2021/04/01 更新

写真a

アサヌマ ヒロユキ
浅沼 浩之
ASANUMA, Hiroyuki
所属
予防早期医療創成センター 教授
職名
教授
連絡先
メールアドレス

学位 1

  1. 工学博士 ( 1989年3月   東京大学 ) 

研究キーワード 3

  1. 核酸化学

  2. 光化学

  3. 高分子化学

研究分野 1

  1. その他 / その他  / 生体関連化学

現在の研究課題とSDGs 6

  1. 核酸機能の光制御を目指した光応答性DNA/RNAの開発

  2. DNA/RNAを認識する高感度蛍光プローブの開発

  3. DNA/RNAを足場とする新規色素クラスターの設計

  4. 非環状型人工核酸SNA, aTNAの開発

  5. 核酸医薬への応用を目指した人工核酸の開発

  6. 人工核酸の非酵素的複製の研究

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経歴 2

  1. 名古屋大学   予防早期医療創成センター   教授

    2020年5月 - 現在

  2. 名古屋大学   大学院工学研究科生命分子工学専攻   教授

    2017年4月 - 2020年5月

学歴 3

  1. 東京大学   大学院工学系研究科   工業化学専門課程博士課程

    1986年4月 - 1989年3月

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    国名: 日本国

  2. 東京大学   大学院工学系研究科   工業化学専門課程修士課程

    1984年4月 - 1986年3月

  3. 東京大学   工学部   合成化学科

    1980年4月 - 1984年3月

所属学協会 5

  1. 生命の起源および進化学会   会員

    2021年4月 - 現在

  2. 日本核酸化学会   運営委員

    2017年9月 - 現在

  3. 高分子学会

    2011年4月 - 現在

  4. 日本化学会

  5. 光化学協会   会員

委員歴 7

  1. 日本核酸化学会   運営委員  

    2017年9月 - 現在   

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    団体区分:学協会

  2. Wiley-VCH   Editorial Advisory Board ChemBioChem  

    2016年1月 - 現在   

  3. 日本化学会生体機能関連化学・バイオテクノロジーディビジョン   幹事  

    2014年9月 - 現在   

  4. 生体機能関連化学部会   部会長  

    2012年4月 - 現在   

  5. 国際核酸化学シンポジウム実行委員会   実行委員  

    2011年9月 - 2012年8月   

  6. 高分子学会東海支部   常任幹事  

    2010年4月 - 現在   

  7. Associate editor of Bulletin of the Chemical Society of Japan  

    2006年4月 - 2010年3月   

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    団体区分:学協会

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受賞 4

  1. 平成29年度日本化学会 学術賞

    2018年3月   公益社団法人日本化学会   非環状型核酸アナログによる機能性オリゴヌクレオチドの創製

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

  2. 平成27年度高分子学会賞(科学)

    2016年5月   公益社団法人高分子学会  

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    受賞国:日本国

  3. 部会講演賞

    2000年9月   日本化学会生体機能関連化学部会   アゾベンゼン導入DNAによる二重鎖形成の光制御機構の解析

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    受賞国:日本国

  4. 若い世代の特別講演会講演証

    1990年4月   日本化学会   乾燥高分子ゲル錯体の多孔性付与による高機能化

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

 

論文 157

  1. Nonenzymatic polymerase-like template-directed synthesis of acyclic L-threoninol nucleic acid 査読有り

    Murayama, K.; Okita, H.; Kuriki, T.; Asanuma, H.

    Nature Communications   12 巻   頁: 804   2021年2月

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    担当区分:最終著者, 責任著者  

    DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-21128-0

  2. Intrastrand backbone-nucleobase interactions stabilize unwound right-handed helical structures of heteroduplexes of L-aTNA/RNA and SNA/RNA 査読有り

      3 巻 ( 1 ) 頁: 156   2020年11月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s42004-020-00400-2

    Web of Science

  3. Efficient Light-Harvesting Antennae Resulting from the Dense Organization of Dyes into DNA Junctions though d-Threoninol 査読有り

    Kashida Hiromu, Azuma Hidenori, Maruyama Ryoko, Araki Yasuyuki, Wada Takehiko, Asanuma Hiroyuki

    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION   59 巻   頁: 11360 - 11363   2020年5月

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/anie.202004221

    Web of Science

  4. 8-Pyrenylvinyl Adenine Controls Reversible Duplex Formation between Serinol Nucleic Acid and RNA by [2+2] Photocycloaddition 査読有り

    Murayama Keiji, Yamano Yuuhei, Asanuma Hiroyuki

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   141 巻 ( 24 ) 頁: 9485-9489   2019年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/jacs.9b03267

    Web of Science

  5. Bifacial Nucleobases for Hexaplex Formation in Aqueous Solution 査読有り

    Kashida Hiromu, Hattori Yuhei, Tazoe Kaho, Inoue Tadashi, Nishikawa Keiji, Ishii Kentaro, Uchiyama Susumu, Yamashita Hayato, Abe Masayuki, Kamiya Yukiko, Asanuma Hiroyuki

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   140 巻 ( 27 ) 頁: 8456-8462   2018年7月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/jacs.8b02807

    Web of Science

  6. DNA-assisted swarm control in a biomolecular motor system 査読有り

    Keya Jakia Jannat, Suzuki Ryuhei, Kabir Arif Md. Rashedul, Inoue Daisuke, Asanuma Hiroyuki, Sada Kazuki, Hess Henry, Kuzuya Akinori, Kakugo Akira

    NATURE COMMUNICATIONS   9 巻   頁: 453   2018年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-017-02778-5

    Web of Science

  7. Microheater-integrated zinc oxide nanowire microfluidic device for hybridization-based detection of target single-stranded DNA 査読有り

    Nanotechnology     2021年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  8. Preparation of artificial hexaplex composed of non-natural nucleic acid 招待有り 査読有り

    Current Protocols     2021年3月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語  

    DOI: 10.1002/cpz1.106

  9. Development of pre-miRNAs modification with FRET dye pair for intracellular visualization of processing intermediates generated in cells 査読有り

    Kamiya, Y.; Kamimoto, H.; Zhu, H. ; Asanuma, H.

    Sensors   21 巻   頁: 1785   2021年3月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語  

    DOI: doi.org/10.3390/s21051785

  10. Light-regulated liquid-liquid phase separation for spatiotemporal protein recruitment and cell aggregation 査読有り

    Ikeuchi, N.; Komachi, T.; Murayama, K.; Asanuma, H.; Maruyama, A.; Shimada, N.

    ACS Applied Materials & Interfaces   13 巻   頁: 5652 - 5659   2021年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acsami.0c22314

  11. Helical amplification system composed of artificial nucleic acids 査読有り

    Kashida, H.; Nishikawa, K.; Shi, W.; Miyagawa, T.; Yamashita, H.; Abe, M.; Asanuma, H.

    Chemical Science   12 巻   頁: 1656 - 1660   2021年1月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d0sc05245k

  12. Dual Crosslinking Photo-Switches for Orthogonal Photo-Control of Hybridization Between Serinol Nucleic Acid and RNA 査読有り

      27 巻   頁: 4599 - 4604   2020年12月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/chem.202003528

    Web of Science

  13. Quantitative Analyses of Forster Resonance Energy Transfer between Identical Pyrene Chromophores (Homo-FRET) In DNA Scaffolds. 査読有り

    Kashida Hiromu, Kawai Hayato, Azuma Hidenori, Araki Yasuyuki, Wada Takehiko, Asanuma Hiroyuki

    CHEMPHOTOCHEM   5 巻   頁: 167 - 172   2020年9月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cptc.202000199

    Web of Science

  14. Investigation of Strand-Selective Interaction of SNA-Modified siRNA with AGO2-MID 査読有り

    Kamiya Yukiko, Takeyama Yuuki, Mizuno Tomonari, Satoh Fuminori, Asanuma Hiroyuki

    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES   21 巻 ( 15 ) 頁: 5218   2020年8月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/ijms21155218

    Web of Science

  15. Photo-regulated trajectories of gliding microtubules conjugated with DNA 査読有り

    Akter Mousumi, Keya Jakia Jannat, Kabir Arif Md Rashedul, Asanuma Hiroyuki, Murayama Keiji, Sada Kazuki, Kakugo Akira

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   56 巻 ( 57 ) 頁: 7953-7956   2020年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d0cc03124k

    Web of Science

  16. A triplex-forming linear probe for sequence-specific detection of duplex DNA with high sensitivity and affinity 査読有り

    Chen Yanglingzhi, Murayama Keiji, Kashida Hiromu, Kamiya Yukiko, Asanuma Hiroyuki

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   56 巻 ( 40 ) 頁: 5358-5361   2020年5月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d0cc01865a

    Web of Science

  17. Incorporation of Pseudo-complementary Bases 2,6-Diaminopurine and 2-Thiouracil into Serinol Nucleic Acid (SNA) to Promote SNA/RNA Hybridization 査読有り

    Kamiya Yukiko, Sato Fuminori, Murayama Keiji, Kodama Atsuji, Uchiyama Susumu, Asanuma Hiroyuki

    CHEMISTRY-AN ASIAN JOURNAL   15 巻 ( 8 ) 頁: 1266-1271   2020年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/asia.201901728

    Web of Science

  18. 核酸医薬の創製に向けた人工核酸の開発 招待有り 査読有り

    樫田啓、村山恵司、浅沼浩之

    バイオマテリアル   38 巻 ( 2 ) 頁: 124 - 129   2020年4月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  19. A Quencher-Free Linear Probe from Serinol Nucleic Acid with a Fluorescent Uracil Analogue 査読有り

    Murayama Keiji, Asanuma Hiroyuki

    CHEMBIOCHEM   21 巻 ( 1-2 ) 頁: 120-128   2020年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201900498

    Web of Science

  20. Selective binding of nucleosides to gapped DNA duplex revealed by orientation and distance dependence of FRET 査読有り

    Kashida Hiromu, Kokubo Yuta, Makino Koki, Asanuma Hiroyuki

    ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY   17 巻 ( 28 ) 頁: 6786-6789   2019年7月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c9ob00946a

    Web of Science

  21. cis-On/trans-Off of DNA Hybridization with Alkylthio-azobenzene on L-Threoninol Responding to Visible Light 招待有り 査読有り 国際共著

    Asanuma Hiroyuki, Ishikawa Teruchika, Yamano Yuuhei, Murayama Keiji, Liang Xingguo

    CHEMPHOTOCHEM   3 巻 ( 6 ) 頁: 418-424   2019年6月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cptc.201900060

    Web of Science

  22. Orthogonally Photocontrolled Non-Autonomous DNA Walker 査読有り 国際共著

    Skugor Marko, Valero Julian, Murayama Keiji, Centola Mathias, Asanuma Hiroyuki, Famulok Michael

    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION   58 巻 ( 21 ) 頁: 6948-6951   2019年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/anie.201901272

    Web of Science

  23. Isothermal double-cycle catalytic system using DNAzyme and RNase H for the highly selective one-pot detection of oligonucleotides 査読有り 国際共著

    An Ran, Kawai Hayato, Asanuma Hiroyuki, Komiyama Makoto, Liang Xingguo

    ANALYST   144 巻 ( 8 ) 頁: 2773-2779   2019年4月

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c8an02520g

    Web of Science

  24. N-Benzoyl-protected Peptide Nucleic Acid (PNA) Monomers Expand the Range of Nucleobases Available for PNA-DNA Chimera 査読有り

    Inagaki Masahito, Uematsu Ryohei, Mizutani Tatsuya, Unabara Daisuke, Araki Yasuyuki, Sakamoto Seiji, Kashida Hiromu, Nishijima Masaki, Asanuma Hiroyuki, Inoue Yoshihisa, Wada Takehiko

    CHEMISTRY LETTERS   48 巻 ( 4 ) 頁: 341-344   2019年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1246/cl.181048

    Web of Science

  25. In-stem molecular beacon targeted to a 5 '-region of tRNA inclusive of the D arm that detects mature tRNA with high sensitivity 査読有り

    Miyoshi Yuichi, Ohtsuki Takashi, Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki, Watanabe Kazunori

    PLOS ONE   14 巻 ( 1 )   2019年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0211505

    Web of Science

  26. Photo-regulatable DNA isothermal amplification by template-mediated ligation 査読有り

    Cheng Bohao, Kashida Hiromu, Shimada Naohiko, Maruyama Atsushi, Asanuma Hiroyuki

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   55 巻 ( 8 ) 頁: 1080-1083   2019年1月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c8cc09218d

    Web of Science

  27. The Use of Serinol Nucleic Acids as Ultrasensitive Molecular Beacons 招待有り 査読有り

    Murayama Keiji, Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki

    NON-NATURAL NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS   1973 巻   頁: 261-279   2019年

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/978-1-4939-9216-4_17

    Web of Science

  28. Quantitative evaluation of energy migration between identical chromophores enabled by breaking symmetry 査読有り

    Kashida Hiromu, Kawai Hayato, Maruyama Ryoko, Kokubo Yuta, Araki Yasuyuki, Wada Takehiko, Asanuma Hiroyuki

    COMMUNICATIONS CHEMISTRY   1 巻   2018年12月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s42004-018-0093-0

    Web of Science

  29. The DNA Duplex as an Aqueous One-Dimensional Soft Crystal Scaffold for Photochemistry 招待有り 査読有り

    Asanuma Hiroyuki, Murayama Keiji, Kamiya Yukiko, Kashida Hiromu

    BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN   91 巻 ( 12 ) 頁: 1739-1748   2018年12月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1246/bcsj.20180278

    Web of Science

  30. Development of Visible-Light-Responsive RNA Scissors Based on a 10-23 DNAzyme 査読有り

    Kamiya Yukiko, Arimura Yu, Ooi Hideaki, Kato Kenjiro, Liang Xing-Guo, Asanuma Hiroyuki

    CHEMBIOCHEM   19 巻 ( 12 ) 頁: 1305 - 1311   2018年6月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201800020

    Web of Science

  31. DNA Microcapsule for Photo-Triggered Drug Release Systems

    Kamiya Yukiko, Yamada Yoshinobu, Muro Takahiro, Matsuura Kazunori, Asanuma Hiroyuki

    CHEMMEDCHEM   12 巻 ( 24 ) 頁: 2016-2021   2017年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cmdc.201700512

    Web of Science

  32. Introduction of 2,6-Diaminopurines into Serinol Nucleic Acid Improves Anti-miRNA Performance 査読有り

    Kamiya Yukiko, Donoshita Yuka, Kamimoto Hiroshi, Murayama Keiji, Ariyoshi Jumpei, Asanuma Hiroyuki

    CHEMBIOCHEM   18 巻 ( 19 ) 頁: 1917-1922   2017年10月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201700272

    Web of Science

  33. Chaperone-Polymer-Assisted, Photodriven DNA Strand Displacement

    Cheng Bohao, Kashida Hiromu, Shimada Naohiko, Maruyama Atsushi, Asanuma Hiroyuki

    CHEMBIOCHEM   18 巻 ( 16 ) 頁: 1568-1572   2017年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201700202

    Web of Science

  34. D-aTNA Circuit Orthogonal to DNA Can Be Operated by RNA Input via SNA

    Murayama Keiji, Nagao Ryuya, Asanuma Hiroyuki

    CHEMISTRYSELECT   2 巻 ( 20 ) 頁: 5624-5627   2017年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/slct.201701126

    Web of Science

  35. Antisense oligonucleotide modified with serinol nucleic acid (SNA) induces exon skipping in mdx myotubes 査読有り

    Le, B. T.; Murayama, K.; Shabanpoor, F.; Asanuma, H.; Veedu, R. N.

