論文 - 本多　裕之

In Silico Screening of a Bile Acid Micelle Disruption Peptide for Oral Consumptions from Edible Peptide Database 査読有り

Kento Imai, Yuri Takeuchi, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda

Foods   10 巻   頁： 2496   2021年10月

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担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.3390/foods10102496

Identification of barley-derived peptides with angiotensin converting enzyme inhibitory activity

Endo, K; Akiyama, H; Kano, K; Mishiro-Sato, E; Karashima, T; Kajiwara, Y; Takashita, H; Shimizu, K; Honda, H

INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD ENGINEERING   21 巻 ( 2 ) 頁： 87 - 95   2025年3月

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DOI： 10.1515/ijfe-2024-0255

Web of Science

Quercetin induces a slow myofiber phenotype in engineered human skeletal muscle tissues

Nagai, A; Kaneda, Y; Izumo, T; Nakao, Y; Honda, H; Shimizu, K

FASEB JOURNAL   38 巻 ( 16 ) 頁： e70009   2024年8月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1096/fj.202400914RR

Web of Science

PubMed

Discovery of fibroblast growth factor 2-derived peptides for enhancing mice skeletal muscle satellite cell proliferation

Fujii, I; Kinoshita, R; Akiyama, H; Nakamura, A; Iwamori, K; Fukada, S; Honda, H; Shimizu, K

BIOTECHNOLOGY JOURNAL   19 巻 ( 8 ) 頁： e2400278   2024年8月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1002/biot.202400278

Web of Science

PubMed

Separation and enrichment of multiple bile acid micelle-disrupting peptides by adsorption/desorption process with heat-treated porous silica gels

Iriyama, M; Hagawa, H; Shimizu, S; Akiyama, H; Shimizu, K; Honda, H

BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL   205 巻   2024年5月

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DOI： 10.1016/j.bej.2024.109283

Web of Science

Electrical pulse stimulation-induced tetanic exercise simulation increases the secretion of extracellular vesicles from C2C12 myotubes

Murata, A; Akiyama, H; Honda, H; Shimizu, K

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   672 巻   頁： 177 - 184   2023年9月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1016/j.bbrc.2023.06.054

Web of Science

PubMed

l-Anserine Increases Muscle Differentiation and Muscle Contractility in Human Skeletal Muscle Cells

Nagai, A; Ida, M; Izumo, T; Nakai, M; Honda, H; Shimizu, K

JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY   71 巻 ( 23 ) 頁： 8952 - 8958   2023年5月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1021/acs.jafc.3c01685

Web of Science

PubMed

A Sulfur Containing Melanogenesis Substrate, <i>N</i>-Pr-4-<i>S</i>-CAP as a Potential Source for Selective Chemoimmunotherapy of Malignant Melanoma

Tamura, Y; Ito, A; Wakamatsu, K; Torigoe, T; Honda, H; Ito, S; Jimbow, K

INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES   24 巻 ( 6 )   2023年3月

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記述言語：英語  

DOI： 10.3390/ijms24065235

Web of Science

PubMed

Alignment of Skeletal Muscle Cells Facilitates Acetylcholine Receptor Clustering and Neuromuscular Junction Formation with Co-Cultured Human iPSC-Derived Motor Neurons

Shimizu, K; Kassai, H; Kamei, Y; Yamamoto, K; Nagashima, T; Maekawa, T; Akiyama, H; Honda, H

CELLS   11 巻 ( 23 )   2022年12月

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記述言語：英語  

DOI： 10.3390/cells11233760

Web of Science

PubMed

蛍光標識ペプチドアレイを用いたプロテアーゼ切断検出と機械学習を用いた切断部位予測 査読有り

水谷嶺太、森陽子、小川翔大、田添佳歩、秋山裕和、清水一憲、本多裕之

生物工学会誌   100 巻 ( 10 ) 頁： 528 - 540   2022年11月

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担当区分：責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.34565/seibutsukogaku.100.10_528

Molecular Events in the Melanogenesis Cascade as Novel Melanoma-Targeted Small Molecules: Principle and Development

Wakamatsu, K; Ito, A; Tamura, Y; Hida, T; Kamiya, T; Torigoe, T; Honda, H; Ito, S; Jimbow, K

CANCERS   14 巻 ( 22 )   2022年11月

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記述言語：英語  

DOI： 10.3390/cancers14225588

Web of Science

PubMed

Screening of anti-atrophic peptides by using photo-cleavable peptide array and 96-well scale contractile human skeletal muscle atrophy models

Yamamoto, K; Ohsumi, S; Nagashima, T; Akiyama, H; Honda, H; Shimizu, K

BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING   119 巻 ( 8 ) 頁： 2196 - 2205   2022年8月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1002/bit.28125

Web of Science

PubMed

Development of microfluidic chip for entrapping tobacco BY-2 cells 査読有り

Kazunori Shimizu, Yaichi Kawakatsu, Ken-ichi Kurotani, Masahiro Kikkawa,Ryo Tabata, Daisuke Kurihara, Hiroyuki Honda, Michitaka Notaguchi

PLOS ONE   17 巻 ( 4 ) 頁： e0266982   2022年4月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1371/journal.pone.0266982

Selective concentration of antimicrobial peptides to heat-treated porous silica gel using adsorption/desorption

Hagawa, H; Imai, K; Gao, ZW; Taniguchi, M; Shimizu, K; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   133 巻 ( 2 ) 頁： 161 - 167   2022年2月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2021.11.002

Web of Science

PubMed

「ペプチドアレイ」を基盤とする低抗原性生理活性ペプチドの製造に関する研究 査読有り

栗本昌樹、久保智里、越智浩、本多裕之、大河内美奈

生物工学会誌   100 巻 ( 2 ) 頁： 70 - 75   2022年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： DOI: 10.34565/seibutsukogaku.100.2_70

Immunomodulation of Melanoma by Chemo-Thermo-Immunotherapy Using Conjugates of Melanogenesis Substrate NPrCAP and Magnetite Nanoparticles: A Review 査読有り

Yasuaki Tamura, Akira Ito, Kazumasa Wakamatsu, Takafumi Kamiya, Toshihiko Torigoe, Hiroyuki Honda, Toshiharu Yamashita, Hisashi Uhara, Shosuke Ito and Kowichi Jimbow

International Journal of Molecular Sciences   23 巻 ( 12 ) 頁： 6457   2022年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Analysis of Plasmodesmata Permeability using Cultured Tobacco BY-2 Cells Entrapped in Microfluidic Chips 査読有り

Ken-ichi Kurotani, Yaichi Kawakatsu, Masahiro Kikkawa, Ryo Tabata, Daisuke Kurihara, Hiroyuki Honda, Kazunori Shimizu, Michitaka Notaguchi

Journal of Plant Research   135 巻   頁： 693 - 701   2022年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1007/s10265-022-01406-8

Molecular Events in the Melanogenesis Cascade as Novel Melanoma-Targeted Small Molecules: Principle and Development 査読有り

Kazumasa Wakamatsu, Akira Ito, Yasuaki Tamura, Tokimasa Hida, Takafumi Kamiya,Toshihiko Torigoe, Hiroyuki Honda, Shosuke Ito and Kowichi Jimbow

Cancers   14 巻   頁： 5588   2022年

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記述言語：英語  

DOI： doi: 10.3390/cancers14225588

Agonist/Antagonist Activity of Oxytocin Variants Obtained from Free Cyclic Peptide Libraries Generated via Amino Acid Substitution

Kinoshita, R; Kozaki, I; Shimizu, K; Shibata, T; Ochiai, A; Honda, H

ACS OMEGA   6 巻 ( 46 ) 頁： 31244 - 31252   2021年11月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1021/acsomega.1c04982

Web of Science

PubMed

In Silico Screening of a Bile Acid Micelle Disruption Peptide for Oral Consumptions from Edible Peptide Database

Imai, K; Takeuchi, Y; Shimizu, K; Honda, H

FOODS   10 巻 ( 10 )   2021年10月

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記述言語：英語  

DOI： 10.3390/foods10102496

Web of Science

PubMed

Simple stain-free screening method for pectinolytic microorganisms under alkalophilic conditions

Ishihara, M; Kikkawa, M; Shimizu, K; Suzuki, H; Honda, H

BIOTECHNOLOGY LETTERS   43 巻 ( 9 ) 頁： 1905 - 1911   2021年9月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1007/s10529-021-03162-6

Web of Science

PubMed

Machine learning screening of bile acid-binding peptides in a peptide database derived from food proteins

Imai, K; Shimizu, K; Honda, H

SCIENTIFIC REPORTS   11 巻 ( 1 ) 頁： 16123   2021年8月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1038/s41598-021-95461-1

Web of Science

PubMed

Effect of Magnetic Nanoparticle Internalization on Cell Density in Skeletal Muscle Tissue 査読有り

Yuji Kirihara, Hiromu Miyata, Zugui Peng, Kenta Shimba, Yoshitaka Miyamoto, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda, Tohru Yagi

IEEJ Transactions on Electronics, Information and Systems   141 巻 ( 7 ) 頁： 795 - 801   2021年7月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1541/ieejeiss.141.795

Development of a human neuromuscular tissue-on-a-chip model on a 24-well-plate-format compartmentalized microfluidic device

Yamamoto, K; Yamaoka, N; Imaizumi, Y; Nagashima, T; Furutani, T; Ito, T; Okada, Y; Honda, H; Shimizu, K

LAB ON A CHIP   21 巻 ( 10 ) 頁： 1897 - 1907   2021年5月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1039/d1lc00048a

Web of Science

PubMed

Screening of a novel free fatty acid receptor 1 (FFAR1) agonist peptide by phage display and machine learning based-amino acid substitution

Yoshioka, K; Yamashita, H; Shimizu, K; Shimomura, S; Shibata, T; Miyazaki, J; Honda, H

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   550 巻   頁： 177 - 183   2021年4月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1016/j.bbrc.2021.02.142

Web of Science

PubMed

Screening of a novel free fatty acid receptor 1 (FFAR1) agonist peptide by phage display and machine learning based-amino acid substitution 査読有り

Keitaro Yoshioka, Haruki Yamashita, Kazunori Shimizu, Sayako Shimomura, Takahiro Shibata, Jun-ichi Miyazaki, Hiroyuki Honda

Biochemical and Biophysical Research Communications   550 巻   頁： 177 - 183   2021年2月

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担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2021.02.142

分子構造相同性解析を用いた脂肪酸受容体活性化ペプチドの探索 査読有り

吉岡慶太郎、山下春来、藤谷将也、加藤竜司、清水一憲、本多裕之

化学工学論文集   47 巻 ( 3 ) 頁： 64-68   2021年2月

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担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1252/kakoronbunshu.47.64

Heterologous production of new lasso peptide koreensin based on genome mining

Fuwa, H; Hemmi, H; Kaweewan, I; Kozaki, I; Honda, H; Kodani, S

JOURNAL OF ANTIBIOTICS   74 巻 ( 1 ) 頁： 42 - 50   2021年1月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1038/s41429-020-00363-5

Web of Science

PubMed

Increasing the activity of cell adherent cyclic NGR peptides by optimizing the peptide length and amino acid character 査読有り

Kozaki, I; Suzuki, T; You, SC; Shimizu, K; Honda, H

JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE   27 巻 ( 1 ) 頁： e3287   2021年1月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/psc.3287

Web of Science

PubMed

Effect of Magnetic Nanoparticle Internalization on Cell Density in Skeletal Muscle Tissue 査読有り

Yuji Kirihara, Hiromu Miyata, Zugui Peng, Kenta Shimba, Yoshitaka Miyamoto, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda, Tohru Yagi

IEEJ Transactions on Electronics, Information and Systems   141 巻 ( 7 ) 頁： 795 - 801   2021年

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記述言語：英語  

DOI： https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2021.11.002

Screening of FFAR1-Activating Peptides by Molecular Structural Analysis

Yoshioka, K; Yamashita, H; Fujitani, M; Kato, R; Shimizu, K; Honda, H

KAGAKU KOGAKU RONBUNSHU   47 巻 ( 3 ) 頁： 64 - 68   2021年

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DOI： 10.1252/kakoronbunshu.47.64

Web of Science

Controlling distance, size and concentration of nanoconjugates for optimized LSPR based biosensors

Chowdhury, AD; Nasrin, F; Gangopadhyay, R; Ganganboina, AB; Takemura, K; Kozaki, I; Honda, H; Hara, T; Abe, F; Park, S; Suzuki, T; Park, EY

BIOSENSORS & BIOELECTRONICS   170 巻   頁： 112657   2020年12月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1016/j.bios.2020.112657

Web of Science

PubMed

Antidepressive effect of an inward rectifier K<SUP>+</SUP> channel blocker peptide, tertiapin-RQ

Okada, M; Kozaki, I; Honda, H

PLOS ONE   15 巻 ( 11 ) 頁： e0233815   2020年11月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1371/journal.pone.0233815

Web of Science

PubMed

Machine Learning-Based Amino Acid Substitution of Short Peptides: Acquisition of Peptides with Enhanced Inhibitory Activities against α-Amylase and α-Glucosidase

Yamashita, H; Fujitani, M; Shimizu, K; Kanie, K; Kato, R; Honda, H

ACS BIOMATERIALS SCIENCE & ENGINEERING   6 巻 ( 11 ) 頁： 6117 - 6125   2020年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/acsbiomaterials.0c01010

Web of Science

PubMed

Bile acid micelle disruption activity of short-chain peptides from tryptic hydrolyzate of edible proteins 査読有り

Ito, M; Shimizu, K; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   130 巻 ( 5 ) 頁： 514 - 519   2020年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2020.07.006

Web of Science

PubMed

In Vitro Model of Human Skeletal Muscle Tissues with Contractility Fabricated by Immortalized Human Myogenic Cells

