講演・口頭発表等 - 小池 亮太郎
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巨大複合体の構造分類を目指して
小池亮太郎
第24回日本蛋白質科学会年会 2024年6月11日
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Cas9C末端領域の網羅的構造比較
榎本廉,佐久間航也,太田元規,小池亮太郎
第24回日本蛋白質科学会年会 2024年6月11日
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液-液相分離を起こす低複雑性領域の配列パターン
鎮目雄大,太田元規,小池亮太郎
第24回日本蛋白質科学会年会 2024年6月12日
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たんぱく質間相互作用ネットワークを利用したかゆみ伝達経路の網羅的探索
鶴見康太,小池亮太郎,太田元規
第24回日本蛋白質科学会年会 2024年6月11日
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不凍タンパク質様-βヘリックス構造の網羅的AlphaFoldDB探索
小中祐輝,佐久間航也,小池亮太郎,太田元規
第24回日本蛋白質科学会年会 2024年6月11日
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構造比較による殺虫性タンパク質の探索
橋本龍典,太田元規,小池亮太郎
第24回日本蛋白質科学会年会 2024年6月13日
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Elastic network model reveals distinct flexibilities of capping proteins bound to CARMIL and twinfilin-tail
Ryotaro Koike, Motonori Ota
2023年11月14日
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ATPアーゼの活性部位における水分子の配置
小池亮太郎
第23回日本蛋白質科学会年会 2023年7月6日
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天然変性タンパク質データベース:IDEAL
安保 勲人, 佐久間 航也, 嘉戸 裕美子, 坂本 盛宇, 細田 和男, 鹿間 周子, 大安 裕美, 高木 大輔, 山口 敦子, 畠中 秀樹, 小池 亮太郎, 廣明 秀一, 福地 佐斗志, 太田 元規
トーゴーの日シンポジウム2022 2022年10月5日
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Structural changes of ATPase complexes in the PDB
Ryotaro Koike
2022年9月29日
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Structural flexibility of actin in molecular dynamics simulation 国際会議
Ryotaro Koike, Motonori Ota
2021年12月18日
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Protein kinases phosphorylate long intrinsically disordered regions of substrate proteins 国際会議
Motonori Ota, Mutsuki Amano, Kozo Kaibuchi, Ryotaro Koike
2021年12月18日
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生体発動分子ATPアーゼの構造変化と機能発現メカニズムの網羅的解析
小池亮太郎
第2回発動分子科学研究会 2021年12月1日
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Elastic network model analysis shows distinct flexibilities of capping protein bound to CARMIL or twinfilin
Ryotaro Koike, Motonori Ota
2021年11月25日
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Relationship between Length of Intrinsically Disordered Regions and Protein Function
Haruka Tanimoto, Ryotaro Koike, Motonori Ota
2021年11月25日
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Directed Protein-Protein Interaction Network Representing Intracellular Signaling Pathways
Wenruo Cao, Ryotaro Koike, Motonori Ota
2021年11月27日
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Structural characterization of homologous hetero-oligomers
Kota Ito, Clara Shionyu, Yasunobu Sugimoto, Ryotaro Koike, Motonori Ota
2021年11月25日
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天然変性タンパク質データベース:IDEAL(@2021)
太田 元規, 嘉戸 裕美子, 坂本 盛宇, 細田 和男, 鹿間 周子, 大安 裕美, 高木 大輔, 安保 勲人, 山口 敦子, 畠中 秀樹, 小池 亮太郎, 廣明 秀一, 福地 佐斗志
トーゴーの日シンポジウム2021 2021年10月5日
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異なる機能状態にあるアクチンの構造ゆらぎとその相関関係
小池亮太郎,森次圭,太田元規
第21回日本蛋白質科学会年会 2021年6月17日
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Structural flexibility of actin studied by molecular dynamics simulation
Ryotaro Koike, Motonori Ota
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Phosphorylation on an intrinsically disordered region regulates the DNA binding activity of a transcription factor via transient interactions
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Full-atom Motion Tree detects side-chain motions and their coupling with domain motions
Ryotaro Koike, Motonori Ota
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全原子Motion Treeとドメイン運動に伴う側鎖の運動