    RSC Advances   7 巻   頁: 34049-34052   2017年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: DOI: 10.1039/c7ra06091b

  36. 光応答性DNAの開発―ナノ環境を汚染しない分子マシンへの応用― 招待有り

    浅沼浩之

    現代化学   556 巻 ( 7 ) 頁: 50-55   2017年7月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語  

  37. DNA二重鎖の高い安定性と直交性をもつ疑似塩基対の開発 招待有り 査読有り

    樫田啓、浅沼浩之

    高分子論文集   74 巻 ( 4 ) 頁: 257-264   2017年7月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語  

  38. Orientation-dependent FRET system reveals differences in structures and flexibilities of nicked and gapped DNA duplexes

    Kashida Hiromu, Kurihara Ayako, Kawai Hayato, Asanuma Hiroyuki

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   45 巻 ( 11 )   2017年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gkx200

    Web of Science

  39. Development of pseudo base-pairs on D-threoninol which exhibit various functions 招待有り 査読有り

    Kashida, H.; Asanuma, H.

    Bull. Chem. Soc. Jpn.   90 巻   頁: 475   2017年5月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  40. Design of photo-functional oligonucleotide by "copolymerization" of natural nucleobases with base-surrogate prepared from acyclic scaffold 招待有り 査読有り

    Asanuma, H.; Murayama, K.; Kamiya, Y.; Kashida, H.

    Polymer J.   49 巻   頁: 279-289   2017年3月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    DOI: doi:10.1038/pj.2016.120

  41. DNA二重鎖による色素会合体の精密位置配向制御と光化学への展開 招待有り 査読有り

    浅沼浩之、樫田啓

    固体物理   52 巻 ( 3 ) 頁: 149-158   2017年3月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語  

  42. Effect of Methyl Group on Acyclic Serinol Scaffold for Tethering Dyes on the DNA Duplex Stability

    Murayama Keiji, Asanuma Hiroyuki

    CHEMBIOCHEM   18 巻 ( 1 ) 頁: 142-149   2017年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201600558

    Web of Science

  43. Orientation-dependent FRET system reveals differences in structures and flexibilities of nicked and gapped DNA duplexes 査読有り

    Kashida, H.; Kurihara, A.; Kawai, H.; Asanuma, H.

    Nucleic Acids Res.   45 巻 ( 11 ) 頁: e105   2017年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  44. Antisense oligonucleotide modified with serinol nucleic acid (SNA) induces exon skipping in mdx myotubes

    Le Bao T., Murayama Keiji, Shabanpoor Fazel, Asanuma Hiroyuki, Veedu Rakesh N.

    RSC ADVANCES   7 巻 ( 54 ) 頁: 34049-34052   2017年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c7ra06091b

    Web of Science

  45. Development of Pseudo Base Pairs Which Show High DNA Duplex Stabilities and Orthogonality

    Kashida Hiromu, Asanuma Hiroyuki

    KOBUNSHI RONBUNSHU   74 巻 ( 4 ) 頁: 257-264   2017年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1295/koron.2017-0009

    Web of Science

  46. 天然に存在しない非環状構造の核酸アナログ-人工の非環状骨格で神の設計した環状骨格に挑む 招待有り

    村山恵司、浅沼浩之

    化学   71 巻 ( 3 ) 頁: 66-67   2016年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語  

  47. Acyclic artificial nucleic acids with phosphodiester bonds exhibit unique functions 招待有り 査読有り

    H. Kashida, K. Murayama, H. Asanuma

    Polymer J.   48 巻   頁: 781-786   2016年

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    記述言語:英語  

  48. A stem-less probe using spontaneous pairing between Cy3 and quencher for RNA detection 招待有り 査読有り

    Kashida, H., Morimoto, K., Asanuma, H.

    Sci. Technol. Adv. Mater.   17 巻   頁: 267-273   2016年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  49. Faint electric treatment-induced rapid endosomal escape for efficient delivery of functional macromolecules into the cytoplasm 査読有り

    Hasan, M., Nishimoto, A., Ohgita, T., Hama, S., Kashida, H., Asanuma, H., Kogure, K.

    J. Control. Release   228 巻   頁: 20-25   2016年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  50. Visible Light-Triggered Crosslinking of DNA Duplex by Reversible [2+2] Photocycloaddition of Styrylpyrene 査読有り

    Doi, T., Kawai, H., Murayama, K., Kashida, H., Asanuma, H.

    Chem. Eur. J.     頁: 0000-0000   2016年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 0000-0000

  51. Strand-invading linear probe combined with unmodified PNA 査読有り

    Aasanuma, H., Niwa, R., Akahane, M., Murayama, K., Kashida, H., Kamiya, Y.

    Bioorg. Med. Chem.     2016年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: DOI:10.1016/j.bmc.2016.06.055

  52. Dynamics of Inter-DNA Chain Interaction of Photoresponsive DNA 査読有り

    Nakasone, Y., Ooi, H., Kamiya, Y., Asanuma, H., Terazima, M.

    J. Am. Chem. Soc.     頁: 0000-0000   2016年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  53. 新規人工核酸SNAを用いたRNAイメージング 招待有り

    樫田 啓、村山恵司、浅沼浩之

    生体の科学   66 巻 ( 2 ) 頁: 145-150   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語  

  54. Reversible photo-switching of DNA fuction with azobenzene-tethered DNA 招待有り

    Y. Kamiya, H. Asanuma

    The Glen Report   27 巻   頁: 1-3   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  55. Pre-organized guide RNA in Cas9 complex is ready for selection of the target double-stranded DNA 招待有り 査読有り

    Y. Kamiya, H. Asanuma

    ChemBioChem   16 巻   頁: 2273-2275   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  56. Terminus-free siRNA prepared by photo-crosslinking activated via slicing by Ago2 査読有り

    Y. Kamiya, K. Iishiba,T. Doi, K. Tsuda, H. Kashida, H. Asanuma,

    Biomater. Sci.   3 巻   頁: 1534-1538   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  57. Azobenzene C-nucleosides for photo-controlled hybridization of DNA at room temperature 査読有り

    T. Goldau, K. Murayama, C. Brieke, H. Asanuma, A. Heckel

    Chem. Eur. J.   21 巻   頁: 17870-17876   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: DOI: 10.1002/chem.201503303

  58. Hetero-Selective DNA-like Duplex Stabilized by Donor-Acceptor Interaction 査読有り

    T. Doi, T. Sakakibara,H. Kashida, Y. Araki, T. Wada, H. Asanuma

    Chem. Eur. J.   21 巻   頁: 15974-15980   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: DOI: 10.1002/chem.201502653

  59. Ultra-Sensitive Molecular Beacon Designed with Totally Serinol Nucleic Acid (SNA) for Monitoring mRNA in Cell 招待有り 査読有り

    K. Murayama, Y. Kamiya, H. Kashida, H. Asanuma

    ChemBioChem   16 巻   頁: 1298-1301   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: DOI: 10.1002/cbic.201500167

  60. Molecular design of Cy3 derivative for highly sensitive in-stem molecular beacon and its application to the wash-free FISH 査読有り

    H. Kashida, T. Osawa, K. Morimoto, Y. Kamiya, H. Asanuma

    Bioorg. Med. Chem.   23 巻   頁: 1758-1762   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  61. Efficiency of [2+2] photodimerization of various stilbene derivatives within the DNA duplex scaffold 査読有り

    T. Doi, H. Kashida, H. Asanuma

    Org. Biomol. Chem.   13 巻   頁: 4430-4437   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  62. Highly sensitive and robust linear probe for detection of mRNA in cells 査読有り

    H. Asanuma, M. Akahane, R. Niwa, H. Kashida, Y. Kamiya

    Angew. Chem. Int. Ed.   54 巻   頁: 4315-4319   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  63. Acyclic L-Threoninol Nucleic Acid (L-aTNA) with Suitable Structural Rigidity Cross-pairs with DNA and RNA 査読有り

    K. Murayama, H. Kashida, H. Asanuma,

    Chem. Commun.   51 巻   頁: 6500-6503   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  64. Reversible photoswitching of RNA hybridization at room temperature with an azobenzene C-nucleoside 査読有り

    T. Goldau, K. Murayama, C. Brieke, S. Steinwand, P. Mondal, M. Biswas, I. Burghardt, J. Wachtveitl, H. Asanuma, A. Heckel

    Chem. Eur. J.   21 巻   頁: 2845-2854   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  65. Synthetic gene involving azobenzene-tethered T7 promoter for the photocontrol of gene expression by visible light 査読有り

    Y. Kamiya, T. Takagi, H. Ooi, H. Ito, X.G. Liang, H. Asanuma,

    ACS Synth. Biol.   4 巻   頁: 365-370   2015年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  66. DNA二重鎖を足場とした配向依存的FRET 招待有り

    浅沼浩之、栗原綾子、樫田啓

    光化学   45 巻   頁: 146-147   2014年12月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  67. Light-driven DNA nanomachine with a photoresponsive molecular engine 招待有り 査読有り

    Kamiya, Y.; Asanuma, H.

    Accounts of Chemical Research   47 巻   頁: 1663-1672   2014年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  68. De Novo Design of Functional Oligonucleotides with Acyclic Scaffolds 招待有り 査読有り

    Asanuma, H.; Kashida, H.; Kamiya, Y.

    Chem. Rec.     2014年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    DOI: DOI:10.1002/tcr.201402040

  69. Enhancement of stability and activity of siRNA by terminal substitution with Serinol Nucleic Acid (SNA) 査読有り

    Y. Kamiya, J. Takai, H. Ito, K. Murayama, H. Kashida, H. Asanuma.

    ChemBioChem   15 巻   頁: 2549-2555   2014年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  70. Highly specific DNA detection from massive background nucleic acids based on rolling circle amplification of target dsDNA 査読有り

    X. Wang, X. Yu, X. Wand, M. Suzuki, H. Asanuma, P. Dong, W. Wu, X.G. Liang,

    RSC Adv.   4 巻   頁: 38293-38299   2014年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  71. Selective labeling of mature RISC using siRNA carrying fluorophore-quencher pair 査読有り

    Kamiya, Y.; Ito, A.; Ito, H.; Urushihara, M.; Takai, J.; Fujii, T.; Liang, X.G.; Kashida, H.; Asanuma, H.

    Chem. Sci.     2013年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: DOI:10.1039/C3SC51197A

  72. A "sugar-deficient" G-quadruplex: incorporation of aTNA in G4 structures 査読有り

    Zhou, J.; Murayama, K.; Amrane, S.; Kashida, H.; Bourdoncle, A.; Asanuma, H.; Mergny, J. L.

    Chem. Sci.   4 巻   頁: 3693-3698   2013年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  73. Highly stable duplex formation by artificial nucleic acids aTNA and SNA with acyclic scaffolds 査読有り

    Murayama, K.; Tanaka, Y.; Toda, T.; Kashida, H.; Asanuma, H.

    Chem. Eur. J.     2013年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/chem.201301578

  74. p-Stilbazole moieties as artificial base pairs for photocrosslinking of DNA duplex 査読有り

    Kashida, H.; Doi, T.; Sakakibara, T.; Hayashi, T.; Asanuma, H.

    J. Am. Chem. Soc.   135 巻   頁: 7960-7966   2013年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  75. Evaluation of intrinsic spectroscopic properties of chromophore assemblies by shielding with cyclohexyl base pairs within a DNA duplex 査読有り

    Kashida, H.; Higashiyama, N.; Kato, T.; Asanuma, H.

    Bioorg. Med. Chem.     2013年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2013.04.032

  76. Photoswitch nucleic acid catalytic activity by regulating topological structure with a universal supra-photoswitch 査読有り

    Liang, X.G.; Zhou, M.G.; Kato, K.; Asanuma, H.

    ACS Synth. Biol   2 巻   頁: 194-202   2013年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  77. Development of a robust model system of FRET using base-surrogates tethering fluorophores for strict control of their position and orientation within DNA duplex 査読有り

    Kato, T.; Kashida, H.; Kishida, H.; Yada, H.; Okamoto, H.; Asanuma, H.

    J. Am. Chem. Soc.   135 巻   頁: 741-750   2013年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  78. Quencher-free linear probe with multiple fluorophores on acyclic scaffold 査読有り

    Asanuma, H.; Akahane, M.; Kondo, N.; Osawa, T.; Kato, T.; Kashida, H.

    Chem. Sci.     頁: in press   2012年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  79. Reversed assembling of dyes in RNA duplex compared with those in DNA 査読有り

    Fujii, T.; Urushihara, M.; Kashida, H.; Ito, H.; Liang, X.G.; Yagi-Utsumi, M.; Kato, K.; Asanuma, H.

    Chem. Eur. J.     頁: in press   2012年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  80. Bulge-like asymmetric hetero dye-clustering in DNA duplex results in efficient quenching of background emission based on the maximized excitonic interaction 査読有り

    Fujii, T.; Hara, Y.; Osawa, T.; Kashida, H.; Liang, X.G.; Yoshida, Y.; Asanuma, H.

    Chem. Eur. J.     頁: in press   2012年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  81. Quencher-free molecular beacon tethering 7-hydroxycoumarin detects targets through protonation/deprotonation 査読有り

    Kashida, H.; Yamaguchi K.; Hara, Y.; Asanuma, H.

    Bioorg. Med. Chem.   20 巻   頁: 4310-4315   2012年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  82. Coherent Interactions of Dyes Assembled on DNA 招待有り 査読有り

    Asanuma, H.; Fujii, T.; Kato, T.; Kashida, H.

    J. Photochem. Photobiol. C   13 巻   頁: 1065-1084   2012年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  83. Preparation of supramolecular chromophoric assemblies using a DNA duplex 招待有り 査読有り

    Kashida, H.; Asanuma, H.

    Phys. Chem. Chem. Phys.   14 巻   頁: 7196-7204   2012年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  84. Design of an Artificial Functional Nanomaterial with High Recognition Ability 招待有り 査読有り

    Liang, X. G.; Mochizuki, T.; Fujii, T.; Kashida, H.; Asanuma, H.

    Natural Computing   11 巻   頁: 231-238   2012年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  85. Polycation-chaperoned in-stem molecular beacon system 査読有り

    Asanuma, H.; Osawa, T.; Kashida, H.; Fujii, T.; Liang, X. G.; Niwa, K.; Yoshida, Y.; Shimada, N.; Maruyama, A

    Chem. Commun.   48 巻   頁: 1760-1762   2012年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  86. A model of elongation of short DNA sequence by thermophilic DNA polymerase under isothermal conditions 査読有り

    Kato, T.; Liang, X. G.; Asanuma, H.

    Biochemistry   51 巻   頁: 7846-7853   2012年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  87. Preparation of photoresponsive DNA tethering ortho-methylated azobenzene as a supraphotoswitch 招待有り 査読有り

    Asanuma, H.; Nishioka, H.; Ishikawa, T.; Liang, X. G.

    Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry     頁: accepted   2011年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  88. Detection of three-base deletion by exciplex formation with perylene derivatives 査読有り

    Kashida, H.; Kondo, N.; Sekiguchi, K.; Asanuma, H.

    Chem. Commun.     頁: accepted   2011年7月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  89. Control of the Chirality and Helicity of Oligomers of Serinol Nucleic Acid (SNA) by Sequence Design 査読有り

    Kashida, H.; Murayama, K.; Toda, T.; Asanuma, H.

    Angew. Chem. Int. Ed.,   50 巻   頁: 1285-1288   2011年3月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  90. Cationic dye-triplet as unique "glue" that can connect full-matched termini of the duplexes 査読有り

    Kashida, H.; Hayashi, T.; Fujii, T.; Asanuma, H.

    Chem. Eur. J.   17 巻   頁: 2614-2622   2011年2月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  91. Improvement of RNAi activity and strand-selectivity of RISC formation by modified siRNA involving intercalators near 5'-termini 査読有り

    Hiroshi Ito, Masaaki Urushihara, Xingguo Liang, Hiroyuki Asanuma

    ChemBioChem     頁: ***-***   2011年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  92. Photon-fueled DNA nanodevice carrying two different photoswitches 査読有り

    Hidenori Nishioka, Xingguo Liang, Tomohiro Kato, Hiroyuki Asanuma

    Angew. Chem. Int. Ed.     頁: ***-***   2011年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  93. Cyclohexyl "base pairs" stabilize duplexes and intensify pyrene fluorescence by shielding it from natural base pairs 査読有り

    Kashida, H.; Sekiguchi, K.; Higashiyama, N.; Kato, T.; Asanuma, H.

    Org. Biomol. Chem.     頁: ***-***   2011年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  94. Ultrafast photoisomerization and its single-shot pump pulse efficiency of trans-azobenzene derivative: Compound for photosensitive DNA 査読有り

    T. Chen, A. Yamaguchi, K. Igarashi, N. Nakagawa, H. Nishioka, H. Asanuma, M. Yamashita

    Opt. Commun.     2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.optcom.2011.10.032

  95. Femtosecond photoisomerization of azobenzene-derivative binding to DNA 査読有り

    T. Chen, K. Igarashi, N. Nakagawa, K. Yamane, T. Fujii, H. Asanuma, M. Yamashita

    J. Photochem. Photobiol. A   223 巻   頁: 119-123   2011年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  96. Nick Sealing by T4 DNA Ligase on a Modified DNA Template Tethering a Functional Molecule on D-Threoninol 査読有り

    Liang Xingguo, Kenta Fujioka, Hiroyuki Asanuma

    Chem. Eur. J.   17 巻   頁: 10388-10396   2011年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  97. An interstrand-wedged duplex composed of alternating DNA base pairs and covalently attached intercalators 査読有り

    Liang, X.G.; Nishioka H.; Mochizuki, T.; Asanuma, H.

    J. Mater. Chem.   20 巻   頁: 575-581   2010年1月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    An interstrand-wedged duplex involving alternating base pairs and covalently attached intercalators via D-threoninols was constructed. In this novel duplex structure, natural DNA base pairs and artificially introduced planar molecules such as azobenzene derivatives are lined up one by one. Although each base pair is sandwiched by two intercalators and vice versa, the duplex is extremely stable compared with the corresponding native DNA duplex.

  98. An efficient FRET between pyrene and perylene assembled in a DNA duplex and its potential for discriminating single base changes 査読有り

    Kashida, H.; Takatsu,T.; Sekiguchi, K.; H. Asanuma

    Chem. Eur. J.   16 巻   頁: 2479-2486   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In order to increase the apparent Stokes' shift of perylene, pyrene (donor) and perylene (acceptor) were assembled in a DNA duplex to achieve the efficient fluorescence resonance energy transfer (FRET) from pyrene to perylene. Multiple donors were introduced in the vicinity of acceptors via D-threoninol and natural base pairs were inserted between the dyes. Accordingly, donors and acceptors could be accumulated inside the DNA without forming undesired excimer/exciplex. When two pyrene moieties were located in proximity to one perylene with one base pair inserted between them, efficient FRET occurred within the duplex. Thus, strong emission at 460 nm was observed from perylene when excited at 345 nm where pyrene has its absorption. The apparent Stokes' shift became as large as 115 nm with a high apparent FRET efficiency.

  99. Construction of photoresponsive RNA for photoswitching RNA hybridization 査読有り

    Ito, H.; Liang, X.G.; Nishioka, H.; Asanuma, H.

    Org. Biomol. Chem.     頁: in press   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  100. Robust and photo-controllable DNA capsules using azobenzenes 査読有り

    Tanaka, F.; Mochizuki, T.; Liang, X.G.; Asanuma, H.; Tanaka, S.; Suzuki, K.; Kitamura, S.; Nishikawa, A.; Ui-Tei, K.; Hagiya, M

    Nano Lett.   10 巻   頁: 3560-3565   2010年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  101. Unexpectedly stable artificial duplex from flexible acyclic threoninol. 査読有り

    Asanuma, H.; Toda, T.; Murayama, K.; Liang, X.G.; Kashida, H.

    J. Am. Chem. Soc.   132 巻   頁: 14702-14703   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  102. Insulator base pairs for lighting-up perylenediimide in a DNA duplex 査読有り

    Hiromu Kashida,Koji Sekiguchi,and Hiroyuki Asanuma

    Chem. Eur. J.   16 巻   頁: 11554-11557   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Perylenediimide (PDI) is highly quenched by nucleobases, which greatly restricts its application as a fluorescent probe. Here, we propose “insulator base pairs" tethering cyclohexane ring through D-threoninol. When “insulator base pairs" were inserted between PDI and nucleobases, the quantum yield of PDI drastically increased several thousand-fold. The “insulator base pairs" reported here also have the potential to increase the quantum yields of other fluorophores.

  103. Coherent Quenching of a Fluorophore for the Design of a Highly Sensitive In-Stem Molecular Beacon. 査読有り

    Yuichi Hara, Taiga Fujii, Hiromu Kashida, Koji Sekiguchi, Xingguo Liang, Kosuke Niwa, Tomokazu Takase, Yasuko Yoshida, and Hiroyuki Asanuma

    Angew. Chem. Int. Ed.   49 巻   頁: 5502-5506   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Excitonic interaction (coherency) was utilized to design a highly sensitive In-Stem molecular beacon (ISMB) in which both a fluorophore and a quencher on D-threoninols are incorporated into the stem region as a pseudo “base-pair". A systematic study indicated that minimization of the difference of max between the fluorophore and the quencher maximized quenching efficiency due to maximization of coherency. A highly sensitive ISMB could be prepared using the excitonically optimized pair of Cy3 and modified Methyl Red.

  104. Accumulation of fluorophores into DNA duplexes to mimic the properties of quantum dots 査読有り

    Hiromu Kashida, Koji Sekiguchi, Xingguo Liang, Hiroyuki Asanuma

    J. Am. Chem. Soc.   132 巻   頁: 6223-6230   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    By using perylene and pyrene as fluorophores, we have designed various fluorophore assemblies that mimic inorganic quantum dots in showing a high emission intensity, a large Stokes' shift, and a modulated emission maximum. For this purpose, we utilized two kinds of duplex motifs with D-threoninols as scaffolds: cluster and interstrand-wedged motifs. In the cluster motif, fluorophores are introduced into both strands to produce tentative pseudo-“base-pairs", in which the dyes strongly interact with each other and form dimers, trimers or hexamers. In the interstrand-wedged motif, a base-pair is inserted between the fluorophores to suppress their direct interaction. These two motifs were applied to accumulate dyes within a DNA duplex depending on their emission properties. Since pyrene exhibits strong excimer emission, the emission at 500 nm of a pyrene cluster motif strongly increased as the number of accumulated dyes increased, whereas interstrand-wedged motif quenched pyrene monomer emission. In contrast, assembled perylenes, which are mostly quenched by dimerization, showed intense monomer emission in the interstrand-wedged motif whereas perylene cluster motifs strongly suppressed perylene emission. These two motifs were then applied to the hetero-assembly of pyrenes and perylenes. Both a large Stokes' shift and a modulation of the emission maximum, which are also characteristics of inorganic quantum dots, were successfully realized using fluorescent resonance energy transfer (FRET) and exciplex formation. These fluorophore assemblies thus obtained could be enzymatically ligated to longer DNA, demonstrating that this technique has the potential to be a versatile labeling agent for biomolecules.

  105. *Photoregulation of DNA transcription by using photoresponsive T7 promoter and clarification of its mechanism 査読有り

    Xingguo Lianga, Ryuji Wakuta, Kenta Fujioka, Hiroyuki Asanuma

    FEBS Journal   277 巻   頁: 1551-1561   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Using photoresponsive T7 promoters tethering two 2-methylazobenzenes or 2,6-dimethylazobenzenes, highly efficient photoregulation of DNA transcription was attained. Under UV-A irradiation (320-400 nm), the rate of transcription with T7 RNA polymerase and a photoresponsive promoter involving two 2,6-dimethylazobenzenes was 10-fold faster than that after visible light irradiation (400-600 nm). By attaching a non-modified azobenzene (Azo) and 2,6-dimethylazobenzene (DM-azo) at the two positions, respectively, and by utilizing the different cis-to-trans thermal stability between cis Azo and cis DM-azo, four species of T7 promoter (cis-cis, trans-cis, cis-trans, and trans-trans) were obtained. The four species showed transcriptional activity in the order of cis-cis > cis-trans > trans-cis > trans-trans. Kinetic analysis revealed that the Km for the cis-cis promoter (both of the introduced azobenzene derivatives were in the cis form) and T7 RNA polymerase was 68 times larger than that of the trans-trans form, indicating that high photoregulatory efficiency was mainly due to a remarkable difference in affinity with RNA polymerase. The present approach is promising for the creation of biological tools for artificially controlling gene expression, and as a photo-controlled system for supplying RNA fuel for RNA-powered molecular nanomachines.

  106. *A light-driven DNA nanomachine for efficiently photoswitching RNA digestion 査読有り

    Zhou M.G.; Liang, X.G.; Mochizuki, T.; Asanuma, H.

    Angew. Chem. Int. Ed.   49 巻   頁: 2167-2170   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A machine-like photoresponsive DNA enzyme was constructed that can work for us at a single molecule level. The complete ON-OFF photoswitching of RNA digestion was realized by photoregulating the topological structure of DNAzyme/RNA complex. The interstrand-wedged duplex was used as the supra-photoswitch.

  107. Effect of the ortho modification of azobenzene on the photoregulatory efficiency of DNA hybridization and thermal stability of its cis-form 査読有り

    Nishioka H.; Liang, X.G.; Asanuma, H.

    Chem. Eur. J.   16 巻   頁: 2054-2062   2010年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We synthesized various azobenzenes methylated at their ortho-positions with respect to the azo bond for more effective photoregulation of DNA hybridization. Photoregulatory efficiency, evaluated from the change of Tm (Tm) induced by trans-cis isom-erization, was significantly improved for all ortho-modified azobenzenes compared with non-modified azoben-zene due to the more stabilized trans-form and more destabilized cis-form. Among the synthesized azobenzenes, 4-carboxy-2,6-dimethylazobenzene (2,6-Me-Azo), in which two ortho-positions of the distal benzene ring with respect to carboxyl group were methy-lated, exhibited the largest Tm, whereas newly synthesized 2,6-Me-Azo (4-carboxy-2,6-dimethylazobenzene), which possesses two methyl groups on the two ortho-positions of the other benzene ring, showed moderate im-provement of Tm.

  108. Line up base pairs and intercalators one by one in a stable duplex

    Liang, X.G.; Mochizuki T.; Nishioka H.; Asanuma, H.

    Nucleic Acids Symp. Ser.   53 巻   頁: 189-190   2009年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    A stable double helix involving alternating base pairs and azobenzene moieties was constructed. In this supramolecule, base pairs and azobenzenes are lined up one by one to form an interstrand-wedged motif: each base pair is sandwiched with two azobenzenes, and each azobenzene intercalates between two base pairs. This motif was formed by the hybridization of two modified DNA tethering multiple azobenzene moieties at a frequency of one azobenzene for every two nucleotides. Furthermore, this structure could be simply dismantled by UV light irradiation and reformed with the irradiation of visible light. By using this new duplex motif, construction of a variety of photoresponsive nanostructures and nanodevices is highly expected.

  109. Efficient energy transfer from pyrene to perylene assembled inside DNA duplex

    Kashida, H.; Takatsu, T.; Asanuma, H.

    Nucleic Acids Symp. Ser.,   53 巻   頁: 29-30   2009年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    Pyrene (donor) and perylene (acceptor) were assembled in a DNA duplex to increase the apparent Stokes' shift of perylene. Plural Multiple donors were introduced in the vicinity of acceptors via D-threoninol and natural base pairs were inserted between donors and acceptors in order to suppress undesired interactions between them. When two pyrene moieties were located in proximity to one perylene with one base pair inserted between them, efficient FRET occurred within the duplex. Thus, strong emission at 495 nm was observed from perylene when excited at 345 nm where pyrene has its absorption. The apparent Stokes' shift became as large as 115 nm with a high FRET efficiency (>1). However, the introduction of more than two pyrenes did not enhance the fluorescence intensity of perylene, due to the short Förster radius (R0) of the donor pyrene.

  110. *Analysis of Coherent Heteroclustering of Different Dyes by Use of Threoninol-Nucleotides for Comparison with the Molecular Exciton Theory 査読有り

    Taiga Fujii, Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma

    Chem. Eur. J.   15 巻   頁: 10092-10102   2009年10月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    To test the molecular exciton theory for heterodimeric chromophores, various heterodimers and clusters, in which two different dyes were stacked alternately, were prepared by hybridizing two oligodeoxyribo-nucleotides (ODNs), each of which tethered a different dye on D-threoninol at the center of the strand. NMR analyses revealed that two different dyes from each strand were stacked antiparallel to each other in the duplex, and were located adjacent to the 5'-side of a natural nucleobase. Spectroscopic behaviors of these heterodimers were systematically examined as a function of the difference in the wavelength of the dye absorption maxima (max). We found that the absorption spectrum of the heterodimer was significantly different from that of the simple sum of each monomeric dye in the single-strand. When azobenzene and Methyl Red, which have max at 336 nm and 480 nm in the single-strand, respectively, (max = 144 nm), were assembled on ODNs, the band derived from azobenzene exhibited a small hyperchromism whereas the band from Methyl Red showed hypochromism and both bands shifted to a longer wavelength (bathochromism). These hyper- and hypochromisms were further enhanced in a heterodimer derived from 4'-methylthioazobenzene and Methyl Red that had a much smaller max (82 nm) (max = 398 and 480 nm in the single-strand, respectively). With a combination of 4'-dimethylamino-2-nitroazobenzene and Methyl Red, which had an even smaller max (33 nm), a single sharp absorption band that was apparently different from the sum of the single-stranded spectra was observed. These changes in the intensity of the absorption band could be explained by the molecular exciton theory that has been mainly applied to the spectral behavior of H- and/or J-aggregates composed of homo dyes. However, the bathochromic band shifts observed at shorter wavelengths did not agree with the hypsochromism predicted by the

  111. *In-Stem Molecular Beacon containing a Pseudo Base Pair of Threoninol Nucleotides for Removal of Background Emission 査読有り

    Hiromu Kashida, Tomohiko Takatsu, Taiga Fujii, Koji Sekiguchi, Xingguo Liang, Kosuke Niwa, Tomokazu Takase, Yasuko Yoshida, and Hiroyuki Asanuma

    Angew. Chem. Int. Ed.   48 巻   頁: 7044-7047   2009年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    An in-stem molecular beacon (IS-MB), which tethers perylene and anthraquinone in the stem region via D-threoninol, effectively detected target sequences. This design of IS-MB is also applicable to the discrimination of a one-base deletion mutant from wild type (full-match) without background emission.