Nagashima, T; Hadiwidjaja, S; Ohsumi, S; Murata, A; Hisada, T; Kato, R; Okada, Y; Honda, H; Shimizu, K

ADVANCED BIOSYSTEMS   4 巻 ( 11 ) 頁： e2000121   2020年11月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1002/adbi.202000121

Web of Science

PubMed

Effect of cell-extracellular matrix interaction on myogenic characteristics and artificial skeletal muscle tissue

Ding, R; Horie, M; Nagasaka, S; Ohsumi, S; Shimizu, K; Honda, H; Nagamori, E; Fujita, H; Kawamoto, T

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   130 巻 ( 1 ) 頁： 98 - 105   2020年7月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2020.02.008

Web of Science

PubMed

Fluorometric virus detection platform using quantum dots-gold nanocomposites optimizing the linker length variation

Nasrin, F; Chowdhury, AD; Takemura, K; Kozaki, I; Honda, H; Adegoke, O; Park, EY

ANALYTICA CHIMICA ACTA   1109 巻   頁： 148 - 157   2020年5月

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記述言語：英語  

DOI： 10.1016/j.aca.2020.02.039

Web of Science

PubMed

Fabrication of contractile skeletal muscle tissues using directly converted myoblasts from human fibroblasts

Shimizu, K; Ohsumi, S; Kishida, T; Mazda, O; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   129 巻 ( 5 ) 頁： 632 - 637   2020年5月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2019.11.013

Web of Science

PubMed

Disulfide linked hetero dimeric peptide arrays for screening functional peptides inside cells

Kozaki, I; Shimizu, K; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   129 巻 ( 5 ) 頁： 613 - 618   2020年5月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2019.11.012

Web of Science

PubMed

Effectiveness of Lifestyle Intervention Using the Internet of Things System for Individuals with Early Type 2 Diabetes Mellitus

Kato, S; Ando, M; Honda, H; Yoshida, Y; Imaizumi, T; Yamamoto, N; Maruyama, S

INTERNAL MEDICINE   59 巻 ( 1 ) 頁： 45 - 53   2020年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.2169/internalmedicine.3150-19

Web of Science

PubMed

Increasing the activity of cell adherent cyclic NGR peptides by optimizing the peptide length and amino acid character 査読有り

Ikko Kozaki, Takehiro Suzuki, You Sheng-Chao, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Hond

Journal of Peptide Science   27 巻 ( 1 ) 頁： e3287   2020年

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1002/psc.3287

Fluorometric virus detection platform using quantum dots-gold nanocomposites optimizing the linker length variation 査読有り

Fahmida Nasrin, Ankan Dutta Chowdhury, Kenshin Takemura, Ikko Kozaki, Hiroyuki Honda, Oluwasesan Adegoke, Enoch Y. Park

Analytica Chimica Acta   1109 巻   頁： 148-157   2020年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1016/j.aca.2020.02.039

Effect of cell-extracellular matrix interaction on myogenic characteristics and artificial skeletal muscle tissue 査読有り

Ran Ding, Masanobu Horie, Sumire Nagasaka, Saki Ohsumi, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda, Eiji Nagamori, Hideaki Fujita, Takuo Kawamoto

Journal of Bioscience and Bioengineering   130 巻 ( 1 ) 頁： 98-105   2020年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1016/j.jbiosc.2020.02.008

Bile acid micelle disruption activity of short-chain peptides from tryptic hydrolysate of edible proteins 査読有り

Masako Ito, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   130 巻 ( 5 ) 頁： 514-519   2020年

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1016/j.jbiosc.2020.07.006

Heterologous production of new lasso peptide koreensin based on genome mining 査読有り

Haruki Yamashita, Masaya Fujitani, Kazunori Shimizu, Kei Kanie, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

The Journal of Antibiotics     2020年

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1038/s41429-020-00363-5

Increasing the activity of cell adherent cyclic NGR peptides by optimizing the peptide length and amino acid character 査読有り

Ikko Kozaki, Takehiro Suzuki, You Sheng-Chao, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda

Journal of Peptide Science   27 巻 ( 1 ) 頁： e3287   2020年

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1002/psc.3287

Machine learning-based amino acid substitution of short peptides: Acquisition of peptides with enhanced inhibitory activities against α-amylase and α-glucosidase 査読有り

Haruki Yamashita, Masaya Fujitani, Kazunori Shimizu, Kei Kanie, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

ACS Biomaterials Science & Engineering     2020年

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1021/acsbiomaterials.0c01010

Controlling distance, size and concentration of nanoconjugates for optimized LSPR based biosensors 査読有り

Ankan Dutta Chowdhury, Fahmida Nasrin, Rupali Gangopadhyay, Akhilesh Babu Ganganboina, Kenshin Takemura, Ikko Kozaki, Hiroyuki Honda, Toshimi Hara, Fuyuki Abe, Tetsuro Suzuki, Enoch Y. Park

Biosensors and Bioelectronics   170 巻   頁： 112657   2020年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1016/j.bios.2020.112657

In Vitro Model of Human Skeletal Muscle Tissues with Contractility Fabricated by Immortalized Human Myogenic Cells 査読有り

Kazunori Shimizu, Takunori Nagashima, Stacy Hariwijawa, Saki Ohsumi, Akari Murata, Yohei Okada, Hiroyuki Honda

Advanced Biosystems     2020年

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1002/adbi.202000121

Antidepressive effect of an inward rectifier K+ channel blocker peptide, tertiapin-RQ 査読有り

Masayoshi Okada, Ikko Kozaki, Hiroyuki Honda

PLoS ONE   15 巻 ( 11 ) 頁： e023815   2020年

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担当区分：最終著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1371/journal.pone.0233815

Pep-MS assay: Protease hydrolysis assay system using photo-cleavable peptide array and mass spectrometer

Kurimoto, M; Shimizu, K; Ochi, H; Abe, F; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   128 巻 ( 2 ) 頁： 156 - 161   2019年8月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2019.02.005

Web of Science

PubMed

Predictive selection and evaluation of appropriate functional peptides for intestinal delivery with a porous silica gel

Imai, K; Shimizu, K; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   128 巻 ( 1 ) 頁： 44 - 49   2019年7月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2019.01.001

Web of Science

PubMed

Open-Chamber Co-Culture Microdevices for Single-Cell Analysis of Skeletal Muscle Myotubes and Motor Neurons with Neuromuscular Junctions

Yamaoka, N; Shimizu, K; Imaizumi, Y; Ito, T; Okada, Y; Honda, H

BIOCHIP JOURNAL   13 巻 ( 2 ) 頁： 127 - 132   2019年6月

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s13206-018-3202-3

Web of Science

Identification of an early cell fate regulator by detecting dynamics in transcriptional heterogeneity and co-regulation during astrocyte differentiation

Ando, T; Kato, R; Honda, H

NPJ SYSTEMS BIOLOGY AND APPLICATIONS   5 巻   頁： 18   2019年5月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/s41540-019-0095-2

Web of Science

PubMed

Searching for high-binding peptides to bile acid for inhibition of intestinal cholesterol absorption using principal component analysis

Ito, M; Shimizu, K; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   127 巻 ( 3 ) 頁： 366 - 371   2019年3月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2018.08.006

Web of Science

PubMed

Selective Elimination of Bitter Peptides by Adsorption to Heat-treated Porous Silica Gel

Imai, K; Ikeda, A; Shimizu, K; Honda, H

FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY RESEARCH   25 巻 ( 2 ) 頁： 179 - 186   2019年3月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.3136/fstr.25.179

Web of Science

In-process evaluation of culture errors using morphology-based image analysis

Imai, Y; Yoshida, K; Matsumoto, M; Okada, M; Kanie, K; Shimizu, K; Honda, H; Kato, R

REGENERATIVE THERAPY   9 巻   頁： 15 - 23   2018年12月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.reth.2018.06.001

Web of Science

PubMed

Genomic analysis of a <i>Streptomyces tsukubaensis</i> mutant with reduced FR900525 production isolated by selection for <i>S</i>-(2-aminoethyl) L-cysteine resistance

Shimizu, S; Futase, A; Yokoyama, T; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   126 巻 ( 5 ) 頁： 580 - 585   2018年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2018.05.009

Web of Science

PubMed

Selective Elimination of Human Induced Pluripotent Stem Cells Using Medium with High Concentration of L-Alanine

Nagashima, T; Shimizu, K; Matsumoto, R; Honda, H

SCIENTIFIC REPORTS   8 巻 ( 1 ) 頁： 12427   2018年8月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/s41598-018-30936-2

Web of Science

PubMed

Interaction between porous silica gel microcarriers and peptides for oral administration of functional peptides

Imai, K; Shimizu, K; Kamimura, M; Honda, H

SCIENTIFIC REPORTS   8 巻 ( 1 ) 頁： 10971   2018年7月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/s41598-018-29345-2

Web of Science

PubMed

Mutations responsible for alcohol tolerance in the mutant of <i>Synechococcus elongatus</i> PCC 7942 (SY1043) obtained by single-cell screening system

Hirokawa, Y; Kanesaki, Y; Arai, S; Saruta, F; Hayashihara, K; Murakami, A; Shimizu, K; Honda, H; Yoshikawa, H; Hanai, T

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   125 巻 ( 5 ) 頁： 572 - 577   2018年5月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2017.11.012

Web of Science

PubMed

Genomic analysis of a Streptomyces tsukubaensis mutant with reduced FR900525 production isolated by selection for S-(2-aminoethyl) L-cysteine resistance, 査読有り

Shiho Shimizu, Futase Ayako, Tatsuya Yokoyama, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   126 巻 ( 5 ) 頁： 580-585   2018年5月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： org/10.1016/j.jbiosc.2018.05.009

Lifestyle intervention using Internet of Things (IoT) for the elderly: A study protocol for a randomized control trial (the BEST-LIFE study)

Kato, S; Ando, M; Kondo, T; Yoshida, Y; Honda, H; Maruyama, S

NAGOYA JOURNAL OF MEDICAL SCIENCE   80 巻 ( 2 ) 頁： 175 - 182   2018年5月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.18999/nagjms.80.2.175

Web of Science

PubMed

Effect of dietary energy and polymorphisms in BRAP and GHRL on obesity and metabolic traits.

Imaizumi T, Ando M, Nakatochi M, Yasuda Y, Honda H, Kuwatsuka Y, Kato S, Kondo T, Iwata M, Nakashima T, Yasui H, Takamatsu H, Okajima H, Yoshida Y, Maruyama S

Obesity research & clinical practice   12 巻 ( 1S1 ) 頁： 39-48   2018年1月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.orcp.2016.05.004

PubMed

Effective screening for hypolipidemic bile acid-binding peptides by hierarchical clustering-based catalog array. Journal of Bioscience 査読有り

Ryuji Kato, Kei Kanie, Chiaki Kaga, Mina Okochi, Satoshi Nagaoka, Hiroyuki Honda

Biotechnology and Applied Biochemistry   1 巻 ( 1 ) 頁： 1001   2018年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of peptides associated with adhesion and aggregation of <i>Lactobacillus rhamnosus</i> GG <i>in vitro</i>

Okochi, M; Sugita, T; Asai, Y; Tanaka, M; Honda, H

BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL   128 巻   頁： 178 - 185   2017年12月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.bej.2017.10.004

Web of Science

Association between kidney function and genetic polymorphisms in atherosclerotic and chronic kidney diseases: A cross-sectional study in Japanese male workers

Kubo, Y; Imaizumi, T; Ando, M; Nakatochi, M; Yasuda, Y; Honda, H; Kuwatsuka, Y; Kato, S; Kikuchi, K; Kondo, T; Iwata, M; Nakashima, T; Yasui, H; Takamatsu, H; Okajima, H; Yoshida, Y; Maruyama, S

PLOS ONE   12 巻 ( 10 ) 頁： e0185476   2017年10月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1371/journal.pone.0185476

Web of Science

PubMed

Morphology-based non-invasive quantitative prediction of the differentiation status of neural stem cells

Fujitani, M; Huddin, NS; Kawai, S; Kanie, K; Kiyota, Y; Shimizu, K; Honda, H; Kato, R

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   124 巻 ( 3 ) 頁： 351 - 358   2017年9月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2017.04.006

Web of Science

PubMed

Randomized controlled trial for assessment of Internet of Things system to guide intensive glucose control in diabetes outpatients: Nagoya Health Navigator Study protocol

Onoue, T; Goto, M; Kobayashi, T; Tominaga, T; Ando, M; Honda, H; Yoshida, Y; Tosaki, T; Yokoi, H; Kato, S; Maruyama, S; Arima, H

NAGOYA JOURNAL OF MEDICAL SCIENCE   79 巻 ( 3 ) 頁： 323 - 329   2017年8月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.18999/nagjms.79.3.323

Web of Science

PubMed

Alcohol-tolerant mutants of cyanobacterium <i>Synechococcus elongatus</i> PCC 7942 obtained by single-cell mutant screening system

Arai, S; Hayashihara, K; Kanamoto, Y; Shimizu, K; Hirokawa, Y; Hanai, T; Murakami, A; Honda, H

BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING   114 巻 ( 8 ) 頁： 1771 - 1778   2017年8月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/bit.26307

Web of Science

PubMed

Effective modification of cell death-inducing intracellular peptides by means of a photo-cleavable peptide array-based screening system

Kozaki, I; Shimizu, K; Honda, H

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   124 巻 ( 2 ) 頁： 209 - 214   2017年8月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2017.03.013

Web of Science

PubMed

Detection of <i>Her2</i>-overexpressing cancer cells using keyhole shaped chamber array employing a magnetic droplet-handling system

Okochi, M; Koike, S; Tanaka, M; Honda, H

BIOSENSORS & BIOELECTRONICS   93 巻   頁： 32 - 39   2017年7月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.bios.2016.11.013

Web of Science

PubMed

Three-Dimensional Culture Model of Skeletal Muscle Tissue with Atrophy Induced by Dexamethasone.

