講演・口頭発表等 - 倭 剛久
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Role of reorganizable interactions through native residue contacts in the allosteric communication in proteins: A computational study by the residue-residue energy conductivity analysis 国際会議
T. Yamato
Protein Dynamics, Telluride Science Research Workshop
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Energy flow and allosteric communication pathways in proteins: Computational study on the role of native inter-residue interactions 国際会議
T. Yamato
Thermal transport at the nanoscale, Telluride science research workshop
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Exploring protein function using computational biophysics 国際会議
Takahisa Yamato
The 1st International Symposium
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タンパク質の計算生物物理：物質・エネルギー・情報の流れ
倭剛久
蛋白研セミナー「タンパク質科学の未来を語る：実験・理論研究者の対話」
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Computational studies of photoreceptor function: From primary photochemistry to protein structural-changes 国際会議
Takahisa Yamato
Photosensory Receptors & Signal Transduction, Gordon Research Conferences
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Intramolecular communication chart of proteins: Computational analysis of energy transfer pathways 国際会議
Takahisa Yamato
Telluride Science Research Center Work Shop, Thermal transport at the nanoscale
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Energy, electron, proton transfer and ligand migration in proteins. (invited lecture) 国際会議
T. Yamato
University of Nevada, Chemistry Department Seminars
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Signal transduction of photoreceptor proteins. I. Color tuning mechanism 国際会議
T. Yamato
2007 NCTS Spring Workshop on Complex Systems and Signals
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Signal transduction of photoreceptor proteins. II. Excited-state dynamics 国際会議
T. Yamato
2007 NCTS Spring Workshop on Complex Systems and Signals
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Signal transduction of photoreceptor proteins. III. Long-range intramolecular signaling 国際会議
T. Yamato
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生命科学における理論物理・化学の役割
倭 剛久
筑波大学計算科学研究センター発足シンポジウムー計算科学による新たな知の発見・統合・創出ー
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生物の中の陽子
倭 剛久
シンポジウム「物質の創生と発展」
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Spectral tuning, photoisomerization and energy transfer pathways in photoactive yellow protein 国際会議
T. Yamato
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Spectral tuning, photoisomerization and energy flow in photoactive yellow protein 国際会議
12th International Conference on Retinal Proteins
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Color tuning and energy flow of photoactive yellow protein 国際会議
XXIst IUPAC SYMPOSIUM ON PHOTOCHEMISTRY
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Energy flow analysis of photoactive yellow protein
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生体分子構造情報の時間軸への展開による生命機能の解読
倭 剛久
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Energy flow analysis of photoactive yellow protein 国際会議
American Physical Society Annual Meeting
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Analysis of Energy Flow in Proteins: Application to Photoactive Yellow Protein
The 3rd Open Workshop "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
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Spectral Tuning in Photoactive Yellow Protein
The 3rd Open Workshop "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
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Computational Studies on the structure-function relationships of photosensory receptors
The 7th AIST International Symposium on Photoreaction Control and Photofunctional Materials (PCPM2006)
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電子と核が織り成すタンパク質物性
倭 剛久
フォ－ラム「分子系の物性」
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Molecular mechanism of photosensory proteins: Study on the photoactive yellow protein and rhodopsin
Jaeri seminar
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Spectral tuning in photoactive yellow protein 国際会議
49th Annual Meeting, Biophysical Society
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タンパク質の構造と機能の物理
倭 剛久
名古屋大学理学部物理学教室講演会
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Structure-Function relationship of photoreceptor proteins 国際会議
8th membrane research forum
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光受容タンパク質の反応機構の分子論
倭 剛久
第12回理論化学シンポジウム
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Protein-Driven Photoisomerization Reaction of Proteins
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蛋白質分子が駆動する光異性化反応
倭 剛久
分子科学研究所研究会「ロドプシンの分子科学」
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巨大分子の励起状態計算と量子構造生物学
T.Yamato
平成14年度生理学研究所研究会
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蛋白質分子が駆動する生体反応：非経験的QM/MM法による研究