  112. Photoisomerization dynamics study on cis-azobenzene derivative using ultraviolet-to-visible tunable femtosecond pulses 査読有り

    Yamaguchi, N.; Nagasawa, N.; Igarashi, K.; Sekikawa, T.; Asanuma, H.; Yamashita, M.

    Appl. Surf. Sci.   255 巻   頁: 9864-9868   2009年7月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We performed the transient absorption measurement and the first rate equation (RE) analysis for cis isomer of 4-carboxy-20,60-dimethylazobenzene to clarify the quantitative difference between the photoisomerization process and the thermal relaxation process from the SC
    1 excited state. The RE analysis enabled us to determine the cis-to-trans photoisomerization rate per each pump pulse to be 3% under the condition of the 430 nm, 150 fs pump pulse with energy of 200 nJ. Moreover, the signal due to the yielded trans molecules appearing in the transient absorption was assigned from the following observed result: the transient absorbance change at the 380 nm probe mostly decreased within 300 fs after the 430 nm pulse pumping and then slowly decreased to zero, while the absorbance change at the 350 nm probe had a positive constant component in the over one picosecond time region. The RE analysis showed
    that this constant component is due to the yielded transmolecules, and its positive value is due to the fact
    that the absorption cross-section of the ST 0 -to- ST
    2 transition in their trans molecules is larger than that of
    the SC0 -to- SC 2 transition in the original cis molecules.

  113. Positively charged base surrogate for highly stable “base-pairing" through electrostatic and stacking interactions. 査読有り

    Hiromu Kashida, Hidehiro Ito, Taiga Fujii, Takamitsu Hayashi, Hiroyuki Asanuma

    J. Am. Chem. Soc.   131 巻   頁: 9928-9930   2009年7月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    “Base pairs" of cationic dyes (p-methylstilbazole) were incorporated into oligodeoxyribonucleotides (ODNs). This “base pair" greatly stabilized the duplex through electrostatic and stacking interactions. The melting temperature of modified ODN was higher than those of neutral dyes and native base pairs. Further stabilization of the duplex was observed when the number of cationic dyes increased.

  114. *A Supra-Photoswitch Involving Sandwiched DNA Base Pairs and Azobenzenes for Light-Driven Nanostructures and Nanodevices 査読有り

    Liang, X.G.; Mochizuki, T.; Asanuma, H.

    Small   5 巻 ( 15 ) 頁: 1761-1768   2009年6月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A supra-photoswitch was designed for complete ON / OFF switching of DNA hybridization by light irradiation for the purpose of using DNA as a material for building nanostructures. Azobenzenes, attached to D-threoninols that function as scaffolds, were introduced into each DNA strand after every two natural nucleotides (in the form (NNX)n where N and X represent the natural nucleotide and the azobenzene moiety, respectively). Hybridization of these two modified strands formed a supra-photoswitch consisting of alternating natural base pairs and azobenzene moieties. In this newly designed sequence, each base pair is sandwiched between two azobenzene moieties and all the azobenzene moieties are separated by base pairs. When the duplex is irradiated by visible light, the azobenzene moieties take the trans form and this duplex is surprisingly stable compared to the corresponding native duplex composed of only natural oligonucleotides. On the other hand, when the azobenzene moieties are isomerized to the cis form by UV light irradiation, the duplex is completely dissociated. Based on this design, a DNA hairpin structure was synthesized that should be closed by visible light irradiation and opened by UV light irradiation at the level of a single molecule. Indeed, perfect ON-OFF photoregulation was attained. This design is a promising strategy for the design of supra-photoswitches such as photoresponsive sticky ends on DNA nano devices and other nanostructures.

  115. Construction of Photon-Fueled DNA Nanomachines by Tethering Azobenzenes as Engines 査読有り

    Liang, X.G.; Nishioka, H.; Takenaka, N.; Asanuma, H.

    Lecture Note in Computer Science   5347 巻   頁: 21-32   2009年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Nanoscale DNA tweezers operated by photo-irradiation were constructed by using azobenzene-modified DNA as materials. The azobenzenes that can photoisomerize between trans and cis form were used as the engines to open and close the tweezers. The work principle is based on the reversible photoregulation of DNA hybridization. When non-substituted azobenzene was used, the tweezers were open after UV light irradiation ((330-350 nm, cis form), and closed after visible light irradiation (440-460 nm, trans form). More interestingly, the operation reversed when an azobenzene derivative with a para-isopropyl group was used: UV light irradiation closed the tweezers and visible light irradiation opened them. As compared with the oligonucleotide-fuelled DNA machines, the nanomachines constructed here were “environment-friendly" because no dsDNA waste was produced. Furthermore, the operation can be repeated many times simply by switching the photoirradiation without any decrease of the cycling efficiency.

  116. DNAを切断するはさみ

    西岡英則、浅沼浩之

    化学   64 巻   頁: 70-71   2009年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語  

    遺伝子工学(遺伝子組み換え技術)は、1)遺伝子であるDNAの特定の位置での“裁断”、2)得られたDNA断片の、ベクターと呼ばれる遺伝子の“運び屋”への“縫製”、そして3)ベクターの細胞内への導入(形質転換)、という3つの基本技術に基づいている。この中でも1)のDNAを“裁断”する “はさみ”=制限酵素 の発見が、現在の遺伝子工学を可能にしたと言っても過言ではない。この天然由来の“はさみ”に相当する制限酵素には様々な種類が存在し、その多くは4~6塩基程度の塩基配列を認識してDNAを切断する。したがって数千塩基程度の短い遺伝子ならば、天然の制限酵素を用いることで特定の1~2箇所を切断することが可能である。しかしながら、高等生物のような巨大なゲノムDNAに対して利用すると非常に多くの断片が生じてしまう。例えば、30億塩基を持つヒトゲノムに対して6塩基しか認識しない制限酵素を利用すると、おおよそ73万 (= 30億÷46)もの断片が生じてしまうことになる。すなわち、天然の制限酵素では、高等生物のDNAを配列特異的に1箇所で切断することは不可能である。このような問題点を克服するために近年、認識配列に制限が無い人工的な “はさみ”=「人工制限酵素」に関する様々な研究が活発に行われている。ここでは、DNAを配列特異的に切断する人工制限酵素について紹介する。

  117. *Rational Design of Functional DNA with a Non-Ribose Acyclic Scaffold 招待有り 査読有り

    H. Kashida, X.G. Liang, H. Asanuma

    Current Organic Chemistry   13 巻 ( 11 ) 頁: 1065-1084   2009年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    The growing field of DNA technology requires new modified DNAs that can perform advanced functions. No matter how we optimize the length and sequence of DNA using only the four naturally occurring nucleotides, potential performance is limited. In this review, we describe a facile and effective method of rationally designing new functional DNA by focusing on acyclic scaffolds, especially threoninols, which are utilized to incorporate functional molecules into
    DNA. Wedge-type insertion of a functional molecule with a planar structure of proper size in D-threoninol to DNA does
    not destabilize the duplex, although the backbone structure is changed. Rather, intercalation offsets such distortions and significantly raises the melting temperature of the DNA duplex. Based on the wedge-type insertion, photoresponsive DNA (tethering azobenzenes) and fluorescent probes that can detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertion/
    deletion (indel) polymorphisms have been designed. Furthermore, a variety of molecular clusters of dyes have also been prepared from acyclic scaffolds tethering dyes.

  118. Glucuronidase-assisted transglycosylation for the synthesis of highly functional disaccharides: β-D-Glucuronyl 6-O-sulfo-β-D-gluco- and -β-D-Galactopyranosides 査読有り

    Nagatsuka T.; Uzawa H.; Asanuma H., Nishida, Y.

    J. Carbohydrate Chem.   28 巻   頁: 94-106   2009年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The substrate specificity of snail, limpet, and bovine glucuronidases was examined by using p-nitrophenyl glucuronide and p-nitrophenyl 6-O-sulfo-D-glycopyranosides as the glycosyl donor and acceptors, respectively. When the donor was treated with these enzymes in the absence of the acceptors, beta(1-3) glucuronyl disaccharides were obtained as the major products together with beta(1-2) isomers as the result of an enzymatic "self-transglycosylation"reaction.

  119. Modulation of pKa of Brooker's Merocyanine by DNA Hybridization 査読有り

    Kashida, H.; Sano, K.; Hara, Y.; Asanuma, H.

    Bioconjugate Chem.   20 巻   頁: 258-265   2009年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Brooker's merocyanine (BM), which changes its emission and absorption maxima upon protonation, was introduced into oligodeoxyribonucleotide (ODN) via D-threoninol by postsynthetic modification on a CPG (Controlled-Pore Glass) support. The pKa of BM in the modified ODN increased from 9.5 to 10.1 upon hybridization. As a result, absorption maxima shifted from 492 nm to 432 nm at pH 10.0 by the presence of its complementary strand. This spectral shift was sufficiently large so that DNA hybridization could easily be discriminated even by the naked eye; the color of the solution changed from orange to yellow upon hybridization. In addition, the fluorescence emission was strongly quenched upon hybridization, demonstrating that this probe can also detect the target DNA by the fluorescence change. Ratiometric detection of hybridization was also possible by simultaneous excitation of both protonated and deprotonated BMs. Furthermore, we could also modulate its pKa by the anti-parallel stacking of two BM molecules in the duplex; the pKa of BM decreased from 10.1 to 9.7 by the stacking of two BMs in an anti-parallel manner. Thus, control of the microenvironment around the BM molecule allowed modulation of its pKa, which is applicable to the sequence specific recognition of target DNA.

  120. Light driven open/close operation of an azobenzene-modified DNA nano-pincette

    Liang, X.G.; Takenaka, N.; Nishioka, H.; Asanuma, H.

    Nucleic Acids Res. Symp. Ser.   52 巻   頁: 697-698   2008年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    A photoresponsive DNA nano-pincette was constructed by using azobenzene-modified DNA as materials. When the azobenzene-modified part hybridizes with its complementary sequence on the pincette, the duplex formation closes it. On the contrary, the pincette is opened after the formed duplex dissociates. Based on reversible photoswitching of this DNA hybridization, the pincette involving non-substituted azobenzene can be opened simply by UV light irradiation and closed by visible light irradiation. Interestingly, the operation can be reversed by using para-isopropyl group substituted azobenzene: visible light opens the pincette, and UV light closes it. In both cases, the azobenzene-modified part was attached to the pincette throughout the open/close operation, which makes single molecular operation possible. Furthermore, the operation can be repeated many times without any decrease of the cycling efficiency and no DNA waste was produced.

  121. Preparation of coherent hetero clusters with threoninol scaffold.

    Fujii, T.; Kashida, H.; Asanuma, H.

    Nucleic Acids Symp. Ser.   52 巻   頁: 699-700   2008年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    New hetero aggregates where different dyes stacked alternately were prepared by hybridizing two DNAs, each of which tethered a different dye in the centre of strand. Spectral changes due to exciton coupling between different kinds of dyes were observed. Especially, hetero aggregates of Methyl Red and 2-nitro-4'-dimethylaminoazobenzene showed substantial narrowing of the band, demonstrating coherent coupling occurred in these aggregates.

  122. Incorporation of cationic dyes into DNA for distinct stabilization of duplex

    Kashida, H.; Itoh, H.; Fujii, T.; Asanuma, H.

    Nucleic Acids Symp. Ser.   2008 巻   頁: 701-702   2008年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    In this study, cationic dyes (methylstilbazole) were introduced into ODN. When two complementary ODNs, both of which tethered thise dye, were hybridized, the melting temperature drastically increased. Furthermore, The duplex was further stabilized by introducing multiple dyes.

  123. Construction of a photo-switchable gene for turning on and off gene expression with light irradiation

    Liang, X.G.; Fujioka, K.; Tsuda, Y.; Wakuda, R.; Asanuma, H.

    Nucleic Acids Res. Symp. Ser.   52 巻   頁: 19-20   2008年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    A photoresponsive GFP gene was constructed by attaching a T7 promoter that involves two azobenzene moieties as the photoswitch. The azobenzene moieties tethered on D-threoninol were inserted precisely into the sequence of T7 promoter at two positions in the non-template strand. By using azobenzene-tethered DNA as a primer, azobenzene was attached to GFP gene after PCR amplification. However, a single-stranded overhang involving azobenzene was formed because primer extension stopped at the position of azobenzene moiety. Interestingly we found that oligonucleotide complementary to the overhang could be ligated by T4 DNA ligase at the stopped position, and the intact photoresponsive T7 promoter was attached onto GFP gene. Furthermore, the in vitro expression of the constructed photoresponsive GFP gene was successfully switched on and off with light irradiation.

  124. A DNA Nanomachine Powered by Light Irradiation 査読有り

    Liang, X.G.; Takenaka, N.; Nishioka, H.; Asanuma, H.

    ChemBioChem   9 巻 ( 5 ) 頁: 702-705   2008年5月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The photoresponsive DNA tweezers as a nanomachine fuelled with photons were constructed by using azobenzene-modified DNA. The tweezers were photoswitched to be open with the UV light irradiation (335-345 nm) and to be closed with the visible light irradiation (445-455 nm) without further adding oligonucleotides as the fuel.

  125. Postsynthetic modification of DNA via threoninol on a solid support by means of allylic protection 査読有り

    Hiroyuki Asanuma, Yuichi Hara, Akira Noguchi, Kanae Sano, Hiromu Kashida

    Tetrahedron Letters   49 巻   頁: 5144-5146   2008年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We have developed a facile but versatile method to introduce functional molecules into DNA on a CPG support. Threoninol, whose amino group was protected with an (allyloxy)carbonyl (Alloc) group, was introduced into DNA via the corresponding phosphoramidite monomer. After selective deprotection of the Alloc group by treatment with palladium(0), a dye with a carboxyl group could be introduced into the DNA on the CPG support through an amide bond.