Shimizu K, Genma R, Gotou Y, Nagasaka S, Honda H

Bioengineering (Basel, Switzerland)   4 巻 ( 2 )   2017年6月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.3390/bioengineering4020056

PubMed

Reduction of FR900525 using an S-(2-aminoethyl) L-cysteine-resistant mutant

Shimizu Shiho, Futase Ayako, Yokoyama Tatsuya, Ueda Satoshi, Honda Hiroyuki

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   123 巻 ( 6 ) 頁： 685-691   2017年6月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2017.01.006

Web of Science

PubMed

Visualization of morphological categories of colonies for monitoring of effect on induced pluripotent stem cell culture status

Nagasaka, R; Matsumoto, M; Okada, M; Sasaki, H; Kanie, K; Kii, H; Uozumi, T; Kiyota, Y; Honda, H; Kato, R

REGENERATIVE THERAPY   6 巻   頁： 41 - 51   2017年6月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.reth.2016.12.003

Web of Science

PubMed

Association of interactions between dietary salt consumption and hypertension-susceptibility genetic polymorphisms with blood pressure among Japanese male workers

Imaizumi Takahiro, Ando Masahiko, Nakatochi Masahiro, Maruyama Shoichi, Yasuda Yoshinari, Honda Hiroyuki, Kuwatsuka Yachiyo, Kato Sawako, Kondo Takaaki, Iwata Masamitsu, Nakashima Toru, Yasui Hiroshi, Takamatsu Hideki, Okajima Hiroshi, Yoshida Yasuko, Matsuo Seiichi

CLINICAL AND EXPERIMENTAL NEPHROLOGY   21 巻 ( 3 ) 頁： 457-464   2017年6月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s10157-016-1315-3

Web of Science

PubMed

Image-based cell quality evaluation to detect irregularities under same culture process of human induced pluripotent stem cells

Nagasaka Risako, Gotou Yuto, Yoshida Kei, Kanie Kei, Shimizu Kazunori, Honda Hiroyuki, Kato Ryuji

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   123 巻 ( 5 ) 頁： 642-650   2017年5月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2016.12.015

Web of Science

PubMed

Comparison of non-destructive evaluation methods for iPS cellular status monitoring

Nagasaka, R; Gotou, Y; Yoshida, K; Kanie, K; Shimizu, K; Honda, H; Kato, R

JOURNAL OF PHARMACOLOGICAL SCIENCES   133 巻 ( 3 ) 頁： S247 - S247   2017年3月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Web of Science

Exploring high-affinity binding properties of octamer peptides by principal component analysis of tetramer peptides

Kume Akiko, Kawai Shun, Kato Ryuji, Iwata Shinmei, Shimizu Kazunori, Honda Hiroyuki

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING   123 巻 ( 2 ) 頁： 230-238   2017年2月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2016.08.005

Web of Science

PubMed

[Screening and design of short length functional peptide by peptide array].

Honda H

Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society   89 巻 ( 1 ) 頁： 15-20   2017年2月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

PubMed

; Reduction of FR900525 using an S-(2-aminoethyl) l-cysteine-resistant mutant 査読有り

Shiho Shimizu, , Ayako Futase, Tatsuya Yokoyama, Satoshi Ueda, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering     2017年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2017.01.006

Detection of Her2-overexpressing cancer cells using keyhole shaped chamber array employing a magnetic droplet-handling system 査読有り

Mina Okochi, Shinji Koike, Masayoshi Tanaka, Hiroyuki Honda

Biosensors and Bioelectronics   93 巻   頁： 32-39   2017年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Exploring high-affinity binding properties of octamer peptides by principal component analysis of tetramer peptides 査読有り

Akiko Kume, Shun Kawai, Ryuji Kato, Shinmei Iwata, Kazunori Shimizu, and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   123 巻 ( 2 ) 頁： 230-238   2017年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2016.08.005

Image-based cell quality evaluation to detect irregularities under same culture process of human induced pluripotent stem cells 査読有り

Risako Nagasaka; Yuto Gotou; Kei Yoshida; Kei Kanie, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda, Ryuji Kato

Journal of Bioscience and Bioengineering   20170000 巻   2017年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2016.12.015

Morphological Evaluation of Nonlabeled Cells to Detect Stimulation of Nerve Growth Factor Expression by Lyconadin B 査読有り

Shun Kawai, Hiroto Sasaki, Norihiro Okada, Kei Kanie, Satoshi Yokoshima, Tohru Fukuyama, Hiroyuki Honda, and Ryuji Kato

J Biomol Screen   Ａｐｒ 巻 ( 28 )   2016年4月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： pii: 1087057116645500

Tobias Opthof, Marcel AG van der Heyden, Itsuo Kodama, Jong-Kook Lee: A new in vitro co-culture model using magnetic force-based nanotechnology 査読有り

Hiroki Takanari, Keiko Miwa, XianMing Fu, Junichi Nakai, Akira Ito, Kousuke Ino, Hiroyuki Honda, Wataru Tonomura, Satoshi Konishi

Journal of Cellular Physiology   Ｆｅｂ 巻 ( 12 )   2016年2月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/jcp.25342

Development of a tactical screening method to investigate the characteristics of functional peptides 査読有り

Akiko Kume, Mina Okochi, Kazunori Shimizu, Yasuko Yoshida, and Hiroyuki Honda

Biotechnology and Bioprocess Engineering   ( 21 ) 頁： 119-127   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s12257-015-0523-0

A Single Cell Culture System of Cyanobacteria Using Lectin-Conjugated Magnetite Nanoparticles and Magnetic Force 査読有り

Sayuri Arai, Mina Okochi, Kazunori Shimizu, Taizo Hanai, Hiroyuki Honda

Biotechnology and Bioengineering   ( 113 ) 頁： 112-119   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/bit.25707

Comparisons of cell culture medium using distribution of morphological features in microdevice 査読有り

Hiroto Sasaki, Junko Enomoto, Yurika Ikeda, Hiroyuki Honda, Junji Fukuda, Ryuji Kato

Journal of Bioscience and Bioengineering   ( 121 ) 頁： 117-123   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Rapid colorimetric antibody detection using a dual-function peptide probe for silver nanoparticle aggregation and antibody recognition 査読有り

Mina Okochi, Tomohiro Kamiya, Takeshi Omasa, Masayoshi Tanaka, Hiroyuki Honda

Analytical Sciences   ( 32 ) 頁： 93-97   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Focused screening of ECM-selective adhesion peptides on cellulose-bound peptide microarrays 査読有り

Kei Kanie, Yuto Kondo, Junk Owaki, Yurika Ikeda, Yuji Narita, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

Bioengineering   3 巻   頁： 31   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.3390/bioengineering3040031

Ex vivo culture of circulating tumor cells using magnetic force-based coculture on a fibroblast feeder layer 査読有り

Shuhei Yamamoto, Kazunori Shimizu, Jiahui Fei, Hiroji Iwata, Mina Okochi, Hayao Nakanishi and Hiroyuki Honda

Biotechnology Journal   11 巻 ( 11 ) 頁： 1433-1442   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/biot.201600084

Parametric analysis of colony morphology of non-labelled live human pluripotent stem cells for cell quality control 査読有り

Ryuji Kato, Megumi Matsumoto, Hiroto Sasaki, Risako Joto, Mai Okada, Yurika Ikeda, Kei Kanie, Mika Suga, Masaki Kinehara, Kana Yanagihara, Yu-Jung Liu, Kozue Uchio-Yamada, Takayuki Fukuda, Hiroaki Kii, Takayuki Uozumi, Hiroyuki Honda, Yasujiro Kiyota, and Miho Furue

Scientific Reports   6 巻   頁： 34009   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/srep34009

Plasma-Activated Medium Selectively Eliminates Undifferentiated Human Induced Pluripotent Stem Cell

Ryo Matsumoto, Kazunori Shimizu, Takunori Nagashima, Hiromasa Tanaka, Masaaki Mizuno, Fumitaka Kikkawa, Masaru Hori, Hiroyuki Honda

Regenerative Therapy   5 巻   頁： 55-63   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： org/10.1016/j.reth.2016.07.001

Screening of Osteogenic-Enhancing Short Peptides from BMPs for Biomimetic Material Applications 査読有り

Kei Kanie, Rio Kurimoto, Jing Tian, Katsumi Ebisawa, Yuji Narita, Hiroyuki Honda and Ryuji Kato

Materials   9 巻   頁： 730   2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.3390/ma9090730

Association of interactions between dietary salt consumption and hypertension- susceptibility genetic polymorphisms with blood pressure among Japanese male workers 査読有り

Takahiro Imaizumi, Masahiko Ando, Masahiro Nakatochi2, Shoichi Maruyama, Yoshinari Yasuda, Hiroyuki Honda, Yachiyo Kuwatsuka, Sawako Kato, Takaaki Kondo, Masamitsu Iwata, Toru Nakashima, Hiroshi Yasui, Hideki Takamatsu, Hiroshi Okajima, Yasuko Yoshida, Seiichi Matsuo

Clinical and Experimental Nephrology     2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s10157-016-1315-3

Effect of dietary energy andpolymorphisms in BRAP and GHRL onobesity and metabolic traits 査読有り

Takahiro Imaizumi, Masahiko Ando, Masahiro Nakatochi, Yoshinari Yasuda, Hiroyuki Honda, Yachiyo Kuwatsuka, Sawako Kato, Takaaki Kondo, Masamitsu Iwata, Toru Nakashima, Hiroshi Yasui,Hideki Takamatsu, Hiroshi Okajima, Yasuko Yoshida,Shoichi Maruyama

Obesity Research & Clinical Practice     2016年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.orcp.2016.05.004

Identification of an interaction between VWF rs7965413 and platelet count as a novel risk marker for metabolic syndrome: an extensive search of candidate polymorphisms in a case-control study 査読有り

Masahiro Nakatochi, Yasunori Ushida, Yoshinari Yasuda, Yasuko Yoshida, Shun Kawai, Ryuji Kato, Toru Nakashima, Masamitsu Iwata, Yachiyo Kuwatsuka, Masahiko Ando, Nobuyuki Hamajima, Takaaki Kondo, Hiroaki Oda, Mutsuharu Hayashi, Sawako Kato, Makoto Yamaguchi, Shoichi Maruyama, Seiichi Matsuo, and Hiroyuki Honda

PLOS ONE   ( Feburary 3 )   2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1371/jornal.phone0117591

Effects of the properties of short peptides conjugated with cell-penetrating peptides on their internalization into cells 査読有り

Ryo Matumoto,Mina Okochi,Kazunori Shimizu,Kei Kanie,Ryuji Kato and Hiroyuki Honda

SCIENCE REPORTS     2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/srep12884

Three-dimensional magnetic cell array for evaluation of anti-proliferative effects of chemo-thermo treatment on cancer spheroids 査読有り

Shuhei Yamamoto, Mina Okochi, Kowichi Jimbow, and Hiroyuki Honda

Biotechnology and Bioprocess Engineering   ( 20 ) 頁： 488-497   2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s12257-014-0724-y

Differential variability and correlation of gene expression identifies key genes involved in neuronal differentiation 査読有り

Tatsuya Ando, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

BMC Systems Biology   9 巻 ( 82 )   2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1186/s12918-015-0231-6

In vivo heat-stimulus-triggered osteogenesis 査読有り

Kunihiro Ikuta, Hiroshi Urakawa, Eiji Kozawa, Shunsuke Hamada, Takehiro Ota, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

International Journal of Hyperthermia   31 巻 ( 1 ) 頁： 58-66   2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.3109/02656736.2014.988662

Design of dual functional peptide probe both as binder to angiotensin II and inducer of silver nanoparticle aggregation for label-free colorimetric assay 査読有り

Mina Okochi, Masashi Kuboyama, Masayoshi Tanaka and Hiroyuki Honda

TALANTA   ( 142 ) 頁： 235-239   2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.talanta.2015.04.054

Efficient capturing of circulating tumor cells using a magnetic capture column and a size-selective filter 査読有り

Shuhei Yamamoto, Jiahui Fei, Mina Okochi, Kazunori Shimizu, Akiko Yusa, Naoto Kondo, Hiroji Iwata, Hayao Nakanishi, and Hiroyuki Honda

Bioprocess and Biosystems Engineering   ( 38 ) 頁： 1693-1704   2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s00449-015-1412-9

Development of a tactical screening method to investigate the characteristics of functional peptides 査読有り

Tatsuya Ando, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

BMC Systems Biology   9 巻 ( 82 )   2015年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1186/s12918-015-0231-6

Characterization of Time-Course Morphological Features for Efficient Prediction of Osteogenic Potential in Human Mesenchymal Stem Cells 査読有り

Fumiko Matsuoka, Ichiro Takeuchi, Hideki Agata, Hideaki Kagami, Hirofumi Shiono, Yasujiro Kiyota, Hiroyuki Honda, Ryuji Kato

Biotechnology and Bioengineering     2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： DOI/10.1002/bit.25189

Label-Free Morphology-Based Prediction of Multiple D ifferentiation Potentials of Human Mesenchymal StemCells for Early Evaluation of Intact Cells 査読有り

Hiroto Sasaki, Ichiro Takeuchi, Mai Okada, Rumi Sawada, Kei Kanie1, Yasujiro Kiyota,Hiroyuki Honda, Ryuji Kato

PLOS ONE   9 巻 ( 4 ) 頁： e93952   2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Degranulation of basophilic leukemia cells on branched-chain peptide array with an ova-dnp double epitope 査読有り

