2026/08/31 更新

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ナンバ　サトコ
難波　里子
NAMBA Satoko
所属
高等研究院 特任助教
大学院情報学研究科 特任助教
職名
特任助教
外部リンク

研究キーワード 18

  1. 難治性疾患

  2. 薬剤組み合わせ

  3. 生命医科学

  4. 深層学習

  5. 治療標的分子

  6. 機械学習

  7. 希少疾患

  8. 医薬品開発

  9. 創薬標的分子

  10. メディカルインフォマティクス

  11. バイオインフォマティクス

  12. ドラッグリポジショニング

  13. ターゲットリポジショニング

  14. オミクスデータ

  15. TWAS

  16. GWAS

  17. AI創薬

  18. 老化

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研究分野 2

  1. ライフサイエンス / 薬系化学、創薬科学  / Drug discovery

  2. 情報通信 / 生命、健康、医療情報学  / Bioinformatics

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経歴 3

  1. 名古屋大学   大学院情報学研究科   特任助教   YLC特任助教, テニュアトラック

    2026年4月 - 現在

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    国名：日本国

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  2. 名古屋大学   高等研究院   特任助教   YLC特任助教, テニュアトラック

    2026年4月 - 現在

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    国名：日本国

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  3. 名古屋大学   大学院情報学研究科   研究員   日本学術振興会特別研究員（PD）

    2025年4月 - 2026年3月

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    国名：日本国

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所属学協会 4

  1. 日本分子生物学会

    2025年 - 現在

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  2. 日本薬理学会

    2024年 - 現在

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  3. International Society for Computational Biology

    2022年 - 現在

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  4. 日本バイオインフォマティクス学会

    2020年 - 現在

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委員歴 2

  1. エイジング若手研究者連盟—SAKRA—   海外部スタッフ  

    2025年8月 - 現在   

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    団体区分：その他

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  2. International Society for Computational Biology (ISCB) Student Council (SC) Regional Student Group (RSG)-Japan   代表  

    2025年7月 - 現在   

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    団体区分：学協会

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受賞 1

  1. 日本薬理学会100周年記念博士研究奨励賞

    2026年3月   第99回日本薬理学会年会   遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた疾患横断的な治療標的予測

    難波里子

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    受賞区分：国内学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国：日本国

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論文 1

  1. Mechanism-based prediction of drug synergy via network controllability analysis of therapeutic pathways in intractable diseases. 査読有り Open Access

    Namba S, Goda M, Kuniki Y, Ishizawa K, Iida M, Takeshita JI, Yamanishi Y

    iScience   29 巻 ( 4 ) 頁： 115339 - 115339   2026年4月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Iscience  

    Identifying effective drug combinations for multidrug therapies in intractable diseases remains challenging, and drug synergy depends on regulatory mechanisms. Herein, we introduce a mechanistic framework that redefines drug combination strategies into two distinct synergy paradigms—“boost” and “complement”—and present a network-based method called SYNERGIE to predict associated combinations across diseases. For diseases lacking known therapeutic targets, we introduced network controllability analysis to estimate therapeutic pathways and target molecules. SYNERGIE integrates drug-disease and drug-drug interactions across multiomics layers using Bayesian optimization to prioritize disease-state-specific combinations. SYNERGIE outperformed existing methods across 14 diseases, and identified both doublets and triplets. Therapeutic effects of triplets predicted for colorectal cancer were validated through in vitro experiments and multi-resolution omics analyses of human cohort data at bulk and single-cell levels. SYNERGIE offers a mechanism-aware approach to identifying clinically viable combination therapies, and is expected to support stratified treatment of intractable diseases.

    DOI： 10.1016/j.isci.2026.115339

    Open Access

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

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書籍等出版物 1

  1. AI・データ駆動型創薬研究

    難波里子, 山西芳裕（ 担当： 分担執筆 ,  範囲: 希少疾患の創薬標的分子を予測するAI技術―ゲノムとトランスクリプトームの融合が拓く新しい治療戦略）

    羊土社  2026年3月  （ ISBN:9784758104333 ）

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    担当ページ：60–68   記述言語：日本語

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MISC 1

  1. 国際会議参加報告 第33回Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology（ISMB） 招待有り

    難波里子  

    日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター第48号   2026年1月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：会議報告等  

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講演・口頭発表等 8

  1. ゲノムとトランスクリプトームの融合による希少疾患の治療標的分子予測 招待有り

    難波 里子

    NGS EXPO 2026  2026年10月 

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    開催年月日： 2026年10月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

    開催地：奈良   国名：日本国  

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  2. がん組織の生物学的年齢に基づく患者の予後予測

    上條陽平, 難波里子, 鍋倉宰, 井本逸勢, 山西芳裕

    第14回生命医薬情報学連合大会  2026年8月27日 

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    開催年月日： 2026年8月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  3. ISCB Student Council RSG-Japan：日本から世界へつながる若手研究者コミュニティ」

    難波里子

    第14回生命医薬情報学連合大会  2026年8月26日 

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    開催年月日： 2026年8月

    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

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  4. SYNERGIE: マルチオミクスネットワーク統合と可制御性解析の融合による難治性疾患の薬剤シナジー探索基盤

    難波里子, 合田光寛, 國木悠理香, 石澤啓介, 飯田緑, 竹下潤一, 山西芳裕

    第14回生命医薬情報学連合大会  2026年8月27日 

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    開催年月日： 2026年8月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  5. SYNERGIE: A mechanism-aware framework for identifying clinically actionable drug synergies via multi-layer modeling and network controllability 国際会議

    Satoko Namba, Mitsuhiro Goda, Yurika Kuniki, Keisuke Ishizawa, Midori Iida, Jun-ichi Takeshita, Yoshihiro Yamanishi

    The 34nd International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2026)  2026年7月14日 

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    開催年月日： 2026年7月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：Washington, DC in US  

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  6. Therapeutic Target Discovery for Rare Diseases via Machine Learning Integrating GWAS and TWAS 国際会議

    Satoko Namba, Michio Iwata, Shin-Ichi Nureki, Noriko Yuyama Otani, and Yoshihiro Yamanishi

    The 34nd International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2026)  2026年7月12日 

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    開催年月日： 2026年7月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

    開催地：Washington, DC in US   国名：アメリカ合衆国  

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  7. 遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた疾患横断的な治療標的予測 招待有り

    難波 里子

    第99回日本薬理学会年会  2026年3月18日 

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    開催年月日： 2026年3月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

    開催地：仙台   国名：日本国  

    日本薬理学会100周年記念博士研究奨励賞 受賞講演

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  8. 創薬標的分子の探索AI 招待有り

    難波里子

    日本学術会議化学委員会主催 分子科学研究所所長招聘会議 公開シンポジウム『AI for Chemical Sciences』  2026年6月11日  日本学術会議化学委員会

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

    開催地：愛知   国名：日本国  

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科研費 2

  1. 多階層オミクスデータを活用した難治性疾患の治療標的探索AIの開発研究

    2026年4月 - 2027年3月

    名古屋大学  YLC特任助教 スタートアップ研究費 

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    担当区分：研究代表者 

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  2. GWASとTWASの融合による治療標的分子の組み合わせを予測する情報技術の開発

    研究課題/研究課題番号：25KJ0159  2025年4月 - 2028年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費（PD）

    難波 里子

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    資金種別：競争的資金

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学術貢献活動 1

  1. 若手研究者よ、世界へ羽ばたけ!：国際学会プレゼン GP

    役割：企画立案・運営等

    ISCB SC RSG-Japan  2026年8月

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    種別：大会・シンポジウム等 

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