  126. Threoninol as a Scaffold of Dyes (Threoninol-nucleotide) and Their Stable Interstrand Clustering in Duplexes 査読有り

    Hiromu Kashida, Taiga Fujii, Hiroyuki Asanuma

    Org. Biomol. Chem.   6 巻 ( 16 ) 頁: 2892 - 2899   2008年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Functional molecules such as dyes (Methyl Red, azobenzene, and Naphthyl Red) were tethered on D-threoninol as base surrogates (threoninol-nucleotide), which were consecutively incorporated at the center of natural oligodeoxyribonucleotides (ODNs). Hybridization of two ODNs involving threoninol-nucleotides allowed interstrand clustering of the dyes on D-threoninol and greatly stabilized the duplex. When two complementary ODNs, both of which had tethered Methyl Reds on consecutive D-threoninols, were hybridized, the melting temperature increased proportionally to the number of Methyl Reds, due to stacking interactions. Clustering of Methyl Reds induced both hypsochromicity and narrowing of the band, demonstrating that Methyl Reds were axially stacked relative to each other (H-aggregation). Since hybridization lowered the intensity of circular dichroism peaks at the p-p* transition region of Methyl Red (300 nm – 500 nm), clustered Methyl Reds were scarcely wound in the duplex. Alternate hetero dye clusters could also be prepared only by hybridization of two ODNs with different threoninol-nucleotides, such as Methyl Red / azobenzene and Methyl Red / Naphthyl Red combinations. A combination of Methyl Red and azobenzene induced bathochromic shift and broadening of the band at the Methyl Red region due to the disturbance of exciton interaction among Methyl Reds. But interestingly, the Methyl Red and Naphthyl Red combination induced merging of each absorption band to give a single sharp band, indicating that exciton interaction occurred among the different dyes. Thus, D-threoninol can be a versatile scaffold for introducing functional molecules into DNA for their ordered clustering.

  127. Molecular Design for Reversing the Photoswitching Mode of Turning ON and OFF DNA Hybridization 査読有り

    Xingguo Liang, Nobutaka Takenaka, Hidenori Nishioka, Hiroyuki Asanuma

    Chem. Asian J.   9 巻   頁: 702-705   2008年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A new photoswitch of DNA hybridization involving para-substituted azobenzene (such as isopropyl or tert-butyl substituted one) on L-threoninol as a linker was synthesized. When visible light was irradiated to the modified DNA, the duplex was dissociated due to the destabilization effect of the bulky substituent on trans-azobenzene. In contrast, trans-to-cis isomerization (UV light irradiation) facilitated the duplex formation. The direction of this photoswitching mode was entirely reversed as compared with the previous one carrying an unmodified azobenzene on D-threoninol whose trans-form turned on the hybridization, and cis-form turned it off. Such reversed and reversible photoswitching of DNA hybridization was directly demonstrated by using fluorophore- and quencher-attached oligonucleotides. Furthermore, it was revealed that the cis-to-trans thermal isomerization was greatly suppressed in the presence of the complementary strand due to the formation of more stable duplex in cis-form.

  128. Diastereomer Separation of Azobenzene-Tethered Oligodeoxyribonucleotides and Determination of Their Absolute Configurations by Enzymatic Digestion. 査読有り

    Xingguo Liang, Makoto Komiyama, Hiroyuki Asanuma

    Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids   27 巻   頁: 332-350   2008年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Two diastereomers were produced by the introduction of azobenzene-tethering prochiral linker (2,2-bis(hydroxymethyl)propionic acid) in the modified ODN, which had been used for the photo-regulation of DNA functions. We found that this modified ODN with sequence 5¢-…pNpXpN…-3¢ (p = phosphate; N = nucleoside; X = azobenzene residue) could be digested to pX (the phosphate at the 5¢ side of X was left) by an over excess of Phosphodiesterase I. By comparing the retention time of pX from the separated diastereomer with that of authentic R- or S-pX on chiral HPLC, absolute configuration could be easily determined.

  129. Photoregulation of DNA hybridization by introducing an azobenzene: Molecular design for more stabilization of DNA duplex with cis-azobenzene than with its trans-form.

    Xingguo Liang, Nobutaka Takenaka, Hidenori Nishioka, Hiroyuki Asanuma

    Nucleic Acids Symp. Ser.   51 巻   頁: 169-170   2007年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    Previously, photoregulation of DNA hybridization was achieved by introducing nonsubstituted azobenzene via a D-threoninol linker: DNA duplex formed (ON) after visible light irradiation (planar trans-form), whereas the duplex dissociated (OFF) after UV light irradiation (non-planar cis-form). In this study, for more efficient photoregulation of DNA functions, the reverse switch that can turn on duplex formation with UV, and turn off it with visible light irradiation was designed. When para-isopropylazobenzene (p-iPrAzo) was introduced into DNA via a L-thereoninol linker, the photoswitching direction was completely reversed: the duplex involving non-planar cis-p-iPrAzo was much more stable than that involving planar trans-form.

  130. Unexpected efficient ab initio DNA synthesis at low temperature by using thermophilic DNA

    Xingguo Liang, Tomohiro Kato, Hiroyuki Asanuma

    Nucleic Acids Symp. Ser.   51 巻   頁: 351-352   2007年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    DNA was synthesized in the absence of DNA or RNA as template (or primer) from dNTPs at relatively low temperatures (25~50oC) by thermophilic Vent DNA polymerase whose proper reaction temperature for primer extension is 70~80oC. Unexpectedly, the ab initio DNA synthesis was even more efficient at 50oC as compared with that at 70oC. Interestingly, the ab initio DNA synthesis by Vent (exo-), a mutant version of Vent DNA polymerase lacking of 3¢®5¢ exonuclease activity, became much less efficient, and it could only carry out ab intio DNA synthesis after a long incubation time. This remarkable difference between Vent and Vent (exo-) indicates that the exonuclease activity domain of Vent may play an important role at the initiation step of ab initio DNA synthesis.

  131. Effective photoregulation of gene expression by photoresponsive T7 promoter

    Xingguo Liang, Ryuji Wakuda, Yuichiro Tsuda, Hidenori Nishioka, Hiroyuki Asanuma

    Nucleic Acids Symp. Ser.   51 巻   頁: 349-350   2007年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    We constructed a photoresponsive T7 promoter by tethering two 2,6-dimethyl azobenzenes (4-(2,6-dimethyl-phenlylazo)-benzoic acids) via D-threoninol linkers. Under UV light irradiation, the rate of transcription with T7 RNA polymerase (RNAP) on the photoresponsive promoter was 10-fold faster than that under visible light irradiation. Kinetic analysis revealed that Km of cis-cis-promoter (both of the introduced azobenzenes are in cis-form) with T7 RNAP was more than 60 times larger than that of trans-trans-form, indicating that the high photoregulatoryion efficiency was obtained mainly due to the remarkable difference in their affinity with RNAP. By attaching a photoresponsive promoter to the GFP gene, we also showed that photoregulation of gene expression became practicable.

  132. Development of photoresponsive RNA towards photoswitching of RNA functions

    Hiroshi Ito, Hidenori Nishioka, Xingguo Liang, Hiroyuki Asanuma

    Nucleic Acids Symp. Ser.   51 巻   頁: 171-172   2007年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    By introducing azobenzene into RNA via a D-threoninol linker, the photoresponsive RNA was developed for the photoswitching of RNA hybridization. The Tm measurements showed that RNA/RNA duplex formation and dissociation could be efficiently photoregulated. The difference in Tm between trans- and cis-form (DTm) was as large as 9~12oC when azobenzene was tethered at the central position of a 10-nt-long RNA. Interestingly, photoregulation ability of the azobenzene introduced in RNA was even greater than that in DNA for photoswitching the corresponding duplex formation. The constructed photoresponsive RNA is promising to be applied for the photoregulation of RNA functions such as Ribozyme activity, RNAi, pre-mRNA editing, and aptamer complex formation.

  133. Design of peptide nucleic acid by introduction of carbohydrate on lysine linker.

    Akira Noguchi, Hiroyuki Asanuma

      51 巻   頁: 261-262   2007年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    We synthesized “cartridge" type monomer involving mannose unit on lysine as a linker and additionally in-serted it to peptide nucleic acid (PNA) oligomer. Ad-vantage of this procedure is that functional molecule could be easily introduced into anywhere position of PNA without sacrificing base-pairs, although such in-sertion lowered stability of the duplex with DNA.

  134. ペリレンを使用した高感度DNAプローブの開発

    樫田啓、髙津智彦、浅沼浩之

      51 巻   頁: 279-280   2007年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  135. DNA-色素コンジュゲーションによるくし型へテロ会合体の調製

    藤井大雅、樫田啓、浅沼浩之

      51 巻   頁: 277-278   2007年11月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  136. Detection of genetic polymorphisms with high sensitivity by DNA-perylene conjugate 査読有り

    Hiromu Kashida, Tomohiko Takatsu, Hiroyuki Asanuma

    Tetrahedron Letters   48 巻   頁: 6759-6762   2007年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Modified oligodeoxyribonucleotides (ODNs) involving two perylene moieties are synthesized. By using this ODN, one-base deletion can easily be distinguished with high sensitivity. In addition, emission color of the solution greatly changed so that the detection was possible even by naked eyes.

  137. 2¢,6¢-Dimethylazobenzene as an efficient and thermo-stable photo-regulator for the photoregulation of DNA hybridization 査読有り

    Hidenori Nishioka, Xingguo Liang, Hiromu Kashida, and Hiroyuki Asanuma

    Chem. Commun.   2007 巻   頁: 4354-4356   2007年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The introduction of methyl groups into two ortho positions (2¢ and 6¢ positions) of the same benzene ring in an azobenzene remarkably raised both its photoregulation ability and the thermal stability of the cis-form.

  138. Recognition of Solution Structures of Peptides byMolecularly Imprinted Cyclodextrin Polymers 査読有り

    Shi-hui Song, Kazumi Shirasaka, Mami Katayama,Suguru Nagaoka, Shinji Yoshihara, Tomo Osawa,Jun Sumaoka, Hiroyuki Asanuma, andMakoto Komiyama

    Macromolecules   40 巻   頁: 3530-3532   2007年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  139. Synthesis of azobenzene-tethered DNA for reversible photo-regulation of DNA functions: hybridization and transcription 招待有り 査読有り

    Hiroyuki Asanuma, Xingguo Liang, Hidenori Nishioka, Daijiro Matsunaga, Minghe Liu, Makoto Komiyama

    Nature Protocols   2 巻 ( 1 ) 頁: 203-212   2007年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A phosphoramidite monomer bearing an azobenzene is synthesized from D-threoninol. By using this monomer, azobenzene moieties can be introduced into oligodeoxyribonucleotide (DNA) at any position on a conventional DNA synthesizer. With this azobenzene-tethered DNA, formation and dissociation of DNA duplex can be reversibly photo-regulated by cis-trans isomerization of the azobenzene. When the azobenzene takes trans-form, a stable duplex is formed. Upon isomerization of the trans-azobenzene to its cis-form by UV-light irradiation (300 nm < l < 400 nm), the duplex can be dissociated to two strands. The duplex is re-formed on photo-induced cis→trans isomerization (l > 400 nm). By introducing azobenzenes into T7 promoter at specific positions, transcription by T7-RNA polymerase is also efficiently and reversibly photo-regulated. The reversible regulation can be repeated many times without causing damage to DNA or the azobenzene moiety. All these procedures take about 10 days to complete.

  140. Construction of novel dye aggregates based on "comb-type" sequence

    Hiromu Kashida, Taiga Fujii, Hiroyuki Asanuma

    Nucleic Acids Symp. Ser.   51 巻   頁: 11-12   2007年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

    Novel dye aggregates (“comb-type" aggregates) was prepared by hybridizing modified oligodeoxyribo-nucleotides (ODNs), in which dyes were introduced consecutively. From NMR structural analysis, dye molecules were intercalated between base pairs and stacked in anti-parallel manner. When ODNs containing three Methyl Red moieties were hybridized, strong exciton coupling was observed. In addition, thermal stability of duplex was substantially enhanced due to the intermolecular stacking.

  141. Exciplex Formation between Pyrene and N,N-Dimethylaniline in DNA for the Detection of One-base Deletion 査読有り

    Hiromu Kashida, Makoto Komiyama, Hiroyuki Asanuma

    Chem. Lett.   35 巻 ( 8 ) 頁: 934-935   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Exciplex emission from pyrene and N,N-dimethylaniline moieties was observed in aqueous solution by incorporating them into DNA. By using exciplex formation, one-base deletion was successfully detected.

  142. Azobenzene-tethered T7 promoter for Efficient Photoregulation of Transcription 査読有り

    Minghe Liu, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    J. Am. Chem. Soc.   128 巻   頁: 1009-1015   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Azobenzene was additionally introduced into side chain of T7 promoter for the photoregulation of transcription reaction by T7 RNA polymerase (T7 RNAP). When single azobenzene molecule was introduced into the T7 promoter either at the loop binding region of the RNAP (–7 to –11 position) or at the unwinding region (+1 to –4 position), transcription was suppressed in the trans-form but proceeded faster in the cis-form. The amount of transcripts after UV irradiation with respect to that under dark was only 1.5 – 2.0-fold. Kinetic analysis of the transcription reaction revealed that photoregulatory mechanism was different in these positions. The photoisomerization of an azobenzene at the loop binding region primarily affected Km. On the other hand, the isomerization of an azobenzene at unwinding region mainly affected kcat. Still more clear-cut photoregulation was achieved when two azobenzenes were introduced into both loop binding and unwinding regions, respectively: transcription proceeded 7.6-fold faster after UV irradiation than that under dark. This synergistic effect was observed only when two azobenzenes were introduced into these two different regions, respectively, and introduction into the same loop binding region drastically lowered the transcription activity. The cooperation of two azobenzenes at loop binding and unwinding region would contribute to the clear-cut photoregulation of transcription.

  143. Importance of the Position of Vinyl Group on b-Cyclodextrin for the Effective Imprinting of Amino Acid Derivatives and Oligopeptides in Water 査読有り

    Osawa, T.; Shirasaka, K.; Matsui, T.; Akiyama, T.; Yoshihara, S.; Hishiya, T.; Asanuma, H.; Komiyama, M.

    Macromolecules   39 巻   頁: 2460-2466   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Two kinds of vinyl monomers of b-cyclodextrin (b-CyD) that tether a vinyl group on either wider rim of the truncated cone or its smaller rim were synthesized and applied to the imprinting towards amino acid derivatives and oligopeptides in water. Mono-3-(N-acrylamido)-3-deoxy-altro-b-cyclodextrin (3-AAm-CyD) showed remarkable imprinting effect for the enantioselective recognition of protected amino acids such as N-benzyloxycarbonyltyrosine (Z-Tyr). However, the imprinted polymer from mono-6-(N-acrylamido)-6-deoxy-b-cyclodextrin (6-AAm-CyD) hardly showed enantioselectivity. According to NOESY analysis on pre-organized b-CyD/Z-Tyr complex in D2O, the aromatic moieties of Z-Tyr were included into the cavity of b-CyD from its wider rim. Since the vinyl group of 3-AAm-CyD protruded towards the template and was polymerized there, detailed shape of the template was precisely copied on the polymer by the imprinting. In case of 6-AAm-CyD, however, the shape of template could not be well transcribed because its vinyl group was located at opposite side of the cavity and thus co-polymerization occurred far from the template molecule. On the other hand, the imprinted polymers from both b-CyD vinyl monomers were effective for the recognition of sequences of tetrapeptides composed of two glycines and two phenylalanines, although the selectivity itself was not remarkable. In these polymers, even the b-CyD residues of 6-AAm-CyD were immobilized complementarily to the phenyl rings and bound them.

  144. Improved Method of Molecular Imprinting of Cyclodextrin on Silica-gel Surface for the Preparation of Stable Stationary HPLC Phase 査読有り

    Matsui, T. , Osawa , T.; Shirasaka , K.; Katayama, M.; Hishiya, T.; Asanuma H., Komiyama, M.