Hisayuki Sugiura, Noriyasu Okazaki, Toshimi Sugiura, Hiroyuki Honda, Mina Okochi

Biochemical Engineering Journal   87 巻   頁： 8–14   2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Design of Quenching Peptide Probes Incorporating Tryptophan for Rapid IgG Detection 査読有り

Tomoya Sugita, Mina Okochi, and Hiroyuki Honda

Chemistry Letters   43 巻 ( 4 ) 頁： 550–552   2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Development of a New Rapid Isolation Device for Circulating Tumor Cells (CTCs) Using 3D Palladium Filter and Its Application for Genetic Analysis

Akiko Yusa, Makoto Toneri, Taisuke Masuda, Seiji Ito, Shuhei Yamamoto, Mina Okochi, Naoto Kondo, Hiroji Iwata, Yasushi Yatabe, Yoshiyuki Ichinosawa, Seichin Kinuta, Eisaku Kondo, Hiroyuki Honda, Fumihito Arai, Hayao Nakanishi

PLOS ONE   9 巻 ( 2 ) 頁： e88821   2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

In vivo heat-stimulus-triggered osteogenesis 査読有り

Kunihiro Ikuta, Hiroshi Urakawa, Eiji Kozawa, Shunsuke Hamada, Takehiro Ota, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda, Takeshi Kobayashi, Naoki Ishiguro, and Yoshihiro Nishida

International Journal of Hyperthermia   ( Dec 19 ) 頁： 1-9   2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.3109/02656736.2014.988662

Micro-compartmentalized cultivation of cyanobacteria for mutant screening using glass slides with highly water-repellent mark 査読有り

Sayuri Arai, Mina Okochi, Taizo Hanai, Hiroyuki Honda

Biotechnology Reports   4 巻   頁： 151-155   2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effect of Vascular Formed Endothelial Cell Network on the Invasive Capacity of Melanoma Using the In Vitro 3D Co-Culture Patterning Model 査読有り

Shuhei Yamamoto, Michael Masakuni Hotta, Mina Okochi, Hiroyuki Honda

PLOS ONE   9 巻 ( 7 ) 頁： e103502   2014年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Cell Behavior Observation and Gene Expression Analysis of Melanoma Associated with Stromal Fibroblasts in a Three-Dimensional Magnetic Cell Culture Array 査読有り

Mina Okochi, Taku Matsumura, Shuhei Yamamoto, Eiichi Nakayama, Kowichi Jimbow, Hiroyuki Honda

Biotechnology Progress   29 巻 ( 1 ) 頁： 135-142   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

全網羅ミルクペプチドアレイを用いたアレルギー診断ペプチド探索への分布関数解析法の応用 査読有り

中杤昌弘、片山真、加藤竜司、大河内美奈、高瀬智和、吉田安子、川瀬三雄、本多裕之

化学工学論文集   39 巻 ( 1 ) 頁： 40-45   2013年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Combinational risk factors of metabolic syndrome from health check-up data identified by Fuzzy neural network 査読有り

Yasunori Ushida, Ryuji Kato, Kosuke Niwa, Daisuke Tanimura, Hideo Izawa, Kenji Yasui, Tomokazu Takase, Yasuko Yoshida, Mitsuo Kawase, Tsutomu Yoshida, Toyoaki Murohara, Hiroyuki Honda

BMC Medical Informatics and Decision Making   12 巻 ( 80 ) 頁： doi:10.1186/1472-6947-12-80. 7.   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

iPS cell sheets created by a novel magnetite tissue engineering method for reparative angiogenesis 査読有り

Tetsutaro Kito, Rei Shibata, Masakazu Ishii, Hirohiko Suzuki, Tatsuhito Himeno, Yoshiyuki Kataoka, Yumiko Yamamura, Takashi Yamamoto, Naomi Nishio, Sachiko Ito, Yasushi Numaguchi, Tohru Tanigawa, Jun K Yamashita, Noriyuki Ouchi, Hiroyuki Honda, Kenichi Isobe and Toyoaki Murohara

Scientific Reports   3 巻   頁： 1418   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/srep01418

Image-Based Cell Quality Assessment: Modeling of Cell Morphology and Quality for Clinical Cell Therapy 査読有り

Hiroto Sasaki, Fumiko Matsuoka, Wakana Yamamoto, Kenji Kojima, Hiroyuki Honda and Ryuji Kato

Tissue Engineering and Biomaterials   10 巻   頁： 207-226   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Morphology-Based Prediction of Osteogenic Differentiation Potential of Human Mesenchymal Stem Cells. 査読有り

Fumiko Matsuoka, Ichiro Takeuchi, Hideki Agata, Hideaki Kagami, Hirofumi Shiono, Yasujiro Kiyota, Hiroyuki Honda, Ryuji Kato

PLoS ONE   8 巻 ( 2 ) 頁： e55082   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi/10.1371/journal.pone.0055082

T-cell receptor repertoires of tumor-infiltrating lymphocytes after hyperthermia using functionalized magnetite nanoparticles. 査読有り

Ito A, Yamaguchi M, Okamoto N, Sanematsu Y, Kawabe Y, Wakamatsu K, Ito S, Honda H, Kobayashi T, Nakayama E, Tamura Y, Okura M, Yamashita T, Jimbow K, Kamihira M

Nanomedicine   8 巻 ( 6 ) 頁： 891-902   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi: 10.2217/nnm.12.142

Melanoma-Targeted Chemothermotherapy and In Situ Peptide Immunotherapy through HSP Production by Using Melanogenesis Substrate, NPrCAP, and Magnetite Nanoparticles

Kowichi Jimbow, Yasue Ishii-Osai, Shosuke Ito, Yasuaki Tamura, Akira Ito, Akihiro Yoneta, Takafumi Kamiya, Toshiharu Yamashita, Hiroyuki Honda, Kazumasa Wakamatsu, Katsutoshi Murase, Satoshi Nohara, Eiichi Nakayama, Takeo Hasegawa, Itsuo Yamamoto, and Takeshi Kobayashi

Journal of Skin Cancer     2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi.org/10.1155/2013/742925

Droplet-based biochemical assay by magnetic wire manipulation between multiple droplets

Mitsuhiro Shikida, Tatsuaki Sugito, Mina Okochi, Hiroyuki Honda

Microsystem Technologies   20 巻   頁： 315-323   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Morphology-Based Prediction of Osteogenic Differentiation Potential of Human Mesenchymal Stem Cells 査読有り

Fumiko Matsuoka, Ichiro Takeuchi, Hideki Agata, Hideaki Kagami, Hirofumi Shiono, Yasujiro Kiyota, Hiroyuki Honda, Ryuji Kato

PLOS ONE   8 巻 ( 2 ) 頁： e55082   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Detection of QT Prolongation Through Approximation of the T Wave on Gaussian Mixture Modeling 査読有り

Shin Hibino, Norihiro Ueda, Mitsuru Horiba, Kenji Yasui, Yuusuke Kagamihara, Shuji Funahashi, Kaichiro Kamiya, Hiroyuki Honda

Circulation Journal   77 巻   頁： 2728-2735   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Macrophage migration inhibitory factor and stearoyl-CoA desaturase 1: Potential prognostic markers for soft tissue sarcomas based on bioinformatics analyses 査読有り

Hiro Takahashi, Robert Nakayama, Shuhei Hayashi, Takeshi Nemoto, Yasuyuki Murase, Koji Nomura, Teruyoshi Takahashi, Kenji Kubo, Shigetaka Marui, Koji Yasuhara, Tetsuro Nakamura, Takuya Sueo, Anna Takahashi, Kaname Tsutsumiuchi, Tsutomu Ohta, Akira Kawai, Shintaro Sugita, Shinjiro Yamamoto, Takeshi Kobayashi, Hiroyuki Honda, Teruhiko Yoshida, Tadashi Hasegawa

PLOS ONE   8 巻 ( 10 ) 頁： e78250   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： doi/10.1371/journal.pone.0078250

Screening of peptide ligands that bind to the Fc region of IgG using peptide array and its application to affinity purification of antibody. 査読有り

Tomoya Sugita, Makoto Katayama, Mina Okochi, Takamitsu Ichihara, Ryuji Kato, and Hiroyuki Honda

Biochemical Engineering Journal   79 巻   頁： 33-40   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Magnetic force-based cell patterning for evaluation of the effect of stromal fibroblasts on invasive capacity in 3D cultures. 査読有り

Mina Okochi, Taku Matsumura, and Hiroyuki Honda

Biosensors and Bioelectronics   40 巻   頁： 300-307   2013年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Mechanism of putative neo-antigen formation from N-propionyl-4-Scysteaminylphenol,a tyrosinase substrate, in melanoma models 査読有り

Shosuke Ito, Akira Nishigaki, Yasue Ishii-Osai, Makoto Ojika, Kazumasa Wakamatsu,Toshiharu Yamashita, Yasuaki Tamura, Akira Ito, Hiroyuki Honda, Eiichi Nakayama, Kowichi Jimbow

Biochemical Pharmacology   84 巻   頁： 646-653   2012年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening for silver nanoparticle-binding peptides by using a peptide array 査読有り

Masashi Kuboyama, Ryuji Kato, Mina Okochi, Hiroyuki Honda

Biochemical Engineering Journal   66 巻   頁： 73– 77   2012年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

N-propionyl-4-S-cysteaminylphenol induces apoptosis in B16F1 cells and mediates tumor-specific T-cell immune responses in a mouse melanoma model 査読有り

Yasue Ishii-Osai, Toshiharu Yamashita, Yasuaki Tamura, Noriyuki Sato, Akira Ito, Hiroyuki Honda, Kazumasa Wakamatsu, Shosuke Ito, Eiichi Nakayama, Masae Okura and Kowichi Jimbow

Journal of Dermatological Science   67 巻   頁： 51-60   2012年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of an α-Amylase Inhibitor Peptide by photolinker-Peptide Array 査読有り

Takashi Ochiai, Tomoya Sugita, Ryuji Kato, Mina Okochi, and Hiroyuki Honda

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry   76 巻 ( 4 ) 頁： 819-824   2012年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

T-cell receptor repertoires of tumor-infiltrating lymphocytes after hyperthermia using functionalized magnetite nanoparticles

Akira Ito, Masaki Yamaguchi, Noriaki Okamoto, Yuji Sanematsu, Yoshiniri Kawabe, Kazumasa Wakamatsu, Shosuke Ito, Hiroyuki Honda, Takeshi Kobayashi, Eiichi Nakayama, Yasuaki Tamura, Masae Okura, Toshiharu Yamashita, Kowichi Jimbow and Masamichi Kamihira :

Nanomedicine     2012年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.2217/NNM.12.142

Enhancement of the Activity of a Lactobacilli- Aggregating Peptide by Freezing Treatment

Yuji Asai, Tomoya Sugita, Ryuji Kato, Mina Okochi, Kyuya Nakagawa, and Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering   48 巻 ( 5 ) 頁： 609-614   2012年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Collagen type IV-specific tripeptides for selective adhesion of endothelial and smooth muscle cells 査読有り

Kei Kanie, Yuji Narita, Junki Owaki, Yingzi Zhao, Fumiaki Kuwabara, Makoto Satake, Susumu Honda, Hiroaki Kaneko, Tomohiko Yoshioka, Mina Okochi, Hiroyuki Honda,Ryuji Kato

Biotechnology and Bioengineering   109 巻 ( 7 ) 頁： 1808-1816   2012年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Gingival and dermal fibroblasts: Their similarities and differences revealed from gene expression 査読有り

Katsumi Ebisawa, Ryuji Kato, Mai Okada, Tomotaka Sugimura, Mazlyzam Abdul Latif, Yusuke Hori, Yuji Narita, Minoru Ueda, Hiroyuki Honda and Hideaki Kagami

Journal of Bioscience and Bioengineering   111 巻 ( 3 ) 頁： 255-258   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Peptide Array-Based Peptide-Cell Interaction Analysis 査読有り

Ryuji Kato, Chiaki Kaga, Kei Kanie, Mitoshi Kunimatsu, Mina Okochi and Hiroyuki Honda

Mini-reviews in organic chemistry   8 巻 ( 2 ) 頁： 171-177   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Personalized assessment of oxidative cellular damages associated with diabetes using the erythrocytes adhesion assay 査読有り

Mina Okochi, Yuki Sakai1 Yayoi Isaji, Hiroshi Nagasaki, Yoji Hamada, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   112 巻 ( 6 ) 頁： 635-637   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

ミルクタンパク質全網羅ペプチドアレイを用いたIgG結合ペプチドの探索 査読有り

片山真、杉田智哉、加藤竜司、大河内美奈、松島充代子、川部勤、高瀬智和、吉田安子、川瀬三雄、本多裕之

化学工学論文集   37 巻   頁： 546-550   2011年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Fabrication of a pen-shaped portable biochemical reaction system based on magnetic bead manipulatio

Mituhiro Shikita, Noriyuki Inagaku, Mina Okochi, Hiroyuki Honda, Kazuo Sato

Journal of Micromechanics and Microengineering   21 巻   頁： 7   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Droplet introduction into a pen-shaped portable reaction system by gravity and interfacial forces 査読有り

M. Shikita, N. Inagaki, M. Okochi, H. Honda, K. Sato

Micro & Nano Letters   6 巻 ( 4 ) 頁： 253-256   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of peptides with a high affinity to bile acids using peptide arrays and a computational analysis

Toshikazu Takeshita, Mina Okochi, Ryuji Kato, Chiaki Kaga, Yasuyuki Tomita, Satoshi Nagaoka, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   112 巻 ( 1 ) 頁： 92-97   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

mino acid sequence preferences to control cell-specific organization of endothelial cells, smooth muscle cells, and fibroblasts 査読有り

Kei Kanie, Ryuji Kato, Yingzi Zhao, Yuji Narita, Mina Okochi, Hiroyuki Honda

Journal of Peptide Science   17 巻 ( 6 ) 頁： 479-486   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Peptide Array-Based Peptide-Cell Interaction Analysis 査読有り

