論文 - 寺田 智樹
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Landscape-Based View on the Stepping Movement of Myosin VI 招待有り 査読有り 国際共著
Terada, TP; Nie, QM; Sasai, M
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 126 巻 ( 38 ) 頁: 7262 - 7270 2022年9月
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Folding pathway of a multidomain protein depends on its topology of domain connectivity 査読有り
Takashi Inanami, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 111 巻 ( 45 ) 頁: 15969 - 15974 2014年9月
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Coupling of Lever Arm Swing and Biased Brownian Motion in Actomyosin 査読有り 国際共著
Qing-Miao Nie, Akio Togashi, Takeshi N. Sasaki, Mitsunori Takano, Masaki Sasai, Tomoki P. Terada
PLoS Computational Biology 10 巻 ( 4 ) 頁: e1003552, 1-13 2014年4月
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Time Scales in Epigenetic Dynamics and Phenotypic Heterogeneity of Embryonic Stem Cells 査読有り
Masaki Sasai, Yudai Kawabata, Koh Makishi, Kazuhito Itoh, Tomoki P. Terada
PLoS Computational Biology 9 巻 ( 12 ) 頁: e1003380,1-17 2013年12月
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Unidirectional Brownian motion observed in an in silico single molecule experiment of an actomyosin motor 査読有り
Mitsunori Takano, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 107 巻 ( 17 ) 頁: 7769 - 7774 2010年4月
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Correlation between evolutionary structural development and protein folding 査読有り
Chioko Nagao, Tomoki P. Terada, Tetsuya Yomo, Masaki Sasai
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 102 巻 ( 52 ) 頁: 18950 - 18955 2005年12月
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Conformational change of actomyosin complex drives the multiple stepping movement 査読有り
Tomoki P. Terada, Masaki Sasai, Tetsuya Yomo
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99 巻 ( 14 ) 頁: 9202-9206 2002年6月
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A Landscape-Based View on the Stepping Movement of Myosin VI 国際共著
Tomoki P. Terada, Qing-Miao Nie, Masaki Sasai
Biophysical Journal 118 巻 ( 3 ) 頁: 436A - 437A 2020年2月
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A landscape-based view on the stepping movement of myosin VI 国際共著
T. P. Terada, Q. M. Nie, M. Sasai
European Biophysics Journal with Biophysics Letters 48 巻 ( Supplement 1 ) 頁: S234 - S234 2019年7月
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Single-molecular and ensemble-level oscillations of cyanobacterial circadian clock 査読有り
Sumita Das, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
Biophysics and Physicobiology 15 巻 頁: 136 - 150 2018年5月
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Role of ATP Hydrolysis in Cyanobacterial Circadian Oscillator 査読有り
Sumita Das, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
Scientific Reports 7 巻 頁: 17469 2017年12月
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Cooperativity and modularity in protein folding 招待有り 査読有り
Masaki Sasai, George Chikenji, Tomoki P. Terada
Biophysics and Physicobiology 13 巻 頁: 281 - 293 2016年11月
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Importance of consensus region of multiple-ligand templates in a virtual screening method 査読有り
Tatsuya Okuno, Koya Kato, Shintaro Minami, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai, George Chikenji
Biophysics and Physicobiology 13 巻 頁: 149 - 156 2016年7月
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真核細胞のルースな遺伝子制御とクロマチン動態 招待有り 査読有り
笹井理生, 寺田智樹
生物物理 56 巻 ( 2 ) 頁: 106 - 108 2016年3月
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ランドスケープ描像で見る細胞分化の物理 招待有り 査読有り
寺田智樹
日本物理学会誌 70 巻 ( 10 ) 頁: 765 - 769 2015年10月
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VS-APPLE: A Virtual Screening Algorithm Using Promiscuous Protein–Ligand Complexes 査読有り
55 巻 ( 6 ) 頁: 1108 - 1119 2015年6月
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アクトミオシンの粗視化モデル解析:モーター機能におけるループの柔らかさの重要性 招待有り 査読有り
寺田智樹
生物物理 55 巻 ( 3 ) 頁: 148 - 150 2015年5月
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Conformational flexibility of loops of myosin enhances the global bias in the actin-myosin interaction landscape 招待有り 査読有り
Qing-Miao Nie, Masaki Sasai, Tomoki P. Terada
Physical Chemistry Chemical Physics 16 巻 ( 14 ) 頁: 6441-6447 2014年1月
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Entropic Mechanism of Allosteric Communication in Conformational Transitions of Dihydrofolate Reductase. 招待有り 査読有り
Tomoki P. Terada, Toru Kimura, Masaki Sasai