    J. Inclu. Phenom. Macrocyclic Chem.   56 巻   頁: 39-44   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    By using N-(3-triethoxysilyl)propylacrylamide (TPAAm), vinyl groups were introduced onto the surface of silicagel.
    On the surface of this silica-gel, b-CyD was molecularly imprinted by using a redox initiator, and the composite
    was used as stationary phase of high performance liquid chromatography (HPLC). The pump pressure was sufficiently
    low and did not increase even after continuous elution for 24 h. In order to prepare still more stable columns,
    a new polymerization process was developed. There, the redox initiator was first mixed with the surface-modified
    silica-gel and then vinylated b-CyD, crosslinker, and the template were added. This modification promoted the
    immobilization of b-CyD copolymer to the silica-gel, resulting in still lower pump pressure. Concurrently, the
    imprinting efficiency was increased in comparison with previous method where the redox initiator was directly
    added to the mixture of the b-CyD–template complex, crosslinker, and surface-modified silica-gel. The molecularly
    imprinted b-CyD column, prepared by this new method, efficiently discriminated the enantiomers of
    N-benzyloxycarbonyltyrosine.

  145. Enhancement of RNA cleavage activity of 10-23 DNAzyme by covalently introduced intercalator 査読有り

    H. Asanuma, H. Hayashi, J. Zhao, X. Liang, A. Yamazawa, T. Kuramochi, D. Matsunaga, Y. Aiba, H. Kashida, M. Komiyama

    Chem. Commun.     頁: 5062-5064   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    By introducing an intercalator through D-threoninol to the 10-23 DNAzyme at the junction between its catalytic loop and the binding arm, the RNA cleavage activity was greatly improved.

  146. Insertion of Two Pyrene Moieties to Oligodeoxyribonucleotides for the Efficient Detection of Insertion/Deletion Polymorphisms 査読有り

    Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    Chem. Commun.     頁: 2768-2770   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    For the detection of deletion polymorphisms, two pyrene moieties are tethered to oligodeoxyribonucleotide (ODN) on both sides of the intervening base. When this probe ODN was hybridized with wild type ODN, both pyrenes intercalated between base pairs and only monomer emission was observed. In contrast, strong excimer emission was generated by hybridization with one-base deletion mutant. Similarly, two-base deletion was also detected.

  147. Covalent Incorporation of Methyl Red Dyes into Double-Stranded DNA for Their Ordered Clustering 査読有り

    Kashida, H.; Tanaka, M.; Baba, S.; Sakamoto, T.; Kawai, G.; Asanuma, H.; Komiyama, M.

    Chem. Eur. J.   12 巻   頁: 777-784   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Ordered dye cluster of Methyl Reds was formed in double-stranded DNA by hybridizing two complementary DNA-dye conjugates that involve Methyl Red moiety on threoninol linker and 1,3-propanediol as a spacer alternately in the middle of the sequence. In the duplex, Methyl Reds from each strand were axially stacked anti-parallel to each other as determined from NMR analysis. This clustering of Methyl Reds induced distinct change of both UV-Vis and CD spectra. Single-stranded DNA-Methyl Red conjugate on D-threoninol linkers and (1,3-propanediol) spacers exhibited broad absorption spectrum having lmax at around 480 nm, and almost no CD was observed at around absorption maximum of Methyl Red. However, when Methyl Reds were clustered by hybridization, lmax shifted towards shorter wavelength with respect to its monomeric transition. This hypsochromic shift increased with the number of Methyl Reds. Furthermore, positive couplet was also strongly induced here. These dye clusters are H-aggregates, in which molecular excitons are coupled. The positive couplet demonstrates that the clusters on D-threoninol forms right-hand helix. In contrast, induced CD became much weaker with Methyl Red on L-threoninol, which intrinsically prefers counterclockwise winding. Thus, mutual orientation of the stacked dyes was controlled by the chirality of the linker.

  148. Incorporation of methyl group on azobenzene for the effective photo-regulation of hybridization and suppression of thermal isomerization

    H. Nishioka, H. Kashida, M. Komiyama, X. Liang, and H. Asanuma

    Nucleic Acids Res. Supple.   50 巻   頁: 85-86   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  149. Activation of DNA enzyme 10-23 by tethering an intercalator to its backbone

    H. Hayashi, X. Liang, J. Zhao, M. Komiyama, and H. Asanuma

    Nucleic Acids Res. Supple   50 巻   頁: 167-168   2006年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  150. Design of Light-switchable Phage Promoter for Efficient Photo-regulation of Gene-expression

    Minghe Liu, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    Nucleic Acids Res. Supple.   49 巻   頁: 283-284   2005年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  151. Clear-cut photo-regulation of the formation and dissociation of the DNA duplex by modified oligonucleotide involving multiple azobenzenes

    Hiroyuki Asanuma, Daijiro Matsunaga, Makoto Komiyama

    Nucleic Acids Res. Supple.   49 巻   頁: 35-36   2005年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  152. Efficient Separation of Hydrophobic Biomolecules by Molecularly Imprinted Cyclodextrins 査読有り

    Hishiya, T.; Asanuma, H.; Komiyama, M.

    J. Inclu. Phenom. Macrocyclic Chem.   50 巻   頁: 51-55   2004年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  153. Real time monitoring of the interaction of T7 RNA polymerase with azobenzene-tethered T7 promoter by biosensor

    Minghe Liu, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    Nucleic Acids Res. Supple. 4   4 巻   頁: 221-222   2004年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  154. Photoregulation of in vitro transcription/translation of GFP by tethering an azobenzene to T7 promoter

    Jing Zhao, J. Zhou, Minghe Liu, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    Nucleic Acids Res. Supple. 4   4 巻   頁: 199-120   2004年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語  

  155. Photo-regulation of RNA Digestion by RNase H with Azobenzene-Tethered DNA 査読有り

    Daijiro Matsunaga, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    J. Am. Chem. Soc.   126 巻 ( 37 ) 頁: 11452-11453   2004年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    RNA digestion by RNase H, which is responsible for the antisense effect, was efficiently photo-regulated by use of the duplex of azobenzene-tethered sense DNA and native antisense DNA. Under dark, RNA digestion was suppressed because antisense DNA was strongly hybridized with azobenzene-tethered sense DNA, and accordingly RNA was isolated. On UV light irradiation, antisense DNA was released from the azobenzene-tethered DNA due to the trans to cis isomerization and hybridized with RNA, which was digested by RNase H.

  156. Interstrand H aggregation of cationic dyes for narrowing the absorption spectra and stabilizing the duplex 査読有り

    Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    Supramol. Chem.   16 巻 ( 6 ) 頁: 459-464   2004年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Interstrand H-aggregates of cationic dyes are prepared by hybridization of the two DNA-dye conjugates involving Naphthyl Red moiety and spacer alternately in the middle of the sequence. At pH 5.0 where Naphthyl Red is positively charged, single-stranded DNA-Naphthyl Red conjugate involving three dye groups and three spacer residues exhibited broad absorption spectrum having lmax at around 530 nm. But hybridization of two DNA-Naphthyl Red conjugates that are complementary provided rather different spectrum: much narrower absorption band appeared at 507 nm, which is 23 nm shorter than the single stranded conjugates. These spectroscopic behaviors indicate that dyes in the duplex are H-aggregated and excitons are strongly coupled in the aggregate. In addition to the appearance of narrow H-band, melting temperature dramatically increased by the H-aggregation of stacked cationic dyes compared with that of natural duplex without dye and spacer residues. Thus, positive charges on the stacked dyes did not interfere the duplex formation by the electrostatic repulsion, and moreover fairly promoted the hybridization.

  157. Alternating hetero H-aggregation of different dyes by interstrand stacking from two DNA-dye conjugates

    Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma, Makoto Komiyama

    Angew. Chem. Int. Ed.   43 巻 ( 47 ) 頁: 6522-6525   2004年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    New hetero aggregates in which Methyl Reds and Naphthyl Reds are stacked alternately were successfully prepared by hybridization of two DNA-dye conjugates. When the Naphthyl Red conjugate was hybridized with Methyl Red conjugate, a new sharp absorption band (H-band) appeared at 480 nm that was different from the lmax of each dye conjugate in the single-stranded state. In addition to this new band in the UV-Vis spectrum, strong circular dichroism was also induced by interstrand hetero-stacking of these dyes. These results demonstrated that even different dyes as well as identical dyes could exhibit H-band.

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書籍等出版物 20

  1. DNA機能の拡張 査読有り

    浅沼浩之( 担当: 単著)

    講談社  2020年12月  ( ISBN:978-4-06-520786-4

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    記述言語:日本語 著書種別:学術書

  2. 核酸の直交性

    浅沼浩之、村山恵司( 担当: 共著)

    CBI学会出版  2019年4月  ( ISBN:978-4-9909076-4-8

  3. ナノマテリアルとしての光応答性DNA

    浅沼浩之、神谷由紀子( 担当: 共著)

    エヌ・ティー・エス  2018年12月 

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    総ページ数:806   担当ページ:7   記述言語:日本語 著書種別:学術書

  4. 遺伝子を蛍光検出するナノプローブ開発 査読有り

    浅沼浩之、樫田 啓( 担当: 共著)

    丸善プラネット(株)  2017年12月 

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    記述言語:日本語

  5. 非環状骨格型人工核酸:aTNA, SNA

    神谷由紀子、村山恵司、樫田 啓、浅沼浩之( 担当: 共著)

    シーエムシー出版  2016年 

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    記述言語:日本語

  6. 生体材料化学-基礎と応用―

    浅沼浩之、樫田啓、神谷由紀子( 担当: 共著)

    (株)コロナ社  2015年11月  ( ISBN:978-4-339-06750-7

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    記述言語:日本語

  7. プローブへの応用を目指した人工ヌクレオチドの設計

    浅沼浩之、樫田 啓( 担当: 共著)

    一粒書房  2014年 

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    記述言語:日本語

  8. 核酸医薬を目指した機能性siRNA

    神谷由紀子、浅沼浩之( 担当: 共著)

    一粒書房  2014年 

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    記述言語:日本語

  9. ナノ環境に優しい光応答性DNAの設計

    神谷由紀子、浅沼浩之( 担当: 共著)

    コロナ社   2013年 

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    記述言語:日本語

  10. Oligonucleotide Conjugates for Detection of Specific Nucleic Acid Sequences

    Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma( 担当: 共著)

    RSC publishing   2012年12月 

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    記述言語:英語

  11. 核酸の配列特異的認識のためのオリゴヌクレオチドコンジュゲート

    樫田 啓, 浅沼 浩之( 担当: 共著)

    the Royal Society of Chemisry  2012年 

     詳細を見る

    記述言語:英語

  12. カートリッジ型人工ヌクレオチドによる光応答性DNAの設計

    浅沼浩之, 梁興国( 担当: 共著)

    化学同人  2011年 

     詳細を見る

    記述言語:日本語

  13. 人工核酸を利用したプローブDNAの調製と遺伝子多型検出

    樫田啓、浅沼浩之( 担当: 共著)

    NTS  2010年4月 

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    記述言語:日本語

    これまでに様々な蛍光色素で修飾した核酸プローブが合成されており、溶液中での遺伝子多型の検出に関しては数多くの報告がなされてきた。しかしながら、それに比べて基板にこれらの核酸プローブを固定化した例は必ずしも多くない。その原因としては、プローブ自身の蛍光によるバックグラウンドが挙げられる。蛍光色素で修飾した核酸プローブを基板上に固定化する場合、プローブ自身が発する蛍光により検出が阻害されてしまう。そのため、蛍光性核酸プローブを固定化したDNAチップを調製するためには、ターゲット非存在下でプローブ自身の蛍光を抑制することが必要となる。そこで、本節ではこのようなプローブ単体でのバックグラウンドが抑制された核酸プローブの例として1)モレキュラービーコン及び2)レシオメトリックプローブについて述べる。

  14. DNAのダイナミックな光制御(超分子サイエンスー基礎から材料への展開ー

    浅沼浩之、梁興国( 担当: 共著)

    NTS  2009年5月 

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    記述言語:日本語

    天然のDNAの更なる機能化を目的としてこれまでに様々な化学修飾がDNAに対して行われてきたが、上述のようにDNAの応用分野が多様化したことで、DNAの化学修飾の重要性は更に増しつつある。もちろん天然の4つの核酸塩基だけでも多彩なナノ構造を形成し様々な機能を発揮するが、化学修飾によって天然のDNAでは実現不可能な機能を補うことが出来れば、DNAの応用範囲は飛躍的に拡大するであろう。本稿ではこのような観点から筆者らが開発したアゾベンゼン導入型光応答性DNAと、これを用いたDNAナノマシンのダイナミックな光制御について解説したい。

  15. 光機能化DNAファイバー(”ファイバー”スーパーバイオミメティックス)

    浅沼浩之( 担当: 単著)

    NTS  2006年10月 

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    記述言語:日本語

  16. 光による核酸機能の制御(図解 高分子新素材の全て)

    浅沼浩之( 担当: 単著)

    工業調査会  2005年 

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    記述言語:日本語

  17. Molecular imprinting – from fundamentals to applications-

    Makoto Komiyama, Toshifumi Takeuchi, Takashi Mukawa, Hiroyuki Asanuma( 担当: 共著)

    Wiley-VCH  2003年 

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    記述言語:英語

  18. Encyclopedia of Separation Science

    Naoki Toshima, and Hiroyuki Asanuma( 担当: 共著)

    Academic Press Ltd.  2000年 

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    記述言語:英語

  19. Synthesis of Hybrid Polymers Which Bind Guests in Water by Hydrogen Bond Formation

    Makoto Komiyama and Hiroyuki Asanuma( 担当: 共著)

    2000年 

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    記述言語:英語

  20. Polymer for Gas Separation

    Naoki Toshima, Hiroyuki Asanuma( 担当: 共著)

    VHC Publishers  1992年 

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    記述言語:英語

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講演・口頭発表等 85

  1. RNAより前に、XNAの世界は存在したか? 招待有り

    浅沼浩之

    生命の起原および進化学会 シンポジウム w/ABC早稲田サテライト  2021年3月11日  生命の起原および進化学会

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    開催年月日: 2021年3月11日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:On-line   国名:日本国  

  2. 非環状型人工核酸SNAとその類縁体の医療展開 招待有り

    浅沼浩之

    令和2年度東海シンポジウム  2021年1月15日  高分子学会東海支部

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    開催年月日: 2021年1月14日 - 2021年1月15日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:On-line   国名:日本国  

  3. How far can we escape from DNA? 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    Program Conference CLiC digital summer school  

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    開催年月日: 2020年8月18日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Fraukfurt on line   国名:日本国  

  4. Photoresponsive XNAs for the photo-switching of bio- and nano-functions 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    China-Japan Joint Interdisciplinary Symposium on Molecular Magnetic Materials 

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    開催年月日: 2019年12月27日 - 2019年12月29日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Guangzhou   国名:中華人民共和国  

  5. Acyclic XNAs of controlled orthogonality towards DNA and RNA 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    The Fourth A3 Roundtable Meeting on Asia Chemical Probe Research Hub  

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    開催年月日: 2019年11月18日 - 2019年11月21日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  6. Acyclic SNA and aTNA as a new class of XNA for bio- and nanotechnology 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    ISNAC 2019  

     詳細を見る

    開催年月日: 2019年10月29日 - 2019年10月31日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Koganei Civic Center   国名:日本国  

