, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi
The 16th International Microscopy Congress
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Two-dimensional Crystallografic Study of Pig Gastric H/K-ATPase 国際会議
Kazuhiro Abe, Tomohiro Nishizawa, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi
IUBMB Cation pump meeting
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K+-induced change in oligomeric assembly of C12E8-solubilized pig gastric H/K-ATPase observed by single-molecule detection technique. 国際会議
Kazuhiro Abe, Shunji Kaya, Kazuyashu Sakaguchi, Toshiaki Imagawa, Yutaro Hayashi, Kazuya Taniguchi
Na,K-ATPase & Related Cation Pumps
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Investigation of tetraprotomeric structure of pig gastric H/K-ATPase based on single-molecule detection techniques 国際会議
Abe K, Kaya S, Kikumoto M, Oiwa K, Katoh T, Yazawa M and Taniguchi K
FASEB Summer Research Conference, Transport ATPases: Genomics to Mechanism and Releavnce to Diseases
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K+ induced simultaneous liberation of two moles of Pi one from mole of EP and the other from EATP of oligomeric H/K-ATPase from pig stomach 国際会議
Kazuhiro Abe, Shunji Kaya, Toshiaki Imagawa, Kazuya Taniguchi
10th International Conference on Na/K-ATPase and Related Cation Pumps
共同研究・競争的資金等の研究課題 11
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高次構造体連関が制御する脂質スクランブルシステム
2022年10月 - 2028年3月
CREST
阿部一啓
担当区分：研究分担者 資金種別：競争的資金
配分額：96000000円
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胃酸分泌の分子メカニズム解明と新規薬剤開発の為の構造基盤
2018年11月 - 2021年3月
武田科学振興財団 生命科学研究助成
阿部一啓
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
配分額：10000000円
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細胞膜におけるリン脂質の非対称分布とその崩壊
2014年10月 - 2020年3月
CREST
阿部一啓
担当区分：研究分担者 資金種別：競争的資金
配分額：51000000円
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構造・情報科学を駆使した新たな胃酸抑制剤の創生
2023年1月 - 2023年12月
第40回研究助成
阿部一啓
配分額：2000000円
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カチオン能動輸送体の構造機能解析と機能獲得変異体による基質特異性の解明
2021年4月 - 2022年3月
第35回ノバルティス研究奨励金
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
配分額：1000000円
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『細胞死を司るポンプ』脂質フリッパーゼのリン脂質認識と輸送機構
2021年3月 - 2022年3月
公益財団法人 小野医学研究財団 2020年度 小野医学研究助成
阿部一啓
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
配分額：2000000円
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細胞膜を隔てた物質非対称分布を作り出す能動輸送体の作動機構の解明
2020年12月 - 2022年3月
大幸財団 自然科学系学術研究助成
阿部一啓
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
配分額：4000000円
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胃プロトンポンプを初めとしたヒト能動輸送体の構造機能解析と創薬への展開
2019年12月 - 2021年9月
内藤記念科学奨励金・研究助成
阿部一啓
資金種別：競争的資金
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物質不均衡を司る能動輸送体の構造解析と創薬
2019年12月 - 2021年4月
上原記念生命科学財団 研究助成金
阿部一啓
資金種別：競争的資金
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クライオ電子顕微鏡のフィードバックに基づく膜タンパク質複合体の生産と技術支援
2017年4月 - 2022年3月
創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業
阿部一啓
担当区分：研究分担者 資金種別：競争的資金
配分額：275000000円
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多様な顕微鏡技術による膜タンパク質複合体の多階層での機能構造研究
2012年10月 - 2017年3月
創薬等支援技術基盤プラットフォーム補助金
資金種別：競争的資金
科研費 8
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物質不均衡分布を司る能動輸送体P型ATPaseの構造機能生理学
研究課題/研究課題番号：21H02426 2021年4月 - 2024年3月
科学研究費助成事業 基盤研究(B)
阿部 一啓
担当区分：研究代表者
配分額：17550000円 （ 直接経費：13500000円 、 間接経費：4050000円 ）
生命の根幹とも言える細胞膜を隔てた物質不均衡分布は、主としてカチオンの能動輸送体（イオンポンプ）として知られるP型ATPaseファミリーによって作り出される。この中で、
・100万倍のH+濃度勾配を作り出す胃プロトンポンプ
・アポトーシスに関与するリン脂質フリッパーゼATP11C
これら2つのユニークなポンプの作動機構解明を目指す。 -
胃プロトンポンプの構造生理学研究
2017年4月 - 2021年3月
科学研究費補助金 基盤研究(B)
担当区分：研究代表者
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研究課題/研究課題番号：17H03653 2017年4月 - 2021年3月
科学研究費助成事業 基盤研究(B)
阿部 一啓
担当区分：研究代表者
配分額：17030000円 （ 直接経費：13100000円 、 間接経費：3930000円 ）
胃プロトンポンプの高分解能構造を決定し、なぜ我々の胃の中が強い酸性になっているのかが分子レベルで理解できた(Abe et al., 2018, Nature）。K+結合構造も解析し、輸送するイオンの個数を明確に決定、限られたエネルギーによって胃に強酸を輸送する仕組みを明らかにした(Yamamoto et al., 2019, eLife)。