小池亮太郎,太田元規
第19回日本蛋白質科学会年会
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Description of structural changes by Motion Tree 国際会議
Ryotaro Koike
63rd Annual Meeting of the Biophysical Society
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リン酸化部位を含む天然変性領域
小池亮太郎,天野睦紀,貝淵弘三,太田元規
第18回日本蛋白質科学会
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Structural changes of homodimers in the PDB
Ryotaro Koike
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ATPase mechanism and dynamic assembly of actin revealed by the F-form crystal structures
Ryotaro Koike
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蛋白質複合体の相互作用面の運動
小池亮太郎
第17回日本蛋白質科学会
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Description of protein structural changes by full-atom Motion Tree
Ryotaro Koike
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Interface property of protean segments: intrinsically disordered regions that undergo disorder-to-order transitions upon binding
Divya Shaji, Takayuki Amemiya, Ryotaro Koike, Motonori Ota
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ホモ二量体における構造変化の網羅的解析から見えた蛋白質複合体に特有な運動
小池亮太郎、雨宮崇之、堀井達哉、太田元規
第16回日本蛋白質科学会
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Database analysis of structural changes in protein complexes
Ryotaro Koike, Motonori Ota
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Structural and functional characterization of structural changes in homodimeric proteins
Takayuki Amemiya, Tatsuya Horii, Ryotaro Koike, Motonori Ota
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Motion Tree delineates hierarchical structure of protein dynamics observed in molecular dynamics simulation
Kei Moritsugu, Ryotaro Koike, Akinori Kidera
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Motion tree analysis of the multidrug transporter AcrB
Tsutomu Yamane, Ryotaro Koike, Motonori Ota, Satoshi Murakami, Akinori Kidera, Mitsunori Ikeguchi
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動的構造に着目したCARMIL蛋白質によるキャップ蛋白質の機能阻害メカニズムの解明
小池亮太郎、武田修一、前田雄一郎、太田元規
第15回日本蛋白質科学会
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蛋白質複合体構造の大規模比較から見る構造多様性
小池亮太郎、太田元規
第14回日本蛋白質科学会
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データベースIDEALの新機能と機能性天然変性領域の配列・構造比較
福地佐斗志、雨宮崇之、坂本盛宇、野邉由紀子、細田和男、嘉戸裕美子、小池亮太郎、廣明秀一、太田元規
第14回日本蛋白質科学会
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ホモ二量体タンパク質の低分子リガンド結合に伴う立体構造変化の分類
雨宮崇之、堀井達哉、小池亮太郎、太田元規
第14回日本蛋白質科学会
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Hierarchical description and extensive classification of protein structural changes by Motion Tree.
Ryotaro Koike, Motonori Ota, Akinori Kidera
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Motion Tree を利用した capping protein の動的構造解析
第51回日本生物物理学会
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天然変性タンパク質データベース IDEAL の機能拡張 —PPI ネットワーク
第51回日本生物物理学会
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多剤排出トランスポーター AcrB の Motion Tree 法による解析
第51回日本生物物理学会
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CARMIL蛋白質の天然変性領域によるアロステリックなキャップ蛋白質の機能制御
小池亮太郎、武田修一、前田雄一郎、太田元規
第13回日本蛋白質科学会
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Motion Tree 法を用いた SERCA のリガンド解離における構造変化の解析
小林千草,小池亮太郎,太田元規,杉田有治
第13回日本蛋白質科学会
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Structural fluctuations of capping proteins analyzed by molecular dynamics simulations.
Ryotaro Koike, Shuichi Takeda, Maéda Yuichiro, Motonori Ota
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分子動力学法によるcapping protein(CP)の動的構造の解析
小池亮太郎、武田修一、前田雄一郎、太田元規
第12回日本蛋白質科学会