倭 剛久
生体分子シミュレーションワークショップ
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Quantum structural biology of protein-driven reactions
Genproc2003
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タンパク質の励起移動・電子移動・励起状態ダイナミクス
倭 剛久
第２回スーパーコンピュータワークショップ
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計算機実験で探る光受容蛋白質の構造機能相関
倭 剛久
第４回バイオデザイン研究会
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Theoretical study on the photoisomerization dynamics of photoactive yellow protein 国際会議
1st Asian Conference on Photobiology
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Early Stages of Photoreceptor Protein Reactions Investigated by Computational Approach 国際会議
Gordon Conference on Photosensory Receptors & Signal Transduction
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Electronic structure calculations and biophysics 国際会議
The 4th Asian Workshop on First-Principles Electronic Structure Calculations
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Structure-function relationships of photoreceptor proteins: Molecular dynamics study
Photobiology and Energy Conversion: ICBP2001 Satellite Meeting
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有限要素と歪みテンソル解析を用いた球状蛋白質の圧力変形の研究(共著)
第45回タンパク質構造討論会 大阪
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倭 剛久
Biothermology Workshop 2023 2023年12月26日 Biothermology Workshop/JSPS科研費/立命館大学
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Energy and heat flow in proteins 招待有り 国際会議
Takahisa Yamato
Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics 2023年7月24日 Telluride Science and Innovation Center
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Network model for vibrational energy transfer in proteins 招待有り 国際会議
T. Yamato
Pacifichem 2021 2021年12月16日 ACS/CSC/CSJ/CCS/KCS/NZIC/RACI
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Network model for vibrational energy transfer in proteins 招待有り 国際会議
T. Yamato
Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics 2021年7月15日 Telluride Science Research Center
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タンパク質－水の界面における熱輸送：熱伝導係数の水モデル依存性
吉村 風汰、 倭 剛久
令和5年度生物物理中部支部討論会 2024年3月20日 日本生物物理学会
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タンパク質2次構造の熱輸送特性
在田 陽一、Tingting Wang、齊藤 詩恋、杉浦 航、倭 剛久
令和5年度生物物理中部支部討論会 2024年3月19日 日本生物物理学会
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High resolution heat current analysis of proteins: Role of secondary structure 国際会議
Yoichi Arita, Tingting Wang, Shigure Saito, Takahisa Yamato
Annual meeting of the Biophysical Society of Japan 2023年11月15日 The Biophysical Society of Japan
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Computational study of heat flow in proteins: Observation of residue-residue communication at the atomic level 国際会議
Shigure Saito, Tingting Wang, Wataru Sugiura, Yoichi Arita, Takahisa yamato
Annual meeting of the Biophysical Society of Japan 2023年11月15日 The Biophysical Society of Japan
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Prediction of protein structure and function by deep learning
2023年11月15日
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Local thermal transport in an alpha-helical protein using a linear-homopolymer-like model
Tingting Wang, Takahisa Yamato, Wataru Sugiura
2023年3月31日
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タンパク質の局所熱輸送物性
日本化学会 第１０３春季年会 2023年3月24日 日本化学会
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Local thermal transport in an alpha-helical protein
Tingting Wang, Takahisa Yamato, Wataru Sugiura
2023年3月24日
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Structural and Dynamic Characterization of a Highly Flexible Protein by AlphaFold-Multimer and MD Simulations Integrating DEER and SAXS data 国際共著
Tingting WANG, Alessio BONUCCI, Véronique Receveur-Bréchot, Valérie BELLE, Takahisa YAMATO
2023年3月24日
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Local Thermal Transport in an α-helical Protein
Tingting Wang, Takahisa Yamato, Wataru Sugiura
2023年3月10日
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Local Thermal Transport in an α-helical Protein
Tingting Wang, Takahisa Yamato, Wataru Sugiura
2023年3月10日
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Computational study on the signal transduction mechanism of dimeric sensory domain of FixL protein
Tingting Wang, Takahisa Yamato
2022年9月29日
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Computational study on ligands discrimination of dimeric sensory domain of BjFixL protein
Tingting Wang, Takahisa Yamato
2022年9月14日
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タンパク質の熱エネルギー流の理論計算 招待有り
倭 剛久
学術変革領域(B) 低エネルギー操作 勉強会 2022年9月2日 学術変革領域（B) 低エネルギー操作
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Computational study on the signal transduction mechanism of dimeric sensory domain of FixL protein
Tingting Wang, Takahisa Yamato
2022年9月1日
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Site-selective heat current analysis of proteins