我々はまた、アポトーシスに関わる脂質フリッパーゼの構造解析に成功し(Nakanishi et al., 2020, JBC; Nakanishi et al., 2020, Cell Rep)、その分子メカニズムを明らかにした。
少なくともヒトの組織において最大のイオン濃度勾配を作り出すことのできる胃プロトンポンプの最も重要なメカニズム『どのようにしてpH1もの強酸（胃酸）に対してH+を輸送することができるのかが明らかになった。
不快な胸焼けを伴う胃炎は、胃の中が強い酸性の為に引き起こされる。胃プロトンポンプの高分解能構造は、現在臨床利用される胃酸抑制剤の改良や、新たな作用機序をもった薬剤の論理的設計に資する。
脂質フリッパーゼの構造解析によって、イオンポンプと近縁のタンパク質でありながら、どのようにイオンと比して巨大な基質（リン脂質）を輸送できるのか、その分子メカニズムを明らかにした。 -
チャネルを中心とした構造生理学的研究
研究課題/研究課題番号：15H05775 2015年5月 - 2020年3月
藤吉 好則
担当区分：研究分担者
チャネルを中心とする膜タンパク質の構造生理学研究を総合的に進めた結果、ギャップ結合チャネルのgating機構のモデルを提案し、プロトンを透過させない水チャネルAQP4は脳浮腫などと関わるのでその阻害剤開発のための構造解析を行い、イオン透過を制御する電位感受性Na+チャネルの構造機能研究と共にバクテリア由来のCa2+チャネルを初めて発見し、プロトンポンプの高分解能の構造解析に成功し、タイト結合チャネルの構造モデルを提案した。なお、アセチルコリン受容体では十分な成果が得られなかったが、エンドセリン受容体の構造解析結果を得ることができた。
構造研究が困難とされてきた膜タンパク質の構造を高い分解能で解析するための技術開発を進め、チャネルを中心とする構造を実際に解析して、構造生理学的に詳細に理解することができるようにした。2報のNature誌の論文をはじめ着実な論文発表を行った。特に、急激に発展しつつあり、創薬の分野でも注目を集めつつあるクライオ電子顕微鏡を用いた構造研究分野で、装置開発や関連技術開発などの貢献をした。 -
最大級のイオン濃度勾配を形成する胃プロトンポンプ作動機構の解明
2014年4月 - 2018年3月
科学研究費補助金 若手研究(A)
担当区分：研究代表者
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電子線結晶学と酵素化学的研究に基づいた胃プロトンポンプのユニークな作動機構の解明
2012年4月 - 2014年3月
科学研究費補助金
担当区分：研究代表者
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４量体Ｈ／Ｋ－ＡＴＰaseの構造機能連関～４量体構造の生理的意義の解明～ (1701307)
2006年4月 - 2009年3月
科学研究費補助金
阿部 一啓
担当区分：研究代表者
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P型‐ATPaseの多量体構造と機能の相関 (1509844)
2004年4月 - 2006年3月
科学研究費補助金
阿部 一啓
担当区分：研究代表者
担当経験のある科目 (本学) 37
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基礎生化学Ⅲ
2020
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創薬分子構造学実験
2020
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創薬探索科学
2020
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先端構造科学
2020
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多分野融合実践演習
2020
-
先端構造科学
2018
-
多分野融合実践演習
2018
-
多分野融合実践実習
2018
-
創薬分子構造学実験
2018
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創薬分子構造学セミナー1Ｂ
2018
-
創薬探索科学
2018
-
創薬分子構造学セミナー1Ａ
2018
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創薬分子構造学セミナー1Ｂ
2017
-
創薬分子構造学セミナー1Ａ
2017
-
多分野融合実践演習
2017
-
多分野融合実践実習
2017
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創薬分子構造学実験
2017
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創薬分子構造学セミナー1Ａ
2016
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多分野融合実践演習
2016
-
多分野融合実践実習
2016
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創薬分子構造学実験
2016
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創薬分子構造学セミナー1Ｂ
2016
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創薬分子構造学セミナー1Ａ
2015
-
多分野融合実践演習
2015
-
多分野融合実践実習
2015
-
創薬分子構造学実験
2015
-
創薬分子構造学セミナー1Ｂ
2015
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創薬分子構造学セミナー1Ａ
2014
-
創薬分子構造学セミナー1Ｂ
2014
-
創薬分子構造学実験
2014
-
多分野癒合実践実習
2014
-
多分野融合実践演習
2014
-
創薬分子構造学実験
2013
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創薬分子構造学セミナー1Ｂ
2013
-
創薬分子構造学セミナー1Ａ
2013
-
多分野癒合実践実習
2013
-
多分野融合実践演習
2013
担当経験のある科目 (本学以外) 5
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分子細胞生物学
2022年1月 （愛媛大学）
科目区分：学部専門科目
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化学特別講義（生物化学特別講義）
2021年11月 （北海道大学）
科目区分：大学院専門科目
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生命システム科学特別講義
2021年9月 （県立広島大学）
科目区分：学部専門科目
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分子細胞生物学
2021年1月 （愛媛大学）
科目区分：学部専門科目
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基盤物理化学特論
2020年6月 （京都大学）
科目区分：大学院専門科目
メディア報道 25
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AI創薬を活用した胃酸抑制剤の共同研究を開始 新聞・雑誌
科学新聞 2023年3月
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New study explains mechanisms of salt transport and could help treat cystic fibrosis インターネットメディア
EurekAlert! https://www.eurekalert.org/news-releases/965387 2022年9月
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New study explains mechanisms of salt transport and could help treat cystic fibrosis インターネットメディア
PHYS.ORG https://phys.org/news/2022-09-mechanisms-salt-cystic-fibrosis.html 2022年9月