Ryuji Kato, Chiaki Kaga, Kei Kanie, Mitoshi Kunimatsu, Mina Okochi and Hiroyuki Honda

Mini-reviews in organic chemistry   8 巻 ( 2 ) 頁： 171-177   2011年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

長期追跡健康診断データにおける遺伝・環境要因を用いた生活習慣病リスク決定法 査読有り

牛田泰徳、加藤竜司、谷村大輔、井澤英夫、安井健二、高瀬智和、吉田安子、川瀬雄三、吉田勤、室原豊明、本多裕之

生物工学会誌   88 巻 ( 11 ) 頁： 562-569   2010年4月

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Scale-up fermentation of echinocandin-type antibiotic FR901379 査読有り

Munekazu Kanda, Eiji Yamamoto, Akihiro Hayashi, Tetsuya Yabutani, Michio Yamashita, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   109 巻 ( 2 ) 頁： 138-144   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

混合正規分布による心電図Ｔ波の近似とＱＴ間隔の自動計測への応用 査読有り

日比野　新、中杤昌弘、上田典浩、堀場　充、安井健二、鏡原有祐、寺澤敏昭、神谷香一郎、児玉逸雄、松原充隆、本多裕之

生体医工学   48 巻 ( 4 ) 頁： 359-368   2010年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Transfer of gene to human retinal pigment epithelial cells using magnetite cationic liposomes 査読有り

Yasuki Fujii, Shu Kachi, Akira Ito, Tamayo Kawasumi, Hiroyuki Honda, Hiroko Terasaki

British Journal of Ophthalmology   94 巻   頁： 1074-1077   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Melanoma-targeted chemo-thermo-immuno (CTI)-therapy using N-propionyl-4-S-cysteaminylphenol-magnetite nanoparticles elicits CTL response via heat shock protein-peptide complex release. 査読有り

Akiko Sato, Yasuaki Tamura, Noriyuki Sato, Toshiharu Yamashita, Tomoaki Takada, Makito Sato,Yasue Osai, Masae Okura, Ichiro Ono, Akira Ito, Hiroyuki Honda, Kazumasa Wakamatsu, Shosuke Ito and Kowichi Jimbow

Cancer Science   110 巻 ( 9 ) 頁： 1939-1946   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Peptide Array-Based Characterization and Design of ZnO-High Affinity Peptides 査読有り

Mina Okochi, Tomoya Sugita, Seiji Furusawa, Mitsuo Umetsu, Tadafumi Adschiri, Hiroyuki Honda

Biotechnology and Bioengineering   106 巻 ( 6 ) 頁： 845-851   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Construction of an Electrochemical Antibiofouling System for Plate Heat Exchangers 査読有り

Hitoshi Wake, Toshihiro Takimoto, Hirokazu Takayanagi, Kinichi Ozawa, Hideo Kadoi, Shigeki Mukai, Yoshinari Komura, Mina Okochi, Hiroyuki Honda and Tadashi Matsunaga

Journal of Chemical Engineering of Japan   43 巻 ( 7 ) 頁： 608-611   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Practical cell labeling with magnetite cationic liposomes for cell manipulation 査読有り

Hiroshi Ito, Yurika Nonogaki, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   110 巻 ( 1 ) 頁： 124-129   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

A compact, automated cell culture system for clinical scale cell expansion from primary tissues 査読有り

Ryuji Kato, Daisuke Iejima, Hideki Agata, Izumi Asahina, Kunihiko Okada, Minoru Ueda, Hiroyuki Honda, and Hideaki Kagami

Tissue Engineering Part C     頁： Ebub ahead print   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Directed evolution of angiotensin II-inhibiting peptides using a microbead display 査読有り

Rui Gan, Seiji Furuzawa, Takaaki Kojima, Kei Kanie, Ryuji Kato, Mina Okochi, Hiroyuki Honda, and Hideo Nakano

Journal of Bioscience and Bioengineering   109 巻 ( 4 ) 頁： 411-417   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of ZnO-high affinity peptide using spot-synthesized peptide arrays and computational analysis 査読有り

Mina Okochi, Masafumi Ogawa, Chiaki Kaga, Tomoya Sugita, Yasuyuki Tomita, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

Acta Biomaterialia   6 巻   頁： 2301-2306   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Fabrication process of carbon nanotube field effect transistors using atomic layer deposition passivation for biosensors. 査読有り

Yasuhiro Nakashima, Yutaka Ohno, Shigeru Kishimoto, Mina Okochi, Hiroyuki Honda, Takashi Mizutani

J. Nanosci. Nanotechnol.   10 巻   頁： 3805-3809   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

: Identification of Novel Candidate Genes for Treatment Response to Risperidone and Susceptibility for Schizophrenia: Integrated Analysis Among Pharmacogenomics, Mouse Expression, and Genetic Case-Control Association Approaches 査読有り

Masashi Ikeda, Yasuyuki Tomita, Akihiro Mouri, Minori Koga, Tomo Ohkouchi, Reiji Yoshimura, Yoshio Yamanouchi, Yoko Kinoshita, Ryota Hashimoto, Hywel Williams, Masatoshi Takeda, Jun Nakamura, Toshitaka Nabeshima, Michael J. Owen, Michael C. O'Donovan, Hiroyuki Honda, Tadao Arinami, Norio Ozaki, Nakao Iwata

Biological Psychiatry   67 巻 ( 3 ) 頁： 263-269   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Droplet-based gene expression analysis using a device with magnetic force-based-droplet-handling system 査読有り

Mina Okochi, Hiroyoshi Tsuchiya, Fumitaka Kumazawa, Mitsuhiro Shikida, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   109 巻 ( 2 ) 頁： 193-197   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Magnetic manipulation device for the optimization of cell processing conditions 査読有り

Hiroshi Ito, Ryuji Kato, Kousuke Ino, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   109 巻 ( 2 ) 頁： 182-188   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

混合正規分布による心電図Ｔ波の近似とＱＴ間隔の自動計測への応用 査読有り

)日比野　新、中杤昌弘、上田典浩、堀場　充、安井健二、鏡原有祐、寺澤敏昭、神谷香一郎、児玉逸雄、松原充隆、本多裕之

生体医工学   48 巻 ( 4 ) 頁： 359-368   2010年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Forkhead box A1 transcriptional pathway in KRT7-expressing esophageal squamous cell carcinomas with extensive lymph node metastasis s 査読有り

Masayuki Sano, Kazuhiko Aoyagi, Hiro Takahashi, Takashi Kawamura, Tomoko Mabuchi, Hiroyasu Igaki, Yuji Tachimori, Hoichi Kato, Atsushi Ochiai, Hiroyuki Honda, Yuji Nimura, Masato Nagino, Teruhiko Yoshida, Hiroki Sasak

International Journal of Oncology   36 巻   頁： 321-330   2010年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Application of magnetic force-based cell patterning for controlling cell-cell interactions in angiogenesis 査読有り

Kosuke Ino, Mina Okochi, Hiroyuki Honda :

Biotechnology and Bioengineering   102 巻 ( 3 ) 頁： 882-890   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

*Peptide array-based analysis of the specific IgE and IgG4 in cow's milk allergens and its use in allergy evaluation 査読有り

Naoki Matsumoto, Mina Okochi, Miyoko Matsushima, Ryuji Kato, Tomokazu Takase, Yasuko Yoshida, Mitsuo Kawase, Ken-ichi Isobe, Tsutomu Kawabe, Hiroyuki Honda

Peptides   30 巻   頁： 1840-1847   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

N-Propionyl-Cysteaminylphenol-Magnetite Conjugate (NPrCAP/M) Is a Nanoparticle for the Targeted Growth Suppression of Melanoma Cells 査読有り

Makito Sato, Toshihar Yamashita, Masae Ohkura, Yasue Osai, Akiko Sato, Tomoaki Takada, Hidenobu Matsusaka, Ichiro Ono, Yasuaki Tamura, Noriyuki Sato, Yasushi Sasaki, Akira Ito, Hiroyuki Hond, Kazumasa Wakamatsu, Shosuke Ito, Kowichi Jimbow

Journal of Investigative Dermatology   129 巻 ( 9 ) 頁： 2233-2241   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

短鎖機能性ペプチド探索：ペプチドインフォマティクス 招待有り 査読有り

本多裕之

生物工学会誌   87 巻 ( 6 ) 頁： 280-282   2009年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Improvement of FR901379 production by mutant selecton and medium optimization 査読有り

Munekazu Kanda, Masaru Tsuboi, Kazutoshi Sakamoto, Shiho Shimizu, Michio Yamashita, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   107 巻 ( 5 ) 頁： 530-534   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of epithelial cell-adhesive peptides from fibronectin loop region and its cell specificity, 査読有り

Chiaki Kaga, Shigeyuki Nomura, Mina Okochi, Tomoko Nozu, Tomokazu Nagao, Atsushi Nagai, Toshinori Nakayama, Kazuo Suzuki, Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering of Japan   42 巻 ( 4 ) 頁： 298-302   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Preparation of L929 cell array by magnetic pinholder device for single cell function analysis, 査読有り

Hironobu Koide, Yayoi Isaji, Mina Okochi, Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering of Japan   42 巻 ( 4 ) 頁： 290-297   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Agitation of magnetic beads by multi-layered flat coils 査読有り

Mitsuhiro Shikida, Motoki Koyama, Nobuhiro Nagao, Rentaro Imai, Hiroyuki Honda, Mina Okochi, Hiroyoshi Tsuchiya, Kazuo Sato

Sensor and Actuator B: Chemical   137 巻   頁： 774-780   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

残存脳腫瘍に対する磁気センサを用いた新しい腫瘍検出技術の開発（第一報）：マグネタイトカチオニックリポソーム投与の最適化と安全性, 査読有り

梶田泰一、本多裕之、内山　剛、加藤竜司、林　雄一郎、竹林成典、夏目敦至、水野正明、若林俊彦、吉田　純：

生体医工学   47 巻 ( 1 ) 頁： 99-104   2009年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Drastic change in cell surface hydrophobicity of a new bacterial strain, Pseudomonas sp. TIS1-127, induced by growth temperature and its effects on the toluene-conversion rate 査読有り

Katsutoshi Hori, Naoto Hiramatsu, Mari Nannbu, Kei Kanie, Mina Okochi, Hiroyuki Honda, Hisami Watanabe

Journal of Bioscience and Bioengineering   107 巻 ( 3 ) 頁： 250-255   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Development of peptide arrays for detection of IgE-binding epitopes in cow's milk allergens 査読有り

Naoki Matsumoto, Mina Okochi, Miyoko Matsushima, Akiko Ogawa, Tomokazu Takase, Yasuko Yoshida, Mitsuo Kawase, Ken-ichi Isobe, Tsutomu Kawabe, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   107 巻 ( 3 ) 頁： 324-330   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

*Three-dimensional cell culture array using magnetic force-based cell patterning for analysis of invasive capacity of BALB/3T3/v-src 査読有り

Mina Okochi, Sho Takano, Yayoi Isaji, Takeshi Senga, Michinari Hamaguchi, Hiroyuki Honda

Lab on a Chip   9 巻   頁： 3378-3384   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Magnetic force-based lab-on-a-chip for single cell analysis in a droplet 査読有り

Mina Okochi, Hiroyoshi Tsuchiya, Fumitaka Kumazawa, Mitsuhiro Shikida, Hiroyuki Honda

ECS Transactions   16 巻 ( 17 ) 頁： 15-20   2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

部屋の住み心地に及ぼす物理的・感覚的因子の組み合わせ解析－ファジィニューラルネットワークによる住居環境解析－

牛田泰徳、加藤竜司、守本とも子、本多裕之

日本感性工学会論文誌   9 巻 ( 1 ) 頁： 97-102   2009年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Growth Inhibition of Re-Challenge B16Melanoma Transplant by Conjugates of Melanogenesis Substrate and Magnetite Nanoparticles as the Basis for Developing Melanoma-Targeted Chemo-Thermo-Immunotherapy 査読有り

Tomoaki Takada, Toshiharu Yamashita, Makito Sato, Aki Tomoaki Takada, Toshiharu Yamashita, Makito Sato, Akiko Sato, Ichiro Ono, Yasuaki Tamura, Noriyuki Sato, Atsushi Miyamoto, Akira Ito, Hiroyuki Honda, KazumasaWakamatsu, Shosuke Ito and Kowichi Jimbow

Journal of Biomedicine and Biotechnology     2009年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1155/2009/457936

Expression Profiling of Peripheral-Blood Mononuclear Cells from Patients with Chronic Hepatitis C Undergoing Interferon Therapy 査読有り

Makoto Tateno, Masao Honda, Takashi Kawamura, Hiroyuki Honda, and Shuichi Kaneko

The Journal of Infectious Diseases   32 巻 ( 9 ) 頁： 742-747   2008年4月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

The complementarity of the technical tools of tissue engineering and the concepts of artificial organs for the design of functional bioartificial tissues 査読有り

Petros Lenas1, Angel Moreno, Laertis Ikonomou, Joerg Mayer, Hiroyuki Honda, Antonio Novellino, Camilo Pizarro, Eleni Nicodemou-Lena, Silvia Rodergas, Jesus Pintor

Artificial Organs   32 巻 ( 9 ) 頁： 742-746   2008年4月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

機能性磁性ナノ微粒子を用いた三次元組織構築技術 査読有り

井藤彰、本多裕之、上平正道

薬学雑誌   128 巻 ( 1 ) 頁： 21-28   2008年4月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Hyperthermic treatment of DMBA-induced rat mammary cancer using magnetic nanoparticles 査読有り

Jun Motoyama, Noriyuki Yamashita, Tomio Morino, Takeshi Kobayashi, Hiroyuki Honda