  7. DNA nanocapsule for photo-triggered drug release 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    2019 International Research Forum on Biology and Medical Science (IRFBMS 2019)  

     詳細を見る

    開催年月日: 2019年8月22日 - 2019年8月25日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:台湾  

  8. DNA and XNA nanomachines powered by light irradiation 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    10th NTTH Joint Symposium  

     詳細を見る

    開催年月日: 2019年7月29日 - 2019年7月31日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Hotel Hokke Club Hakodate   国名:日本国  

  9. Design of functional oligonucleotide with acyclic scaffold 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

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    開催年月日: 2019年6月27日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Shenyang Pharmaceutical University   国名:中華人民共和国  

  10. 非環状型人工核酸が拓く新たなバイオテクノロジー 招待有り

    浅沼 浩之

    ワークショップ「核酸化学の開く未来」 

     詳細を見る

    開催年月日: 2019年6月19日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  11. Azobenzene-tethered DNA for photo-triggered nanocapsule for drug release 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    World Chemistry Conference and Exhibition 2019 (WCCE-2019) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2019年6月13日 - 2019年6月15日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Brussels, Belgium   国名:ベルギー王国  

  12. Totally acyclic XNAs for medical applications 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    Functional Nucleic Acids: From Laboratory to Targeted Molecular Therapy(FNA Perth 2018) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年11月22日 - 2018年11月24日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:オーストラリア連邦  

  13. DNA二重鎖のナノフォトニクスへの応用 招待有り

    浅沼 浩之

    第22回 VBLシンポジウム  

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年11月21日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  14. Azobenzene-Tethered DNA for Photo-Driven Nanomachine 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    XIX NOST-Organic Chemistry Conference (XIX-NOST-OCC) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年9月6日 - 2018年9月9日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Hotel Grand Hyatt, Goa, India   国名:インド  

  15. Light-triggered DNA nanomachine 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    FISNA2018 

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年7月4日 - 2018年7月6日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  16. 医療応用を目指した核酸の機能的再インストール 招待有り

    浅沼浩之

    第29回万有仙台シンポジウム―未来を指向した有機化学 

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年6月8日 - 2018年6月11日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:仙台   国名:日本国  

  17. 非環状型人工核酸による分子演算の拡張と核酸医薬への展開 招待有り

    浅沼浩之

    情報計算化学生物学会(CBI学会) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年5月18日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:グランフロント大阪 ナレッジキャピタル   国名:日本国  

  18. DNA nanomachine and nanoarchitecture powered by light-irradiation 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    The International Conference of Layers, Films and Membranes for Green, Environmental and Biomedical Sciences (LFM2018) 

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    開催年月日: 2018年5月14日 - 2018年5月16日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(基調)  

    開催地: National Taiwan University of Science and Technology, Taipei (Tiwan)   国名:台湾  

  19. Creation of functional oligonucleotide with nucleotide-analogues designed from acyclic scaffold 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

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    開催年月日: 2018年3月20日 - 2018年3月23日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  20. Azobenzene-tethered DNA for the photo-regulation of DNA functions 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    INTERNATIONAL CONGRESS ON PURE & APPLIED CHEMISTRY 2018 (ICPAC2018) 

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    開催年月日: 2018年3月7日 - 2018年3月10日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Siem Reap, Cambodia   国名:カンボジア王国  

  21. Light-driven DNA nanomachine with an azobenzene-tethered DNA as photon-engine 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    the Pure and Applied Chemistry International Conference 2018 (PACCON 2018) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年2月7日 - 2018年2月9日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地: Hat Yai, Songkhla (Thailand)   国名:タイ王国  

  22. Light-driven molecular machines with azobenzene-tethered DNA 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    International Conference on Natural and Artificial Molecular Machines (NAMM2018) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年12月18日 - 2017年12月20日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:IIT Bombay (India)   国名:インド  

  23. "Design of totally acyclic XNAs for medical applications 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    The Second International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2017) 

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    開催年月日: 2017年12月14日 - 2017年12月16日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Kyoto Univ. (Kyoto)   国名:日本国  

  24. SNA and iL-aTNA for nucleic acid medicine 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    1st Minisymposium on Material Biology  

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    開催年月日: 2017年10月16日 - 2017年10月17日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Tokyo institute of Technology   国名:日本国  

  25. Orientation-dependent FRET in DNA duplex 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    FISNA2017 

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    開催年月日: 2017年7月19日 - 2017年7月21日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  26. Orientation-Dependent FRET in DNA Duplex for Structural Analysis of Secondary Structure in Solution 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    NTTH symposium 

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    開催年月日: 2017年7月14日 - 2017年7月16日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Takayama, Gifu   国名:日本国  

  27. Programmable Artificial Nucleic Acids for Bio-application 招待有り

    Hiroyuki Asanuma

    The 20th ISIR International Symposium  

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    開催年月日: 2016年12月12日 - 2016年12月13日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:Osaka, Japan   国名:日本国  

  28. D-L-aTNA and SNA as a new class of acyclic XNA 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    Beilstein Organic Chemistry Symposium 2016 Nucleic Acid Chemistry  

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    開催年月日: 2016年10月5日 - 2016年10月7日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地: Prien (Chiemsee), Germany   国名:ドイツ連邦共和国  

  29. Physics in DNA(4); [2+2] photodimerization of stilbene derivatives within the DNA duplex 招待有り 国際会議

    Hiroyuki Asanuma, Tetsuya Doi, Hiromu Kashida

    The First Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub 

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    開催年月日: 2016年9月22日 - 2016年9月24日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地: Fukuoka, Japan   国名:日本国  

  30. Orientation-dependent FRET in DNA duplex 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    3rd Fluorescent Biomolecules and Their Building Blocks-Design and Applications (FB3) 

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    開催年月日: 2016年7月7日 - 2016年7月11日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:中華人民共和国  

  31. Tracing the Fate of siRNA

    Hiroyuki Asanuma

    FIBER International Summit for Nucleic Acids 2016 (FISNA2016) 

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    開催年月日: 2016年7月6日 - 2016年7月8日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  32. 非環状型人工核酸による光機能性ナノマテリアルの創製

    浅沼浩之

    第65回高分子学会年次大会 

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    開催年月日: 2016年5月25日 - 2016年5月27日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:神戸国際会議場・展示場 神戸   国名:日本国  

  33. Stemless linear probe for the detection of RNA in living cell 国際会議

    H. Asanuma, M. Akahane, R. Niwa, Y. Kamiya, H. Kashida

    Pacifichem2015  

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    開催年月日: 2015年12月15日 - 2015年12月20日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:アメリカ合衆国  

  34. Stemless linear probe for detecting mRNA in living cell 国際会議

    Hiroyuki Asanuma, Mariko Akahane, Yukiko Kamiya, Hiromu Kashida

    BIT's 6th World Gene Convention-2015 

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    開催年月日: 2015年11月13日 - 2015年11月15日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:中華人民共和国  

  35. RNA detection in living cell with super-sensitive linear probe 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    International Conference on Small Science 2015 (ICSS-2015) 

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    開催年月日: 2015年11月4日 - 2015年11月7日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:タイ王国  

  36. Tracing the "fate" of siRNA 国際会議

    Yukiko Kamiya, Anna Ito, and Hiroyuki Asanuma

    The 3rd China-Japan Symposium on Nanomedicine 

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    開催年月日: 2015年6月19日 - 2015年6月20日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:中華人民共和国  

  37. Stemless linear probe with multiple fluorophores on D-threoninols for thefluorescent imaging of m-RNA in cell. 国際会議

    Hiroyuki Asanuma, Mariko Akahane, Hiromu Kashida, Yukiko Kamiya

    1st International Caparica Conference on Chromogenic and Emissive Materials 

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    開催年月日: 2014年9月8日 - 2014年9月10日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:ポルトガル共和国  

  38. de novo Design of functional oligonucleotide with acyclic scaffold 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

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    開催年月日: 2014年7月3日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:グレートブリテン・北アイルランド連合王国(英国)  

  39. Orientation-dependent FRET between the intercalated donor and acceptor fluorophores 国際会議

    Hiromu Kashida, Ayako Kurihara, Tomohiro Kato, and Hiroyuki Asanuma

    XVIth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components 

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    開催年月日: 2014年6月8日 - 2014年6月13日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:チェコ共和国  

  40. Design of highly sensitive fluorescent probe prepared from acyclic threoninol 国際会議

    Hiroyuki Asanuma, Yukiko Kamiya Hiromu Kashida, Xingguo Liang

    2014 China-Japan-Korea and Southeast Asia Joint Symposium on ADVANCED PROCESSING TECHNOLOGY and SAFETY CONTROL of AQUATIC PRODUCTS 

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    開催年月日: 2014年5月12日 - 2014年5月14日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:中華人民共和国  

  41. Functional siRNA for RNAi activation, improvement of strand selection, and fluorescence tracing of RISC 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    RNA-Methods Workshop 

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    開催年月日: 2013年12月13日 - 2013年12月14日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:ドイツ連邦共和国  

  42. Azobenzene as a molecular engine for driving DNA-based nanomachine with light 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    Selective Regulation in Nanoscaled systems 

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    開催年月日: 2013年12月8日 - 2013年12月11日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:ドイツ連邦共和国  

  43. Orientation-dependent FRET between the fluorophores within DNA duplex 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

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    開催年月日: 2013年11月24日 - 2013年11月27日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:大韓民国  

  44. Functional siRNA for fluorescent monitoring of RISC with improved activity and strand selectivity

    Hiroyuki Asanuma, Anna Ito, Junya Takai, Masaaki Urushihara, Hiroshi Ito, Taiga Fujii, Xingguo Liang, and Yukiko Kamiya

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    開催年月日: 2013年11月7日 - 2013年11月9日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  45. Physics in DNA 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    A3RONA 2013 in Kobe 

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    開催年月日: 2013年8月30日 - 2013年9月1日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  46. DNA nano-engineering for the construction of photon-fuelled molecular-machine with azobenzenes as molecular engine 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    French-Japanese Seminar on Bioinspired Methods and Applications 

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    開催年月日: 2013年2月4日 - 2013年2月6日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  47. DNA nano-engineering for the construction of photon-fuelled molecular-machine.

    H. Asanuma, H. Nishioka, X.G. Liang, Y. Kamiya

    5th NTTH symposium 

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    開催年月日: 2012年12月19日 - 2012年12月21日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  48. Control of emission property by assembling dyes for designing intelligent probe 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    2012 Telluride Workshop on Nucleic Acid Chemistry 

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    開催年月日: 2012年7月29日 - 2012年8月3日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:アメリカ合衆国  

  49. Photon-fuelled DNA nanomachine carrying azobenzene as molecular engine 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    CIMTECH2012 

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    開催年月日: 2012年6月10日 - 2012年6月15日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:イタリア共和国  

  50. Highly Sensitive Fluorescent Probe designed with Threoninol-Nucleotides 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    A3RONA 2012 

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    開催年月日: 2012年5月18日 - 2012年5月20日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:大韓民国  

  51. New Artificial Nucleic Acids from Acyclic Scaffolds

    K. Murayama, T. Toda, H. Kashida, and H. Asanuma

    BMMP-12 

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    開催年月日: 2012年1月24日 - 2012年1月27日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  52. Artificial nucleotides for therapy-siRNA activation and probing-

    Hiroyuki Asanuma

    GCOE satellite sympoium  

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    開催年月日: 2011年11月28日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  53. Photon-fuelled nanomachine carrying azobenzene as molecular engine 国際会議

    Hiroyuki Asanuma

    A3RONA2011 

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    開催年月日: 2011年10月14日 - 2011年10月16日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:中華人民共和国  

  54. OLD BUT NEW ARTIFICIAL NUCLEIC ACIDS FROM ACYCLIC THREONINOL (aTNA) AND SERINOL (SNA) 国際会議

    Hiromu Kashida, Keiji Murayama, Takasuke Toda, Xingguo Liang, and Hiroyuki Asanuma

    XVth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components 

     詳細を見る

    開催年月日: 2011年6月5日 - 2011年6月10日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(基調)  

    国名:チェコ共和国  

  55. Light-up of DNA with artificial nucleotides

    H. Kashida, K. Sekiguchi, H. Asanuma

    BMMP11 

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    開催年月日: 2011年1月25日 - 2011年1月28日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  56. 次世代核酸医薬を目指した人工核酸の設計

    浅沼浩之

    名古屋大学予防早期医療創成センター 第4回研究会 

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    開催年月日: 2010年11月11日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  57. Light-up of DNA with Threoninol-Nucleotides 国際会議

    A3RONA 2010 JAPAN 

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    開催年月日: 2010年10月30日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  58. 人工DNAを活用した簡便かつ高感度検出が可能なプローブ設計

    浅沼浩之

    生体分子計測のボトムアップテクノロジー 

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    開催年月日: 2010年10月25日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  59. AZOBENZENE-TETHERED DNA FOR THE PHOTOREGULATION OF DNA FUNCTIONS

    IRT 2010 - XIX International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 

     詳細を見る

    開催年月日: 2010年8月31日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

  60. カートリッジ型人工核酸によるDNAの光機能化

    国際バイオEXPO 

     詳細を見る

    開催年月日: 2010年6月30日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:日本国  

  61. RATIONAL DESIGN OF PHOTORESPONSIVE DNA WITH CARTRIDGE-TYPE NUCLEOTIDE 国際会議

    The 4th International Symposium on Polymer Chemistry (PC2010) 

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    開催年月日: 2010年6月4日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

  62. Design of in-stem molecular beacon (ISMB) with "threoninol nucleotide" for the discrimination of polymorphisms 国際会議

    Gene-2009 

     詳細を見る

    開催年月日: 2009年12月4日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  63. 遺伝子発現の光制御を目指した光応答性DNAの開発

    第30回日本レーザー医学会総会 

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    開催年月日: 2009年12月2日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  64. Threoninol-nucleotidesによるDNAの再インストール

    浅沼浩之

    第58回高分子討論会 

     詳細を見る

    開催年月日: 2009年9月18日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  65. Rational design of functional DNA with threoninol-nucleotides 国際会議

    Vielberth-Symposium on Functional Nucleic Acids 

     詳細を見る

    開催年月日: 2009年9月10日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

  66. Photo-driven DNA Nanomachine with New Duplex Motif Composed of Threoninol 国際会議

    International Conference on Materials for Advanced Technologies 

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    開催年月日: 2009年7月1日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    In the present paper, we demonstrate photoresponsive DNA tweezers as a nanomachine fuelled with photons by using azobenzene-modified DNA. The tweezers are opened by UV light irradiation (330-350 nm) and closed by visible light irradiation (440-460 nm) without adding oligonucleotides as the fuel.