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New study explains mechanisms of salt transport and could help treat cystic fibrosis インターネットメディア
Bioengineer.org https://bioengineer.org/new-study-explains-mechanisms-of-salt-transport-and-could-help-treat-cystic-fibrosis/ 2022年9月
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Research explains mechanisms of salt transport and could help treat cystic fibrosis インターネットメディア
MIRAGE https://www.miragenews.com/research-explains-mechanisms-of-salt-transport-859128/ 2022年9月
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New study explains mechanisms of salt transport and could help treat cystic fibrosis インターネットメディア
SCIENMAG https://scienmag.com/new-study-explains-mechanisms-of-salt-transport-and-could-help-treat-cystic-fibrosis/ 2022年9月
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ナトリウムポンプのつくりかた インターネットメディア
日本の研究.com 2022年9月
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Binding structure analysis of gastric acid inhibitors ー Action of existing drugs revealed at the molecular level インターネットメディア
2022年7月
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胃酸抑制剤の結合構造解析 既存薬の作用 分子レベルで判明 名古屋大など成果 新聞・雑誌
科学新聞 2022年6月
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胃酸抑制剤の結合構造を解析 ～胃酸抑制剤の論理的なドラッグデザインに道～ インターネットメディア
日本の研究.com 2022年5月
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Unique underpinnings revealed for stomach’s acid pump インターネットメディア
MIRAGE https://www.miragenews.com/unique-underpinnings-revealed-for-stomachs-acid-652064/ 2021年10月
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Researchers improve understanding of molecular mechanisms underlying stomach’s acid pump インターネットメディア
AZO life science https://www.azolifesciences.com/news/20211015/Researchers-improve-understanding-of-molecular-mechanisms-underlying-stomache28099s-acid-pump.aspx 2021年10月
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Study reveals unique molecular mechanisms of stomach’s acid pump インターネットメディア
News medical life science https://www.news-medical.net/news/20211015/Study-reveals-unique-molecular-mechanisms-stomache28099s-acid-pump.aspx 2021年10月
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Unique underpinnings revealed for stomach’s acid pump インターネットメディア
SCIENMAG https://scienmag.com/unique-underpinnings-revealed-for-stomachs-acid-pump/ 2021年10月
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Unique underpinnings revealed for stomach’s acid pump New understandings of a stomach enzyme could lead to better anti-ulcer drugs. インターネットメディア
ScienceDaily https://www.sciencedaily.com/releases/2021/10/211014100121.htm 2021年10月
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Unique underpinnings revealed for stomach's acid pump インターネットメディア
Newsbreak https://www.newsbreak.com/news/2402816116871-unique-underpinnings-revealed-for-stomach-s-acid-pump 2021年10月
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Unique underpinnings revealed for stomach's acid pump インターネットメディア
PHYS.ORG https://phys.org/news/2021-10-unique-underpinnings-revealed-stomach-acid.html 2021年10月
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胃酸を分泌するタンパク質を改造！？ ～輸送するイオンの数を人工的に変えることに成功～ インターネットメディア
日本の研究.com 2021年9月
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細胞死をつかさどる脂質輸送体の作動メカニズム 新聞・雑誌
科学新聞 2020年10月
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Eat Me!! 細胞死を司る脂質輸送体の作動メカニズムが電子顕微鏡による構造解析で明らかに！ インターネットメディア
日本の研究.com 2020年10月
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一度に幾つの荷物を運べる？？ ～胃酸分泌を担う胃プロトンポンプが輸送するイオンの個数を構造解析によって決定～ インターネットメディア
日本の研究.com 2019年9月
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胃プロトンポンプの構造解明 テレビ・ラジオ番組
NHK 2018年4月
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世界初！胃酸分泌を担う胃プロトンポンプの構造を解明―胃酸抑制剤結合構造と強酸に対してプロトンを吐き出す仕組み― インターネットメディア
日本の研究.com https://research-er.jp/articles/view/69534 2018年4月
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胃酸分泌 タンパク質解明 新聞・雑誌
中日新聞 2018年4月
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強い酸性の胃液 仕組み解明 新聞・雑誌
朝日新聞 朝日新聞 2018年4月