BioMagnetic Research and Technology   6 巻 ( 2 )   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effect of global transcriptional regulators related to carbohydrate metabolism on organic solvent tolerance in Escherichia coli 査読有り

Mina Okochi, Masaki Kurimoto, Kazunori Shimizu, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   105 巻 ( 4 ) 頁： 389-394   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Fabrication of vertically-aligned carbon nanotube electrodes using grid-inserted plasma-enhanced chemical vapor deposition for chemical sensors 査読有り

Yoshihiro Kojima, Shigeru Kishimoto, Mina Okochi, Hiroyuki Honda, Takashi Mizutani

Japanese Journal of Applied Physics   47 巻 ( 4 ) 頁： 2028-2031   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

A palmtop-sized rotary-drive-type biochemical analysis system by magnetic bead handling 査読有り

Mitsuhiro Shikida, Nobuhiro Nagao, Rentaro Imai, Hiroyuki Honda, Mina Okochi, Hiroshi Ito, Kazuo Sato:

of Micromechanics and Microengineering   18 巻 ( 065012(9pp) )   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Cell culture arrays using magnetic force-based cell patterning for dynamic single cell analysis 査読有り

Kosuke Ino, Mina Okochi, Nao Konishi, Masahiro Nakatochi, Rentaro Imai, Mitsuhiro Shikida, Akira Ito and Hiroyuki Honda

Lab on a Chip   8 巻   頁： 134-142   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Size dependent heat generation of magnetite nanoparticles under AC magnetic field for cancer therapy 査読有り

Jun Motoyama, Toshiyuki Hakata, Ryuji Kato, Noriyuki Yamashita, Tomio Morino, Takeshi Kobayashi, Hiroyuki Honda

BioMagnetic Research and Technology   6 巻   頁： 4   2008年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Use of erythrocyte adhesion assay to predict the risk of diabetic complications 査読有り

Yayoi Isaji, Mina Okochi, Fumihiko Horio, Hiroyuki Honda

Biochemical Engineering Journal   43 巻   頁： 178-184   2008年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Cancer DNA microarray analysis considering multi-subclass with graph-based clustering method 査読有り

Takashi Kawamura, Hironori Mutoh, Yasuyuki Tomita, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   106 巻 ( 5 ) 頁： 442-448   2008年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

心理・背景因子データからの妊産期うつ病発症リスク診断 査読有り

冨田康之、加藤竜司、野坂幸世、武藤裕紀、富田真紀子、濱田祥子、涌井陽子、金井篤子、村瀬聡美、臼井比奈子、石川直子、廣瀬允美、水野妙子、後藤節子、尾崎紀夫、本多裕之

生物工学会誌   86 巻 ( 11 ) 頁： 519-523   2008年

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記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

A motif detection and classification method for peptide sequences using genetic programming 査読有り

Yasuyuki Tomita, Ryuji Kato, Mina Okochi, and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   106 巻 ( 2 ) 頁： 154-161   2008年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Peptide array-based screening of human mesenchymal stem cell-adhesive peptides derived from fibronectin type III domain 査読有り

Mina Okochi, Shigeyuki Nomura, Chiaki Kaga, Hiroyuki Honda

Biochemical and Biophysical Research Communications   371 巻 ( 1 ) 頁： 85-89   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

On-chip polymerase chain reaction microdevice employing a magnetic droplet-manipulation system 査読有り

Hiroyoshi Tsuchiya, Mina Okochi, Nobuhiro Nagao, Mitsuhiro Shikida and Hiroyuki Honda

Sensors & Actuators:B. Chemical   130 巻 ( 2 ) 頁： 583-588   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effect of heat therapy using magnetic nanoparticles conjugated with cationic liposomes on prostate tumor in bone 査読有り

Noriyasu Kawai, Mituru Futakuchi, Tatsuro Yoshida, Akira Ito, Shinya Sato, Taku Naiki, Hiroyuki Honda :

Prostate   68 巻 ( 7 ) 頁： 784-792   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Overexpression of prefoldin from the hyperthermophilic archaeum Pyrococcus horikoshii OT3 endowed Escherichia coli with organic solvent tolerance 査読有り

Mina Okochi, Kei Kanie, Masaki Kurimoto, Masafumi Yohda, Hiroyuki Honda

Applied Microbiology and Biotechnology   79 巻   頁： 443-449   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Plasmid DNA transfection Using magnetite cationic liposomes for construction of multilayered gene-engineered cell sheet 査読有り

Kosuke Ino, Tamayo Kawasumi, Akira Ito, Hiroyuki Honda

Biotechnology and Bioengineering   100 巻 ( 1 ) 頁： 171-179   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Identification of HLA-A24-restricted epitopes with high affinity to Hsp70 using peptide array 査読有り

Mina Okochi, Hiroki Hayashi, Akira Ito, Ryuji Kato, Yasuaki Tamura, Noriyuki Sato, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   105 巻 ( 3 ) 頁： 198-203   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of cell adhesive peptide from the human laminin-5 α3 chain globular 2 and 3 dimains 査読有り

Shigeyuki Nomura, Chiaki Kaga, Ryuji Kato, Mina Okochi, Hiroyuki Honda:

Journal of Chemical Engineering of Japan   41 巻 ( 3 ) 頁： 206-209   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Computationally-assisted screening and design of cell-interactive peptides by a cell-based assay using peptide arrays and a fuzzy neural network algorithm 査読有り

Chiaki Kaga, Mina Okochi, Yasuyuki Tomita, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

Biotechniques   44 巻 ( 3 ) 頁： 393-402   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Proposal of newly gene filtering method, Bag PART, for gene expression analysis with small samples 査読有り

Takashi Kawamura, Hiro Takahashi, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   105 巻 ( 1 ) 頁： 81-84   2008年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Incorporating of capillary-lake structures into dermal cell sheets constructed by magnetic force-bases tissue engineering 査読有り

kousuke Ino, Akira Ito, Hirohito Kumazawa, Hideaki Kagami, Minoru Ueda, Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering Japan   40 巻 ( 1 ) 頁： 51-58   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Heat immunotherapy with heat shock protein expression by hyperthermia using magnetite nanoparticles 査読有り

Akira Ito, Takeshi Kobayashi, Hiroyuki Honda

Ann.Cancer Res.Therap.   15 巻 ( 2 ) 頁： 27-34   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

異臭味産生藻類のファジイニューラルネットワークによる増殖要因解析 査読有り

石橋良信、及川栄作、本多裕之、安達智広、中杤昌弘

環境工学研究論文集   44 巻   頁： 255-263   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Application of an ultra-water-repellent surface to cell culture 査読有り

Kosuke Ino, Akira Ito, Yunying Wu, Nagahiro Saito, Eri Hibino, Osamu Takai, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   104 巻 ( 5 ) 頁： 420-423   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

爪部悪性黒色腫のための周期的パターン抽出法の開発 査読有り

中杤昌弘、古賀 弘、斎田俊明、小林　猛、本多裕之

化学工学論文集   33 巻 ( 6 ) 頁： 570-580   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of a novel octamer peptide, CNSCWSKD, that induces caspase-dependent cell death 査読有り

Chiaki Kaga, Mina Okochi, Mari Nakanishi, Hiroki Hayashi, Ryuji Kato, Hiroyuki Honda

Biochemical and Biophysical Research Communications   362 巻 ( 4 ) 頁： 1063-1068   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Investigation of the relationship between sample size and risk factors for complex diseases based a simulation study 査読有り

Yasuyuki Tomita, Masahiro Nakatochi, Hiroyuki Asano, Hideo Izawa, Norio Sugimoto, Mitsuhiro Yokota, Hiroyuki Honda

Chemical-Bioinformatics Journal   7 巻 ( 1 ) 頁： 1-11   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Mag-Seeding of Rat Bone Marrow Stromal Cells into Porous Hydroxyapatite Scaffolds for Bone Tissue Engineering 査読有り

Kazunori Shimizu, Akira Ito and Hiroyuki

Journal of Bioscience and Bioengineering   104 巻 ( 3 ) 頁： 171-177   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Bone tissue engineering with human mesenchymal stem cell sheets constructed using magnetite nanoparticles and magnetic force 査読有り

Kazunori Shimizu, Akira Ito, Tatsuro Yoshida, Yoichi Yamada, Minoru Ueda, Hiroyuki Honda

Journal of Biomedical Material Reseach Part B   82 巻 ( 2 ) 頁： 471-480   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Cell patterning using magnetite nanoparticles and magnetic force 査読有り

Kosuke Ino, Akira Ito, Hiroyuki Honda

Biotechnology and Bioengineering   97 巻 ( 5 ) 頁： 1309-1317   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effective cell-seeding using magnetite nanoparticles and magnetic force onto decellularized blood vessels for vascular tissue engineering 査読有り

Kazunori Shimizu, Akira Ito, Manabu Arinobe, Yosuke Murase, Yoshihisa Iwata, Yuji Narita, Hideaki Kagami, Minoru Ueda, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   103 巻 ( 5 ) 頁： 472-478   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Association study between apolipoprotein L and schizophrenia by using exhaustive and rule-based analysis method for the identification of multilocus interactions 査読有り

Yasuyuki Tomita, Masashi Ikeda, Hironori Mutoh, Toshiya Inada, Nakao Iwata, Noriko Ozaki, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   103 巻 ( 4 ) 頁： 303-310   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Increased organic solvent tolerance by overexpression of manXYZ in Escherichia coli 査読有り

Mina Okochi, Masaki Kurimoto, Kazunori Simizu, Hiroyuki Honda

Applied Microbiogy Biotechnology   73 巻 ( 6 ) 頁： 1394-1399   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Construction of multi-layered cardiomyocyte sheets using magnetite nanoparticles and magnetic force 査読有り

Kazunori Shimizu, Akira Ito, Jong-kook Lee, Tatsuro Yoshida, Keiko Miwa, Hisaaki Ishiguro, Yasushi Numaguchi, Toyoaki Murohara, Itsuo Kodama, Hiroyuki Honda

Biotechnology and Bioengineering   96 巻 ( 4 ) 頁： 803-809   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Enhanced activity of 3d-hydroxysteroid dehydrogenase by addition of the co-solvent 1-butyl-3-methylimidazolium (L)-lactate in aqueous phase of biphasic systems for reduction of steroids 査読有り

Mina Okochi, Izumi Nakagawa, Takeshi Kobayashi, Shuhei Hayashi, Shintoro Furusaki, Hiroyuki Honda(2007

Journal of Biotechnology   128 巻   頁： 376-382   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

4-S-Cysteaminylphenol-loaded magnetite cationic liposomes for combination therapy of hyperthermia with chemotherapy against malignant melanoma 査読有り

Akira Ito, Masatake Fujioka, Tatsuro Yoshida, Kazumasa Wakamatsu, Shousuke Ito, Toshiharu Yamashita, Kowichi Jimbow, Hiroyuki Honda

Cancer Science   98 巻 ( 3 ) 頁： 424-430   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

New cancer diagnosis method with exhaustive maker gene selection and reliable prediction modeling using boosting and projective adaptive resonance theory with improved reliable index 査読有り

Hiro Takahashi, Yasuyuki Murase Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Biochemical Engineering Journal   33 巻   頁： 100-109   2007年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Prediction of peptide binding to major histocompatibility complex class II molecules through use of boosted fussy classfier with SWEEP operator method 査読有り

Hiro Takahashi and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   101 巻 ( 2 ) 頁： 137-141   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Gene expression property of high density three-dimensional tissue of Hep G2 formed in Radial –flow bioreactor 査読有り

Tomokatsu Hongo, Mariko Kajikawa, Seiichi Isida, Shougo Ozawa, Yasuo Ono, Junichi Sawada, Youichi Ishikawa, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   101 巻 ( 3 ) 頁： 243-250   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Pentamer peptide from Fas antigen ligand inhibits tumor-growth with solid-bound form found by peptide array 査読有り

Ryuji Kato, Yukako Okuno, Chiaki Kaga, Mitoshi Kunimatsu, Takeshi Kobayashi, and Hiroyuki Honda

Journal of Peptide Research   66 巻   頁： 146-153   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Complete regression of experimental prostate cancer in nude mice by repeated hyperthermia using magnetite cationic liposomes and a newly developed solenoid containing a ferrite core 査読有り

Noriyasu Kawai, Akira Ito, Yoko Nakahara, Hiroyuki Honda, Takeshi Kobayashi, Mitsuru Futakuchi, Tomoyuki Shirai, Keiichi Tozawa, Kenjiro Kohri

The Prostate   66 巻   頁： 718-727   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Proposal of pumpless, valveless, and flowless miniaturized reactor using magnetic beads for a portable gene analysis device 査読有り

Hiroshi Ito, Kentaro Takayanagi, Mina Okochi, Mitsuhiro Shikida, Kazuo Sato, Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering Japan   39 巻 ( 12 ) 頁： 1296-1299   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Classification method for predicting the development of myocardial infarction by using interaction between genetic and environmental factors 査読有り

Yasuyuki Tomita, Hiroyuki Asano, Hideo Izawa, Mitsuhiro Yokota and Hiroyuki Honda

IPSJ Transactions on Bioinformatics   47 巻 ( SIG 17(TBIO 1) ) 頁： 48-66   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Cancer immunotherapy based on intracellular hyperthermia using magnetite nanoparticles: a novel concept of "heat-controlled necrosis" with heat shock protein expression 査読有り

Akira Ito, Hiroyuki Honda, Takeshi Kobayashi

Cancer Immunol Immunother   55 巻 ( 3 ) 頁： 320-328   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Development of an enzymatic reaction device using magnetic bead-cluster handling 査読有り