  67. 光機能性インテリジェントDNAの設計と応用

    平成21年度第三回PST-net 例会 

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    開催年月日: 2009年4月17日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    光機能性DNAを用いた機能性材料の設計と応用について講演する。

  68. 光が導くバイオテクノロジー

    「光科学技術と応用」シンポジウム 

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    開催年月日: 2009年2月27日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    光応答性DNAを用いた遺伝子発現の光制御に関する今後の展望について講演する。

  69. DNAを利用した光機能マテリアルの開発

    平成20年度東海シンポジウム 

     詳細を見る

    開催年月日: 2009年1月29日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    我々は、非環状リンカーのD-Threoninolを活用した機能分子の導入法が上記の目的に合うことを見出した。D-ThreoninolをScaffoldに用いて機能分子(インターカレーター)を導入した“人工塩基=Threoninol nucleotide”は、任意の配列に任意の数DNA中に導入することが可能であり、しかも二重鎖の不安定化や基質特異性を損なわずに二重鎖内にインターカレートする。

  70. Photoregulation of Gene Expression with Azobenzene-tethered Promoter 国際会議

    Ninth International Symposium on biomimetic Materials Processing (BMMP-9) 

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    開催年月日: 2009年1月22日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    In the present paper, we propose another strategy for the photoregulation of gene expression with the azobenzene-tethered DNA. Azobenzene is introduced into the promoter region (T7-promoter) of RNA polymerase (RNAP) and transcription reaction by RNAP is photoregulated by trans-cis isomerization of the incorporated azobenzenes.

  71. 非環状リンカーによるDNAの再インストール

    日本学術振興会第174委員会第27回研究会 

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    開催年月日: 2008年12月10日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    本講演でリボースに代わる新たなScaffoldとして非環状リンカーのD-Threoninol(Fig.1a参照)を活用した“DNAの再インストール”と、その応用展開について解説する。

  72. PHOTOREGULATION OF DNA FUNCTIONS BY AZOBENZENE-TETHERED OLIGONUCLEOTIDES 国際会議

    NU-UM Joint Symposium 

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    開催年月日: 2008年11月24日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    Here, efficient photo-switching of hybridization with this modified DNA and its application to the bio-reaction are introduced.

  73. 配列の差異を検出するインテリジェントDNAプローブの開発

    第39回中部化学関係学協会支部連合秋季大会 

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    開催年月日: 2008年11月8日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    本講演では、このthreoninol-nucleotideを活用した、SNPsやIndelsを検出可能なインテリジェントDNAプローブについて解説する。

  74. AZOBENZENE-TETHERED PROMOTER TOWARDS THE PHOTO-REGULATION OF GENE EXPRESSION 国際会議

    Japan-Korea Polymer Young Scientists Symposium 

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    開催年月日: 2008年10月23日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    A simple and effective approach for introducing azobenzene moieties tethered on D-threoninol to long duplex DNA (gene) was developed. By PCR and enzymatic ligation, the chemically modified part was introduced to the exact position we expected. By using the constructed photoresponsive gene, the GFP expression could be simply switched on and off by light-irradiation. As the photoswitch was equipped in the promoter, this strategy is promising to photoregulate the expression of any gene or functiona

  75. DNAの再インストールによる光デバイス化

    高分子エレクトロニクス研究会 

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    開催年月日: 2008年6月20日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    我々はリボースに頼らない非天然機能分子の導入法の一つとしてD-threoninolが非常に有効であることを見出し、これをScaffoldに用いたDNAの“再インストール”を行っている。本講演では、アゾベンゼン導入D-threoninolを使用した光デバイスとしてのDNAの再インストールについて紹介する。

  76. Interstrand Clustering of Dyes in the DNA Duplex with Threoninol 国際会議

    Hiroyuki Asanuma, Taiga Fujii, Hiromu Kashida

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    開催年月日: 2008年1月24日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  77. リボースに頼らないDNAの光機能化

    浅沼浩之

    機能性分子シンポジウム 

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    開催年月日: 2008年1月12日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    本発表では、D-threoninolをScaffoldに使用したDNAの再インストールについて、紹介する。

  78. 情報を持った繊維:DNAファイバーの光機能化

    浅沼浩之

    繊維学会夏季セミナー 

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    開催年月日: 2007年9月6日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    筆者らは、核酸が関与する酵素反応や分子マシンの光制御を目的とした光機能化DNAファイバーの開発を目指した。光刺激は数ある外部刺激の中でも1)反応系を汚染しない、2)分子設計により励起波長の制御が可能、3)レンズによる集光やレーザー光の利用で局所的な刺激ができる、といった長所を持つ。また近年パルスレーザーの進歩に伴って多光子励起が可能になり、より長波長の光による色素分子の励起も容易になりつつある。ここでは筆者らが近年開発した可逆的な応答を示す光機能化DNAファイバーについて解説する。

  79. DNAの再構築 -リボースを使用しないオリゴヌクレオチドの機能化-

    浅沼浩之

    FIBERシンポジウム 

     詳細を見る

    開催年月日: 2007年6月2日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    我々は、リボースに頼らない非天然分子の導入法の一つとしてD-threoninolを提案してきた。ScaffoldとしてD-threoninolを用いると、DNA二重鎖の安定性を損なうことなくインターカレーターを多数導入することが出来る。またD-threoninolに導入した機能分子を“擬似塩基”として天然のオリゴヌクレオチド中に導入することも可能である。本講演では、D-threoninolをScaffoldに用いたDNAの機能化について解説する。

  80. 超分子デバイスとしての機能性DNA

    浅沼浩之

    第10回VBLシンポジウム 

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年10月16日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    本発表では、筆者らが近年開発した可逆的な応答を示す光デバイス化DNAについて解説する。

  81. Azobenzene-Tethered DNA as a Photo-Switching Biodevice 国際会議

    11th International Symposium on Colloidal and Molecular Electro-Optics (ELOPTO-2006) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年5月23日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    DNA has not only a biological role of storing genetic information but also various physical and chemical functions. These role and functions are mainly based on the spontaneous hybridization of two strands that are complementary each other. If the formation and dissociation of the DNA duplex can be photo-regulated as schematically illustrated in Fig.1, we can get a new effective photo-switching biodevice and scope of the application should be extended, such as artificial regulation of gene exp

  82. 色素とのコンジュゲーションによるDNAの光機能化

    浅沼浩之

    表面技術協会 第113講演大会 

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    開催年月日: 2006年3月15日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    色素分子は、発光・吸収などの光学特性や、特定波長の光照射による可逆的な構造異性化など特異的な性質を有しており、DNAとのコンジュゲーションによって光応答性などDNAに新たな機能の付与が期待できる。逆にDNAの超分子性を活用することで色素分子のクラスター化が容易となり、単量体では実現不可能な光学物性の発現が期待できる。本講演では、互いの特性を生かした色素とDNAの新たなコンジュゲートについて、筆者らの最近の成果を紹介する。

  83. PHOTOREGULATION OF DNA FUNCTIONS BY AZOBENZENE-TETHERED OLIGONUCLEOTIDES 国際会議

    Sixth International Symposium on Biomimetic Materials Processing (BMMP-6) 

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年1月25日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    We have synthesized modified DNA tethering azobenzenes, and hybridization with its complementary strand has been successfully photo-regulated. Here, efficient photo-switching of hybridization with this modified DNA and its application to the bio-reaction are introduced.

  84. 生体機能の光制御を目指したアゾベンゼン導入DNAの設計

    浅沼浩之

    第16回MRSシンポジウム 

     詳細を見る

    開催年月日: 2005年12月10日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

  85. 機能分子との交互コンジュゲーションが広げるDNAの可能性

    浅沼浩之

    SORST ジョイントシンポジウム (4)  ― クロスオーバーする生命と化学 ― 

     詳細を見る

    開催年月日: 2005年11月28日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:日本国  

    機能分子の核酸への導入は、天然に無い性能をDNAやRNAに付与する上で有効な手段である。しかし化学修飾は多くの場合二重鎖の不安定化や配列特異性の低下を伴うため、5’末端への機能分子の導入が一般的である。もちろん精緻にデザインした化学修飾ヌクレオシドを合成してDNA鎖の内部に導入した例も多数報告されているが、合成や分子設計に煩雑さを伴う場合もある。従ってDNA二重鎖の安定性や配列特異性を損なわず簡便に機能分子を多数導入できる一般的な手法が開発されれば、応用の可能性が大きく広がると期待できる。我々はアゾベンゼン

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共同研究・競争的資金等の研究課題 3

  1. 非環状型機能性人工核酸の開発

    研究課題番号:AS2915131U  2017年10月 - 2020年03月

    研究成果展開事業 研究成果最適展開支援プログラムA-STEP 

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:51350000円 ( 直接経費:39500000円 、 間接経費:11850000円 )

  2. DNAハイブリダイゼーションの高効率可逆光スイッチング技術の開発と,そのバイオテクノロジーへの応用

    2005年10月 - 2011年03月

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

  3. 生体反応の光制御を目指した人工核酸デバイスの創製

    2002年11月 - 2006年03月

    科学技術振興機構PRESTO 

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

科研費 8

  1. 核酸医薬への応用を目指した非環状型人工核酸の開発

    2019年09月 - 現在

    国立研究開発法人日本医療研究開発機構  先端的バイオ創薬等基盤技術開発事業 

    神谷由紀子

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:146900000円 ( 直接経費:113000000円 、 間接経費:33900000円 )

  2. 非環状型機能性人工核酸の開発

    研究課題/研究課題番号:AS2915131U  2017年10月 - 2020年03月

    国立研究開発法人科学技術振興機構  研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP) 

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:51350000円 ( 直接経費:39500000円 、 間接経費:11850000円 )

  3. ステム構造を必要としない高感度リニアプローブの創成

    2013年04月 - 2015年03月

    科学研究費補助金  基盤研究(A)

    浅沼浩之

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:47450000円 ( 直接経費:36500000円 、 間接経費:10950000円 )

    モレキュラービーコン(MB)は汎用性の高い蛍光プローブとして知られているが、ステム・ループ構造に起因する様々な欠点を持つ。我々は、疑似ヌクレオチド化した蛍光色素をDNA 中に適切な間隔で導入することで、ステム・ループ構造を必要としない全く新たなコンセプトの蛍光プローブ“リニアプローブ”の開発に成功した。本申請研究では、リニアプローブのコンセプトを更に発展させて、モレキュラービーコンを遥かに凌駕する高輝度・高感度リニアプローブを開発し、
    1) 高い酵素耐性と高速応答を活かしたm-RNA の細胞内でのイメージング、2) PNA を組み合わせることでストランドインベージョンによる二重鎖DNA の直接蛍光ラベル への応用 を目指す。

  4. 細胞内微量miRNAの検出を目指した人工核酸によるシグナル増幅回路の開発

    2016年04月 - 2021年03月

    公益財団法人 旭硝子財団  ステップアップ助成 

    浅沼浩之

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:12000000円 ( 直接経費:12000000円 )

  5. 構造化ゲルと化学反応場の協働による運動創発

    2012年10月 - 2017年03月

    科学研究費補助金  研究領域提案型(計画研究)

    浅沼浩之

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    担当区分:研究分担者  資金種別:競争的資金

    配分額:52000000円 ( 直接経費:40000000円 、 間接経費:12000000円 )

  6. 医療応用を目指した人工核酸の創成

    2012年04月 - 2015年03月

    キャノン財団  研究助成プログラム「産業基盤の創生」 

    浅沼浩之

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:20000000円 ( 直接経費:20000000円 )

  7. スーパー制限酵素による巨大DNAの遺伝子操作

    2006年10月 - 2011年03月

    科学研究費補助金 

    小宮山真

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    担当区分:研究分担者 

  8. 新規人工核酸“グライコ核酸”の創製

    2006年

    科学研究費補助金  萌芽研究,課題番号:18655069

    浅沼 浩之

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    担当区分:研究代表者 

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産業財産権 13

  1. 人工核酸を含むオリゴヌクレオチド

    浅沼浩之、樫田啓、村山恵司

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    出願番号:特願2015-003424  出願日:2015年1月9日

    出願国:国内  

  2. 蛍光標識オリゴヌクレオチド誘導体及びその利用

    浅沼浩之 樫田啓 近藤展代 大澤卓矢 赤羽真理子

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    出願人:名古屋大

    出願番号:特願2011―221332号  出願日:2011年10月5日

    出願国:国内  

  3. オリゴヌクレオチドプローブ及びその利用

    浅沼浩之、丸山厚、嶋田直彦、梁興国、樫田啓、藤井大雅、大澤卓矢、吉田安子、丹羽孝介

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    出願人:日本碍子株式会社

    出願番号:特願2011-33986  出願日:2011年2月18日

    出願国:国内  

  4. イン・ステムビーコン型プローブ用のハイブリダイゼーション剤及びその利用

    丸山厚,嶋田直彦,浅沼浩之,梁興国,樫田啓,藤井大雅,大澤卓矢,吉田安子,丹羽孝介

     詳細を見る

    出願人:日本碍子株式会社

    出願番号:特願2011―033986号  出願日:2011年

    出願国:国内  

  5. オリゴヌクレオチド及びその利用

    浅沼 浩之、 樫田 啓、 関口 康司、近藤 展代

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    出願番号:特願2010-206043  出願日:2010年9月14日

    出願国:国内  

  6. オリゴヌクレオチドおよびその利用

    浅沼 浩之、 梁 興国、 樫田 啓、 西岡 英則、藤井 大雅、石川 顕慎

     詳細を見る

    出願番号:特願2010-194942  出願日:2010年8月31日

    出願国:国内  

  7. インスレーター及びその利用

    樫田啓、浅沼浩之、関口康司

     詳細を見る

    出願人:法人名大

    出願番号:特願2010-042632  出願日:2010年2月26日

    出願国:国内  

  8. 標的核酸の検出方法

    浅沼浩之、梁興国、樫田啓、吉田安子、吉良茂樹、丹羽孝介

     詳細を見る

    出願人:法人名大、日本ガイシ(株)

    出願番号:特願2009-298170  出願日:2009年12月28日

    出願国:国内  

  9. オリゴヌクレオチドプローブ及びその利用

    浅沼浩之、梁興国、樫田啓、原雄一、吉田安子、吉良茂樹

     詳細を見る

    出願人:法人名大、日本ガイシ(株)

    出願番号:特願2009-298160  出願日:2009年12月28日

    出願国:国内  

  10. オリゴヌクレオチドプローブ及びその利用

    浅沼浩之、梁興国、樫田啓、吉田安子、高瀬智和、丹羽孝介

     詳細を見る

    出願人:法人名大、日本ガイシ(株)

    出願番号:PCT/JP2009/061980  出願日:2009年6月30日

    出願国:国内  

  11. ターゲットDNAの特異増幅方法の開発

    梁興国、浅沼浩之、鈴木昌友、加藤智博

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    出願番号:特願2009-145741  出願日:2009年6月18日

    出願国:国内  

  12. オリゴヌクレオチドプローブ及びその利用

    浅沼 浩之、梁 興国、樫田 啓、吉田 安子、高瀬 智和、丹羽 孝介

     詳細を見る

    出願番号:特願2008-172526  出願日:2008年7月1日

    出願国:国内  

  13. DNAエンザイムおよびその活性制御方法

    浅沼浩之、小宮山 真、松永 大次郎、倉持 壮

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    出願人:独立行政法人科学技術振興機構

    出願番号:特願2004-55086  出願日:2005年2月24日

    公開番号:PCT/JP/2005/003052 

    出願国:外国  

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担当経験のある科目 (本学以外) 2

  1. 光スイッチングデバイスとしての光応答性DNAの開発と、その応用

    2007年4月 - 2008年3月 名古屋市立大学 大学院薬学研究科)

  2. 生命分子工学特論

    2005年4月 - 2006年3月 東京大学大学院工学系研究科化学生命工学専攻)