The Journal of Physical Chemistry B 117 巻 ( 42 ) 頁: 12864 - 12877 2013年5月
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Dynamical Modeling of Three-Dimensional Genome Organization in Interphase Budding Yeast 査読有り
Naoko Tokuda, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
Biophysical Journal 102 巻 ( 2 ) 頁: 296 - 304 2012年1月
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Synchronization of Circadian Oscillation of Phosphorylation Level of KaiC in vitro 査読有り
Tetsuro Nagai, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
Biophysical Journal 98 巻 ( 11 ) 頁: 2469 - 2477 2010年6月
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Mechanism of Robust Circadian Oscillation of KaiC Phosphorylation In Vitro 査読有り
Kohei Eguchi, Mitsumasa Yoda, Tomoki P. Terada and Masaki Sasai
Biophysical Journal 95 巻 ( 4 ) 頁: 1773 - 1784 2008年5月
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Monomer-Shuffling and Allosteric Transition in KaiC Circadian Oscillation 査読有り
Mitsumasa Yoda, Kohei Eguchi, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
PLoS ONE 2 巻 ( 5 ) 頁: e408,1-8 2007年5月
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タンパク質のダイナミクスとインフォマティクス 招待有り 査読有り
笹井理生, 寺田智樹
高分子 51 巻 ( 6 ) 頁: 448 2002年6月
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分子進化とフォールディング機構 招待有り
笹井理生, 寺田智樹
蛋白質 核酸 酵素 47 巻 ( 6 ) 頁: 677 - 683 2002年5月
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Nucleotide binding to the chaperonin GroEL: noncooperative binding of ATP analogs and ADP, and cooperative effect of ATP 査読有り
Tomonao Inobe, Tadashi Makio, Etsuko Takasu-Ishikawa, Tomoki P. Terada, Kunihiro Kuwajima
Biochimica et Biophysica Acta 1545 巻 ( 1-2 ) 頁: 160 - 173 2001年2月
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Equilibrium and Kinetic Studies on Folding of the Authentic and Recombinant Forms of Human α-Lactalbumin by Circular Dichroism Spectroscopy 査読有り 国際共著
Tapan K. Chaudhuri, Munehito Arai, Tomoki P. Terada, Teikichi Ikura, Kunihiro Kuwajima
Biochemistry 39 巻 ( 50 ) 頁: 15643 - 15651 2000年11月
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Thermodynamics of nucleotide binding to the chaperonin GroEL studied by isothermal titration calorimetry: evidence for noncooperative nucleotide binding 査読有り
Tomoki P. Terada, Kunihiro Kuwajima
Biochimica et Biophysica Acta 1431 巻 ( 2 ) 頁: 269 - 281 1999年5月
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Effect of the Extra N-terminal Methionine Residue on the Stability and Folding of Recombinant α-Lactalbumin Expressed in Escherichia coli 査読有り 国際共著
Tapan K. Chaudhuri, Katsunori Horii, Takao Yoda, Munehito Arai, Shinji Nagata, Tomoki P. Terada, Hidefumi Uchiyama, Teikichi Ikura, Kouhei Tsumoto, Hiroshi Kataoka, Masaaki Matsushima, Kunihiro Kuwajima, Izumi Kumagai
Journal of Molecular Biology 285 巻 ( 3 ) 頁: 1179 - 1194 1999年1月
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Observation of kaonic hydrogen atom x rays 査読有り 国際共著
T.M. Ito, R.S. Hayano, S.N. Nakamura, T.P. Terada, M. Iwasaki, D.R. Gill, L. Lee, A. Olin, M. Salomon, S. Yen, K. Bartlett, G.A. Beer, G. Mason, G. Trayling, H. Outa, T. Taniguchi, Y. Yamashita, R. Seki
Physical Review C 58 巻 ( 4 ) 頁: 2366 - 2382 1998年10月
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A new approach to measure kaonic hydrogen X-rays 査読有り 国際共著
S.N. Nakamura, M. Iwasaki, K. Bartlett, G.A. Beer, D.R. Gill, R.S. Hayano, T.M. Ito, M. Kuwata, L. Lee, G. Mason, H. Ohkubo, A. Olin, H. Outa, M. Salomon, R. Seki, K. Shibuya, T. Taniguchi, T.P. Terada, G. Trayling, T. Watanabe, Y. Yamashita, S. Yen
Nuclear Instruments and Methods in Physics Research A 408 巻 ( 2-3 ) 頁: 438 - 452 1998年5月
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Observation of Kaonic Hydrogen Kα X Rays 査読有り 国際共著
M. Iwasaki, R.S. Hayano, T.M. Ito, S.N. Nakamura, T.P. Terada, D.R. Gill, L. Lee, A. Olin, M. Salomon, S. Yen, K. Bartlett, G.A. Beer, G. Mason, G. Trayling, H. Outa, T. Taniguchi, Y. Yamashita, R. Seki
Physical Review Letters 78 巻 ( 16 ) 頁: 3067 - 3069 1997年4月
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Cascade calculation of hadronic hydrogen atoms 査読有り
T.P. Terada and R.S. Hayano
Physical Review C 55 巻 ( 1 ) 頁: 73 - 87 1997年1月
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A Pulse-Processor Based on Rise Time Measurement of Trapezoidal Waveforms by Using a Count-Up ADC 査読有り
M. Kuwata, H. Maeda, K. Husimi, S. Ohkawa, M. Iwasaki, S.N. Nakamura, T.M. Ito, T. Terada
IEEE Transactions on Nuclear Science 43 巻 ( 3 ) 頁: 1626 - 1628 1996年6月