Mitsuhiro Shikida, Kentaro Takayanagi, Hiroyuki Honda,, Hiroshi Ito, Kazuo Sato

Journal of Micromechanics and Microengineering   16 巻   頁： 1875-1883   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Cancer diagnosis marker extraction for soft tissue sarcomas based on gene expression profiling data using the projective adaptive resonance theory (PART)filtering method 査読有り

Takeshi Nemoto, Teruhiko Yoshida, Hiroyuki Honda and Tadashi Hasegawa

BMC Bioinformatics   399 巻 ( 7 ) 頁： 1-11   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Classification of intramural metastases and lymph node metastases for esophageal cancer from gene expression by using boosting and projective adaptive resonance theory 査読有り

Hiro Takahashi, Kazuhiko Aoyagi, Yukihiro Nakanishi, Hiroki Sasaki, Teruhiko Yoshida, Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   102 巻 ( 1 ) 頁： 46-52   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Lymphoma prognostication from expression profiling using a combination method of boosting and projective adaptive resonance theory 査読有り

Hiro Takahashi, Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering of Japan   39 巻 ( 7 ) 頁： 767-771   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

a new simple and practical gene filtering approach based on the concept of projective adaptive resonance theory (PART) filtering method 査読有り

Hiro Takahashi, Hiroyuki Honda : Modified signal-to-noise

Bioinformatics   22 巻 ( 13 ) 頁： 1662-1664   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Fabrication of antigen sensors using carbon nanotubu field effect transistors 査読有り

Kentaro Tani, Hiroshi Ito, Yutaka Ohno, Shigeru Kishimoto, Mina Okochi, Hiroyuki Honda and Takashi Mizutani

Japanese Journal of Applied Physics   45 巻 ( 6B ) 頁： 5481-5484   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Peptide array based interaction assay of solid-bound peptide and anchorage-dependant cells and its effectiveness in cell-adhesive peptide design 査読有り

Ryuji Kato, Chiaki Kaga, Mitoshi Kunimatsu, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   101 巻 ( 6 ) 頁： 485-495   2006年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Construction of robust prognostic predictors by using projective adaptive resonance theory as a gene filtering method 査読有り

Hiro Takahashi, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Bioinformatics   21 巻 ( 2 ) 頁： 179-186   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

High-throughput screening of cell death inducible short peptides from TNF-related apoptosis-inducing ligand sequence 査読有り

Mina Okochi, Mari Nakanishi, Ryuji Kato, Takeshi Kobayashi, and Hiroyuki Honda

FEBS Letter   580 巻 ( 3 ) 頁： 885-889   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

A new reliable cancer diagnosis method using boosted fuzzy classifier with SWEEP operator method 査読有り

Hiro Takahashi and Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering of Japan   38 巻   頁： 763-773   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Exhaustive exploring using artificial neural network for identification of SNPs combination related to helicobacter pylori infection susceptibility 査読有り

Hironori Mutoh, Nobuyuki Hamajima, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Chemical Bio Informatics Journal   5 巻 ( 2 ) 頁： 15-26   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Magnetic force-based mesenchymal stem cell expansion using antibody-conjugated magnetoliposomes 査読有り

Akira Ito, Eri Hibino, Kazunori Shimizu, Takeshi Kobayashi, Yoichi Yamada, Hideharu Hibi and Minoru Ueda and Hiroyuki Honda

Journal of Biomedical, Materials Research: Part B-Applied Biomaterials   75 巻 ( 2 ) 頁： 320－327   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Complete regression of hereditary melamona in a mouse model by repeated hyperthermia using magnetite cationic liposomes 査読有り

Akira Ito, Yoko Nakahara, Masatake Fujioka, Takeshi Kobayashi, Kazue Takeda, Izumi Nakashima and Hiroyuki Honda

Japanese Journal of Hyperthermic Oncology   21 巻 ( 3 ) 頁： 139-149   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

A novel methodology for fabrication of tissue-engineered tubular constructs using magnetite nanoparticles and magnetic force 査読有り

Akira Ito, Kousuke Ino, Masao Hayashida, Takeshi Kobayashi, Hiroshi Matsumura, Hideaki Kagami, Minoru Ueda and Hiroyuki Honda

Tissue Engineering   11 巻 ( 9/10 ) 頁： 1553-1561   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Novel strategy for protein exploration High-throughput screening assisted with fuzzy neural network 査読有り

Ryuji Kato, Hideo Nakano, Hiroyuki Konishi, Katsuya Kato, Yuchi Koga, Tsuneo Yamane, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Journal of Molecular Biology   351 巻   頁： 683-692   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Intratumoral injection of immature cells enhances antitumor effect of hyperthermia using magnetic nanoparticles 査読有り

Kouji Tanaka, Akira Ito, Takeshi Kobayashi, Tatsuyoshi Kawamura, Shinji Shimada, Kazuhiko Matsumoto, Toshiaki Saida and Hiroyuki Honda

Int. J of Cancer   116 巻   頁： 624-633   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Construction and delivery of tissue-engineering human retinal pigment epithelial cell sheets using magnetite nanoparticles and magnetic force 査読有り

Akira Ito, Eri Hibino, Hiroyuki Honda Chiaki Kobayashi, Hiroko Terasaki, Hideaki Kagami, Minoru Ueda and Takeshi Kobayashi

Tissue Engineering   11 巻 ( 3/4 ) 頁： 489-496   2005年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Using wettability and interfacial tension to handle droplets of magnetic beads in a micro-chemical-analysis system 査読有り

Mitsuhiro Shikida, Kentaro Takayanagi, Kohta Inouchi, Hiroyuki Honda and Kazuo Sato

Sensors and Actuators B   113 巻   頁： 563-569   2005年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Association between Helicobacter pylori seropositivity and NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1(NQO1)C609T polymorphism observed in outpatients and health checkup examinees 査読有り

Yasuyuki Goto, Nobuyuki Hamajima, Hiroyuki Honda, Keitaro Matsuo, Kazuhito Yamamoto, Akiko Tamakoshi, Takefumi Ando and Hidemi Goto

Gastric Cancer   8 巻   頁： 12-17   2005年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

The effect of RGD peptide-conjugated magnetite cationic liposomes on cell growth and cell sheet harvesting 査読有り

Akira Ito, Kousuke Ino, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Biomaterials   26 巻   頁： 6185-6193   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Three-dimensional high density culture of HepG2 cells in a 5-ml radial-flow bioreactor for construction of atificial liver 査読有り

Tomokatu Hongo, Mariko Kajikawa, Seiichi Ishida, Shogo Ozawa, Yoichi Ishikawa, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   99 巻 ( 3 ) 頁： 237-244   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Discovery of glpC, an organic solvent tolerance-related gene in Escherichia coli, using gene expression profiles from DNA microarrays 査読有り

Kazunori Shimizu, Shuhei Hayashi, Takeshi Kako, Maiko Suzuki, Norihiko Tsukagoshi, Noriyuki Doukyu, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Applied and Environmental Microbiology   71 巻 ( 2 ) 頁： 1093-1096   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Time-course data analysis of gene expression profiles reveals purR regulon concerns in organic solvent tolerance in Escherichia coli 査読有り

Kazunori Shimizu, Shuhei Hayashi, Noriyuki Doukyu, Takeshi Kobayashi, and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   99 巻 ( 1 ) 頁： 72-74   2005年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Antitumor effect of combined therapy of recombinant heat shock protein 70 and hyperthermia using magnetic nanoparticles in an experimental subcutaneous murine melanoma

Akira Ito,Fumiko Matsuoka,Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Cancer Immunology and Immunotherapy   53 巻   頁： 26-32   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Artificial neural network approach for selection of casual single nucleotide polymorphisms and construction of prediction model on childhood allegic asthma

Yasuyuki Tomita,Shuta Tomita,Yuko Hasegawa,Yoichi Suzuki,Taro Shirakawa,Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

BMC Bioinformatics   5 巻   頁： 120   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Tissue engineering using magnetite nanoparticles and magnetic force:heterotypic layers co-cultured hepatocytes and endothelial cells

Akira Ito,Yohei Kuga,Hiroyuki Honda,Ken-ichiro Hata,Hideaki Kagami,Minoru Ueda and Takeshi Kobayashi

Tissue Engineering   10 巻 ( 5/6 ) 頁： 833-840   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

A new methodology of mesenchymal stem cell expansion using magnetic nanoparticles

Akira Ito,Eri Hibino,Hiroyuki Honda,Ken-ichiro Hata,Hideaki Kagami,Minoru Ueda and Takeshi Kobayashi

Biochemical Engineering Journal   20 巻   頁： 119-125   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Angiotensin Ⅱinhibitory peptide found in the receptor sequence using peptide array

Ryuji Kato,Mitoshi Kunimatsu,Seigo Fujimoto,Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Biochemical and Biophysical research Communications   315 巻   頁： 22-29   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Local hyperthermia enhances thromobosis in aneurysms containing platinum colis 査読有り

Osamu Suzuki, Shigeru Miyachi, Takeshi Okamoto, Akira Ito, Masashige Shinkai, Hiroyuki Honda, Takeshi Kobayashi, Makoto Neguro and Jun Yoshida

Interventional Neuroradiology   10 巻 ( 3 ) 頁： 203-211   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Hyperthermia using magnetite cationic liposomes for hamster osteosarcoma 査読有り

Fumiko Matsuoka, Masashige Shinkai, Hiroyuki Honda, Tadahiko Kubo, Takashi Sugita and Takeshi Kobayashi

BioMagnetic Research and Technology   2 巻   頁： 3   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Magnetite nanoparticle-loaded anti-HER2 immunoliposomes for combination of antibody therapy with hyperthermia 査読有り

Akira Ito, Yuko Kuga, Hiroyuki Honda, Hiroyuki Kikkawa, Atsushi Horiuchi, Yuji Watanabe and Takeshi Kobayashi

Cancer Letters   212 巻   頁： 167-175   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Construction and harvest of multilayered keratinocyte sheets using magnetite nanoparticles and magnetic force 査読有り

Akira Ito, Masao Hayashida, Hiroyuki Honda, Ken-ichiro Hata, Hideaki Kagami, Minoru Ueda and Takeshi Kobayashi

Tissue Engineering   10 巻 ( 5/6 ) 頁： 873-880   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Evaluation of the Alzheimer type-dementia by magnetic resonance imaging using fuzzy neural networks 査読有り

Xicheng Liu, Shin Hibino, Yoshihiro Hasegawa, Taizo Hanai, Takeo Mitsushima, Akihiko Iida, Michitaka Matsubara Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Journal of Chemical Engineering of Japan   37 巻 ( 3 ) 頁： 429-435   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Proposal of reliability index in search for reliable solutions of reversible calculation based on fuzzy neural network modeling 査読有り

Taizo Hanai, Naoya Iwata, Takeshi Furuhashi, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Journal of Chemical Engineering of Japan   37 巻 ( 4 ) 頁： 523-530   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

A preprocessing method for inferring genetic interaction from gene expression data using Boolian algorithm 査読有り

Kazumi Hakamada, Taizo Hanai, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   98 巻 ( 6 ) 頁： 457-468   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Prognostic predictor with multiple fuzzy neural models using expression profiles for metastases of breast cancer 査読有り

Hiro Takahashi, Kayoko Masuda, Tatsuya Ando, Takeshi Kobayashi, and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   98 巻 ( 3 ) 頁： 193-199   2004年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Transglutaminase-mediated gelatin matrices incorporating cell adhesion factors as a biomaterial for tissue engineering

Akira Ito,Atunori Mase,Masashige Shinkai,Hiroyuki Honda,Ken-ichoro Hata,Minoru Ueda and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   95 巻 ( 2 ) 頁： 196-199   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Complete regression of mouse mammary carcinoma with a size greater than 15mm by frequent repeated hyperthermia using magnetite nanoparticles

Akira Ito,Kouji Tanaka,Hiroyuki Honda,Shigeru Abe,Hideyo Yamaguchi and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   96 巻 ( 4 ) 頁： 364-369   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Maltiple fuzzy neural network system for outcome prediction and classification of 220 lymphoma patients on the basis of molecular profiling

Tatsuya Ando,Miyuki Suguro,Takeshi Kobayashi,Masao Seto and Hiroyuki Honda

Cancer Science   94 巻 ( 10 ) 頁： 906-913   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Heat shock protein 70 expression induces antitumor immunity during intracellular hyperthermia using magnetic nanoparticles

Akira Ito,Masashige Shinkai,Hiroyuki Honda,Kazuhiro Yoshikawa,Shinsuke Saga,Toshihiko Wakabayashi,Jun Yoshida and Takeshi Kobayashi

Cancer Immunology and Immunotherapy   52 巻 ( 5 ) 頁： 80-88   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Screening of stress enhancer based on analysis of gene expression profiles:hyperthermia-induced tumor necrosis by an MMP-3 inhibitor

Naoko Kato,Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Cancer Science   94 巻 ( 7 ) 頁： 644-649   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Proliferation and stratification of keratinocite on cultured amniotic cells for tissue Engineering

Akira Ito,Yohei Takizawa,Masashige Shinkai,Hiroyuki Honda,Ken-ichiro Hata,Minoru Ueda,Naohiko Kuno,Atsuo Itakura and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   95 巻 ( 6 ) 頁： 589-593   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Analysis of organic solvent tolerance in Escherichia coli using gene expression profiles from DNA microarrays

Shuhei Hayashi,Rikizo Aono,Taizo Hanai,Hirotada Mori,Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   95 巻 ( 4 ) 頁： 379-383   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Anti-cancer effect and immune inductionbyhyperthermia of malignant melanoma using magnetite cationic liposomes

Masataka Suzuki,Masashige Shinkai,Hiroyuki Honda,and Takeshi Kobayashi

Melanoma Reserch   13 巻 ( 2 ) 頁： 129-135   2003年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Sensory modeling of coffee with a fuzzy neural network 査読有り