Takahisa Yamato, Wataru SUGIURA, Tingting WANG
2022年3月17日
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Thermal conductivity of proteins
倭 剛久
日本生物物理学会年会 2021年11月26日 日本生物物理学会
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Non-uniform thermal transport properties in proteins 招待有り
T. Yamato
The 8th HPCI Project Report Meeting 2021年10月29日 HPCI
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Non-uniform thermal transport properties in proteins
倭 剛久
HPC計算科学連携プロジェクト成果報告会 2021年7月30日 名古屋大学
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Computational study on the signal transduction mechanism of dimeric sensory domain of FixL protein
Tingting WANG, Hiroshi SUGIMOTO, Hiroyasu KOTEISHI, Yoshitsugu SHIRO, Takahisa YAMATO
2021年3月31日
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金属のタンパク質配位における結合部位近傍の振動エネルギー移動ネットワーク 招待有り
倭 剛久
科研費「生命金属科学」第４回領域会議 2020年8月31日 新学術領域「生命金属科学」
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Molecular mechnism of allosteric communication in proteins: Computational analysis of energy flow 国際会議
T. Yamato
Large-scale molecular simulations in biology, chemistry, and physics
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多自由度・大規模系における反応と構造空間探索：生体系へのアプローチ
倭 剛久
第４回物性科学領域横断研究会
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Proteins at work: Computational biophysics of energy, electron, and proton transfer and ligand migration 国際会議
COE Start-up International Workshop
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多自由度・大規模系における反応と構造空間探索
倭 剛久、光武亜代理
新学術領域研究「物質デザイン」キックオフミーティング
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Intramolecular communication chart of human beta-2 adrenergic receptor: A computational study 国際会議
Seminar, Center for membrane biology, University of Texas
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Introduction to Biophysics
1st Nagoya Summer School on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems
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Molecular simulation tutorial
Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, U.S.A.
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Structure-function relationships of DNA photolyase: Analysis of electrontransfer reaction
The 50th Annual Meeting of the Japanese PlantPhysiologists, Nagoya, Japan,
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Electronic state, molecular dynamics, and functions of proteins.
Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Dec. 4, 2008, Fukuoka, Japan.
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Computational study of photoreceptor functions: From primary photochemistry to protein structural changes
Seminar, Emory University, Atlanta, U.S.A. Sep. 10-14, 2008.
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Electronic state and function of proteins (Seminar)
Foundation Advanced Technology Institute, Aug. 31, 2008. Nagano, Japan.
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Electronic states, dynamics, and molecular functions of photoreceptor proteins. 国際会議
1st CMD International Symposium -Chemical Computations, May. 30-Jun. 1, 2008, Seoul, Korea.
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Development of Multi Layer Self Consistent Field Molecular Orbital Method
International Symposium on Frontiers of Computational Science 2005
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Non-Condon theory for the energy gap dependence of electron transfer rate
International Symposium on Frontiers of Computational Science 2005
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Analysis of energy transfer pathway in photosensory receptor
International Symposium on Frontiers of Computational Science 2005
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非弾性トンネル機構が引き起こす蛋白質中電子移動速度の異常なエネルギーギャップ依存性
H. Nishioka, A. Kimura, T. Yamato, T. Kawatsu, T. Kakitani
第43回日本生物物理学会年会
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基準振動解析による変異タンパク質の等温圧縮率計算
S. Mimura, T. Yamato, K. Gekko
第43回日本生物物理学会年会
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蛋白質中のエネルギー流の解析
T.Ishikura, H.Watanabe, T. Yamato
第43回日本生物物理学会年会
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PYPの吸収波長制御の分子論
K. Kawaguchi, T. Yamato
第43回日本生物物理学会年会
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蛋白質中のエネルギー流の解析
T.Ishikura, H.Watanabe, T. Yamato
第5回日本蛋白質科学会年会
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Spectral tuning, photoisomerization and energy flow in photoactive yellow protein
IMS SymposiumStructure and Function of Retinal Proteins and GPCRs
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Spectral Tuning in Photoactive Yellow Protein
IMS SymposiumStructure and Function of Retinal Proteins and GPCRs
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Energy Flow in Photoactive Yellow Protein
IMS SymposiumStructure and Function of Retinal Proteins and GPCRs
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蛋白質中のエネルギー流の解析
T.Ishikura, H.Watanabe, T. Yamato
第9回理論化学討論会