Osamu Tominaga, Fumio Ito, Taizo Hanai, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Journal of Food Science   67 巻 ( 1 ) 頁： 363-368   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Magnetite needle as heating mediator for intracellular hyperthermia of tumor

Masashige Shinkai,Kengo Ueno,Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Japanese Journal of Hyperthermia Oncology   18 巻 ( 4 ) 頁： 191-198   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Hidden Markov model-based prediction of antigenic peptides that interact with MHC class II molecules

Hideki Noguchi,Ryuji Kato,Taizo Hanai,Yukari Matubara,Hiroyuki Honda,Vladimir Brusic and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   94 巻 ( 3 ) 頁： 264-270   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Artificial neural network predictive model for allergic disease using single nucleotide polymorphisms data

Shuta Tomida,Taizo Hanai,Naoki Koma,Youichi Suzuki,Takeshi Kobayashi and Honda Hiroyuki

Journal of Bioscience and Bioengineering   93 巻 ( 5 ) 頁： 470-478   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Determination of blending ratio on regular coffee samples by information technology

Osamu Tominaga,Fumio Ito,Taizo Hanai,Hiroyuki Honda and Takeshi kobayashi

Jornal of Chemical Engineering of Japan   35 巻 ( 2 ) 頁： 137-143   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effect of functional magnetic particles on radiofrequency capactive hesting

Masashige Shinkai,Kousuke Ueda,Shinji Ohtsu,Hiroyuki Honda,KenjiroKohri and Takeshi Kobayashi

Japanese Journal of Cancer Reserch   93 巻   頁： 103-108   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Magnetite needle as heating mediator for intracellular hyperthermia of tumor 査読有り

Masashige Shinkai, Kengo Ueno, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Japanese Journal of Hyperthermia Oncology   18 巻 ( 4 ) 頁： 191-198   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Fuzzy Neural Network Applied to Gene Expression Profiling for Prognosis of Diffuse Large B-cell Lymphoma 査読有り

Tatsuya Ando, Miyuki Suguro, Taizo Hanai, Takeshi Kobayashi, Hiroyuki Honda and Masao Seto

Japanese Journal of Cancer Research93, 1207-1212 (2002)   93 巻   頁： 1207-1212   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Modeling of consumer's preferences for regular coffee samples and its application to product design 査読有り

Osamu Tominaga, Fumio Ito, Taizo Hanai, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Food Science and Technology Research   8 巻 ( 3 ) 頁： 281-285   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Enhanced anthocyanin production from grape callus in an air-lift type bioreactor using a viscous additive-supplemented medium 査読有り

Hiroyuki Honda, Kousuke Hiraoka, Eiji Nagamori, Mariko Omote, Yoshihito Kato, Setsuro Hiroka and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   94 巻 ( 2 ) 頁： 135-139   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Analysis of expression profile using fuzzy adaptive resonance theory 査読有り

Shuta Tomida, Taizo Hanai, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Bioinformatics   18 巻 ( 8 ) 頁： 1073-1083   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Production of single chain recombinant monellin by high cell density culture of genetically engineered Candida utilis using limited feeding of sodium ions 査読有り

Xiaoli Zhang, Takeshi Ito, Keiji Kondo, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Journal of Chemical Engineering of japan   35 巻 ( 7 ) 頁： 654-659   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Artificial neural network predictive model for allergic disease using single nucleotide polymorphisms data 査読有り

Shuta Tomida,Taizo Hanai,Naoki Koma,Youichi Suzuki, Takeshi Kobayashi and Hiroyuki Honda

Journal of Bioscience and Bioengineering   93 巻 ( 5 ) 頁： 470-478   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

茶葉ポリフェノール物質による貝類の海藻摂食活性の阻害 査読有り

長森英二、服部直人、本多裕之、小林　猛

化学工学論文集   28 巻 ( 3 ) 頁： 287-291   2002年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

High celldensity culture of Rhodococcus erythropolis KA2-5-1 for in situ induction of dibenzothiophene degrading activity 査読有り

Hibiki Matsushita, Takahiro Sugiyama, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Journal of the Chinese Institute of Chemical Engineers   32 巻 ( 3 ) 頁： 219-225   2001年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

To obtain cells with high dibenzothiophene (DBT) degrading activity, two phase fed-batch culture of Rhodococcus erythropolis KA 2-5-1 was carried out, which consisted of growth phase in the medium containing sulfate ion as a sulfur source and induction phase for expression of DBT degrading enzyme by DBT addition. Cell concentration of 24.3 g-dry cells/L was obtained after 30 h culture and the maximum specific degrading activity of 18.2 mmol/kg-dry cells/h was achieved at 10 h after induction. In order to simplify the system and lower an operational cost, next, in situ induction of the enzyme activity was conducted by means of sulfur limitation since the activity of the strain can only be induced under sulfur starvation. The strain was cultivated in fed-batch mode in the modified A medium containing 96 mg/L of sulfate ion. At 22 h, sulfate concentration decreased below 10 mg/L and approximately 10 g/L of cell concentration was obtained. When 125 mg/L of DBT was added at 22 h, the enzyme activity increased rapidly and the maximum specific activity of 14.3 mmol/kg-dry cells/h was obtained at 28 h. However, the DBT degrading activity decreased rapidly thereafter. From the assay of remaining concentration of medium components in the culture broth, it was found that Fe and Mg ions were exhausted at the end of cultivation. Fed-batch culture with feeding of concentrated solution of Fe and Mg ions was then conducted. After 23 h, 125 mg/L of DBT was added, and the enzyme activity increased rapidly. In this case, the activity did not decrease, and the maximum specific degrading activity of 18.5 mmol/kg-dry cells/h and cell concentration of 41.7 g-dry cells/L were obtained at 34 h.

Determination of operating conditions in activated sludge process using fuzzy neural network and genetic algorithm 査読有り

Hiroyuki Yoshikawa, Taizo Hanai, Shuta Tomida, Hiroyuki Honda, and Takeshi Kobayashi

Journal of Chemical Engineering of Japan   34 巻 ( 8 ) 頁： 1033-1039   2001年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Fussy neural network model for assessment of Alzheimer-type dementia 査読有り

Shin Hibino, Taizo Hanai, Erika Nagata, Michitaka Matsubara, Kazutoshi Fukagawa, Tatsuaki Shirataki, Hiroyuki Honda, and Takeshi Kobayashi

Journal of Chemical Engineering of Japan   34 巻 ( 7 ) 頁： 936-942   2001年

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Enhanced and prolonged production of regenerated plantlet from carrot callus in viscous additive-supplemented medium 査読有り

Eiji Nagamori, Mariko Omote, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   91 巻 ( 3 ) 頁： 283-287   2001年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

To reduce the hydrodynamic stress in plant cell culture and enhance the production of regenerated plantlets, a liquid medium containing a viscous additive was newly designed and plantlet production from embryogenic carrot callus cultivated in the medium was examined. Na-Alginate or carboxymethyl cellulose (CMC) was used as the viscous additive. The viscosity of the medium increased with increasing additive content and the number of regenerated plantlets also increased. When carrot calli were cultivated in the medium containing 0.4% CMC, designated as N medium (viscosity, 3 mPa・s), the maximum enhancement of plantlet regeneration, approximately 2.5 times higher than that in the control medium, was obtained. Enlargement of callus size observed in N medium is considered to be the main reason for the enhanced plantlet regeneration. Regeneration enhancement was sufficiently induced after calli were cultivated once in N medium, but this regenerarion ability rapidly disappeared after once cultivation in the conventional medium. In repeated batch culture using N medium, plantlet production continued at a high level for 18 batches (250 d) with no significant decrease, while in the control culture without CMC the number of plantlets produced dropped to almost zero by the sixth batch (84 d).

Lipase production in two step fed-batch culture of an organic solvent-tolerant Pseudomonas aeruginosa LST-03 査読有り

Takeshi Ito, Hirokazu Kikuta, Eiji Nagamori, Hiroyuki Honda, Hiroyasu Ogino, Haruo Ishikawa and Takeshi Kobayashi

Journal of Bioscience and Bioengineering   91 巻 ( 3 ) 頁： 245-250   2001年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Efficient lipase production by two-step fed-batch culture of an organic solvent-tolerant bacterium, Pseudomonas aeruginosa LST-03, was investigated. When FB synthetic medium was used in flask culture, no lipase activity was detected, whereas lipase was produced at 2.3 I.U./ml in C2 complex medium. However, lipase production was induced in FB medium when a fatty acid was added to the culture broth in the stationary phase. Among fatty acids tested, long chain saturated fatty acids, such as C18 (stearic acid) and C20 (arachidic acid), were found to function as effective inducers for the production of lipase, giving an activity level almost the same as that obtained in C2 medium in flask culture. Two-step lipase production, comprised of a growth phase in fed-batch mode and a production phase in which lipase was induced by the addition of 5 %(v/v) stearic acid, was carried out in a jar-fermentor. In the growth phase, the maximum cell concentration at 16 h was only 20 in terms of the optical density at 660nm (OD660), and a low level of lipase production (8 I.U./ml) was obtained after 167 h. This was considered to be due to the exhaustion of several medium components brought about by the use of an unsuitable medium or feeding solution. After analyzing the contents of the compounds in the culture broth by inductively coupled plasma spectrometry for metal ions and HPLC for anions, a modified FB medium was designed. When this modified FB medium was used in two-step fed-batch culture, the maximum cell concentration reached an OD660 of 55 (30.2 g-dry cells/l) at 16.5 h, and lipase was produced at 96 I.U./ml after 35 h, which is approximately 40 times higher than the production level obtained in flask culture using C2 medium.

Fuzzy neural network-based prediction of the motif for MHC class II binding peptides 査読有り

Hideki Noguchi, Taizo Hanai, Hiroyuki Honda, Leonard C. Harrison and Takeshi Kobayashi

Journal of Biosience and Bioengineering   92 巻 ( 3 ) 頁： 227-231   2001年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Optimization of bovine cathepsin C production by cultivation of recombinant methylotrophic yeast Candida oidinii

Hiroyuki Kikuta, Kenjiro Kano, Hiroyuki Honda and Takeshi Kobayashi

Jornal of hemical Engineering of Japan   34 巻 ( 6 ) 頁： 848-851   2001年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Augmentation of MHC class I antigen presentation via heat shock protein expression by hyperthermia 査読有り

Akira Ito, Masashige Shinkai, Hiroyuki Honda, Toshihiko Wakabayashi, Jun Yoshida and Takeshi Kobayashi

Cancer Immmunology and Immunotherapy   50 巻   頁： 515-522   2001年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

知的推論モデルによる品質の定量化と培養プロセスの管理

本多裕之

生物工学会誌   78 巻 ( 3 ) 頁： 94-100   2000年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Fuzzy control of bioprocess in Japan

Biotechnology Annual Review   5 巻   頁： 1-23   2000年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Development of chitosan-magnetite aggregates containing Nitrosomonas europaea cells for nitrification enhancement

Journal of Bioscience and Bioengineering   89 巻 ( 5 ) 頁： 420-425   2000年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Selection of embryogenic sugarcane callus by image analysis

Journal of Bioscience and Bioengineering   87 巻 ( 5 ) 頁： 700-702   1999年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Recovery of recombinant Escherichia coli by chitosan-conjugated magnetite

Biochemical Engineering Journal   3 巻   頁： 157-160   1999年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

FNNを用いたビール品質と醸造工程のモデル化

化学工学論文集   25 巻 ( 5 ) 頁： 695-701   1999年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

機能性磁性微粒子を用いた脳病変部に対する新しい磁気センシング法の開発 査読有り

新海政重、大島　晶、柳瀬　貢、内山　剛、毛利佳年雄、若林俊彦、吉田　純、本多裕之、小林　猛

化学工学論文集   24 巻 ( 2 ) 頁： 174-178   1998年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Temperature control of Ginjo sake mashing process by automatic fuzzy modeling using fuzzy networks 査読有り

Hiroyuki Honda, Taizo Hanai, Akemi Katayama, Hisao Tohyama and Takeshi Kobayashi

Journal of Fermentation and Bioengineering   85 巻 ( 1 ) 頁： 107-112   1998年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

High cell density culture of Rhodococcus rhodochrous by pH-stat feeding and dibenzothiophene degradation 査読有り

Hiroyuki Honda, Hiroyasu Sugiyama, Ikuo Saito and Takeshi Kobayashi

Journal of Fermentation and Bioengineering   85 巻 ( 3 ) 頁： 334-338   1998年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Colominic acid production from Escherichia coli in a fed-batch culture under the control of ammonium ions using an FIA system

Journal of Fermentation and Bioengineering.   83 巻 ( 1 ) 頁： 59-63   1997年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Production of Fv fragment of monoclonal antibody from recombinant methylotrophic yeast, Pichia pastoris

Journal of Chemical Engineering of Japan   29 巻 ( 2 ) 頁： 390-392   1996年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Characteristics on heat sterilization of a novel autoclave with a turntable for rotation

Journal of Fermentation and Bioengineering   81 巻 ( 6 ) 頁： 570-572   1996年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effective tPA production by BHK cells in nutrients-controlled culture using on-line HPLC measuring system

Journal of Fermentation and Bioengineering   80 巻 ( 1 ) 頁： 107-110   1995年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effective lactic acid production by two stage extractive fermentation

Journal of Fermentation and Bioengineering   79 巻 ( 6 ) 頁： 589-593   1995年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Effect of additives such as anti-oxidative agent on albumin secretion from primary culture of rat hepatocyte

Biotechnology Letters   17 巻 ( 4 ) 頁： 365-370   1995年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

ファジィ推論を用いた吟醸もろみ制御試験

生物工学会誌   73 巻 ( 4 ) 頁： 283-289   1995年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

活性汚泥混合液中でのウイルス感染価の低減について

水環境学会誌   16 巻 ( 5 ) 頁： 339-345   1993年

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）